单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6421	2024-08-04	Single-cell, single-nucleus, and spatial transcriptomics characterization of the immunological landscape in the healthy and PSC human liver 2024-May, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2023.12.023 PMID:38199298	研究论文	本文对健康和PSC人肝脏的免疫生态进行单细胞、单核和空间转录组特征化。	本研究利用多组学方法生成了PSC肝脏的综合图谱，提供了对PSC细胞复杂性的深入理解。	本研究主要基于样本量有限的PSC患者，可能无法全面代表所有PSC病例。	研究PSC肝脏的细胞组成及其潜在的病理机制。	研究对象为10个PSC患者的肝脏样本及对照组的健康和神经性去世供体肝脏。	数字病理学	原发性硬化性胆管炎	单细胞和单核RNA测序、空间转录组学	NA	细胞数据	10个PSC肝脏样本和24个神经性去世供体肝脏样本
6422	2024-08-07	Single-cell analysis extracted CAFs-related genes to established online app to predict clinical outcome and radiotherapy prognosis of prostate cancer 2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-023-03348-6 PMID:38070051	研究论文	本研究通过单细胞分析提取与癌症相关成纤维细胞（CAFs）相关的基因，并建立在线应用程序，用于预测前列腺癌的临床结果和放疗预后	本研究首次通过单细胞RNA测序和差异基因表达分析，识别出与前列腺癌预后相关的CAFs相关基因，并开发了一个在线预测工具	本研究主要依赖于公共数据库的数据，未来需要更多临床样本验证模型的准确性	旨在通过单细胞分析识别CAFs相关基因，评估其在预测前列腺癌预后和放疗预后中的潜力	前列腺癌及其相关成纤维细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	COX和LASSO分析	转录组数据	训练集257例，测试集129例，GSE70770集199例，GSE116918集248例
6423	2024-08-07	Microenvironmental changes in familial adenomatous polyposis during colorectal cancer carcinogenesis 2024-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216822 PMID:38521200	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了家族性腺瘤性息肉病（FAP）患者的正常组织、腺瘤和癌组织的转录组，揭示了FAP在结直肠癌发生过程中的微环境变化	首次通过单细胞RNA测序详细分析了FAP患者的微环境变化，并比较了FAP与散发性结直肠癌的微环境差异	样本量相对较小，仅包括四名FAP患者和40名散发性结直肠癌患者	探究家族性腺瘤性息肉病在结直肠癌发生过程中的微环境变化	家族性腺瘤性息肉病患者的正常组织、腺瘤和癌组织	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	56,225个未分类的单细胞，来自4名FAP患者和26名FAP患者及40名散发性结直肠癌患者的组织样本
6424	2024-08-07	OH2 oncolytic virus: A novel approach to glioblastoma intervention through direct targeting of tumor cells and augmentation of anti-tumor immune responses 2024-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216834 PMID:38537773	研究论文	本研究介绍了OH2溶瘤病毒，一种源自单纯疱疹病毒2型（HSV-2）的疗法，用于治疗胶质母细胞瘤（GBM），通过直接靶向肿瘤细胞和增强抗肿瘤免疫反应	OH2溶瘤病毒通过选择性靶向肿瘤细胞复制、诱导细胞毒性DNA损伤应激和激发抗肿瘤免疫反应，显示出显著的抗肿瘤活性	NA	探索OH2溶瘤病毒作为胶质母细胞瘤治疗新方法的有效性	胶质母细胞瘤（GBM）及其治疗	数字病理学	脑癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
6425	2024-08-04	Evaluation of McCauley et al.: A framework for systematic evaluation of tissue signaling responses by single-cell RNA-seq 2024-Apr-17, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.03.007 PMID:38636454	评论	对McCauley等人论文的同行评审过程的单次快照	开发了一个系统性评估组织信号响应的框架	没有提供关于具体实验数据或结果的详细信息	评估组织信号反应的系统性方法	人类气道上皮中的信号反应	数字病理学	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA	NA
6426	2024-08-04	Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations 2024-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.05.588294 PMID:38645202	研究论文	本研究通过多种方法分析了小儿低级别胶质瘤的肿瘤微环境	揭示了与BRAF变异相关的独特肿瘤微环境和免疫细胞异质性	尚需进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用	加深对小儿低级别胶质瘤生物学的理解，以识别新型、更有效且毒性较小的治疗方法	小儿低级别胶质瘤及其肿瘤微环境的细胞组成	数字病理学	NA	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	细胞, RNA	小儿低级别胶质瘤样本
6427	2024-08-04	Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis 2024-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-023-1017-7 PMID:37955814	research paper	通过单细胞RNA-seq分析对26个胶质瘤进行分类，揭示了原始少突胶质细胞样（pri-OPC）和放射胶质细胞样（RG）的肿瘤之间的免疫逃逸和微环境的区别	首次揭示了pri-OPC样和RG样胶质瘤在免疫逃逸程序上的显著差异	样本数量较少，仅涉及26个胶质瘤，可能影响结果的广泛适用性	探讨胶质瘤与神经发生和胶质发生之间的关系	26个胶质瘤样本，分类为pri-OPC样和RG样肿瘤	数字病理学	胶质瘤	单细胞RNA-seq	NA	RNA-seq数据	26个胶质瘤样本
