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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-06 |
Dysfunction of infiltrating cytotoxic CD8+ T cells within the graft promotes murine kidney allotransplant tolerance
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179709
PMID:38888968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,小鼠肾脏异体移植耐受性与浸润性CD8+ T细胞在移植物内重编程为耗竭/调节样表型相关 | 首次揭示细胞毒性CD8+ T细胞在移植肾脏内通过IFN-γ介导重编程为耗竭/调节样表型,并提出'防御性耐受'新概念 | 研究仅限于小鼠模型,CD8-KO实验表明调节样表型细胞对耐受诱导并非必需,机制尚未完全阐明 | 探究肾脏异体移植耐受的免疫学机制 | 小鼠肾脏异体移植模型和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),过继性T细胞转移 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 602 | 2025-10-06 |
A pathologically expanded, clonal lineage of IL-21-producing CD4+ T cells drives inflammatory neuropathy
2024-Jun-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178602
PMID:39087473
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定出驱动炎症性神经病变的IL-21产生型CD4+ T细胞克隆谱系 | 首次发现IL-21表达CD4+ T细胞在炎症性神经病变中的克隆扩增和多功能特性,揭示Tfh/Tph细胞亚群共同谱系分化途径 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明炎症性神经病变中致病性CD4+ T细胞的关键特性 | 炎症性神经病变小鼠模型中外周神经组织 | 免疫学 | 炎症性神经病变 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 603 | 2025-10-06 |
Self-regulating CAR-T cells modulate cytokine release syndrome in adoptive T-cell therapy
2024-Jun-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221988
PMID:38607370
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研究论文 | 本研究开发了能够自我调节的自体CAR-T细胞,通过分泌细胞因子抑制剂减轻细胞因子释放综合征 | 首次设计能够分泌托珠单抗衍生单链可变片段的CAR-T细胞,实现自我调节炎症反应 | 研究基于人源化小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 改善CAR-T细胞治疗的安全性并同时增强疗效 | CD19 CAR-T细胞和细胞因子释放综合征 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化NSG-SGM3小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 604 | 2025-10-06 |
Vascular restoration through local delivery of angiogenic factors stimulates bone regeneration in critical size defects
2024-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.07.003
PMID:39100886
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨缺损修复机制,并开发了搭载Spp1和Cxcl12的PCL/PLGA支架材料促进血管生成和骨再生 | 首次在单细胞水平揭示临界尺寸骨缺损中血管生成障碍的关键机制,并创新性地开发了可局部缓释Spp1和Cxcl12的双电纺支架材料 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未在大型动物或临床实验中测试 | 探索临界尺寸骨缺损的修复机制并开发促进骨再生的新型治疗方法 | 小鼠临界尺寸骨缺损模型及再生组织中的细胞群体 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序,电纺丝技术,电喷雾技术 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织学数据,行为学数据 | 小鼠骨缺损模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 605 | 2025-10-06 |
Integrated Single-cell Multiomic Analysis of HIV Latency Reversal Reveals Novel Regulators of Viral Reactivation
2024-05-09, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae003
PMID:38902848
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研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析揭示HIV潜伏逆转的新调控因子 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术同时分析潜伏感染细胞的转录组和表观基因组特征,并利用机器学习预测病毒再激活 | 研究仅针对CD4+ T细胞,未涉及其他潜在HIV潜伏库细胞类型 | 揭示HIV潜伏逆转的分子机制和新型调控因子 | 约125,000个潜伏感染的原代CD4+ T细胞 | 单细胞多组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 约125,000个原代CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 606 | 2025-10-06 |
Young glial progenitor cells competitively replace aged and diseased human glia in the adult chimeric mouse brain
2024-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01798-5
PMID:37460676
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研究论文 | 本研究通过移植年轻健康的人类胶质祖细胞成功替代成年嵌合小鼠大脑中的衰老和病变胶质细胞 | 首次发现年轻健康胶质祖细胞在成年大脑中具有竞争优势,能够通过YAP1/MYC/E2F信号通路取代衰老和病变胶质细胞 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 | 探究健康胶质细胞是否能在成年前脑中竞争取代病变人类胶质细胞 | 人类胶质祖细胞和亨廷顿病模型小鼠 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 607 | 2025-10-06 |
