单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7520 篇文献，本页显示第 6221 - 6240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6221 | 2024-08-05 |
Lipoxin A 4 /FPR2 signaling mitigates ferroptosis of alveolar epithelial cells via NRF2-dependent pathway during lung ischemia-reperfusion injury
2024-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590127
PMID:38712069
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研究论文 | 本研究探讨了Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中肺泡上皮细胞铁死亡的保护作用 | 揭示了LxA4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性机制减轻肺泡上皮细胞的铁死亡 | 本研究的局限性在于尚未探讨不同类型肺移植患者的普遍适用性 | 研究Lipoxin A4对肺缺血再灌注损伤中铁死亡的保护作用 | 主要研究对象为肺泡II型上皮细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 包括来自肺移植患者的样本，以及WT、Fpr2 -/-和Nrf2 -/-小鼠的样本 |
| 6222 | 2024-08-04 |
ALDH2 as an immunological and prognostic biomarker: Insights from pan-cancer analysis
2024-Apr-19, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037820
PMID:38640328
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研究论文 | 本研究全面评估了ALDH2在全癌症中的重要性 | 首次揭示了ALDH2与多种癌症类型及其免疫微环境的关联 | 尚未深入探讨ALDH2在各癌症类型中的具体机制 | 研究ALDH2在全癌症中的免疫学和预后生物标志物作用 | 分析ALDH2在不同癌症类型中的表达与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、免疫组化染色 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 跨16种不同癌症类型的肿瘤及正常组织样本 |
| 6223 | 2024-08-04 |
Myeloid-Mas Signaling Modulates Pathogenic Crosstalk among MYC+CD63+ Endothelial Cells, MMP12+ Macrophages, and Monocytes in Acetaminophen-Induced Liver Injury
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306066
PMID:38350725
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研究论文 | 本研究探讨了在乙酰氨基酚诱导的肝损伤中，髓系Mas信号通路对细胞间病理性交互的调节作用 | 首次揭示了髓系Mas在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用，提供了细胞间相互作用的新视角 | 未明确Mas在乙酰氨基酚诱导肝损伤中的具体作用机制和细分功能 | 研究髓系Mas信号通路在乙酰氨基酚诱导的肝损伤微环境中的作用 | MYC+CD63+内皮细胞、MMP12+巨噬细胞和单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和动态观测成像 | NA | 生物样本 | 来自急性肝衰竭患者的样本 |
| 6224 | 2024-08-05 |
Identification of a distinct cluster of GDF15high macrophages induced by in vitro differentiation exhibiting anti-inflammatory activities
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1309739
PMID:38655264
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研究论文 | 本文研究了在体外分化中诱导的GDF15high巨噬细胞的特征及其抗炎活性 | 本研究首次识别出一种GDF15high巨噬细胞亚群，并揭示其独特的分子特征和抗炎功能 | 无法排除体外诱导协议对GDF15high巨噬细胞抗炎表型的影响 | 探讨GDF15high巨噬细胞的身份及其在炎症反应中的角色 | 来源于人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞的GDF15high巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA | 约1%的人外周血单核细胞和大鼠骨髓单核细胞中带有GDF15high表型的细胞 |
| 6225 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1418495
PMID:38711509
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更正 | 这篇文章是对先前发表文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6226 | 2024-08-05 |
Alteration of Thyroid Hormones in Mouse Models of Alzheimer's Disease and Aging
2024, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000536089
PMID:38228117
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病和衰老小鼠模型中甲状腺激素的变化 | 本研究首次揭示了免疫细胞浸润与甲状腺激素变化之间的潜在机制 | 研究仅限于小鼠模型，临床应用需要进一步验证 | 探讨甲状腺激素与阿尔茨海默病及衰老之间的关系 | FAD4T小鼠模型和自然衰老小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | FAD4T小鼠和自然衰老小鼠的甲状腺样本 |
| 6227 | 2024-08-05 |
Intrahepatic IgA complex induces polarization of cancer-associated fibroblasts to matrix phenotypes in the tumor microenvironment of HCC
2024-Feb-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000772
PMID:38466639
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研究论文 | 本研究揭示了IgA复合物对肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中癌相关成纤维细胞（CAFs）的影响 | 首次阐明了肝内IgA如何诱导HCC-CAFs朝向更恶性基质表型极化 | 本研究的样本量相对较小，仅分析了50个HCC样本 | 探讨IgA复合物在HCC肿瘤微环境中对CAFs的作用 | 从HCC样本中分离的癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 50个HCC样本 |
