本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6441 | 2024-08-05 |
Deciphering Müller cell heterogeneity signatures in diabetic retinopathy across species: an integrative single-cell analysis
2024-May-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01847-y
PMID:38698486
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析阐明了糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的复杂特征 | 首次揭示了不同物种中穆勒细胞的异质性及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 未明确提到该研究的局限性 | 深入理解糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的细胞机制 | 糖尿病视网膜病变中的穆勒细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了斯普拉吉-道利大鼠模型和人类患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6442 | 2024-08-04 |
A cuproptosis-related signature predicts prognosis and indicates cross-talk with immunocyte in ovarian cancer
2024-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00981-7
PMID:38696071
|
研究论文 | 本文构建了一个新的与铜死亡相关的基因特征,具有良好的预后能力,以评估卵巢癌患者的结果 | 建立了与铜死亡相关的预后模型,并发现了其与免疫细胞的交互作用和化疗反应的关系 | 本研究主要依赖于TCGA和GEO数据库,可能存在数据偏差问题 | 研究铜死亡与卵巢癌进展之间的关系 | 卵巢癌患者的基因组数据和细胞实验 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因组数据 | TCGA中583名卵巢癌患者和GEO中260名卵巢癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6443 | 2024-08-05 |
Development of an Automated Morphometric Approach to Assess Vascular Outcomes following Exposure to Environmental Chemicals in Zebrafish
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13214
PMID:38701112
|
研究论文 | 本文开发了一种自动化形态度量方法来评估环境化学物质对血管的影响 | 提出了一个基于深度学习的定量框架ECA-ResXUnet,用于自动分割血管网和提取特征 | 对环境化学物质对血管的影响研究还不够全面 | 研究环境化学物质对血管形态的影响并开发评估方法 | Tg(fli1a:eGFP)斑马鱼胚胎作为实验对象 | 数字病理学 | NA | 高含量成像平台和单细胞RNA测序 | ECA-ResXUnet | 图像 | 对150种环境化学物质处理的斑马鱼幼体进行了评估 | NA | NA | NA | NA |
| 6444 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation
2024-May-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01000-5
PMID:38691253
|
研究论文 | 本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色 | IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关,且可能作为新的治疗靶点 | 研究主要依赖于现有数据库,可能存在数据偏差 | 探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系 | IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用 | 数字病理学 | 肿瘤相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6445 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms underlying the therapeutic effects of Linggui Zhugan decoction in stroke: Insights from network pharmacology and single-cell transcriptomics analysis
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037482
PMID:38552092
|
研究论文 | 本研究探讨了灵桂治肝汤在中风治疗中的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞转录组分析揭示灵桂治肝汤的关键成分、靶点和通路 | 尚未完全阐明其疗效的具体分子机制 | 研究灵桂治肝汤在中风治疗中的分子机制 | 主要研究灵桂治肝汤的活性成分及其靶点 | 数字病理学 | 中风 | 网络药理学和单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据 | 144个潜在靶点与2035个中风相关基因的交集分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6446 | 2024-08-04 |
Mechanistic insights into FEN1-mediated drug sensitivity and risk signature in colon cancer: An integrative bioinformatics study
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037517
PMID:38552056
|
研究论文 | 本研究探讨了FEN1在结肠癌中的表达及其与临床病理和预后的关系 | 提出了一个由FEN1导出的多基因预后风险标志,并揭示了FEN1表达水平与结肠癌转移潜力及药物敏感性之间的相互作用 | FEN1表达与预后的明显相关性未能得到确认 | 深入探讨FEN1在结肠癌中的作用,尤其是在药物敏感性和预后方面 | 结肠癌患者的FEN1表达及其与转移的关系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序,基因集富集分析,Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus的多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6447 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals comprehensive microenvironment and highlights the dysfuntional state of NK cells in endometrioid carcinoma
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037555
PMID:38552055
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了子宫内膜样癌(EEC)中的肿瘤微环境,重点是自然杀伤(NK)细胞的功能异常状态 | 发现了一种CD56dim_DNAJB1 NK细胞亚群,其具有低细胞毒性和高压力水平,显示出NK细胞在肿瘤微环境中的功能失调 | NA | 更好地理解EEC中的肿瘤微环境的多样性 | 21个样本,包括16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织,特别关注肿瘤浸润的NK细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 21个样本(16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织) | NA | NA | NA | NA |
| 6448 | 2024-08-04 |
Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer
2024-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216881
PMID:38614384
|
研究论文 | 本研究建立了一种非侵入性方法,通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌 | 该研究开发了一种基于质谱的程序,筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板,并表现出高准确性 | 未提及具体的局限性 | 旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测 | 研究对象为314个呼吸样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱 | 集成学习 | 呼吸样本 | 314个呼吸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6449 | 2024-08-04 |
BMP signaling maintains auricular chondrocyte identity and prevents microtia development by inhibiting protein kinase A
2024-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91883
PMID:38690987
|
研究论文 | 本文研究BMP信号在维持耳廓软骨细胞身份及防止微小耳畸形发展中的作用 | 发现BMP-Smad1/5/9信号激活与耳廓软骨细胞再生活性降低相关,提供了微小耳发病机理的新见解 | 目前对于微小耳发病机制的理解仍不完全,研究可能未能涵盖所有相关基因和路径 | 探讨BMP信号如何维持耳廓软骨细胞身份以及防止微小耳的发病 | 研究对象为成人小鼠耳廓软骨细胞以及人类微小耳样本 | 数字病理学 | 微小耳畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成人小鼠耳廓软骨细胞和人类微小耳样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6450 | 2024-08-05 |
Acute Lymphoblastic Leukemia with Myeloid Mutations Is a High-Risk Disease Associated with Clonal Hematopoiesis
2024-May-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0106
PMID:38150184
|
研究论文 | 本研究探讨了急性淋巴细胞白血病(ALL)中与骨髓突变相关的克隆性造血的影响 | 该研究首次揭示了急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的存在及其对预后的影响 | 本研究的样本量可能不足以全面反映该疾病的所有临床特征 | 研究急性淋巴细胞白血病中骨髓突变的作用及其病理机制 | 成年人急性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞蛋白基因组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 研究涉及的成年ALL案例中,包括TP53突变和骨髓克隆突变的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6451 | 2024-08-05 |
Characterization of macrophages in head and neck squamous cell carcinoma and development of MRG-based risk signature
2024-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60516-6
PMID:38688945
|
研究论文 | 本研究探讨了头颈部鳞状细胞癌中的巨噬细胞特征,并开发了基于MRG的风险标志。 | 首次识别了8个具有预后潜力的巨噬细胞相关基因,并构建了预测模型,探讨了它们在HNSCC中的作用。 | 研究可能未考虑到所有可能影响HNSCC预后的因素,样本量和分类可能存在局限性。 | 研究巨噬细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其与疾病预后的关系。 | 头颈部鳞状细胞癌的患者样本及其巨噬细胞特征。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq,bulk RNA-seq | Cox回归模型 | 临床数据,基因表达数据 | 包含特定的HNSCC患者数据,样本量在文中未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6452 | 2024-08-05 |
Functional specialization of hippocampal somatostatin-expressing interneurons
2024-Apr-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306382121
PMID:38640347
|
研究论文 | 该文章探讨了海马体中表达生长抑素的GABA能抑制神经元的功能特化。 | 该研究为功能性不同的海马CA1抑制神经元亚群提供了一种新的识别和访问方法,揭示了它们在功能上的多样性。 | 该研究未完全解决神经元的具体功能与其转录组特征之间的联系。 | 研究海马抑制神经元的亚群特征及其功能特化。 | 研究对象为海马CA1区的抑制神经元亚群。 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 四种小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6453 | 2024-08-04 |
Spatiotemporal transcriptomic changes of human ovarian aging and the regulatory role of FOXP1
2024-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00607-1
PMID:38594460
|
研究论文 | 该研究系统性地表征人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学的方法,首次揭示了八种卵巢细胞在衰老过程中的时空分子特征 | 本文对衰老机制的理解仍有限,可能需要更多的实验进行验证 | 旨在全面理解人类卵巢衰老过程中的时空转录组变化 | 研究对象为人类卵巢细胞的岁月变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6454 | 2024-08-05 |
BAP1 is required prenatally for differentiation and maintenance of postnatal murine enteric nervous system
2024-Mar-12, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177771
PMID:38690732
|
研究论文 | 本文发现BAP1在胎儿期对小鼠肠道神经系统的分化和维持至关重要 | 首次阐明BAP1缺失对肠道神经元分化和早期存活的影响 | 未能探讨其他可能的表观遗传调节因子对ENS发育的影响 | 研究BAP1在胎儿期对肠道神经系统发展的重要性 | Tyr-Cre Bap1fl/fl小鼠的肠道神经系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | Tyrosinase-Cre Bap1fl/fl小鼠的肠道神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6455 | 2024-08-05 |
Predicting mitophagy-related genes and unveiling liver endothelial cell heterogeneity in hepatic ischemia-reperfusion injury
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1370647
PMID:38694511
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的作用 | 该研究识别了8个关键基因并建立了基于这些基因的诊断模型,揭示了内皮细胞的异质性 | 研究仅基于有限的样本和单细胞数据分析,可能需要更广泛的验证 | 探究线粒体自噬相关基因在肝脏缺血再灌注损伤中的重要性 | 研究对象包括44个肝脏缺血再灌注损伤样本及44个正常对照样本 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 44个肝脏缺血再灌注损伤样本和44个正常对照样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6456 | 2024-08-05 |
Galectin-3 inhibition ameliorates alveolar epithelial cell pyroptosis in phosgene-induced acute lung injury
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111965
PMID:38583242
|
研究论文 | 本研究探讨了Galectin-3抑制对磷酸酯引发的急性肺损伤中的肺泡上皮细胞焦亡的改善作用 | 首次提出Galectin-3通过抑制Gal3/caspase-8/GSDMD信号通路来改善肺泡上皮细胞焦亡的机制 | 该研究主要在小鼠模型中进行,临床应用的转化需要进一步验证 | 探究Galectin-3在磷酸酯引发的急性肺损伤中的作用及其机制 | 磷酸酯引发的急性肺损伤模型中的肺泡上皮细胞和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型,未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6457 | 2024-08-05 |
Establishment and validation of a tumor-infiltrating γδT cell related prognostic gene signature in head and neck squamous cell carcinoma
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112054
PMID:38608477
|
研究论文 | 本文建立并验证了与肿瘤浸润γδT细胞相关的预后基因特征在头颈部鳞状细胞癌中的应用 | 首次提出γδT细胞基因特征作为头颈部鳞状细胞癌患者的独立预后指标 | 本研究仅使用了TCGA HNSCC数据库及100个肿瘤样本,样本数量可能限制了结果的广泛适用性 | 评估γδT细胞在头颈部鳞状细胞癌中的浸润及其与临床病理因素的关联 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本和相应的基因特征 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因组数据 | 100个头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6458 | 2024-08-05 |
CXCR6 defines therapeutic subtypes of CD4+ cytotoxic T cell lineage for adoptive cell transfer therapy in pediatric B cell acute lymphoblastic leukemia
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111972
PMID:38569429
|
研究论文 | 本研究探讨CXCR6作为新生儿B细胞急性淋巴细胞白血病中细胞毒性CD4 T细胞的治疗亚型的作用 | 提出CXCR6可以作为小儿B-ALL患者骨髓中细胞毒性CD4 Trm细胞的标志 | 需要更多的临床数据验证CXCR6在其他患者群体中的作用 | 研究CXCR6在小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者中细胞毒性CD4 T细胞的影响 | 小儿B细胞急性淋巴细胞白血病患者及健康供体的骨髓和外周血样本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术 (FCM), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 集成机器学习算法 | 血液样本 | 包括小儿B-ALL患者和健康供体的样本,具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6459 | 2024-08-05 |
The skin circadian clock gene F3 as a potential marker for psoriasis severity and its bidirectional relationship with IL-17 signaling in keratinocytes
2024-May-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111993
PMID:38565044
|
研究论文 | 本研究探讨了皮肤生物钟基因F3与牛皮癣严重程度及其与IL-17信号传导之间的双向关系 | 揭示了皮肤生物钟基因F3与IL-17信号通路之间的双向联系,指出F3可能通过激活JAK-STAT信号在角质形成细胞中引发异常细胞内炎症 | 关于F3和IL-17信号通路关系的机制需要进一步研究 | 研究皮肤生物钟基因F3与牛皮癣病理机制之间的关系 | 牛皮癣病灶与健康对照组 | 数字病理 | 牛皮癣 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 生物信息学数据 | GSE121212的牛皮癣病灶和健康对照样本,以及多个数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6460 | 2024-08-05 |
Living in Syn: T Cell Antigen Identification Based on Synapse Sequencing
2024-May-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0239
PMID:38557780
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于突触测序的T细胞抗原识别新平台Tsyn-seq | 提出了一种新的抗原发现平台Tsyn-seq,利用TCR-肽-HLA诱导的突触进行全基因组表位筛选 | 文章没有提及具体的局限性 | 研究T细胞抗原的识别机制 | 聚焦于通过突触测序识别T细胞表位 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |