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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-18 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
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研究论文 | 本研究提出了一种整合空间转录组学与组织病理学图像数据的新型深度学习方法,以更好地捕捉癌症组织中的生物学模式 | 首次将ResNet深度学习模型提取的形态学特征与空间基因表达数据相结合进行聚类分析,实现了图像感知的特征发现 | 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等侵袭性癌症类型,在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 通过整合多模态数据提升空间转录组学分析的生物学洞察力 | 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤, 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学, 组织病理学成像 | ResNet-50, Louvain聚类 | 空间基因表达数据, 高分辨率全切片组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 622 | 2026-04-17 |
CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes
2024-10-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024
PMID:39214091
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研究论文 | 本研究探讨了在非肥胖糖尿病小鼠中,针对胰岛素衍生表位的CD4 T细胞反应的动态性和致病性,揭示了InsC-ChgA特异性CD4 T细胞的独特致病作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析了胰腺中胰岛素特异性CD4 T细胞的命运异质性,并发现InsC-ChgA特异性CD4 T细胞偏向于独特的Th1效应表型且具有致病性 | 研究仅基于非肥胖糖尿病小鼠模型,结果可能不完全适用于人类自身免疫性糖尿病 | 探究自身免疫性糖尿病中胰岛素特异性CD4 T细胞的反应异质性和致病机制 | 非肥胖糖尿病小鼠的胰腺CD4 T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-04-17 |
Oncogenic Calreticulin Induces Immune Escape by Stimulating TGFβ Expression and Regulatory T-cell Expansion in the Bone Marrow Microenvironment
2024-Sep-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3553
PMID:38885318
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研究论文 | 本研究揭示了致癌性钙网蛋白通过刺激TGFβ表达和调节性T细胞扩增,在骨髓微环境中诱导免疫逃逸的机制 | 首次在骨髓增殖性肿瘤中鉴定出ERK/Sp1/TGFβ1轴作为免疫抑制机制,并证明靶向该轴可增强T细胞活性和糖酵解能力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 | 探究致癌性钙网蛋白突变如何影响骨髓微环境并促进免疫逃逸 | 骨髓增殖性肿瘤患者和小鼠模型中的骨髓细胞及T细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四个独立患者队列及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-04-17 |
CD8+ T-cell differentiation and dysfunction inform treatment response in acute myeloid leukemia
2024-09-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021680
PMID:38776511
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研究论文 | 本研究通过多模态方法揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞分化状态、功能障碍与治疗反应之间的关联 | 首次发现早期记忆CD8+ T细胞在AML治疗反应中的关键作用,并揭示其分化为激活状态与NK样/衰老状态两种终末状态的动态过程 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证CD8+ T细胞衰老与治疗抵抗的因果机制 | 探究急性髓系白血病中CD8+ T细胞分化状态与治疗反应的关系 | 急性髓系白血病患者的CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 高维流式细胞术,单细胞转录组测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据 | 整合多个独立数据集的AML CD8+ T细胞单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-04-17 |
Tumor immune microenvironment of NSCLC with EGFR exon 20 insertions may predict efficacy of first-line ICI-combined regimen
2024-09, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107933
PMID:39191079
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和多重免疫荧光染色,探讨了EGFR外显子20插入突变非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境特征及其与免疫检查点抑制剂联合方案疗效的关联 | 首次在单细胞水平上比较了EGFR外显子20插入突变、L858R突变和野生型非小细胞肺癌的免疫微环境差异,并揭示了ex20ins患者中更抑制性的免疫微环境特征 | 样本量相对有限(scRNA-seq仅15例,mIF分析共62例),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 | 探究EGFR外显子20插入突变非小细胞肺癌的肿瘤免疫微环境特征,并分析其与免疫检查点抑制剂联合方案疗效的相关性 | 非小细胞肺癌患者,包括EGFR外显子20插入突变、L858R突变和野生型三种亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | scRNA-seq分析15例初治NSCLC样本,mIF分析62例(ex20ins 28例,L858R 30例,野生型4例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-04-17 |
Single-cell atlas of the human brain vasculature across development, adulthood and disease
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07493-y
PMID:38987604
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类大脑血管系统在发育、成年和疾病状态下的分子图谱 | 首次大规模单细胞水平揭示了人类大脑血管系统的分子异质性,并识别了疾病血管中动脉静脉分化改变、胎儿基因重新激活以及保守的失调通路 | 样本来源包括胎儿和成人患者,但可能未覆盖所有疾病亚型或种族多样性,且为观察性研究,机制验证需进一步实验 | 解析人类大脑血管系统的细胞和分子结构,以理解其在发育、健康和疾病中的作用 | 人类胎儿和成人患者的大脑血管内皮细胞、血管周围细胞及其他组织来源细胞 | 单细胞组学 | 脑肿瘤、脑血管畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 117个样本,来自68个人类胎儿和成人患者,共606,380个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-04-17 |
Differences in microenvironment of lung cancer and pleural effusions by single-cell RNA sequencing
2024-07, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107847
PMID:38889499
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序比较了匹配的肺癌组织活检与胸腔积液微环境的差异 | 首次对同一患者的匹配肺癌活检组织和胸腔积液进行单细胞RNA测序直接比较 | 样本量较小(10例患者),未明确说明使用的具体单细胞测序平台 | 理解肺癌肿瘤微环境在组织与胸腔积液中的生物学差异 | 肺癌患者匹配的肿瘤组织活检和胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例患者的匹配肺癌活检和胸腔积液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 628 | 2026-04-17 |
Large-scale neurophysiology and single-cell profiling in human neuroscience
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07405-0
PMID:38898291
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综述 | 本文探讨了大规模单细胞神经生理学、单细胞RNA测序和空间转录组学等技术在人类神经科学研究中的整合应用及其前景 | 提出了将清醒脑手术中切除的功能映射人脑组织进行体外培养,并进行多模态细胞与功能分析的工作流程,为理解人脑功能细胞架构提供了统一框架 | NA | 为人类神经科学研究提供一个统一框架,探索网络水平活动背后的细胞基础 | 人脑组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 神经像素技术, 体外组织长期培养 | NA | 神经生理学数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 629 | 2026-04-15 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-11, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 本研究通过大规模测序数据和CRISPRi实验,揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中广泛存在的转座子失调及其与神经炎症的关联 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统表征了转座子表达数量性状位点,并通过CRISPRi实验验证了特定转座子对C1QTNF4基因表达的神经元特异性抑制作用 | 研究主要基于三个脑库的数据,样本代表性可能有限,且CRISPRi实验仅在iPSC衍生神经元中进行,未涵盖其他脑细胞类型 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座子失调的遗传调控机制及其在疾病中的作用 | 人类阿尔茨海默病患者的衰老脑组织样本及iPSC衍生神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序、全基因组测序、CRISPR干扰 | 数量性状位点分析 | 基因组数据、转录组数据 | 基于三个人类AD脑库的大规模样本 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组测序 | NA | NA |
| 630 | 2026-04-15 |
A scalable approach to topic modelling in single-cell data by approximate pseudobulk projection
2024-10, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402713
PMID:39107066
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研究论文 | 本文提出了一种名为ASAP的可扩展近似方法,用于单细胞RNA-seq数据中的主题建模,通过近似伪批量投影提高计算效率 | ASAP方法在单细胞RNA-seq数据分析中实现了比现有方法更准确且计算时间和内存消耗大幅降低的可扩展近似主题建模 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种可扩展的近似方法,用于单细胞数据中的主题建模,以降低计算资源需求 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-04-15 |
TRPC3 suppression ameliorates synaptic dysfunctions and memory deficits in Alzheimer's disease
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.611061
PMID:39345364
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研究论文 | 本研究通过抑制TRPC3通道,改善了阿尔茨海默病模型中的突触功能障碍和记忆缺陷 | 首次发现TRPC3在AD患者和模型中的上调,并鉴定出抑制剂JW-65能通过恢复钙信号通路发挥神经保护作用 | 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究TRPC3通道在阿尔茨海默病神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | AD患者脑组织、AD小鼠模型(急性和慢性)以及培养的大鼠海马神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq、生物信息学分析、RNA-seq | NA | RNA-seq数据、细胞和动物模型数据 | AD患者队列的已发表单细胞RNA-seq数据、死后AD脑组织、急性和慢性AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 632 | 2026-04-15 |
Lin-CD117+CD34+FcεRI+ progenitor cells are increased in chronic spontaneous urticaria and predict clinical responsiveness to anti-IgE therapy
2024-09, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16127
PMID:38634175
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研究论文 | 本研究探讨了慢性自发性荨麻疹患者外周血中Lin-CD117+CD34+FcεRI+祖细胞的增加及其对抗IgE疗法临床反应性的预测价值 | 首次将外周血中特定的祖细胞亚群(Lin-CD34+CD117+FcεRI+)与CSU的临床表型及抗IgE治疗反应相关联,并利用单细胞RNA测序揭示了其细胞谱系组成 | 样本量相对有限(CSU患者n=55,对照组n=22),单细胞RNA测序仅在部分患者(n=8)和对照(n=4)中进行,需要更大规模的研究验证 | 探究慢性自发性荨麻疹的病理机制,并寻找预测抗IgE治疗(奥马珠单抗)临床反应性的生物标志物 | 慢性自发性荨麻疹患者(n=55,其中12人接受奥马珠单抗治疗)和健康对照(n=22)的外周血样本 | 免疫学,皮肤病学 | 慢性自发性荨麻疹 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | CSU患者55例(其中12例接受奥马珠单抗),健康对照22例;scRNA-Seq子集:CSU患者8例,健康对照4例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2026-04-15 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-06, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
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综述 | 本文回顾了肝类器官作为研究工具的发展历程,并探讨了其在肝脏基础研究、药物发现与安全性测试以及疾病病理生物学理解三个领域的贡献 | 系统性地阐述了肝类器官从“青春期”向“成熟期”发展的关键路径,并前瞻性地指出了未来五年内单细胞RNA测序、CRISPR技术与类器官方法学改进相结合将带来的突破 | 未提供具体的实验数据或案例研究,主要基于现有文献和发展趋势进行评述 | 评估肝类器官作为研究工具的当前应用与未来潜力,推动其在肝脏疾病研究和治疗中的应用 | 肝类器官及其在肝脏研究中的应用 | 组织工程与疾病模型 | 肝脏疾病(包括肝纤维化) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR技术、类器官培养技术 | 类器官模型 | 综述性文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2026-04-15 |
Thrombospondin 2 is a key determinant of fibrogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
2024-02, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15792
PMID:38010940
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研究论文 | 本研究通过分析NAFLD患者的单细胞RNA测序数据、肝组织样本和LX-2细胞,揭示了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的高表达及其通过TGFβ通路调控纤维化的机制 | 首次在NAFLD中通过单细胞RNA测序和原位杂交技术,明确了THBS2/TSP2在肝星状细胞中的特异性高表达,并发现其通过非经典TGFβ-SMAD2/3通路调控胶原生成 | 研究主要基于体外细胞模型(LX-2细胞)和基因数据集分析,缺乏体内实验验证;样本量未明确说明,可能影响结果的普适性 | 识别NAFLD中表达THBS2/TSP2的特定细胞,并探究其上调的分子机制 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者肝组织、肝星状细胞(HSCs)及LX-2细胞系 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量聚合酶链反应(qPCR)、原位杂交、计算生物学、遗传学、免疫学和药理学方法 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、肝组织样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-04-14 |
The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07822-1
PMID:39169177
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研究论文 | 本研究揭示了骨膜通过形成基质屏障来抵御头颈部鳞状细胞癌骨侵袭的机制 | 首次证明骨膜反应是抵御癌症骨侵袭的天然防御机制,并发现HIF1α-TIMP1信号轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证相对有限 | 探究骨膜在癌症骨侵袭过程中的生理功能和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的骨侵袭过程 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,组织学分析,基因编辑小鼠模型 | 基因可调控小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 人类HNSCC病变样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-04-14 |
Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01885-y
PMID:38956380
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)的多样性,揭示了不同组织中ILC1亚型的高度可变性 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术系统性地描绘了人类组织中ILC1s的多样性,并识别出肠道上皮中富含成熟的EOMES ILC1s以及其他组织中表达ZNF683的NK细胞,这些发现为理解ILC1-NK谱系在疾病中的表型和功能变化奠定了基础 | NA | 研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)的多样性和分布 | 人类组织中的第1组先天淋巴样细胞(ILC1s)和自然杀伤(NK)细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-04-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-07-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070827
PMID:39062541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平上揭示了SCF+G-CSF治疗如何调节小胶质细胞和外周髓系细胞以减轻阿尔茨海默病病理 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小(仅使用APP/PS1小鼠) | 探究SCF+G-CSF治疗在老年阿尔茨海默病大脑中的修复机制 | 28月龄APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 28月龄APP/PS1小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2026-04-14 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-06-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的先进计算工具,通过深度学习和数据整合来推断细胞特异性基因调控网络 | DeepIMAGER采用监督学习方法,将基因对的共表达模式转化为类图像表示,并整合转录因子结合信息进行模型训练,显著提高了基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞特异性基因调控网络的工具 | 基因调控网络,涉及多种细胞类型,包括多发性骨髓瘤树突状细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习 | 图像表示(由基因对共表达模式转化而来) | 六种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 639 | 2026-04-14 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-06-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
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研究论文 | 本研究首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制,并识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3作为潜在的免疫生物标志物和药物靶点 | 首次整合bulk组学和单细胞测序验证来系统揭示T2DM与CRC共病的分子机制,识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3,并发现ENTPD3阳性的癌症相关成纤维细胞亚群具有独特的肿瘤抑制特征和免疫治疗预测价值 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏体内外实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制和免疫学基础 | 2型糖尿病和结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Connectivity Map, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-04-14 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞(SSCs)的发育模式 | 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱,并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 | 研究样本仅来自沙子岭猪,可能限制了结果的普适性;且未进行功能验证实验 | 探究沙子岭猪睾丸发育,特别是精原干细胞的发育模式 | 沙子岭猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞,覆盖三个关键出生后发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |