单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7520 篇文献，本页显示第 6201 - 6220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6201 | 2024-08-04 |
KHDRBS1 as a novel prognostic signaling biomarker influencing hepatocellular carcinoma cell proliferation, migration, immune microenvironment, and drug sensitivity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1393801
PMID:38660302
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研究论文 | 本研究探讨了KHDRBS1在肝细胞癌发展中的作用及其作为预后信号生物标志物的潜力 | 发现KHDRBS1在肝细胞癌中的促肿瘤作用，并揭示了其在肿瘤进展中的临床意义 | 缺乏更广泛的临床试验数据来验证KHDRBS1作为治疗靶点的有效性 | 研究KHDRBS1在肝细胞癌中的表达模式及其对癌症细胞增殖和迁移的影响 | 针对肝细胞癌中的KHDRBS1阳性和阴性恶性细胞进行分析 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据、临床样本 | 来自公共数据库的多队列数据和临床样本 |
| 6202 | 2024-08-04 |
Integration of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq constructs: a cancer-associated fibroblasts-related signature to predict prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/VCCZ1477
PMID:38715811
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研究论文 | 本研究提出了一种与癌症相关的成纤维细胞特征，以预测透明细胞肾细胞癌的预后和治疗反应 | 文章创新性在于结合了大规模RNA测序和单细胞RNA测序，识别并验证了预测预后和治疗反应的成纤维细胞相关基因特征 | 文章未提供不同肿瘤类型间的比较，且需要在更大样本上验证CRG特征的有效性 | 研究透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗响应的预测方法 | 研究癌症相关成纤维细胞及其在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | RNA-seq | 加权相关网络分析 | 基因表达数据 | 涉及TCGA肿瘤样本和ccRCC细胞系 |
| 6203 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of the Immunosuppressive Function of Regulatory T Cells in Human Hepatocellular Carcinoma Tissues
2024 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748241251580
PMID:38712609
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研究论文 | 本文对人类肝细胞癌组织中的调节性T细胞的免疫抑制功能进行了综合分析 | 建立了一种基于Treg相关基因组的预后模型，并揭示了Tregs在HCC中的独特作用及其与其他免疫细胞的相互作用 | 研究主要基于现有的转录组数据，尚需更多临床验证 | 探讨调节性T细胞在肝细胞癌患者中的作用及其对治疗效果的影响 | 重点研究肝细胞癌患者组织中的调节性T细胞及其免疫调节机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 多色荧光免疫组织化学(mIHC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本和转录组数据 | 涉及肝细胞癌组织样本和相关数据集的多样本分析 |
| 6204 | 2024-08-05 |
Revealing gene expression heterogeneity in a clonal population of Tetrahymena thermophila through single-cell RNA sequencing
2024-Jul, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2024.101720
PMID:38711548
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析克隆种群中的基因表达异质性 | 首次使用peaks2utr方法估算缺失的3'非翻译区，从而创建修订的注释文件用于分析 | 未提及样本来源的具体细节和外部验证 | 研究克隆种群中基因表达的可变性 | 对5000个Tetrahymena thermophila细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5000个细胞 |
| 6205 | 2024-08-04 |
TIGIT Blockade Reshapes the Tumor Microenvironment Based on the Single-cell RNA-Sequencing Analysis
2024-Jun-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000511
PMID:38545758
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研究论文 | 这篇文章研究了TIGIT阻断治疗对肿瘤微环境的影响。 | 文章提供了对TIGIT阻断后免疫微环境变化的新理解，并揭示了其在肿瘤免疫疗法中的潜力。 | 文章中没有提到具体的临床数据和长期疗效评估。 | 研究TIGIT阻断在肿瘤免疫治疗中的作用和机制。 | 小鼠在接受抗TIGIT治疗前后的单细胞RNA测序分析。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 在小鼠中进行的单细胞测序 |
| 6206 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies NOTCH3-Mediated Interactions between Stromal Cells That Promote Microenvironment Remodeling and Invasion in Lung Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1183
PMID:38335304
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOTCH3介导的间质细胞间相互作用在肺腺癌中的作用 | 首次揭示了NOTCH信号在肿瘤微环境重塑和细胞侵袭中的作用 | 尚未明确NOTCH3信号靶向治疗的临床应用前景 | 深入理解肺腺癌中的间质生物学 | 9名未接受治疗的肺腺癌患者的256,379个细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自9名患者的256,379个细胞，包括13,857个间充质细胞 |
| 6207 | 2024-08-05 |
919 granules improve postpartum depression through the regulation of abnormal peripheral blood IL-1β
2024-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.116623
PMID:38643545
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研究论文 | 该文探讨919颗粒通过调节异常外周血IL-1β来改善产后抑郁症 | 首次揭示了产后抑郁症患者外周血cDC2和增殖B细胞的比例升高与IL-1β的显著相关性 | 研究中未提及样本的多样性和长期疗效验证 | 研究产后抑郁症的发病机制及919颗粒的治疗效果 | 健康产后女性和产后抑郁症患者的外周血样本 | 数字病理 | 产后抑郁症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 动物模型 | 外周血样本 | 健康产后女性与产后抑郁症患者的外周血样本 |
| 6208 | 2024-08-04 |
[Spatial transcriptomics techniques and its applications in plant research]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230662
PMID:38658142
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综述 | 本文探讨了空间转录组技术在植物研究中的应用 | 总结了空间转录组技术的发展过程及其在植物细胞研究中的进展 | 概述了空间转录组技术在植物应用中面临的挑战 | 探索空间转录组技术在植物中的应用 | 植物细胞的生长、分化、识别及抗逆性 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 6209 | 2024-08-05 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-Apr-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
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研究论文 | 这项研究通过分析人类多能干细胞生成的畸胎瘤的表观基因组和转录组，探讨人类染色质的普遍特征。 | 文章提出了构建表观遗传特征矩阵的方法，以量化畸胎瘤中的多种细胞群体，并揭示染色质状态的独特特征。 | 研究的局限性未详细说明 | 本研究旨在分析畸胎瘤的表观基因组和转录组，以理解干细胞分化和发育过程。 | 本文的研究对象是人类多能干细胞产生的畸胎瘤。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq, scRNA-Seq, scATAC-Seq | NA | 转录组, 表观基因组 | NA |
| 6210 | 2024-08-05 |
ITGAM: A Pivotal Regulator in Macrophage Dynamics and Cardiac Function During Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Apr, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59342
PMID:38711712
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研究论文 | 本研究揭示了在脓毒症诱导的心肌病中ITGAM在巨噬细胞动态和心脏功能中的调节作用 | 识别了ITGAM作为调节巨噬细胞功能的重要分子，并探讨了其在脓毒症诱导的心肌病中的双重作用 | 研究结果显示ITGAM中和抗体的使用虽然改善了心脏功能，但却增加了脓毒症后期的死亡率，反映出其复杂的作用 | 探讨脓毒症诱导的心肌病中的免疫细胞动态和其分子机制 | 主要研究巨噬细胞在脓毒症诱导的心肌病中的行为以及ITGAM和ICAM-1的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 6211 | 2024-08-04 |
Revealing cell-cell communication pathways with their spatially coupled gene programs
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae202
PMID:38706319
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研究论文 | 本文提出了一种新方法IGAN，以推测细胞间通信及其上游/下游路径 | 首次能够估计两个特定单一空间相邻细胞之间的基因关联/网络 | 尚未说明此方法在多细胞系统中的应用限制 | 探索细胞间通信的机制和其相关的基因程序 | 针对单个相邻细胞的细胞间通信模式进行研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 公共数据集 | 多个人类细胞类型的数据集 |
| 6212 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing data imputation using bi-level feature propagation
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae209
PMID:38706317
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研究论文 | 本研究提出了一种双层特征传播的单细胞RNA测序数据插补方法，旨在解决技术噪声和稀疏性问题 | 提出了双层特征传播（scBFP）方法，通过两步图形基础的特征传播，改善了单细胞RNA测序数据的插补和去噪效果 | 方法可能在特定的复杂情况下仍然受到噪声传播的影响 | 本研究的目标是提高单细胞RNA测序数据处理的准确性和有效性 | 研究对象为单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图形基础模型 | 基因表达数据 | 大量单细胞RNA样本 |
| 6213 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics and Mendelian randomization reveal LUCAT1's role in right-sided colorectal cancer risk
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1357704
PMID:38711918
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研究论文 | 这项研究探讨了单细胞转录组学和孟德尔随机化对右侧结直肠癌风险中LUCAT1作用的研究 | 确认了LUCAT1与右侧结直肠癌风险之间的潜在因果关系 | 未提及限制性因素 | 研究右侧结直肠癌的病理机制 | 对左侧和右侧结直肠癌的细胞级差异进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 孟德尔随机化 | 基因组数据 | NA |
| 6214 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415915
PMID:38715603
|
更正 | 这篇文章更正了之前的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6215 | 2024-08-05 |
Unveiling novel insights in acute myeloid leukemia through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1365330
PMID:38711849
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病中的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术洞察了急性髓系白血病的复杂性和异质性，以及AML细胞与免疫细胞和骨髓微环境之间的相互作用 | 文章强调了单细胞RNA测序在急性髓系白血病领域的当前局限性和未来方向 | 研究急性髓系白血病的病理机制和治疗潜力 | 急性髓系白血病细胞及其微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 6216 | 2024-08-04 |
A contrastive learning approach to integrate spatial transcriptomics and histological images
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.039
PMID:38707535
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的模型ConGcR，用于整合基因表达、空间位置和组织形态数据，以进行数据表征和空间组织结构识别 | 本研究创新性地提出了ConGcR模型，结合图卷积和ResNet编码器，增强了空间嵌入表示的建模能力 | 未提及具体限制 | 本研究旨在提高组织架构识别的准确性，并为空间转录组分析任务提供有效的数据表征 | 研究对象包括16个人脑、4只鸡心、8个乳腺肿瘤和30个来自人类肺部的空间转录组样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组技术 | 对比学习模型 | 基因表达、空间位置、组织图像 | 共58个样本，包括16个人脑、4只鸡心、8个乳腺肿瘤和30个人肺样本 |
| 6217 | 2024-08-04 |
Hybrid sequence-based analysis reveals the distribution of bacterial species and genes in the oral microbiome at a high resolution
2024-Jul, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2024.101717
PMID:38708423
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研究论文 | 本研究利用无培养分析技术识别口腔微生物组中的细菌种类和基因分布 | 采用细菌单细胞基因组测序等先进技术，实现了对口腔微生物的高分辨率分析 | 样本中约80%为非细菌源DNA，可能影响细菌种类的识别 | 旨在识别口腔微生物组中的细菌种类并研究其基因分布 | 研究对象为来自同一个体的唾液样本 | 数字病理学 | NA | 细菌单细胞基因组测序, 16S rRNA测序, 大规模全基因组测序 | NA | 基因组序列 | 48个井的样本中，非活性样本为43个，活性样本为45个 |
| 6218 | 2024-08-04 |
Identification of sepsis-associated mitochondrial genes through RNA and single-cell sequencing approaches
2024-May-03, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-024-01891-x
PMID:38702721
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研究论文 | 本研究通过RNA和单细胞测序方法鉴定与脓毒症相关的线粒体基因 | 发现了两个与脓毒症预后密切相关的线粒体基因COX7B和NDUFA4 | 样本量较小，仅包含20名脓毒症患者和10名健康志愿者作为对照 | 识别与脓毒症相关的线粒体生物标志物，以提高脓毒症诊断和预后的准确性 | 20名脓毒症患者的外周血样本及10名健康志愿者的血样作为对照 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 20名脓毒症患者和10名健康志愿者 |
| 6219 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to elucidate the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and cancer cells in hepatocellular carcinoma with spleen-deficiency syndrome
2024-May, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2023.11.008
PMID:38707923
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）合并脾虚综合征（SDS）中癌症相关成纤维细胞（CAFs）与癌细胞之间的相互作用 | 揭示了CAFs与癌细胞之间的交互在SDS中促进肿瘤发展，并确认了PDGF信号通路在此过程中的重要作用 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用和人类数据的验证需进一步研究 | 研究脾虚综合征下肝细胞癌中细胞间的相互作用 | 主要研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学与空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 建立了以HCC-SDS小鼠为模型共29个细胞簇 |
| 6220 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals 2D cytokine assay can model atopic dermatitis more accurately than immune-competent 3D setup
2024-May, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15077
PMID:38711200
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研究论文 | 本研究探讨了不同体外模型对特应性皮炎（AD）模拟的准确性。 | 首次使用单细胞RNA测序数据比较了2D和3D细胞培养在模拟AD方面的效果。 | 未能研究Th2细胞对模型AD的影响，且仅基于特定细胞类型的研究，结果可能有限。 | 理解特应性皮炎的病理生理，并识别新的治疗方法。 | 使用原代成纤维细胞和角质形成细胞进行的体外模型实验。 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 2D/3D细胞培养 | 基因表达数据 | 使用来自临床研究的皮肤活检的单细胞RNA测序数据和健康与AD供体的已发布数据 |