单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 6521 - 6540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6521 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell-cell communication and potential biomarker in sepsis and septic shock patients
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111938
PMID:38593502
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症与脓毒性休克患者的细胞间通信及潜在生物标志物 | 研究首次识别了脓毒症单核细胞中的Resistin信号通路和脓毒性休克单核细胞中的IL16信号，证明了这两个分子可能作为脓毒症和脓毒性休克的潜在诊断标志物 | 研究仅在鼠模型中进行了验证，尚需更大规模的人体临床数据支持 | 旨在识别脓毒症和脓毒性休克的潜在生物标志物 | 健康个体、脓毒症和脓毒性休克患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康个体与脓毒症、脓毒性休克患者的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6522 | 2024-08-05 |
Prognostic and immunological implications of glutathione metabolism genes in lung adenocarcinoma: A focus on the core gene SMS and its impact on M2 macrophage polarization
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111940
PMID:38593503
|
研究论文 | 该研究探讨了谷胱甘肽代谢基因在肺腺癌中的预后和免疫环境的作用。 | 提出了一个包含七个谷胱甘肽代谢基因的风险特征模型，并发现核心基因SMS与M2巨噬细胞极化相关。 | 本文对谷胱甘肽代谢在肺腺癌中的角色缺乏全面的研究，可能导致结论的局限性。 | 研究谷胱甘肽代谢基因与肺腺癌患者预后和免疫微环境之间的关系。 | 肺腺癌患者，分为高风险和低风险组进行分析。 | 数字病理学 | 肺癌 | Lasso结合Cox回归，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了六个GEO数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6523 | 2024-08-05 |
Revealing the pathogenesis of keloids based on the status: Active vs inactive
2024-May, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15088
PMID:38685820
|
研究论文 | 本研究分析了活跃与非活跃瘢痕疙瘩的转录组特征。 | 首次将瘢痕疙瘩的活动状态纳入转录组分析，揭示了活跃瘢痕疙瘩中促炎性成纤维细胞的显著增加。 | 研究仅限于上胸部或背部的瘢痕疙瘩样本，可能影响结果的广泛适用性。 | 旨在探究不同活动状态瘢痕疙瘩的病理机制。 | 选取了活跃和非活跃的瘢痕疙瘩、成熟瘢痕及正常瘢痕样本。 | 数字病理 | 疤痕疙瘩 | 单细胞RNA测序和多重免疫荧光 | NA | 组织样本 | 使用了活跃和非活跃的瘢痕疙瘩、成熟瘢痕和正常瘢痕样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6524 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune cell dysfunction in the peripheral blood of patients with highly aggressive gastric cancer
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13591
PMID:38319150
|
研究论文 | 本研究采用单细胞RNA测序揭示了高度侵袭性胃癌患者外周血中免疫细胞的功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序展示了HAGC患者外周血单核细胞的显著变化，特别是嗜中性粒细胞的成熟度及其对T细胞的抑制作用 | 研究样本量较小，仅包括18名患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 这个研究旨在揭示高度侵袭性胃癌患者的免疫反应 | 研究对象包括七名HAGC患者、六名正常晚期胃癌患者及五名健康个体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 共18个样本，其中包括7名HAGC患者、6名正常晚期胃癌患者和5名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 6525 | 2024-08-05 |
T-Cell-Based Platform for Functional Screening of T-Cell Receptors Identified in Single-Cell RNA Sequencing Data Sets of Tumor-Infiltrating T-Cells
2024-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4972
PMID:38686347
|
研究论文 | 本研究展示了一种结合全转录组和T细胞受体测序的有效方法，用以识别肿瘤反应性TCR克隆类型 | 创新点在于建立了一种高效的体外功能检测平台，以筛选大量通过单细胞RNA测序识别的TCR克隆类型 | 最初开发的检测主要针对人源TCR，虽然也成功应用于小鼠源的TCR，但适用性仍需进一步验证 | 研究旨在开发和验证一种高效的TCR功能筛选方法 | 研究对象为从肿瘤浸润的T细胞中隔离出的TCR克隆 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq），全转录组测序 | NA | mRNA | 肿瘤样本和同系小鼠肿瘤模型中衍生的CD8和CD4 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6526 | 2024-08-05 |
Tumor-associated macrophage subtypes on cancer immunity along with prognostic analysis and SPP1-mediated interactions between tumor cells and macrophages
2024-Apr, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011235
PMID:38648200
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAM）亚型对癌症免疫和预后的影响 | 研究揭示了TAM的异质性，识别了十一种亚型及其对预后的影响，并发现SPP1通路在TAM亚型之间及与肿瘤细胞之间的关键通信作用 | 对不同癌症类型中TAM的分子特征和临床相关性的系统性研究仍然缺乏 | 系统探索不同癌症类型中TAM的分子特征及其对癌症预后的影响 | 三种不同肿瘤类型的单细胞RNA测序数据，分析巨噬细胞的克隆和分类 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 三种不同肿瘤类型的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6527 | 2024-08-04 |
scRNA-seq characterizing the heterogeneity of fibroblasts in breast cancer reveals a novel subtype SFRP4+ CAF that inhibits migration and predicts prognosis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1348299
PMID:38686196
|
研究论文 | 本文研究了乳腺癌中癌相关成纤维细胞的异质性，并首次发现了一种新的SFRP4+ CAF亚型，抑制迁移并预测预后 | 首次鉴定了SFRP4+ CAF亚型，主要存在于正常组织中，并发现其对乳腺癌细胞迁移具有抑制作用 | 尽管发现了新的CAF亚型，但其功能机制和临床应用仍需进一步研究 | 旨在全面了解乳腺癌中癌相关成纤维细胞的特征和作用 | 研究对象为14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本中的CAF | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 样本 | 14个乳腺癌正常-肿瘤配对样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6528 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing and ATAC sequencing identify novel biomarkers for bicuspid aortic valve-associated thoracic aortic aneurysm
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1265378
PMID:38685981
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序和ATAC测序识别与二尖瓣主动脉和胸主动脉瘤相关的新生物标志物 | 首次系统性评估了二尖瓣主动脉与胸主动脉瘤相关组织的细胞组成，并识别了不同表达基因 | 样本量较小，仅来自两名BAV患者和两名心脏移植供体 | 提高对二尖瓣主动脉病因学的理解 | 二尖瓣主动脉和胸主动脉瘤相关的组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | NA | 组织样本 | 4个样本（2名BAV患者和2名心脏移植供体） | NA | NA | NA | NA |
| 6529 | 2024-08-05 |
Narrow band imaging-based radiogenomics for predicting radiosensitivity in nasopharyngeal carcinoma
2024-Jun, European journal of radiology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1016/j.ejro.2024.100563
PMID:38681663
|
研究论文 | 本研究评估了窄带成像内镜在利用放射组学预测鼻咽癌放射敏感性的有效性，并探讨相关的分子机制 | 基于窄带成像的放射组学模型为预测鼻咽癌放射敏感性提供了一种新颖有效的方法 | 论文中未提及研究的局限性 | 研究的目的是评估窄带成像内镜在鼻咽癌放射敏感性预测中的有效性 | 参与研究的对象是57名经过病理诊断的鼻咽癌患者 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | RNA测序 | 随机森林算法 | 图像 | 57名鼻咽癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6530 | 2024-08-04 |
Identification of eight genes associated with recurrent patellar dislocation
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109697
PMID:38680665
|
研究论文 | 本研究首次通过全外显子测序识别与反复髌骨脱臼相关的八个基因 | 识别出CPD基因与反复髌骨脱臼的相关性，提供了全新的视角来理解该疾病 | 研究可能缺乏大样本验证，样本的多样性有待提升 | 识别反复髌骨脱臼的易感基因并探讨其潜在发病机制 | 关注反复髌骨脱臼患者的基因组特征 | NA | NA | 全外显子测序 (WES) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6531 | 2024-08-04 |
Stratification and prognostic evaluation of breast cancer subtypes defined by obesity-associated genes
2024-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00988-0
PMID:38676834
|
研究论文 | 研究探讨与肥胖相关基因定义的乳腺癌亚型的分层与预后评估 | 识别了七个中心基因作为乳腺癌的分子诊断生物标志物，并提出了通过神经网络模型进行有效的诊断 | 七个中心基因作为预后分子标志物表现不佳，生存预测AUC值大多数低于0.5 | 研究肥胖作为乳腺癌风险因素对其机制的影响 | 1226名乳腺癌患者，其被分为BRCA亚型1和亚型2 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR，RNA转录组数据分析 | 神经网络模型 | 基因表达数据 | 1226名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6532 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of metabolomics and transcriptomics to uncover biomarkers in sepsis
2024-04-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59400-0
PMID:38678059
|
研究论文 | 利用代谢组学结合RNA测序识别脓毒症患者血液中的生物标志物并发现新的诊断和治疗靶点 | 首次联合应用代谢组学和转录组学，鉴定脓毒症特异性生物标志物和靶基因 | 样本量较小，仅包含16个脓毒症患者和11个系统性炎症反应综合症患者 | 识别脓毒症的生物标志物和潜在靶点 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合症患者的血液样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | 液相色谱-质谱联用技术（LC-MS/MS）和RNA测序 | NA | 代谢物和基因数据 | 16个脓毒症患者和11个SIRS患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6533 | 2024-08-05 |
scINRB: single-cell gene expression imputation with network regularization and bulk RNA-seq data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae148
PMID:38600665
|
研究论文 | 提出了一种基于网络正则化和批量RNA-seq数据的单细胞基因表达填充方法scINRB | scINRB通过网络正则化非负矩阵分解保持细胞间和基因间的相似性，并结合批量RNA-seq数据的信息 | 尽管scINRB表现出色，但研究的适用性和数据类型可能仍受限于特定的实验条件 | 开发一种准确且稳健的单细胞基因表达数据填充方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的基因表达缺失（dropout事件） | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 非负矩阵分解 | 数据集 | 在模拟和实验数据集上进行测试 | NA | NA | NA | NA |
| 6534 | 2024-08-05 |
The Characteristics of Macrophage Heterogeneity in Atherosclerotic Aortas
2024-02, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-023-10434-1
PMID:37713049
|
研究论文 | 本文研究了动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的特征 | 通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群的不同表型和功能特性 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏大型临床样本的验证 | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其异质性 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 6个亚群（基于单细胞分析） | NA | NA | NA | NA |
| 6535 | 2024-08-05 |
A Novel Four-Gene Signature Based on Nonsense-Mediated RNA Decay for Predicting Prognosis in Hepatocellular Carcinoma: Bioinformatics Analysis and Functional Validation
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S450711
PMID:38680213
|
研究论文 | 本文提出了一种基于无义介导的RNA降解(NMD)的四基因风险模型，用于预测肝细胞癌的预后 | 创新的NMD风险模型通过四个NMD相关基因有效区分肝细胞癌的高低风险组 | 尚未提及具体的临床试验数据来进一步支持模型的临床适用性 | 研究NMD在肝细胞癌预后方面的潜力 | 374个肝细胞癌样本和50个正常肝样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox回归 | 无 | 基因表达数据 | 374个肝细胞癌样本和50个正常肝样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6536 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of a Dendritic Cell Marker Genes Signature to Predict Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2024-Apr-29, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000521
PMID:38679823
|
研究论文 | 这项研究构建了一种新的树突状细胞标记基因特征，用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗反应 | 提出了一种新的树突细胞标记基因特征，能够独立预测患者预后和免疫治疗效果 | 仅在有限的独立队列中验证了预测能力 | 开发预测肺腺癌预后及其对免疫治疗反应的新方法 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 在训练队列和6个独立队列中涉及到多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6537 | 2024-08-05 |
Naive and regulatory B-cell transcription patterns guide the increased risk of papillary thyroid carcinoma in obesity
2024-Apr-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2024.70.4.19
PMID:38678617
|
研究论文 | 本文探讨了肥胖与乳头状甲状腺癌之间的关系，分析了B细胞转录模式的影响 | 揭示了肥胖人群中B细胞的转录模式与乳头状甲状腺癌风险增加之间的关联 | 尚未明确肥胖相关脂肪因子的具体调控机制 | 探讨肥胖如何增加乳头状甲状腺癌的风险及其相关机制 | 研究肥胖与乳头状甲状腺癌之间的关系及相关B细胞转录模式 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA序列数据 | 从GEO数据库下载的肥胖和健康人群的皮下脂肪组织RNA序列数据，以及乳头状甲状腺癌的肿瘤组织数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6538 | 2024-08-04 |
Comprehensiveness cuproptosis related genes study for prognosis and medication sensitiveness across cancers, and validation in prostate cancer
2024-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57303-8
PMID:38671021
|
研究论文 | 本研究对铜死亡相关基因（CRGs）在多种癌症中的作用进行了全面调查 | 揭示了CRGs在不同癌症中的预后价值和药物敏感性关联，建立了前列腺癌的预后特征 | 研究中关于CRGs功能的机制仍然模糊，可能需要更多的实验来验证 | 探讨CRGs在各种癌症中的作用及其在前列腺癌中的验证 | 参与分析的26种癌症及前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 26种癌症中的多种样本，以及前列腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6539 | 2024-08-05 |
Short-Term Dietary Restriction Potentiates an Anti-Inflammatory Circulating Mucosal-Associated Invariant T-Cell Response
2024-Apr-22, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16081245
PMID:38674935
|
研究论文 | 这篇文章探讨了短期饮食限制对抗炎症的循环粘膜相关不变T细胞反应的影响 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了短期蛋白-卡路里饮食限制下MAIT细胞的转录组反应，并揭示了与肠道微生物种类变化的关系 | 对短期饮食限制及其对全身免疫影响的理解仍然不足，研究样本仅限于健康志愿者 | 研究短期饮食限制在调节术后炎症中的潜在作用 | 健康志愿者的PBMCs和粪便样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和粪便样本 | 健康志愿者4名，进行为期4天的饮食限制 | NA | NA | NA | NA |
| 6540 | 2024-08-05 |
PPARγ attenuates cellular senescence of alveolar macrophages in asthma-COPD overlap
2024-Apr-20, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02790-6
PMID:38643159
|
研究论文 | 本研究探讨了PPARγ在哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症中的作用。 | 首次揭示了PPARγ在调节与细胞衰老相关的巨噬细胞特征中的重要作用。 | 本研究主要基于公共数据集，临床验证尚需进行。 | 研究PPARγ如何影响哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症中巨噬细胞的衰老。 | 主要关注于哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症患者的肺部单核细胞/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 哮喘-慢性阻塞性肺疾病重叠症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、RNA-Seq、CyTOF | NA | RNA，细胞数据 | 通过公共数据集及独立队列研究得到的BALF样本数据 | NA | NA | NA | NA |