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当前共找到 7460 篇文献,本页显示第 6681 - 6700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6681 2024-08-07
Predicting mechanism of immune response in microsatellite instability colorectal cancer
2024-Mar-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究利用计算程序分析单细胞RNA测序数据,识别出微卫星不稳定性结直肠癌(MSI-CRC)中特定的表达程序,并探讨了这些程序与免疫反应和转移功能的关系 首次通过非负矩阵分解(NMF)识别出MSI-CRC特有的三个复发模块,并发现这些模块与代谢和炎症反应功能富集相关 研究主要集中在MSI-CRC的免疫反应机制,未涉及微卫星稳定性(MSS)结直肠癌的比较分析 探讨微卫星不稳定性结直肠癌中免疫反应的预测机制 微卫星不稳定性结直肠癌(MSI-CRC)的免疫反应和转移功能 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) 非负矩阵分解(NMF) 基因表达数据 涉及多个结直肠癌细胞系的单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA
6682 2024-08-07
A p53 score derived from TP53 CRISPR/Cas9 HMCLs predicts survival and reveals a major role of BAX in the response to BH3 mimetics
2024-Mar-28, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过CRISPR/Cas9技术从TP53+/+和TP53-/mut t(4;14)人类骨髓瘤细胞系(HMCLs)中衍生出TP53-/-克隆,建立了严格的p53依赖性基因表达谱,并开发了一个功能性p53评分系统,该评分系统涉及13个在p53沉默时特异性下调的基因。 本研究首次建立了一个功能性p53评分系统,能够有效识别双等位TP53失活的骨髓瘤患者样本,并预测其总体生存率。此外,研究还发现p53调控的BAX表达对骨髓瘤细胞对BH3模拟物的敏感性有直接影响,并且MCL1和BCL2 BH3模拟物的组合显示出协同效应。 研究主要集中在骨髓瘤细胞系和患者样本上,未来需要进一步验证该评分系统在其他癌症类型中的应用。 建立一个功能性p53评分系统,以识别双等位TP53失活的骨髓瘤细胞,并研究p53调控的BAX在骨髓瘤细胞对BH3模拟物反应中的作用。 TP53+/+和TP53-/mut t(4;14)人类骨髓瘤细胞系(HMCLs),以及骨髓瘤患者样本。 数字病理学 骨髓瘤 CRISPR/Cas9技术 NA 基因表达数据 涉及17个失调基因,13个特异性下调基因,以及多个骨髓瘤细胞系和患者样本。 NA NA NA NA
6683 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals the immune features and viral tropism in the central nervous system of mice infected with Japanese encephalitis virus
2024-Mar-26, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了日本脑炎病毒感染小鼠中枢神经系统后的免疫特征和病毒趋向性 首次通过单细胞RNA测序揭示了日本脑炎病毒对小鼠大脑中不同神经亚型的病毒趋向性和细胞组成的改变 NA 探讨日本脑炎病毒在小鼠中枢神经系统中的作用机制及其对神经损伤和炎症的影响 日本脑炎病毒感染的小鼠中枢神经系统细胞 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 88,000个单细胞 NA NA NA NA
6684 2024-08-07
Unveiling the functional heterogeneity of cytokine-primed human umbilical cord mesenchymal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-Mar-26, Cell & bioscience
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了由不同细胞因子预处理的脐带间充质干细胞的功能异质性及其分子机制 本研究首次在单细胞水平上揭示了细胞因子预处理对间充质干细胞异质性、生物功能及其功能亚群的调控作用 NA 揭示细胞因子预处理的间充质干细胞的细胞异质性、功能亚群及分子机制 脐带间充质干细胞 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及IFN-γ、TNF-α、IL-4、IL-6、IL-15和IL-17预处理的脐带间充质干细胞 NA NA NA NA
6685 2024-08-07
Single-Cell Transcriptome Analysis of Small Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Endometrium Reveals ISL1 as a Potential Biomarker for Diagnosis and Treatment
2024-Mar-13, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了子宫内膜小细胞神经内分泌癌的转录组,揭示了ISL1作为潜在的诊断和治疗生物标志物 首次在子宫内膜小细胞神经内分泌癌中探讨了ISL1的表达及其作为生物标志物的潜力 研究样本量较小,仅基于单一病例的样本进行分析 探索子宫内膜小细胞神经内分泌癌的诊断和治疗标志物 子宫内膜小细胞神经内分泌癌及其细胞内的ISL1表达 数字病理学 妇科肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 单一病例样本 NA NA NA NA
6686 2024-08-04
Ferroptosis-Related lncRNA to Predict the Clinical Outcomes and Molecular Characteristics of Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma
2024-Feb-29, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 该研究构建了一种基于铁死亡相关的长非编码RNA风险评分模型,用于预测肾脏肾小管细胞癌的临床结果和分子特征 提出了一种新的肾脏肾小管细胞癌亚型,并开发了准确的预后模型 未提及具体的限制因素 研究肾脏肾小管细胞癌的预后与分子特征 肾脏肾小管细胞癌患者 数字病理学 肾脏癌症 单细胞转录组学 风险评分模型 基因表达数据 基于TCGA-KIRP数据集 NA NA NA NA
6687 2024-08-07
Comparative study on differential expression analysis methods for single-cell RNA sequencing data with small biological replicates: Based on single-cell transcriptional data of PBMCs from COVID-19 severe patients
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文比较了在生物学重复样本较少的情况下,八种差异表达分析(DEA)方法在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中的适应性 提出了基于信息熵的新方法DEF-scRNA-seq,在生物学重复样本较少的情况下具有显著优势 NA 评估和比较在生物学重复样本较少的情况下,不同差异表达分析方法的性能 COVID-19重症患者的PBMCs单细胞转录组数据 单细胞测序 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 生物学重复样本较少 NA NA NA NA
6688 2024-08-04
MDFI promotes the proliferation and tolerance to chemotherapy of colorectal cancer cells by binding ITGB4/LAMB3 to activate the AKT signaling pathway
2024-12-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了MDFI通过结合ITGB4/LAMB3激活AKT信号通路以促进结直肠癌细胞的增殖和化疗耐受性 发现MDFI与ITGB4/LAMB3之间的正相关关系以及其在AKT信号通路中的新作用 缺乏大规模临床样本的验证 研究MDFI在结直肠癌细胞中的作用及其机制 结直肠癌细胞及其相关的信号通路 数字病理学 结直腸癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 使用了来自GSE144735数据集的样本和TCGA及CCLE数据 NA NA NA NA
6689 2024-08-04
Comprehensive single-cell analysis reveals heterogeneity of fibroblast subpopulations in ovarian cancer tissue microenvironment
2024-Mar-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 该研究揭示了卵巢癌组织微环境中成纤维细胞亚群的异质性。 首次较为全面地分析了卵巢癌组织微环境中成纤维细胞亚群的特性及其在TGFβ信号通路中的功能。 对成纤维细胞亚群的特定功能了解仍然不够充分。 探讨卵巢癌组织中成纤维细胞亚群的异质性及其在癌症进展中的作用。 卵巢癌组织样本中的成纤维细胞亚群。 数字病理学 卵巢癌 单细胞测序 NA RNA-seq 32个卵巢癌样本和3226个公共数据库中的大规模RNA-seq数据 NA NA NA NA
6690 2024-08-04
Modulator of TMB-associated immune infiltration (MOTIF) predicts immunotherapy response and guides combination therapy
2024-Mar-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究开发了一种新工具MOTIF,用于预测免疫疗法响应并指导联合治疗 MOTIF将肿瘤突变负担(TMB)与CD8 T细胞浸润之间的关系进行了综合分析,提供了新的预测模型 该研究主要基于已有的RNA-seq数据,没有进行前瞻性临床试验 研究旨在提高TMB水平高的癌症患者对免疫检查点抑制剂的响应 研究对象是9311个肿瘤样本及84个单细胞RNA-seq数据集 数字病理学 肿瘤 RNA-seq NA RNA数据 9311个肿瘤样本和84个人类单细胞RNA-seq数据集 NA NA NA NA
6691 2024-08-07
Prognostic prediction using a gene signature developed based on exhausted T cells for liver cancer patients
2024-Mar-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究基于T细胞耗竭的关键预后基因开发了一个用于肝癌患者的预后预测模型 利用单细胞RNA测序数据和基因共表达网络分析,结合Lasso和多/单变量Cox分析构建了一个新的风险评分系统,并开发了一个能够预测不同风险组免疫浸润和免疫治疗敏感性的诺模图 NA 开发一个基于T细胞耗竭的关键预后基因的预后预测模型,以改善肝癌患者的临床治疗 肝癌患者 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 风险评分系统 单细胞RNA测序数据 18,413个细胞 NA NA NA NA
6692 2024-08-07
Nephroblastoma-specific dysregulated gene SNHG15 with prognostic significance: scRNA-Seq with bulk RNA-Seq data and experimental validation
2024-Mar-25, Discover. Oncology
研究论文 本研究通过结合单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和批量RNA测序(RNA-Seq)数据,识别并验证了在肾母细胞瘤(WT)中具有预后意义的失调基因SNHG15。 首次整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示了SNHG15在肾母细胞瘤中的预后价值及其功能机制。 实验仅限于G401细胞系,未来研究需在更多细胞系和临床样本中验证SNHG15的作用。 探索肾母细胞瘤中的预后标志物及其分子机制。 肾母细胞瘤组织中的SNHG15基因及其在细胞增殖、迁移和凋亡中的作用。 数字病理学 肾母细胞瘤 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),批量RNA测序(RNA-Seq) NA RNA 基于scRNA-seq数据识别了20个簇,并注释了10种细胞类型 NA NA NA NA
6693 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing unveils tumor heterogeneity and immune microenvironment between subungual and plantar melanoma
2024-03-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了指(趾)甲下黑色素瘤(SM)和足底黑色素瘤(PM)之间的肿瘤异质性和免疫微环境差异 首次详细比较了SM和PM在基因表达、拷贝数变异(CNV)及肿瘤相关通路(如NF-κb和Wnt)的差异,并揭示了免疫微环境中特定轴(EPHA3-EFNA1和TIGIT-NECTIN2)的表达情况 研究样本仅限于SM和PM患者,可能无法完全代表所有类型的黑色素瘤 探索不同亚型黑色素瘤的肿瘤异质性和免疫微环境 指(趾)甲下黑色素瘤(SM)和足底黑色素瘤(PM) 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 24,789个单细胞 NA NA NA NA
6694 2024-08-07
Identification of the shared hub gene signatures and molecular mechanisms between HIV-1 and pulmonary arterial hypertension
2024-03-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过分析HIV-1和肺动脉高压(PAH)的微阵列数据,利用WGCNA、GO和通路富集分析等方法,识别了两者之间的共享枢纽基因和分子机制 首次揭示了HIV-1与PAH之间通过I型干扰素(IFN)途径的共享分子机制,并确定了关键枢纽基因ISG15和IFI27 NA 阐明HIV-1感染与肺动脉高压之间的分子机制 HIV-1感染和肺动脉高压的共享枢纽基因及其分子机制 数字病理学 肺动脉高压 WGCNA, GO和通路富集分析, CIBERSORT, scRNA-seq NA 微阵列数据, scRNA-seq数据 NA NA NA NA NA
6695 2024-08-07
Sirpα on tumor-associated myeloid cells restrains antitumor immunity in colorectal cancer independent of its interaction with CD47
2024-Mar, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌组织,发现肿瘤相关巨噬细胞和中性粒细胞来源的抑制细胞在免疫抑制特征上显著增加,且Sirpα在这些细胞中的表达增强,与肿瘤进展抵抗性相关。 首次揭示了Sirpα在肿瘤相关髓系细胞中独立于CD47的免疫抑制作用,并展示了Sirpα缺乏通过重编程肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫活性的机制。 NA 探究肿瘤相关髓系细胞中Sirpα的免疫抑制机制及其对结直肠癌免疫治疗的影响。 结直肠癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞和中性粒细胞来源的抑制细胞。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
6696 2024-08-07
Single Cell Analysis of Lung Lymphatic Endothelial Cells and Lymphatic Responses during Influenza Infection
2024-Mar, Journal of respiratory biology and translational medicine
研究论文 研究了流感感染期间肺淋巴内皮细胞和淋巴反应的单细胞分析 发现了流感感染期间肺淋巴内皮细胞中存在的新的PD-L1亚群 NA 探讨感染期间淋巴系统的重塑过程 肺淋巴内皮细胞和淋巴反应 数字病理学 流感 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
6697 2024-08-04
Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Feb-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文研究了在双膦酸盐治疗失败的骨质疏松患者中通过单细胞转录组学揭示异质的骨免疫特征 研究首次揭示了骨质疏松患者中免疫细胞的异质性及其与双膦酸盐治疗失败的相关性 样本量可能有限,未深入探讨其他可能影响结果的生物标志物 探讨骨质疏松症中的免疫细胞异质性及其在双膦酸盐治疗中的作用 选取不同骨质疏松症状态的绝经后女性,包括非骨质疏松、经过治疗改善的患者及治疗失败者 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 免疫细胞转录组数据 三组共涉及多名绝经后女性样本,具体样本量未详细说明 NA NA NA NA
6698 2024-08-04
Rabies virus-based barcoded neuroanatomy resolved by single-cell RNA and in situ sequencing
2024-Feb-06, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文结合条形码狂犬病毒与单细胞和原位测序,探索小鼠大脑中的逆行标记和跨突触标记 本研究首次将条形码狂犬病毒与高通量的单细胞RNA测序和原位测序相结合,以实现神经元类型的广泛映射 目前条形码狂犬病毒的应用仅限于映射非神经元细胞的相互作用和培养神经元的突触连接 研究各种神经元类型的连接性,从而理解神经电路的结构和功能 小鼠大脑中的目标神经元及其突触连接 数字神经解剖学 NA RNA条形码测序 NA 转录组数据 对96个逆行标记细胞和295个跨突触标记细胞进行了单细胞RNA测序,对4130个逆行标记细胞和2914个跨突触标记细胞进行了原位测序 NA NA NA NA
6699 2024-08-07
Association Between Diverse Cell Death Patterns Related Gene Signature and Prognosis, Drug Sensitivity, and Immune Microenvironment in Glioblastoma
2024-Jan-12, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于多种程序性细胞死亡模式相关基因构建了一个新的预测胶质母细胞瘤(GBM)预后的模型,并探讨了该模型与药物敏感性和免疫微环境的关系 首次整合了11种程序性细胞死亡模式相关基因,构建了一个新的预后模型,并验证了其在不同数据集中的有效性 需要进一步的研究来验证该模型在更大规模样本和不同人群中的应用效果 开发一个有效的工具来预测GBM的预后,并探讨其与药物敏感性和免疫微环境的关系 胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后、药物敏感性和免疫微环境 数字病理学 脑瘤 转录组数据分析 Cox回归分析 转录组数据 使用了来自TCGA-GBM、REMBRANDT、CGGA和GSE162631数据集的GBM病例的bulk和单细胞转录组数据及临床数据 NA NA NA NA
6700 2024-08-07
Single-cell disulfidptosis regulator patterns guide intercellular communication of tumor microenvironment that contribute to kidney renal clear cell carcinoma progression and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾透明细胞癌中的硫化物凋亡调控因子模式,揭示了其在肿瘤微环境中对细胞间通讯的影响及其与疾病进展和免疫治疗的关系 首次详细探讨了硫化物凋亡在肿瘤微环境中的具体作用,并揭示了其与肾透明细胞癌生物特性和预后的关联 研究样本量相对较小,且仅限于肾透明细胞癌,可能限制了结果的广泛适用性 探讨硫化物凋亡调控因子在肾透明细胞癌肿瘤微环境中的作用及其对疾病进展和免疫治疗的影响 肾透明细胞癌的肿瘤微环境中的单细胞 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 非负矩阵分解(NMF) RNA 41,784个单细胞,来自7个肾透明细胞癌样本 NA NA NA NA
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