单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 6521 - 6540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6521 2024-08-07
Single-cell RNA-sequencing of virus-specific cellular immune responses in chronic hepatitis B patients
2024-Apr-08, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术研究慢性乙型肝炎患者的HBV特异性细胞免疫反应 创建了HBV免疫反应的单细胞RNA测序数据集,有助于更好地理解失调的免疫反应 NA 探索慢性乙型肝炎患者中HBV特异性T细胞反应的转录变化 慢性乙型肝炎患者和健康对照者的血液及肝脏组织样本 数字病理学 乙型肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 21名慢性乙型肝炎患者和10名健康对照者的血液样本,以及5份匹配的肝脏活检样本 NA NA NA NA
6522 2024-08-04
Histone 3 lysine 9 acetylation-specific reprogramming regulates esophageal squamous cell carcinoma progression and metastasis
2024-Apr, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了H3K9ac在食道鳞状细胞癌(ESCC)进展和转移中的特定作用 识别了ESCC中H3K9ac特异性的表观遗传重编程及其与肿瘤发生和转移的关系 仅分析了三个ESCC患者的样本,样本量较小 揭示H3K9ac在食道鳞状细胞癌进展和转移中的作用 食道鳞状细胞癌(ESCC)患者的配对正常组织、原发肿瘤和转移淋巴结组织 数字病理 食道癌 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 3名食道鳞状细胞癌患者的配对样本 NA NA NA NA
6523 2024-08-07
Granzyme K- and amphiregulin-expressing cytotoxic T cells and activated extrafollicular B cells are potential drivers of IgG4-related disease
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体及B细胞受体测序,全面、无偏倚地观察了IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞 首次揭示了Granzyme K和amphiregulin表达的细胞毒性T细胞及激活的外滤泡B细胞在IgG4相关疾病中的潜在驱动作用 NA 探索IgG4相关疾病中组织浸润的T细胞和B细胞的全面、无偏倚的视图 IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞和B细胞 免疫学 IgG4相关疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 68名IgG4相关疾病患者和30名Sjögren综合征患者 NA NA NA NA
6524 2024-08-04
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-Mar-29, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本研究提供了一种单细胞和单核转录组分析的新方法,适用于脑类器官的研究 通过使用单核而非完整细胞进行测序,克服了难以分离细胞类型的限制,使转录组分析具有更广泛的适用性 未提及具体的局限性 本研究旨在推动脑类器官研究中的单细胞转录组学应用 关注于脑类器官中的神经元和非神经元细胞类型 数字病理学 NA 转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
6525 2024-08-04
Intermittent fasting promotes ILC3s secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了间歇性禁食如何促进ILC3分泌IL-22,从而促进白色脂肪组织的变褐。 提出了ILC3/IL-22/IL-22R轴在间歇性禁食代谢益处中的作用机制。 未涉及潜在的临床转化和人类研究 探讨间歇性禁食对代谢益处的机制。 研究了小鼠肠道内的ILC3细胞和其对白色脂肪组织变褐的影响。 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 细胞数据 饮食诱导肥胖小鼠 NA NA NA NA
6526 2024-08-04
Intratumoral CXCR4hi neutrophils display ferroptotic and immunosuppressive signatures in hepatoblastoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究发现肝母细胞瘤中的CXCR4高表达中性粒细胞表现出铁死亡和免疫抑制特征 揭示了肝母细胞瘤内不同发展阶段的中性粒细胞及其在肿瘤免疫抑制中的作用 未提及具体的临床试验数据或长期结果 探讨肝母细胞瘤中肿瘤浸润中性粒细胞的功能特征 肝母细胞瘤中的肿瘤浸润中性粒细胞 数字病理学 肝母细胞瘤 批量RNA测序和单细胞RNA测序 NA 基因数据 研究中分析了不同发育阶段的中性粒细胞的样本 NA NA NA NA
6527 2024-08-04
Unraveling the mechanisms of NK cell dysfunction in aging and Alzheimer's disease: insights from GWAS and single-cell transcriptomics
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了衰老与阿尔茨海默病(NK细胞功能失常)之间的机制 通过GWAS和单细胞转录组学分析,揭示NK细胞在衰老与阿尔茨海默病中的作用 未提及具体的实验室验证或长期跟踪研究 研究衰老如何影响NK细胞的功能以及与阿尔茨海默病的关系 研究对象为不同年龄段的阿尔茨海默病患者的NK细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞核转录组测序,基因组宽关联研究(GWAS) NA 基因表达数据 2,171名60岁以上的老年人 NA NA NA NA
6528 2024-08-07
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用多色免疫组织化学技术(mIHC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了结直肠癌(CRC)组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义,并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析,揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性,并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 NA 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 数字病理学 结直肠癌 多色免疫组织化学(mIHC),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 组织样本 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 NA NA NA NA
6529 2024-08-07
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库,鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1,并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物,并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 NA 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制,并寻找新的预后生物标志物。 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 数字病理学 脑肿瘤 qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 蛋白质水平数据 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 NA NA NA NA
6530 2024-08-07
A division-of-labor mode contributes to the cardioprotective potential of mesenchymal stem/stromal cells in heart failure post myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了3D培养的间充质干细胞(MSCs)在心肌梗死后心力衰竭治疗中的保护作用及其机制 本研究首次揭示了3D MSCs在细胞层面的异质性和分工模式,并通过机器学习预测模型和网络服务器开发了预测MSCs分泌效能的配体模型 NA 提高MSCs的生产效率并寻找评估其治疗效能的新方法 3D培养的人脐带间充质干细胞(hUC-MSCs)及其在心肌梗死后心力衰竭治疗中的应用 细胞生物学 心血管疾病 单细胞和批量RNA测序 机器学习预测模型 RNA测序数据 使用了125种组合算法进行筛选,并对CD142+和CD142- MSCs进行了差异表达分析 NA NA NA NA
6531 2024-08-07
Comprehensive investigation into the influence of glycosylation on head and neck squamous cell carcinoma and development of a prognostic model for risk assessment and anticipating immunotherapy
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了糖基化在头颈鳞状细胞癌中的影响,并开发了一个预测模型用于风险评估和免疫治疗反应预测 首次详细阐明了糖基化与头颈鳞状细胞癌的关系,并开发了一个基于糖基化相关基因的风险预测模型 NA 研究糖基化在头颈鳞状细胞癌中的作用,并开发一个预测模型以评估患者风险和免疫治疗反应 头颈鳞状细胞癌 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 Cox回归和Lasso回归 基因数据 184个调控糖基化的基因 NA NA NA NA
6532 2024-08-07
Deep Imputation Bi-stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-cell RNA-sequencing Data
2024-Apr-12, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
research paper 本文提出了一种新的方法DSINMF,通过深度矩阵分解对单细胞RNA测序数据进行聚类 DSINMF方法包括特征选择、缺失值插补、降维和深度矩阵分解与双随机图正则化四个步骤,以提高聚类效果 NA 探索细胞异质性和功能,辅助识别疾病机制和生物标志物 单细胞RNA测序数据 digital pathology NA RNA-seq CNN 基因转录组数据 九个数据集 NA NA NA NA
6533 2024-08-07
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-Apr-10, Cell host & microbe IF:20.6Q1
研究论文 本研究探讨了老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法的增强敏感性现象,并通过元分析和单细胞RNA测序数据揭示了其潜在机制,特别是与肠道微生物群相关的特定肠型。 识别了一种与老年患者免疫疗法效果改善相关的特定肠型,并通过小鼠实验证实了其治疗潜力。 NA 探索老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法增强敏感性的机制,并寻找个性化癌症免疫疗法的新途径。 老年癌症患者的肠道微生物群及其对免疫疗法的影响。 NA 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 25个中小型试验 NA NA NA NA
6534 2024-08-05
scRNAseq and High-Throughput Spatial Analysis of Tumor and Normal Microenvironment in Solid Tumors Reveal a Possible Origin of Circulating Tumor Hybrid Cells
2024-Apr-08, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 利用高通量单细胞和空间转录组学分析肿瘤混合细胞的来源. 首次识别共表达上皮和巨噬细胞标记的肿瘤混合细胞,并提供了其特征转录组的信息. 关于循环混合细胞在组织中的来源的研究较少,且基于一两种标记的研究方法有限. 探讨循环混合细胞的组织来源及其在不同类型癌症中的表现. 肿瘤混合细胞(THCs)和正常组织中的细胞(NHCs)的转录组特征. 数字病理学 乳腺癌和结肠癌 高通量单细胞转录组和空间转录组学 NA NA 涉及乳腺癌和结肠癌的稀有样本 NA NA NA NA
6535 2024-08-04
Defining T cell receptor repertoires using nanovial-based binding and functional screening
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文利用纳米瓶进行T细胞受体多样性的定义和筛选 提出了一种新颖的纳米瓶技术,可以有效地捕获和激活特定的T细胞,从而链接TCR序列与其靶标 对特定抗原的识别和效率可能受到pMHC的选择和设计限制 开发一种新的方法来识别和筛选抗原反应性T细胞,以应用于免疫疗法 通过纳米瓶捕获并排序反应特定病毒和癌症抗原的T细胞 数字病理学 癌症 单细胞测序 NA 文本 NA NA NA NA NA
6536 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-Apr, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析新鲜和冷冻组织中的细胞,揭示了冷冻标志,表现为应激和激活的基因上调 首次揭示了冷冻处理对人类组织T细胞、ILCs和NK细胞的单细胞RNA测序结果的影响,特别是应激和激活相关基因的上调 NA 研究冷冻处理对人类组织中细胞的单细胞RNA测序结果的影响 人类组织中的T细胞、ILCs和NK细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
6537 2024-08-07
High lymphocyte signature genes expression in parathyroid endocrine cells and its downregulation linked to tumorigenesis
2024-Apr, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了甲状旁腺内分泌细胞中淋巴细胞标志物的高表达及其与肿瘤发生的关系 首次发现甲状旁腺内分泌细胞中CD4和CD226的高表达,并揭示了其在甲状旁腺腺瘤发病机制中的作用 由于正常甲状旁腺样本获取困难,研究样本数量有限 深入理解甲状旁腺内分泌细胞的功能及其在肿瘤发生中的作用 甲状旁腺内分泌细胞及其在甲状旁腺腺瘤中的变化 数字病理学 甲状旁腺疾病 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 6个正常甲状旁腺样本和8个甲状旁腺腺瘤样本 NA NA NA NA
6538 2024-08-05
Machine Learning-Based Characterization and Identification of Tertiary Lymphoid Structures Using Spatial Transcriptomics Data
2024-Mar-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 该研究利用空间转录组数据对三级淋巴结构进行表征和识别 首次应用机器学习技术识别三级淋巴结构的标记,并建立预测模型 目前对TLS标记的一致性仍有待进一步验证 旨在通过机器学习方法识别和预测三级淋巴结构 三级淋巴结构及其标记基因 机器学习 癌症 空间转录组学 支持向量分类器 基因表达数据 NA NA NA NA NA
6539 2024-08-07
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods with and without Sample Multiplexing
2024-Mar-29, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究对比分析了有无样本多重化的单细胞RNA测序方法 首次对比了使用样本多重化的Parse Biosciences平台和未使用样本多重化的10x Genomics平台的单细胞RNA测序方法 研究仅使用了来自两名健康个体的PBMCs样本,可能限制了结果的普遍性 评估不同单细胞RNA测序方法在样本多重化与非多重化条件下的性能 来自两名健康个体的外周血单个核细胞(PBMCs) 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 两名健康个体的PBMCs样本 NA NA NA NA
6540 2024-08-04
A comprehensive multi-omics analysis identifies a robust scoring system for cancer-associated fibroblasts and intervention targets in colorectal cancer
2024-Mar-13, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究建立了一个癌症相关成纤维细胞的评分系统,并识别了结直肠癌的干预靶点 创新性地开发了一个基于CAF基因评分的系统,用于评估结直肠癌患者的免疫微环境和预后 研究的局限性在于样本量和真实性的验证需要进一步的临床试验支持 研究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的临床应用和生物学机制 癌症相关成纤维细胞及其在结直肠癌中的不同亚型 数字病理学 结直肠癌 机器学习分析 NA 基因组数据 多个结直肠癌队列的样本 NA NA NA NA
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