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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6401 | 2024-08-04 |
The role of FERMT2 in the tumor microenvironment and immunotherapy in pan-cancer using comprehensive single-cell and bulk sequencing
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30505
PMID:38726194
|
研究论文 | 该文章探讨了FERMT2在肿瘤微环境及免疫治疗中的作用 | 该研究结合单细胞和大规模测序技术,首次全面分析了FERMT2在不同癌症类型中的免疫特征和预后意义 | 研究的具体方法和样本数量在摘要中未提及,可能影响结果的普适性 | 本研究旨在评估FERMT2在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 研究对象为在肿瘤微环境中表达FERMT2的不同癌症类型的细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序、复合免疫荧光染色 | NA | 组织切片数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6402 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis for the prognostic and immunological role of CD47: interact with TNFRSF9 inducing CD8 + T cell exhaustion
2024-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00951-z
PMID:38720108
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研究论文 | 本研究探讨了CD47在癌症免疫治疗中的作用及其与CD8+ T细胞耗竭的关系 | 揭示了CD47影响多种癌症类型中CD8+ T细胞耗竭的机制,并提出将CD47和TNFRSF9作为免疫治疗的新靶点 | 未详细讨论CD47在不同癌症微环境中的具体作用机制 | 阐明CD47在癌症免疫微环境中的预后和免疫学相关性 | 本研究对象包括多种癌症类型的患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 6403 | 2024-08-05 |
Transcriptomic imputation of genetic risk variants uncovers novel whole-blood biomarkers of Parkinson's disease
2024-May-08, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-024-00698-y
PMID:38719867
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研究论文 | 本研究探讨了基因表达特征作为帕金森病生物标志物的潜力 | 发现PATL2基因作为临床和前驱性帕金森病的潜在生物标志物 | 未在不同人群中验证结果的广泛性 | 通过转录组插补发现新的全血生物标志物用于帕金森病 | 转录组插补生成的全血基因表达签名 | 数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序 | 随机森林分类器 | 基因表达数据 | 1176个帕金森病患者、254个前驱症状患者和860个健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 6404 | 2024-08-05 |
Molecular Basis of Neuronal and Microglial States in the Aging Brain and Impact on Cerebral Blood Vessels
2024-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084443
PMID:38674028
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综述 | 本文介绍了神经元和胶质细胞在衰老过程中的变化及其对大脑微环境的影响 | 探讨了单细胞RNA测序和蛋白质组学等技术在研究大脑衰老过程中动态变化的应用 | 未明确指出具体的研究限制 | 理解大脑衰老过程中神经元和胶质细胞的状态变化 | 研究大脑衰老中神经元、胶质细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6405 | 2024-08-04 |
Integrating bulk and single-cell sequencing data to construct a Scissor+ dendritic cells prognostic model for predicting prognosis and immune responses in ESCC
2024-Apr-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03683-9
PMID:38619620
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研究论文 | 该文章主要构建了一种Scissor+树突状细胞预后模型,以预测食管鳞状细胞癌患者的预后和免疫反应 | 文章首次结合大规模与单细胞测序数据,提供了树突状细胞在食管鳞状细胞癌中的重要性及其子群体的分层 | 文章中未明确提及模型在其他类型癌症中的适用性和泛化能力 | 研究旨在揭示食管鳞状细胞癌中树突状细胞的异质性及其与预后的关系 | 研究对象为60名食管鳞状细胞癌患者的单细胞数据和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 未适用 | 细胞数据 | 包含60名患者的192,078个单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6406 | 2024-08-05 |
Cell-type-specific and disease-associated expression quantitative trait loci in the human lung
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01702-0
PMID:38548990
|
研究论文 | 研究人类肺部特定细胞类型和疾病相关的表达数量性状位点 | 首次在38种细胞类型中绘制了表达数量性状位点(eQTL),揭示了细胞特异性调控效应 | 研究仅涉及肺纤维化患者和未受影响供体,可能限制了结果的普遍性 | 阐明遗传变异如何影响组织特定基因表达与疾病的机制 | 对66名肺纤维化患者和48名未受影响供体的肺组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66名肺纤维化患者和48名未受影响供体 | NA | NA | NA | NA |
| 6407 | 2024-08-05 |
Neutrophil extracellular traps promoting fibroblast activation and aggravating limb ischemia through Wnt5a pathway
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/SQOC7984
PMID:38726275
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞外陷阱(NETs)在肢体缺血病理进展中的作用 | 首次揭示了NETs通过Wnt5a通路在肢体缺血中促进成纤维细胞激活的机制 | 尚未在人类样本中验证结果的临床相关性 | 研究NETs在肢体缺血中的功能及其与成纤维细胞的相互作用 | 主要研究对象为缺血小鼠模型中的成纤维细胞和光滑肌细胞 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞RNA测序,免疫组化,西方印迹 | NA | 组织样本 | 9个不同细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 6408 | 2024-08-05 |
Integrated enhancer regulatory network by enhancer-promoter looping in gastric cancer
2024-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcae020
PMID:38720882
|
研究论文 | 本研究分析了胃癌细胞中增强子-启动子环状相互作用的调控网络 | 发现胃癌特异性增强子通过增强子-启动子环与近邻启动子相互作用激活多个基因,尤其是在胃癌细胞中表达的肿瘤相关基因 | 未提及具体的局限性 | 研究胃癌细胞中增强子如何调控癌基因转录 | 胃癌细胞系与正常胃上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,CRISPR干扰 | NA | 基因表达数据 | 使用了两种胃癌细胞系和临床胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6409 | 2024-08-04 |
Genomic insights into the cellular specialization of predation in raptorial protists
2024-May-07, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01904-2
PMID:38715037
|
研究论文 | 本研究探讨了捕食原生动物的细胞特化的基因组机制 | 首次揭示了Haptoria纤毛虫在毒素生成和释放中的基因重复与表达特征 | 对毒素形成和释放的遗传过程的理解仍然有限 | 研究Haptoria纤毛虫的捕食策略及其细胞结构 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | NA | NA | NA | NA |
| 6410 | 2024-08-05 |
Single-cell senescence identification reveals senescence heterogeneity, trajectory, and modulators
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.009
PMID:38604170
|
研究论文 | 本文介绍了一种机器学习程序SenCID,用于准确识别衰老细胞 | SenCID能够识别不同的衰老身份,并重建衰老轨迹,揭示了衰老调节因子的层级结构 | 未提及具体的限制 | 研究细胞衰老及其异质性 | 602个样本来自52个衰老转录组数据集 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 转录组测序 | 机器学习模型 | 文本数据 | 602个样本,涉及30种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 6411 | 2024-08-04 |
Catalytic Nanodots-Driven Pyroptosis Suppression in Nucleus Pulposus for Antioxidant Intervention of Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202313248
PMID:38299823
|
研究论文 | 本研究开发了碳化锰纳米点(MCDs)作为抗氧化剂,以抑制髓核细胞的焦亡,从而有效缓解椎间盘退变。 | 该研究首次使用碳化锰纳米点作为ROS清除催化生物材料,展示了其在抑制焦亡和缓解椎间盘退变中的优越效果。 | 该研究的局限性可能包括小鼠模型的适用性和长期效果需进一步验证。 | 研究的目的是开发一种新的抗氧化干预措施,以抑制椎间盘退变中的焦亡。 | 研究对象为椎间盘退变相关的髓核细胞。 | 数字病理 | 椎间盘退变 | 催化干预 | 小鼠模型 | 生物材料和生物化学数据 | 使用了多种小鼠样本进行体内评估 | NA | NA | NA | NA |
| 6412 | 2024-08-05 |
Identification of a novel ADCC-related gene signature for predicting the prognosis and therapy response in lung adenocarcinoma
2024-May, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01871-y
PMID:38507067
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研究论文 | 该研究识别了一种新的ADCC相关基因特征,预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次系统编制ADCC相关基因创建预后标志,并展示了其在多组患者中的有效性 | 可能未对所有潜在的ADCC相关基因进行全面考察,且外部验证需要进一步研究 | 旨在通过ADCC相关基因特征提高肺腺癌患者的预后预测和治疗反应评估 | 包括1564例肺腺癌患者以及其他多种癌症类型的总共5000多名患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习 | 集成机器学习方法 | 基因组数据、单细胞数据 | 1564名肺腺癌患者,2057名非小细胞肺癌患者,以及5000多名其他癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6413 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a signature based on myofibroblastic cancer-associated fibroblast marker genes for predicting prognosis, immune infiltration, and therapeutic response in bladder cancer
2024-May, Investigative and clinical urology
IF:2.5Q2
DOI:10.4111/icu.20230300
PMID:38714517
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研究论文 | 本研究探讨了用于预测膀胱癌预后、免疫浸润和治疗反应的肌成纤维癌相关成纤维细胞标记基因的特征。 | 本研究构建了一个基于两个基因(COL6A1和MAP1B)的风险特征,为膀胱癌患者提供了新的治疗靶点。 | 本研究在样本选择和数据分析上可能存在一定的局限性,未详细讨论如何克服这些局限。 | 研究目的在于探索膀胱癌患者临床诊断和治疗中的myCAF标记基因生物标志物。 | 研究对象为膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据和临床数据。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学 | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6414 | 2024-08-05 |
Early megakaryocyte lineage-committed progenitors in adult mouse bone marrow
2024-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000187
PMID:38721470
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研究论文 | 本研究首次识别了成年小鼠骨髓中早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 本研究提出了一个新的分化模型,表明巨核细胞谱系承诺发生在分化的晚期,而非直接由造血干细胞生成。 | 研究中未能展示MgPs在体内的再生能力,且MgPs在基因表达上表现出转录异质性。 | 研究巨核细胞谱系承诺的前体细胞在小鼠骨髓中的特点及其起源。 | 成年小鼠骨髓中的早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞克隆培养、反转录聚合酶链反应(RT-PCR) | NA | 细胞、基因表达数据 | CD201CD48细胞和CD48细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6415 | 2024-08-04 |
Tumoral and stromal hMENA isoforms impact tertiary lymphoid structure localization in lung cancer and predict immune checkpoint blockade response in patients with cancer
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105003
PMID:38340557
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞中的hMENA亚型与三次淋巴结构(TLS)的关系及其对肺癌患者结果的影响 | 发现hMENA的选择性剪接是TLS相关肿瘤免疫微环境的重要未探索因素,且hMENA亚型可作为临床结果和ICB响应的潜在生物标志物 | 研究主要基于回顾性观察,可能存在样本选择偏倚 | 本研究旨在了解hMENA亚型如何影响肺癌的三次淋巴结构及其与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 研究对象为非小细胞肺癌(NSCLC)患者的肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序,免疫组化,空间转录组学 | NA | 组织样本,转录组数据 | N0 NSCLC患者的手术切除组织 | NA | NA | NA | NA |
| 6416 | 2024-08-04 |
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury-induced myofibroblasts
2024-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01326-2023
PMID:38212077
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研究论文 | 本文研究了Sfrp1在肺纤维母细胞转变为损伤诱导的肌成纤维细胞过程中的抑制作用 | 首次揭示了Sfrp1在调节人类肺纤维母细胞对TGFβ1响应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和特定患者组织样本,可能限制结果的普遍适用性 | 探讨肺纤维母细胞在损伤和修复过程中的命运变化 | 小鼠肺再生过程中的纤维母细胞及其转变 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 组织样本 | 小鼠模型和特定的特发性肺纤维化患者组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6417 | 2024-08-04 |
Identifying specific TLS-associated genes as potential biomarkers for predicting prognosis and evaluating the efficacy of immunotherapy in soft tissue sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372692
PMID:38720884
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研究论文 | 本研究探讨了TLS相关基因作为软组织肉瘤预后和免疫治疗疗效的潜在生物标志物 | 本研究系统性地探索了TLS及其相关基因,并建立了与预后和免疫治疗反应相关的风险评分和标志基因 | 研究仍需进一步验证TLS分数和生物标志物在临床中的有效性 | 探讨TLS结构在软组织肉瘤中的作用以及相关生物标志物 | 从TCGA-SARC和GSE212527队列收集的RNAseq和单细胞测序样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序、单细胞测序 | 无 | RNA测序数据 | 256个RNAseq样本和7个单细胞测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6418 | 2024-08-04 |
Cell communication pathway prognostic model identified detrimental neurodevelopmental pathways in neuroblastoma
2024-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.100997
PMID:38669760
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研究论文 | 该文章开发了一种细胞通信通路预后模型,以识别神经母细胞瘤中的有害神经发育通路 | 文章提出了细胞通信通路预后模型(CCPPM),为研究细胞通信通路对疾病预后的影响提供了新的方法 | 由于样本量有限和单细胞RNA-seq数据的临床生存信息不完整,确定这些通信通路对预后的影响具有挑战性 | 研究细胞通信路径对神经母细胞瘤预后的影响 | 神经母细胞瘤的细胞通信通路 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6419 | 2024-08-04 |
Nitrogen sensing and regulatory networks: it's about time and space
2024-May-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae038
PMID:38366121
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综述 | 本文探讨了植物对氮信号的感知与调控网络的时间和空间维度 | 揭示了氮感知/信号传导的时空系统生物学新方面,特别是在拟南芥模型中的应用 | 主要集中在拟南芥模型上,可能限制结果的普遍适用性 | 研究植物如何在不同细胞类型及长距离上整合氮的响应以确保实时协调 | 主要研究对象为植物,尤其是拟南芥中的氮感知和信号传导机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、轨迹推断、伪时间分析、机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6420 | 2024-08-05 |
Characterization of the malignant cells and microenvironment of infantile fibrosarcoma via single-cell RNA sequencing
2024-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-24-66
PMID:38715675
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了婴儿纤维肉瘤的恶性细胞及其微环境 | 揭示了婴儿纤维肉瘤的普遍转录特征,识别了潜在的新标记物和功能性恶性细胞亚型 | 样本量可能有限,仅来自四名患者,缺乏纵向跟踪数据 | 阐明婴儿纤维肉瘤的转录特征,并探索新的诊断和治疗靶点 | 收集四名患者的婴儿纤维肉瘤新鲜组织样本 | 数字病理学 | 婴儿纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |