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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 6261 - 6280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6261 | 2024-08-07 |
PRPF19 could serve as a prognostic biomarker for patients with bladder cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-May, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.01.064
PMID:38245411
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6262 | 2024-08-05 |
DNA G-Quadruplex in NRP1 Promoter Facilitates SARS-CoV-2 Infection
2024-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084422
PMID:38674009
|
研究论文 | 本文探讨了DNA G-四链体在NRP1启动子中的作用如何促进SARS-CoV-2感染。 | 揭示了G-四链体在SARS-CoV-2感染中的新机制，以及其对NRP1表达和病毒进入细胞的重要性。 | 未详细讨论G-四链体干预的潜在效果及其在不同细胞类型中的普适性。 | 研究G-四链体在宿主因子NRP1启动子中的作用及其对SARS-CoV-2感染的影响。 | 重点研究NRP1启动子中的G-四链体，并分析其对SARS-CoV-2感染的促进作用。 | 数字病理学 | NA | 生物信息学、生化分析和生物学测定 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从人类支气管上皮细胞中获得的模拟SARS-CoV-2感染的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6263 | 2024-08-04 |
Upregulation of EMR1 (ADGRE1) by Tumor-Associated Macrophages Promotes Colon Cancer Progression by Activating the JAK2/STAT1,3 Signaling Pathway in Tumor Cells
2024-Apr-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084388
PMID:38673975
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞如何通过激活JAK2/STAT1,3信号通路促进结肠癌的进展。 | 揭示了EMR1在结肠癌中的作用及其与巨噬细胞的信号相互作用的机制。 | 此研究未探讨其他可能的信号通路对结肠癌进展的影响。 | 研究EMR1及其与巨噬细胞的信号相互作用在结肠癌进展中的作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞和结肠癌细胞。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | pT3微卫星不稳定结肠癌组织 | NA | NA | NA | NA |
| 6264 | 2024-08-05 |
Unified cross-modality integration and analysis of T cell receptors and T cell transcriptomes by low-resource-aware representation learning
2024-May-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100553
PMID:38688285
|
研究论文 | 提出了UniTCR，一个新的低资源感知的多模态表示学习框架，用于统一跨模态集成。 | 该框架设计了双模态对比学习模块和单模态保留模块，有效地将每种模态嵌入共同的潜在空间。 | 未提及具体的限制条件 | 研究T细胞异质性，通过跨模态数据的整合推动免疫学研究。 | 研究对象为T细胞受体和T细胞转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和T细胞受体测序(TCR-seq) | 对比学习 | 多模态数据 | 多个配对的scRNA-seq/TCR-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6265 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals distinct immune cell features in cutaneous lesions of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid
2024-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110219
PMID:38631594
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了天疱疮和大疱性类天疱疮皮肤损伤中的免疫细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞VDJ测序详细分析了BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞组成和状态 | 对皮肤损伤中的免疫特征的认识仍然有限，可能需要更大的样本量和其他生物标志物的验证 | 探究BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞特征和转录谱 | 大疱性类天疱疮和天疱疮患者的皮肤病变 | 数字病理学 | 大疱性类天疱疮，天疱疮 | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ测序 | NA | 细胞转录组数据 | 涉及BP和PV患者的皮肤损伤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6266 | 2024-08-04 |
Cell-mediated cytotoxicity within CSF and brain parenchyma in spinal muscular atrophy unaltered by nusinersen treatment
2024-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48195-3
PMID:38750052
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研究论文 | 这篇文章探讨了在脊髓性肌萎缩症(SMA)中细胞介导的细胞毒性及首个抗体nusinersen治疗的影响 | 该研究首次通过单细胞转录组学揭示了SMA患者脑脊液中的NK细胞和CD8+ T细胞扩张以及与疾病相关的细胞毒性特征 | 样本数量较小，且未能在nusinersen治疗后观察到具体的免疫反应变化 | 本研究旨在探索脊髓性肌萎缩症中的局部免疫反应及其对nusinersen治疗的影响 | 研究对象包括SMA患者和对照组的脑脊液样本 | 自然语言处理 | 脊髓性肌萎缩症 | 单细胞转录组学，多重免疫组织化学 | NA | 脑脊液样本 | SMA: N = 9 对照组: N = 9 | NA | NA | NA | NA |
| 6267 | 2024-08-05 |
Machine-learning developed an iron, copper, and sulfur-metabolism associated signature predicts lung adenocarcinoma prognosis and therapy response
2024-May-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02839-6
PMID:38745285
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研究论文 | 本研究提出了一个与铁、铜和硫代谢相关的特征，可以预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次将铁、铜和硫代谢相关基因结合在一起，构建预后特征，填补了以往研究的空白 | 未提及其他潜在影响因素和机制的详细探讨 | 探讨铁、铜和硫代谢在肺腺癌中的作用，并开发相关预后指标 | 1564名肺腺癌患者及1249名非小细胞肺癌(NCSLC)患者 | 机器学习 | 肺癌 | 机器学习方法 | 无监督集群分析 | 基因组数据 | 1564名肺腺癌患者、1249名非小细胞肺癌患者以及超过1万名其他癌症类型患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6268 | 2024-08-05 |
Multi-omics integration of scRNA-seq time series data predicts new intervention points for Parkinson's disease
2024-05-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61844-3
PMID:38744869
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研究论文 | 该研究通过分析时间序列的scRNA-seq数据揭示了帕金森病早期发展的新干预点 | 提出了一种基于非负矩阵三因子分解的新数据整合方法，整合不同的数据集与分子相互作用网络 | 研究主要依赖于文献支持的基因，未涵盖所有可能的PD相关基因 | 揭示帕金森病早期发展的关键基因和分子机制 | 来自患者来源的诱导多能干细胞分化获得的中脑多巴胺能神经元的时间序列scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 帕金森病 | scRNA-seq | 非负矩阵三因子分解 | 基因表达数据 | 涉及来自患者的诱导多能干细胞分化的中脑多巴胺能神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6269 | 2024-08-04 |
Exploring the immune escape mechanisms in gastric cancer patients based on the deep AI algorithms and single-cell sequencing analysis
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18379
PMID:38752750
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研究论文 | 本研究旨在开发胃癌患者的预后模型，并探讨免疫逃逸机制 | 通过深度机器学习和单细胞测序分析，利用101种算法构建了预测模型，并识别了潜在靶向药物 | 尚未提及具体的研究限制 | 提升胃癌患者的临床管理和个性化治疗 | 胃癌患者及其免疫逃逸机制 | 计算机视觉 | 胃癌 | 单细胞测序分析 | 深度机器学习 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6270 | 2024-08-05 |
Single-cell atlas reveals the immunosuppressive microenvironment and Treg cells landscapes in recurrent Glioblastoma
2024-May, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00740-4
PMID:38429367
|
研究论文 | 本研究揭示了复发性胶质母细胞瘤的免疫抑制性微环境及调节性T细胞的分布 | 首次在单细胞水平上分析复发性胶质母细胞瘤与脑脊液的免疫微环境，并发现S100A9作为潜在生物标志物 | 样本量较小，仅包含来自两名患者的四个临床样本 | 揭示复发性胶质母细胞瘤的免疫微环境及潜在脑脊液生物标志物 | 复发性胶质母细胞瘤与非恶性脑肿瘤患者的临床样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床样本 | 四个临床样本，来自两名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6271 | 2024-08-05 |
Immunoregulatory and neutrophil-like monocyte subsets with distinct single-cell transcriptomic signatures emerge following brain injury
2024-Feb-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03032-8
PMID:38310257
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研究论文 | 本研究揭示了脑损伤后单核细胞亚群的免疫调节特性及其单细胞转录组特征 | 首次表明创伤导致特定CD115/Ly6C单核细胞群体的释放，并与神经保护相关 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床应用需要进一步验证 | 探索脑损伤后单核细胞的免疫反应和潜在的神经保护机制 | 小鼠模型中观察到的单核细胞亚群及其转录组特征 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中观察的单核细胞数目未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6272 | 2024-08-04 |
Reconstructing developmental trajectories using latent dynamical systems and time-resolved transcriptomics
2024-May-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.04.004
PMID:38754365
|
研究论文 | 本文提出了一种新框架，以克服单细胞转录组学在研究细胞命运决策动态性方面的挑战 | 引入了sci-FATE2优化的代谢标记方法和两个阶段的动态建模框架VelvetVAE和VelvetSDE，显著提高了数据质量和动态建模能力 | 目前的方法在时间分辨率和数据质量方面仍存在一定限制 | 研究细胞在发育过程中的命运决策动态性 | 45,000个分化成神经管身份的胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 代谢标记 | 变分自编码器(VAE)和神经随机微分方程(nSDE) | 转录组数据 | 45,000个胚胎干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6273 | 2024-08-04 |
Single-Cell Multi-Omics Map of Cell Type-Specific Mechanistic Drivers of Multiple Sclerosis Lesions
2024-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200213
PMID:38564686
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研究论文 | 该文章探讨了多发性硬化损伤的细胞类型特异性机制驱动因素 | 首次使用单细胞多组学技术揭示了多发性硬化特异性少突胶质细胞遗传特征及其与铁摄取信号的关联 | 研究样本数量较少，仅涉及6名多发性硬化患者和3名非神经病对照 | 研究多发性硬化中的细胞动态及其在病变中的作用 | 使用来自6名渐进性多发性硬化患者的脑白质损伤样本 | 数字病理学 | 多发性硬化 | 单核RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 9个病变样本和3个对照样本来自6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6274 | 2024-08-05 |
Generation of complex bone marrow organoids from human induced pluripotent stem cells
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02172-2
PMID:38374263
|
研究论文 | 本文展示了一种从人类诱导多能干细胞生成复杂骨髓类器官的方法 | 创新之处在于生成了模拟人类骨髓微环境的复杂三维骨髓类器官 | 没有提到具体的局限性 | 研究与人类骨髓微环境相关的造血发展和疾病 | 从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了从人类诱导多能干细胞生成的骨髓类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 6275 | 2024-08-05 |
sciCSR infers B cell state transition and predicts class-switch recombination dynamics using single-cell transcriptomic data
2024-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02060-1
PMID:37932398
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研究论文 | 本文介绍了sciCSR，一个分析B细胞类转变和动态的计算管道 | sciCSR能够利用单细胞RNA测序数据分析类转变事件，并构建马尔可夫状态模型推断CSR的动态和方向 | 未提及具体限制 | 分析B细胞成熟过程中类转变重组的动态 | 采用单细胞RNA测序数据，研究B细胞的类转变和动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 马尔可夫状态模型 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 6276 | 2024-08-05 |
ENO1 promotes trophoblast invasion regulated by E2F8 in recurrent miscarriage
2024-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302032RR
PMID:38661062
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研究论文 | 本研究探讨了ENO1在复发性流产中通过E2F8调控滋养层细胞侵袭的机制 | 发现ENO1通过E2F8依赖性方式促进滋养层细胞侵袭，为复发性流产的生理机制提供了潜在的新靶点 | 研究主要基于基因表达分析，缺乏临床样本验证和长期跟踪研究 | 探索复发性流产的机制及其与滋养层细胞功能障碍的关系 | 主要研究复发性流产中的外滋养层细胞（EVTs）及其相关基因 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA测序, 免疫荧光检测, 西方印迹, 染色质免疫沉淀(ChIP), 实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR), 透析实验 | NA | 基因表达数据 | 1724个差异表达基因的分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6277 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of juvenile idiopathic arthritis patients' immune characteristics based on bulk and single-cell sequencing data
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1359235
PMID:38751447
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研究论文 | 本研究基于大规模和单细胞测序数据，综合分析了青少年特发性关节炎（JIA）患者的免疫特征 | 该研究揭示了JIA患者在T细胞受体和B细胞受体谱的克隆性和多样性方面的显著差异，并识别出特定的V基因和J基因，扩展了对JIA的理解 | 本研究未深入探讨JIA的所有分子机制，尚需更多研究验证相关发现 | 研究青少年特发性关节炎（JIA）患者的免疫特征及其潜在的免疫治疗策略 | 青少年特发性关节炎（JIA）患者及健康对照组 | 数字病理学 | 青少年特发性关节炎 | Bulk RNA-seq和单细胞RNA分析 | NA | RNA序列数据 | JIA患者和健康对照组的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6278 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of vestibular schwannoma reveals functionally distinct macrophage subsets
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02646-2
PMID:38480935
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研究论文 | 本研究分析了前庭神经瘤中功能上不同的巨噬细胞亚群 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了前庭神经瘤中巨噬细胞的三种不同亚群及其基因表达特征 | 样本量较小，仅分析了三例前庭神经瘤样本，可能影响结果的广泛性 | 评估前庭神经瘤中巨噬细胞的表型和功能特征 | 前庭神经瘤样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三例前庭神经瘤样本和十例前庭神经瘤样本的RT-qPCR分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6279 | 2024-08-05 |
MUFFIN: a suite of tools for the analysis of functional sequencing data
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae051
PMID:38745992
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研究论文 | MUFFIN是一个用于分析功能测序数据的Python工具包 | MUFFIN提供了广泛的工具，填补了Python生态系统中缺失的功能，特别是针对非编码区域的分析 | 文章未详细讨论MUFFIN在处理特定种类样本时的局限性 | 开发一个适用于多种基因组测序分析的工具包 | 针对scRNA-seq、ChIP-seq和ATAC-seq数据集进行建模和分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 测序数据 | 三个不同的scRNA-seq、ChIP-seq和ATAC-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6280 | 2024-08-05 |
The Treatment of Refractory Vitiligo With Autologous Cultured Epithelium Grafting: A Real-World Retrospective Cohort Study
2024-May-14, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szae009
PMID:38513284
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研究论文 | 本研究评估了一种改良自体培养上皮移植技术在治疗难治性白癜风中的效果 | 提出了一种改良的自体培养上皮移植技术，并首次在大规模真实世界患者中应用 | 本研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏倚 | 评估自体培养上皮移植在白癜风治疗中的有效性和影响因素 | 726名接受自体培养上皮移植（ACEG）治疗的白癜风患者 | 数字病理学 | 白癜风 | 自体培养上皮移植（ACEG） | 广义线性混合模型 | 临床数据 | 726名白癜风患者 | NA | NA | NA | NA |