本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6561 | 2024-08-04 |
Integration of scRNA and bulk RNA-sequence to construct the 5-gene molecular prognostic model based on the heterogeneity of thyroid carcinoma endothelial cell
2024-02-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2023254
PMID:38186223
|
研究论文 | 本研究构建了基于甲状腺癌内皮细胞异质性的5基因分子预后模型 | 揭示内皮细胞与乳头状甲状腺癌进展的强关联,并筛选出5个关键基因 | 对于肿瘤微环境中的细胞关注较少,可能影响研究的全面性 | 探索甲状腺癌的分子预后过程及其内皮细胞的作用 | 甲状腺癌的内皮细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6562 | 2024-08-07 |
Proteomic profiling of aqueous humor-derived exosomes in Vogt-Koyanagi-Harada disease and Behcet's uveitis
2024-02, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.109895
PMID:38185270
|
research paper | 本研究首次对来自Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体进行了无标记定量蛋白质组学分析,以确定其在疾病中的潜在作用 | 首次对房水来源的外泌体进行无标记定量蛋白质组学分析,并发现补体相关通路在这些疾病发病机制中的重要作用 | NA | 探究Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎中房水来源外泌体的蛋白质组学特征及其在疾病发病机制中的作用 | Vogt-Koyanagi-Harada病和Behcet氏葡萄膜炎患者的房水来源外泌体 | NA | Vogt-Koyanagi-Harada病, Behcet氏葡萄膜炎 | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | 84名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6563 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-01-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:37782774
|
研究论文 | 研究探讨了蛋白精氨酸甲基转移酶5(PRMT5)靶向治疗在套细胞淋巴瘤(MCL)中的耐药性问题 | 发现使用temsirolimus靶向阻断mTORC1可以克服PRMT5抑制剂的耐药性,并在耐药的MCL细胞系中显示出治疗协同作用 | 研究主要基于患者来源的异种移植(PDX)模型和细胞系,可能需要进一步的临床验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的耐药机制并寻找克服耐药性的策略 | 套细胞淋巴瘤(MCL)及其对PRMT5抑制剂的耐药性 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个,初级耐药细胞系4个,耐药PDX模型若干 | NA | NA | NA | NA |
| 6564 | 2024-08-04 |
Comprehensive molecular and cellular characterization of endoplasmic reticulum stress-related key genes in renal ischemia/reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1340997
PMID:38495888
|
研究论文 | 本研究全面表征了与内质网应激相关的三种关键基因在肾脏缺血/再灌注损伤中的作用 | 该研究首次确定了与内质网应激相关的三种关键基因,并探讨了它们在肾脏移植后愈后预后的价值 | 研究的限制在于使用了已有的数据集,可能无法完全捕捉肾脏缺血/再灌注损伤的所有机制 | 研究旨在揭示肾脏缺血/再灌注损伤的潜在机制,以发现有效的肾脏保护靶点 | 研究对象为在肾脏缺血/再灌注损伤中涉及的关键基因及其相关途径 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从GEO数据库收集了495个肾脏样本进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 6565 | 2024-08-05 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-Jan, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
|
研究论文 | 本文研究了载脂蛋白L基因在炎症引起的β细胞损伤中的新作用 | 发现APOL基因在β细胞中的表达受到炎症的显著上调,揭示了它们在胰腺炎症中的新调节作用 | 研究主要集中在单一细胞模型,可能无法全面反映复杂的体内环境 | 探讨载脂蛋白L基因在β细胞炎症损伤中的作用机制 | 主要研究人类胰腺β细胞以及与糖尿病相关的细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了原代人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6566 | 2024-08-07 |
Multi-omics and tumor immune microenvironment characterization of a prognostic model based on aging-related genes in melanoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/UZGP9704
PMID:38590405
|
研究论文 | 本文通过分析与衰老相关的基因,构建了一个针对黑色素瘤的预后模型,并探讨了其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次基于衰老相关基因构建黑色素瘤预后模型,并展示了其在预测患者死亡率方面的高准确性 | NA | 构建一个基于衰老相关基因的黑色素瘤预后模型,并探讨其在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析 | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6567 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing explores the evolution of the ecosystem from leukoplakia to head and neck squamous cell carcinoma
2024-04-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-58978-9
PMID:38582791
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索从白斑病到头颈鳞状细胞癌的生态系统演变过程 | 发现了在白斑病向头颈鳞状细胞癌进展过程中,与预后相关的多个细胞亚群及其不同的命运走向 | NA | 揭示白斑病向头颈鳞状细胞癌进展的分子机制,并为新治疗策略的开发提供理论基础 | 白斑病和头颈鳞状细胞癌的细胞生态系统 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自基因表达综合数据库和UCSC Xena数据库的样本信息 | NA | NA | NA | NA |
| 6568 | 2024-08-07 |
IRF1 governs the expression of SMARCC1 via the GCN5-SETD2 axis and actively engages in the advancement of osteoarthritis
2024-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.01.002
PMID:38586591
|
研究论文 | 本研究分析了IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎(OA)发展中的作用 | 发现IRF1通过GCN5和SETD2调控SMARCC1的表达,进而影响H3K27ac和H3K4me3修饰,促进M1巨噬细胞的极化,推动骨关节炎的进展 | NA | 分析IRF1-GCN5-SETD2-SMARCC1轴在骨关节炎发展中的功能 | IRF1、SMARCC1、GCN5、SETD2以及它们在骨关节炎中的作用 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 13名骨关节炎患者和7名无骨关节炎的骨折患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6569 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals altered lipid metabolism and inflammation-related gene expression of sebaceous glands in psoriasis and atopic dermatitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1334844
PMID:38433843
|
研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的脂质代谢和炎症相关基因表达的变化 | 首次深入探讨了皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用,揭示其与炎症微环境的相互影响 | 未能探讨其他炎症性皮肤疾病对皮脂腺的影响 | 研究皮脂腺在银屑病和特应性皮炎中的作用 | 银屑病和特应性皮炎患者的人类皮肤样本 | 数字病理学 | 银屑病, 特应性皮炎 | 空间转录组学 | NA | 人类皮肤样本 | 涉及银屑病和特应性皮炎患者的皮肤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6570 | 2024-08-07 |
Unveiling macrophage diversity in myocardial ischemia-reperfusion injury: identification of a distinct lipid-associated macrophage subset
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335333
PMID:38449872
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在心肌缺血-再灌注损伤中鉴定出一种新型脂质相关巨噬细胞亚型,并探讨了其在心肌重塑中的潜在作用 | 首次在心肌缺血-再灌注损伤中发现并鉴定了一种新型脂质相关巨噬细胞亚型,该亚型具有高表达的Spp1和Trem2等基因 | NA | 旨在识别心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型,并探索其对心脏修复和损伤的双重作用 | 心肌缺血-再灌注损伤中的巨噬细胞亚型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用小鼠和人类的心脏样本进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 6571 | 2024-08-07 |
Integrative analysis identifies oxidative stress biomarkers in non-alcoholic fatty liver disease via machine learning and weighted gene co-expression network analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1335112
PMID:38476236
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和加权基因共表达网络分析,识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物 | 本研究发现了两个与非酒精性脂肪肝病中氧化应激密切相关的关键基因,CDKN1B和TFAM,这些基因可能作为新的诊断和治疗靶点 | NA | 识别非酒精性脂肪肝病中的氧化应激生物标志物,为临床管理提供新的视角 | 非酒精性脂肪肝病中的氧化应激相关基因 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据 | 涉及31个交集基因和NASH小鼠模型中的肝脏组织 | NA | NA | NA | NA |
| 6572 | 2024-08-07 |
CD81 and CD82 expressing tumor-infiltrating lymphocytes in the NSCLC tumor microenvironment play a crucial role in T-cell activation and cytokine production
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1336246
PMID:38515751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌肿瘤微环境中表达CD81和CD82的肿瘤浸润淋巴细胞在T细胞激活和细胞因子产生中的重要作用 | 发现四跨膜蛋白家族成员CD81和CD82在激活的T细胞中表达,并与激活和耗竭标记物有强相关性,体外实验证实IL-2刺激的T细胞中CD81和CD82表达增加 | NA | 阐明非小细胞肺癌肿瘤微环境中与T细胞激活相关的分子特征 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本中的T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名非小细胞肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6573 | 2024-08-07 |
SAP-expressing T peripheral helper cells identify systemic lupus erythematosus patients with lupus nephritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1327437
PMID:38550577
|
研究论文 | 本文研究了SAP表达的T外周辅助细胞在系统性红斑狼疮(SLE)患者中的作用,特别是与狼疮性肾炎(LN)的关系。 | 首次探讨了SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用,并利用单细胞RNA测序数据验证了其在肾浸润T细胞中的表达。 | NA | 探讨SAP表达的T外周辅助细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞(PBMC)和肾浸润T细胞。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序(scRNA seq) | NA | 细胞表面标记和细胞内SAP的表达数据 | 30名SLE患者(包括10名LN患者)和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 6574 | 2024-08-07 |
Identification of potential biomarkers for idiopathic pulmonary arterial hypertension using single-cell and bulk RNA sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1328234
PMID:38586587
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序分析,探索特发性肺动脉高压(IPAH)中的细胞异质性和分子病理,并识别潜在的生物标志物 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序数据,首次识别出12个候选生物标志物,并通过RT-qPCR验证了其中5个基因在肺动脉内皮细胞中的表达差异 | NA | 揭示IPAH的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 特发性肺动脉高压(IPAH)的细胞异质性和分子病理 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序 | NA | RNA | 涉及三个IPAH数据集和两个额外的PAH数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6575 | 2024-08-04 |
Perturbed liver gene zonation in a mouse model of non-alcoholic steatohepatitis
2024-May, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.155830
PMID:38428673
|
研究论文 | 本研究探讨了非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型中肝脏基因分区的扰动 | 揭示了Wnt信号通路在小鼠NASH模型中如何影响肝脏基因分区的变化 | 研究未能探讨RSPO3过表达或Rspo3敲低对NASH病理的影响 | 研究非酒精性脂肪性肝炎中的肝脏基因分区及其调节机制 | 小鼠模型中的非酒精性脂肪性肝炎 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 空间转录组学、bulk RNAseq、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6576 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of hepatic non-parenchymal cell responses to chronic PFO5DoDA exposure in male mice
2024-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123721
PMID:38462192
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了雄性小鼠肝脏非实质细胞在长期暴露于PFO5DoDA后的异质性反应。 | 首次详细研究了PFO5DoDA对肝脏非实质细胞的影响,揭示了这些细胞在暴露后的异质性反应和相互作用变化。 | 研究仅限于雄性小鼠,且样本量较小,可能影响结果的普遍性。 | 探讨PFO5DoDA暴露对肝脏非实质细胞的异质性影响及其机制。 | 雄性小鼠肝脏非实质细胞在PFO5DoDA暴露后的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 15,008个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6577 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling reveals transcriptome dynamics during bovine oocyte growth
2024-Apr-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10234-0
PMID:38580918
|
研究论文 | 本研究运用单细胞RNA测序揭示了牛卵母细胞生长过程中的转录组动态变化 | 通过单细胞RNA测序首次揭示了牛卵母细胞各生长阶段关键基因和通路的独特数据集 | 大部分研究集中于已完全成熟的卵母细胞,难以获得早期发育阶段的数据 | 探讨牛卵母细胞从次级卵泡阶段到中腺泡阶段的转录组动态 | 牛卵母细胞,包括不同直径的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 已知直径的卵母细胞(< 60 到 > 120 μm) | NA | NA | NA | NA |
| 6578 | 2024-08-04 |
SOXC are critical regulators of adult bone mass
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47413-2
PMID:38580651
|
研究论文 | 这篇文章探讨了SOXC转录因子在调控成年骨量中的重要性 | 揭示了SOXC通过调节骨质吸收和形成在成年骨量维持中的作用 | 尚未完全理解SOXC在成人骨量控制中的具体机制 | 研究SOXC对成年骨量的调控作用 | 使用SOXC功能丧失和功能获得小鼠模型进行研究 | 生物医学 | 骨质疏松症 | 小鼠模型 | 功能丧失和功能获得模型 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 6579 | 2024-08-07 |
Targeting pathogenic CD8+ tissue-resident T cells with chimeric antigen receptor therapy in murine autoimmune cholangitis
2024-Apr-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46654-5
PMID:38580644
|
研究论文 | 本研究使用Il12bIl2ra小鼠(DKO小鼠)作为自身免疫性胆管炎模型,通过Cd8a敲除或抗CD8α抗体治疗预防/减少胆管免疫病理,并开发针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体(CAR)-T细胞疗法。 | 首次描述了针对表达PD-1的CD8 Trm细胞的嵌合抗原受体(CAR)-T细胞的开发,并证明了其在治疗自身免疫性胆管炎中的潜在疗效。 | NA | 研究CD8 Trm细胞在自身免疫性胆管炎中的致病作用及PD-1靶向CAR-T细胞的潜在治疗用途。 | 自身免疫性胆管炎模型小鼠及CD8 Trm细胞。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Il12bIl2ra小鼠(DKO小鼠)作为模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6580 | 2024-08-07 |
Metacell-based differential expression analysis identifies cell type specific temporal gene response programs in COVID-19 patient PBMCs
2024-Apr-05, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00364-2
PMID:38580667
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,利用元细胞方法分析COVID-19患者外周血单个核细胞(PBMCs)中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 提出了一种新的计算框架,使用元细胞作为“重复”以增加统计严谨性,并展示了这种方法在保留表达变异性和产生更有生物学意义的差异表达基因(DEGs)方面的优势 | 当前单细胞RNA测序分析存在基因检测数量少、实验成本高导致重复样本不足以及数据分析中将单个细胞视为独立测量导致统计膨胀的问题 | 旨在解决单细胞RNA测序技术在时间序列样本分析中的局限性 | COVID-19患者外周血单个核细胞(PBMCs)中的细胞类型特异性时间基因响应程序 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 时间序列的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |