单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6581 - 6600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6581 | 2024-08-04 |
Macrophage diversity in human cancers: New insight provided by single-cell resolution and spatial context
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28332
PMID:38571605
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研究论文 | 本文总结了最近研究中使用先进技术揭示的人类癌症中肿瘤相关巨噬细胞的新功能亚群 | 该研究强调了特定肿瘤相关巨噬细胞亚群的转录组特征及其临床意义，并利用空间转录组学技术揭示了巨噬细胞与其他细胞类型之间的空间相互作用 | 对特定肿瘤类型中肿瘤相关巨噬细胞状态的知识仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中巨噬细胞表型的多样性及其在不同人类癌症中的功能 | 研究肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞及其特定亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及多个不同类型人类癌症的巨噬细胞 |
| 6582 | 2024-08-07 |
Identification and validation of mutual hub genes in idiopathic pulmonary fibrosis and rheumatoid arthritis-associated usual interstitial pneumonia
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28088
PMID:38571583
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析探索特发性肺纤维化（IPF）和类风湿关节炎相关寻常间质性肺炎（RA-UIP）中的共同枢纽基因和通路 | 筛选出四个共同枢纽基因（THBS2, TIMP1, POSTN, 和 CD19），并验证这些基因在IPF和RA-UIP中的潜在生物标志物作用 | NA | 探索IPF和RA-UIP中的共同枢纽基因和通路 | IPF和RA-UIP患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | GSE199152数据集中的IPF和RA-UIP患者肺组织样本 |
| 6583 | 2024-08-04 |
Virus-reactive T cells expanded in aplastic anemia eliminate hematopoietic progenitor cells by molecular mimicry
2024-Apr-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023142
PMID:38277625
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研究论文 | 本研究探讨了反应性T细胞在再生障碍性贫血中的作用。 | 新发现的病毒相关T细胞通过分子模仿机制消除造血前体细胞的作用。 | 尚未明确T细胞克隆的具体贡献及其抗原特异性。 | 研究再生障碍性贫血患者中T细胞的分化状态及其对造血前体细胞的影响。 | 对15名获得性再生障碍性贫血患者的T细胞克隆进行分析。 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞测序和免疫表型分析 | NA | 细胞 | 15名获得性再生障碍性贫血患者 |
| 6584 | 2024-08-04 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
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研究论文 | CITEViz是一个交互式R-Shiny应用程序，用于在CITE-Seq数据中高效分类细胞群体 | CITEViz通过简化CITE-Seq数据的流式细胞术门控工作流程，实现了对细胞群体的标准化分类 | 目前CITEViz的功能可能不覆盖所有类型的多组学数据处理 | 开发一个工具以优化和标准化CITE-Seq数据的门控过程 | 外周血单核细胞的CITE-Seq数据集及主要血细胞群体 | 数字病理学 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞测序数据 | 涉及外周血单核细胞的CITE-Seq数据集 |
| 6585 | 2024-08-07 |
Single cell analysis reveals the roles and regulatory mechanisms of type-I interferons in Parkinson's disease
2024-Apr-02, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01590-1
PMID:38566100
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了帕金森病中I型干扰素的作用及其调控机制 | 首次详细描述了不同细胞类型中I型干扰素的具体特征及其在帕金森病中的作用机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需更多实验验证 | 揭示I型干扰素在帕金森病中的作用及其调控机制 | 帕金森病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 39,024个单细胞RNA测序结果，包括5名帕金森病患者和6名健康对照 |
| 6586 | 2024-08-04 |
Dissecting the spatiotemporal diversity of adult neural stem cells
2024-Apr, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00022-z
PMID:38365956
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研究论文 | 本研究探讨了成体神经干细胞的时空多样性 | 该研究结合单细胞转录组学和在体RNA代谢标记技术，揭示了成体神经干细胞的组织原则 | 本研究主要集中于斑马鱼大脑，限制了其对其他类型动物的适用性 | 研究成体神经干细胞的功能状态及其在空间和时间上的调节 | 成体斑马鱼大脑中的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、在体RNA代谢标记 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼大脑不同区域的单细胞样本 |
| 6587 | 2024-08-04 |
Deciphering cutaneous melanoma prognosis through LDL metabolism: Single-cell transcriptomics analysis via 101 machine learning algorithms
2024-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15070
PMID:38570935
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研究论文 | 本文探讨了低密度脂蛋白（LDL）代谢与皮肤黑色素瘤之间的关系 | 结合机器学习算法构建的LDL相关特征，可以用于评估皮肤黑色素瘤患者的预后和免疫状态 | 未提及具体的临床验证和应用，可能限制了结果的广泛适用性 | 调查低密度脂蛋白在皮肤黑色素瘤中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 分析与低密度脂蛋白代谢相关的基因及其在皮肤黑色素瘤细胞中的表现 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序、bulk-RNA测序 | 机器学习算法 | 基因组数据 | 使用了多个数据集，包括GSE215120，TCGA，GSE19234，GSE22153和GSE65904 |
| 6588 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the ameliorative effect of rosmarinic acid on diabetic nephropathy-induced kidney injury by modulating oxidative stress and inflammation
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.01.003
PMID:38572101
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研究论文 | 本研究探讨了迷迭香酸对糖尿病肾病诱导的肾损伤的改善作用 | 揭示了单细胞层次上迷迭香酸对肾损伤的多样性反应及其机制 | 研究可能未涵盖所有与糖尿病肾病相关的细胞反应 | 探讨迷迭香酸在糖尿病肾病中改善肾脏损伤的作用 | 糖尿病肾病诱导的肾损伤及迷迭香酸的治疗效果 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 6589 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染后的免疫反应 | 揭示了灭活疫苗与自然感染在免疫细胞比例和转录组方面的细微差异，以及细胞间通讯模式的独特变化 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 理解COVID-19免疫学中灭活疫苗与自然感染的免疫反应 | 灭活SARS-CoV-2疫苗接种者与COVID-19患者的PBMC样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者 |
| 6590 | 2024-08-07 |
Monocyte state 1 (MS1) cells in critically ill patients with sepsis or non-infectious conditions: association with disease course and host response
2024-03-19, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-024-04868-5
PMID:38504349
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞状态1（MS1）细胞在重症监护病房（ICU）中患有脓毒症或非感染性疾病的患者中的分布及其与疾病进程和宿主反应的关系 | 首次使用转录组反卷积方法（CIBERSORTx）评估MS1细胞在脓毒症患者中的比例，并研究其与疾病严重程度和宿主反应失调的关系 | 研究未区分MS1细胞在幸存者和非幸存者之间或二次感染患者之间的差异 | 确定MS1细胞特征与疾病表现、预后和宿主反应特征之间的关联 | 脓毒症患者和ICU中无感染的患者 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 332名脓毒症患者和215名无感染的ICU患者 |
| 6591 | 2024-08-04 |
Phylogenomic position of eupelagonemids, abundant, and diverse deep-ocean heterotrophs
2024-Jan-08, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrae040
PMID:38457644
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研究论文 | 本研究探讨了深海异养原生生物Eupelagonemids的系统发育位置 | 研究通过单细胞转录组技术揭示了Eupelagonemids的多样性及其与其他分类群的关系 | 目前对Eupelagonemids的培养和研究仍然有限，数据主要来自光学显微镜图像和部分基因序列 | 确定Eupelagonemids在真核生物树中的位置，并填补其生物学信息的缺失 | 研究对象为两种Eupelagonemid细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因序列 | 两个Eupelagonemid细胞 |
| 6592 | 2024-08-04 |
Single-cell Sequencing Data Reveals Aggressive CD68-type Macrophages and Prognostic Models in Bladder Cancer
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中激进CD68型巨噬细胞及其预后模型 | 研究首次利用单细胞测序数据鉴定了膀胱癌中的预后生物标志物，并构建了膀胱癌预后风险指导系统 | 研究主要基于公共数据库的数据，可能存在样本选择偏差 | 研究膀胱癌中相关免疫细胞类型与侵袭性之间的关系以及建立预后管理系统 | 以膀胱癌为研究对象，分析与其侵袭性相关的CD68型巨噬细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | COX回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌细胞测序数据，具体样本数量未注明 |
| 6593 | 2024-08-04 |
Identification of Key Genes in Angiogenesis of Breast and Prostate Cancers in the Context of Different Cell Types
2024, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 这篇文章识别了在乳腺癌和前列腺癌的不同细胞类型中，与血管生成相关的关键基因 | 文章揭示了不同细胞类型中血管生成相关基因模块的过表达模式 | 没有具体提到研究的局限性 | 研究不同细胞类型如何影响血管生成过程 | 前列腺癌和乳腺癌样本中的血管生成相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了乳腺癌和前列腺癌样本中的单细胞RNA-Seq数据 |
| 6594 | 2024-08-07 |
Penile cavernous sinusoids are Prox1-positive hybrid vessels
2024-Jan-01, Vascular biology (Bristol, England)
DOI:10.1530/VB-23-0014
PMID:38051669
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研究论文 | 本文鉴定了阴茎海绵体窦状血管为表达淋巴内皮细胞身份基因Prox1、Vegfr3和Lyve1的新型混合血管床 | 发现了阴茎海绵体窦状血管作为新的混合血管床，并揭示了其在糖尿病相关勃起功能障碍中的转录变化 | NA | 详细描述混合阴茎海绵体窦状血管的分子特征，并为治疗失调的阴茎血管疾病提供分子靶点 | 阴茎海绵体窦状血管的混合特性及其在勃起功能障碍中的作用 | NA | 勃起功能障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类阴茎海绵体组织 |
| 6595 | 2024-08-07 |
Inflammasome signaling is dispensable for ß-amyloid-induced neuropathology in preclinical models of Alzheimer's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1323409
PMID:38352874
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研究论文 | 本文评估了在阿尔茨海默病（AD）的ß-淀粉样蛋白诱导的神经病理学模型中，炎症小体信号在体内的作用 | 研究结果质疑了炎症小体激活在预临床淀粉样蛋白模型中的普遍作用 | 研究仅限于特定的鼠标模型，可能不适用于所有AD模型 | 探讨炎症小体信号在ß-淀粉样蛋白诱导的AD神经病理学中的作用 | APP/PS1和AppNL-G-F鼠标模型中的微胶质细胞和全身炎症小体信号 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个鼠标模型 |
| 6596 | 2024-08-07 |
HES6 knockdown in human hematopoietic precursor cells reduces their in vivo engraftment potential and their capacity to differentiate into erythroid cells, B cells, T cells and plasmacytoid dendritic cells
2024-Apr-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2023.283432
PMID:38572564
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研究论文 | 本研究探讨了HES6在人类造血过程中的作用，通过体外和体内模型发现HES6敲降会影响造血前体细胞的植入潜力和分化能力 | 首次揭示了HES6在人类造血过程中的具体作用，包括影响细胞周期进展和下游目标基因 | NA | 研究HES6在人类造血过程中的作用 | 人类造血前体细胞 | NA | NA | bulk和scRNA-seq | NA | RNA | 脐带血衍生的造血前体细胞 |
| 6597 | 2024-08-07 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-Apr, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞TCR/BCR测序分析，探讨了COVID-19加强疫苗在稳定期类风湿关节炎（RA）患者中的免疫反应 | 首次综合分析了COVID-19加强疫苗在RA患者中的单细胞免疫图谱和TCR/BCR免疫组库 | 研究样本量较小，且仅限于稳定期RA患者 | 探讨COVID-19加强疫苗对RA患者关键免疫细胞亚群及其反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者在接受COVID-19加强疫苗前后的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞TCR/BCR测序（scTCR/BCR-seq） | NA | 单细胞数据 | 从稳定期RA患者中收集的配对外周血单个核细胞（PBMCs），共8个主要和27个次要细胞簇 |
| 6598 | 2024-08-04 |
The ontogenesis and heterogeneity of basophils
2024, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyae003
PMID:38567293
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综述 | 该文章综述了嗜碱细胞的发育过程和异质性 | 该综述强调了嗜碱细胞发育途径中的新发现，包括新识别的嗜碱细胞前体和成熟亚群 | 该综述未提供新的实验数据或实验结果 | 探讨嗜碱细胞的发育和生物学 | 各种物种的嗜碱细胞发育过程 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文献综述 | NA |
| 6599 | 2024-08-07 |
INO80-Dependent Remodeling of Transcriptional Regulatory Network Underlies the Progression of Heart Failure
2024-04-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过整合人类样本、遗传小鼠模型和基因组学方法，探讨了INO80染色质重塑复合体在心脏稳态和功能障碍中的作用 | 揭示了INO80依赖的染色质景观和转录网络重塑是心脏功能障碍的主要机制 | NA | 探讨INO80染色质重塑复合体在心脏功能障碍中的作用 | INO80染色质重塑复合体及其在心脏功能中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序、染色质免疫沉淀后高通量测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 基因组数据 | 人类样本和遗传小鼠模型 |
| 6600 | 2024-08-04 |
Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
2024-Apr-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47068-z
PMID:38561380
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研究论文 | 本文分析了乳腺癌中免疫抑制成纤维细胞的空间格局和可塑性 | 首次构建了乳腺癌中FAP+ CAF相关的高分辨率空间细胞生态图谱 | 尚未充分理解FAP+ CAF的所有多样性与功能 | 研究乳腺癌中特定成纤维细胞亚群的空间分布和功能 | 主要关注乳腺癌中FAP+ 免疫抑制成纤维细胞的不同亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，功能测定 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |