单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6601 - 6620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6601 | 2024-08-07 |
Monocytes Release Pro-Cathepsin D to Drive Blood-to-Brain Transcytosis in Diabetes
2024-Mar-29, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323622
PMID:38420756
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研究论文 | 研究探讨了单核细胞释放的前胱天蛋白酶D在糖尿病中驱动血液到大脑的转胞吞作用中的作用 | 发现了循环中的前胱天蛋白酶D在糖尿病脑微血管病变发病机制中的新作用 | NA | 确定2型糖尿病进展中微血管并发症的潜在机制 | 人类单核细胞样本和表达人胱天蛋白酶D的转基因小鼠 | NA | 糖尿病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA | 控制组和糖尿病患者的单核细胞样本 |
| 6602 | 2024-08-07 |
Versican Promotes Cardiomyocyte Proliferation and Cardiac Repair
2024-03-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 首次揭示了versican作为心脏成纤维细胞来源的促进增殖的蛋白聚糖，并阐明了其在促进成年心脏修复中的作用 | NA | 探究versican在心肌细胞增殖和心脏修复中的作用 | 新生和成年小鼠的心脏 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、液相色谱-质谱分析、Western blot、免疫染色、定量逆转录聚合酶链反应、Masson三色染色、超声心动图 | NA | NA | 新生和成年小鼠 |
| 6603 | 2024-08-07 |
DESP demixes cell-state profiles from dynamic bulk molecular measurements
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100729
PMID:38490205
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research paper | 本文介绍了一种名为DESP的算法，该算法利用单细胞RNA测序等独立估计的细胞状态比例，解析细胞状态对批量分子测量（特别是定量蛋白质组学）的相对贡献 | DESP算法能够从批量分子测量中准确重建细胞状态特征，为研究细胞状态水平的蛋白质组和其他分子谱提供了一个可推广的计算框架 | NA | 开发一种算法，用于解析细胞状态对批量分子测量的贡献，并提供对细胞状态水平分子谱的研究方法 | 细胞状态对批量分子测量的贡献，特别是蛋白质组和转录组的测量 | machine learning | NA | single-cell RNA sequencing, quantitative proteomics | DESP algorithm | proteome, transcriptome | NA |
| 6604 | 2024-08-07 |
Anchored-fusion enables targeted fusion search in bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Mar-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100733
PMID:38503288
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Anchored-fusion的高灵敏度融合基因检测工具，该工具能够锚定感兴趣的基因并恢复传统算法通常过滤掉的短读序列匹配 | Anchored-fusion包含基于深度学习层次结构的模块，采用自蒸馏学习（HVLD）有效过滤假阳性融合片段，同时保持真实融合基因 | NA | 开发一种高灵敏度的融合基因检测工具，适用于低测序深度的应用 | 融合基因的检测 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA |
| 6605 | 2024-08-04 |
EIF2Ss, a Novel c-Myc-Correlated Gene Family, is Associated with Poor Prognosis and Immune Infiltration in Pancreatic Adenocarcinoma
2024-Mar-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2903119
PMID:38538250
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研究论文 | 本研究分析了EIF2S基因家族在胰腺腺癌中的诊断、预后和治疗中的作用 | 发现EIF2S在胰腺腺癌组织中高表达，并与不良预后和免疫浸润相关 | 尚未报告EIF2S在PAAD中的具体功能机制 | 探讨EIF2S基因家族与胰腺腺癌的关系 | 胰腺腺癌患者的基因表达和生存情况 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能富集分析，免疫共沉淀，质谱分析，西方印迹 | NA | 基因表达数据 | 基于TCGA数据库，具体样本数未提供 |
| 6606 | 2024-08-04 |
Construction of an immune predictive model and identification of TRIP6 as a prognostic marker and therapeutic target of CRC by integration of single-cell and bulk RNA-seq data
2024-Mar-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03658-w
PMID:38430268
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研究论文 | 本研究构建了一个免疫预测模型，并识别了TRIP6作为结直肠癌的预后标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和总RNA测序数据构建了结直肠癌的分子免疫预测模型 | 未能深入探讨模型的临床应用效果 | 识别结直肠癌患者的免疫状态，并构建预后模型以预测患者结果 | 结直肠癌患者的免疫细胞浸润和关键基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 包含来自GEO的结直肠癌单细胞RNA-seq数据和UCSC Xena的总RNA-seq数据 |
| 6607 | 2024-08-04 |
Proteomic and transcriptomic profiling of brainstem, cerebellum and olfactory tissues in early- and late-phase COVID-19
2024-Mar, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01573-y
PMID:38366144
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研究论文 | 本文分析了不同阶段COVID-19患者脑干、脑小脑和嗅觉组织的蛋白质组和转录组特征 | 首次通过单核RNA测序和空间转录组学整合分析COVID-19不同阶段的神经炎症反应 | 研究对象为已故个体，可能会影响结果的临床适用性 | 探讨COVID-19过程中神经系统的免疫反应及其对神经功能的影响 | 不同阶段的COVID-19患者的脑干组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 不同阶段的已故COVID-19患者脑干组织 |
| 6608 | 2024-08-04 |
Mutational signature and prognosis in adenocarcinoma of the bladder
2024-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6239
PMID:38180342
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研究论文 | 本文揭示了膀胱腺癌的突变和转录组特征，并评估了其与预后的关系 | 首次报告了膀胱腺癌中与化学致癌物相关的突变特征，并与预后相关联 | 样本数量较少，仅包含23名患者，可能限制结果的广泛适用性 | 揭示膀胱腺癌的突变和转录组特征 | 23名膀胱腺癌患者，包括16名原发性膀胱腺癌患者和7名尿管腺癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全外显子测序、全基因组测序、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 23个样本，包含16个原发性膀胱腺癌和7个尿管腺癌 |
| 6609 | 2024-08-07 |
The collagen landscape in cancer: profiling collagens in tumors and in circulation reveals novel markers of cancer-associated fibroblast subtypes
2024-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6207
PMID:37728068
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研究论文 | 本研究旨在通过分析肿瘤和循环中的胶原蛋白表达，识别癌症相关成纤维细胞亚型的潜在标志物 | 发现了特定胶原蛋白亚型与癌症相关成纤维细胞亚型（如iCAFs和myCAFs）的关联，并揭示了这些胶原蛋白在不同实体瘤中的表达失调与生存率的关联 | NA | 识别癌症生物标志物并探索新的治疗靶点 | 癌症相关成纤维细胞及其胶原蛋白表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开的单细胞RNA测序数据集和TCGA数据库中的肿瘤样本，以及癌症患者的血清样本 |
| 6610 | 2024-08-07 |
Transcriptional profile of human thymus reveals IGFBP5 is correlated with age-related thymic involution
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322214
PMID:38318192
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研究论文 | 研究通过收集和整合公开的人类单细胞转录组测序数据，构建了人类胸腺细胞图谱，并发现了与年龄相关的胸腺退化相关的关键调节因子IGFBP5 | 首次系统地探索了早期胸腺细胞的细胞间通讯和调节因子，以及年龄相关的人类胸腺差异，并通过生物信息学和实验验证，揭示了IGFBP5作为胸腺退化的功能标记 | NA | 研究人类胸腺中与年龄相关的退化机制 | 人类胸腺的细胞和分子机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 350,678个细胞来自36个样本 |
| 6611 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell type-specific immune regulation associated with human neuromyelitis optica spectrum disorder
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1322125
PMID:38440735
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）患者的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型特异性的免疫调控 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了NMOSD患者外周血单个核细胞的免疫特征 | NA | 探讨视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）的外周免疫特征 | NMOSD患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 6612 | 2024-08-07 |
Increased glycolysis and cellular crosstalk in eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1321560
PMID:38444858
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）中糖酵解酶基因表达增加及其与细胞间相互作用的关系 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了eCRSwNP中糖酵解重编程与细胞间相互作用的关系 | NA | 研究嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）中糖酵解酶基因表达增加及其与细胞间相互作用的关系 | 嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉（eCRSwNP）患者的上皮细胞、基质细胞和记忆T细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 6613 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals transcript enrichment in oxidative phosphorylation, fluid sheer stress, and inflammatory pathways in obesity-related glomerulopathy
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.101101
PMID:38560497
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了肥胖相关肾小球病变患者的肾脏样本，揭示了特定细胞类型中基因表达的变化 | 首次报道了肥胖相关肾小球病变患者中免疫细胞（如T细胞和B细胞）的减少，以及特定细胞类型中与氧化磷酸化、细胞粘附、产热和炎症途径相关的基因富集 | 研究样本量较小，仅包括四名肥胖相关肾小球病变患者和三名肥胖对照组 | 旨在阐明肥胖相关肾小球病变的分子机制，并探索新的预防或治疗策略 | 肥胖相关肾小球病变患者的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名肥胖相关肾小球病变患者和三名肥胖对照组 |
| 6614 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Profiling Cellular Heterogeneity and Specific Responses of Fish Gills to Microplastics and Nanoplastics
2024-Apr-02, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c10338
PMID:38512049
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料暴露的细胞异质性和特定反应 | 首次揭示了罗非鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性反应，并提供了单细胞分辨率的毒理学机制敏感标记 | NA | 研究鱼鳃对微塑料和纳米塑料的细胞异质性和特定反应 | 罗非鱼鳃的单个细胞群体对微塑料和纳米塑料暴露的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种已识别的细胞群体 |
| 6615 | 2024-08-04 |
Integrated single-cell transcriptomics reveals the hypoxia-induced inflammation-cancer transformation in NASH-derived hepatocellular carcinoma
2024-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13576
PMID:37994257
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的炎症-癌症转化机制在NASH衍生的肝细胞癌中的作用 | 首次通过单细胞转录组学整合研究识别出了从NAFLD到HCC的转变过程中CYP7A1肝细胞的功能和亚群体 | 未提及样本的具体数量及其在临床应用中的直接验证 | 探讨NAFLD相关肝细胞癌的发展机制 | 肝细胞和巨噬细胞的单细胞转录组分析 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病相关肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四个单细胞转录组数据集 |
| 6616 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of bulk and single-cell RNA-seq reveals the molecular characterization of the immune microenvironment and oxidative stress signature in melanoma
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28244
PMID:38560689
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研究论文 | 本研究探讨了黑色素瘤免疫微环境和氧化应激特征的异质性。 | 通过整合散装和单细胞RNA测序数据，识别出六种肿瘤亚群，并构建了预测风险模型。 | 研究主要集中在黑色素瘤上，可能无法推广至其他类型肿瘤。 | 旨在分析黑色素瘤的免疫微环境和氧化应激标志物的分子特征。 | 研究对象为黑色素瘤的细胞及其脉络中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq | NA | 单细胞和散装RNA测序数据 | 不明确提供样本数量 |
| 6617 | 2024-08-04 |
SpatialcoGCN: deconvolution and spatial information-aware simulation of spatial transcriptomics data via deep graph co-embedding
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae130
PMID:38557675
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpatialcoGCN的深度图共嵌入框架，用于提高空间转录组数据的去卷积和模拟性能 | 该研究通过自监督的共图卷积网络模型显著改善了空间转录组数据的低空间分辨率和检测到的RNA转录本数量的问题 | 尚未提及具体的限制因素 | 探讨空间转录组数据中细胞的功能和相互作用 | 使用空间转录组数据和单细胞数据进行细胞组成的去卷积和模拟 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度学习 | 共图卷积网络 | 空间转录组数据 | 模拟的空间转录组数据和来自人类导管癌、发育中人类心脏和小鼠大脑的真实数据集 |
| 6618 | 2024-08-07 |
An immune cell map of human lung adenocarcinoma development reveals an anti-tumoral role of the Tfh-dependent tertiary lymphoid structure
2024-Mar-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101448
PMID:38458196
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术绘制了人肺腺癌发展过程中的免疫细胞图谱，揭示了Tfh依赖的三级淋巴结构在抗肿瘤中的作用 | 首次揭示了Tfh依赖的三级淋巴结构在人肺腺癌发展中的抗肿瘤作用，并通过IL-21-IL-21受体信号通路介导 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 探究人肺腺癌发展过程中的免疫反应及其对患者生存的影响 | 人肺腺癌发展过程中的免疫细胞及其动态变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 6619 | 2024-08-04 |
MMR vaccination induces trained immunity via functional and metabolic reprogramming of γδ T cells
2024-Jan-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170848
PMID:38290093
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研究论文 | 这篇文章系统地研究了MMR疫苗是否可以诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 这项研究首次揭示了MMR疫苗通过功能和代谢重编程γδ T细胞来诱导训练免疫的机制。 | 这项研究的样本量较小，仅涉及39名健康成年人，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究MMR疫苗是否能诱导先天免疫细胞的长期功能变化。 | 39名健康成年人，接受MMR疫苗或安慰剂的随机对照试验。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39名健康成年人 |
| 6620 | 2024-08-07 |
Dynamics of Endothelial Cell Generation and Turnover in Arteries During Homeostasis and Diseases
2024-01-09, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文通过使用基于Cre-loxP和Dre-rox的双重组系统，开发了一种遗传系统，用于在体内无缝记录内皮细胞（EC）的增殖，并结合单细胞RNA测序和基因敲除，揭示了动脉中EC生成在稳态和疾病中的细胞和分子机制。 | 本文创新性地使用遗传增殖追踪技术，结合单细胞RNA测序和基因敲除，精确测量了动脉中内皮细胞的生成动态，并揭示了其与疾病状态的关系。 | 由于大型血管如动脉的增殖频率较低，目前评估动脉中内皮细胞生成动态仍具有挑战性。 | 旨在深入理解血管稳态和疾病的细胞机制，特别是内皮细胞的生成和周转。 | 研究对象为动脉中的内皮细胞（EC）及其在稳态和疾病状态下的生成和周转。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 成年小鼠的主动脉内皮细胞 |