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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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6121 | 2024-08-04 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
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研究论文 | 本文研究了产后高血压(PPPE)中母体免疫变化及预测生物标志物的潜在性 | 发现胎盘CD163+细胞和初始妊娠期血压可作为非侵入性预测PPPE的生物标志物 | 研究样本的规模和多样性可能限制了结论的普遍性 | 理解PPPE诊断时的免疫贡献及周产期生物标志物的预测潜力 | 通过采集PPPE患者和健康对照组的胎盘和血液样本进行比较分析 | 数字病理学 | 产后高血压 | 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞内细胞因子染色 | NA | 血液样本、胎盘组织 | 涉及PPPE患者和健康对照组的样本 |
6122 | 2024-08-04 |
Identification of PANoptosis-related predictors for prognosis and tumor microenvironment by multiomics analysis in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94200
PMID:38577605
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在胶质瘤进展中的功能,并识别了预测胶质瘤预后的相关指标 | 本研究首次识别了与PANoptosis相关的四个预测因子,并建立了PANRG评分模型,与肿瘤微环境的关系得到了探讨 | 本研究的局限性在于样本数量和实验验证的范围可能不足 | 研究PANoptosis相关基因在胶质瘤中的预后预测和新治疗靶点的开发 | 胶质瘤患者的基因数据和临床样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | LASSO-Cox回归分析 | 基因数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据 |
6123 | 2024-08-05 |
Prognostic and Immune Landscape Analysis of Ubiquitination-related Genes in Hepatocellular Carcinoma: Based on Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93425
PMID:38577593
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研究论文 | 本研究分析了与泛素化相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫景观 | 本研究首次基于泛素化相关基因建立了肝细胞癌预测模型,并确定了三个关键生物标志物 | 目前仍缺乏关于泛素化相关基因在肝细胞癌免疫疗法中的实际应用验证 | 探讨泛素化相关基因在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用 | 主要研究肝细胞癌中与泛素化相关的基因及其表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,转录组差异表达分析 | 加权基因共表达网络分析,Cox回归,Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集,样本大小未具体提及 |
6124 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome reveals highly complement activated microglia cells in association with pediatric tuberculous meningitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387808
PMID:38745656
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研究论文 | 该研究揭示了与儿童结核性脑膜炎相关的高度补体激活的微胶质细胞。 | 首次在结核性脑膜炎患儿的脑脊液和外周血单核细胞中发现了33种单核细胞亚群和补体激活的微胶质细胞。 | 样本量仅为6个患儿,可能影响结果的普遍性。 | 揭示结核性脑膜炎中的免疫机制及微胶质细胞的作用。 | 研究对象为患有结核性脑膜炎的儿童及其外周血单核细胞和脑脊液细胞。 | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 6名儿童 |
6125 | 2024-08-05 |
Characteristics of T Cells in Single-Cell Datasets of Peripheral Blood and Cerebrospinal Fluid in Alzheimer's Disease Patients
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230784
PMID:38043012
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的特征 | 揭示了阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的扩展及其功能特征 | 没有提及具体的样本量和实验限制 | 探索阿尔茨海默病患者外周血和脑脊液中T细胞的潜在特征 | 阿尔茨海默病患者的外周血和脑脊液中T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 数据集(GSE181279和GSE134578) | NA |
6126 | 2024-08-05 |
Copper-binding protein modelling by single-cell transcriptome and Bulk transcriptome to predict overall survival in lung adenocarcinoma patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94588
PMID:38577594
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和大规模转录组模型预测肺腺癌患者的总体生存率 | 提出了一种新的铜结合蛋白模型,显示其在肺腺癌预后中的高预测能力 | 未提及可能的样本选择偏倚或数据集的局限性 | 旨在评估铜结合蛋白在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者的铜结合蛋白及其在生存预测中的表现 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,LASSO-Cox分析,RT-qPCR | CBPRS模型 | 转录组数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的多个队列,具体样本数量未说明 |
