单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 6401 - 6420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6401 | 2024-08-05 |
Immunoregulatory and neutrophil-like monocyte subsets with distinct single-cell transcriptomic signatures emerge following brain injury
2024-Feb-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03032-8
PMID:38310257
|
研究论文 | 本研究揭示了脑损伤后单核细胞亚群的免疫调节特性及其单细胞转录组特征 | 首次表明创伤导致特定CD115/Ly6C单核细胞群体的释放，并与神经保护相关 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床应用需要进一步验证 | 探索脑损伤后单核细胞的免疫反应和潜在的神经保护机制 | 小鼠模型中观察到的单核细胞亚群及其转录组特征 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中观察的单核细胞数目未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6402 | 2024-08-04 |
Single-Cell Multi-Omics Map of Cell Type-Specific Mechanistic Drivers of Multiple Sclerosis Lesions
2024-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200213
PMID:38564686
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研究论文 | 该文章探讨了多发性硬化损伤的细胞类型特异性机制驱动因素 | 首次使用单细胞多组学技术揭示了多发性硬化特异性少突胶质细胞遗传特征及其与铁摄取信号的关联 | 研究样本数量较少，仅涉及6名多发性硬化患者和3名非神经病对照 | 研究多发性硬化中的细胞动态及其在病变中的作用 | 使用来自6名渐进性多发性硬化患者的脑白质损伤样本 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单核RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 9个病变样本和3个对照样本来自6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6403 | 2024-08-05 |
Generation of complex bone marrow organoids from human induced pluripotent stem cells
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02172-2
PMID:38374263
|
研究论文 | 本文展示了一种从人类诱导多能干细胞生成复杂骨髓类器官的方法 | 创新之处在于生成了模拟人类骨髓微环境的复杂三维骨髓类器官 | 没有提到具体的局限性 | 研究与人类骨髓微环境相关的造血发展和疾病 | 从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 6404 | 2024-08-05 |
sciCSR infers B cell state transition and predicts class-switch recombination dynamics using single-cell transcriptomic data
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02060-1
PMID:37932398
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研究论文 | 本文介绍了sciCSR，一个分析B细胞类转变和动态的计算管道 | sciCSR能够利用单细胞RNA测序数据分析类转变事件，并构建马尔可夫状态模型推断CSR的动态和方向 | 未提及具体限制 | 分析B细胞成熟过程中类转变重组的动态 | 采用单细胞RNA测序数据，研究B细胞的类转变和动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 马尔可夫状态模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 6405 | 2024-08-05 |
ENO1 promotes trophoblast invasion regulated by E2F8 in recurrent miscarriage
2024-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302032RR
PMID:38661062
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研究论文 | 本研究探讨了ENO1在复发性流产中通过E2F8调控滋养层细胞侵袭的机制 | 发现ENO1通过E2F8依赖性方式促进滋养层细胞侵袭，为复发性流产的生理机制提供了潜在的新靶点 | 研究主要基于基因表达分析，缺乏临床样本验证和长期跟踪研究 | 探索复发性流产的机制及其与滋养层细胞功能障碍的关系 | 主要研究复发性流产中的外滋养层细胞（EVTs）及其相关基因 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA测序, 免疫荧光检测, 西方印迹, 染色质免疫沉淀(ChIP), 实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR), 透析实验 | NA | 基因表达数据 | 1724个差异表达基因的分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6406 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of juvenile idiopathic arthritis patients' immune characteristics based on bulk and single-cell sequencing data
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1359235
PMID:38751447
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研究论文 | 本研究基于大规模和单细胞测序数据，综合分析了青少年特发性关节炎（JIA）患者的免疫特征 | 该研究揭示了JIA患者在T细胞受体和B细胞受体谱的克隆性和多样性方面的显著差异，并识别出特定的V基因和J基因，扩展了对JIA的理解 | 本研究未深入探讨JIA的所有分子机制，尚需更多研究验证相关发现 | 研究青少年特发性关节炎（JIA）患者的免疫特征及其潜在的免疫治疗策略 | 青少年特发性关节炎（JIA）患者及健康对照组 | 数字病理学 | 青少年特发性关节炎 | Bulk RNA-seq和单细胞RNA分析 | NA | RNA序列数据 | JIA患者和健康对照组的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6407 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of vestibular schwannoma reveals functionally distinct macrophage subsets
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02646-2
PMID:38480935
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研究论文 | 本研究分析了前庭神经瘤中功能上不同的巨噬细胞亚群 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了前庭神经瘤中巨噬细胞的三种不同亚群及其基因表达特征 | 样本量较小，仅分析了三例前庭神经瘤样本，可能影响结果的广泛性 | 评估前庭神经瘤中巨噬细胞的表型和功能特征 | 前庭神经瘤样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三例前庭神经瘤样本和十例前庭神经瘤样本的RT-qPCR分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6408 | 2024-08-05 |
MUFFIN: a suite of tools for the analysis of functional sequencing data
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae051
PMID:38745992
|
研究论文 | MUFFIN是一个用于分析功能测序数据的Python工具包 | MUFFIN提供了广泛的工具，填补了Python生态系统中缺失的功能，特别是针对非编码区域的分析 | 文章未详细讨论MUFFIN在处理特定种类样本时的局限性 | 开发一个适用于多种基因组测序分析的工具包 | 针对scRNA-seq、ChIP-seq和ATAC-seq数据集进行建模和分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 测序数据 | 三个不同的scRNA-seq、ChIP-seq和ATAC-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6409 | 2024-08-05 |
The Treatment of Refractory Vitiligo With Autologous Cultured Epithelium Grafting: A Real-World Retrospective Cohort Study
2024-May-14, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szae009
PMID:38513284
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研究论文 | 本研究评估了一种改良自体培养上皮移植技术在治疗难治性白癜风中的效果 | 提出了一种改良的自体培养上皮移植技术，并首次在大规模真实世界患者中应用 | 本研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏倚 | 评估自体培养上皮移植在白癜风治疗中的有效性和影响因素 | 726名接受自体培养上皮移植（ACEG）治疗的白癜风患者 | 数字病理学 | 白癜风 | 自体培养上皮移植（ACEG） | 广义线性混合模型 | 临床数据 | 726名白癜风患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6410 | 2024-08-05 |
Mapping of mitogen and metabolic sensitivity in organoids defines requirements for human hepatocyte growth
2024-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48550-4
PMID:38740814
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研究论文 | 本文揭示了人类肝细胞在发育和再生中的增长机制，特别是胎儿和成人肝细胞类器官的生长差异 | 通过转录组和表型方法对肝细胞类器官的生长要求进行了特征化，发现了促进成人肝细胞增殖的潜在策略 | 该研究主要集中于类器官的体外生长，缺乏体内验证 | 探讨人类肝细胞在发育和再生过程中的增殖机制 | 研究对象为人类胎儿肝细胞（FH）和成人初级人类肝细胞（PHH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量的具体信息 | NA | NA | NA | NA |
| 6411 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis enhances prognostic accuracy of PD-1/PD-L1 immunotherapy response in lung adenocarcinoma through necroptotic anoikis gene signatures
2024-05-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61629-8
PMID:38740918
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞与整体RNA测序分析，提升了对肺腺癌PD-1/PD-L1免疫疗法反应的预后准确性 | 提出了与凋亡相关的基因特征HMR、FAM83A和KRT6A，增强了预测肺腺癌患者对免疫治疗反应的能力 | 承认数据集的回顾性性质及样本规模需要更大 | 本研究旨在提高肺腺癌患者在PD-1/PD-L1免疫治疗中的预后评估准确性 | 研究对象是肺腺癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了GSE50081、IMvigor210和GSE78220数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6412 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing in Organ and Cell Transplantation
2024-Apr-11, Biosensors
DOI:10.3390/bios14040189
PMID:38667182
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在器官和细胞移植中的应用及其潜在影响 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示移植组织转录组以及与移植并发症相关的细胞类型和状态 | 文章未详细讨论单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 研究单细胞RNA测序在器官和干细胞移植中的应用 | 应用单细胞RNA测序分析被移植组织中的供体和受体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6413 | 2024-08-04 |
Identification of PANoptosis-related predictors for prognosis and tumor microenvironment by multiomics analysis in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94200
PMID:38577605
|
研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在胶质瘤进展中的功能，并识别了预测胶质瘤预后的相关指标 | 本研究首次识别了与PANoptosis相关的四个预测因子，并建立了PANRG评分模型，与肿瘤微环境的关系得到了探讨 | 本研究的局限性在于样本数量和实验验证的范围可能不足 | 研究PANoptosis相关基因在胶质瘤中的预后预测和新治疗靶点的开发 | 胶质瘤患者的基因数据和临床样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | LASSO-Cox回归分析 | 基因数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6414 | 2024-08-05 |
Prognostic and Immune Landscape Analysis of Ubiquitination-related Genes in Hepatocellular Carcinoma: Based on Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93425
PMID:38577593
|
研究论文 | 本研究分析了与泛素化相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫景观 | 本研究首次基于泛素化相关基因建立了肝细胞癌预测模型，并确定了三个关键生物标志物 | 目前仍缺乏关于泛素化相关基因在肝细胞癌免疫疗法中的实际应用验证 | 探讨泛素化相关基因在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用 | 主要研究肝细胞癌中与泛素化相关的基因及其表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，转录组差异表达分析 | 加权基因共表达网络分析，Cox回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，样本大小未具体提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6415 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome reveals highly complement activated microglia cells in association with pediatric tuberculous meningitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387808
PMID:38745656
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研究论文 | 该研究揭示了与儿童结核性脑膜炎相关的高度补体激活的微胶质细胞。 | 首次在结核性脑膜炎患儿的脑脊液和外周血单核细胞中发现了33种单核细胞亚群和补体激活的微胶质细胞。 | 样本量仅为6个患儿，可能影响结果的普遍性。 | 揭示结核性脑膜炎中的免疫机制及微胶质细胞的作用。 | 研究对象为患有结核性脑膜炎的儿童及其外周血单核细胞和脑脊液细胞。 | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 6名儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 6416 | 2024-08-05 |
Characteristics of T Cells in Single-Cell Datasets of Peripheral Blood and Cerebrospinal Fluid in Alzheimer's Disease Patients
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230784
PMID:38043012
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的特征 | 揭示了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的扩展及其功能特征 | 没有提及具体的样本量和实验限制 | 探索阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的潜在特征 | 阿尔茨海默病患者的外周血和脑脊液中T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据集（GSE181279和GSE134578） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6417 | 2024-08-05 |
Copper-binding protein modelling by single-cell transcriptome and Bulk transcriptome to predict overall survival in lung adenocarcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94588
PMID:38577594
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和大规模转录组模型预测肺腺癌患者的总体生存率 | 提出了一种新的铜结合蛋白模型，显示其在肺腺癌预后中的高预测能力 | 未提及可能的样本选择偏倚或数据集的局限性 | 旨在评估铜结合蛋白在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者的铜结合蛋白及其在生存预测中的表现 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，LASSO-Cox分析，RT-qPCR | CBPRS模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个队列，具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6418 | 2024-08-04 |
Navigating colorectal cancer prognosis: A Treg-related signature discovered through single-cell and bulk transcriptomic approaches
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24214
PMID:38459654
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和大规模转录组方法发现了与Treg相关的结直肠癌预后标志 | 本研究结合了单细胞异质性和大规模转录组数据，构建了基于Treg相关特征的预后模型 | 临床应用验证尚需进一步研究，以及样本量的限制可能影响结果的普适性 | 研究结直肠癌的预后及其与调节性T细胞的关系 | 结直肠癌患者的Treg细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和大规模转录组分析 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 分析了GSE132465和GSE188711中结直肠癌的单细胞和大规模数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6419 | 2024-08-04 |
Precision unveiled: Synergistic genomic landscapes in breast cancer-Integrating single-cell analysis and decoding drug toxicity for elite prognostication and tailored therapeutics
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24205
PMID:38450906
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研究论文 | 本研究探索了与T细胞相关的基因与谷氨酰胺代谢之间的关系，以构建乳腺癌患者的预后分级指标 | 创新点在于开发了一种TRG_GM分类器，整合了临床指标，提高了乳腺癌的预后预测能力 | 缺少对多种指标结合的深入探索以揭示不同维度的预后表现 | 研究旨在通过分析基因与代谢的关系，提升乳腺癌的个性化治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者及其相关的生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 机器学习，Cox分析，Lasso算法 | NA | 基因组数据，免疫特征数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6420 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of bulk RNA-seq and scRNA-seq data indicates the prognostic and immunologic values of SERPINH1 in glioma
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24192
PMID:38506564
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研究论文 | 本文章探讨了SERPINH1在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 本研究首次阐明了SERPINH1在胶质瘤中的表达及其作为独立预后因素的作用 | 仅使用了在线数据库的数据，未报告临床样本的多样性 | 研究SERPINH1在胶质瘤中的潜在价值 | 胶质瘤相关的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq，qRT-PCR，免疫组织化学 | Cox回归分析 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |