单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6481 - 6500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6481 | 2024-08-07 |
Precursor exhausted CD8+T cells in colorectal cancer tissues associated with patient's survival and immunotherapy responsiveness
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1362140
PMID:38510246
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研究论文 | 本研究利用多色免疫组织化学技术（mIHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了结直肠癌（CRC）组织中肿瘤浸润T细胞的定位及其临床意义，并探讨了其在免疫治疗反应中的作用。 | 本研究首次通过mIHC技术和scRNA-seq分析，揭示了结直肠癌微环境中T细胞的转录和功能特性，并证实了其在患者生存和免疫治疗反应中的关键作用。 | NA | 探讨结直肠癌组织中T细胞的分布及其在患者生存和免疫治疗反应中的作用。 | 结直肠癌组织中的T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多色免疫组织化学（mIHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 人类结直肠癌组织及小鼠MC38肿瘤模型 |
| 6482 | 2024-08-07 |
Novel prognostic biomarker TBC1D1 is associated with immunotherapy resistance in gliomas
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372113
PMID:38529286
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研究论文 | 本文通过分析TCGA、CGGA和GEO数据库，鉴定了与胶质瘤免疫治疗抵抗相关的基因TBC1D1，并通过多种实验方法验证了其在免疫治疗中的作用。 | 首次发现TBC1D1作为胶质瘤免疫治疗抵抗的新型预后生物标志物，并探讨了其在免疫抑制微环境中的作用。 | NA | 研究胶质瘤免疫治疗抵抗的机制，并寻找新的预后生物标志物。 | 胶质瘤及其免疫治疗抵抗机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, GSEA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质水平数据 | 使用了来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多组数据 |
| 6483 | 2024-08-07 |
A division-of-labor mode contributes to the cardioprotective potential of mesenchymal stem/stromal cells in heart failure post myocardial infarction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363517
PMID:38562923
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养的间充质干细胞（MSCs）在心肌梗死后心力衰竭治疗中的保护作用及其机制 | 本研究首次揭示了3D MSCs在细胞层面的异质性和分工模式，并通过机器学习预测模型和网络服务器开发了预测MSCs分泌效能的配体模型 | NA | 提高MSCs的生产效率并寻找评估其治疗效能的新方法 | 3D培养的人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs）及其在心肌梗死后心力衰竭治疗中的应用 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞和批量RNA测序 | 机器学习预测模型 | RNA测序数据 | 使用了125种组合算法进行筛选，并对CD142+和CD142- MSCs进行了差异表达分析 |
| 6484 | 2024-08-07 |
Comprehensive investigation into the influence of glycosylation on head and neck squamous cell carcinoma and development of a prognostic model for risk assessment and anticipating immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1364082
PMID:38562924
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研究论文 | 本文研究了糖基化在头颈鳞状细胞癌中的影响，并开发了一个预测模型用于风险评估和免疫治疗反应预测 | 首次详细阐明了糖基化与头颈鳞状细胞癌的关系，并开发了一个基于糖基化相关基因的风险预测模型 | NA | 研究糖基化在头颈鳞状细胞癌中的作用，并开发一个预测模型以评估患者风险和免疫治疗反应 | 头颈鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归和Lasso回归 | 基因数据 | 184个调控糖基化的基因 |
| 6485 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术，构建了肺腺癌（LUAD）的免疫微环境图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了LUAD的预后模型 | 首次构建了LUAD的单细胞图谱，并基于耗竭的CD8+ T细胞标记基因建立了预后模型，识别了GALNT2作为潜在的治疗靶点 | NA | 旨在详细描绘LUAD及其相关微环境的特征，并建立基于耗竭CD8+ T细胞的预后模型 | LUAD的免疫细胞，包括CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 19名患者 |
| 6486 | 2024-08-07 |
Deep Imputation Bi-stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-cell RNA-sequencing Data
2024-Apr-12, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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research paper | 本文提出了一种新的方法DSINMF，通过深度矩阵分解对单细胞RNA测序数据进行聚类 | DSINMF方法包括特征选择、缺失值插补、降维和深度矩阵分解与双随机图正则化四个步骤，以提高聚类效果 | NA | 探索细胞异质性和功能，辅助识别疾病机制和生物标志物 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | CNN | 基因转录组数据 | 九个数据集 |
| 6487 | 2024-08-07 |
A specific enterotype derived from gut microbiome of older individuals enables favorable responses to immune checkpoint blockade therapy
2024-Apr-10, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2024.03.002
PMID:38513657
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研究论文 | 本研究探讨了老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法的增强敏感性现象，并通过元分析和单细胞RNA测序数据揭示了其潜在机制，特别是与肠道微生物群相关的特定肠型。 | 识别了一种与老年患者免疫疗法效果改善相关的特定肠型，并通过小鼠实验证实了其治疗潜力。 | NA | 探索老年癌症患者对免疫检查点阻断疗法增强敏感性的机制，并寻找个性化癌症免疫疗法的新途径。 | 老年癌症患者的肠道微生物群及其对免疫疗法的影响。 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 25个中小型试验 |
| 6488 | 2024-08-05 |
scRNAseq and High-Throughput Spatial Analysis of Tumor and Normal Microenvironment in Solid Tumors Reveal a Possible Origin of Circulating Tumor Hybrid Cells
2024-Apr-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16071444
PMID:38611120
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研究论文 | 利用高通量单细胞和空间转录组学分析肿瘤混合细胞的来源. | 首次识别共表达上皮和巨噬细胞标记的肿瘤混合细胞，并提供了其特征转录组的信息. | 关于循环混合细胞在组织中的来源的研究较少，且基于一两种标记的研究方法有限. | 探讨循环混合细胞的组织来源及其在不同类型癌症中的表现. | 肿瘤混合细胞(THCs)和正常组织中的细胞(NHCs)的转录组特征. | 数字病理学 | 乳腺癌和结肠癌 | 高通量单细胞转录组和空间转录组学 | NA | NA | 涉及乳腺癌和结肠癌的稀有样本 |
| 6489 | 2024-08-04 |
Defining T cell receptor repertoires using nanovial-based binding and functional screening
2024-Apr-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320442121
PMID:38536748
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研究论文 | 本文利用纳米瓶进行T细胞受体多样性的定义和筛选 | 提出了一种新颖的纳米瓶技术，可以有效地捕获和激活特定的T细胞，从而链接TCR序列与其靶标 | 对特定抗原的识别和效率可能受到pMHC的选择和设计限制 | 开发一种新的方法来识别和筛选抗原反应性T细胞，以应用于免疫疗法 | 通过纳米瓶捕获并排序反应特定病毒和癌症抗原的T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA |
| 6490 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-Apr, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350660
PMID:38304946
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析新鲜和冷冻组织中的细胞，揭示了冷冻标志，表现为应激和激活的基因上调 | 首次揭示了冷冻处理对人类组织T细胞、ILCs和NK细胞的单细胞RNA测序结果的影响，特别是应激和激活相关基因的上调 | NA | 研究冷冻处理对人类组织中细胞的单细胞RNA测序结果的影响 | 人类组织中的T细胞、ILCs和NK细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6491 | 2024-08-07 |
High lymphocyte signature genes expression in parathyroid endocrine cells and its downregulation linked to tumorigenesis
2024-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105053
PMID:38471398
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了甲状旁腺内分泌细胞中淋巴细胞标志物的高表达及其与肿瘤发生的关系 | 首次发现甲状旁腺内分泌细胞中CD4和CD226的高表达，并揭示了其在甲状旁腺腺瘤发病机制中的作用 | 由于正常甲状旁腺样本获取困难，研究样本数量有限 | 深入理解甲状旁腺内分泌细胞的功能及其在肿瘤发生中的作用 | 甲状旁腺内分泌细胞及其在甲状旁腺腺瘤中的变化 | 数字病理学 | 甲状旁腺疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 6个正常甲状旁腺样本和8个甲状旁腺腺瘤样本 |
| 6492 | 2024-08-05 |
Machine Learning-Based Characterization and Identification of Tertiary Lymphoid Structures Using Spatial Transcriptomics Data
2024-Mar-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073887
PMID:38612697
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研究论文 | 该研究利用空间转录组数据对三级淋巴结构进行表征和识别 | 首次应用机器学习技术识别三级淋巴结构的标记，并建立预测模型 | 目前对TLS标记的一致性仍有待进一步验证 | 旨在通过机器学习方法识别和预测三级淋巴结构 | 三级淋巴结构及其标记基因 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 支持向量分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 6493 | 2024-08-07 |
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods with and without Sample Multiplexing
2024-Mar-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25073828
PMID:38612639
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研究论文 | 本研究对比分析了有无样本多重化的单细胞RNA测序方法 | 首次对比了使用样本多重化的Parse Biosciences平台和未使用样本多重化的10x Genomics平台的单细胞RNA测序方法 | 研究仅使用了来自两名健康个体的PBMCs样本，可能限制了结果的普遍性 | 评估不同单细胞RNA测序方法在样本多重化与非多重化条件下的性能 | 来自两名健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两名健康个体的PBMCs样本 |
| 6494 | 2024-08-04 |
A comprehensive multi-omics analysis identifies a robust scoring system for cancer-associated fibroblasts and intervention targets in colorectal cancer
2024-Mar-13, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-05548-7
PMID:38478111
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研究论文 | 本研究建立了一个癌症相关成纤维细胞的评分系统，并识别了结直肠癌的干预靶点 | 创新性地开发了一个基于CAF基因评分的系统，用于评估结直肠癌患者的免疫微环境和预后 | 研究的局限性在于样本量和真实性的验证需要进一步的临床试验支持 | 研究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌中的临床应用和生物学机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在结直肠癌中的不同亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 机器学习分析 | NA | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列的样本 |
| 6495 | 2024-08-07 |
Differentiation Potential of Hypodifferentiated Subsets of Nephrogenic Rests and Its Relationship to Prognosis in Wilms Tumor
2024 Mar-Apr, Fetal and pediatric pathology
IF:0.7Q4
DOI:10.1080/15513815.2024.2303081
PMID:38217324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据进行伪时间分析，生成了一个与Wilms瘤分化相关的基因签名，用于预测儿童总体生存率，并探讨了肾源性残余向Wilms瘤的分化轨迹及其与预后的关系。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肾源性残余向Wilms瘤的分化轨迹，并开发了一个基于WTDRG的风险模型和临床适用的列线图。 | NA | 探讨Wilms瘤的发生机制及针对不良预后的干预措施。 | 肾源性残余和Wilms瘤。 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6496 | 2024-08-04 |
Comparative analysis of single-cell transcriptome reveals heterogeneity and commonality in the immune microenvironment of colorectal cancer and inflammatory bowel disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1356075
PMID:38529274
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研究论文 | 本文分析了结直肠癌（CRC）和炎症性肠病（IBD）免疫微环境的异质性和共性 | 首次通过单细胞转录组分析深入探讨了CRC和IBD的细胞通信及其与衰老和炎症反应的关系 | 未详细阐明分子机制，且样本数虽大但仍可能不足以覆盖所有变异 | 旨在理解衰老、炎症与肿瘤在CRC和IBD中的特征 | 研究对象为92名CRC患者和24名IBD患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 432,314个单细胞，来自92名CRC患者和24名IBD患者 |
| 6497 | 2024-08-07 |
Lung type 3 innate lymphoid cells respond early following Mycobacterium tuberculosis infection
2024-Apr-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03299-23
PMID:38407132
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研究论文 | 研究探讨了肺部类型3先天淋巴细胞（ILC3s）在结核分枝杆菌感染早期的反应机制 | 揭示了ILC3在结核分枝杆菌感染早期的激活和招募机制，特别是IL-1R信号通路和CXCR5信号通路的作用 | NA | 研究ILC3在结核分枝杆菌感染早期的反应机制及其作为潜在疫苗靶点的可能性 | 肺部类型3先天淋巴细胞（ILC3s）及其在结核分枝杆菌感染中的作用 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肺部先天淋巴细胞（ILCs） |
| 6498 | 2024-08-07 |
Interferon Regulatory Factor 6 Determines Intestinal Epithelial Cell Development and Immunity
2024-Apr-09, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.03.013
PMID:38604478
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研究论文 | 研究探讨了干扰素调节因子6（IRF6）在肠道上皮细胞（IEC）发育和免疫中的作用 | 首次揭示了IRF6在IEC生物学中的作用，包括调节上皮细胞发育和调节先天免疫反应以减少细胞毒性和维持屏障功能 | NA | 研究IRF6在肠道上皮细胞发育和免疫中的具体作用 | 肠道上皮细胞（IEC）和IRF6的功能 | NA | NA | CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及转化的鼠IEC和IEC类器官 |
| 6499 | 2024-08-04 |
Deciphering the cellular heterogeneity of the insect brain with single-cell RNA sequencing
2024-Apr, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.13270
PMID:37702319
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综述 | 本文回顾了昆虫大脑的基本结构及其与行为的关联，重点探讨学习和记忆相关的方面 | 介绍了单细胞RNA测序在昆虫大脑研究中的应用，揭示了细胞亚群的分类及发育轨迹 | 缺乏关于昆虫大脑功能调节如何具体作用的更深入解析 | 探讨昆虫大脑的细胞异质性及其对行为的影响 | 昆虫大脑的不同细胞类型及其连接和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 6500 | 2024-08-04 |
Tumor-specific activation of folate receptor beta enables reprogramming of immune cells in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354735
PMID:38384467
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研究论文 | 该文章展示了肿瘤特异性激活叶酸受体β如何重编程肿瘤微环境中的免疫细胞 | 阐明了FRβ在肿瘤微环境中的特定作用以及其对免疫细胞重编程的影响 | 未明确提及研究的局限性 | 研究FRβ在肿瘤相关巨噬细胞中的功能及其对肿瘤微环境的重编程作用 | 主要研究肿瘤微环境中的免疫抑制性巨噬细胞及其功能变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |