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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6701 | 2024-08-07 |
Cytotoxic CD8+ Temra cells show loss of chromatin accessibility at genes associated with T cell activation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1285798
PMID:38370415
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研究论文 | 研究探讨了人类衰老过程中记忆T细胞的扩张及其与CMV感染的关系,特别是Temra细胞的表观遗传模式和细胞异质性 | 通过单细胞转录组分析和ATAC-seq技术,揭示了Temra细胞与Tcm/em细胞在染色质可及性方面的差异,并发现了与基因表达相关的染色质可及性位点 | 研究主要集中在Temra细胞与Tcm/em细胞的比较,未涉及其他T细胞亚群的全面分析 | 探究衰老和CMV感染对CD8 Temra细胞分子和细胞异质性的影响 | CD8 Temra细胞及其与CMV感染的关系 | 免疫学 | NA | ATAC-seq, 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 涉及多个个体,具体数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 6702 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies cancer cell-intrinsic RARRES1 as a predictor of prognosis and immune response in triple-negative breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1360507
PMID:38533207
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序数据,揭示了三阴性乳腺癌(TNBC)中肿瘤微环境(TME)的细胞组成异质性,并识别了与TME相关的基因RARRES1,该基因表达与TNBC患者的预后和免疫检查点抑制剂(ICIs)反应呈正相关 | 本研究提出了一种定量评估TME免疫特征的方法,并提供了一个框架,通过综合分析识别与TME相关的癌细胞内在特征 | NA | 揭示三阴性乳腺癌中癌细胞与肿瘤微环境之间的关系,并识别预测治疗反应和预后的生物标志物 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境(TME) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6703 | 2024-08-04 |
Intratumoral IL-12 delivery via mesenchymal stem cells combined with PD-1 blockade leads to long-term antitumor immunity in a mouse glioblastoma model
2024-Apr, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115790
PMID:38431436
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研究论文 | 本研究开发了IL-12分泌的间充质干细胞,并评估了其与抗PD-1联合治疗胶质母细胞瘤的疗效 | 通过将IL-12分泌的间充质干细胞与抗PD-1联合使用,显著增强了针对胶质母细胞瘤的抗肿瘤免疫 | 本研究在小鼠模型中进行,临床转化的有效性和安全性需进一步验证 | 探索抗PD-1与IL-12-secreting间充质干细胞联合治疗对胶质母细胞瘤的长期疗效 | 胶质母细胞瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 小鼠单细胞转录组测序 | NA | 实验小鼠组织样本 | 共涉及29只小鼠,分别是16只和13只小鼠用于不同单疗法,12只小鼠用于联合疗法 | NA | NA | NA | NA |
| 6704 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing: A promising approach for uncovering the characteristic of pancreatic islet cells in type 2 diabetes
2024-Apr, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.116292
PMID:38394848
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综述 | 这篇文章总结了单细胞测序在2型糖尿病胰岛细胞特征研究中的应用 | 该研究强调了单细胞测序在揭示细胞异质性和改善干细胞治疗中的创新应用 | 文章讨论了单细胞测序的局限性,但未具体阐述 | 探讨单细胞测序在2型糖尿病发病机制中的潜在应用和治疗靶点 | 胰岛细胞和功能性β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观遗传学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6705 | 2024-08-07 |
Siglec9 + tumor-associated macrophages predict prognosis and therapeutic vulnerability in patients with colon cancer
2024-Mar-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111771
PMID:38430807
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研究论文 | 研究探讨了Siglec9阳性肿瘤相关巨噬细胞在结肠癌中的表达模式及其临床意义 | 首次全面分析了Siglec9阳性肿瘤相关巨噬细胞在结肠癌中的表达及其对预后和辅助化疗反应的影响 | 研究为回顾性分析,可能存在选择偏倚 | 评估Siglec9阳性肿瘤相关巨噬细胞在结肠癌中的临床意义及治疗潜力 | 结肠癌患者中的Siglec9阳性肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 组织样本 | 两个不同医疗中心的临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 6706 | 2024-08-07 |
UFL1 ablation in T cells suppresses PD-1 UFMylation to enhance anti-tumor immunity
2024-Mar-21, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.01.024
PMID:38377992
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研究论文 | 本研究探讨了UFMylation在T细胞中的生理作用,特别是UFL1 E3连接酶在调节PD-1 UFMylation和增强抗肿瘤免疫中的作用。 | 首次揭示了UFL1通过促进PD-1 UFMylation来拮抗PD-1的泛素化和降解,以及AMPK通过磷酸化UFL1来破坏PD-1 UFMylation的机制。 | NA | 探究UFMylation在T细胞中的生理作用及其在癌症治疗中的潜在应用。 | UFL1 E3连接酶在T细胞中的功能及其对PD-1 UFMylation的影响。 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Ufl1条件性敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6707 | 2024-08-07 |
Lower respiratory tract single-cell RNA sequencing and neutrophil extracellular trap profiling of COVID-19-associated pulmonary aspergillosis: a single centre, retrospective, observational study
2024-03, The Lancet. Microbe
DOI:10.1016/S2666-5247(23)00368-3
PMID:38280387
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和嗜中性粒细胞外捕获物(NETs)分析,探讨了COVID-19相关肺曲霉病(CAPA)患者的免疫特征,特别是嗜中性粒细胞和NETs的浓度 | 首次详细描述了CAPA患者的免疫细胞景观,特别是嗜中性粒细胞的成熟轨迹和NETs的形成,以及这些特征与患者预后的关系 | 本研究为回顾性观察研究,样本量有限,且仅在一个中心进行 | 旨在描述重症COVID-19患者,无论是否伴有CAPA,其免疫特征,特别是嗜中性粒细胞和NETs的浓度 | 重症COVID-19患者,包括伴有和不伴有CAPA的患者 | 数字病理学 | COVID-19相关肺曲霉病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 43份支气管肺泡灌洗样本,59名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6708 | 2024-08-07 |
Regulatory T cells and IFN-γ-producing Th1 cells play a critical role in the pathogenesis of Sjögren's Syndrome
2024-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576314
PMID:38328096
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞和IFN-γ产生Th1细胞在Sjögren综合征发病机制中的关键作用 | 报道了一个更准确的Sjögren综合征小鼠模型,并提供了调节性T细胞和IFN-γ产生Th1细胞在Sjögren综合征发病机制中的关键作用的证据 | NA | 研究Sjögren综合征的发病机制 | Sjögren综合征患者的唾液腺和泪腺以及淋巴组织 | NA | 自身免疫疾病 | RNA测序, 流式细胞术, 单细胞转录组分析 | NA | RNA | 小鼠模型和Sjögren综合征患者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6709 | 2024-08-07 |
Identification, sorting and profiling of functional killer cells via the capture of fluorescent target-cell lysate
2024-Mar, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01089-z
PMID:37652987
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PAINTKiller的流式细胞术兼容检测方法,用于准确识别和分离共培养物中的功能性杀伤细胞亚群 | 该方法通过检测被裂解细胞内荧光蛋白在裂解细胞表面的标记,实现了对杀伤细胞亚群的精确识别和分离 | NA | 开发一种新的检测方法,用于评估细胞介导的细胞毒性,并能够识别和分离细胞毒性效应细胞的亚群 | 功能性杀伤细胞亚群的识别和分离 | 细胞生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6710 | 2024-08-07 |
Introducing single cell stereo-sequencing technology to transform the plant transcriptome landscape
2024-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2023.10.002
PMID:37914553
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综述 | 本文综述了单细胞立体测序技术(Stereo-seq)在植物转录组学中的应用及其优势 | Stereo-seq技术结合了空间信息与单细胞转录组学,解决了传统单细胞RNA测序(scRNA-seq)无法提供高分辨率空间转录组信息的问题 | NA | 探讨Stereo-seq技术在植物研究中的应用,以推进我们对植物转录组学时代生物过程的理解 | 植物转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6711 | 2024-08-04 |
Detailed survey of an in vitro intestinal epithelium model by single-cell transcriptomics
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109383
PMID:38523788
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序详细调查了两种成人结直肠癌细胞系共培养模型的细胞类型异质性 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了肠上皮模型的细胞类型异质性,并与人类生理进行全面比较 | 共培养模型无法完整模拟人类上皮的先天免疫特征 | 探索成人结直肠癌细胞系共培养模型的生物学特性及其与人类生理的相似性 | 两种成人结直肠癌细胞系Caco-2和HT29的共培养系统 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用两种结直肠癌细胞系的共培养系统 | NA | NA | NA | NA |
| 6712 | 2024-08-07 |
Mild hypothermia promotes neuronal differentiation of human neural stem cells via RBM3-SOX11 signaling pathway
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109435
PMID:38523796
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研究论文 | 本研究探讨了轻度低温(35°C)对人类神经干细胞(hNSCs)神经元分化的影响 | 发现了轻度低温通过RBM3-SOX11信号通路促进hNSCs神经元分化的机制 | NA | 研究轻度低温对hNSCs神经元分化的影响及其机制 | 人类神经干细胞(hNSCs) | 神经科学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6713 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk RNA sequencing highlights the role of M1-like infiltrating macrophages in antibody-mediated rejection after kidney transplantation
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27865
PMID:38524599
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析,揭示了肾移植后抗体介导排斥反应中M1样浸润巨噬细胞的作用 | 首次详细描述了肾移植后抗体介导排斥反应中巨噬细胞的亚群及其在病理和预后中的作用 | 研究主要基于已有的数据库和临床数据,未涉及前瞻性临床试验 | 探讨肾移植后抗体介导排斥反应中巨噬细胞的表型、起源和机制 | 肾移植后抗体介导排斥反应中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 五份肾移植后活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6714 | 2024-08-04 |
Dynamic video recognition for cell-encapsulating microfluidic droplets
2024-Mar-25, The Analyst
DOI:10.1039/d4an00022f
PMID:38441128
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研究论文 | 本研究探讨了在微流体液滴视频识别中应用弱监督细胞计数网络的软件 | 提出了一种实时视频处理方法,能够在没有监督位置信息的情况下准确定位液滴和被包覆的细胞,并显著减少标注工作量 | 未提及研究的具体限制 | 优化液滴微流控技术中的质量控制,并提高基于视频识别的细胞包覆评估 | 主要研究不同微流体结构中包覆六种类型细胞/珠子的液滴 | 数字病理学 | NA | 弱监督细胞计数网络 | NA | 视频 | 六种类型的细胞/珠子液滴 | NA | NA | NA | NA |
| 6715 | 2024-08-04 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
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method paper | 本文集中于使用新型原位杂交实验分析肌腱组织中基因表达水平的空间方法 | 提出了一种新的在单细胞水平上检测目标RNA的技术,并增强了对肌腱细胞的分子表征 | 尚未讨论在多种动物模型或人类肌腱组织分析中的潜在局限性 | 研究和分析肌腱中基因表达水平的空间分布 | 肌腱组织中的特定细胞以及其他富含基质的组织如骨、软骨和韧带 | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | NA | 不同动物模型和人类肌腱组织的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6716 | 2024-08-04 |
Dynamic YAP expression in the non-parenchymal liver cell compartment controls heterologous cell communication
2024-Mar-04, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05126-1
PMID:38436764
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研究论文 | 该文章探讨了YAP和TAZ在小鼠非实质性肝细胞中的动态表达如何控制细胞间的通信。 | 提出了一种新的机制,说明YAP如何通过影响非实质性细胞的细胞间通信来促进炎症。 | 研究主要集中在小鼠模型,结果是否适用于人类尚不清楚 | 研究YAP和TAZ的失活对肝细胞特征和细胞间通信的影响 | 使用了专门缺失YAP和TAZ的小鼠模型进行观察 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 免疫组化,单细胞测序,蛋白质组学 | NA | 组织样本,血清 | YAPKO和DKO小鼠,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6717 | 2024-08-07 |
GLIPR2: a potential biomarker and therapeutic target unveiled - Insights from extensive pan-cancer analyses, with a spotlight on lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1280525
PMID:38476239
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研究论文 | 本研究通过广泛的数据集分析,探讨了GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达情况及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力,特别关注肺腺癌。 | 首次全面分析GLIPR2在多种癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系,揭示了其在肺腺癌中的诊断和预后价值。 | NA | 探讨GLIPR2在多种癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多中心队列涵盖多种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 6718 | 2024-08-07 |
Coniferyl ferulate alleviate xylene-caused hematopoietic stem and progenitor cell toxicity by Mgst2
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1334445
PMID:38523643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了松脂素阿魏酸酯(CF)通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的作用 | 首次揭示了松脂素阿魏酸酯通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的新机制 | NA | 探讨松脂素阿魏酸酯对二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的缓解作用及其分子机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPCs)及二甲苯引起的毒性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的骨髓造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6719 | 2024-08-07 |
ICOS costimulation in combination with CTLA-4 blockade remodels tumor-associated macrophages toward an antitumor phenotype
2024-Apr-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231263
PMID:38517331
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研究论文 | 研究探讨了ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗对肿瘤相关巨噬细胞表型的重塑作用 | 发现ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗能显著重塑淋巴和髓系细胞,增强Th1 CD4 T细胞、效应CD8 T细胞和M1样抗肿瘤促炎巨噬细胞的富集 | NA | 研究ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗在抗肿瘤治疗中的协同作用及其机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CyTOF和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及B16-F10细胞疫苗和多种免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6720 | 2024-08-07 |
Single cell deciphering of progression trajectories of the tumor ecosystem in head and neck cancer
2024-Mar-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46912-6
PMID:38519500
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了头颈部鳞状细胞癌在不同阶段的肿瘤生态系统进展轨迹 | 首次揭示了恶性上皮细胞的转录发育轨迹及由TFDP1调控的肿瘤生成上皮亚群,并发现了POSTN纤维母细胞和SPP1巨噬细胞在肿瘤进展中的浸润增加及其与恶性细胞的相互作用增强 | NA | 旨在更好地表征头颈部鳞状细胞癌的肿瘤进展轨迹 | 头颈部鳞状细胞癌的正常组织、癌前组织、早期和晚期癌症组织、淋巴结及复发肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多种组织样本,包括正常组织、癌前组织、早期和晚期癌症组织、淋巴结及复发肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |