单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 6161 - 6180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6161 | 2024-08-04 |
A Clustering Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Automatic Weighting Penalty and Low-Rank Representation
2024 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3362472
PMID:38319777
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研究论文 | 本文提出了一种基于自动加权惩罚和低秩表示的单细胞RNA-Seq数据聚类方法 | 引入加权距离约束并结合相似性约束，提出JAGLRR聚类方法，提高了特征贡献的评估 | 未提及具体的局限性 | 改善现有单细胞RNA-Seq数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 数据集 | 8个真实数据集和模拟数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6162 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of the maternal-fetal interface during ICP and normal pregnancy
2024-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians
DOI:10.1080/14767058.2024.2361278
PMID:38835155
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研究论文 | 本研究揭示了在妊娠期肝内胆汁淤积（ICP）与正常妊娠中母-胎界面的细胞异质性和基因表达差异 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统性分析了ICP与正常妊娠中胎盘的细胞类型、基因特征和功能变化 | 样本数量较小，仅分析了两名个体，可能影响结果的通用性 | 研究ICP影响胎盘的遗传机制 | 对比ICP和正常妊娠胎盘中母-胎界面的细胞类型和基因表达 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 2名个体，一名为ICP患者，一名为正常妊娠者 | NA | NA | NA | NA |
| 6163 | 2024-08-04 |
Lapagyl mitigates UV-induced inflammation and immunosuppression via Foxp3+ Tregs and CCL pathway: A single-cell transcriptomics study
2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155679
PMID:38701542
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研究论文 | 本研究评估了草本产品Lapagyl对紫外辐射引起的皮肤老化的疗效 | 揭示了Lapagyl通过调节Foxp3+ Tregs和CCL通路减轻皮肤炎症和免疫抑制的机制 | 模型建立在SKH-1无毛小鼠上，结果能否推广到人类尚需进一步验证 | 评估Lapagyl在对抗紫外辐射引起的皮肤老化中的有效性 | 研究对象为使用紫外辐射模型的SKH-1无毛小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 组织样本 | SKH-1无毛小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6164 | 2024-08-05 |
Characterization of a Human Respiratory Mucosa Model to Study Odorant Metabolism
2024-Jun-05, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00752
PMID:38775624
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研究论文 | 本文研究了人类呼吸粘膜模型，以探索气味物质代谢 | 首次揭示了组织工程化人类呼吸粘膜模型的XME特征，并证明其适合用于研究鼻腔气味物质代谢 | 该研究主要集中在特定的代谢酶上，其他酶的角色尚未探索 | 研究人类鼻腔呼吸粘膜在气味物质代谢中的作用 | 人类呼吸组织模型及其内部的代谢酶活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 组织工程化模型 | 生物实验数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6165 | 2024-08-04 |
Memory/Active T-Cell Activation Is Associated with Immunotherapeutic Response in Fumarate Hydratase-Deficient Renal Cell Carcinoma
2024-Jun-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2760
PMID:38512114
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研究论文 | 本研究探讨了记忆/活跃T细胞激活与富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌免疫治疗反应之间的关系 | 识别了一种与ICI+TKI治疗有效性相关的记忆和效应T细胞的特征 | 需要进一步验证记忆/活跃T细胞特征与治疗效果之间的关联 | 研究富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌的最佳治疗和分子相关性 | 91名来自15个医疗中心的富马酸酯水合酶缺乏型肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据和RNA数据 | 91名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6166 | 2024-08-05 |
NGEF is a potential prognostic biomarker and could serve as an indicator for immunotherapy and chemotherapy in lung adenocarcinoma
2024-May-19, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03046-1
PMID:38764064
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研究论文 | 本研究评估了NGEF作为肺腺癌的预后生物标志物和潜在治疗靶点的有效性 | 揭示了NGEF在肺腺癌中的作用，并指出其与肿瘤阶段、免疫浸润和化疗反应的显著关联 | 未明确指出具体的局限性 | 研究NGEF在肺腺癌中的预后价值和作为治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者的NGEF表达及其与临床特征的关联 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 定量聚合酶链反应, 免疫组化染色, 西方印迹分析 | NA | NA | LUAD样本中基于中位数NGEF表达构建的高低表达组 | NA | NA | NA | NA |
| 6167 | 2024-08-04 |
Understanding Spondyloarthritis Pathogenesis: The Promise of Single-Cell Profiling
2024-04, Current rheumatology reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11926-023-01132-7
PMID:38227172
|
review | 本文概述了单细胞分析在脊柱关节炎研究中的最新进展和趋势 | 引入基于测序的方法对RNA、蛋白质或表观遗传修饰进行单细胞分辨率的量化，推动了发现驱动的研究 | 研究仍处于早期阶段，面临高成本和疾病组织样本有限的挑战 | 阐述单细胞分析在脊柱关节炎发病机制研究中的应用 | 主要研究脊柱关节炎相关的细胞状态和治疗反应特征 | NA | 脊柱关节炎 | 单细胞TCR-seq | NA | RNA, 蛋白质, 表观遗传修饰 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6168 | 2024-08-04 |
Navigating the landscapes of spatial transcriptomics: How computational methods guide the way
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1839
PMID:38527900
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综述 | 本文综述了空间转录组数据挖掘的当前计算方法 | 提出了对现有分析理论和工具的更新和改革建议，以应对新的实验技术 | 数据分析和生物学见解生成的困难尚未完全解决 | 探讨空间转录组研究中的计算方法 | 空间转录组数据及其挖掘方法 | 计算生物学 | NA | NA | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6169 | 2024-08-04 |
Spatial analysis toolkits for RNA in situ sequencing
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1842
PMID:38605484
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综述 | 本文介绍了RNA原位测序（ISS）的生物信息学工具包及其数据分析流程 | 提出了适用于ISS数据分析的先进生物信息学工具，并详细审查了每种工具的应用及其与ISS数据的兼容性 | 未提及具体的实验实例支持工具的有效性 | 帮助研究者选择合适的工具以进行ISS数据分析 | RNA原位测序（ISS）和相关数据分析工具 | 数字病理学 | NA | 原位测序（ISS） | NA | 图像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6170 | 2024-08-05 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq analyses revealed the function and clinical value of thrombospondins in colon cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.021
PMID:38827236
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研究论文 | 本研究揭示了血小板反应蛋白在结肠癌中的功能和临床价值。 | 研究首次系统分析了血小板反应蛋白在结肠癌中的表达及作用，识别了其作为新的治疗靶点和预后标志物的潜力。 | 该研究依赖于多个高通量数据集，可能存在数据异质性和分析方法的局限性。 | 明确血小板反应蛋白在结肠癌中的具体作用及其临床意义。 | 利用1981个样本分析血小板反应蛋白在结肠癌中的预后相关性和细胞来源。 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq | NA | 样本 | 1981个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6171 | 2024-08-05 |
Plasma proteome analysis implicates novel proteins as potential therapeutic targets for chronic kidney disease: A proteome-wide association study
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31704
PMID:38828357
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研究论文 | 该研究通过全基因组关联研究结合人类血浆蛋白组学识别与慢性肾病相关的新型蛋白。 | 本研究首次系统性识别出22种与慢性肾病显著相关的血浆蛋白，其中INHBC、LMAN2和SNUPN被提出作为新的治疗靶点。 | 研究集中于特定种类的已知蛋白，可能存在未识别新的潜在靶点的局限。 | 识别与慢性肾病发病机制相关的新型蛋白和潜在的治疗靶点。 | 研究涉及与慢性肾病相关的22种血浆蛋白及其在疾病中的作用。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据 | 分析了健康人类和小鼠肾脏的单细胞RNA测序数据，具体样本量未列明 | NA | NA | NA | NA |
| 6172 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of gene signatures associated with aging in human aortic dissection
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31298
PMID:38828294
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析探讨了与人类主动脉夹层相关的衰老基因签名。 | 研究识别了与衰老相关的枢纽基因，并提出了ESR1下调可能加重主动脉夹层的假说。 | 研究需要进一步验证有关ESR1在主动脉夹层形成中的作用，尤其是在临床环境中。 | 分析衰老相关基因与主动脉夹层的关联，以提供新见解和治疗策略。 | 衰老相关基因及其在主动脉夹层中表达的调控网络。 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及从13名主动脉夹层患者的197,605个主动脉细胞中获得的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6173 | 2024-08-05 |
Molecular characterization of nodose ganglia development reveals a novel population of Phox2b+ glial progenitors in mice
2024-Jun-03, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1441-23.2024
PMID:38830761
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研究论文 | 本文研究了迷走神经结的发展，并发现了一种新的Phox2b+胶质前体细胞群体 | 揭示了迷走神经结的胶质前体细胞具有独特的转录程序，并且这些细胞能够产生自主神经元 | 对迷走神经胶质细胞的发育基因程序尚未完全理解 | 探究迷走神经结中的胶质细胞前体的发育和转录特征 | 以小鼠为研究对象，分析迷走神经结中胶质前体细胞的性质 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 小鼠，性别不限 | NA | NA | NA | NA |
| 6174 | 2024-08-04 |
Mitochondrial RNA modification-based signature to predict prognosis of lower grade glioma: a multi-omics exploration and verification study
2024-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63592-w
PMID:38824202
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研究论文 | 该研究探讨了线粒体RNA修饰在低级别胶质瘤预后中的作用 | 提出了一种基于线粒体RNA修饰的评分系统以预测低级别胶质瘤的预后，并通过多组学数据进行验证 | 线粒体RNA修饰相关基因的作用机制可能尚未完全解释 | 研究线粒体RNA修饰对低级别胶质瘤的影响及其预后预测能力 | 低级别胶质瘤及其相关的线粒体RNA修饰基因 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | RNA-seq | LASSO回归, 随机生存森林 | 基因表达数据 | 1120个正常脑组织样本和529个低级别胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6175 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
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研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6176 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
|
研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6177 | 2024-08-05 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveal heterogeneity and diagnostic markers in papillary thyroid carcinoma lymph-node metastasis
2024-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-023-02262-6
PMID:38146045
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研究论文 | 本研究分析了乳头状甲状腺癌的淋巴结转移，寻找诊断标记物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，探索了乳头状甲状腺癌淋巴结转移的异质性 | 研究中样本量有限，仅包括66名患者的样本 | 旨在发现乳头状甲状腺癌淋巴结转移的诊断标记物及治疗靶点 | 研究对象为乳头状甲状腺癌患者的淋巴结转移细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和常规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 66名乳头状甲状腺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6178 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素，并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6179 | 2024-08-05 |
Proteomic analysis of pleomorphic dermal sarcoma reveals a fibroblastic cell of origin and distinct immune evasion mechanisms
2024-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62927-x
PMID:38822058
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现多形性皮肤肉瘤的细胞来源和独特的免疫逃逸机制 | 首次识别出多形性皮肤肉瘤的潜在细胞来源及其免疫逃逸机制 | 样本数量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨多形性皮肤肉瘤的细胞起源及其免疫逃逸途径 | 分析健康皮肤、恶性黑色素瘤、鳞状细胞癌和多形性皮肤肉瘤的样本 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 质谱 | NA | 蛋白质数据、单细胞测序数据 | 分析了20个正常皮肤样本、27个恶性黑色素瘤样本、20个鳞状细胞癌样本和24个多形性皮肤肉瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6180 | 2024-08-05 |
Neoantigen-specific stimulation of tumor-infiltrating lymphocytes enables effective TCR isolation and expansion while preserving stem-like memory phenotypes
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008645
PMID:38816232
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研究论文 | 本研究探讨了针对新抗原特异性刺激肿瘤浸润淋巴细胞的效果。 | 开发了一种名为'NeoExpand'的体外刺激方法，能够选择性扩展新抗原反应性的TIL，改善其表型和功能。 | 研究样本仅限于具有p53或RAS突变的25名患者，可能影响结果的普遍适用性。 | 探讨如何优化新抗原反应性肿瘤浸润淋巴细胞的扩展和分离。 | 25名来自肺癌患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 体外刺激 | NA | 样本 | 25个TIL样本 | NA | NA | NA | NA |