本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6481 | 2024-08-07 |
Telocytes in the Luminal GI Tract
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.002
PMID:38342300
|
综述 | 本文综述了间质细胞(telocytes)在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色 | 探讨了间质细胞通过其长细胞质突起与其他细胞类型连接,形成三维网络,并在肠道中作为干细胞微环境的关键组成部分,提供Wnt蛋白促进干细胞和祖细胞增殖 | 单细胞RNA测序分析揭示了其他基质群体和微环境组织机制,对间质细胞在干细胞微环境中的作用提出了疑问 | 探讨间质细胞在胃肠道腔内的当前研究状态、存在的争议及未来研究方向 | 间质细胞在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6482 | 2024-08-04 |
High-dimensional deconstruction of ovarian cancer at single-cell precision reveals HEBP2 that reshape the TIME and drive carboplatin resistance
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101917
PMID:38554571
|
研究论文 | 该研究利用单细胞测序分析卵巢癌患者的肿瘤免疫微环境,探讨不同巨噬细胞亚群在卵巢癌进展中的作用。 | 该研究首次揭示了脂肪酸相关基因HEBP2在卵巢癌化疗耐药中的重要作用,且说明了其在改变肿瘤免疫微环境中发挥的作用。 | 未提及具体的样本量和实验细节,可能对结果的普遍适用性产生影响。 | 旨在揭示卵巢癌化疗耐药的机制,并研究HEBP2在这一过程中的作用。 | 研究对象为卵巢癌患者的肿瘤组织及其免疫细胞环境。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 未具体提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6483 | 2024-08-07 |
CCR7 affects the tumor microenvironment by regulating the activation of naïve CD8+ T cells to promote the proliferation of oral squamous cell carcinoma
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101924
PMID:38430712
|
研究论文 | 本文研究了CCR7通过调节幼稚CD8+ T细胞的激活来影响口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤微环境的机制 | 首次深入研究了CCR7在肿瘤微环境中对幼稚CD8+ T细胞抗肿瘤免疫反应的作用 | 仅通过CCR7敲除小鼠模型进行研究,可能需要更多临床数据支持 | 探讨CCR7在口腔鳞状细胞癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | CCR7在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的作用及对幼稚CD8+ T细胞的影响 | NA | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | CCR7敲除小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6484 | 2024-08-07 |
Insights into the role of the N6-methyladenosine reader IGF2BP3 in the progression of oral squamous cell carcinoma and its connection to cell-cycle control
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101932
PMID:38492500
|
研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷阅读器IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌进展中的作用及其与细胞周期控制的联系 | 本研究首次揭示了IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的过度表达,并发现其与细胞周期G2/M转换阶段的关联 | 研究主要基于批量测序和单细胞RNA测序数据,可能需要更多实验验证 | 探究IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对细胞周期的影响 | 口腔鳞状细胞癌中的IGF2BP3表达及其对细胞周期的影响 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6485 | 2024-08-07 |
Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer
2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03402-x
PMID:38492153
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6486 | 2024-08-07 |
Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm
2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.52014
PMID:38317016
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据,深入探讨了侵入颅内动脉瘤(IA)壁的中性粒细胞的特征和功能异质性 | 首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义,揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制 | NA | 阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义 | 中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义 | NA | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | 涉及人和小鼠模型的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6487 | 2024-08-07 |
Identification of SARS-CoV-2-specific T cell and its receptor
2024-03-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01537-6
PMID:38539271
|
研究论文 | 本研究开发了一种机器学习模型,能够基于TCR序列特征区分COVID-19患者和健康个体,并识别了与SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体相关的TCR库 | 首次精确识别了疫苗诱导的SARS-CoV-2特异性TCR和T细胞免疫机制,并展示了这些T细胞的高细胞毒性和延长生存期 | NA | 识别SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体,为开发有效的免疫策略提供理论基础 | SARS-CoV-2特异性T细胞和TCR,以及疫苗诱导的细胞免疫 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫库测序(IR-seq),流式细胞术 | 机器学习模型 | TCR序列 | HLA-A*02疫苗接种个体 | NA | NA | NA | NA |
| 6488 | 2024-08-04 |
Identification of TMZ resistance-associated histone post-translational modifications in glioblastoma using multi-omics data
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14649
PMID:38448295
|
研究论文 | 本文探讨了在多组学数据中识别与 TMZ 耐药性相关的组蛋白翻译后修饰。 | 研究发现 H3K9ac 可能通过促进 SP1 转录因子的招募来增强 MGMT 转录,从而驱动 GBM 耐药性。 | 本研究主要分析了 TMZ 处理的少量 GBM 细胞系,可能缺乏临床样本的充分代表性。 | 探讨 GBM 耐药性机制,特别是与组蛋白翻译后修饰相关的机制。 | 建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系,并分析了其转录组序列。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序 | NA | 多组学数据 | 建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 6489 | 2024-08-04 |
Exosome-transmitted podoplanin promotes tumor-associated macrophage-mediated immune tolerance in glioblastoma
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14643
PMID:38470096
|
研究论文 | 本研究探讨了外泌体转运的podoplanin如何促进胶质母细胞瘤相关巨噬细胞介导的免疫耐受。 | 该研究首次揭示了胶质母细胞瘤细胞来源的外泌体中podoplanin与巨噬细胞功能之间的具体关系,从而为免疫逃逸机制提供了新的理解。 | 研究依赖于公共数据库中的样本,可能存在样本异质性和数据完整性的问题。 | 研究胶质母细胞瘤中巨噬细胞浸润模式及podoplanin的作用,探讨其对免疫抑制的影响。 | 灵长类动物和小鼠的巨噬细胞和T细胞。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 免疫组化 | NA | 转录组数据, 组织切片 | 公共数据库中的胶质瘤患者样本以及BALB/c和OT-II小鼠的巨噬细胞和T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6490 | 2024-08-07 |
CD8+ T cell infiltration and proliferation in the brainstem during experimental cerebral malaria
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14431
PMID:37697956
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术,探讨了实验性脑型疟疾(ECM)中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况,并分析了脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。 | 首次在单细胞分辨率下系统研究了ECM期间脑实质区域的细胞变化,发现脑内浸润的CD8+ T细胞高度激活并表达PD-1,脑实质细胞上调PD-L1表达,揭示了PD-1/PD-L1信号通路在ECM治疗中的潜在价值。 | NA | 探讨实验性脑型疟疾中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况,以及脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。 | 实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光 | NA | RNA | 健康和实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织 | NA | NA | NA | NA |
| 6491 | 2024-08-07 |
Unraveling the complex pathophysiology of white matter hemorrhage in intracerebral stroke: A single-cell RNA sequencing approach
2024-03, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14652
PMID:38433011
|
研究论文 | 本研究旨在阐明白质出血(WMH)在脑内出血(ICH)中的细胞动态和病理生理机制 | 采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,深入分析了WMH后的细胞变化和基因表达 | NA | 阐明白质出血在脑内出血中的细胞动态和病理生理机制 | 脑内出血中的白质出血 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 从脑内出血后第三天的同侧纹状体出血区域提取的单细胞悬液 | NA | NA | NA | NA |
| 6492 | 2024-08-04 |
Decoding the gene regulatory network of endosperm differentiation in maize
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44369-7
PMID:38167709
|
研究论文 | 本研究分析了玉米胚乳分化过程中的基因调控网络 | 首次利用单细胞转录组技术解剖玉米胚乳的基因调控网络 | 本研究仅关注于玉米的胚乳,不一定适用于其他作物的研究 | 揭示玉米胚乳发育过程中的基因调控机制 | 发育中的玉米胚乳,分析细胞分化的转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | 17,022个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6493 | 2024-08-04 |
Set7 Methyltransferase and Phenotypic Switch in Diabetic Glomerular Endothelial Cells
2024-Apr-17, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000345
PMID:38630537
|
研究论文 | 本研究探讨了Set7甲基转移酶在糖尿病肾病(DKD)中对肾小管内皮细胞功能的影响 | 揭示了Set7在糖尿病肾小管内皮细胞表型转变中的调控作用,并表明靶向Set7可能保护肾小管细胞损伤 | 本研究主要在小鼠模型中进行,未来需要更多人类样本的验证 | 研究Set7在糖尿病肾病中对内皮细胞功能的作用 | 以糖尿病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA-seq | 小鼠模型和人类肾脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6494 | 2024-08-07 |
Dynamic Hippo pathway activity underlies mesenchymal differentiation during lung alveolar morphogenesis
2024-Apr-05, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202430
PMID:38602485
|
研究论文 | 研究探讨了Hippo信号通路在肺泡形态发生中调节次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)功能的动态变化 | 首次揭示了Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF功能、增殖和时间身份的调节作用 | NA | 研究Hippo信号通路在肺泡形态发生中对SCMF的调节作用 | 次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)及其在肺泡形态发生中的作用 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从报告鼠中纯化的SCMF细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6495 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of pediatric renal tissues revealed the potential relationship between immunoglobulin A nephropathy and immunoglobulin A vasculitis with nephritis
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1651
PMID:38591641
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6496 | 2024-08-04 |
Intermittent fasting promotes type 3 innate lymphoid cells secreting IL-22 contributing to the beigeing of white adipose tissue
2024-03-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91060
PMID:38536726
|
研究论文 | 这篇文章研究了间歇性禁食如何促进3型固有淋巴细胞分泌IL-22,进而有助于白色脂肪组织的变白。 | 文章首次揭示了肠道ILC3s在白色脂肪组织变白中的作用,以及ILC3/IL-22/IL-22R轴对间歇性禁食代谢益处的贡献 | 文章未提及临床试验或人类数据的支持 | 探讨间歇性禁食对代谢的益处及其机制 | 研究对象为小鼠,特别是饮食诱导肥胖的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 饮食诱导肥胖的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6497 | 2024-08-04 |
Distinct fibroblast subpopulations associated with bone, brain or intrapulmonary metastasis in advanced non-small-cell lung cancer
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1605
PMID:38445456
|
研究论文 | 本研究探讨了与骨、脑或肺内转移相关的非小细胞肺癌中的成纤维细胞亚群。 | 本研究首次在单细胞水平上区分和分析了与骨转移、大脑转移和肺内转移相关的成纤维细胞亚群。 | 本研究的样本量较小,仅分析了14个组织活检样本,限制了结果的广泛适用性。 | 研究非小细胞肺癌中成纤维细胞与转移之间的关系。 | 重点分析了14例具有骨转移、脑转移或肺内转移的晚期非小细胞肺癌患者的组织样本。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 14个组织活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6498 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals prognosis-associated cellular heterogeneity in the papillary thyroid carcinoma microenvironment
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1594
PMID:38426403
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组技术揭示了乳头状甲状腺癌微环境中的预后相关细胞异质性 | 本文通过开发空间RNA临床分析方法,首次揭示了乳头状甲状腺癌微环境中的细胞异质性与预后之间的相关性 | 研究仅分析了五个乳头状甲状腺癌组织切片,样本量相对较小,可能影响结论的普适性 | 探讨乳头状甲状腺癌微环境中的细胞异质性及其对预后的影响 | 乳头状甲状腺癌患者的肿瘤组织切片 | 数字病理 | 甲状腺癌 | 空间转录组技术 | NA | RNA表达数据 | 5个乳头状甲状腺癌组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 6499 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of T-cell metabolism reprogramming: Advancing single-cell approaches for precision immunotherapy in tumour immunity
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1620
PMID:38468489
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在解析T细胞亚群及其代谢状态中的应用,以及这些代谢途径如何影响肿瘤微环境中的T细胞功能 | 本文揭示了T细胞代谢重编程与免疫功能之间的相互作用,为精准免疫治疗提供了新的视角 | NA | 探索T细胞代谢与免疫功能之间的相互作用机制,以推动精准免疫治疗的发展 | T细胞的代谢途径及其在肿瘤微环境中的功能 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6500 | 2024-08-07 |
Mechanism and endoscopic-treatment-induced evolution of biliary non-anastomotic stricture after liver transplantation revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1622
PMID:38481381
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝移植后胆道非吻合口狭窄的机制及内镜治疗引起的演变 | 首次对胆道并发症患者的胆管进行单细胞转录组测序,分析了非吻合口狭窄及内镜治疗期间多种细胞类型的比例和表型变化 | 样本采集不足且缺乏公认的动物模型 | 揭示肝移植后胆道非吻合口狭窄的病理生理和遗传机制及内镜治疗引起的演变 | 肝移植后胆道非吻合口狭窄患者 | 数字病理学 | 肝移植并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受连续胆道支架植入的非吻合口狭窄患者的胆管样本 | NA | NA | NA | NA |