单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 6421 - 6440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6421 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-Apr, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞环境 | 首次确定了促进翼状胬肉的新的细胞亚群和细胞间相互作用 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行更广泛的临床验证 | 揭示翼状胬肉的病理机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者和正常对照的结膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 45605个细胞来自翼状胬肉患者和正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 6422 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in choroidal neovascularization model
2024-May, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109877
PMID:38537669
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研究论文 | 本文通过单细胞测序探索了脉络膜新生血管化模型中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次详细描述了RPE/脉络膜复合体内的细胞多样性和特定细胞类型之间复杂的相互作用 | 研究可能需要更大样本量和长时间跟踪，以充分验证发现的细胞类型及其功能 | 探索与年龄相关性黄斑变性相关的脉络膜新生血管化中的细胞组成和相互作用 | 主要研究脉络膜/视网膜色素上皮复合体中的各种细胞类型，包括内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6423 | 2024-08-04 |
Roxithromycin exposure induces motoneuron malformation and behavioral deficits of zebrafish by interfering with the differentiation of motor neuron progenitor cells
2024-May, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116327
PMID:38626605
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研究论文 | 本研究探讨了罗克沙星（ROX）对斑马鱼运动神经元发育和行为缺陷的影响 | 首次揭示罗克沙星暴露导致斑马鱼运动神经元前体细胞分化受阻 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，可能无法完全适用于人类 | 研究罗克沙星早期暴露的发育毒性及其对运动功能的影响 | 使用斑马鱼作为脊椎动物模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 胚胎 | 总样本数为410（n=100，n=100，n=100，n=80，n=30，n=80） | NA | NA | NA | NA |
| 6424 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis implicates novel insights of lactate metabolism into immunotherapy response prediction and survival prognostication
2024-Apr-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03042-7
PMID:38664705
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研究论文 | 该文章探讨了乳酸代谢与免疫治疗反应之间的关系及其在癌症预后中的应用 | 提出了一个与乳酸代谢相关的新标记（LM.SIG），用于预测免疫治疗反应和生存预后 | 研究依赖于公开的转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 揭示乳酸代谢对免疫治疗反应的影响并预测癌症患者的生存状况 | 分析接受免疫治疗的癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 40个泛癌症单细胞RNA测序队列和8个免疫治疗转录组队列以及30个TCGA数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6425 | 2024-08-05 |
Loss of Y in regulatory T lymphocytes in the tumor micro-environment of primary colorectal cancers and liver metastases
2024-04-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60049-y
PMID:38658633
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研究论文 | 该文章研究了原发性结直肠癌和肝转移癌的肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞Y染色体缺失的频率和功能影响 | 首次探讨了肿瘤微环境中浸润性白血球中的Y染色体缺失与结直肠癌的关系 | 目前仅关注了调节性T淋巴细胞，未能探讨其他类型淋巴细胞的影响 | 研究肿瘤微环境中Y染色体缺失在结直肠癌发生中的作用 | 研究对象为血液、肿瘤微环境和非肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 在肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞的Y染色体缺失频率为22% | NA | NA | NA | NA |
| 6426 | 2024-08-05 |
scGAL: unmask tumor clonal substructure by jointly analyzing independent single-cell copy number and scRNA-seq data
2024-Apr-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10319-w
PMID:38649804
|
研究论文 | 该文章介绍了一种新型混合模型scGAL，用于推断肿瘤克隆拷贝数亚结构 | scGAL结合了自编码器和生成对抗网络，能够联合分析单细胞拷贝数和基因表达数据，克服拷贝数数据中的噪声影响 | 可能仍受到个别数据集特征和技术限制的影响 | 准确解码肿瘤克隆拷贝数亚结构以提供癌症的演化机制见解 | 真实癌症数据集中的单细胞拷贝数和基因表达数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | scDNA-seq | 生成对抗网络 | 拷贝数数据和基因表达数据 | 三个真实癌症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6427 | 2024-08-05 |
Discrete-state models identify pathway specific B cell states across diseases and infections at single-cell resolution
2024-04-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2024.111769
PMID:38423206
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研究论文 | 该文章研究了在健康和疾病状况下B细胞的特定状态。 | 开发了基于状态的离散模型，利用单细胞RNA测序数据来识别与氧调控通路相关的B细胞状态。 | 研究仅限于已发布的单细胞RNA测序数据，可能忽略其他重要因素。 | 理解B细胞在感染、疫苗接种和其他疾病中的状态及其调节方式。 | 研究不同疾病和感染中的B细胞状态及其转变。 | 数字病理学 | 乳腺癌, HIV | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 离散状态模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6428 | 2024-08-05 |
YTE-17 inhibits colonic carcinogenesis by resetting antitumor immune response via Wnt5a/JNK mediated metabolic signaling
2024-Apr, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.11.008
PMID:38665223
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研究论文 | 本研究探讨了YTE-17通过Wnt5a/JNK介导的代谢信号通路抑制结肠癌发生的机制 | 本研究首次揭示YTE-17通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞平衡来预防结直肠癌 | 关于YTE-17在预防结直肠癌的机制了解仍有限 | 探索YTE-17在结直肠癌预防中的潜在作用 | 研究对象包括暴露于YTE-17的肠上皮细胞及其在结肠癌模型中的免疫微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | iTRAQ分析、单细胞RNA测序 | 参与性癌症模型 | 组织样本 | 不同阶段的结肠癌模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6429 | 2024-08-04 |
Gene Expression Patterns in the Ctenophore Pleurobrachia bachei: In Situ Hybridization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_9
PMID:38668969
|
研究论文 | 本研究提出了一种用于观察海洋无脊椎动物Pleurobrachia bachei的基因表达模式的原位杂交方法 | 提供了适用于高度脆弱的动物的原位杂交协议，并展示了细胞表型标记的表达模式 | 对脆弱动物的应用具有挑战性，可能限制了方法的通用性 | 研究Ctenophora类动物的基因表达模式 | 成年Pleurobrachia bachei | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 成年Pleurobrachia bachei的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6430 | 2024-08-04 |
Analysis and Visualization of Single-Cell Sequencing Data with Scanpy and MetaCell: A Tutorial
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_17
PMID:38668977
|
教程 | 本章节提供了对单细胞RNA测序数据分析流程的概述和实践指南 | 提出了使用Scanpy和MetaCell的实用指南，以及对主要分析步骤和数据可视化的最佳实践的比较 | 尚未充分代表用户在使用scRNA-seq分析中所需的实用指南 | 旨在为单细胞RNA测序的数据分析提供系统性的方法和实用指南 | 以单细胞RNA测序数据为研究对象，分析生物样本的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用了来自栅鳗鱼的scRNA-seq数据集，相应样本大小未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6431 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of CYBB as a prognostic marker and therapeutic target in glioma: A bioinformatics approach
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29549
PMID:38655339
|
研究论文 | 本文综合分析了CYBB作为神经胶质瘤的预后标志物和治疗靶点 | 建立了基于CYBB和线粒体基因的预后模型，揭示其在神经胶质瘤患者预后中的潜在应用 | 未提及具体的样本数量和研究的局限性 | 识别新的标志基因并建立预后模型以改善神经胶质瘤的早期诊断和预后判断 | 研究对象为神经胶质瘤患者及其临床病理特征 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 10基因预后模型 | 基因表达数据 | 7名神经胶质瘤患者的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6432 | 2024-08-04 |
Identifying MS4A6A+ macrophages as potential contributors to the pathogenesis of nonalcoholic fatty liver disease, periodontitis, and type 2 diabetes mellitus
2024-Apr-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e29340
PMID:38644829
|
研究论文 | 本研究识别了MS4A6A+巨噬细胞作为非酒精性脂肪肝病、牙周炎和2型糖尿病发病机制的重要贡献者 | 首次确定了MS4A6A+巨噬细胞在多种疾病交互作用中的重要性 | 缺乏临床验证和更大样本量的支持 | 探讨非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病和牙周炎之间的共同机制 | 分析与NAFLD、T2DM和PD相关的数据集及其差异表达基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病、2型糖尿病、牙周炎 | 单细胞测序、免疫组织化学染色 | LASSO算法 | 基因表达数据 | 三个疾病相关的数据集中识别了25个共享的差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 6433 | 2024-08-05 |
Unravelling immune microenvironment features underlying tumor progression in the single-cell era
2024-Apr-22, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03335-z
PMID:38649887
|
综述 | 本综述探讨了单细胞RNA测序(SC-RNA-seq)在肿瘤免疫微环境(TIME)特征解析中的重要性。 | 强调了SC-RNA-seq在肿瘤发生和进展中揭示TIME细胞和分子变化的新颖性。 | 未具体提及传统测序方法的局限性细节。 | 阐明免疫细胞与肿瘤发生和进展之间的关系。 | 肿瘤免疫微环境中细胞异质性的变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6434 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome atlas in C57BL/6 mice encodes morphological phenotypes in the aging kidneys
2024-Apr-19, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03514-0
PMID:38641839
|
研究论文 | 本研究提供了C57BL/6小鼠在不同发育阶段的肾脏形态和单细胞转录组图谱的综合数据。 | 提供了关于C57BL/6小鼠肾脏在整个发育阶段的详细形态学和单细胞转录组参考标准，有助于生物研究的进一步扩展。 | 缺乏对其他小鼠品系或其它管理条件下的肾脏形态及转录组的比较研究。 | 探究C57BL/6小鼠肾脏在不同发育阶段的形态变化及其单细胞转录组。 | C57BL/6小鼠的肾脏在胚胎到老化过程中的各个阶段。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 肾脏组织数据 | 8组，每组5-6只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6435 | 2024-08-05 |
Membrane to cortex attachment determines different mechanical phenotypes in LGR5+ and LGR5- colorectal cancer cells
2024-Apr-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47227-2
PMID:38637494
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研究论文 | 本文研究了LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞在机械性状上的差异 | 揭示了LGR5+细胞与LGR5-细胞在机械属性上的显著差异及其对转移的潜在影响 | 对不同细胞群体在转移过程中的具体机制尚未深入探讨 | 探讨结直肠癌细胞群体的机械性状如何影响其转移能力 | 分析LGR5+和LGR5-结直肠癌细胞的机械性能和生物学特性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 来自患者队列的结直肠癌源性类器官样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6436 | 2024-08-05 |
Establishment of a cholangiocarcinoma risk evaluation model based on mucin expression levels
2024-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i4.1344
PMID:38660669
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研究论文 | 本研究建立了一个基于粘蛋白表达水平的胆管癌风险评估模型 | 首次系统性探讨了粘蛋白在胆管癌进展及预后中的作用，建立了风险评估公式 | 尚未完全理解粘蛋白家族如何影响胆管癌的进展和预后 | 研究粘蛋白在胆管癌进展中的作用并建立风险评估模型 | 14个胆管癌样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组化 | LASSO回归 | RNA数据 | 14个胆管癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6437 | 2024-08-05 |
Identification of receptors and factors associated with human coronaviruses in the oral cavity using single-cell RNA sequencing
2024-Apr-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e28280
PMID:38560173
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了与人类冠状病毒在口腔中相关的受体和因素 | 本研究整合了多个口腔组织的单细胞RNA测序数据，识别了特定细胞簇及SARS-CoV-2和与冠状病毒相关的受体的表达模式 | SCARFs在其他口腔部位的表达模式相对复杂，可能仅与SARS-CoV-2感染特定相关 | 探究四种人类冠状病毒在口腔中的感染机制和靶细胞特征 | 本研究对象为七种人类口腔组织中的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 七种人类口腔组织的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6438 | 2024-08-04 |
Staphylococcus aureus induces drug resistance in cancer T cells in Sézary syndrome
2024-Apr-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021671
PMID:38170178
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研究论文 | 本研究报告了金黄色葡萄球菌及其肠毒素在Sézary综合症患者的恶性T细胞中诱导耐药性 | 首次揭示了金黄色葡萄球菌肠毒素诱导的抗药机制及其在Sézary综合症中的影响 | 本研究未涉及多种其他类型的细菌或影响因素 | 探索金黄色葡萄球菌诱导的药物耐受机制及其在SE综合症中的作用 | 对来自Sézary综合症患者的恶性T细胞进行研究 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞样本 | 来自Sézary综合症患者的多个原代恶性T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6439 | 2024-08-04 |
Spatial motifs reveal patterns in cellular architecture of complex tissues
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588586
PMID:38645046
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研究论文 | 空间组织对保证组织的生理功能和癌症等病理状态至关重要 | 提出了一种新方法，通过空间邻域图检测细胞类型的空间模式 | 未提及该方法在其他组织类型或更复杂条件下的适用性 | 旨在识别细胞类型之间的更高阶关联，以理解复杂组织的发育和功能 | 主要研究小鼠视网膜双极细胞和下丘脑前视区域的空间图谱 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 合成数据和空间图谱 | 使用合成数据进行验证，具体样本量未知 | NA | NA | NA | NA |
| 6440 | 2024-08-05 |
Predictive and Prognostic Biomarkers in Patients With Mycosis Fungoides and Sézary Syndrome (BIO-MUSE): Protocol for a Translational Study
2024-Apr-04, JMIR research protocols
IF:1.4Q3
DOI:10.2196/55723
PMID:38436589
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研究论文 | 本研究旨在识别与真菌病和塞扎里综合症患者相关的预后生物标志物 | 首次综合分析血液和皮肤中的免疫细胞及微生物环境，以发现潜在的新预后生物标志物 | 由于样本数量尚少，可能影响研究结果的普遍适用性和统计学意义 | 识别与真菌病和塞扎里综合症相关的预后生物标志物 | 真菌病和塞扎里综合症患者的血液和皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，数字空间分析 | NA | 血液和皮肤样本 | 正在招募120名真菌病或塞扎里综合症的成年患者以及20名健康志愿者 | NA | NA | NA | NA |