6127 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the retina under acute high intraocular pressure
2024-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.389363
PMID:38526288
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研究论文 | 本文分析了在急性高眼压下视网膜的单细胞RNA测序特征 | 首次揭示了高眼压下视网膜的分子变化和细胞间相互作用 | 未提及具体限制 | 探讨高眼压引起的视网膜损伤的分子机制 | 视网膜细胞,特别是视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 建立了急性高眼压的大鼠模型 |
6128 | 2024-08-04 |
Navigating colorectal cancer prognosis: A Treg-related signature discovered through single-cell and bulk transcriptomic approaches
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24214
PMID:38459654
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研究论文 | 本研究通过单细胞和大规模转录组方法发现了与Treg相关的结直肠癌预后标志 | 本研究结合了单细胞异质性和大规模转录组数据,构建了基于Treg相关特征的预后模型 | 临床应用验证尚需进一步研究,以及样本量的限制可能影响结果的普适性 | 研究结直肠癌的预后及其与调节性T细胞的关系 | 结直肠癌患者的Treg细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和大规模转录组分析 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 分析了GSE132465和GSE188711中结直肠癌的单细胞和大规模数据集 |
6129 | 2024-08-04 |
Precision unveiled: Synergistic genomic landscapes in breast cancer-Integrating single-cell analysis and decoding drug toxicity for elite prognostication and tailored therapeutics
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24205
PMID:38450906
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研究论文 | 本研究探索了与T细胞相关的基因与谷氨酰胺代谢之间的关系,以构建乳腺癌患者的预后分级指标 | 创新点在于开发了一种TRG_GM分类器,整合了临床指标,提高了乳腺癌的预后预测能力 | 缺少对多种指标结合的深入探索以揭示不同维度的预后表现 | 研究旨在通过分析基因与代谢的关系,提升乳腺癌的个性化治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者及其相关的生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 机器学习,Cox分析,Lasso算法 | NA | 基因组数据,免疫特征数据 | NA |
6130 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of bulk RNA-seq and scRNA-seq data indicates the prognostic and immunologic values of SERPINH1 in glioma
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24192
PMID:38506564
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研究论文 | 本文章探讨了SERPINH1在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 本研究首次阐明了SERPINH1在胶质瘤中的表达及其作为独立预后因素的作用 | 仅使用了在线数据库的数据,未报告临床样本的多样性 | 研究SERPINH1在胶质瘤中的潜在价值 | 胶质瘤相关的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq,qRT-PCR,免疫组织化学 | Cox回归分析 | RNA序列数据 | NA |
6131 | 2024-08-05 |
Exploring the causal relationship between antihypertensive drugs and glioblastoma by combining drug target Mendelian randomization study, eQTL colocalization, and single-cell RNA sequencing
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24210
PMID:38450887
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研究论文 | 本研究评估了抗高血压药物对神经胶质母细胞瘤的潜在因果影响 | 本研究首次结合了药物靶点孟德尔随机化研究、eQTL共定位以及单细胞RNA测序,探讨了抗高血压药物与神经胶质母细胞瘤之间的因果关系 | 需要更多的研究来验证这些发现,并进一步揭示血压与神经胶质母细胞瘤之间的复杂关系 | 评估血压和抗高血压药物对神经胶质母细胞瘤的潜在因果影响 | 针对5种抗高血压药物的研究对象,包括β-受体拮抗剂等 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序、Mendelian随机化分析 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 欧洲人群的基因组广泛关联研究(GWAS)总结统计信息 |
6132 | 2024-08-04 |
Single nucleus and spatial transcriptomic profiling of healthy human hamstring tendon
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300601RRR
PMID:38742770
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研究论文 | 本研究确定了健康人类腘绳肌肌腱中所有细胞类型的转录组和位置 | 首次在健康腘绳肌肌腱中识别了12种不同的细胞类型,包括先前未报告的不同骨骼肌细胞类型、卫星细胞、脂肪细胞和未知的神经系统细胞 | 研究只集中于四名健康供体,样本量有限 | 探讨健康腘绳肌肌腱的分子和细胞基础 | 四名健康供体的腘绳肌肌腱细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名健康供体的10,533个细胞核 |
6133 | 2024-08-04 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。 | 本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度,并识别了因果通路。 | NA | 探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。 | 主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
6134 | 2024-08-05 |
Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish†
2024-May-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae019
PMID:38288660
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研究论文 | 本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用 | 揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上,可能无法完全推广到其他物种 | 研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能 | Foxp2缺失的斑马鱼模型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼 |
6135 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq data analysis reveals functionally relevant biomarkers of early brain development and their regulatory footprints in human embryonic stem cells (hESCs)
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae230
PMID:38739758
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类胚胎干细胞中的早期神经发育相关生物标志物及其调控网络 | 该文章揭示了539个差异表达基因及其在早期人脑发育中的功能角色,并构建了基因调控网络 | 研究中所使用的样本主要来自体外分化的胚胎干细胞,可能无法完全代表完整的生物体内发育过程 | 识别早期神经发育中的差异表达基因及其分子机制 | 人类胚胎干细胞在不同发育阶段的差异表达基因 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在hESC分化为神经元的体外实验中,共分析了26天(D26)和54天(D54)时的样本 |
6136 | 2024-08-04 |
Preparation of High-Viability Single-Cell Suspensions from African Turquoise Killifish Brain Tissue
2024-02-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107829
PMID:36931736
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research paper | 本研究描述了如何从非洲蓝色杀鱼的脑组织中准备高活性的单细胞悬液 | 本研究创新性地提供了一种从新兴模型生物制备高活性单细胞悬液的协议 | 未提及该方法在其他物种或组织中的适用性 | 本研究的目的是为单细胞测序准备高活性的单细胞悬液 | 非洲蓝色杀鱼的脑组织 | NA | NA | 酶解与机械解离 | NA | NA | 研究成功用于非洲蓝色杀鱼的10× Genomics单细胞测序实验 |
6137 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
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研究论文 | 本研究揭示了胰管细胞在糖尿病相关炎症中的潜在介导作用 | 首次识别出在炎症环境中胰管细胞亚群表现出独特的促炎症信号 | 研究未明确揭示胰管细胞与其他免疫细胞之间的具体相互作用 | 探索暴露于炎症环境中的原代人胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
6138 | 2024-08-05 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 这项研究利用生物信息学方法揭示了Shelian胶囊对肝细胞癌的潜在机制 | 通过机器学习算法和网络分析确定了四个特征基因,提供了对Shelian胶囊潜在药理机制的初步见解 | 未在临床环境中直接验证所发现的机制 | 研究Shelian胶囊在治疗肝细胞癌中的潜在机制 | 肝细胞癌相关疾病基因和Shelian胶囊的生物活性成分 | 数字病理学 | 肝癌 | 机器学习算法,生物信息学 | NA | 基因表达数据 | 153种成分和170个候选靶点,494个HCC相关疾病基因 |
6139 | 2024-08-05 |
Single cell analysis of short-term dry eye induced changes in cornea immune cell populations
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1362336
PMID:38560382
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研究论文 | 本研究评估了干眼如何改变角膜免疫细胞群体的比例和转录特征 | 通过单细胞RNA测序揭示了干眼条件下角膜免疫细胞的转录谱变化 | 未提及具体的临床试验或长期跟踪研究 | 探究干眼对角膜免疫细胞影响的机制 | 角膜中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 干眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二种角膜免疫细胞群体 |
6140 | 2024-08-04 |
Loss of PBX1 function in Leydig cells causes testicular dysgenesis and male sterility
2024-May-09, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05249-5
PMID:38724675
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研究论文 | 本文研究了PBX1在莱迪格细胞分化和睾酮产生中的作用 | 发现PBX1是小鼠莱迪格细胞分化和睾酮产生的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类 | 探讨PBX1在莱迪格细胞功能和生育中的作用 | 小鼠的莱迪格细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠 |