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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6741 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell transcriptomics reveals the hypoxia-induced inflammation-cancer transformation in NASH-derived hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13576
PMID:37994257
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的炎症-癌症转化机制在NASH衍生的肝细胞癌中的作用 | 首次通过单细胞转录组学整合研究识别出了从NAFLD到HCC的转变过程中CYP7A1肝细胞的功能和亚群体 | 未提及样本的具体数量及其在临床应用中的直接验证 | 探讨NAFLD相关肝细胞癌的发展机制 | 肝细胞和巨噬细胞的单细胞转录组分析 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病相关肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四个单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6742 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA-seq reveals the molecular characterization of the immune microenvironment and oxidative stress signature in melanoma
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28244
PMID:38560689
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研究论文 | 本研究探讨了黑色素瘤免疫微环境和氧化应激特征的异质性。 | 通过整合散装和单细胞RNA测序数据,识别出六种肿瘤亚群,并构建了预测风险模型。 | 研究主要集中在黑色素瘤上,可能无法推广至其他类型肿瘤。 | 旨在分析黑色素瘤的免疫微环境和氧化应激标志物的分子特征。 | 研究对象为黑色素瘤的细胞及其脉络中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 单细胞和散装RNA测序数据 | 不明确提供样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6743 | 2024-08-07 |
An immune cell map of human lung adenocarcinoma development reveals an anti-tumoral role of the Tfh-dependent tertiary lymphoid structure
2024-Mar-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101448
PMID:38458196
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术绘制了人肺腺癌发展过程中的免疫细胞图谱,揭示了Tfh依赖的三级淋巴结构在抗肿瘤中的作用 | 首次揭示了Tfh依赖的三级淋巴结构在人肺腺癌发展中的抗肿瘤作用,并通过IL-21-IL-21受体信号通路介导 | 研究主要基于小鼠模型,需要在人体中进一步验证 | 探究人肺腺癌发展过程中的免疫反应及其对患者生存的影响 | 人肺腺癌发展过程中的免疫细胞及其动态变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6744 | 2024-08-04 |
MMR vaccination induces trained immunity via functional and metabolic reprogramming of γδ T cells
2024-Jan-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170848
PMID:38290093
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研究论文 | 这篇文章系统地研究了MMR疫苗是否可以诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 这项研究首次揭示了MMR疫苗通过功能和代谢重编程γδ T细胞来诱导训练免疫的机制。 | 这项研究的样本量较小,仅涉及39名健康成年人,可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究MMR疫苗是否能诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 39名健康成年人,接受MMR疫苗或安慰剂的随机对照试验。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39名健康成年人 | NA | NA | NA | NA |
| 6745 | 2024-08-04 |
Cancer-associated fibroblasts: protagonists of the tumor microenvironment in gastric cancer
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1340124
PMID:38562556
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综述 | 本研究回顾了癌相关成纤维细胞在胃癌肿瘤微环境中的关键作用 | 探讨了癌相关成纤维细胞的异质性以及其如何促进胃癌的侵袭性和耐药性 | 癌相关成纤维细胞的异质性可能会使针对其的治疗策略开发变得复杂 | 旨在揭示癌相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其潜在治疗策略 | 主要研究癌相关成纤维细胞及其在胃癌中的角色 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6746 | 2024-08-04 |
Clinical implications of single cell sequencing for bladder cancer
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.045442
PMID:38560564
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综述 | 本综述总结了单细胞测序在膀胱癌中的临床应用现状 | 该研究首次系统总结了单细胞测序在膀胱癌中的应用,展示其在预后预测和免疫检查点抑制治疗反应评估中的潜力 | 此综述主要基于已发表的研究,可能存在选择偏倚 | 探讨单细胞测序在膀胱癌临床应用的现状和潜在影响 | 膀胱癌及其相关的单细胞研究 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 41篇发表的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 6747 | 2024-08-04 |
Lung single-cell RNA profiling reveals response of pulmonary capillary to sepsis-induced acute lung injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1308915
PMID:38348045
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研究论文 | 这篇文章探讨了肺毛细血管在脓毒症诱导的急性肺损伤中的反应 | 揭示了不同类型的肺毛细血管在脓毒症急性肺损伤过程中的免疫互动和功能 | 尚不清楚Cd74+毛细血管的功能倾向是免疫还是耐受,需进一步研究确认 | 研究脓毒症引起的急性肺损伤中内皮细胞的功能和相互作用 | 小鼠的肺毛细血管及其在急性肺损伤中的反应 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠肺组织样本,时间点为0、24和48小时 | NA | NA | NA | NA |
| 6748 | 2024-08-07 |
Cystic Fibrosis Mice Are Highly Susceptible to Repeated Acute Pseudomonas aeruginosa Pneumonia after Intranasal Inoculation
2024, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2024/4769779
PMID:38347907
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研究论文 | 研究囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的易感性 | 首次发现囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌感染后比非囊性纤维化小鼠更易感,并揭示了非囊性纤维化小鼠中性粒细胞招募和效应功能的改善 | 研究仅限于F508del转基因囊性纤维化小鼠模型,可能需要进一步研究其他囊性纤维化小鼠模型 | 探讨囊性纤维化小鼠在重复急性铜绿假单胞菌肺炎感染后的免疫反应和易感性 | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 囊性纤维化小鼠和非囊性纤维化小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6749 | 2024-08-07 |
Prognostic Risk Models Using Epithelial Cells Identify β-Sitosterol as a Potential Therapeutic Target Against Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2024, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S447023
PMID:38559590
|
研究论文 | 本研究利用上皮细胞开发预测食管鳞状细胞癌(ESCC)预后的风险模型,并识别β-谷甾醇作为潜在的治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序和功能富集分析,识别了与ESCC相关的核心基因,并构建了基于这些基因的预后模型 | NA | 研究食管鳞状细胞癌中上皮细胞异质性,并开发基于这些细胞类型的预测风险模型 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)中的上皮细胞异质性及其与预后和免疫反应的关系 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 773个食管鳞状细胞癌基因和3407个上皮细胞标记基因 | NA | NA | NA | NA |
| 6750 | 2024-08-07 |
scAnnoX: an R package integrating multiple public tools for single-cell annotation
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17184
PMID:38560451
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scAnnoX的R包,该包整合了多种单细胞注释算法,用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | scAnnoX提供了一个综合框架,用于整合和比较多种单细胞注释算法,提高了注释效率和准确性 | NA | 开发一个综合工具,用于整合和比较现有的单细胞注释算法 | 单细胞注释算法 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6751 | 2024-08-07 |
An androgen receptor-based signature to predict prognosis and identification of ORC1 as a therapeutical target for prostate adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16850
PMID:38562999
|
研究论文 | 本研究旨在通过基于雄激素受体(AR)的特征来预测前列腺腺癌(PRAD)的预后,并识别ORC1作为治疗靶点 | 本研究首次识别了基于AR的10个相关基因(ARGs),并发现ORC1作为关键靶点,能够促进PRAD细胞的增殖和干细胞样特性,增强对enzalutamide的敏感性 | NA | 识别新的AR驱动特征以预测前列腺腺癌的预后,并揭示潜在的治疗靶点 | 前列腺腺癌及其对enzalutamide的耐药性 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO和多变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自GSE99795的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6752 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics: Bridging current technologies with long-read sequencing
2024-04, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2024.101255
PMID:38368637
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研究论文 | 本文探讨了单细胞和空间转录组学与长读长测序技术的结合 | 提出了将单细胞技术、空间转录组学与长读长测序结合的新方法 | 尚存在一些挑战和需要解决的问题 | 旨在描绘细胞在组织背景中的特征及其异质性 | 研究单细胞和空间转录组学领域的技术结合 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6753 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing identifies inflammation-promoting fibroblast-neutrophil interaction in peri-implantitis
2024-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13912
PMID:38088448
|
研究论文 | 本文揭示了通过单细胞测序技术获得的周围种植体炎症浸润的细胞组成和分子环境 | 该研究首次发现了在种植体炎症中促炎症成纤维细胞与中性粒细胞的相互作用 | 该研究可能未涵盖所有相关的细胞类型和潜在的分子机制 | 解释周围种植体炎与牙周炎之间的病理差异 | 周围种植体炎患者的组织与牙周炎患者及健康供体的牙周组织 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 来自患有周围种植体炎和牙周炎的患者,以及健康供体的高通量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6754 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing provides insight into multiple chemotherapy resistance in a patient with refractory DLBCL: a case report
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1303310
PMID:38533514
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病例报告 | 本研究利用单细胞转录组测序和常规批量下一代测序(NGS)分析了一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的肿瘤全景 | 结合NGS和单细胞RNA测序技术,揭示了肿瘤微环境中的异质性和免疫抑制特性,为治疗难治性DLBCL提供了潜在的治疗靶点 | 研究仅基于单一病例,结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 阐明DLBCL进展的机制并开发新的治疗方法 | 一位经历多次化疗复发的大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者 | 数字病理学 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, NGS | NA | 转录组 | 单一患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6755 | 2024-08-07 |
Development and validation of a prognostic model for cervical cancer by combination of machine learning and high-throughput sequencing
2024-Apr, European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology
DOI:10.1016/j.ejso.2024.108241
PMID:38452717
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种结合机器学习和高通量测序的宫颈癌预后模型 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和高通量测序数据,利用多种机器学习算法构建宫颈癌预后模型 | 本研究仅使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据进行模型构建和验证,可能存在样本选择偏倚 | 开发一种评估宫颈癌预后的综合模型 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用了两个单细胞RNA测序项目和TCGA数据,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6756 | 2024-08-04 |
Identification of spatially-resolved markers of malignant transformation in Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46994-2
PMID:38553466
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研究论文 | 该论文研究了乳头状粘液性肿瘤中的恶性转化的空间分辨标记 | 本研究确认了乳头状粘液性肿瘤的亚型特异性标记,为风险分层提供了新的分子依据 | 研究依赖于两个独立患者队列,但可能存在样本多样性和外部验证的不足 | 研究乳头状粘液性肿瘤中恶性转化的分子标记 | 调查乳头状粘液性肿瘤患者的亚型特异性分子标记 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 两个独立的患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 6757 | 2024-08-07 |
Aberrant activated Notch1 promotes prostate enlargement driven by androgen signaling via disrupting mitochondrial function in mouse
2024-Mar-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05143-0
PMID:38538986
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研究论文 | 本研究证明过度激活的Notch1信号在小鼠前列腺上皮细胞中通过增强增殖和抑制凋亡导致前列腺增大 | 揭示了过度激活的Notch1信号通过增加雄激素受体敏感性、破坏细胞线粒体代谢、增加活性氧和增加前体细胞数量诱导前列腺增大的机制,并发现N-乙酰-L-半胱氨酸治疗可以缓解这种过度激活引起的增生 | NA | 探讨Notch信号在前列腺增大和增生中的潜在调控机制 | 小鼠前列腺上皮细胞和人类良性前列腺增生患者 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类良性前列腺增生患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6758 | 2024-08-07 |
Analysis of the effect of CCR7 on the microenvironment of mouse oral squamous cell carcinoma by single-cell RNA sequencing technology
2024-Mar-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03013-y
PMID:38539232
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析CCR7对小鼠口腔鳞状细胞癌微环境的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析CCR7基因敲除对小鼠口腔鳞状细胞癌微环境中细胞类型和基因表达的影响 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类口腔鳞状细胞癌中验证CCR7的作用 | 探讨CCR7在口腔鳞状细胞癌微环境中的作用 | CCR7基因敲除小鼠和野生型小鼠的口腔鳞状细胞癌模型 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三只CCR7基因敲除小鼠和三只野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6759 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of the small intestine throughout the human lifespan demonstrates unique features of fetal immune cells
2024-Mar-28, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.011
PMID:38555026
|
研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集,创建了人类小肠在整个生命周期中的转录组图谱,特别关注免疫细胞,并揭示了胎儿期小肠免疫细胞的独特特征 | 首次展示了胎儿小肠免疫细胞的复杂免疫景观,并识别了其在整个生命周期中的变化 | NA | 探讨人类小肠黏膜免疫系统的发育过程及其在不同生命阶段的特点 | 人类小肠的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涵盖从第一孕期到成年的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6760 | 2024-08-07 |
T cells with increased responsiveness cause obesity in mice without diet intervention
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109471
PMID:38551005
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研究论文 | 本研究使用增强T细胞反应性的老鼠模型,展示了肥胖可以通过免疫细胞驱动 | 首次证明增强的T细胞反应性可以直接导致肥胖,无需饮食干预 | 研究仅限于老鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨肥胖的免疫细胞机制,特别是T细胞的作用 | 增强T细胞反应性的老鼠模型 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序和CyTOF分析 | NA | 细胞 | 多个老鼠模型 | NA | NA | NA | NA |