单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6561 - 6580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6561 | 2024-08-07 |
Single-cell epigenomic dysregulation of Systemic Sclerosis fibroblasts via CREB1/EGR1 axis in self-assembled human skin equivalents
2024-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.22.586316
PMID:38585776
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研究论文 | 研究分析了系统性硬化症（SSc）的3D皮肤样组织模型在单细胞分辨率下的转录组（scRNA-seq）和表观遗传（scATAC-seq）特征 | 首次在单细胞水平上分析了SSc皮肤样组织模型的转录组和表观遗传特征，并鉴定了特定的纤维细胞亚群 | NA | 研究系统性硬化症的皮肤纤维化和内部器官受累的分子机制 | 系统性硬化症患者的自体纤维细胞、巨噬细胞和血浆构建的3D皮肤样组织模型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组, 单细胞表观遗传 | 使用了来自系统性硬化症患者和健康对照捐赠者的纤维细胞、巨噬细胞和血浆 |
| 6562 | 2024-08-04 |
Modeling interpretable correspondence between cell state and perturbation response with CellCap
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585078
PMID:38558987
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研究论文 | 本研究提出CellCap，一种旨在对单细胞扰动实验进行端到端分析的深度生成模型 | CellCap通过稀疏字典学习将细胞状态特异的扰动响应解构为一组转录响应程序，并通过点积交叉注意力来增强模型的解释能力 | 该研究主要评估CellCap在多个模拟场景下的模型可解释性，可能在某些实际应用中表现不佳 | 揭示细胞状态与扰动响应之间的关系，以深入理解细胞行为 | 使用单细胞转录组学和扰动数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 生成模型 | 转录组数据 | 两个真实的单细胞扰动数据集 |
| 6563 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of layer 4 in visual areas of rhesus macaque cortex
2024-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.11.584345
PMID:38559123
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细研究了猕猴视觉皮层中五个相邻区域的细胞异质性，并开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE。 | 开发了一种新的脑空间存档方法BrainSPACE，并首次揭示了猕猴视觉皮层中特定神经元亚型的分布和密度梯度。 | NA | 探索猕猴视觉皮层中相邻区域的细胞异质性和层次结构。 | 猕猴视觉皮层中的V1、V2、V4、MT和TEO区域。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），小分子荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 约100,000个来自视觉区域V1和V4的细胞核 |
| 6564 | 2024-08-07 |
[Single-cell transcriptome characterization of oral mucosal fibroblasts]
2024-Feb, Shanghai kou qiang yi xue = Shanghai journal of stomatology
PMID:38583017
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研究论文 | 本研究通过整合口腔黏膜和皮肤组织的单细胞数据库，对成纤维细胞亚群进行了分类和功能分析 | 首次在单细胞水平上统一了口腔黏膜和皮肤组织成纤维细胞亚型的分类，并分析了它们在功能上的异同 | NA | 阐明正常口腔黏膜和皮肤组织中成纤维细胞亚型的组成和功能差异，为组织修复和再生领域的未来应用提供基础 | 口腔黏膜和皮肤组织的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | UMAP | 转录组数据 | 四个单细胞数据库 |
| 6565 | 2024-08-04 |
Direct male development in chromosomally ZZ zebrafish
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1362228
PMID:38529407
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研究论文 | 本文探讨了NA斑马鱼的性别决定和生殖腺发育机制。 | 揭示了NA斑马鱼在性别决定过程中的直接雄性发育机制，以及性腺发育中不同染色体的作用。 | 研究主要集中于特定的斑马鱼品系，可能无法广泛适用于其他物种。 | 了解NA斑马鱼的性腺发育机制。 | 研究对象为NA斑马鱼及其不同性别的发育过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本和图像 | 19dpf和30dpf的性腺样本 |
| 6566 | 2024-08-07 |
Targeting Monocyte Derived CCL17 Attenuates Murine Crescentic Glomerulonephritis by Affecting Renal CCR4+ Regulatory T-Cell Recruitment
2024, American journal of nephrology
IF:4.3Q1
DOI:10.1159/000534151
PMID:37742620
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞，发现CCL17作为免疫介导性肾脏疾病的潜在治疗靶点，并通过小鼠模型探讨了靶向CCL17的效果。 | 首次研究了化学因子受体CCR4及其配体CCL17在免疫介导性新月形肾小球肾炎中的功能重要性及其对白细胞招募的相关性。 | NA | 探讨化学因子受体CCR4及其配体CCL17在免疫介导性新月形肾小球肾炎中的作用及治疗潜力。 | 人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞，以及小鼠新月形肾小球肾炎模型。 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人及小鼠肾炎肾脏中的白细胞样本 |
| 6567 | 2024-08-07 |
Identification and validation of immune and cuproptosis - related genes for diabetic nephropathy by WGCNA and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1332279
PMID:38390317
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研究论文 | 本研究通过WGCNA和机器学习方法，识别并验证了与糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 | 结合机器学习、WGCNA、免疫细胞浸润和PPI分析，首次识别出与铜死亡、免疫和糖尿病肾病相关的三个关键基因 | NA | 探索糖尿病肾病的早期诊断方法，并识别潜在的诊断标志物 | 糖尿病肾病相关的免疫和铜死亡相关基因 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | WGCNA, 机器学习, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 包括GSE30122和GSE30529两个数据集，以及STZ诱导和db/db糖尿病肾病小鼠模型 |
| 6568 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals discrete tumour microenvironments and autocrine loops within ovarian cancer subclones
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47271-y
PMID:38570491
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研究论文 | 该文使用空间转录组学识别卵巢癌亚克隆及其与浸润细胞群体的关联 | 研究揭示了卵巢癌亚克隆的高亚克隆异质性及其特定的配体和受体表达模式 | NA | 探索高等级浆液性卵巢癌中亚克隆的特征及其微环境交互 | 高等级浆液性卵巢癌亚克隆及其与免疫细胞和基质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | NA | 使用多个样本对单个肿瘤切片进行分析 |
| 6569 | 2024-08-04 |
The novel molecular mechanism of pulmonary fibrosis: insight into lipid metabolism from reanalysis of single-cell RNA-seq databases
2024-Apr-03, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-024-02062-8
PMID:38570797
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研究论文 | 本研究探讨了肺纤维化中脂质代谢的异常与疾病机制之间的关系 | 首次识别低密度脂蛋白（LDL）的失调作为肺纤维化的新风险因素，揭示了不同细胞类型中脂质代谢基因的重新编程 | 研究中没有提供样本大小和具体的实验数据支持 | 研究肺纤维化的分子机制，特别是脂质代谢在其中的作用 | 重点分析与肺纤维化相关的单细胞RNA测序数据及脂质代谢基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 6570 | 2024-08-04 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-Apr-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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研究论文 | 本研究探讨了导管内癌（DCIS）向浸润性乳腺癌（IDC）转变的分子特征及其临床意义 | 本研究系统总结了关于DCIS的关键信号通路和分子特征，并探索了肿瘤细胞内部变化及肿瘤微环境的影响 | 文中未提及具体的研究限制 | 深入理解DCIS及其向IDC转变的生物学特性以促进临床管理 | 主要关注DCIS和IDC的分子特征及其进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、人工智能 | 前临床模型 | NA | NA |
| 6571 | 2024-08-04 |
Shared inflammatory glial cell signature after stab wound injury, revealed by spatial, temporal, and cell-type-specific profiling of the murine cerebral cortex
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46625-w
PMID:38570482
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研究论文 | 该文章揭示了创伤性脑损伤后小鼠大脑皮层中炎症胶质细胞的转录组特征 | 首次结合空间和单细胞转录组学确定受伤小鼠脑皮层中特定胶质细胞的状态及其共享的伤害调控基因 | 未提及具体的临床相关性或在人类中的应用 | 全面了解特定细胞类型响应创伤的机制及其相互作用 | 受伤小鼠大脑皮层中的特定胶质细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 6572 | 2024-08-07 |
Eph-ephrin signaling couples endothelial cell sorting and arterial specification
2024-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46300-0
PMID:38570531
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research paper | 本文通过结合细胞类型特异性和可诱导的小鼠遗传学、体外流动实验、单细胞RNA测序和生化方法，研究了Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | 揭示了Eph-ephrin相互作用如何整合细胞分离和动静脉指定在血管中的机制，对由EPHB4突变引起的人类血管畸形具有潜在相关性 | NA | 探讨Eph-ephrin信号在动脉指定和细胞分类中的作用 | Eph-ephrin信号在血管形成中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 6573 | 2024-08-07 |
Self-assembly of differentiated dental pulp stem cells facilitates spheroid human dental organoid formation and prevascularization
2024-Mar-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i3.287
PMID:38577232
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研究论文 | 本研究展示了成人干细胞和人牙髓干细胞在体外低氧和条件培养基下的三维自组装，形成新型球形牙髓类器官并促进其血管化 | 本研究创新性地建立了体外血管化牙髓类器官模型，并阐明了再生过程中血管生成的新机制 | 牙髓类器官缺乏血管限制了其应用 | 提高干细胞移植后的存活率和恢复能力 | 成人干细胞、人牙髓干细胞和内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定比例的预处理人牙髓干细胞与内皮细胞混合 |
| 6574 | 2024-08-07 |
Ferroptosis biomarkers predict tumor mutation burden's impact on prognosis in HER2-positive breast cancer
2024-Mar-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i3.391
PMID:38576597
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研究论文 | 本研究旨在识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物，并探讨其与肿瘤突变负荷对预后的影响。 | 开发了一个包含PROM2、SLC7A11、FANCD2和FH的四基因预测模型，并在TCGA和METABRIC队列中验证了其有效性。 | NA | 识别和评估HER2阳性乳腺癌中与铁死亡相关的新型生物标志物。 | HER2阳性乳腺癌患者。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | TCGA和METABRIC数据库中的HER2阳性乳腺癌患者。 |
| 6575 | 2024-08-07 |
Regorafenib plus nivolumab in unresectable hepatocellular carcinoma: the phase 2 RENOBATE trial
2024-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02824-y
PMID:38374347
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研究论文 | 研究评估了瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合治疗不可切除肝细胞癌（uHCC）的疗效和安全性 | 首次在多中心、单臂、II期RENOBATE试验中测试了瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合作为uHCC一线治疗的疗效 | 研究为单臂试验，且样本量较小，需要进一步的大规模随机对照试验验证 | 评估瑞戈非尼与纳武利尤单抗联合治疗不可切除肝细胞癌的疗效和安全性 | 不可切除的肝细胞癌患者 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液单个核细胞 | 42名患者 |
| 6576 | 2024-08-04 |
Molecular map of disulfidptosis-related genes in lung adenocarcinoma: the perspective toward immune microenvironment and prognosis
2024-02-11, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-024-01632-y
PMID:38342890
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研究论文 | 本研究系统探讨了与二硫化物相关的基因在肺腺癌中的表达及其预后意义 | 提出了一种新的DRG标记风险评分，可以预测肺腺癌的免疫微环境和预后 | 未提及具体的样本量和实验方法的局限性 | 阐明与二硫化物相关基因在肺腺癌中的预后重要性 | 研究与肺腺癌相关的二硫化物相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | qRT-PCR、单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA |
| 6577 | 2024-08-04 |
The significance of single-cell transcriptome analysis in epididymis research
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1357370
PMID:38577504
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组分析在附睾研究中的重要性 | 通过单细胞测序技术揭示了附睾不同区域的细胞组成和特定基因表达模式 | 对附睾的重要性认识仍然有限 | 重新评估附睾对男性生育能力的重要性 | 附睾不同区域的细胞组成及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6578 | 2024-08-07 |
Bulk and single-cell transcriptome sequencing reveal the metabolic feature in chronic rhinosinusitis with polyps
2024-01, Clinical and experimental allergy : journal of the British Society for Allergy and Clinical Immunology
IF:6.3Q1
DOI:10.1111/cea.14396
PMID:37749764
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6579 | 2024-08-07 |
Cellular and molecular characteristics of stromal Lkb1 deficiency-induced gastrointestinal polyposis based on single-cell RNA sequencing
2024-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6259
PMID:38389501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基于成像的谱系追踪，探讨了与Peutz-Jeghers综合征相关的胃肠道息肉的细胞复杂性。 | 本研究揭示了Lkb1相关息肉的异常干细胞样特征，并识别了Spp1-Cd44或Spp1-Itga8/Itgb1轴在息肉中的重要相互作用。 | NA | 研究Lkb1缺乏引起的胃肠道息肉的细胞和分子特征。 | Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型中的胃肠道息肉。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Lkb1;Myh11-Cre/ERT2和Lkb1;PDGFRα-Cre/ERT2小鼠模型 |
| 6580 | 2024-08-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究揭示了心脏免疫学的整体情况，并确定了一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞在心肌缺血再灌注损伤中的作用 | 首次识别心肌缺血再灌注损伤中具保护作用的新型 Ym-1hi 中性粒细胞亚型 | 未提供人类样本的详细分析，主要集中在小鼠实验上 | 研究心肌缺血再灌注损伤中中性粒细胞的亚型及其动态变化 | 小鼠心脏中隔离的CD45阳性细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 在六个时间点对小鼠心脏进行取样，具体样本量未明确说明 |