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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6121 | 2024-08-05 |
Deciphering the Genetic Links between Psychological Stress, Autophagy, and Dermatological Health: Insights from Bioinformatics, Single-Cell Analysis, and Machine Learning in Psoriasis and Anxiety Disorders
2024-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105387
PMID:38791423
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研究论文 | 本研究探讨了心理压力、自噬相关基因与皮肤健康之间的关系,特别关注银屑病与焦虑障碍的共病机制 | 揭示了银屑病与焦虑障碍之间可能存在的共享生物机制及其潜在生物标志物 | 样本数据来源于GEO数据库,未具体提及样本的多样性和数据的全面性 | 探索银屑病与焦虑障碍之间的共病机制 | 银屑病与焦虑障碍相关的数据和基因 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 未具体提及样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 6122 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
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研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能,机器学习,单细胞测序,空间分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6123 | 2024-08-04 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.03.556122
PMID:37732188
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研究论文 | 本文提出Polaris,一个用于图像基础空间转录组分析的分析管道 | 结合深度学习模型进行细胞分割和点检测,以及概率基因解码器以准确量化单细胞基因表达 | NA | 开发一个无缝的解决方案用于分析空间转录组数据 | 图像基础空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6124 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
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研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道,用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准,并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中,所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 | NA | NA | NA | NA |
| 6125 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
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研究论文 | 本研究探讨了在动脉粥样硬化进展过程中单细胞基因表达模式的临床和病理生理相关性 | 首次通过整合高基因丰度的单细胞亚群与冠状动脉疾病基因调控网络,确认GRN39在促进晚期、症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 对单细胞转录组数据的详细理解仍然不足,且临床适用性需要进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化发病机制的细胞遗传调控网络 | 在Ldlr-/-Apob100/100小鼠模型和人类样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16588个单细胞和600名冠状动脉疾病患者的基因组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6126 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类,强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型,并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 6127 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
|
研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台,以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞,约600种代谢物 | NA | NA | NA | NA |
| 6128 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6129 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
|
研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器,以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据,生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6130 | 2024-08-05 |
Deciphering infected cell types, hub gene networks and cell-cell communication in infectious bronchitis virus via single-cell RNA sequencing
2024-May, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012232
PMID:38743760
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性研究感染性支气管炎病毒对细胞类型和细胞间通讯的影响 | 首次系统性鉴定了特定细胞类型中表达的组织特异性分子标志物和相应的基因网络 | 未提及样本数量的具体细节及其在研究中的影响 | 探讨感染性支气管炎病毒在小鸡中的致病机制及其对免疫反应的影响 | 研究感染性支气管炎病毒感染后的肾脏、法氏囊和气管组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6131 | 2024-08-05 |
Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002633
PMID:38787797
|
研究论文 | 本文探讨了将系统发育整合到单细胞RNA测序分析中的应用,以比较物种、基因和细胞之间的联系 | 提出了将系统发育方法整合进scRNA-seq分析中,以克服物种间比较的挑战并加强基因和细胞演化假设的验证 | NA | 实现跨物种、基因和细胞的比较,揭示细胞基因表达与细胞功能演化之间的联系 | 单细胞RNA测序数据及其在不同物种和细胞中的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 系统发育树 | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6132 | 2024-08-05 |
Immunological Characteristics of Hepatic Dendritic Cells in Patients and Mouse Model with Liver Echinococcus multilocularis Infection
2024-Apr-25, Tropical medicine and infectious disease
IF:2.8Q1
DOI:10.3390/tropicalmed9050095
PMID:38787028
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研究论文 | 本文探讨了肝脏包虫感染患者和小鼠模型中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 首次系统分析了肝脏树突状细胞亚群在肝脏包虫感染中表现出的免疫表型特征 | 未深入探讨不同小鼠模型对免疫特征的影响 | 研究肝脏包虫感染微环境中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 临床包虫感染患者和小鼠模型中的肝脏树突状细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 组织样本 | 四个包虫感染患者标本和感染小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6133 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis of super-enhancer-induced LINC00862 and validation as a SIRT1-promoting factor in cervical cancer and gastric cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101982
PMID:38718436
|
研究论文 | 本研究探讨了LINC00862在多癌症中的生物学意义及其在宫颈癌和胃癌中的作用 | 揭示了LINC00862在宫颈癌和胃癌中的致癌机制,并验证了其作为生物标志物的潜力 | 未具体列出LINC00862在其他类型癌症中的作用及有效性 | 研究LINC00862在不同癌症中的表达及其与免疫疗法的关系 | 主要研究肿瘤和基质细胞中的LINC00862表达及其调控机制 | 数字病理学 | 宫颈癌与胃癌 | 染色质免疫沉淀和RNA免疫沉淀等 | NA | 生物信息学数据和单细胞测序数据 | 涉及大多数肿瘤和基质细胞的表达分析 | NA | NA | NA | NA |
| 6134 | 2024-08-04 |
Dysregulation of peripheral and intratumoral KLRG1+ CD8+T cells is associated with immune evasion in patients with non-small-cell lung cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101968
PMID:38713923
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研究论文 | 本研究探讨了KLRG1+ CD8+ T细胞在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中的免疫逃避中的作用 | 本研究首次揭示KLRG1+ CD8+ T细胞与NSCLC肿瘤免疫逃避的关联性,并提出KLRG1作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究中可能缺乏大规模样本数据来验证KLRG1的预后价值 | 研究KLRG1在非小细胞肺癌患者中的免疫调节作用 | 非小细胞肺癌患者的外周血和肿瘤组织中的KLRG1+ CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞单一测序数据 | NSCLC患者与健康供体、良性肺结节患者的对比样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6135 | 2024-08-05 |
MAPKAP1 orchestrates macrophage polarization and lipid metabolism in fatty liver-enhanced colorectal cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101941
PMID:38692197
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪肝在大肠癌进展中的机械作用,重点关注巨噬细胞极化和脂质代谢。 | 发现MAPKAP1是通过M2巨噬细胞极化和脂质代谢重编程促进大肠癌的重要基因。 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病的复杂性。 | 研究脂肪肝如何影响大肠癌的进展,特别是在巨噬细胞极化和脂质代谢方面。 | 使用小鼠脂肪肝模型以及大肠癌特异性基因MAPKAP1进行研究。 | 数字病理学 | 大肠癌 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | NA | 小鼠模型,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6136 | 2024-08-05 |
FTO elicits tumor neovascularization in cancer-associated fibroblasts through eliminating m6A modifications of multiple pro-angiogenic factors
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216911
PMID:38685450
|
研究论文 | 本研究揭示了FTO通过消除多种促血管生成因子的m6A修饰,促进癌症相关成纤维细胞(CAFs)介导的肿瘤血管生成 | 首次明确了FTO在肿瘤微环境中对CAFs介导的血管生成的作用机制 | 本研究的局限性在于未能明确m6A修饰对CAFs激活的具体作用 | 探讨FTO在CAFs介导的血管生成中的作用及机制 | 研究癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 眼睑黑色素瘤 | 单细胞转录组分析、多组学分析 | NA | mRNA | CAFs样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 6137 | 2024-08-05 |
Cardiopulmonary progenitors facilitate cardiac repair via exosomal transfer of miR-27b-3p targeting the SIK1-CREB1 axis
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13593
PMID:38185757
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研究论文 | 这篇文章探讨了心肺前体细胞在心脏修复中的作用,特别是通过外泌体转移miR-27b-3p靶向SIK1-CREB1轴来促进心脏修复 | 该研究首次揭示心肺前体细胞通过外泌体转移miR-27b-3p促进心脏修复的机制 | 研究只在小鼠模型中进行,临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 研究心肺前体细胞在缺血性心脏疾病中修复受损心脏的机制 | 本研究对象为小鼠胚胎衍生的心肺前体细胞 | 数字病理学 | 缺血性心脏病 | scRNA-seq, miRNA-seq, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 细胞, RNA | 使用E9.5小鼠胚胎获取心肺前体细胞,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6138 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a lactate metabolism-related six-gene prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05723-4
PMID:38627278
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研究论文 | 本文揭示了乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用,并构建了一个可靠的乳酸代谢相关预后标志。 | 文章首次系统性地识别和验证了与乳酸代谢相关的六个基因的预后标志,提供了新思路用于肝内胆管癌的预后评估和治疗。 | 研究对乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学功能的探索仍然有限,需要更多的临床数据来验证。 | 研究目的是明确乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用,开发预后工具。 | 研究对象为肝内胆管癌患者及其相关细胞系。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 高和低乳酸代谢相关基因得分组中的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6139 | 2024-08-04 |
Casp11 Deficiency Alters Subgingival Microbiota and Attenuates Periodontitis
2024-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231221712
PMID:38197150
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研究论文 | 本研究探讨了Caspase-11介导的非经典焦亡、亚龈微生物群变化与巨噬细胞极化之间的相互作用 | 揭示了Caspase-11在牙周炎病理生理过程中的关键作用,并强调其对亚龈微生物群和巨噬细胞M1极化的影响 | 具体机制尚不清楚,需进一步研究以验证这些发现 | 探讨Caspase-11缺失对亚龈微生物群及牙周炎的影响 | 牙周炎患者的临床样本以及实验性牙周炎小鼠模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 临床样本 | 牙周炎患者的临床样本及实验性小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6140 | 2024-08-05 |
Identification of CFH and FHL2 as biomarkers for idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1363643
PMID:38784225
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研究论文 | 本研究识别了CFH和FHL2作为特发性肺纤维化的生物标志物 | 本研究首次确认CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的诊断价值 | 该研究缺乏长期临床验证,临床适用性尚需进一步评估 | 研究CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的作用及其与免疫细胞的关系 | 特发性肺纤维化相关的关键基因及其在免疫细胞中的表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 基因微阵列分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两组数据共涉及647个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |