单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6641	2024-08-07	Adipose stem cells control obesity-induced T cell infiltration into adipose tissue 2024-Mar-26, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113963 PMID:38492218	研究论文	本研究探讨了脂肪干细胞（ASCs）在肥胖诱导的脂肪组织中T细胞浸润的作用	首次揭示了脂肪干细胞通过上调C-C基序趋化因子配体5（CCL5）在肥胖早期阶段调控T细胞积累的关键作用	NA	阐明肥胖诱导的脂肪组织中T细胞浸润的机制	脂肪干细胞和T细胞	NA	肥胖	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用肥胖小鼠的脂肪干细胞和骨髓进行移植实验
6642	2024-08-07	scRNA-Seq: First Atlas and Cellular Landscape of Lacrimal Sac: Implications in Primary Acquired Nasolacrimal Duct Obstruction Pathogenesis 2024-Mar-05, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.65.3.38 PMID:38551583	研究论文	本研究旨在描述原发性获得性鼻泪管阻塞（PANDO）患者泪囊中个体细胞成分的转录变化，并尝试构建首个泪囊细胞图谱，以阐明可能驱动疾病发病机制的潜在机制。	本研究首次构建了泪囊细胞图谱，并揭示了T细胞、B细胞和上皮细胞在炎症反应中的作用以及细胞间信号网络的构建。	NA	描述PANDO患者泪囊中个体细胞成分的转录变化，并构建泪囊细胞图谱以阐明疾病发病机制。	泪囊样本中的个体细胞群体，包括上皮细胞和免疫细胞。	数字病理学	鼻泪管阻塞	单细胞RNA测序	NA	细胞	5名患者的泪囊样本，共25,791个细胞
6643	2024-08-07	Identification of TIMPs signatures in Randall plaque from single-cell RNA sequencing (scRNA-Seq) analysis 2024-Jan-16, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-024-01296-0 PMID:38225514	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
6644	2024-08-07	Single-cell atlas of the small intestine throughout the human lifespan demonstrates unique features of fetal immune cells 2024-Mar-28, Mucosal immunology IF:7.9Q1 DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.011 PMID:38555026	研究论文	本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，创建了人类小肠在整个生命周期中的转录组图谱，特别关注免疫细胞，并揭示了胎儿期小肠免疫细胞的独特特征	首次展示了胎儿小肠免疫细胞的复杂免疫景观，并识别了其在整个生命周期中的变化	NA	探讨人类小肠黏膜免疫系统的发育过程及其在不同生命阶段的特点	人类小肠的免疫细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	涵盖从第一孕期到成年的多个样本
6645	2024-08-07	T cells with increased responsiveness cause obesity in mice without diet intervention 2024-Apr-19, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109471 PMID:38551005	研究论文	本研究使用增强T细胞反应性的老鼠模型，展示了肥胖可以通过免疫细胞驱动	首次证明增强的T细胞反应性可以直接导致肥胖，无需饮食干预	研究仅限于老鼠模型，尚未在人类中验证	探讨肥胖的免疫细胞机制，特别是T细胞的作用	增强T细胞反应性的老鼠模型	NA	肥胖	单细胞RNA测序和CyTOF分析	NA	细胞	多个老鼠模型
6646	2024-08-04	Systematic immune cell dysregulation and molecular subtypes revealed by single-cell RNA-seq of subjects with type 1 diabetes 2024-Mar-27, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01300-z PMID:38539228	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病患者的免疫细胞失调及其分子亚型	首次在单细胞层面全面评估1型糖尿病中的免疫细胞表型	可能缺乏其他类型糖尿病的对照数据	评估1型糖尿病的免疫细胞特征及分子亚型	46名明显的1型糖尿病患者和31名匹配的对照者	数字病理学	1型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	46名1型糖尿病患者和31名对照者
6647	2024-08-07	Pan-cancer evaluation of regulated cell death to predict overall survival and immune checkpoint inhibitor response 2024-Mar-27, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-024-00570-5 PMID:38538696	研究论文	本研究评估了调控细胞死亡（RCD）在泛癌水平上的状态及其与免疫检查点抑制剂（ICI）反应和总体生存率的关系	首次在泛癌水平上全面评估RCD状态及其相关特征，并开发了用于预测ICI反应和总体生存率的RCD签名	NA	探索RCD状态作为预测恶性肿瘤患者ICI反应和总体生存率的生物标志物的潜力	RCD水平在30种癌症类型、29种正常组织和82个scRNA-Seq数据集中的2,573,921个细胞中的分布	数字病理学	泛癌	scRNA-Seq	机器学习算法	数据集	30种癌症类型，29种正常组织，2,573,921个细胞
6648	2024-08-04	Cell Heterogeneity and Variability in Peripheral Nerve after Injury 2024-Mar-20, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25063511 PMID:38542483	综述	本文总结了外周神经损伤后的细胞异质性和变异性。	本研究通过总结当前的测序数据，揭示了外周神经中特别是坐骨神经的细胞异质性。	没有提到具体的实验数据，主要依赖于现有文献的汇总。	研究外周神经的细胞组成和其在损伤后的变化。	探讨施旺细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞的细胞变异。	数字病理学	NA	单细胞测序技术	NA	测序数据	NA
6649	2024-08-07	Subepithelial Stromal Cells: Their Roles and Interactions with Intestinal Epithelial Cells during Gut Mucosal Homeostasis and Regeneration 2024-Mar-17, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12030668 PMID:38540281	综述	本文综述了肠道黏膜稳态和再生过程中上皮下基质细胞与肠上皮细胞的相互作用及其功能	利用单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、共聚焦显微镜和计算重构等新技术，识别和表征了特定的肠道间质干细胞亚群	由于缺乏大多数功能同质亚群的特异性标记，探索这些异质性肠道间质干细胞的功能仍然具有挑战性	旨在理解调控这些细胞激活的细胞途径及其在肠上皮再生过程中的相互作用	肠道间质干细胞及其在肠道形态发生、稳态和再生中的作用	NA	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 共聚焦显微镜	NA	NA	NA
6650	2024-08-04	Unique Spatial Transcriptomic Profiling of the Murine Femoral Fracture Callus: A Preliminary Report 2024-Mar-16, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13060522 PMID:38534368	研究论文	本文探讨了小鼠股骨骨折愈合过程中独特的空间转录组特征	使用Visium CytAssist空间转录组平台提供了首次空间完整的基因表达变化特征	未提及研究的具体限制	研究骨折愈合过程中基因表达的动态变化及其空间分布	采用BALB/c小鼠模型及其在转移性乳腺癌影响下的骨折愈合情况	数字病理学	乳腺癌	空间转录组技术	NA	组织切片	BALB/c小鼠的样本，具体数量未提及
6651	2024-08-04	A Retrospective View of the Triple-Negative Breast Cancer Microenvironment: Novel Markers, Interactions, and Mechanisms of Tumor-Associated Components Using Public Single-Cell RNA-Seq Datasets 2024-Mar-16, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers16061173 PMID:38539508	研究论文	该文章回顾了三阴性乳腺癌的肿瘤微环境，探讨了新的标记物、相互作用及相关机制	通过公共单细胞RNA测序数据集发现了特定的TNBC标记和细胞类型间的相互作用	该研究使用了公共数据集，可能限制了对特定临床背景的分析	寻找新的治疗靶点，以更好地理解三阴性乳腺癌的肿瘤微环境	分析三阴性乳腺癌肿瘤细胞及其微环境中的不同细胞类型	数字病理学	三阴性乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	利用公共单细胞RNA测序数据集分析多种细胞类型
6652	2024-08-07	Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Elucidate the Etiology of Severe COVID-19 2024-Mar-14, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25063280 PMID:38542251	研究论文	本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，探讨了严重COVID-19的潜在病因及其与系统性自身免疫疾病的相似性	本研究首次综合分析了批量和单细胞RNA测序数据，揭示了严重COVID-19与炎症相关基因的上调关系	NA	阐明严重COVID-19的病因	严重COVID-19的基因表达模式及其与炎症综合征的关联	数字病理学	COVID-19	RNA测序	NA	基因表达数据	27项研究和8项meta分析的数据
6653	2024-08-04	Unveiling Shared Immune Responses in Porcine Alveolar Macrophages during ASFV and PRRSV Infection Using Single-Cell RNA-seq 2024-Mar-12, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms12030563 PMID:38543614	研究论文	本研究揭示了非洲猪瘟病毒（ASFV）和猪繁殖与呼吸综合症病毒（PRRSV）感染期间猪肺泡巨噬细胞的共同免疫反应	首次比较了ASFV和PRRSV感染后猪肺泡巨噬细胞共享的免疫反应	本研究可能仅适用于特定的细胞类型和病毒模型，结果的普遍性尚待验证	研究ASFV和PRRSV感染对猪肺泡巨噬细胞免疫反应的影响	猪肺泡巨噬细胞（PAMs）在ASFV和PRRSV感染后的反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	使用两个单细胞转录组数据集
6654	2024-08-04	Exploring Transcriptional Regulation of Beta Cell SASP by Brd4-Associated Proteins and Cell Cycle Control Protein p21 2024-Mar-06, Epigenomes IF:2.5Q3 DOI:10.3390/epigenomes8010010 PMID:38534794	研究论文	这篇文章探讨了Brd4相关蛋白和细胞周期控制蛋白p21对β细胞SASP的转录调控。	揭示了Brd4与多种蛋白绑定，并探讨了p21在β细胞SASP机制中的作用。	在NIT-1细胞中，p21的RNAi干扰对细胞活力或SASP没有显著影响，这可能限制了对p21功能的全面理解。	探讨在1型糖尿病模型中β细胞SASP的转录调控机制。	使用NOD小鼠模型的β细胞系NIT-1作为研究对象。	数字病理学	1型糖尿病	RNA干扰	NA	单细胞RNA测序数据	NOD小鼠模型中的小鼠β细胞和来自对照、自身抗体阳性及1型糖尿病供体的人类β细胞
6655	2024-08-04	Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data 2024-Mar, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-024-00597-5 PMID:38438786	研究论文	该文章介绍了一种名为SCORPION的工具，通过高通量单细胞转录组数据重建可比较的基因调控网络	SCORPION使用信息传递算法重建基因调控网络，并在合成数据上优于12种现有技术，显示其准确识别不同细胞间调控网络差异的能力	文章未讨论SCORPION在不同生物背景下的适应性	研究旨在实现单细胞RNA测序数据在群体水平的基因调控网络比较	文章研究了来自结直肠癌及其相邻健康组织的200,436个单细胞的基因调控网络	数字病理学	结直肠癌	RNA-seq	NA	单细胞 RNA 测序数据	200,436个单细胞
6656	2024-08-07	Schnurri-3 controls osteogenic fate of Adipoq-lineage progenitors in bone marrow 2024-Mar, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.jot.2024.01.008 PMID:38549808	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，探讨了Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的作用及其对骨形成和骨折愈合的影响	首次揭示了Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的功能，及其对骨形成和骨折愈合的促进作用	研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证其临床应用潜力	探讨Schnurri-3在Adipoq谱系前体细胞中的作用及其对骨形成和骨折愈合的影响	Adipoq谱系前体细胞和Schnurri-3基因	NA	骨质疏松症	单细胞RNA测序	基因敲除小鼠模型	RNA序列数据	小鼠和人类样本
6657	2024-08-07	Revisiting Multi-Omics Data to Unravel Galectins as Prognostic Factors in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma 2024-Feb-27, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12030529 PMID:38540141	研究论文	本研究重新审视多组学数据，以揭示半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后因子	本研究通过单细胞RNA测序分析了半乳糖凝集素在肿瘤微环境中的表达及其对预后的影响，并展示了其在预测HPV和突变状态、分层HNSCC预后和预测治疗反应中的三重功能	本研究强调需要进一步研究以评估半乳糖凝集素在HNSCC中的作用，并明确个体半乳糖凝集素在患者分层中的角色	评估半乳糖凝集素作为头颈鳞状细胞癌的预后生物标志物	头颈鳞状细胞癌中的半乳糖凝集素表达及其与HPV和突变状态的关系	数字病理学	头颈鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
6658	2024-08-04	A Keratin 12 Expression-Based Analysis of Stem-Precursor Cells and Differentiation in the Limbal-Corneal Epithelium Using Single-Cell RNA-Seq Data 2024-Feb-26, Biology DOI:10.3390/biology13030145 PMID:38534415	研究论文	这篇文章分析了在单细胞RNA测序数据基础上，角膜上皮中的干前体细胞和分化过程，特别是角蛋白12（Krt12）的表达情况	本研究揭示了角膜上皮分化过程中Krt12表达变化的独特四个步骤，并提供了多种基因组群的识别	这篇文章未提及样本的多样性或外部验证的必要性	旨在探究角膜上皮中干前体细胞的特性及分化机制	研究对象为角膜上皮中的干前体细胞及其分化过程	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	NA
6659	2024-08-07	Comprehensive Transcriptomic Profiling of Diverse Brain Tumor Types Uncovers Complex Structures of the Brain Tumor Microenvironment 2024-Feb-23, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines12030506 PMID:38540119	研究论文	本研究分析了六种脑肿瘤类型（脑膜瘤、星形细胞瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤）的转录组结构，以揭示脑肿瘤微环境的复杂结构	通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫相关基因的无监督聚类，揭示了脑肿瘤微环境中免疫细胞类型的差异分布及其对治疗的反应	NA	提供克服脑肿瘤治疗脆弱性的潜在指导方针	脑肿瘤微环境的转录组结构	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	六种脑肿瘤类型的细胞群体
6660	2024-08-04	SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics 2024-Feb-22, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom14030265 PMID:38540686	研究论文	本研究揭示了SPINK1在肝细胞癌治疗抵抗中的作用	首次阐明了SPINK1在肝细胞癌化疗抵抗中的关键角色，并确定其作为潜在治疗靶点	对SPINK1影响的机制理解仍然有限，尚需进一步的研究	探究SPINK1对肝细胞癌化疗抵抗的影响	肝细胞癌患者的细胞和组织样本	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序和空间转录组学	NA	RNA数据	来自两个肝细胞癌队列的单细胞样本