单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 6441 - 6460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6441 | 2024-08-05 |
Circulating immune cell landscape and T-cell abnormalities in patients with moyamoya disease
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1647
PMID:38566524
|
研究论文 | 本研究揭示了与 moya moya 病相关的循环免疫细胞景观和 T 细胞异常 | 首次全面描绘了 moya moya 病患者的循环免疫细胞的变化及其潜在的免疫失调机制 | 缺乏对其他人群或地域的比较分析，可能限制研究结果的广泛适用性 | 探讨 moya moya 病患者中循环免疫细胞及 T 细胞的变化 | 监测 moya moya 病患者与年龄匹配的健康对照之间的外周血免疫细胞特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序、质谱细胞计数、RNA 测序 | NA | 外周血样本 | 来源于 moya moya 病患者和健康对照的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6442 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional signature-based drug repurposing and in vitro evaluation in colorectal cancer
2024-Mar-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-12142-8
PMID:38528462
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组特征进行药物重定位与结直肠癌的体外评估 | 使用单细胞RNA测序数据和转录特征进行药物重定位，发现12种FDA批准的新药用于结直肠癌治疗 | 虽然进行了体外评估，但缺乏体内评估数据 | 探索通过转录特征进行的药物重定位以提高结直肠癌的治疗效果 | 使用来自29名结直肠癌患者的91,103个单细胞RNA测序样本进行药物筛选 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 91,103个样本来自29名结直肠癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6443 | 2024-08-05 |
hsa-miR-34a-5p enhances temozolomide anti-tumoral effects on glioblastoma: in-silico and in-vitro study
2024, EXCLI journal
IF:3.8Q1
DOI:10.17179/excli2023-6404
PMID:38655096
|
研究论文 | 本研究探讨了hsa-miR-34a-5p及其与替莫唑胺组合对胶质母细胞瘤的影响及相关分子机制 | 本研究验证了hsa-miR-34a-5p在增强替莫唑胺抗肿瘤效应中的作用，并揭示了其通过MAPK通路的机制 | 研究未提及样本的临床前验证和长期效果 | 研究hsa-miR-34a-5p及其与替莫唑胺组合在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤效果 | 胶质母细胞瘤细胞系A172及TCGA-GTEx, CGGA等多个数据集 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | qRT-PCR, MTT, 流式细胞术, 克隆形成实验, Annexin V/PI分析 | NA | RNA测序 | 使用了多个数据集及A172细胞系进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6444 | 2024-08-05 |
Investigating the Cell Origin and Liver Metastasis Factors of Colorectal Cancer by Single-Cell Transcriptome Analysis
2024, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S454295
PMID:38644955
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源和驱动因素 | 本研究首次利用单细胞分析中发现了与肝转移相关的上皮细胞，并建立了LM指数预测肝转移风险 | 本研究的功能实验仅在体外进行，尚未在体内验证 | 研究结直肠癌肝转移风险相关的细胞来源和生物标志物 | 结直肠癌患者特别是高风险肝转移的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6445 | 2024-08-05 |
Identification of tumor heterogeneity associated with KRAS/TP53 co-mutation status in lung adenocarcinoma based on single-cell RNA sequencing
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455404
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序研究KRAS/TP53共突变状态对肺腺癌的影响 | 提出了一种包含七个预后基因的新预测风险模型，并通过LASSO回归验证其预测能力 | NA | 探讨KRAS/TP53共突变状态对肺腺癌肿瘤微环境的影响 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6446 | 2024-08-05 |
Single-cell type annotation with deep learning in 265 cell types for humans
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae054
PMID:38645719
|
研究论文 | 本文开发了一个基于深度学习的单细胞类型预测工具，能够为人类的265种不同细胞类型赋予类型标签 | 该工具首先通过对约五百万个细胞的数据进行处理，并利用细胞本体校正注释，从而显著提高了模型的准确性 | 目前数据库中的不一致标记影响了模型的准确性，并且依赖于现有数据库的注释限制了未来的应用 | 旨在通过深度学习工具提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释准确性 | 研究对象为265种不同的人类细胞类型 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | RNA测序数据 | 约五百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6447 | 2024-08-05 |
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1353570
PMID:38646527
|
研究论文 | 本文报告了饮食糖L-岩藻糖对树突细胞功能和极化的影响 | 提供了L-岩藻糖增强树突细胞功能的新机制，首次证明其能提高抗肿瘤免疫反应 | 研究中未提及样本规模或长期效果评估 | 探讨如何利用L-岩藻糖提升树突细胞的功能以增强免疫治疗 | 研究了L-岩藻糖对树突细胞的极化和免疫刺激活性的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子数据 | 小鼠模型中的肿瘤浸润树突细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6448 | 2024-08-04 |
NIFK, a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Pan-- Cancer Analysis, Significantly Regulates Proliferation and Metastasis of Colorectal Cancer
2024-Apr-24, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 该研究系统分析了NIFK在全癌种中的表达及其在结直肠癌中的作用 | 揭示了NIFK在大多数肿瘤中过表达，并显示出显著的预后效能和与免疫特征的相关性 | 目前缺乏对NIFK在其他癌种的系统分析，如在非结直肠癌中的具体作用 | 探讨NIFK作为潜在预后和免疫生物标志物在癌症中的作用 | 研究NIFK在多种癌症中表达、突变及其在结直肠腺癌中的免疫特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 通过TCGA进行的大规模分析，具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 6449 | 2024-08-04 |
Co-expression of immune checkpoints in glioblastoma revealed by single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.014
PMID:38633388
|
研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中的免疫检查点的共表达及其分子特征 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，首次揭示了胶质母细胞瘤中免疫检查点表达模式及其潜在的免疫逃逸机制 | 本研究基于未治疗的胶质母细胞瘤样本，可能无法完全反映治疗后的情况 | 为了更好地理解胶质母细胞瘤的肿瘤微环境及其免疫逃逸机制 | 未治疗的胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组 | NA | RNA数据 | 180名胶质瘤患者用于预后验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6450 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell transcriptomic profiling reveals molecular subtypes and prognostic biomarkers with implications for targeted therapy in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jun, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101948
PMID:38582059
|
研究论文 | 这篇文章揭示了食道鳞状细胞癌的分子亚型和预后生物标志物。 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了食道鳞状细胞癌的分子异质性和新的预后生物标志物。 | 该研究可能未涵盖所有可能的分子亚型和标志物，需进一步实验验证。 | 本研究旨在识别食道鳞状细胞癌中与DNA复制压力相关的生物标志物，以改善预后风险分层。 | 研究对象为食道鳞状细胞癌（ESCC）样本。 | 数字病理学 | 食道癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | ESCC样本（具体样本数未提供） | NA | NA | NA | NA |
| 6451 | 2024-08-07 |
Identification of CNKSR1 as a biomarker for "cold" tumor microenvironment in lung adenocarcinoma: An integrative analysis based on a novel workflow
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29126
PMID:38628722
|
研究论文 | 本研究通过综合分析，将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的新型潜在生物标志物，并探讨了其在调节T细胞浸润中的作用。 | 本研究开发了一种新的策略来识别针对免疫冷肿瘤的抗PD1/PD-L1免疫治疗局限性的有希望的生物标志物，并首次将CNKSR1鉴定为免疫冷型肺腺癌的生物标志物。 | NA | 旨在识别对PD1/PD-L1免疫治疗无反应的肺腺癌患者的新型生物标志物，以扩大治疗选择。 | 肺腺癌（LUAD）患者的RNA-seq数据和临床样本。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA-seq | 机器学习方法 | RNA-seq数据 | 使用了来自TCGA数据库的肺腺癌RNA-seq数据，并在三个独立的bulk数据集和一个scRNA-seq数据集中进行了验证。 | NA | NA | NA | NA |
| 6452 | 2024-08-04 |
scMoresDB: A comprehensive database of single-cell multi-omics data for human respiratory system
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109567
PMID:38617561
|
研究论文 | 本研究介绍了一个针对人类呼吸系统的单细胞多组学数据库平台 scMoresDB | scMoresDB 提供了一个用户友好的界面，具有跨组学搜索能力和交互式可视化工具 | NA | 创建一个方便的数据共享和综合分析的平台，专注于人类呼吸系统的单细胞多组学数据 | 人类呼吸系统相关的单细胞多组学数据 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6453 | 2024-08-04 |
[Dynamic trajectory and cell communication of different cell clusters in malignant progression of glioblastoma]
2024-Apr-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:38595234
|
研究论文 | 本研究深入探讨了胶质母细胞瘤恶性进展过程中的细胞亚群以及免疫细胞亚群之间的通信网络 | 该研究结合单细胞测序和临床信息，提供了对胶质母细胞瘤动态演变及潜在生物标志物的新见解 | 本研究未提及样本的地区或具体实验方法的局限性 | 探讨胶质母细胞瘤恶性进展中的细胞动态和识别关键风险生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者的细胞亚群及免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 27,151个细胞，包括低级别胶质瘤患者的3,881个细胞、新诊断胶质母细胞瘤患者的10,166个细胞以及复发胶质瘤患者的13,104个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6454 | 2024-08-04 |
Spatial and single-cell explorations uncover prognostic significance and immunological functions of mitochondrial calcium uniporter in breast cancer
2024-Apr-17, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03327-z
PMID:38632642
|
研究论文 | 本研究探讨了线粒体钙单元蛋白（MCU）在乳腺癌中的预后意义和免疫功能 | 本研究首次将MCU作为乳腺癌的独立诊断生物标志物，并揭示其与临床状态和总体生存率的相关性 | 该研究的限制在于基于公共数据集，需进一步验证多个独立样本 | 研究MCU在乳腺癌临床病理、肿瘤免疫微环境及精准肿瘤学中的潜在作用 | 分析乳腺癌患者样本中MCU的表达与临床病理特征及预后的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因数据和生物信息学数据 | 59名乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6455 | 2024-08-04 |
High-altitude hypoxia exposure inhibits erythrophagocytosis by inducing macrophage ferroptosis in the spleen
2024-Apr-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87496
PMID:38629942
|
研究论文 | 该研究探讨了高海拔缺氧通过诱导脾脏巨噬细胞铁死亡抑制红细胞吞噬作用的机制 | 揭示了高海拔缺氧导致脾脏巨噬细胞铁死亡进而影响红细胞清除的机制 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的情况 | 研究高海拔多血症的机制及其影响 | 小鼠模型和体外脾脏巨噬细胞 | 数字病理学 | 高海拔多血症 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 小鼠和人类外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6456 | 2024-08-07 |
Characterization of gene regulatory networks underlying key properties in human hematopoietic stem cell ontogeny
2024-Apr-17, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-024-00192-z
PMID:38630195
|
研究论文 | 本研究分析了不同发育阶段人源造血干细胞/祖细胞（HSPCs）的单细胞转录组，并生成了与造血干细胞关键特性相关的高度共调控基因调控网络（GRNs）模块。 | 首次识别了控制淋巴潜能、自我更新及有氧呼吸等关键特性的基因调控网络和关键调控因子，并展示了这些调控因子在体外促进造血干细胞功能的能力。 | NA | 揭示造血干细胞发育过程中特性变化的内在机制，并为体外生成功能齐全的造血干细胞提供指导。 | 人源造血干细胞/祖细胞（HSPCs）在不同发育阶段的单细胞转录组。 | 基因调控 | NA | 单细胞转录组分析 | 基因调控网络（GRNs） | 转录组数据 | 包括卵黄囊（YS）、AGM、胎肝（FL）、脐带血（UCB）和成人外周血动员的HSPCs等多个发育阶段的样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 6457 | 2024-08-07 |
Improvement of immune dysregulation in individuals with long COVID at 24-months following SARS-CoV-2 infection
2024-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47720-8
PMID:38632311
|
研究论文 | 本研究探讨了轻至中度长期COVID（LC）患者与年龄和性别匹配的恢复期COVID-19对照组（MC）在24个月内的体液和细胞免疫反应及与健康相关的生活质量指标 | 发现LC参与者在3个月时IgG水平升高，中和能力增强，以及特定CD4 T细胞和PD-1、TIM-3表达增加，但这些差异在24个月时不持续 | 研究仅关注了特定免疫标志物和细胞类型，未全面评估所有免疫相关指标 | 研究长期COVID患者的免疫反应及其与健康相关的生活质量随时间的变化 | 长期COVID患者和恢复期COVID-19患者的免疫反应和生活质量 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞数据 | LC和MC参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 6458 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data to construct and validate a cancer-associated fibroblast-related prognostic signature for patients with ovarian cancer
2024-Apr-16, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01399-z
PMID:38627854
|
研究论文 | 建立了基于癌症相关成纤维细胞的卵巢癌预后风险特征 | 开发了一种基于CAF的风险特征，可以准确预测卵巢癌患者的预后 | NA | 基于癌症相关成纤维细胞建立卵巢癌患者的预后风险轮廓 | 卵巢癌患者的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA-seq | Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6459 | 2024-08-07 |
Pan-cancer transcriptional atlas of minimal residual disease links DUSP1 to chemotherapy persistence
2024-Apr-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00509-3
PMID:38627863
|
研究论文 | 本研究首次全面分析了多种癌症类型中的最小残留病（MRD），并揭示了DUSP1基因在MRD中的重要作用 | 首次全面分析了跨多种癌症类型的MRD，并发现了DUSP1基因在MRD中的广泛和显著富集 | NA | 全面理解化疗引起的改变，并识别预防和消除MRD的潜在靶点 | 多种癌症类型的最小残留病（MRD） | 数字病理学 | 泛癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括大量和单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6460 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals activation of endothelial cell and identifies LHPP as a potential target in ulcerative colitis
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29163
PMID:38601522
|
研究论文 | 本研究探讨了单细胞转录组学在溃疡性结肠炎中的应用，并识别LHPP作为潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示LHPP在溃疡性结肠炎中表达的显著下调及其与STAT3表达水平的反向相关 | 本研究没有涉及LHPP在溃疡性结肠炎患者治疗中实际应用的实验验证 | 研究溃疡性结肠炎病理中的细胞动态和分子机制 | 从溃疡性结肠炎患者中分析的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 研究涉及的样本数量和类型未明确说明 | NA | NA | NA | NA |