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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6281 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics and Mendelian randomization reveal LUCAT1's role in right-sided colorectal cancer risk
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1357704
PMID:38711918
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研究论文 | 这项研究探讨了单细胞转录组学和孟德尔随机化对右侧结直肠癌风险中LUCAT1作用的研究 | 确认了LUCAT1与右侧结直肠癌风险之间的潜在因果关系 | 未提及限制性因素 | 研究右侧结直肠癌的病理机制 | 对左侧和右侧结直肠癌的细胞级差异进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 孟德尔随机化 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6282 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415915
PMID:38715603
|
更正 | 这篇文章更正了之前的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6283 | 2024-08-05 |
Unveiling novel insights in acute myeloid leukemia through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1365330
PMID:38711849
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病中的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术洞察了急性髓系白血病的复杂性和异质性,以及AML细胞与免疫细胞和骨髓微环境之间的相互作用 | 文章强调了单细胞RNA测序在急性髓系白血病领域的当前局限性和未来方向 | 研究急性髓系白血病的病理机制和治疗潜力 | 急性髓系白血病细胞及其微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6284 | 2024-08-04 |
A contrastive learning approach to integrate spatial transcriptomics and histological images
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.039
PMID:38707535
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的模型ConGcR,用于整合基因表达、空间位置和组织形态数据,以进行数据表征和空间组织结构识别 | 本研究创新性地提出了ConGcR模型,结合图卷积和ResNet编码器,增强了空间嵌入表示的建模能力 | 未提及具体限制 | 本研究旨在提高组织架构识别的准确性,并为空间转录组分析任务提供有效的数据表征 | 研究对象包括16个人脑、4只鸡心、8个乳腺肿瘤和30个来自人类肺部的空间转录组样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组技术 | 对比学习模型 | 基因表达、空间位置、组织图像 | 共58个样本,包括16个人脑、4只鸡心、8个乳腺肿瘤和30个人肺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6285 | 2024-08-04 |
Hybrid sequence-based analysis reveals the distribution of bacterial species and genes in the oral microbiome at a high resolution
2024-Jul, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2024.101717
PMID:38708423
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研究论文 | 本研究利用无培养分析技术识别口腔微生物组中的细菌种类和基因分布 | 采用细菌单细胞基因组测序等先进技术,实现了对口腔微生物的高分辨率分析 | 样本中约80%为非细菌源DNA,可能影响细菌种类的识别 | 旨在识别口腔微生物组中的细菌种类并研究其基因分布 | 研究对象为来自同一个体的唾液样本 | 数字病理学 | NA | 细菌单细胞基因组测序, 16S rRNA测序, 大规模全基因组测序 | NA | 基因组序列 | 48个井的样本中,非活性样本为43个,活性样本为45个 | NA | NA | NA | NA |
| 6286 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to elucidate the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and cancer cells in hepatocellular carcinoma with spleen-deficiency syndrome
2024-May, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2023.11.008
PMID:38707923
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌(HCC)合并脾虚综合征(SDS)中癌症相关成纤维细胞(CAFs)与癌细胞之间的相互作用 | 揭示了CAFs与癌细胞之间的交互在SDS中促进肿瘤发展,并确认了PDGF信号通路在此过程中的重要作用 | 本研究主要基于小鼠模型,临床应用和人类数据的验证需进一步研究 | 研究脾虚综合征下肝细胞癌中细胞间的相互作用 | 主要研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学与空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 建立了以HCC-SDS小鼠为模型共29个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 6287 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals 2D cytokine assay can model atopic dermatitis more accurately than immune-competent 3D setup
2024-May, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15077
PMID:38711200
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研究论文 | 本研究探讨了不同体外模型对特应性皮炎(AD)模拟的准确性。 | 首次使用单细胞RNA测序数据比较了2D和3D细胞培养在模拟AD方面的效果。 | 未能研究Th2细胞对模型AD的影响,且仅基于特定细胞类型的研究,结果可能有限。 | 理解特应性皮炎的病理生理,并识别新的治疗方法。 | 使用原代成纤维细胞和角质形成细胞进行的体外模型实验。 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 2D/3D细胞培养 | 基因表达数据 | 使用来自临床研究的皮肤活检的单细胞RNA测序数据和健康与AD供体的已发布数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6288 | 2024-08-04 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究探讨了在乙酰氨基酚诱导的肝损伤中,髓系Mas信号通路对细胞间病理性交互的调节作用 | 首次揭示了髓系Mas在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用,提供了细胞间相互作用的新视角 | 未明确Mas在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制和细分功能 | 研究髓系Mas信号通路在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用 | MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和动态观测成像 | NA | 生物样本 | 来自急性肝衰竭患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6289 | 2024-08-05 |
Identification of a distinct cluster of GDF15high macrophages induced by in vitro differentiation exhibiting anti-inflammatory activities
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309739
PMID:38655264
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研究论文 | 本文研究了在体外分化中诱导的GDF15high巨噬细胞的特征及其抗炎活性 | 本研究首次识别出一种GDF15high巨噬细胞亚群,并揭示其独特的分子特征和抗炎功能 | 无法排除体外诱导协议对GDF15high巨噬细胞抗炎表型的影响 | 探讨GDF15high巨噬细胞的身份及其在炎症反应中的角色 | 来源于人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞的GDF15high巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | 约1%的人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞中带有GDF15high表型的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6290 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1418495
PMID:38711509
|
更正 | 这篇文章是对先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6291 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the retina shows that LDHA regulates pathogenesis of autoimmune uveitis
2024-02, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103160
PMID:38160538
|
研究论文 | 本文研究了LDHA在自身免疫性葡萄膜炎中对病理发生的调节作用 | 研究发现LDHA的抑制可以恢复炎症下T效应细胞和T调节细胞的不平衡,并揭示了其在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 未提及具体的临床数据或者长期观察结果 | 旨在揭示自身免疫性葡萄膜炎中视网膜损伤的细胞动态和致病机制 | 实验自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 实验中使用了自身免疫性葡萄膜炎小鼠和人类患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6292 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals a pathogenic role of cytotoxic CD4+ T cells in giant cell arteritis
2024-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103124
PMID:37952293
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研究论文 | 本研究揭示了细胞毒性CD4+ T细胞在巨细胞动脉炎中的致病作用 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析深入探讨了CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的作用 | 研究可能受到样本大小限制,仅包括八名巨细胞动脉炎患者和八名健康对照 | 进一步阐明CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的角色 | 114,799个循环CD4 T细胞来源于活动性和缓解期的巨细胞动脉炎患者与健康对照 | 数字病理学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析 | NA | 细胞数据 | 114,799个CD4 T细胞,来自8名巨细胞动脉炎患者和8名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 6293 | 2024-08-05 |
Deciphering Müller cell heterogeneity signatures in diabetic retinopathy across species: an integrative single-cell analysis
2024-May-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01847-y
PMID:38698486
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析阐明了糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的复杂特征 | 首次揭示了不同物种中穆勒细胞的异质性及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 未明确提到该研究的局限性 | 深入理解糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的细胞机制 | 糖尿病视网膜病变中的穆勒细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了斯普拉吉-道利大鼠模型和人类患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6294 | 2024-08-04 |
A cuproptosis-related signature predicts prognosis and indicates cross-talk with immunocyte in ovarian cancer
2024-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00981-7
PMID:38696071
|
研究论文 | 本文构建了一个新的与铜死亡相关的基因特征,具有良好的预后能力,以评估卵巢癌患者的结果 | 建立了与铜死亡相关的预后模型,并发现了其与免疫细胞的交互作用和化疗反应的关系 | 本研究主要依赖于TCGA和GEO数据库,可能存在数据偏差问题 | 研究铜死亡与卵巢癌进展之间的关系 | 卵巢癌患者的基因组数据和细胞实验 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因组数据 | TCGA中583名卵巢癌患者和GEO中260名卵巢癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6295 | 2024-08-05 |
Development of an Automated Morphometric Approach to Assess Vascular Outcomes following Exposure to Environmental Chemicals in Zebrafish
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13214
PMID:38701112
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研究论文 | 本文开发了一种自动化形态度量方法来评估环境化学物质对血管的影响 | 提出了一个基于深度学习的定量框架ECA-ResXUnet,用于自动分割血管网和提取特征 | 对环境化学物质对血管的影响研究还不够全面 | 研究环境化学物质对血管形态的影响并开发评估方法 | Tg(fli1a:eGFP)斑马鱼胚胎作为实验对象 | 数字病理学 | NA | 高含量成像平台和单细胞RNA测序 | ECA-ResXUnet | 图像 | 对150种环境化学物质处理的斑马鱼幼体进行了评估 | NA | NA | NA | NA |
| 6296 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation
2024-May-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01000-5
PMID:38691253
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研究论文 | 本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色 | IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关,且可能作为新的治疗靶点 | 研究主要依赖于现有数据库,可能存在数据偏差 | 探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系 | IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用 | 数字病理学 | 肿瘤相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6297 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms underlying the therapeutic effects of Linggui Zhugan decoction in stroke: Insights from network pharmacology and single-cell transcriptomics analysis
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037482
PMID:38552092
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研究论文 | 本研究探讨了灵桂治肝汤在中风治疗中的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞转录组分析揭示灵桂治肝汤的关键成分、靶点和通路 | 尚未完全阐明其疗效的具体分子机制 | 研究灵桂治肝汤在中风治疗中的分子机制 | 主要研究灵桂治肝汤的活性成分及其靶点 | 数字病理学 | 中风 | 网络药理学和单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据 | 144个潜在靶点与2035个中风相关基因的交集分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6298 | 2024-08-04 |
Mechanistic insights into FEN1-mediated drug sensitivity and risk signature in colon cancer: An integrative bioinformatics study
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037517
PMID:38552056
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研究论文 | 本研究探讨了FEN1在结肠癌中的表达及其与临床病理和预后的关系 | 提出了一个由FEN1导出的多基因预后风险标志,并揭示了FEN1表达水平与结肠癌转移潜力及药物敏感性之间的相互作用 | FEN1表达与预后的明显相关性未能得到确认 | 深入探讨FEN1在结肠癌中的作用,尤其是在药物敏感性和预后方面 | 结肠癌患者的FEN1表达及其与转移的关系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序,基因集富集分析,Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus的多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6299 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals comprehensive microenvironment and highlights the dysfuntional state of NK cells in endometrioid carcinoma
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037555
PMID:38552055
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了子宫内膜样癌(EEC)中的肿瘤微环境,重点是自然杀伤(NK)细胞的功能异常状态 | 发现了一种CD56dim_DNAJB1 NK细胞亚群,其具有低细胞毒性和高压力水平,显示出NK细胞在肿瘤微环境中的功能失调 | NA | 更好地理解EEC中的肿瘤微环境的多样性 | 21个样本,包括16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织,特别关注肿瘤浸润的NK细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 21个样本(16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织) | NA | NA | NA | NA |
| 6300 | 2024-08-04 |
Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer
2024-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216881
PMID:38614384
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研究论文 | 本研究建立了一种非侵入性方法,通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌 | 该研究开发了一种基于质谱的程序,筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板,并表现出高准确性 | 未提及具体的局限性 | 旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测 | 研究对象为314个呼吸样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱 | 集成学习 | 呼吸样本 | 314个呼吸样本 | NA | NA | NA | NA |