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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6741 | 2024-08-07 |
Multi-omics reveals the switch role of abnormal methylation in the regulation of decidual macrophages function in recurrent spontaneous abortion
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111071
PMID:38295895
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研究论文 | 本文通过整合转录组学、DNA甲基化组学和单细胞RNA测序,探讨了DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系 | 首次系统地描绘了异常DNA甲基化在调控蜕膜巨噬细胞功能中的作用,为复发性自然流产的发生机制提供了新的见解 | NA | 阐明DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系 | 复发性自然流产中的DNA甲基化和蜕膜细胞功能 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 转录组学、DNA甲基化组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及22个低甲基化的CpG位点和16个关键通路 | NA | NA | NA | NA |
| 6742 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF-ACKR3 receptor-ligand interaction between iCAFs and tumor cells in esophageal squamous cell carcinoma
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111093
PMID:38336189
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了食管鳞状细胞癌(ESCC)样本,揭示了肿瘤微环境中iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3受体-配体相互作用。 | 本研究首次在ESCC中发现并验证了iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3相互作用,并揭示了其在肿瘤细胞迁移和侵袭中的作用。 | 研究主要基于GEO数据库中的ESCC样本进行单细胞RNA测序分析,可能存在样本选择偏倚。 | 深入理解食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性,并识别新的治疗靶点。 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)的肿瘤微环境及其细胞间的相互作用。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 31,283个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6743 | 2024-08-07 |
Histone deacetylase 6 suppression of renal tubular epithelial cell promotes interstitial mineral deposition via alpha-tubulin acetylation
2024-04, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111057
PMID:38242268
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)在肾小管上皮细胞中的抑制作用及其通过α-微管蛋白乙酰化促进间质矿物沉积的机制 | 研究发现HDAC6的抑制加剧了MDCK细胞中的矿物沉积,而其过表达则减轻了这一现象,表明HDAC6在调节肾小管上皮细胞矿物沉积中起关键作用 | 研究未观察到与矿物沉积增加相关的成骨相关蛋白表达增加,且单细胞RNA测序结果显示上皮细胞的钙化活性较低,提示成骨性转分化可能并未实际发生 | 探讨HDAC6在肾小管上皮细胞中的作用及其对间质矿物沉积的影响 | 肾小管上皮细胞、高草酸尿大鼠的肾脏组织、体外培养的MDCK细胞及NRK49F细胞 | NA | 肾结石 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肾乳头样本的单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 6744 | 2024-08-04 |
Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45956-y
PMID:38503762
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研究论文 | 这篇文章展示了对海洋生物Xenoturbella bocki进行单细胞RNA测序的研究,突出了其细胞类型的复杂性有限。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Xenacoelomorpha的细胞类型补充,提供了与其他动物的比较。 | 研究主要集中在单一物种上,可能无法全面代表整个Xenacoelomorpha门的细胞类型多样性。 | 探索Xenacoelomorpha中的细胞类型及其与其他生物的关系,理解动物细胞类型演化。 | 研究对象为海洋生物Xenoturbella bocki及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及Xenoturbella bocki的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6745 | 2024-08-07 |
Long-term effects of Omicron BA.2 breakthrough infection on immunity-metabolism balance: a 6-month prospective study
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46692-z
PMID:38503738
|
研究论文 | 本研究追踪了轻度BA.2突破性感染康复者在六个月内的免疫代谢平衡情况 | 首次详细探讨了Omicron BA.2突破性感染后长期免疫代谢失衡的机制和病理特征 | 研究仅限于轻度BA.2突破性感染康复者,可能无法完全代表所有感染情况 | 评估COVID-19长期影响及Omicron突破性感染后的免疫恢复情况,为理解疾病和新一代疫苗管理提供依据 | 轻度BA.2突破性感染康复者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 血液检测数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6746 | 2024-08-04 |
Region-specific cellular and molecular basis of liver regeneration after acute pericentral injury
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.013
PMID:38402618
|
研究论文 | 本研究探讨了急性中心周围损伤后肝脏再生的细胞和分子基础 | 使用Cyp2e1-DreER追踪肝脏再生,并揭示了mTOR/4E-BP1轴和乳酸脱氢酶A在中心周围再生中的重要作用 | 研究主要集中在特定的损伤模式上,可能不适用于所有类型的肝脏损伤 | 研究急性中心周围损伤后肝脏的再生机制 | 重点关注中心周围肝细胞及其再生反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、体内功能测定 | NA | NA | 使用Cyp2e1-DreER命运追踪系统进行的实验,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6747 | 2024-08-07 |
Canonical Wnt signaling directs the generation of functional human PSC-derived atrioventricular canal cardiomyocytes in bioprinted cardiac tissues
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.008
PMID:38366588
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析和3D生物打印技术,发现阶段特异性激活的规范Wnt信号通路可以生成功能性的人类多能干细胞衍生的房室管(AVC)心肌细胞 | 首次发现规范Wnt信号通路在体外调控AVC心肌细胞分化的关键作用,并提供了一种用于功能性人心脏生物制造的关键细胞来源 | NA | 探索生成功能性3D生物打印人类心脏的方法 | 房室管(AVC)心肌细胞 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序分析,3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6748 | 2024-08-07 |
A prognostic model based on Scissor+ cancer associated fibroblasts identified from bulk and single cell RNA sequencing data in head and neck squamous cell carcinoma
2024-02, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2023.110984
PMID:38029947
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出与头颈鳞状细胞癌(HNSCC)不良预后相关的成纤维细胞亚群,并构建了一个预测HNSCC患者生存概率的风险模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,识别出与HNSCC不良预后相关的成纤维细胞亚群,并构建了预测模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的准确性和实用性 | 识别与头颈鳞状细胞癌预后相关的成纤维细胞亚群,并构建预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者的成纤维细胞亚群及其预后相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6749 | 2024-08-04 |
Comparative and integrative single cell analysis reveals new insights into the transcriptional immaturity of stem cell-derived β cells
2024-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10013-x
PMID:38267908
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研究论文 | 文章探讨了干细胞衍生的β细胞(SC-β细胞)的转录身份,尤其是与原代胎儿和成年β细胞的关系 | 揭示了SC-β细胞具有独特的转录特征,特别是持续表达和激活前体和神经偏向基因网络 | 尚未明确SC-β细胞与原代β细胞的关系,需要进一步研究 | 研究干细胞衍生β细胞的转录身份及其发育过程中神经转录网络的作用 | 研究对象为干细胞衍生的β细胞、胎儿β细胞和成年β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 转录数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6750 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics systematically discloses the immune-inflammatory responses of peripheral blood mononuclear cells for diabetic nephropathy
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.06.007
PMID:38510479
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6751 | 2024-08-04 |
Exogenous IL-2 delays memory precursors generation and is essential for enhancing memory cells effector functions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109411
PMID:38510150
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研究论文 | 本研究探讨了外源IL-2信号对记忆前体细胞分化的影响 | 本研究首次揭示外源IL-2延迟记忆前体细胞的生成,并增强了记忆细胞的效应功能 | 本研究的局限性在于未探讨其他细胞因子对记忆前体细胞生成的共同作用 | 研究外源IL-2对CD8 T细胞记忆分化的影响 | CD8 T细胞及其在病毒感染小鼠中的记忆分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 病毒感染小鼠中的转移细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6752 | 2024-08-04 |
scGREAT: Transformer-based deep-language model for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109352
PMID:38510148
|
研究论文 | 提出了一种名为scGREAT的框架,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络。 | scGREAT使用基因嵌入和Transformer来优化推断过程,相较于现有方法具有更好的性能。 | 尽管scGREAT表现良好,但仍可能受到计算开销的限制。 | 研究单细胞转录组数据中的基因调控网络推断。 | 单细胞测序数据和基因调控信息。 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | Transformer | 表达数据,基因文本信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6753 | 2024-08-07 |
Aortic Cellular Heterogeneity in Health and Disease: Novel Insights Into Aortic Diseases From Single-Cell RNA Transcriptomic Data Sets
2024-Apr, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示健康与疾病状态下主动脉细胞异质性方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了主动脉细胞类型在健康与疾病状态下的异质性及其相关生物过程 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何增强我们对主动脉疾病细胞驱动因素的理解 | 主动脉疾病如动脉粥样硬化、主动脉瘤和主动脉硬化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6754 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptome atlas of Lueyang black-bone chicken skin
2024-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.103513
PMID:38350389
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了黑羽鸡和白羽鸡皮肤细胞的转录组特征 | 首次报道了鸡皮肤细胞的组成和转录组特征,并鉴定了与色素颗粒捕获和沉积相关的特定细胞亚群 | NA | 揭示鸡皮肤细胞的转录组特征,为家禽育种提供重要信息 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6755 | 2024-08-07 |
Exploring the metastasis-related biomarker and carcinogenic mechanism in liver cancer based on single cell technology
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27473
PMID:38509894
|
研究论文 | 本研究利用单细胞技术探索肝癌中的转移相关生物标志物和致癌机制 | 本研究首次定义了四种支持转移的细胞集群,并发现特定共享基因在促进癌症进展中发挥关键作用 | NA | 探索肝细胞癌(HCC)发展背后的转移相关机制 | 肝细胞癌中的细胞集群及其与癌症转移的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9种细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 6756 | 2024-08-07 |
Combined analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing to identify pyroptosis-related markers and the role of dendritic cells in chronic obstructive pulmonary disease
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27808
PMID:38509896
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研究论文 | 本研究结合批量RNA测序和单细胞RNA测序技术,识别与慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD中的作用 | 本研究首次结合多种机器学习算法,从GEO数据集中筛选出与COPD诊断相关的焦亡相关基因,并通过外部数据集验证其有效性 | NA | 旨在识别与COPD相关的焦亡标志物,并探讨树突状细胞在COPD发病机制中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)及其相关焦亡标志物和树突状细胞的作用 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序 | 深度神经网络,逻辑回归 | RNA测序数据 | 使用了GEO数据集和外部数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6757 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of age-related changes in leukocytes of diabetic mouse hindpaws
2024-Mar-19, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05128-z
PMID:38502310
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了健康和糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群在12周和21周龄时的失调情况,以揭示慢性糖尿病远端肢体中发生的免疫紊乱。 | 研究首次详细描述了糖尿病小鼠后爪中多种免疫细胞类型的免疫功能和表型随着代谢紊乱和疾病持续时间的改变,特别是在21周龄的Lepr小鼠中观察到 mast 细胞/basophils、真皮γδ T 细胞、异质性 T 细胞和 Type 2 先天淋巴细胞的增加。 | 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类糖尿病患者。 | 探讨糖尿病小鼠后爪中免疫细胞群的失调情况,以理解与糖尿病代谢紊乱相关的病理变化。 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和糖尿病小鼠后爪中的免疫细胞群,年龄分别为12周和21周。 | NA | NA | NA | NA |
| 6758 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis
2024-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305592
PMID:38192178
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研究论文 | 这项研究揭示了结核分枝杆菌与人类免疫细胞之间相互作用的功能异质性。 | 开发了一种新的技术平台,结合单细胞RNA测序和细胞表面抗体测序,提供同一样本的基因组和表型信息。 | 研究对象限于初次结核病患者和健康对照,可能无法全面代表所有结核患者。 | 阐明结核病患者的免疫功能差异及其对结核病结果的影响。 | 分析了23990个外周血单核细胞,来自新一组初次结核患者和健康对照。 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,细胞表面抗体测序 | NA | 基因组数据,表型数据 | 23990个外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6759 | 2024-08-07 |
Exploration of the prognostic prediction value of the PANoptosis-based risk score and its correlation with tumor immunity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3682
PMID:38508210
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研究论文 | 本研究探索了基于PANoptosis风险评分在肺腺癌中的预后预测价值及其与肿瘤免疫的相关性 | 首次构建了基于PANoptosis的15个相关基因的风险模型,用于肺腺癌的预后预测 | NA | 探索肺腺癌中PANoptosis相关基因的预后预测价值及与肿瘤免疫的相关性 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归分析 | RNA表达谱 | 来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus数据库的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6760 | 2024-08-04 |
Stimulated Human Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells Enhance the Osteogenesis and Cranial Bone Regeneration through IL-32 Mediated P38 Signaling Pathway
2024, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2024/6693292
PMID:38510207
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研究论文 | 本研究探讨了刺激人脐带间充质干细胞(S-HuMSCs)对骨生成和颅骨再生的影响,重点分析了IL-32介导的P38信号通路 | 发现IL-32可以通过激活P38信号通路增强间充质干细胞的骨生成分化,揭示了IL-32在颅骨损伤治疗中的潜在疗效 | 本研究主要在体外和动物模型中进行,临床应用的效果尚待进一步验证 | 研究刺激人脐带间充质干细胞对骨生成及颅骨再生的机制 | 人脐带间充质干细胞(S-HuMSCs)及其IL-32高表达变体(IL-32highHuMSCs) | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、流式细胞术、定量实时聚合酶链反应、西方印迹 | NA | 细胞、组织 | 实验中使用了多种细胞类型和一只大鼠颅骨缺损模型 | NA | NA | NA | NA |