单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6661 - 6680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6661 | 2024-08-04 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-Feb-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
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研究论文 | 该研究探讨了系统性红斑狼疮患者皮肤纤维母细胞的炎症反应与瘢痕生成之间的关系 | 揭示了系统性红斑狼疮纤维母细胞在炎症反应中的不同表现，为治疗皮肤损伤提供了新靶点 | 研究仅限于小样本量且主要集中在皮肤样本上 | 旨在理解红斑狼疮皮肤纤维母细胞的炎症机制及其在瘢痕疾病中的作用 | 对22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照的皮肤纤维母细胞进行分析 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 22名系统性红斑狼疮及皮肤红斑狼疮患者和34名健康对照 |
| 6662 | 2024-08-04 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-Feb-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
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研究论文 | 本研究调查了在脓疱性汗腺炎（HS）皮损中B细胞的动态和微环境互动 | 首次在HS皮损中识别了三级淋巴结构，并描述了T细胞、B细胞、抗原呈递细胞和皮肤基质之间的有组织互动 | 本研究主要集中在皮损区域，未能广泛评估HS的全身反应 | 探讨B细胞在脓疱性汗腺炎发病机制中的作用及其微环境 | 研究了脓疱性汗腺炎患者皮损中B细胞的活动 | 数字病理学 | 脓疱性汗腺炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 涉及多个脓疱性汗腺炎皮损样本 |
| 6663 | 2024-08-04 |
Genetic correlations, shared risk genes and immunity landscapes between COVID-19 and venous thromboembolism: evidence from GWAS and bulk transcriptome data
2024-Apr, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01857-w
PMID:38433131
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研究论文 | 本研究表征了COVID-19与静脉血栓栓塞（VTE）之间的遗传相关性及共同致病机制 | 首次揭示了COVID-19及VTE之间的遗传相关性和潜在共享基因，识别了TP53I3和SLPI作为关键基因 | 缺乏关于COVID-19和VTE影响的长期临床数据支持 | 旨在探讨COVID-19与VTE之间的遗传关联及其潜在共同机制 | 研究COVID-19和VTE相关的数据集及基因 | 数字病理学 | NA | GWAS，转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 共涉及四个数据集，包含多个样本 |
| 6664 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Potential Mechanisms for Coronary Artery Lesions in Kawasaki Disease
2024-Apr, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320188
PMID:38357816
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了川崎病中冠状动脉病变的发展机制 | 首次揭示了川崎病中冠状动脉病变发展的免疫细胞和炎症因子风暴的作用机制 | 样本量较小，且仅包括儿童患者 | 探讨川崎病中冠状动脉病变的免疫学机制 | 川崎病患者的单核细胞和血小板 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 212,210个外周血单核细胞，来自16名儿童 |
| 6665 | 2024-08-07 |
Predicting mechanism of immune response in microsatellite instability colorectal cancer
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28120
PMID:38545192
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研究论文 | 本研究利用计算程序分析单细胞RNA测序数据，识别出微卫星不稳定性结直肠癌（MSI-CRC）中特定的表达程序，并探讨了这些程序与免疫反应和转移功能的关系 | 首次通过非负矩阵分解（NMF）识别出MSI-CRC特有的三个复发模块，并发现这些模块与代谢和炎症反应功能富集相关 | 研究主要集中在MSI-CRC的免疫反应机制，未涉及微卫星稳定性（MSS）结直肠癌的比较分析 | 探讨微卫星不稳定性结直肠癌中免疫反应的预测机制 | 微卫星不稳定性结直肠癌（MSI-CRC）的免疫反应和转移功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 涉及多个结直肠癌细胞系的单细胞RNA测序数据 |
| 6666 | 2024-08-07 |
A p53 score derived from TP53 CRISPR/Cas9 HMCLs predicts survival and reveals a major role of BAX in the response to BH3 mimetics
2024-Mar-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021581
PMID:38096363
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术从TP53+/+和TP53-/mut t(4;14)人类骨髓瘤细胞系(HMCLs)中衍生出TP53-/-克隆，建立了严格的p53依赖性基因表达谱，并开发了一个功能性p53评分系统，该评分系统涉及13个在p53沉默时特异性下调的基因。 | 本研究首次建立了一个功能性p53评分系统，能够有效识别双等位TP53失活的骨髓瘤患者样本，并预测其总体生存率。此外，研究还发现p53调控的BAX表达对骨髓瘤细胞对BH3模拟物的敏感性有直接影响，并且MCL1和BCL2 BH3模拟物的组合显示出协同效应。 | 研究主要集中在骨髓瘤细胞系和患者样本上，未来需要进一步验证该评分系统在其他癌症类型中的应用。 | 建立一个功能性p53评分系统，以识别双等位TP53失活的骨髓瘤细胞，并研究p53调控的BAX在骨髓瘤细胞对BH3模拟物反应中的作用。 | TP53+/+和TP53-/mut t(4;14)人类骨髓瘤细胞系(HMCLs)，以及骨髓瘤患者样本。 | 数字病理学 | 骨髓瘤 | CRISPR/Cas9技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及17个失调基因，13个特异性下调基因，以及多个骨髓瘤细胞系和患者样本。 |
| 6667 | 2024-08-07 |
Poor clinical outcomes and immunoevasive contexture in CD161+CD8+ T cells barren human pancreatic cancer
2024-Mar-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008694
PMID:38531664
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研究论文 | 本研究探讨了CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌（PDAC）中的预后价值及其分子特征 | 首次确认肿瘤浸润性CD161+CD8+ T细胞作为PDAC独立预后指标，并发现其与CA19-9水平结合可增强生存预测能力 | 需要进一步研究验证CD161+CD8+ T细胞在风险分层和治疗策略优化中的作用 | 阐明CD161+CD8+ T细胞在PDAC中的预后价值及其分子特征 | CD161+CD8+ T细胞在PDAC中的作用 | 肿瘤学 | 胰腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 186名接受根治性切除的PDAC患者 |
| 6668 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune features and viral tropism in the central nervous system of mice infected with Japanese encephalitis virus
2024-Mar-26, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03071-1
PMID:38532383
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了日本脑炎病毒感染小鼠中枢神经系统后的免疫特征和病毒趋向性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了日本脑炎病毒对小鼠大脑中不同神经亚型的病毒趋向性和细胞组成的改变 | NA | 探讨日本脑炎病毒在小鼠中枢神经系统中的作用机制及其对神经损伤和炎症的影响 | 日本脑炎病毒感染的小鼠中枢神经系统细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 88,000个单细胞 |
| 6669 | 2024-08-07 |
Unveiling the functional heterogeneity of cytokine-primed human umbilical cord mesenchymal stem cells through single-cell RNA sequencing
2024-Mar-26, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01219-3
PMID:38532459
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了由不同细胞因子预处理的脐带间充质干细胞的功能异质性及其分子机制 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了细胞因子预处理对间充质干细胞异质性、生物功能及其功能亚群的调控作用 | NA | 揭示细胞因子预处理的间充质干细胞的细胞异质性、功能亚群及分子机制 | 脐带间充质干细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及IFN-γ、TNF-α、IL-4、IL-6、IL-15和IL-17预处理的脐带间充质干细胞 |
| 6670 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Small Cell Neuroendocrine Carcinoma of the Endometrium Reveals ISL1 as a Potential Biomarker for Diagnosis and Treatment
2024-Mar-13, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2903100
PMID:38538277
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了子宫内膜小细胞神经内分泌癌的转录组，揭示了ISL1作为潜在的诊断和治疗生物标志物 | 首次在子宫内膜小细胞神经内分泌癌中探讨了ISL1的表达及其作为生物标志物的潜力 | 研究样本量较小，仅基于单一病例的样本进行分析 | 探索子宫内膜小细胞神经内分泌癌的诊断和治疗标志物 | 子宫内膜小细胞神经内分泌癌及其细胞内的ISL1表达 | 数字病理学 | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单一病例样本 |
| 6671 | 2024-08-04 |
Ferroptosis-Related lncRNA to Predict the Clinical Outcomes and Molecular Characteristics of Kidney Renal Papillary Cell Carcinoma
2024-Feb-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46030123
PMID:38534739
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研究论文 | 该研究构建了一种基于铁死亡相关的长非编码RNA风险评分模型，用于预测肾脏肾小管细胞癌的临床结果和分子特征 | 提出了一种新的肾脏肾小管细胞癌亚型，并开发了准确的预后模型 | 未提及具体的限制因素 | 研究肾脏肾小管细胞癌的预后与分子特征 | 肾脏肾小管细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾脏癌症 | 单细胞转录组学 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 基于TCGA-KIRP数据集 |
| 6672 | 2024-08-04 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-Feb-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
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研究论文 | 这篇文章研究了神经母细胞瘤中转移性骨髓的单细胞特征，揭示了微环境重塑和转移特征 | 引入单细胞RNA测序技术，分析了转移性骨髓微环境中的免疫细胞群体重塑和基因表达变化 | 该研究仅集中于神经母细胞瘤的转移性骨髓，未涉及其他部位的转移或不同类型的肿瘤 | 理解神经母细胞瘤转移微环境的细胞和分子机制，以改善临床结果 | 转移性和非转移性神经母细胞瘤患者的免疫细胞和肿瘤细胞变化 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个独立的神经母细胞瘤队列 |
| 6673 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2024-Feb-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179067
PMID:38329132
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6674 | 2024-08-07 |
Comparative study on differential expression analysis methods for single-cell RNA sequencing data with small biological replicates: Based on single-cell transcriptional data of PBMCs from COVID-19 severe patients
