单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7520 篇文献，本页显示第 6181 - 6200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6181 | 2024-08-05 |
Integrated enhancer regulatory network by enhancer-promoter looping in gastric cancer
2024-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcae020
PMID:38720882
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研究论文 | 本研究分析了胃癌细胞中增强子-启动子环状相互作用的调控网络 | 发现胃癌特异性增强子通过增强子-启动子环与近邻启动子相互作用激活多个基因，尤其是在胃癌细胞中表达的肿瘤相关基因 | 未提及具体的局限性 | 研究胃癌细胞中增强子如何调控癌基因转录 | 胃癌细胞系与正常胃上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | NA | 基因表达数据 | 使用了两种胃癌细胞系和临床胃癌样本 |
| 6182 | 2024-08-05 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2024-May-09, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
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评论 | 本文回顾了基因表达研究中最新的基因组技术对非模式生物的影响 | 提出了长读序列技术和单细胞RNA测序方法在生态基因组学中的应用潜力 | 传统的RNA测序方法无法捕捉稀有细胞群体的表达变化 | 探讨基因组技术如何提高对基因表达变化的理解 | 非模式生物的基因表达和细胞异质性 | 生态基因组学 | NA | 长读测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6183 | 2024-08-04 |
Genomic insights into the cellular specialization of predation in raptorial protists
2024-May-07, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01904-2
PMID:38715037
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研究论文 | 本研究探讨了捕食原生动物的细胞特化的基因组机制 | 首次揭示了Haptoria纤毛虫在毒素生成和释放中的基因重复与表达特征 | 对毒素形成和释放的遗传过程的理解仍然有限 | 研究Haptoria纤毛虫的捕食策略及其细胞结构 | 七个Haptoria纤毛虫物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | 七个Haptoria纤毛虫物种 |
| 6184 | 2024-08-05 |
Single-cell senescence identification reveals senescence heterogeneity, trajectory, and modulators
2024-May-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.03.009
PMID:38604170
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研究论文 | 本文介绍了一种机器学习程序SenCID，用于准确识别衰老细胞 | SenCID能够识别不同的衰老身份，并重建衰老轨迹，揭示了衰老调节因子的层级结构 | 未提及具体的限制 | 研究细胞衰老及其异质性 | 602个样本来自52个衰老转录组数据集 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 转录组测序 | 机器学习模型 | 文本数据 | 602个样本，涉及30种细胞类型 |
| 6185 | 2024-08-04 |
Catalytic Nanodots-Driven Pyroptosis Suppression in Nucleus Pulposus for Antioxidant Intervention of Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202313248
PMID:38299823
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研究论文 | 本研究开发了碳化锰纳米点（MCDs）作为抗氧化剂，以抑制髓核细胞的焦亡，从而有效缓解椎间盘退变。 | 该研究首次使用碳化锰纳米点作为ROS清除催化生物材料，展示了其在抑制焦亡和缓解椎间盘退变中的优越效果。 | 该研究的局限性可能包括小鼠模型的适用性和长期效果需进一步验证。 | 研究的目的是开发一种新的抗氧化干预措施，以抑制椎间盘退变中的焦亡。 | 研究对象为椎间盘退变相关的髓核细胞。 | 数字病理 | 椎间盘退变 | 催化干预 | 小鼠模型 | 生物材料和生物化学数据 | 使用了多种小鼠样本进行体内评估 |
| 6186 | 2024-08-05 |
Identification of a novel ADCC-related gene signature for predicting the prognosis and therapy response in lung adenocarcinoma
2024-May, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01871-y
PMID:38507067
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研究论文 | 该研究识别了一种新的ADCC相关基因特征，预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 首次系统编制ADCC相关基因创建预后标志，并展示了其在多组患者中的有效性 | 可能未对所有潜在的ADCC相关基因进行全面考察，且外部验证需要进一步研究 | 旨在通过ADCC相关基因特征提高肺腺癌患者的预后预测和治疗反应评估 | 包括1564例肺腺癌患者以及其他多种癌症类型的总共5000多名患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 机器学习 | 集成机器学习方法 | 基因组数据、单细胞数据 | 1564名肺腺癌患者，2057名非小细胞肺癌患者，以及5000多名其他癌症患者 |
| 6187 | 2024-08-05 |
The Mas-related G protein-coupled receptor d (Mrgprd) mediates pain hypersensitivity in painful diabetic neuropathy
2024-May-01, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003120
PMID:38147415
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研究论文 | 该研究探讨了Mrgprd在糖尿病性神经病痛中的作用。 | 首次揭示了Mrgprd在高脂饮食小鼠模型中的表达增加及其与神经痛相关的机制。 | 研究主要集中在动物模型上，尚未在人类糖尿病性神经病痛患者中验证。 | 阐明糖尿病性神经病痛中DRG神经元的超兴奋性分子机制。 | 高脂饮食小鼠模型中的DRG神经元。 | 数字病理 | 糖尿病性神经病痛 | 单细胞RNA测序和体内钙成像。 | NA | RNA数据和钙成像数据。 | 研究涉及高脂饮食小鼠模型的多个神经元亚群体。 |
| 6188 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a signature based on myofibroblastic cancer-associated fibroblast marker genes for predicting prognosis, immune infiltration, and therapeutic response in bladder cancer
2024-May, Investigative and clinical urology
IF:2.5Q2
DOI:10.4111/icu.20230300
PMID:38714517
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研究论文 | 本研究探讨了用于预测膀胱癌预后、免疫浸润和治疗反应的肌成纤维癌相关成纤维细胞标记基因的特征。 | 本研究构建了一个基于两个基因(COL6A1和MAP1B)的风险特征，为膀胱癌患者提供了新的治疗靶点。 | 本研究在样本选择和数据分析上可能存在一定的局限性，未详细讨论如何克服这些局限。 | 研究目的在于探索膀胱癌患者临床诊断和治疗中的myCAF标记基因生物标志物。 | 研究对象为膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据和临床数据。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学 | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据 | NA |
| 6189 | 2024-08-05 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
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研究论文 | 本研究揭示了在椎间盘退化过程中，细胞群体的共享与特定过程。 | 该论文首次识别了退化中椎间盘各特定细胞群体的机制与分子，提供了更精确的IDD预防和治疗靶点。 | 具体样本来源及数量在研究中没有详细阐述。 | 研究椎间盘退化中细胞群体如何促使发病与进展。 | 对人类健康与病变椎间盘的环状纤维与髓核进行单细胞RNA测序分析。 | 数字病理学 | 椎间盘退化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞数据 | 共计70,000多个细胞样本，其中AF为26,983和19,978个细胞，NP为24,489和20,884个细胞 |
| 6190 | 2024-08-05 |
Early megakaryocyte lineage-committed progenitors in adult mouse bone marrow
2024-Apr, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000187
PMID:38721470
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研究论文 | 本研究首次识别了成年小鼠骨髓中早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 本研究提出了一个新的分化模型，表明巨核细胞谱系承诺发生在分化的晚期，而非直接由造血干细胞生成。 | 研究中未能展示MgPs在体内的再生能力，且MgPs在基因表达上表现出转录异质性。 | 研究巨核细胞谱系承诺的前体细胞在小鼠骨髓中的特点及其起源。 | 成年小鼠骨髓中的早期巨核细胞谱系承诺前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞克隆培养、反转录聚合酶链反应（RT-PCR） | NA | 细胞、基因表达数据 | CD201CD48细胞和CD48细胞 |
| 6191 | 2024-08-04 |
Tumoral and stromal hMENA isoforms impact tertiary lymphoid structure localization in lung cancer and predict immune checkpoint blockade response in patients with cancer
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105003
PMID:38340557
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞中的hMENA亚型与三次淋巴结构（TLS）的关系及其对肺癌患者结果的影响 | 发现hMENA的选择性剪接是TLS相关肿瘤免疫微环境的重要未探索因素，且hMENA亚型可作为临床结果和ICB响应的潜在生物标志物 | 研究主要基于回顾性观察，可能存在样本选择偏倚 | 本研究旨在了解hMENA亚型如何影响肺癌的三次淋巴结构及其与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 研究对象为非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤细胞和癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，免疫组化，空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | N0 NSCLC患者的手术切除组织 |
| 6192 | 2024-08-04 |
Sfrp1 inhibits lung fibroblast invasion during transition to injury-induced myofibroblasts
2024-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01326-2023
PMID:38212077
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研究论文 | 本文研究了Sfrp1在肺纤维母细胞转变为损伤诱导的肌成纤维细胞过程中的抑制作用 | 首次揭示了Sfrp1在调节人类肺纤维母细胞对TGFβ1响应中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和特定患者组织样本，可能限制结果的普遍适用性 | 探讨肺纤维母细胞在损伤和修复过程中的命运变化 | 小鼠肺再生过程中的纤维母细胞及其转变 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 组织样本 | 小鼠模型和特定的特发性肺纤维化患者组织样本 |
| 6193 | 2024-08-04 |
Identifying specific TLS-associated genes as potential biomarkers for predicting prognosis and evaluating the efficacy of immunotherapy in soft tissue sarcoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372692
PMID:38720884
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研究论文 | 本研究探讨了TLS相关基因作为软组织肉瘤预后和免疫治疗疗效的潜在生物标志物 | 本研究系统性地探索了TLS及其相关基因，并建立了与预后和免疫治疗反应相关的风险评分和标志基因 | 研究仍需进一步验证TLS分数和生物标志物在临床中的有效性 | 探讨TLS结构在软组织肉瘤中的作用以及相关生物标志物 | 从TCGA-SARC和GSE212527队列收集的RNAseq和单细胞测序样本 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序、单细胞测序 | 无 | RNA测序数据 | 256个RNAseq样本和7个单细胞测序样本 |
| 6194 | 2024-08-04 |
Cell communication pathway prognostic model identified detrimental neurodevelopmental pathways in neuroblastoma
2024-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.100997
PMID:38669760
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研究论文 | 该文章开发了一种细胞通信通路预后模型，以识别神经母细胞瘤中的有害神经发育通路 | 文章提出了细胞通信通路预后模型（CCPPM），为研究细胞通信通路对疾病预后的影响提供了新的方法 | 由于样本量有限和单细胞RNA-seq数据的临床生存信息不完整，确定这些通信通路对预后的影响具有挑战性 | 研究细胞通信路径对神经母细胞瘤预后的影响 | 神经母细胞瘤的细胞通信通路 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 6195 | 2024-08-04 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
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研究论文 | 急性气道损伤激活局部前体细胞并刺激细胞间相互作用的变化以恢复稳态 | 本研究揭示了气道损伤对远端肺部反应的影响，特别是通过巨噬细胞介导的AT2前体细胞的增殖以及MANC2细胞的动态变化 | 未涉及更广泛的临床应用和长期效应的探讨 | 研究气道急性损伤后的肺组织反应及其细胞间相互作用变化 | 小鼠模型，重点关注气道特异性上皮损伤后的肺泡和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 6196 | 2024-08-04 |
Nitrogen sensing and regulatory networks: it's about time and space
2024-May-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae038
PMID:38366121
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综述 | 本文探讨了植物对氮信号的感知与调控网络的时间和空间维度 | 揭示了氮感知/信号传导的时空系统生物学新方面，特别是在拟南芥模型中的应用 | 主要集中在拟南芥模型上，可能限制结果的普遍适用性 | 研究植物如何在不同细胞类型及长距离上整合氮的响应以确保实时协调 | 主要研究对象为植物，尤其是拟南芥中的氮感知和信号传导机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、轨迹推断、伪时间分析、机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6197 | 2024-08-05 |
Characterization of the malignant cells and microenvironment of infantile fibrosarcoma via single-cell RNA sequencing
2024-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-24-66
PMID:38715675
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了婴儿纤维肉瘤的恶性细胞及其微环境 | 揭示了婴儿纤维肉瘤的普遍转录特征，识别了潜在的新标记物和功能性恶性细胞亚型 | 样本量可能有限，仅来自四名患者，缺乏纵向跟踪数据 | 阐明婴儿纤维肉瘤的转录特征，并探索新的诊断和治疗靶点 | 收集四名患者的婴儿纤维肉瘤新鲜组织样本 | 数字病理学 | 婴儿纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个患者的组织样本 |
| 6198 | 2024-08-05 |
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
2024-Apr, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100450
PMID:38369188
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研究论文 | 本研究分析了结直肠癌中IDO和ARG1的表达及髓系细胞浸润特征 | 首次使用定制的10重免疫组化检测结合机器学习进行全面表征，揭示了IDO和ARG1在肿瘤微环境中的重要作用 | 对IDO和ARG1在结直肠癌微环境中表达模式的理解仍不完全 | 探讨IDO和ARG1在结直肠癌中的表达及其预后意义 | 对833名结直肠癌患者的髓系细胞和肿瘤细胞进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 10重免疫组化检测 | 监督学习 | 细胞RNA测序数据 | 分析了833名结直肠癌患者 |
| 6199 | 2024-08-05 |
AMPK signaling inhibits the differentiation of myofibroblasts: impact on age-related tissue fibrosis and degeneration
2024-Feb, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-023-10072-9
PMID:37917219
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研究论文 | 本研究探讨了AMPK信号通路对肌成纤维细胞分化的抑制作用以及其对与年龄相关的组织纤维化和退化的影响 | 提出AMPK信号通路作为肌成纤维细胞分化的有效抑制因子，揭示其在抗衰老和抑制纤维化作用中的重要性 | 没有明确讨论AMPK信号通路的所有潜在机制及其在不同类型组织中的适用性 | 研究AMPK信号通路在衰老相关的组织纤维化和退化过程中的作用 | 研究对象是肌成纤维细胞及其在组织纤维化过程中的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组研究 | NA | 细胞 | NA |
| 6200 | 2024-08-05 |
Characterization of Cell Type Abundance and Gene Expression Timeline from Burned Skin Bulk Transcriptomics by Deconvolution
2024-01-05, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irad178
PMID:37956340
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研究论文 | 本研究探讨了热损伤皮肤中细胞异质性及基因表达时间线。 | 提出了一种通过解卷积技术分析皮肤大规模转录组数据来识别不同细胞类型的丰度和基因表达的时间进程。 | 尚未建立热损伤皮肤细胞异质性的全面时间线。 | 研究热损伤后皮肤中细胞类型丰度及基因表达的变化。 | 重点分析了中性粒细胞、巨噬细胞、内皮细胞和其他皮肤细胞在烧伤后的表现。 | 数字病理学 | NA | CIBERSORTx解卷积 | NA | 转录组数据 | 使用了独立的正常皮肤和外周血单细胞RNA测序数据集 |