| 6228 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the retina shows that LDHA regulates pathogenesis of autoimmune uveitis
2024-02, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103160
PMID:38160538
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研究论文 | 本文研究了LDHA在自身免疫性葡萄膜炎中对病理发生的调节作用 | 研究发现LDHA的抑制可以恢复炎症下T效应细胞和T调节细胞的不平衡，并揭示了其在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 未提及具体的临床数据或者长期观察结果 | 旨在揭示自身免疫性葡萄膜炎中视网膜损伤的细胞动态和致病机制 | 实验自身免疫性葡萄膜炎小鼠及葡萄膜炎患者外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 实验中使用了自身免疫性葡萄膜炎小鼠和人类患者的样本 |
| 6229 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals a pathogenic role of cytotoxic CD4+ T cells in giant cell arteritis
2024-01, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103124
PMID:37952293
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研究论文 | 本研究揭示了细胞毒性CD4+ T细胞在巨细胞动脉炎中的致病作用 | 通过单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析深入探讨了CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的作用 | 研究可能受到样本大小限制，仅包括八名巨细胞动脉炎患者和八名健康对照 | 进一步阐明CD4 T细胞在巨细胞动脉炎中的角色 | 114,799个循环CD4 T细胞来源于活动性和缓解期的巨细胞动脉炎患者与健康对照 | 数字病理学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体谱分析 | NA | 细胞数据 | 114,799个CD4 T细胞，来自8名巨细胞动脉炎患者和8名健康对照 |
| 6230 | 2024-08-05 |
Deciphering Müller cell heterogeneity signatures in diabetic retinopathy across species: an integrative single-cell analysis
2024-May-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01847-y
PMID:38698486
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析阐明了糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的复杂特征 | 首次揭示了不同物种中穆勒细胞的异质性及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 未明确提到该研究的局限性 | 深入理解糖尿病视网膜病变中穆勒细胞的细胞机制 | 糖尿病视网膜病变中的穆勒细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了斯普拉吉-道利大鼠模型和人类患者的样本 |
| 6231 | 2024-08-04 |
A cuproptosis-related signature predicts prognosis and indicates cross-talk with immunocyte in ovarian cancer
2024-May-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00981-7
PMID:38696071
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研究论文 | 本文构建了一个新的与铜死亡相关的基因特征，具有良好的预后能力，以评估卵巢癌患者的结果 | 建立了与铜死亡相关的预后模型，并发现了其与免疫细胞的交互作用和化疗反应的关系 | 本研究主要依赖于TCGA和GEO数据库，可能存在数据偏差问题 | 研究铜死亡与卵巢癌进展之间的关系 | 卵巢癌患者的基因组数据和细胞实验 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因组数据 | TCGA中583名卵巢癌患者和GEO中260名卵巢癌患者 |
| 6232 | 2024-08-05 |
Development of an Automated Morphometric Approach to Assess Vascular Outcomes following Exposure to Environmental Chemicals in Zebrafish
2024-May, Environmental health perspectives
IF:10.1Q1
DOI:10.1289/EHP13214
PMID:38701112
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研究论文 | 本文开发了一种自动化形态度量方法来评估环境化学物质对血管的影响 | 提出了一个基于深度学习的定量框架ECA-ResXUnet，用于自动分割血管网和提取特征 | 对环境化学物质对血管的影响研究还不够全面 | 研究环境化学物质对血管形态的影响并开发评估方法 | Tg(fli1a:eGFP)斑马鱼胚胎作为实验对象 | 数字病理学 | NA | 高含量成像平台和单细胞RNA测序 | ECA-ResXUnet | 图像 | 对150种环境化学物质处理的斑马鱼幼体进行了评估 |
| 6233 | 2024-08-04 |
AI identifies potent inducers of breast cancer stem cell differentiation based on adversarial learning from gene expression data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae207
PMID:38701411
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研究论文 | 本文利用基于转录组数据的人工智能方法识别强效的诱导乳腺癌干细胞分化的小分子。 | 创新之处在于采用对抗学习方法解决不同数据域的适应性问题，从而有效识别和消除域特定偏差。 | 实验验证仅在MDA-MB-231和MCF7细胞中进行，样本可能存在局限性。 | 研究旨在寻找能够诱导乳腺癌干细胞分化的小分子。 | 研究对象为乳腺癌干细胞及其分化过程中的小分子。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-Seq | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 六个小分子在MDA-MB-231和MCF7细胞中进行检验 |
| 6234 | 2024-08-05 |
scEWE: high-order element-wise weighted ensemble clustering for heterogeneity analysis of single-cell RNA-sequencing data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae203
PMID:38701413
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研究论文 | 提出了一种高阶元素加权集成聚类方法scEWE，以分析单细胞RNA测序数据中的异质性 | 开发了一个基于高阶元素加权策略的自我代表性集成学习框架，优化了对个体细胞的聚类权重分配 | 针对特定数据集的性能验证，可能不适用于所有类型的单细胞RNA-seq数据 | 提高单细胞RNA测序数据的异质性分析性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | 集成学习 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 6235 | 2024-08-05 |
Pan-cancer analysis of prognostic and immunological role of IL4I1 in human tumors: a bulk omics research and single cell sequencing validation
2024-May-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01000-5
PMID:38691253
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研究论文 | 本研究探讨了IL4I1在多种肿瘤中的预后和免疫学角色 | IL4I1被发现与癌症的预后和免疫细胞浸润密切相关，且可能作为新的治疗靶点 | 研究主要依赖于现有数据库，可能存在数据偏差 | 探索IL4I1在肿瘤中的表达及其与预后和免疫的关系 | IL4I1在多种人类肿瘤中的表达和作用 | 数字病理学 | 肿瘤相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多种肿瘤样本 |
| 6236 | 2024-08-04 |
Molecular mechanisms underlying the therapeutic effects of Linggui Zhugan decoction in stroke: Insights from network pharmacology and single-cell transcriptomics analysis
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037482
PMID:38552092
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研究论文 | 本研究探讨了灵桂治肝汤在中风治疗中的作用机制 | 首次结合网络药理学和单细胞转录组分析揭示灵桂治肝汤的关键成分、靶点和通路 | 尚未完全阐明其疗效的具体分子机制 | 研究灵桂治肝汤在中风治疗中的分子机制 | 主要研究灵桂治肝汤的活性成分及其靶点 | 数字病理学 | 中风 | 网络药理学和单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据 | 144个潜在靶点与2035个中风相关基因的交集分析 |
| 6237 | 2024-08-04 |
Mechanistic insights into FEN1-mediated drug sensitivity and risk signature in colon cancer: An integrative bioinformatics study
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037517
PMID:38552056
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研究论文 | 本研究探讨了FEN1在结肠癌中的表达及其与临床病理和预后的关系 | 提出了一个由FEN1导出的多基因预后风险标志，并揭示了FEN1表达水平与结肠癌转移潜力及药物敏感性之间的相互作用 | FEN1表达与预后的明显相关性未能得到确认 | 深入探讨FEN1在结肠癌中的作用，尤其是在药物敏感性和预后方面 | 结肠癌患者的FEN1表达及其与转移的关系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序，基因集富集分析，Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自The Cancer Genome Atlas和Gene Expression Omnibus的多个数据集 |
| 6238 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals comprehensive microenvironment and highlights the dysfuntional state of NK cells in endometrioid carcinoma
2024-Mar-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037555
PMID:38552055
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了子宫内膜样癌（EEC）中的肿瘤微环境，重点是自然杀伤（NK）细胞的功能异常状态 | 发现了一种CD56dim_DNAJB1 NK细胞亚群，其具有低细胞毒性和高压力水平，显示出NK细胞在肿瘤微环境中的功能失调 | NA | 更好地理解EEC中的肿瘤微环境的多样性 | 21个样本，包括16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织，特别关注肿瘤浸润的NK细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 21个样本（16个EEC肿瘤组织和5个相邻正常组织） |
| 6239 | 2024-08-04 |
Exhaled volatolomics profiling facilitates personalized screening for gastric cancer
2024-May-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216881
PMID:38614384
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研究论文 | 本研究建立了一种非侵入性方法，通过呼气挥发物组学和集成学习来检测胃癌 | 该研究开发了一种基于质谱的程序，筛选出用于区分胃癌与对照组的 biomarkers 面板，并表现出高准确性 | 未提及具体的局限性 | 旨在开发一种有效的非侵入性筛查工具用于胃癌的早期检测 | 研究对象为314个呼吸样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱 | 集成学习 | 呼吸样本 | 314个呼吸样本 |
| 6240 | 2024-08-04 |
BMP signaling maintains auricular chondrocyte identity and prevents microtia development by inhibiting protein kinase A
2024-May-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91883
PMID:38690987
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研究论文 | 本文研究BMP信号在维持耳廓软骨细胞身份及防止微小耳畸形发展中的作用 | 发现BMP-Smad1/5/9信号激活与耳廓软骨细胞再生活性降低相关，提供了微小耳发病机理的新见解 | 目前对于微小耳发病机制的理解仍不完全，研究可能未能涵盖所有相关基因和路径 | 探讨BMP信号如何维持耳廓软骨细胞身份以及防止微小耳的发病 | 研究对象为成人小鼠耳廓软骨细胞以及人类微小耳样本 | 数字病理学 | 微小耳畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成人小鼠耳廓软骨细胞和人类微小耳样本 |