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299358
PMID:38536877
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研究论文 | 本文比较了在生物学重复样本较少的情况下，八种差异表达分析（DEA）方法在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的适应性 | 提出了基于信息熵的新方法DEF-scRNA-seq，在生物学重复样本较少的情况下具有显著优势 | NA | 评估和比较在生物学重复样本较少的情况下，不同差异表达分析方法的性能 | COVID-19重症患者的PBMCs单细胞转录组数据 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 生物学重复样本较少 |
| 6675 | 2024-08-04 |
MDFI promotes the proliferation and tolerance to chemotherapy of colorectal cancer cells by binding ITGB4/LAMB3 to activate the AKT signaling pathway
2024-12-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2024.2314324
PMID:38375821
|
研究论文 | 本研究探讨了MDFI通过结合ITGB4/LAMB3激活AKT信号通路以促进结直肠癌细胞的增殖和化疗耐受性 | 发现MDFI与ITGB4/LAMB3之间的正相关关系以及其在AKT信号通路中的新作用 | 缺乏大规模临床样本的验证 | 研究MDFI在结直肠癌细胞中的作用及其机制 | 结直肠癌细胞及其相关的信号通路 | 数字病理学 | 结直腸癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 使用了来自GSE144735数据集的样本和TCGA及CCLE数据 |
| 6676 | 2024-08-07 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了程序性死亡配体1（PD-L1）在胶原诱导性关节炎（CIA）小鼠模型中对关节稳态的作用 | 首次揭示了PD-L1+巨噬细胞在关节炎中的保护作用，并展示了其在人类滑膜中的存在 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的直接应用可能存在局限性 | 研究PD-L1在关节炎中的作用及其对关节稳态的影响 | PD-L1在胶原诱导性关节炎中的表达及其对关节炎严重程度的影响 | NA | 关节炎 | 流式细胞术，逆转录-聚合酶链反应，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用CIA小鼠模型和人类滑膜样本进行研究 |
| 6677 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell analysis reveals heterogeneity of fibroblast subpopulations in ovarian cancer tissue microenvironment
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27873
PMID:38533040
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研究论文 | 该研究揭示了卵巢癌组织微环境中成纤维细胞亚群的异质性。 | 首次较为全面地分析了卵巢癌组织微环境中成纤维细胞亚群的特性及其在TGFβ信号通路中的功能。 | 对成纤维细胞亚群的特定功能了解仍然不够充分。 | 探讨卵巢癌组织中成纤维细胞亚群的异质性及其在癌症进展中的作用。 | 卵巢癌组织样本中的成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | RNA-seq | 32个卵巢癌样本和3226个公共数据库中的大规模RNA-seq数据 |
| 6678 | 2024-08-04 |
Modulator of TMB-associated immune infiltration (MOTIF) predicts immunotherapy response and guides combination therapy
2024-Mar-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.01.025
PMID:38320897
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研究论文 | 本研究开发了一种新工具MOTIF，用于预测免疫疗法响应并指导联合治疗 | MOTIF将肿瘤突变负担(TMB)与CD8 T细胞浸润之间的关系进行了综合分析，提供了新的预测模型 | 该研究主要基于已有的RNA-seq数据，没有进行前瞻性临床试验 | 研究旨在提高TMB水平高的癌症患者对免疫检查点抑制剂的响应 | 研究对象是9311个肿瘤样本及84个单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | 肿瘤 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 9311个肿瘤样本和84个人类单细胞RNA-seq数据集 |
| 6679 | 2024-08-07 |
Prognostic prediction using a gene signature developed based on exhausted T cells for liver cancer patients
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28156
PMID:38533068
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研究论文 | 本研究基于T细胞耗竭的关键预后基因开发了一个用于肝癌患者的预后预测模型 | 利用单细胞RNA测序数据和基因共表达网络分析，结合Lasso和多/单变量Cox分析构建了一个新的风险评分系统，并开发了一个能够预测不同风险组免疫浸润和免疫治疗敏感性的诺模图 | NA | 开发一个基于T细胞耗竭的关键预后基因的预后预测模型，以改善肝癌患者的临床治疗 | 肝癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分系统 | 单细胞RNA测序数据 | 18,413个细胞 |
| 6680 | 2024-08-07 |
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for single-cell ATAC Sequencing Data
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543296
PMID:37333088
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研究论文 | 介绍scATAnno，一个用于自动注释scATAC-seq数据的Python包 | scATAnno通过整合查询数据与参考图谱，无需使用scRNA-seq数据即可实现准确的细胞类型注释，并引入了基于KNN和加权距离的不确定性评分来提高注释准确性 | NA | 开发一个自动注释scATAC-seq数据的工具 | scATAC-seq数据中的细胞类型 | 单细胞测序 | NA | scATAC-seq | KNN | scATAC-seq数据 | 多个数据集，包括外周血单个核细胞（PBMC）、三阴性乳腺癌（TNBC）和基底细胞癌（BCC） |