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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6621 | 2024-08-04 |
Dissecting the spatiotemporal diversity of adult neural stem cells
2024-Apr, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00022-z
PMID:38365956
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研究论文 | 本研究探讨了成体神经干细胞的时空多样性 | 该研究结合单细胞转录组学和在体RNA代谢标记技术,揭示了成体神经干细胞的组织原则 | 本研究主要集中于斑马鱼大脑,限制了其对其他类型动物的适用性 | 研究成体神经干细胞的功能状态及其在空间和时间上的调节 | 成体斑马鱼大脑中的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、在体RNA代谢标记 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼大脑不同区域的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6622 | 2024-08-04 |
Deciphering cutaneous melanoma prognosis through LDL metabolism: Single-cell transcriptomics analysis via 101 machine learning algorithms
2024-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15070
PMID:38570935
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研究论文 | 本文探讨了低密度脂蛋白(LDL)代谢与皮肤黑色素瘤之间的关系 | 结合机器学习算法构建的LDL相关特征,可以用于评估皮肤黑色素瘤患者的预后和免疫状态 | 未提及具体的临床验证和应用,可能限制了结果的广泛适用性 | 调查低密度脂蛋白在皮肤黑色素瘤中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 分析与低密度脂蛋白代谢相关的基因及其在皮肤黑色素瘤细胞中的表现 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序、bulk-RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 使用了多个数据集,包括GSE215120,TCGA,GSE19234,GSE22153和GSE65904 | NA | NA | NA | NA |
| 6623 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of rosmarinic acid on diabetic nephropathy-induced kidney injury by modulating oxidative stress and inflammation
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.01.003
PMID:38572101
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研究论文 | 本研究探讨了迷迭香酸对糖尿病肾病诱导的肾损伤的改善作用 | 揭示了单细胞层次上迷迭香酸对肾损伤的多样性反应及其机制 | 研究可能未涵盖所有与糖尿病肾病相关的细胞反应 | 探讨迷迭香酸在糖尿病肾病中改善肾脏损伤的作用 | 糖尿病肾病诱导的肾损伤及迷迭香酸的治疗效果 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6624 | 2024-08-07 |
Monocyte state 1 (MS1) cells in critically ill patients with sepsis or non-infectious conditions: association with disease course and host response
2024-03-19, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-024-04868-5
PMID:38504349
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞状态1(MS1)细胞在重症监护病房(ICU)中患有脓毒症或非感染性疾病的患者中的分布及其与疾病进程和宿主反应的关系 | 首次使用转录组反卷积方法(CIBERSORTx)评估MS1细胞在脓毒症患者中的比例,并研究其与疾病严重程度和宿主反应失调的关系 | 研究未区分MS1细胞在幸存者和非幸存者之间或二次感染患者之间的差异 | 确定MS1细胞特征与疾病表现、预后和宿主反应特征之间的关联 | 脓毒症患者和ICU中无感染的患者 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 332名脓毒症患者和215名无感染的ICU患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6625 | 2024-08-04 |
Phylogenomic position of eupelagonemids, abundant, and diverse deep-ocean heterotrophs
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae040
PMID:38457644
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研究论文 | 本研究探讨了深海异养原生生物Eupelagonemids的系统发育位置 | 研究通过单细胞转录组技术揭示了Eupelagonemids的多样性及其与其他分类群的关系 | 目前对Eupelagonemids的培养和研究仍然有限,数据主要来自光学显微镜图像和部分基因序列 | 确定Eupelagonemids在真核生物树中的位置,并填补其生物学信息的缺失 | 研究对象为两种Eupelagonemid细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因序列 | 两个Eupelagonemid细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6626 | 2024-08-04 |
Single-cell Sequencing Data Reveals Aggressive CD68-type Macrophages and Prognostic Models in Bladder Cancer
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中激进CD68型巨噬细胞及其预后模型 | 研究首次利用单细胞测序数据鉴定了膀胱癌中的预后生物标志物,并构建了膀胱癌预后风险指导系统 | 研究主要基于公共数据库的数据,可能存在样本选择偏差 | 研究膀胱癌中相关免疫细胞类型与侵袭性之间的关系以及建立预后管理系统 | 以膀胱癌为研究对象,分析与其侵袭性相关的CD68型巨噬细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | COX回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌细胞测序数据,具体样本数量未注明 | NA | NA | NA | NA |
| 6627 | 2024-08-04 |
Identification of Key Genes in Angiogenesis of Breast and Prostate Cancers in the Context of Different Cell Types
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 这篇文章识别了在乳腺癌和前列腺癌的不同细胞类型中,与血管生成相关的关键基因 | 文章揭示了不同细胞类型中血管生成相关基因模块的过表达模式 | 没有具体提到研究的局限性 | 研究不同细胞类型如何影响血管生成过程 | 前列腺癌和乳腺癌样本中的血管生成相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了乳腺癌和前列腺癌样本中的单细胞RNA-Seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6628 | 2024-08-07 |
Penile cavernous sinusoids are Prox1-positive hybrid vessels
2024-Jan-01, Vascular biology (Bristol, England)
DOI:10.1530/VB-23-0014
PMID:38051669
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研究论文 | 本文鉴定了阴茎海绵体窦状血管为表达淋巴内皮细胞身份基因Prox1、Vegfr3和Lyve1的新型混合血管床 | 发现了阴茎海绵体窦状血管作为新的混合血管床,并揭示了其在糖尿病相关勃起功能障碍中的转录变化 | NA | 详细描述混合阴茎海绵体窦状血管的分子特征,并为治疗失调的阴茎血管疾病提供分子靶点 | 阴茎海绵体窦状血管的混合特性及其在勃起功能障碍中的作用 | NA | 勃起功能障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类阴茎海绵体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 6629 | 2024-08-07 |
Inflammasome signaling is dispensable for ß-amyloid-induced neuropathology in preclinical models of Alzheimer's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1323409
PMID:38352874
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研究论文 | 本文评估了在阿尔茨海默病(AD)的ß-淀粉样蛋白诱导的神经病理学模型中,炎症小体信号在体内的作用 | 研究结果质疑了炎症小体激活在预临床淀粉样蛋白模型中的普遍作用 | 研究仅限于特定的鼠标模型,可能不适用于所有AD模型 | 探讨炎症小体信号在ß-淀粉样蛋白诱导的AD神经病理学中的作用 | APP/PS1和AppNL-G-F鼠标模型中的微胶质细胞和全身炎症小体信号 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个鼠标模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6630 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用,通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用,包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6631 | 2024-08-04 |
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyae003
PMID:38567293
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综述 | 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 | 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现,包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 | 该综述未提供新的实验数据或实验结果 | 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 | 各种物种的嗜碱细胞发育过程 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6632 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法,探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6633 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6634 | 2024-08-07 |
FANCD2 deficiency sensitizes SHH medulloblastoma to radiotherapy via ferroptosis
2024-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6245
PMID:38229567
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研究论文 | 研究探讨了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的表达及其对放射治疗敏感性的影响 | 首次揭示了FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的高表达及其通过诱导铁死亡增强放射治疗敏感性的机制 | 研究主要集中在细胞和小鼠模型上,尚未在临床试验中验证 | 探究FANCD2在SHH型髓母细胞瘤中的作用及其对放射治疗的影响 | SHH型髓母细胞瘤细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 38个髓母细胞瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6635 | 2024-08-07 |
Mustn1 is a smooth muscle cell-secreted microprotein that modulates skeletal muscle extracellular matrix composition
2024-Apr, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101912
PMID:38458566
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研究论文 | 本研究探讨了Mustn1蛋白在骨骼肌重塑和修复中的作用,特别是在肌肉萎缩和代偿性肥大转变中的功能。 | 发现Mustn1是一种由平滑肌细胞分泌的微蛋白,参与调节骨骼肌细胞外基质的组成,这一发现扩展了Mustn1的功能范围。 | 尚未完全探索Mustn1在肌肉损伤和肌营养不良中的纤维化和免疫浸润作用,以及其作为治疗干预的潜力。 | 旨在识别调节肌肉萎缩到代偿性肥大或损伤恢复转变的基因和分子途径。 | 使用后肢卸载和重载的小鼠模型,研究骨骼肌在萎缩和代偿性再生及肥大过程中的基因和蛋白表达变化。 | NA | NA | qRT-PCR, 免疫组织化学, 批量和单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 细胞外液蛋白组 | 包括Mustn1缺陷型遗传小鼠模型和野生型同窝小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6636 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing reveals a novel signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2024-04-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57714-7
PMID:38561388
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,识别出基于NK细胞标记基因的新型特征,用于预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次建立了基于NK细胞标记基因的12基因特征,用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究仅在TCGA和GEO数据集上进行了验证,未来需要在更多独立数据集上进行进一步验证 | 旨在建立基于NK细胞标记基因的可靠特征,为评估胃癌患者的免疫治疗和预后提供新视角 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 共分析了1560个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6637 | 2024-08-07 |
Identification of genetic modifiers enhancing B7-H3-targeting CAR T cell therapy against glioblastoma through large-scale CRISPRi screening
2024-Apr-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03027-6
PMID:38561797
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研究论文 | 本研究通过大规模CRISPRi筛选,识别增强B7-H3靶向CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤的遗传修饰因子 | 发现了一系列遗传修饰因子,如ARPC4、PI4KA、ATP6V1A、UBA1和NDUFV1,这些因子调节CAR T细胞介导的肿瘤杀伤效果,并揭示了TNFSF15在调节肿瘤-CAR T细胞相互作用中的免疫刺激作用 | NA | 提高CAR T细胞疗法在胶质母细胞瘤中的疗效 | 胶质母细胞瘤细胞系U87 MG细胞与B7-H3靶向CAR T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CRISPRi筛选 | NA | RNA测序数据 | 大规模细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 6638 | 2024-08-07 |
Monocytes Release Pro-Cathepsin D to Drive Blood-to-Brain Transcytosis in Diabetes
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323622
PMID:38420756
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研究论文 | 研究探讨了单核细胞释放的前胱天蛋白酶D在糖尿病中驱动血液到大脑的转胞吞作用中的作用 | 发现了循环中的前胱天蛋白酶D在糖尿病脑微血管病变发病机制中的新作用 | NA | 确定2型糖尿病进展中微血管并发症的潜在机制 | 人类单核细胞样本和表达人胱天蛋白酶D的转基因小鼠 | NA | 糖尿病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA | 控制组和糖尿病患者的单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6639 | 2024-08-07 |
Versican Promotes Cardiomyocyte Proliferation and Cardiac Repair
2024-03-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 首次揭示了versican作为心脏成纤维细胞来源的促进增殖的蛋白聚糖,并阐明了其在促进成年心脏修复中的作用 | NA | 探究versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 新生和成年小鼠的心脏 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、液相色谱-质谱分析、Western blot、免疫染色、定量逆转录聚合酶链反应、Masson三色染色、超声心动图 | NA | NA | 新生和成年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6640 | 2024-08-07 |
DESP demixes cell-state profiles from dynamic bulk molecular measurements
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100729
PMID:38490205
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research paper | 本文介绍了一种名为DESP的算法,该算法利用单细胞RNA测序等独立估计的细胞状态比例,解析细胞状态对批量分子测量(特别是定量蛋白质组学)的相对贡献 | DESP算法能够从批量分子测量中准确重建细胞状态特征,为研究细胞状态水平的蛋白质组和其他分子谱提供了一个可推广的计算框架 | NA | 开发一种算法,用于解析细胞状态对批量分子测量的贡献,并提供对细胞状态水平分子谱的研究方法 | 细胞状态对批量分子测量的贡献,特别是蛋白质组和转录组的测量 | machine learning | NA | single-cell RNA sequencing, quantitative proteomics | DESP algorithm | proteome, transcriptome | NA | NA | NA | NA | NA |