6428	2024-08-07	Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling 2024-Feb, Frontiers of medicine IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11684-023-1010-1 PMID:37870681	研究论文	研究肿瘤来源的外泌体（TEXs）对CD19特异性CAR T细胞功能的影响及其机制	首次揭示了淋巴瘤来源的外泌体通过TGF-β信号通路影响CAR T细胞的功能，并提出了一种新的治疗策略	研究主要集中在体外实验，需要进一步的临床试验验证	探讨肿瘤来源的外泌体对CAR T细胞功能的影响及其潜在机制	CD19特异性CAR T细胞及肿瘤来源的外泌体	免疫学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CAR T细胞
6429	2024-08-07	Noncanonical TRAIL Signaling Promotes Myeloid-Derived Suppressor Cell Abundance and Tumor Growth in Cholangiocarcinoma 2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.006 PMID:38219900	研究论文	本研究探讨了非经典TRAIL信号在胆管癌中促进骨髓来源抑制细胞（MDSCs）丰度和肿瘤生长的机制。	发现非经典TRAIL信号通过激活核因子-κB促进MDSCs的增殖，并揭示了MDSCs对TRAIL介导的凋亡的抵抗机制。	研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。	旨在阐明TRAIL+癌细胞如何利用非经典TRAIL信号在骨髓来源抑制细胞（MDSCs）中促进其丰度，从而影响胆管癌的发展。	研究对象包括TRAIL信号、骨髓来源抑制细胞（MDSCs）以及胆管癌。	肿瘤学	胆管癌	单细胞RNA测序和细胞转录组及表位的测序	NA	RNA	使用了多个免疫健全的同基因、原位胆管癌模型的小鼠肿瘤样本
6430	2024-08-07	Telocytes in the Luminal GI Tract 2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.002 PMID:38342300	综述	本文综述了间质细胞（telocytes）在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色	探讨了间质细胞通过其长细胞质突起与其他细胞类型连接，形成三维网络，并在肠道中作为干细胞微环境的关键组成部分，提供Wnt蛋白促进干细胞和祖细胞增殖	单细胞RNA测序分析揭示了其他基质群体和微环境组织机制，对间质细胞在干细胞微环境中的作用提出了疑问	探讨间质细胞在胃肠道腔内的当前研究状态、存在的争议及未来研究方向	间质细胞在胃肠道腔内的作用及其在干细胞微环境中的角色	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
6431	2024-08-04	High-dimensional deconstruction of ovarian cancer at single-cell precision reveals HEBP2 that reshape the TIME and drive carboplatin resistance 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101917 PMID:38554571	研究论文	该研究利用单细胞测序分析卵巢癌患者的肿瘤免疫微环境，探讨不同巨噬细胞亚群在卵巢癌进展中的作用。	该研究首次揭示了脂肪酸相关基因HEBP2在卵巢癌化疗耐药中的重要作用，且说明了其在改变肿瘤免疫微环境中发挥的作用。	未提及具体的样本量和实验细节，可能对结果的普遍适用性产生影响。	旨在揭示卵巢癌化疗耐药的机制，并研究HEBP2在这一过程中的作用。	研究对象为卵巢癌患者的肿瘤组织及其免疫细胞环境。	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	肿瘤组织样本	未具体提及
6432	2024-08-07	CCR7 affects the tumor microenvironment by regulating the activation of naïve CD8+ T cells to promote the proliferation of oral squamous cell carcinoma 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101924 PMID:38430712	研究论文	本文研究了CCR7通过调节幼稚CD8+ T细胞的激活来影响口腔鳞状细胞癌（OSCC）肿瘤微环境的机制	首次深入研究了CCR7在肿瘤微环境中对幼稚CD8+ T细胞抗肿瘤免疫反应的作用	仅通过CCR7敲除小鼠模型进行研究，可能需要更多临床数据支持	探讨CCR7在口腔鳞状细胞癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	CCR7在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的作用及对幼稚CD8+ T细胞的影响	NA	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	CCR7敲除小鼠模型
6433	2024-08-07	Insights into the role of the N6-methyladenosine reader IGF2BP3 in the progression of oral squamous cell carcinoma and its connection to cell-cycle control 2024-Jun, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101932 PMID:38492500	研究论文	本研究探讨了N6-甲基腺苷阅读器IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌进展中的作用及其与细胞周期控制的联系	本研究首次揭示了IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的过度表达，并发现其与细胞周期G2/M转换阶段的关联	研究主要基于批量测序和单细胞RNA测序数据，可能需要更多实验验证	探究IGF2BP3在口腔鳞状细胞癌中的作用及其对细胞周期的影响	口腔鳞状细胞癌中的IGF2BP3表达及其对细胞周期的影响	数字病理学	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	具体样本数量未在摘要中提及
6434	2024-08-07	Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the lineage of malignant epithelial cells and upregulation of TAGLN2 promotes peritoneal metastasis in gastric cancer 2024-May, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03402-x PMID:38492153	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
6435	2024-08-07	Decoding the biology and clinical implication of neutrophils in intracranial aneurysm 2024-Apr, Annals of clinical and translational neurology IF:4.4Q1 DOI:10.1002/acn3.52014 PMID:38317016	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和外部批量mRNA测序数据，深入探讨了侵入颅内动脉瘤（IA）壁的中性粒细胞的特征和功能异质性	首次详细描述了中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和潜在临床意义，揭示了中性粒细胞在IA形成和破裂中的不同亚群及其作用机制	NA	阐明中性粒细胞在颅内动脉瘤中的生物学特性和临床意义	中性粒细胞在颅内动脉瘤中的功能和临床意义	NA	颅内动脉瘤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA测序数据	涉及人和小鼠模型的数据集
6436	2024-08-07	Identification of SARS-CoV-2-specific T cell and its receptor 2024-03-27, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1 DOI:10.1186/s13045-024-01537-6 PMID:38539271	研究论文	本研究开发了一种机器学习模型，能够基于TCR序列特征区分COVID-19患者和健康个体，并识别了与SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体相关的TCR库	首次精确识别了疫苗诱导的SARS-CoV-2特异性TCR和T细胞免疫机制，并展示了这些T细胞的高细胞毒性和延长生存期	NA	识别SARS-CoV-2特异性T细胞及其受体，为开发有效的免疫策略提供理论基础	SARS-CoV-2特异性T细胞和TCR，以及疫苗诱导的细胞免疫	机器学习	COVID-19	单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫库测序（IR-seq），流式细胞术	机器学习模型	TCR序列	HLA-A*02疫苗接种个体
6437	2024-08-04	Identification of TMZ resistance-associated histone post-translational modifications in glioblastoma using multi-omics data 2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14649 PMID:38448295	研究论文	本文探讨了在多组学数据中识别与 TMZ 耐药性相关的组蛋白翻译后修饰。	研究发现 H3K9ac 可能通过促进 SP1 转录因子的招募来增强 MGMT 转录，从而驱动 GBM 耐药性。	本研究主要分析了 TMZ 处理的少量 GBM 细胞系，可能缺乏临床样本的充分代表性。	探讨 GBM 耐药性机制，特别是与组蛋白翻译后修饰相关的机制。	建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系，并分析了其转录组序列。	数字病理学	胶质母细胞瘤	转录组测序	NA	多组学数据	建立了两个 TMZ 耐药的 GBM 细胞系
6438	2024-08-04	Exosome-transmitted podoplanin promotes tumor-associated macrophage-mediated immune tolerance in glioblastoma 2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14643 PMID:38470096	研究论文	本研究探讨了外泌体转运的podoplanin如何促进胶质母细胞瘤相关巨噬细胞介导的免疫耐受。	该研究首次揭示了胶质母细胞瘤细胞来源的外泌体中podoplanin与巨噬细胞功能之间的具体关系，从而为免疫逃逸机制提供了新的理解。	研究依赖于公共数据库中的样本，可能存在样本异质性和数据完整性的问题。	研究胶质母细胞瘤中巨噬细胞浸润模式及podoplanin的作用，探讨其对免疫抑制的影响。	灵长类动物和小鼠的巨噬细胞和T细胞。	数字病理学	胶质母细胞瘤	RNA-seq, 免疫组化	NA	转录组数据, 组织切片	公共数据库中的胶质瘤患者样本以及BALB/c和OT-II小鼠的巨噬细胞和T细胞
6439	2024-08-07	CD8+ T cell infiltration and proliferation in the brainstem during experimental cerebral malaria 2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14431 PMID:37697956	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术，探讨了实验性脑型疟疾（ECM）中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况，并分析了脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。	首次在单细胞分辨率下系统研究了ECM期间脑实质区域的细胞变化，发现脑内浸润的CD8+ T细胞高度激活并表达PD-1，脑实质细胞上调PD-L1表达，揭示了PD-1/PD-L1信号通路在ECM治疗中的潜在价值。	NA	探讨实验性脑型疟疾中脑干内CD8+ T细胞的浸润和增殖情况，以及脑内浸润CD8+ T细胞与脑实质细胞的相互作用。	实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织	免疫学	疟疾	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫荧光	NA	RNA	健康和实验性脑型疟疾小鼠的脑干组织
6440	2024-08-07	Unraveling the complex pathophysiology of white matter hemorrhage in intracerebral stroke: A single-cell RNA sequencing approach 2024-03, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1111/cns.14652 PMID:38433011	研究论文	本研究旨在阐明白质出血（WMH）在脑内出血（ICH）中的细胞动态和病理生理机制	采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，深入分析了WMH后的细胞变化和基因表达	NA	阐明白质出血在脑内出血中的细胞动态和病理生理机制	脑内出血中的白质出血	数字病理学	脑血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	从脑内出血后第三天的同侧纹状体出血区域提取的单细胞悬液