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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 6681 - 6700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6681 | 2024-08-07 |
SAP-expressing T peripheral helper cells identify systemic lupus erythematosus patients with lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1327437
PMID:38550577
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研究论文 | 本文研究了SAP表达的T外周辅助细胞在系统性红斑狼疮（SLE）患者中的作用，特别是与狼疮性肾炎（LN）的关系。 | 首次探讨了SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用，并利用单细胞RNA测序数据验证了其在肾浸润T细胞中的表达。 | NA | 探讨SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMC）和肾浸润T细胞。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 细胞表面标记和细胞内SAP的表达数据 | 30名SLE患者（包括10名LN患者）和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 6682 | 2024-08-07 |
Identification of potential biomarkers for idiopathic pulmonary arterial hypertension using single-cell and bulk RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1328234
PMID:38586587
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序分析，探索特发性肺动脉高压（IPAH）中的细胞异质性和分子病理，并识别潜在的生物标志物 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序数据，首次识别出12个候选生物标志物，并通过RT-qPCR验证了其中5个基因在肺动脉内皮细胞中的表达差异 | NA | 揭示IPAH的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 特发性肺动脉高压（IPAH）的细胞异质性和分子病理 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及三个IPAH数据集和两个额外的PAH数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6683 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of hepatic non-parenchymal cell responses to chronic PFO5DoDA exposure in male mice
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123721
PMID:38462192
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了雄性小鼠肝脏非实质细胞在长期暴露于PFO5DoDA后的异质性反应。 | 首次详细研究了PFO5DoDA对肝脏非实质细胞的影响，揭示了这些细胞在暴露后的异质性反应和相互作用变化。 | 研究仅限于雄性小鼠，且样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 探讨PFO5DoDA暴露对肝脏非实质细胞的异质性影响及其机制。 | 雄性小鼠肝脏非实质细胞在PFO5DoDA暴露后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 15,008个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6684 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling reveals transcriptome dynamics during bovine oocyte growth
2024-Apr-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10234-0
PMID:38580918
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研究论文 | 本研究运用单细胞RNA测序揭示了牛卵母细胞生长过程中的转录组动态变化 | 通过单细胞RNA测序首次揭示了牛卵母细胞各生长阶段关键基因和通路的独特数据集 | 大部分研究集中于已完全成熟的卵母细胞，难以获得早期发育阶段的数据 | 探讨牛卵母细胞从次级卵泡阶段到中腺泡阶段的转录组动态 | 牛卵母细胞，包括不同直径的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 已知直径的卵母细胞（< 60 到 > 120 μm） | NA | NA | NA | NA |
| 6685 | 2024-08-07 |
Targeting pathogenic CD8+ tissue-resident T cells with chimeric antigen receptor therapy in murine autoimmune cholangitis
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46654-5
PMID:38580644
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研究论文 | 本研究使用Il12bIl2ra小鼠（DKO小鼠）作为自身免疫性胆管炎模型，通过Cd8a敲除或抗CD8α抗体治疗预防/减少胆管免疫病理，并开发针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体（CAR）-T细胞疗法。 | 首次描述了针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体（CAR）-T细胞的开发，并证明了其在治疗自身免疫性胆管炎中的潜在疗效。 | NA | 研究CD8 Trm细胞在自身免疫性胆管炎中的致病作用及PD-1靶向CAR-T细胞的潜在治疗用途。 | 自身免疫性胆管炎模型小鼠及CD8 Trm细胞。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Il12bIl2ra小鼠（DKO小鼠）作为模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6686 | 2024-08-07 |
Metacell-based differential expression analysis identifies cell type specific temporal gene response programs in COVID-19 patient PBMCs
2024-Apr-05, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00364-2
PMID:38580667
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，利用元细胞方法分析COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 提出了一种新的计算框架，使用元细胞作为“重复”以增加统计严谨性，并展示了这种方法在保留表达变异性和产生更有生物学意义的差异表达基因（DEGs）方面的优势 | 当前单细胞RNA测序分析存在基因检测数量少、实验成本高导致重复样本不足以及数据分析中将单个细胞视为独立测量导致统计膨胀的问题 | 旨在解决单细胞RNA测序技术在时间序列样本分析中的局限性 | COVID-19患者外周血单个核细胞（PBMCs）中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6687 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of the cancer-associated fibroblast subtypes and their score system for prediction of outcomes and immunosuppressive microenvironment in prostate cancer
2024-Apr-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03305-5
PMID:38580966
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研究论文 | 本文通过综合分析癌症相关成纤维细胞（CAFs）的亚型及其评分系统，预测前列腺癌的预后和免疫抑制微环境 | 开发了一种CAF亚型评分系统，作为前列腺癌和其他癌症类型的预后因子，并有助于区分前列腺癌中不同的免疫抑制机制 | NA | 研究CAF亚型在前列腺癌中的生物学和临床意义，并开发一种评分系统来预测预后和免疫抑制微环境 | 前列腺癌细胞、正常成纤维细胞和CAFs | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从TCGA、MSKCC、CPGEA和GEO数据库收集的序列、基因组和临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6688 | 2024-08-04 |
GPR65 sensing tumor-derived lactate induces HMGB1 release from TAM via the cAMP/PKA/CREB pathway to promote glioma progression
2024-Apr-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03025-8
PMID:38576043
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤衍生乳酸如何影响肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）并促进胶质瘤进展的机制 | 提出了GPR65在TAM上感应乳酸刺激，并通过cAMP/PKA/CREB信号通路促进HMGB1释放，从而促进肿瘤进展的新机制 | 本研究主要集中于体外实验和小鼠模型，缺乏临床样本验证 | 阐明肿瘤衍生乳酸对胶质瘤中TAMs的影响及其调控通路 | 胶质瘤细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, CCK8, 细胞克隆形成, 创伤愈合, 转移实验, 西方印迹, 免疫荧光染色, RT-PCR, ELISA | 小鼠异种移植肿瘤模型 | 基因表达数据，细胞 assays 数据 | 使用TCGA和CGGA数据集进行的生物信息学分析，以及不同实验中细胞类型的相关检测 | NA | NA | NA | NA |
| 6689 | 2024-08-07 |
Correction for Keum et al., Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404416121
PMID:38547069
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6690 | 2024-08-07 |
DELVE: feature selection for preserving biological trajectories in single-cell data
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46773-z
PMID:38553455
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research paper | 本文介绍了一种名为DELVE的无监督特征选择方法，用于在单细胞数据中保留生物学轨迹 | DELVE采用自下而上的方法来减少混杂变异源的影响，并基于核心调控复合体从动态基因或蛋白质模块中建模细胞状态 | NA | 旨在识别能够稳健重现细胞轨迹的分子特征子集 | 单细胞数据中的生物学轨迹 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, iterative immunofluorescence imaging | NA | single-cell data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6691 | 2024-08-07 |
The remission status of AML patients after allo-HCT is associated with a distinct single-cell bone marrow T-cell signature
2024-Mar-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021815
PMID:38197505
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）患者在接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）100天后骨髓T淋巴细胞和CD34+细胞的特征，以识别与即将复发（REL）或持续完全缓解（CR）相关的T细胞特征。 | 研究首次揭示了在allo-HCT后，骨髓T细胞的特定单细胞特征与AML患者的缓解状态相关，并识别出ADGRG1/GPR56作为CR CD8+ T细胞的表面标记物。 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别与AML患者allo-HCT后缓解状态相关的T细胞特征。 | 急性髓系白血病患者的骨髓T淋巴细胞和CD34+细胞。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 6名AML患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6692 | 2024-08-04 |
Modeling interpretable correspondence between cell state and perturbation response with CellCap
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585078
PMID:38558987
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研究论文 | 本研究提出CellCap，一种旨在对单细胞扰动实验进行端到端分析的深度生成模型 | CellCap通过稀疏字典学习将细胞状态特异的扰动响应解构为一组转录响应程序，并通过点积交叉注意力来增强模型的解释能力 | 该研究主要评估CellCap在多个模拟场景下的模型可解释性，可能在某些实际应用中表现不佳 | 揭示细胞状态与扰动响应之间的关系，以深入理解细胞行为 | 使用单细胞转录组学和扰动数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 生成模型 | 转录组数据 | 两个真实的单细胞扰动数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6693 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of layer 4 in visual areas of rhesus macaque cortex
2024-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584345
PMID:38559123
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细研究了猕猴视觉皮层中五个相邻区域的细胞异质性，并开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE。 | 开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE，并首次揭示了猕猴视觉皮层中特定神经元亚型的分布和密度梯度。 | NA | 探索猕猴视觉皮层中相邻区域的细胞异质性和层次结构。 | 猕猴视觉皮层中的V1、V2、V4、MT和TEO区域。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），小分子荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 约100,000个来自视觉区域V1和V4的细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 6694 | 2024-08-07 |
[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts]
2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology
PMID:38583017
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研究论文 | 本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库，对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析 | 首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类，并分析了它们在功能上的异同 | NA | 阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异，为组织修复和再生领域的未来应用提供基础 | 口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | UMAP | 转录组数据 | 四个单细胞数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 6695 | 2024-08-04 |
Direct male development in chromosomally ZZ zebrafish
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1362228
PMID:38529407
|
研究论文 | 本文探讨了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制。 | 揭示了NA斑马鱼在性别决定过程中的直接雄性发育机制，以及性腺发育中不同染色体的作用。 | 研究主要集中于特定的斑马鱼品系，可能无法广泛适用于其他物种。 | 了解NA斑马鱼的性腺发育机制。 | 研究对象为NA斑马鱼及其不同性别的发育过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本和图像 | 19dpf和30dpf的性腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6696 | 2024-08-07 |
Identification and validation of immune and cuproptosis - related genes for diabetic nephropathy by WGCNA and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1332279
PMID:38390317
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研究论文 | 本研究通过WGCNA和机器学习方法，识别并验证了与糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 | 结合机器学习、WGCNA、免疫细胞浸润和PPI分析，首次识别出与铜死亡、免疫和糖尿病肾病相关的三个关键基因 | NA | 探索糖尿病肾病的早期诊断方法，并识别潜在的诊断标志物 | 糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | WGCNA, 机器学习, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 包括GSE30122和GSE30529两个数据集，以及STZ诱导和db/db糖尿病肾病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6697 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47271-y
PMID:38570491
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研究论文 | 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 | 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 | NA | 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 | 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | NA | 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6698 | 2024-08-04 |
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-024-02062-8
PMID:38570797
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研究论文 | 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 | 首次识别低密度脂蛋白（LDL）的失调作为肺纤维化的新风险因素，揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 | 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 | 研究肺纤维化的分子机制，特别是脂质代谢在其中的作用 | 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6699 | 2024-08-04 |
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46625-w
PMID:38570482
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研究论文 | 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 | 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 | 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 | 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 | 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6700 | 2024-08-07 |
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46300-0
PMID:38570531
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research paper | 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法，研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制，对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 | NA | 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |