单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 6241 - 6260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6241 | 2024-08-04 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和空间转录组学，识别慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的配体-受体相互作用 | 创建了一个整合分析框架，以更全面地分析在慢性肾病和MASH中的细胞特异性配体-受体相互作用 | 研究主要基于两个人体群体的数据，可能存在样本偏倚 | 探索慢性肾病和MASH中细胞特异性配体-受体相互作用的分子机制 | 主要研究细胞之间的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 两个可用的人体队列 | NA | NA | NA | NA |
| 6242 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome revealed dysregulated RNA-binding protein expression patterns and functions in human ankylosing spondylitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1369341
PMID:38770048
|
研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎（AS）不同免疫细胞类型中 RNA 结合蛋白（RBP）的表达特征和调控模式。 | 揭示了 AS 患者不同免疫细胞中 RBP 的特定表达特点及其在病理过程中的关键作用。 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 研究 RBPs 在强直性脊柱炎发生和发展中的潜在关键作用。 | 研究对象为健康对照组（HC）和强直性脊柱炎（AS）患者的外周血单核细胞（PBMC）样本。 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | scRNA-seq 和大规模 RNA-seq | NA | RNA 数据 | HC 29 例，AS 10 例，此外还有 NC 3 例，AS 5 例 | NA | NA | NA | NA |
| 6243 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing to Identify an Immunogenic Cell Death-Related 5-Gene Prognostic Signature in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S449419
PMID:38770169
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，识别出与免疫原性细胞死亡相关的5基因预后标志在肝细胞癌中的应用 | 提出了一种新的预后模型，基于免疫原性细胞死亡相关基因的表达来评估HCC患者对免疫治疗的敏感性 | 研究可能受到样本数量和来源的限制，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨免疫原性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用及其与预后的关系 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境中的细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了肝细胞癌样本及细胞系进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6244 | 2024-08-04 |
NTCdb: Single-cell transcriptome database of human inflammatory-associated diseases
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.057
PMID:38765608
|
研究论文 | 提出了一个人类炎症相关疾病的单细胞转录组数据库NTCdb | 集成了来自17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞的开放数据，填补了关于免疫细胞数据的空白 | 目前数据库可能仍缺乏广泛的临床样本或特定疾病的细胞数据 | 建立一个关于炎症相关疾病的单细胞转录组数据库，以支持疾病机制的研究 | 单细胞转录组数据，特别是来自炎症相关疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 来源于17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6245 | 2024-08-05 |
Integration of multiomics analyses reveals unique insights into CD24-mediated immunosuppressive tumor microenvironment of breast cancer
2024-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01882-9
PMID:38622285
|
研究论文 | 本研究揭示了CD24介导的乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的独特见解 | 使用多组学分析方法深入探索了CD24与免疫细胞的相互作用及其对预后模型的影响 | 未探讨所有可能的免疫标志物，可能限制了研究的全面性 | 探讨CD24在乳腺癌中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | CD24相关基因及其与免疫细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq和MQIF | 机器学习预后模型 | 基因表达数据 | 基于 bulk RNA-seq 数据构建的风险模型包含1488个差异基因 | NA | NA | NA | NA |
| 6246 | 2024-08-04 |
IGF2BP3 promotes glutamine metabolism of endometriosis by interacting with UCA1 to enhances the mRNA stability of GLS1
2024-May-17, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00834-7
PMID:38760723
|
研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP3在内膜异位症中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了IGF2BP3与UCA1相互作用并增强GLS1 mRNA稳定性对谷氨酰胺代谢的影响。 | 该研究主要在体外和小动物模型中进行，可能无法完全反映人类病理特征。 | 研究IGF2BP3对内膜异位症发生和发展的影响及其分子机制。 | 内异症相关的间质细胞及其谷氨酰胺代谢的相关过程。 | 数字病理学 | 内膜异位症 | RNA免疫沉淀、RNA拉下实验、荧光原位杂交、单细胞空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 异位内膜病变与正常内膜组织的比较分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6247 | 2024-08-05 |
Four centrosome-related genes to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with colon cancer
2024-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i5.1908
PMID:38764831
|
研究论文 | 本研究探索了中心体相关基因在结肠癌中的作用。 | 构建了一个由四个基因组成的中心体相关预后特征，能够准确预测结肠癌患者的预后。 | 未详细说明研究的限制因素。 | 研究中心体相关基因在结肠癌中的作用及其对预后的预测能力。 | 结肠癌患者及其相关的中心体相关基因。 | 生物信息学 | 结肠癌 | 生物信息学分析 | Cox回归模型 | 基因组数据 | 726个中心体相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 6248 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-sequencing data reveal molecular subtypes based on lactylation-related genes and prognosis and therapeutic response in glioma
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30726
PMID:38765164
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸化在胶质瘤中的作用，建立了基于乳酸化相关基因的分子亚型和预后模型 | 首次结合单细胞和散装RNA测序数据，识别出基于乳酸化相关基因的胶质瘤分子亚型及其预后关联 | 本研究的数据主要来源于公共数据库，可能存在样本偏差及外部验证缺乏的问题 | 研究乳酸化在胶质瘤中的作用，识别分子亚型及其预后意义 | 胶质瘤患者，重点关注乳酸化相关基因的表达与生存预测 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6249 | 2024-08-05 |
Identifying the miRNA-gene networks contributes to exploring paravertebral muscle degeneration's underlying pathogenesis and therapy strategy
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30517
PMID:38765163
|
研究论文 | 本研究探讨了与脊椎旁肌肉退化相关的miRNA-基因网络及其潜在病理机制和治疗策略 | 通过构建miRNA-基因网络，揭示了脊椎旁肌肉退化的病理过程，提供了新的诊断和治疗方法 | 尚未详尽说明miRNA-mRNA之间具体的调控机制 | 探索脊椎旁肌肉退化的病理机制与治疗策略 | 聚焦于脊椎旁肌肉退化与低背痛的关系 | 数字病理学 | 低背痛 | RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及多个免疫细胞及76个差异表达基因和106个差异表达miRNA | NA | NA | NA | NA |
| 6250 | 2024-08-04 |
A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01687-w
PMID:38627596
|
研究论文 | 本研究生成了小鼠胆汁淤积损伤和修复过程中的高分辨率时空基因表达图谱 | 结合空间增强分辨率组学测序和单细胞转录组学，揭示了胆管细胞驱动信号在损伤-修复反应中的关键作用 | 没有明确提到本研究的具体局限性 | 探索胆汁淤积损伤中细胞动态和分子机制，以期为胆道疾病的发展提供治疗途径 | 小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 空间增强分辨率组学测序，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中进行的实验，具体样本数量未给出 | NA | NA | NA | NA |
| 6251 | 2024-08-05 |
Single-cell mtDNA dynamics in tumors is driven by coregulation of nuclear and mitochondrial genomes
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01724-8
PMID:38741018
|
研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤中细胞间线粒体DNA (mtDNA) 副本数量和基因型的变化及其表型和演化后果 | 采用无扩增的单细胞全基因组测序技术，揭示了mtDNA和nuDNA之间的共同调控关系 | 研究主要集中于细胞系和患者衍生的异种移植模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究肿瘤中mtDNA副本数量的变异及其与细胞大小的关系 | 从来自永生细胞系、患者衍生异种移植和原发人类肿瘤的72,275个单细胞中进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组测序（DLP+） | NA | 基因组数据 | 72,275个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6252 | 2024-08-04 |
A transcriptomics-based RNAi screen for regulators of meiosis and early stages of oocyte development in Drosophila melanogaster
2024-04-03, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkae028
PMID:38333961
|
研究论文 | 该研究通过转录组学方法识别果蝇卵巢中与减数分裂和早期卵母细胞发育相关的调控基因 | 采用转录组学分析结合已发表的单细胞RNA-seq数据，找到2743个共表达基因，其中许多与减数分裂和卵母细胞发育相关 | 研究主要集中在已知的基因上，可能忽略了其他未被充分阐明的基因的功能 | 识别早期卵母细胞发育和减数分裂中涉及的基因 | 以果蝇卵巢为对象，分析早期发育过程中的基因表达与功能 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 分析了3个已发表的单细胞RNA-seq数据集，共测试了526条RNAi线路 | NA | NA | NA | NA |
| 6253 | 2024-08-05 |
State transition and intercellular communication of synovial fibroblasts in response to chronic and acute shoulder injuries unveiled by single-cell transcriptomic analyses
2024-01, Connective tissue research
IF:2.8Q1
DOI:10.1080/03008207.2023.2295322
PMID:38090785
|
研究论文 | 本研究揭示了滑膜成纤维细胞在慢性与急性肩部损伤反应中的状态转变和细胞间通讯的异质性 | 首次利用单细胞转录组学分析揭示了肩部滑膜成纤维细胞的异质性及其细胞状态转变的潜力 | 研究未明确提及样本的具体来源及数量限制 | 探讨滑膜成纤维细胞的异质性及其在细胞状态转变中的潜力 | 滑膜成纤维细胞及其在肩部慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折中的作用 | 数字病理学 | 肩部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6254 | 2024-08-04 |
Evaluation of novel promoters for vascular tissue-specific gene expression in Populus
2024-Jul, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112083
PMID:38588982
|
研究论文 | 该研究评估了用于水分组织特异性基因表达的新型启动子 | 首次识别了三种特定于水分组织的基因并克隆了其启动子，促进了森林树木的精准育种 | 研究只集中于三种特定基因的启动子，未涉猎其他可能影响基因表达的因素 | 开发针对森林树木的特定启动子以实现精准设计和育种 | 三种在杨树中水分组织特异性表达的基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 涉及'84K'杨树的三个基因启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 6255 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell transcriptome and T cell receptor profiling reveals defects of T cell exhaustion in pulmonary tuberculosis
2024-Jun, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2024.106158
PMID:38642678
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和T细胞受体分析揭示了肺结核中T细胞耗竭的缺陷。 | 首次探索了肺结核中T细胞耗竭的功能障碍，并揭示了CD8+ T细胞的耗竭水平显著降低。 | 未能完全明确慢性炎症的性质和免疫抑制细胞的特定作用 | 探讨肺结核中T细胞耗竭的功能障碍及其可能的影響 | 研究了肺结核患者中的T细胞耗竭响应与免疫抑制细胞 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6256 | 2024-08-04 |
High-throughput mechanical phenotyping and transcriptomics of single cells
2024-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48088-5
PMID:38760380
|
研究论文 | 本文描述了一种基于电穿孔的细胞表面张力和转录组学的方法ELASTomics | ELASTomics结合了细胞机械表征与转录组筛选，提供了前所未有的单细胞分辨率 | NA | 研究细胞表面机械特性与转录调控的关系 | 癌细胞系及来自小鼠造血祖细胞的细胞谱系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 电穿孔 | NA | 转录组数据 | 多个癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 6257 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape and the microenvironment of normal adjacent tissues in hypopharyngeal carcinoma
2024-May-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10321-2
PMID:38760729
|
研究论文 | 本文探讨了低咽癌正常邻近组织的单细胞转录组特征及其微环境 | 研究揭示了低咽癌正常邻近组织中不同细胞的转录组信息和肿瘤微环境的影响 | 对疾病样本的异质性和转录组特征的全面评估尚待深入探索 | 研究低咽癌正常邻近组织的单细胞转录组特点 | 低咽癌患者的正常邻近组织中的细胞 | 数字病理学 | 低咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 来自五名捐献者的39,315个高质量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6258 | 2024-08-05 |
Single cell RNA sequencing reveals immunomodulatory mechanism of stem cell factor and granulocyte colony-stimulating factor treatment in the brains of aged APP/PS1 mice
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.09.593359
PMID:38766064
|
研究论文 | 这项研究探讨了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子治疗对老年APP/PS1小鼠大脑中免疫调节机制的影响 | 首次通过转录组学方法揭示SCF和G-CSF组合增强老年APP/PS1小鼠大脑修复的机制 | 未详细讨论其他可能影响结果的外部因素 | 研究SCF+G-CSF治疗如何改变老年APP/PS1小鼠大脑中小胶质细胞和单核/巨噬细胞的功能 | 28个月大的APP/PS1小鼠大脑中的CD11b小胶质细胞和单核/巨噬细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 通过流式细胞术识别的大量CD11b小胶质细胞和单核/巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6259 | 2024-08-04 |
Unraveling the genetic architecture of blood unfolded p-53 among non-demented elderlies: novel candidate genes for early Alzheimer's disease
2024-May-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10363-6
PMID:38702606
|
研究论文 | 本文探讨了与血液U-p53相关的遗传变异，以识别早期阿尔茨海默病相关的新基因。 | 首次通过GWAS研究血液U-p53，揭示了与早期阿尔茨海默病相关的新基因座和通路。 | 样本仅限于健康和轻度认知受损个体，可能限制了结果的广泛适用性。 | 旨在识别血液U-p53相关的遗传变异，以促进早期阿尔茨海默病的诊断。 | 研究对象为484名来自ADNI队列的健康与轻度认知受损个体。 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 基因组关联研究（GWAS） | NA | 血液数据 | 484名健康和轻度认知受损个体 | NA | NA | NA | NA |
| 6260 | 2024-08-05 |
Molecular mechanism of radiation tolerance in lung adenocarcinoma cells using single-cell RNA sequencing
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18378
PMID:38760895
|
研究论文 | 本文探讨了肺腺癌细胞对放射治疗耐受性的分子机制。 | 识别了与放射耐受性相关的两个细胞亚群，并探讨了其基因突变的初步情况。 | 研究主要依赖公共数据库的数据，可能存在数据偏差。 | 探索肺腺癌放射耐受性的分子机制，以改善临床治疗效果。 | 聚焦于肺腺癌细胞及其亚群体对放射治疗的反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用多个公共数据库中的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |