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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6501 | 2024-08-05 |
Characterization of macrophages in head and neck squamous cell carcinoma and development of MRG-based risk signature
2024-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60516-6
PMID:38688945
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研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌中的巨噬细胞特征,并开发了基于MRG的风险标志。 | 首次识别了8个具有预后潜力的巨噬细胞相关基因,并构建了预测模型,探讨了它们在HNSCC中的作用。 | 研究可能未考虑到所有可能影响HNSCC预后的因素,样本量和分类可能存在局限性。 | 研究巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其与疾病预后的关系。 | 头颈部鳞状细胞癌的患者样本及其巨噬细胞特征。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq,bulk RNA-seq | Cox回归模型 | 临床数据,基因表达数据 | 包含特定的HNSCC患者数据,样本量在文中未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6502 | 2024-08-05 |
Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons
2024-Apr-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306382121
PMID:38640347
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研究论文 | 该文章探讨了海马体中表达生长抑素的GABA能抑制神经元的功能特化。 | 该研究为功能性不同的海马CA1抑制神经元亚群提供了一种新的识别和访问方法,揭示了它们在功能上的多样性。 | 该研究未完全解决神经元的具体功能与其转录组特征之间的联系。 | 研究海马抑制神经元的亚群特征及其功能特化。 | 研究对象为海马CA1区的抑制神经元亚群。 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四种小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6503 | 2024-08-04 |
Spatiotemporal transcriptomic changes of human ovarian aging and the regulatory role of FOXP1
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00607-1
PMID:38594460
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研究论文 | 该研究系统性地表征人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,首次揭示了八种卵巢细胞在衰老过程中的时空分子特征 | 本文对衰老机制的理解仍有限,可能需要更多的实验进行验证 | 旨在全面理解人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 研究对象为人类卵巢细胞的岁月变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6504 | 2024-08-05 |
Predicting mitophagy-related genes and unveiling liver endothelial cell heterogeneity in hepatic ischemia-reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1370647
PMID:38694511
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的作用 | 该研究识别了8个关键基因并建立了基于这些基因的诊断模型,揭示了内皮细胞的异质性 | 研究仅基于有限的样本和单细胞数据分析,可能需要更广泛的验证 | 探究线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的重要性 | 研究对象包括44个肝脏缺血再灌注损伤样本及44个正常对照样本 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 44个肝脏缺血再灌注损伤样本和44个正常对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6505 | 2024-08-05 |
Galectin-3 inhibition ameliorates alveolar epithelial cell pyroptosis in phosgene-induced acute lung injury
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111965
PMID:38583242
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研究论文 | 本研究探讨了Galectin-3抑制对磷酸酯引发的急性肺损伤中的肺泡上皮细胞焦亡的改善作用 | 首次提出Galectin-3通过抑制Gal3/caspase-8/GSDMD信号通路来改善肺泡上皮细胞焦亡的机制 | 该研究主要在小鼠模型中进行,临床应用的转化需要进一步验证 | 探究Galectin-3在磷酸酯引发的急性肺损伤中的作用及其机制 | 磷酸酯引发的急性肺损伤模型中的肺泡上皮细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型,未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6506 | 2024-08-05 |
Establishment and validation of a tumor-infiltrating γδT cell related prognostic gene signature in head and neck squamous cell carcinoma
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112054
PMID:38608477
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研究论文 | 本文建立并验证了与肿瘤浸润γδT细胞相关的预后基因特征在头颈部鳞状细胞癌中的应用 | 首次提出γδT细胞基因特征作为头颈部鳞状细胞癌患者的独立预后指标 | 本研究仅使用了TCGA HNSCC数据库及100个肿瘤样本,样本数量可能限制了结果的广泛适用性 | 评估γδT细胞在头颈部鳞状细胞癌中的浸润及其与临床病理因素的关联 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本和相应的基因特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因组数据 | 100个头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6507 | 2024-08-05 |
CXCR6 defines therapeutic subtypes of CD4+ cytotoxic T cell lineage for adoptive cell transfer therapy in pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111972
PMID:38569429
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研究论文 | 本研究探讨CXCR6作为新生儿B细胞急性淋巴细胞白血病中细胞毒性CD4 T细胞的治疗亚型的作用 | 提出CXCR6可以作为小儿B-ALL患者骨髓中细胞毒性CD4 Trm细胞的标志 | 需要更多的临床数据验证CXCR6在其他患者群体中的作用 | 研究CXCR6在小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者中细胞毒性CD4 T细胞的影响 | 小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者及健康供体的骨髓和外周血样本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术 (FCM), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 集成机器学习算法 | 血液样本 | 包括小儿B-ALL患者和健康供体的样本,具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6508 | 2024-08-05 |
The skin circadian clock gene F3 as a potential marker for psoriasis severity and its bidirectional relationship with IL-17 signaling in keratinocytes
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111993
PMID:38565044
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研究论文 | 本研究探讨了皮肤生物钟基因F3与牛皮癣严重程度及其与IL-17信号传导之间的双向关系 | 揭示了皮肤生物钟基因F3与IL-17信号通路之间的双向联系,指出F3可能通过激活JAK-STAT信号在角质形成细胞中引发异常细胞内炎症 | 关于F3和IL-17信号通路关系的机制需要进一步研究 | 研究皮肤生物钟基因F3与牛皮癣病理机制之间的关系 | 牛皮癣病灶与健康对照组 | 数字病理 | 牛皮癣 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 生物信息学数据 | GSE121212的牛皮癣病灶和健康对照样本,以及多个数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6509 | 2024-08-04 |
TENET: Triple-enhancement based graph neural network for cell-cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2024-May-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168543
PMID:38508302
|
研究论文 | 本文提出了一种新的图神经网络方法TENET,用于从空间转录组数据重构细胞-细胞相互作用网络 | TENET采用三重增强机制来改善细胞-细胞相互作用网络的重构精度,尤其在稀疏连接和噪声数据的情况下表现出色 | 可能在特定类型的噪声数据或极端稀疏的连接情况下依然存在准确性挑战 | 旨在提升细胞-细胞相互作用网络的重构准确性 | 重构细胞-细胞相互作用网络 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络 | 真实和合成空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6510 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape of peripheral blood cells provides insights into adaptation of red-eared sliders (Trachemys scripta elegans)
2024-May, Integrative zoology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/1749-4877.12725
PMID:37226359
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研究论文 | 本研究描绘了红耳龟外周血细胞的单细胞转录组图谱,探讨了其环境适应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术对红耳龟外周血细胞进行转录组分析,发现新的免疫信号类型 | 目前的研究主要集中在外周血细胞的转录组分析,未深入探讨其功能和机制 | 研究红耳龟在环境压力下的适应机制,主要通过血液学角度进行探索 | 红耳龟外周血细胞的多种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6511 | 2024-08-05 |
Novel Phosphate Transporter-B PvPTB1;1/1;2 Contribute to Efficient Phosphate Uptake and Arsenic Accumulation in As-Hyperaccumulator Pteris vittata
2024-Apr-30, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.3c09335
PMID:38624169
|
研究论文 | 本研究揭示了低亲和力磷转运体-B 1家族介导的新型磷/砷运输系统在As-超积累植物中的作用 | 首次在维管植物中识别出两种膜蛋白基因,并确认其在磷摄取和砷积累中的作用 | 未提供关于其他植物转运体的对比分析数据 | 研究磷和砷在As-超积累植物中的摄取机制 | As-超积累植物Pteris vittata及其低亲和力磷转运体-B 1家族 | 植物生理学 | NA | 功能补偿实验和转基因分析 | NA | 基因表达数据和细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6512 | 2024-08-05 |
Cauchy hyper-graph Laplacian nonnegative matrix factorization for single-cell RNA-sequencing data analysis
2024-Apr-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05797-4
PMID:38684942
|
研究论文 | 本文提出了一种Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解方法用于单细胞RNA测序数据分析 | 使用Cauchy损失函数替代传统非负矩阵分解中的欧几里得距离,大大降低噪声影响,并结合超图约束。 | 至于模型的训练和优化过程的复杂性,具体应用于更大规模数据时的表现尚未讨论 | 探讨和改善单细胞数据分析中的聚类准确性 | 七个单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解 | Cauchy超图拉普拉斯非负矩阵分解 | RNA测序数据 | 七个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6513 | 2024-08-05 |
A novel defined programmed cell death related gene signature for predicting the prognosis of serous ovarian cancer
2024-Apr-29, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01419-y
PMID:38685095
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研究论文 | 本研究探讨了差异表达的程序性细胞死亡基因在浆液性卵巢癌中的作用及其作为临床预后预测因子的潜力 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定了48个与凋亡信号和氧化应激通路显著相关的差异表达程序性细胞死亡基因,并发现GNA15作为独立预后标志物 | 研究的局限性在于主要依赖于公开数据库的数据,可能存在样本偏差或数据不完整的情况 | 研究旨在探讨程序性细胞死亡基因在浆液性卵巢癌异质性中的贡献以及其作为预后标志的潜力 | 研究对象为浆液性卵巢癌患者的细胞和基因数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 研究涉及的样本数量未具体说明,主要利用两组大型社会数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6514 | 2024-08-05 |
scCompressSA: dual-channel self-attention based deep autoencoder model for single-cell clustering by compressing gene-gene interactions
2024-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10286-2
PMID:38684946
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研究论文 | 提出了一种基于自注意力的深度自编码器模型scCompressSA,用于单细胞聚类,通过压缩基因间相互作用来增强聚类精度 | 该研究提出的双通道自注意力块能够有效整合拓扑特征,从而提高单细胞聚类的准确性 | 对于RNA测序数据的高随机性仍然是细胞类型检测面临的挑战 | 研究单细胞聚类的分子机制并提高细胞类型的检测精度 | 利用scRNA-seq数据中的基因间相互作用来提取特征进行细胞聚类 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度自编码器 | 基因表达数据 | 多个基准scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6515 | 2024-08-04 |
Targeting nucleotide metabolic pathways in colorectal cancer by integrating scRNA-seq, spatial transcriptome, and bulk RNA-seq data
2024-Apr-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01356-5
PMID:38594466
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模RNA测序数据,对结直肠癌中的核苷酸代谢途径进行分析 | 通过不同的实验方法识别出新的结直肠癌治疗靶点ACO1和CPT2,并建立了以核苷酸代谢相关基因为基础的预后模型 | 研究主要依赖于数据分析和体外实验,临床应用需要进一步验证 | 探索结直肠癌中核苷酸代谢的特征及其对预后的影响 | 结直肠癌(CRC)及其相关的核苷酸代谢基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | 涉及多个结直肠癌样本,具体样本量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6516 | 2024-08-04 |
Miracula polaris - A New Species of Miracula from the East Fjords of Iceland
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2333611
PMID:38690034
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research paper | 本研究在冰岛东峡湾发现了一种新物种Miracula polaris。 | 发现了新的寄生生物Miracula polaris,扩展了对早分支卵菌类多样性的理解。 | 研究未深入探讨与已知物种之间的关联性,可能存在未知物种。 | 调查冰岛东峡湾的早分支卵菌类的多样性。 | 研究了寄生在海洋硅藻属中的新寄生物种。 | NA | NA | 分子系统发育学和形态特征分析 | NA | 环境测序数据 | 在冰岛东峡湾的研究站进行了取样,具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6517 | 2024-08-05 |
Role of proteoglycan synthesis genes in osteosarcoma stem cells
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1325794
PMID:38690160
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研究论文 | 本研究探讨了蛋白多糖合成基因在骨肉瘤干细胞中的作用 | 揭示了蛋白多糖和糖胺聚糖在骨肉瘤干细胞表型及肿瘤恶性程度中的关键作用 | 对蛋白多糖合成机制的了解依然有限 | 研究蛋白多糖/糖胺聚糖生物合成及相关基因在骨肉瘤中的作用 | 骨肉瘤干细胞及其相关临床样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq和传统RNA-seq | NA | 临床样本的基因表达数据 | 临床骨肉瘤标本的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6518 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing unveils T-cell characteristic in acute myeloid leukemia
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111927
PMID:38555820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性髓性白血病中T细胞的特征 | 文章创新性地分析了急性髓性白血病患者的T细胞亚群,特别是CD4+和CD8+ T细胞的组成变化 | 本研究的样本数量有限,可能影响结果的普遍适用性 | 探讨不同T细胞亚型在急性髓性白血病免疫失调中的作用 | 来自三名急性髓性白血病患者的骨髓样本中的T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名急性髓性白血病患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6519 | 2024-08-04 |
Differences in nature killer cell response and interference with mitochondrial DNA induced apoptosis in moxifloxacin environment
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111970
PMID:38608472
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研究论文 | 本文研究了环境中莫西沙星对自然杀伤细胞反应的影响及其对线粒体DNA诱导的凋亡的干扰 | 揭示了莫西沙星环境中NK细胞的新亚群体及其激活反应机制 | 样本量较小,仅来自3名健康成人 | 探索莫西沙星对NK细胞的免疫调节作用及其机制 | 健康成年人外周血单核细胞(PBMC) | 免疫学 | NA | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 细胞样本 | 3名健康成年人 | NA | NA | NA | NA |
| 6520 | 2024-08-05 |
Identification and validation of regulatory T cell-associated gene signatures to predict colon adenocarcinoma prognosis
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112034
PMID:38588631
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞相关基因特征在预测结肠腺癌预后中的作用 | 创新点在于建立了Tregs相关风险评分,并验证了其在结肠腺癌预后中的预测能力 | 本研究的局限性在于样本主要来源于TCGA数据集,可能存在选择偏倚 | 研究调节性T细胞在结肠腺癌预后中的重要性,以及寻找潜在的生物标志物 | 研究对象为结肠腺癌患者的临床信息、RNA-seq数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 使用TCGA数据集中的结肠腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |