单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7518 篇文献，本页显示第 6081 - 6100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6081 | 2024-08-05 |
Single-cell mtDNA dynamics in tumors is driven by coregulation of nuclear and mitochondrial genomes
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01724-8
PMID:38741018
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研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤中细胞间线粒体DNA (mtDNA) 副本数量和基因型的变化及其表型和演化后果 | 采用无扩增的单细胞全基因组测序技术，揭示了mtDNA和nuDNA之间的共同调控关系 | 研究主要集中于细胞系和患者衍生的异种移植模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究肿瘤中mtDNA副本数量的变异及其与细胞大小的关系 | 从来自永生细胞系、患者衍生异种移植和原发人类肿瘤的72,275个单细胞中进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞全基因组测序（DLP+） | NA | 基因组数据 | 72,275个单细胞 |
| 6082 | 2024-08-04 |
A transcriptomics-based RNAi screen for regulators of meiosis and early stages of oocyte development in Drosophila melanogaster
2024-04-03, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkae028
PMID:38333961
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研究论文 | 该研究通过转录组学方法识别果蝇卵巢中与减数分裂和早期卵母细胞发育相关的调控基因 | 采用转录组学分析结合已发表的单细胞RNA-seq数据，找到2743个共表达基因，其中许多与减数分裂和卵母细胞发育相关 | 研究主要集中在已知的基因上，可能忽略了其他未被充分阐明的基因的功能 | 识别早期卵母细胞发育和减数分裂中涉及的基因 | 以果蝇卵巢为对象，分析早期发育过程中的基因表达与功能 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | 分析了3个已发表的单细胞RNA-seq数据集，共测试了526条RNAi线路 |
| 6083 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals tumoral microenvironment heterogenicity and hypervascularization in human carotid body tumor
2024-Apr, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31175
PMID:38214142
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研究论文 | 本研究对人类颈动脉体瘤的单细胞转录组进行分析，揭示了肿瘤微环境的异质性和高血管生成特征 | 首次对颈动脉体瘤的单细胞转录组进行全面特征描述，提供了形成机制的新见解 | 尚未提及研究的具体限制 | 解析颈动脉体瘤的微环境组成及分子复杂性 | 人类颈动脉体瘤的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6084 | 2024-08-05 |
State transition and intercellular communication of synovial fibroblasts in response to chronic and acute shoulder injuries unveiled by single-cell transcriptomic analyses
2024-01, Connective tissue research
IF:2.8Q1
DOI:10.1080/03008207.2023.2295322
PMID:38090785
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研究论文 | 本研究揭示了滑膜成纤维细胞在慢性与急性肩部损伤反应中的状态转变和细胞间通讯的异质性 | 首次利用单细胞转录组学分析揭示了肩部滑膜成纤维细胞的异质性及其细胞状态转变的潜力 | 研究未明确提及样本的具体来源及数量限制 | 探讨滑膜成纤维细胞的异质性及其在细胞状态转变中的潜力 | 滑膜成纤维细胞及其在肩部慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折中的作用 | 数字病理学 | 肩部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及慢性旋转袖撕裂和急性近端肱骨骨折患者的样本 |
| 6085 | 2024-08-04 |
Evaluation of novel promoters for vascular tissue-specific gene expression in Populus
2024-Jul, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112083
PMID:38588982
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研究论文 | 该研究评估了用于水分组织特异性基因表达的新型启动子 | 首次识别了三种特定于水分组织的基因并克隆了其启动子，促进了森林树木的精准育种 | 研究只集中于三种特定基因的启动子，未涉猎其他可能影响基因表达的因素 | 开发针对森林树木的特定启动子以实现精准设计和育种 | 三种在杨树中水分组织特异性表达的基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 涉及'84K'杨树的三个基因启动子 |
| 6086 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell transcriptome and T cell receptor profiling reveals defects of T cell exhaustion in pulmonary tuberculosis
2024-Jun, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2024.106158
PMID:38642678
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和T细胞受体分析揭示了肺结核中T细胞耗竭的缺陷。 | 首次探索了肺结核中T细胞耗竭的功能障碍，并揭示了CD8+ T细胞的耗竭水平显著降低。 | 未能完全明确慢性炎症的性质和免疫抑制细胞的特定作用 | 探讨肺结核中T细胞耗竭的功能障碍及其可能的影響 | 研究了肺结核患者中的T细胞耗竭响应与免疫抑制细胞 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6087 | 2024-08-04 |
High-throughput mechanical phenotyping and transcriptomics of single cells
2024-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48088-5
PMID:38760380
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研究论文 | 本文描述了一种基于电穿孔的细胞表面张力和转录组学的方法ELASTomics | ELASTomics结合了细胞机械表征与转录组筛选，提供了前所未有的单细胞分辨率 | NA | 研究细胞表面机械特性与转录调控的关系 | 癌细胞系及来自小鼠造血祖细胞的细胞谱系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 电穿孔 | NA | 转录组数据 | 多个癌细胞系 |
| 6088 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic landscape and the microenvironment of normal adjacent tissues in hypopharyngeal carcinoma
2024-May-17, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10321-2
PMID:38760729
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研究论文 | 本文探讨了低咽癌正常邻近组织的单细胞转录组特征及其微环境 | 研究揭示了低咽癌正常邻近组织中不同细胞的转录组信息和肿瘤微环境的影响 | 对疾病样本的异质性和转录组特征的全面评估尚待深入探索 | 研究低咽癌正常邻近组织的单细胞转录组特点 | 低咽癌患者的正常邻近组织中的细胞 | 数字病理学 | 低咽癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 来自五名捐献者的39,315个高质量细胞 |
| 6089 | 2024-08-05 |
Single cell RNA sequencing reveals immunomodulatory mechanism of stem cell factor and granulocyte colony-stimulating factor treatment in the brains of aged APP/PS1 mice
2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.09.593359
PMID:38766064
|
研究论文 | 这项研究探讨了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子治疗对老年APP/PS1小鼠大脑中免疫调节机制的影响 | 首次通过转录组学方法揭示SCF和G-CSF组合增强老年APP/PS1小鼠大脑修复的机制 | 未详细讨论其他可能影响结果的外部因素 | 研究SCF+G-CSF治疗如何改变老年APP/PS1小鼠大脑中小胶质细胞和单核/巨噬细胞的功能 | 28个月大的APP/PS1小鼠大脑中的CD11b小胶质细胞和单核/巨噬细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 通过流式细胞术识别的大量CD11b小胶质细胞和单核/巨噬细胞 |
| 6090 | 2024-08-05 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable genes from spatial transcriptomic data
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592851
PMID:38765956
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研究论文 | 介绍了一种名为scBSP的工具，该工具用于从空间转录组数据中识别空间可变基因 | scBSP通过稀疏矩阵操作显著提高了计算效率，能够在短时间内处理大规模空间转录组数据 | NA | 提高从空间转录组数据中识别空间可变基因的效率和准确性 | 空间转录组数据中的空间可变基因 | 数字病理学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 处理了19,950个基因在181,367个点上的数据 |
| 6091 | 2024-08-04 |
Unraveling the genetic architecture of blood unfolded p-53 among non-demented elderlies: novel candidate genes for early Alzheimer's disease
2024-May-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10363-6
PMID:38702606
|
研究论文 | 本文探讨了与血液U-p53相关的遗传变异，以识别早期阿尔茨海默病相关的新基因。 | 首次通过GWAS研究血液U-p53，揭示了与早期阿尔茨海默病相关的新基因座和通路。 | 样本仅限于健康和轻度认知受损个体，可能限制了结果的广泛适用性。 | 旨在识别血液U-p53相关的遗传变异，以促进早期阿尔茨海默病的诊断。 | 研究对象为484名来自ADNI队列的健康与轻度认知受损个体。 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 基因组关联研究（GWAS） | NA | 血液数据 | 484名健康和轻度认知受损个体 |
| 6092 | 2024-08-05 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
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研究论文 | 本文描述了一种处理新鲜骨组织样本以生成空间转录组学数据的方法 | 提出了一种新方法，通过去钙处理保持组织形态学细节，成功生成高质量的空间转录组数据 | 该方法对硬组织的应用仍然面临挑战，可能不是所有硬组织样本均适用 | 研究空间转录组学在骨组织分析中的应用 | 新鲜获得的骨组织样本和来自组织库的甲醇包埋样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 来自骨肉瘤的原发肿瘤和肺转移样本的组织库样本 |
| 6093 | 2024-08-05 |
Molecular mechanism of radiation tolerance in lung adenocarcinoma cells using single-cell RNA sequencing
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18378
PMID:38760895
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研究论文 | 本文探讨了肺腺癌细胞对放射治疗耐受性的分子机制。 | 识别了与放射耐受性相关的两个细胞亚群，并探讨了其基因突变的初步情况。 | 研究主要依赖公共数据库的数据，可能存在数据偏差。 | 探索肺腺癌放射耐受性的分子机制，以改善临床治疗效果。 | 聚焦于肺腺癌细胞及其亚群体对放射治疗的反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用多个公共数据库中的单细胞数据 |
| 6094 | 2024-08-07 |
PRPF19 could serve as a prognostic biomarker for patients with bladder cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-May, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.01.064
PMID:38245411
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6095 | 2024-08-05 |
DNA G-Quadruplex in NRP1 Promoter Facilitates SARS-CoV-2 Infection
2024-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084422
PMID:38674009
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研究论文 | 本文探讨了DNA G-四链体在NRP1启动子中的作用如何促进SARS-CoV-2感染。 | 揭示了G-四链体在SARS-CoV-2感染中的新机制，以及其对NRP1表达和病毒进入细胞的重要性。 | 未详细讨论G-四链体干预的潜在效果及其在不同细胞类型中的普适性。 | 研究G-四链体在宿主因子NRP1启动子中的作用及其对SARS-CoV-2感染的影响。 | 重点研究NRP1启动子中的G-四链体，并分析其对SARS-CoV-2感染的促进作用。 | 数字病理学 | NA | 生物信息学、生化分析和生物学测定 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从人类支气管上皮细胞中获得的模拟SARS-CoV-2感染的单细胞数据 |
| 6096 | 2024-08-04 |
Upregulation of EMR1 (ADGRE1) by Tumor-Associated Macrophages Promotes Colon Cancer Progression by Activating the JAK2/STAT1,3 Signaling Pathway in Tumor Cells
2024-Apr-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25084388
PMID:38673975
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞如何通过激活JAK2/STAT1,3信号通路促进结肠癌的进展。 | 揭示了EMR1在结肠癌中的作用及其与巨噬细胞的信号相互作用的机制。 | 此研究未探讨其他可能的信号通路对结肠癌进展的影响。 | 研究EMR1及其与巨噬细胞的信号相互作用在结肠癌进展中的作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞和结肠癌细胞。 | 数字病理学 | 结肠癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | pT3微卫星不稳定结肠癌组织 |
| 6097 | 2024-08-04 |
Cis-regulatory control of transcriptional timing and noise in response to estrogen
2024-May-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100542
PMID:38663407
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研究论文 | 该研究探讨了顺式调控元件在雌激素响应中的转录时间和噪音控制 | 首次结合使用单细胞RNA测序和机器学习方法，揭示了活跃增强子与基因转录时间和噪音之间的关系 | 对调控特性的综合理解仍不完全，可能需更深入的机制研究 | 研究雌激素对转录水平、时间动态和转录噪音的影响 | 单细胞RNA-seq技术下的雌激素处理细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 6098 | 2024-08-05 |
Unified cross-modality integration and analysis of T cell receptors and T cell transcriptomes by low-resource-aware representation learning
2024-May-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100553
PMID:38688285
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研究论文 | 提出了UniTCR，一个新的低资源感知的多模态表示学习框架，用于统一跨模态集成。 | 该框架设计了双模态对比学习模块和单模态保留模块，有效地将每种模态嵌入共同的潜在空间。 | 未提及具体的限制条件 | 研究T细胞异质性，通过跨模态数据的整合推动免疫学研究。 | 研究对象为T细胞受体和T细胞转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和T细胞受体测序(TCR-seq) | 对比学习 | 多模态数据 | 多个配对的scRNA-seq/TCR-seq数据集 |
| 6099 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing reveals distinct immune cell features in cutaneous lesions of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid
2024-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110219
PMID:38631594
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了天疱疮和大疱性类天疱疮皮肤损伤中的免疫细胞特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞VDJ测序详细分析了BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞组成和状态 | 对皮肤损伤中的免疫特征的认识仍然有限，可能需要更大的样本量和其他生物标志物的验证 | 探究BP和PV皮肤损伤中的免疫细胞特征和转录谱 | 大疱性类天疱疮和天疱疮患者的皮肤病变 | 数字病理学 | 大疱性类天疱疮，天疱疮 | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ测序 | NA | 细胞转录组数据 | 涉及BP和PV患者的皮肤损伤样本 |
| 6100 | 2024-08-04 |
Cell-mediated cytotoxicity within CSF and brain parenchyma in spinal muscular atrophy unaltered by nusinersen treatment
2024-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48195-3
PMID:38750052
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研究论文 | 这篇文章探讨了在脊髓性肌萎缩症(SMA)中细胞介导的细胞毒性及首个抗体nusinersen治疗的影响 | 该研究首次通过单细胞转录组学揭示了SMA患者脑脊液中的NK细胞和CD8+ T细胞扩张以及与疾病相关的细胞毒性特征 | 样本数量较小，且未能在nusinersen治疗后观察到具体的免疫反应变化 | 本研究旨在探索脊髓性肌萎缩症中的局部免疫反应及其对nusinersen治疗的影响 | 研究对象包括SMA患者和对照组的脑脊液样本 | 自然语言处理 | 脊髓性肌萎缩症 | 单细胞转录组学，多重免疫组织化学 | NA | 脑脊液样本 | SMA: N = 9 对照组: N = 9 |