Marmosets contain multitudes
2024-Apr-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97866
PMID:38661001
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示狨猴携带来自其兄弟姐妹的遗传差异细胞的程度 | 利用单细胞RNA测序技术首次在狨猴中量化了来自兄弟姐妹的遗传嵌合细胞 | NA | 研究狨猴体内遗传嵌合现象 | 狨猴细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 608 | 2025-10-06 |
Stimulator of Interferon Genes Pathway Activation through the Controlled Release of STINGel Mediates Analgesia and Anti-Cancer Effects in Oral Squamous Cell Carcinoma
2024-Apr-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12040920
PMID:38672274
|
研究论文 | 本研究开发了STINGel缓释制剂,通过激活干扰素基因刺激因子通路,在口腔鳞状细胞癌模型中同时实现镇痛和抗癌效果 | 开发了延长STING激动剂可用时间的缓释制剂STINGel,首次系统研究其在口腔鳞癌疼痛管理中的作用机制 | 研究局限于动物模型,尚未进行临床试验验证 | 研究STINGel缓释制剂对口腔鳞状细胞癌疼痛的镇痛作用及其机制 | 口腔鳞状细胞癌动物模型 | 癌症研究 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,行为学检测 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | 两种口腔鳞癌模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 609 | 2025-10-06 |
BuDDI: BulkDeconvolution withDomainInvariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2024-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549951
PMID:37503097
|
研究论文 | 提出BuDDI方法,通过域适应技术整合单细胞和批量RNA-seq数据来预测细胞类型特异性扰动效应 | 使用变分自编码器学习四个独立潜在空间,能够模拟细胞类型特异性扰动响应,无需单细胞扰动数据训练 | NA | 开发从批量数据推断细胞类型特异性扰动效应的方法 | 单细胞RNA-seq数据和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 610 | 2025-10-06 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
|
研究论文 | 提出一种名为STew的空间转录组多视图表示学习方法,用于联合分析空间信息和基因表达 | 开发了首个空间转录组多视图表示学习方法,能够有效利用空间信息揭示与基因表达共享的变异 | NA | 解决空间转录组数据分析中有效利用空间信息的挑战 | 人类背外侧前额叶皮层、小鼠主嗅球和银屑病皮肤组织 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多视图表示学习 | 空间转录组数据 | 多个数据集,包含数千个空间位置 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组技术、Slide-seqV2技术、10x Xenium单细胞空间转录组技术 |
| 611 | 2025-10-06 |
Genetic and Functional Analyses of Cutibacterium Acnes Isolates Reveal the Association of a Linear Plasmid with Skin Inflammation
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.029
PMID:37478901
|
研究论文 | 本研究通过遗传和功能分析揭示痤疮丙酸杆菌携带线性质粒与皮肤炎症的关联 | 发现线性质粒的存在与痤疮丙酸杆菌的促炎能力相关,表明菌株类型不足以预测炎症反应 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,需要进一步人体验证 | 探究不同痤疮丙酸杆菌菌株类型与皮肤炎症的关系 | 痤疮丙酸杆菌分离株 | 微生物学 | 痤疮 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 从健康受试者和痤疮患者皮肤拭子分离的痤疮丙酸杆菌菌株 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 612 | 2025-10-06 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae148
PMID:39380691
|
研究论文 | 本研究揭示侵袭性高级别NF2突变脑膜瘤通过上调VGLL4和FAT3/4下调致癌YAP信号通路 | 首次发现侵袭性NF2突变脑膜瘤中YAP1靶基因表达降低与VGLL4和FAT3/4表达升高相关 | 研究主要基于体外细胞系实验,需要更多体内实验验证 | 探究不同级别NF2突变脑膜瘤对YAP活性的依赖性差异 | 人类脑膜瘤组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大型人类脑膜瘤队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 613 | 2025-10-06 |
Evaluating methods for integrating single-cell data and genetics to understand inflammatory disease complexity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1454263
PMID:39703500
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研究论文 | 评估整合单细胞数据与遗传学数据以理解炎症疾病复杂性的方法 | 首次对三种整合GWAS和scRNA-seq的算法进行系统性基准测试,并评估非编码SNP整合方法 | 依赖现有单细胞技术,缺乏疾病特异性图谱时结果可能产生误导 | 开发评估整合遗传学和单细胞数据方法的框架,以识别炎症疾病中遗传相关的细胞状态和基因 | 类风湿性关节炎和溃疡性结肠炎患者 | 生物信息学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | scGWAS, scDRS, scPagwas, MAGMA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | 单细胞数据:183,742和228,211个细胞;GWAS数据:97,173和45,975个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 614 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54761-6
PMID:39737976
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析筛选胰腺癌分子成像靶点,并开发靶向claudin-4的PET成像探针 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学数据驱动筛选胰腺癌分子成像靶点,发现claudin-4作为高特异性成像靶标 | 研究基于人类手术样本,样本来源和数量可能存在限制 | 开发胰腺癌特异性分子成像靶点和成像探针 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, PET成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 人类手术样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 615 | 2025-10-06 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629499
PMID:39763713
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研究论文 | 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御的新机制 | 首次发现肺成纤维细胞在真菌感染中具有保护性功能,通过获得新的免疫调节特性和增强ECM分泌能力来限制感染严重程度 | 研究主要关注periostin阳性成纤维细胞亚群,其他成纤维细胞亚群的功能尚未完全阐明 | 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染过程中的功能响应和防御机制 | 肺成纤维细胞,烟曲霉菌,免疫正常和免疫抑制宿主 | 免疫学,传染病学 | 侵袭性曲霉病,真菌性肺炎 | 细胞谱系追踪,靶向细胞消融,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 616 | 2025-10-06 |
Chemotherapy induces myeloid-driven spatially confined T cell exhaustion in ovarian cancer
2024-Dec-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.11.005
PMID:39658541
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了化疗诱导的骨髓细胞驱动T细胞耗竭在卵巢癌中的空间限制机制 | 发现了化疗诱导的骨髓细胞网络(Myelonets)通过NECTIN2-TIGIT相互作用导致CD8 T细胞耗竭的空间限制机制 | 样本量相对有限(117例),且仅针对高级别浆液性卵巢癌 | 探究化疗对卵巢癌抗肿瘤免疫的适应性变化 | 117例高级别浆液性卵巢癌样本(化疗前后采集) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据 | 117例HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 617 | 2025-10-06 |
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176207
PMID:39621585
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的关键作用,发现其失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 | 首次发现内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3同时失活(而非仅PHD2)通过激活糖酵解/MCT4轴促进肾脏不良修复,并证明MCT4抑制剂可恢复适应性修复 | 机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探究缺血性急性肾损伤向慢性肾病转变的内皮细胞机制 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 618 | 2025-10-06 |
VICTOR: Validation and inspection of cell type annotation through optimal regression
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.028
PMID:39296808
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研究论文 | 介绍了一种名为VICTOR的新方法,用于评估单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的可靠性 | 通过弹性网络正则化回归结合最优阈值来评估细胞注释的置信度,在识别不准确注释方面表现优于现有方法 | NA | 开发评估单细胞数据细胞类型注释可靠性的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性网络正则化回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 619 | 2025-10-06 |
A temporal cortex cell atlas highlights gene expression dynamics during human brain maturation
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01990-6
PMID:39567748
|
研究论文 | 通过单核RNA测序构建人类颞叶皮层的儿科和成人联合细胞图谱,揭示大脑成熟过程中的基因表达动态 | 首次构建包含非洲裔样本的儿科和成人联合细胞图谱,发现与认知和突触可塑性相关的LTK和FREM兴奋性神经元亚型在儿科组织中表达升高 | 研究主要聚焦于颞叶皮层,可能无法完全代表其他脑区的发育特征 | 探索人类大脑成熟过程中的细胞类型特异性基因表达动态 | 人类颞叶组织样本,包含儿科和成人样本及非洲裔样本 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但鉴定了75种细胞亚型 | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 620 | 2025-10-06 |
Tumor Expression of CD83 Reduces Glioma Progression and Is Associated with Reduced Immunosuppression
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0281
PMID:39601621
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质瘤中CD83+肿瘤细胞可抑制肿瘤进展并改善免疫抑制微环境 | 首次发现肿瘤细胞自身表达的CD83能够调节免疫微环境并增强抗肿瘤T细胞反应 | 需要进一步研究CD83表达是否能够增强免疫治疗效果 | 探究CD83在胶质瘤免疫抑制微环境中的作用机制 | 人类和小鼠胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |