单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 6321 - 6340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6321 | 2024-08-05 |
Novel insights into the protective effects of leonurine against acute kidney injury: Inhibition of ER stress-associated ferroptosis via regulating ATF4/CHOP/ACSL4 pathway
2024-May-25, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2024.111016
PMID:38670420
|
研究论文 | 本研究探讨了药用成分leonurine在急性肾损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示了leonurine通过调节ATF4/CHOP/ASCL4信号通路抑制与内质网应激关联的铁死亡 | 未提及该研究的具体局限性 | 研究leonurine对急性肾损伤的益处及其作用机制 | 急性肾损伤模型中的leonurine的治疗效果 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | NA | NA | 组织学数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6322 | 2024-08-04 |
A Galectin-9-Driven CD11chigh Decidual Macrophage Subset Suppresses Uterine Vascular Remodeling in Preeclampsia
2024-May-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了CD11chigh胎盘巨噬细胞亚群在先兆子痫的形成中抑制子宫血管重塑的作用 | 发现了一个独特的CD11chigh dMφ亚群，其通过抑制子宫螺旋动脉重塑发挥作用，并阐明了其与胎盘来源的galectin-9的关系 | 临床实验证据需要进一步验证以确认galectin-9作为预测先兆子痫的生物标志物的有效性 | 探讨CD11chigh dMφ在先兆子痫中的作用及其潜在机制 | 研究对象包括孕妇和小鼠模型，以及相关的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 条件性基因敲除小鼠和一种新的先兆子痫小鼠模型 | 生物样本 | 多个独立的先兆子痫小鼠模型以及一项回顾性先兆子痫队列研究 | NA | NA | NA | NA |
| 6323 | 2024-08-04 |
LINC00330/CCL2 axis-mediated ESCC TAM reprogramming affects tumor progression
2024-May-20, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-024-00592-8
PMID:38769475
|
研究论文 | 本研究探讨了LINC00330/CCL2轴介导的肿瘤相关巨噬细胞（TAM）重编程在食管鳞状细胞癌进展中的作用 | 揭示了LINC00330通过破坏CCL2/CCR2轴和其下游信号通路来抑制ESCC进展的新机制 | 在研究中未提及样本容量和具体的实验设计限制 | 研究LINC00330在ESCC进展中对TAM重编程的影响 | 食管鳞状细胞癌相关的长期非编码RNA和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 转录组测序 | NA | 临床样本和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6324 | 2024-08-05 |
Serglycin secreted by late-stage nucleus pulposus cells is a biomarker of intervertebral disc degeneration
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44313-9
PMID:38167807
|
研究论文 | 本文探讨了晚期髓核细胞分泌的serglycin作为椎间盘退变的生物标志物 | 首次识别了晚期髓核细胞并确认了serglycin如何调节椎间盘退变的潜在机制 | 样本量较小，仅包含三名男性和四名女性 | 研究serglycin在椎间盘退变中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 晚期髓核细胞及其分泌的serglycin | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 七个（男性三名，女性四名） | NA | NA | NA | NA |
| 6325 | 2024-08-04 |
PANoptosis and Autophagy-Related Molecular Signature and Immune Landscape in Ulcerative Colitis: Integrated Analysis and Experimental Validation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S455862
PMID:38800594
|
研究论文 | 本研究调查了与PANoptosis和自噬相关的溃疡性结肠炎(UC)的分子特征和免疫微环境 | 本研究首次识别并验证了与UC相关的PANoptosis和自噬的新分子特征，可能影响免疫失调和伤口愈合 | 研究中对候选基因的验证主要基于小鼠模型，缺乏大规模临床样本支持 | 探讨溃疡性结肠炎中PANoptosis和自噬相关基因的分子特征及免疫微环境 | 溃疡性结肠炎患者及小鼠模型的相关基因和免疫细胞渗透 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了UC数据集GSE206285，验证了小鼠模型中的关键候选基因表达 | NA | NA | NA | NA |
| 6326 | 2024-08-04 |
Peripheral nervous system lymphatic vessels: A simple delivery route to promote nerve regeneration
2024-Jul, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114783
PMID:38688418
|
研究论文 | 本文阐明了周围神经系统淋巴血管的存在及其在神经再生中的作用 | 首次证明了外围神经中的淋巴血管在促进神经再生中的独特运输能力 | 研究主要集中在动物模型上，缺乏临床人类样本的验证 | 探讨周围神经系统淋巴血管在神经再生中的作用及其输送能力 | 使用大鼠、PROX1-EGFP转基因小鼠和人类的周围神经样本 | 数字病理学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 使用了大鼠和转基因小鼠的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6327 | 2024-08-05 |
Characteristics of peripheral blood mononuclear cells and potential related molecular mechanisms in patients with autoimmune hepatitis: a single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun, Medical molecular morphology
IF:1.2Q3
DOI:10.1007/s00795-024-00380-5
PMID:38340154
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性肝炎患者外周血单核细胞的特征及潜在相关分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统性分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特征 | 对免疫细胞群体特征的理解仍然有限，可能没有考虑其他类型的免疫细胞 | 分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特点及其潜在的分子机制 | 来自4名健康对照和4名自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3690个来自健康对照和3511个来自自身免疫性肝炎患者的单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 6328 | 2024-08-05 |
Identifying potential drug targets for keloid: A Mendelian randomization study
2024-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.023
PMID:38797322
|
研究论文 | 本文识别了瘢痕疙瘩的潜在药物靶点 | 通过孟德尔随机化研究发现七种潜在的药物靶点，特别强调了NTM的临床相关性 | 本研究可能受限于样本量和数据库的可用性 | 识别瘢痕疙瘩的药物靶点以改进治疗效果 | 靶向瘢痕疙瘩的七种蛋白质 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析 | NA | 蛋白质数据, scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6329 | 2024-08-04 |
The Identification of RPL4 as a Hub Gene Associated with Goat Litter Size via Weighted Gene Co-Expression Network Analysis
2024-May-15, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14101470
PMID:38791687
|
研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别出与山羊窝重相关的枢纽基因RPL4 | 揭示了RPL4基因在山羊生育能力中的重要作用，为评估山羊窝重提供了生物标志物 | 未提及样本的地理分布和环境影响因素 | 探索与山羊生殖性能相关的标志基因 | 山羊卵母细胞中的基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 卵母细胞数据集GSE136005来自GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 6330 | 2024-08-05 |
Identifying Key Regulatory Genes in Drug Resistance Acquisition: Modeling Pseudotime Trajectories of Breast Cancer Single-Cell Transcriptome
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101884
PMID:38791962
|
研究论文 | 本文提出了一种结合数学建模和伪时间分析的方法，以研究乳腺癌单细胞转录组中的药物耐药性关键调控基因 | 创新点在于使用时间序列scRNA-seq数据和单基因数学模型，识别了约560-680个表现多稳定表达状态的基因 | 对分子系统层面动态细胞转变的理解仍然有限 | 研究药物耐药性获得的关键调控基因 | MCF-7乳腺癌细胞系在他莫昔芬处理下的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 单基因数学模型 | 基因表达数据 | 6000个基因的多个亚群体 | NA | NA | NA | NA |
| 6331 | 2024-08-05 |
Deciphering the Genetic Links between Psychological Stress, Autophagy, and Dermatological Health: Insights from Bioinformatics, Single-Cell Analysis, and Machine Learning in Psoriasis and Anxiety Disorders
2024-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105387
PMID:38791423
|
研究论文 | 本研究探讨了心理压力、自噬相关基因与皮肤健康之间的关系，特别关注银屑病与焦虑障碍的共病机制 | 揭示了银屑病与焦虑障碍之间可能存在的共享生物机制及其潜在生物标志物 | 样本数据来源于GEO数据库，未具体提及样本的多样性和数据的全面性 | 探索银屑病与焦虑障碍之间的共病机制 | 银屑病与焦虑障碍相关的数据和基因 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 未具体提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6332 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
|
研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能，机器学习，单细胞测序，空间分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6333 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
|
研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道，用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准，并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中，所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 | NA | NA | NA | NA |
| 6334 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类，强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型，并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 6335 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
|
研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台，以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞，约600种代谢物 | NA | NA | NA | NA |
| 6336 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6337 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
|
研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器，以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据，生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6338 | 2024-08-05 |
Immunological Characteristics of Hepatic Dendritic Cells in Patients and Mouse Model with Liver Echinococcus multilocularis Infection
2024-Apr-25, Tropical medicine and infectious disease
IF:2.8Q1
DOI:10.3390/tropicalmed9050095
PMID:38787028
|
研究论文 | 本文探讨了肝脏包虫感染患者和小鼠模型中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 首次系统分析了肝脏树突状细胞亚群在肝脏包虫感染中表现出的免疫表型特征 | 未深入探讨不同小鼠模型对免疫特征的影响 | 研究肝脏包虫感染微环境中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 临床包虫感染患者和小鼠模型中的肝脏树突状细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 组织样本 | 四个包虫感染患者标本和感染小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6339 | 2024-08-04 |
Dysregulation of peripheral and intratumoral KLRG1+ CD8+T cells is associated with immune evasion in patients with non-small-cell lung cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101968
PMID:38713923
|
研究论文 | 本研究探讨了KLRG1+ CD8+ T细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的免疫逃避中的作用 | 本研究首次揭示KLRG1+ CD8+ T细胞与NSCLC肿瘤免疫逃避的关联性，并提出KLRG1作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究中可能缺乏大规模样本数据来验证KLRG1的预后价值 | 研究KLRG1在非小细胞肺癌患者中的免疫调节作用 | 非小细胞肺癌患者的外周血和肿瘤组织中的KLRG1+ CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，细胞单一测序数据 | NSCLC患者与健康供体、良性肺结节患者的对比样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6340 | 2024-08-05 |
MAPKAP1 orchestrates macrophage polarization and lipid metabolism in fatty liver-enhanced colorectal cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101941
PMID:38692197
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪肝在大肠癌进展中的机械作用，重点关注巨噬细胞极化和脂质代谢。 | 发现MAPKAP1是通过M2巨噬细胞极化和脂质代谢重编程促进大肠癌的重要基因。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性。 | 研究脂肪肝如何影响大肠癌的进展，特别是在巨噬细胞极化和脂质代谢方面。 | 使用小鼠脂肪肝模型以及大肠癌特异性基因MAPKAP1进行研究。 | 数字病理学 | 大肠癌 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | NA | 小鼠模型，样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |