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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 6581 - 6600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6581 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses of the cancer-associated fibroblast subtypes and their score system for prediction of outcomes and immunosuppressive microenvironment in prostate cancer
2024-Apr-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03305-5
PMID:38580966
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研究论文 | 本文通过综合分析癌症相关成纤维细胞（CAFs）的亚型及其评分系统，预测前列腺癌的预后和免疫抑制微环境 | 开发了一种CAF亚型评分系统，作为前列腺癌和其他癌症类型的预后因子，并有助于区分前列腺癌中不同的免疫抑制机制 | NA | 研究CAF亚型在前列腺癌中的生物学和临床意义，并开发一种评分系统来预测预后和免疫抑制微环境 | 前列腺癌细胞、正常成纤维细胞和CAFs | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从TCGA、MSKCC、CPGEA和GEO数据库收集的序列、基因组和临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6582 | 2024-08-04 |
GPR65 sensing tumor-derived lactate induces HMGB1 release from TAM via the cAMP/PKA/CREB pathway to promote glioma progression
2024-Apr-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03025-8
PMID:38576043
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤衍生乳酸如何影响肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）并促进胶质瘤进展的机制 | 提出了GPR65在TAM上感应乳酸刺激，并通过cAMP/PKA/CREB信号通路促进HMGB1释放，从而促进肿瘤进展的新机制 | 本研究主要集中于体外实验和小鼠模型，缺乏临床样本验证 | 阐明肿瘤衍生乳酸对胶质瘤中TAMs的影响及其调控通路 | 胶质瘤细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, CCK8, 细胞克隆形成, 创伤愈合, 转移实验, 西方印迹, 免疫荧光染色, RT-PCR, ELISA | 小鼠异种移植肿瘤模型 | 基因表达数据，细胞 assays 数据 | 使用TCGA和CGGA数据集进行的生物信息学分析，以及不同实验中细胞类型的相关检测 | NA | NA | NA | NA |
| 6583 | 2024-08-07 |
Correction for Keum et al., Heterogeneous osteoimmune profiles via single-cell transcriptomics in osteoporotic patients who fail bisphosphonate treatment
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404416121
PMID:38547069
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6584 | 2024-08-04 |
[Prediction of prognosis of patients with radical resection of intrahepatic cholangiocarcinoma based on single cell omics]
2024-Apr-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
|
研究论文 | 基于单细胞组学分析，旨在评估肝内胆管癌患者根治性切除术后的生存获益 | 探讨了与患者预后相关的上皮细胞群体，并提出了抗氧化型肝内胆管癌组织分类的概念 | 缺乏足够的临床指标及其对预后的影响数据 | 评估肝内胆管癌患者根治性切除术的预后 | 46例接受根治性切除术的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据和生存数据 | 共包括146名患者，46名进行根治性切除术，100名用于微阵列数据分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6585 | 2024-08-07 |
DELVE: feature selection for preserving biological trajectories in single-cell data
2024-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46773-z
PMID:38553455
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research paper | 本文介绍了一种名为DELVE的无监督特征选择方法，用于在单细胞数据中保留生物学轨迹 | DELVE采用自下而上的方法来减少混杂变异源的影响，并基于核心调控复合体从动态基因或蛋白质模块中建模细胞状态 | NA | 旨在识别能够稳健重现细胞轨迹的分子特征子集 | 单细胞数据中的生物学轨迹 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, iterative immunofluorescence imaging | NA | single-cell data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6586 | 2024-08-07 |
The remission status of AML patients after allo-HCT is associated with a distinct single-cell bone marrow T-cell signature
2024-Mar-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021815
PMID:38197505
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）患者在接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）100天后骨髓T淋巴细胞和CD34+细胞的特征，以识别与即将复发（REL）或持续完全缓解（CR）相关的T细胞特征。 | 研究首次揭示了在allo-HCT后，骨髓T细胞的特定单细胞特征与AML患者的缓解状态相关，并识别出ADGRG1/GPR56作为CR CD8+ T细胞的表面标记物。 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别与AML患者allo-HCT后缓解状态相关的T细胞特征。 | 急性髓系白血病患者的骨髓T淋巴细胞和CD34+细胞。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 6名AML患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6587 | 2024-08-04 |
HyGAnno: hybrid graph neural network-based cell type annotation for single-cell ATAC sequencing data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae152
PMID:38581422
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研究论文 | 本研究提出了一种新的自动化细胞注释方法HyGAnno，适用于单细胞ATAC测序数据 | HyGAnno通过并行图神经网络以半监督方式将细胞类型信息从标记良好的scRNA-seq参考转移到未标记的scATAC-seq目标，并利用全基因组可及性峰特征来促进训练过程 | 在一些数据集上，细胞预测的可靠性可能较低，影响注释的准确性 | 研究开发一种高效的细胞类型注释方法，以提高单细胞ATAC测序数据的细胞注释质量 | 本研究关注的对象是细胞类型注释，特别是针对单细胞ATAC测序数据的未标记样本 | 数字病理 | 肿瘤 | 图神经网络 | 并行图神经网络 | 单细胞ATAC测序数据 | 在多个数据集上评估，具体样本量未给出 | NA | NA | NA | NA |
| 6588 | 2024-08-04 |
Modeling interpretable correspondence between cell state and perturbation response with CellCap
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585078
PMID:38558987
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研究论文 | 本研究提出CellCap，一种旨在对单细胞扰动实验进行端到端分析的深度生成模型 | CellCap通过稀疏字典学习将细胞状态特异的扰动响应解构为一组转录响应程序，并通过点积交叉注意力来增强模型的解释能力 | 该研究主要评估CellCap在多个模拟场景下的模型可解释性，可能在某些实际应用中表现不佳 | 揭示细胞状态与扰动响应之间的关系，以深入理解细胞行为 | 使用单细胞转录组学和扰动数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 生成模型 | 转录组数据 | 两个真实的单细胞扰动数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6589 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of layer 4 in visual areas of rhesus macaque cortex
2024-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584345
PMID:38559123
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细研究了猕猴视觉皮层中五个相邻区域的细胞异质性，并开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE。 | 开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE，并首次揭示了猕猴视觉皮层中特定神经元亚型的分布和密度梯度。 | NA | 探索猕猴视觉皮层中相邻区域的细胞异质性和层次结构。 | 猕猴视觉皮层中的V1、V2、V4、MT和TEO区域。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），小分子荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 约100,000个来自视觉区域V1和V4的细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 6590 | 2024-08-07 |
[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts]
2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology
PMID:38583017
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研究论文 | 本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库，对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析 | 首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类，并分析了它们在功能上的异同 | NA | 阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异，为组织修复和再生领域的未来应用提供基础 | 口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | UMAP | 转录组数据 | 四个单细胞数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 6591 | 2024-08-04 |
Direct male development in chromosomally ZZ zebrafish
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1362228
PMID:38529407
|
研究论文 | 本文探讨了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制。 | 揭示了NA斑马鱼在性别决定过程中的直接雄性发育机制，以及性腺发育中不同染色体的作用。 | 研究主要集中于特定的斑马鱼品系，可能无法广泛适用于其他物种。 | 了解NA斑马鱼的性腺发育机制。 | 研究对象为NA斑马鱼及其不同性别的发育过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本和图像 | 19dpf和30dpf的性腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6592 | 2024-08-07 |
Targeting Monocyte Derived CCL17 Attenuates Murine Crescentic Glomerulonephritis by Affecting Renal CCR4+ Regulatory T-Cell Recruitment
2024, American journal of nephrology
IF:4.3Q1
DOI:10.1159/000534151
PMID:37742620
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞，发现CCL17作为免疫介导性肾脏疾病的潜在治疗靶点，并通过小鼠模型探讨了靶向CCL17的效果。 | 首次研究了化学因子受体CCR4及其配体CCL17在免疫介导性新月形肾小球肾炎中的功能重要性及其对白细胞招募的相关性。 | NA | 探讨化学因子受体CCR4及其配体CCL17在免疫介导性新月形肾小球肾炎中的作用及治疗潜力。 | 人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞，以及小鼠新月形肾小球肾炎模型。 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6593 | 2024-08-07 |
Identification and validation of immune and cuproptosis - related genes for diabetic nephropathy by WGCNA and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1332279
PMID:38390317
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研究论文 | 本研究通过WGCNA和机器学习方法，识别并验证了与糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 | 结合机器学习、WGCNA、免疫细胞浸润和PPI分析，首次识别出与铜死亡、免疫和糖尿病肾病相关的三个关键基因 | NA | 探索糖尿病肾病的早期诊断方法，并识别潜在的诊断标志物 | 糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | WGCNA, 机器学习, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 包括GSE30122和GSE30529两个数据集，以及STZ诱导和db/db糖尿病肾病小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6594 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47271-y
PMID:38570491
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研究论文 | 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 | 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 | NA | 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 | 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | NA | 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6595 | 2024-08-04 |
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-024-02062-8
PMID:38570797
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研究论文 | 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 | 首次识别低密度脂蛋白（LDL）的失调作为肺纤维化的新风险因素，揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 | 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 | 研究肺纤维化的分子机制，特别是脂质代谢在其中的作用 | 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6596 | 2024-08-04 |
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46625-w
PMID:38570482
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研究论文 | 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 | 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 | 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 | 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 | 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6597 | 2024-08-07 |
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46300-0
PMID:38570531
|
research paper | 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法，研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制，对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 | NA | 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6598 | 2024-08-07 |
Self-assembly of differentiated dental pulp stem cells facilitates spheroid human dental organoid formation and prevascularization
2024-Mar-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i3.287
PMID:38577232
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研究论文 | 本研究展示了成人干细胞和人牙髓干细胞在体外低氧和条件培养基下的三维自组装，形成新型球形牙髓类器官并促进其血管化 | 本研究创新性地建立了体外血管化牙髓类器官模型，并阐明了再生过程中血管生成的新机制 | 牙髓类器官缺乏血管限制了其应用 | 提高干细胞移植后的存活率和恢复能力 | 成人干细胞、人牙髓干细胞和内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定比例的预处理人牙髓干细胞与内皮细胞混合 | NA | NA | NA | NA |
| 6599 | 2024-08-07 |
Ferroptosis biomarkers predict tumor mutation burden's impact on prognosis in HER2-positive breast cancer
2024-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i3.391
PMID:38576597
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研究论文 | 本研究旨在识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物，并探讨其与肿瘤突变负荷对预后的影响。 | 开发了一个包含PROM2、SLC7A11、FANCD2和FH的四基因预测模型，并在TCGA和METABRIC队列中验证了其有效性。 | NA | 识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物。 | HER2阳性乳腺癌患者。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | TCGA和METABRIC数据库中的HER2阳性乳腺癌患者。 | NA | NA | NA | NA |
| 6600 | 2024-08-04 |
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01632-y
PMID:38342890
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研究论文 | 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 | 提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 | 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 | 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 | 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |