单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7518 篇文献，本页显示第 6061 - 6080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6061 | 2024-08-05 |
Mendelian Randomization and Transcriptomic Analysis Reveal the Protective Role of NKT Cells in Sepsis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S459706
PMID:38774448
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研究论文 | 本研究揭示了NKT细胞在脓毒症中的保护作用及其与28天死亡率的关系 | 首次通过孟德尔随机化分析揭示NKT细胞在脓毒症中的保护作用，并发现了独特的FOS+NKT亚型 | 未能探索NKT细胞在脓毒症中的具体机制 | 研究NKT细胞在脓毒症中的角色及其对28天死亡率的影响 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化分析 | 基因组数据 | 115名脓毒症患者 |
| 6062 | 2024-08-05 |
Exploring dendritic cell subtypes in cancer immunotherapy: unraveling the role of mature regulatory dendritic cells
2024, Upsala journal of medical sciences
IF:1.5Q2
DOI:10.48101/ujms.v129.10627
PMID:38716077
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综述 | 本文探讨了树突细胞在癌症免疫治疗中的亚型及成熟调节树突细胞的作用 | 文章通过单细胞RNA测序分析揭示了树突细胞的表型获取、转录状态和功能程序的最新研究成果 | 文章未提及具体的实验研究和数据支持 | 研究树突细胞在肿瘤免疫微环境中的功能和激活 | 重点研究树突细胞亚型及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 6063 | 2024-08-05 |
NK Cell-Monocyte Cross-talk Underlies NK Cell Activation in Severe COVID-19
2024-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300731
PMID:38578283
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研究论文 | 这篇文章探讨了重症COVID-19患者外周血中的NK细胞与单核细胞之间的相互作用及其对NK细胞激活和功能障碍的影响 | 首次结合了细胞间通讯分析与体外原代细胞共培养实验，以揭示COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 仅在体外模型中进行验证，尚未在活体系统中进行全面观察 | 了解重症COVID-19中NK细胞功能障碍的机制 | 重症COVID-19患者的NK细胞和单核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 细胞数据 | 健康供体的NK细胞与来自重症COVID-19患者或健康供体的单核细胞共培养 |
| 6064 | 2024-08-04 |
Transcriptomic profiling and regulatory pathways of cardiac resident macrophages in aging
2024-May-20, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05235-x
PMID:38763956
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研究论文 | 本研究探讨了衰老对心脏常驻巨噬细胞的转录组特征及其调控通路 | 揭示了衰老过程中心脏常驻巨噬细胞亚群的功能差异，特别是 CCR2 巨噬细胞在炎症反应中的作用 | 仅使用了老鼠模型，结果可能不适用于人类 | 探究衰老对心脏常驻巨噬细胞的影响及其与心血管疾病的关系 | 老龄小鼠的心脏常驻巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | Smart-Seq | NA | 基因表达数据 | 20 个月大的老鼠 |
| 6065 | 2024-08-05 |
Decoding the complexity of delayed wound healing following Enterococcus faecalis infection
2024-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.95113
PMID:38767331
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研究论文 | 本文研究了肠球菌感染后延迟伤口愈合的复杂性 | 通过单细胞RNA测序创建了感染伤口的综合单细胞图谱，揭示了感染时细胞和转录组的独特变化 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能限制了对人类伤口愈合的直接适用性 | 探讨肠球菌感染对伤口愈合过程的影响和分子机制 | 对比感染与未感染的伤口，分析超过23000个细胞的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞转录组数据 | 超过23000个细胞 |
| 6066 | 2024-08-07 |
Correction: ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2024-May-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00517-3
PMID:38769580
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6067 | 2024-08-05 |
[Dental pulp stem cells in tooth regeneration: advancement and emerging directions]
2024-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文回顾了牙髓干细胞和人类脱落乳牙干细胞在牙齿再生中的应用。 | 提出了单细胞RNA测序和器官样培养系统在精准和可控再生中的应用潜力。 | 再生效率不稳定，仍需进一步研究。 | 探讨牙齿再生领域的最新进展和临床转化应用。 | 牙髓干细胞(DPSC)和人类脱落乳牙干细胞(SHED)。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 6068 | 2024-08-05 |
Blimp-1 and c-Maf regulate immune gene networks to protect against distinct pathways of pathobiont-induced colitis
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01814-z
PMID:38609547
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Blimp-1和c-Maf如何共同调控IL-10来保护免疫网络，防止由病原体引起的结肠炎。 | 揭示了Blimp-1和c-Maf在调控IL-10以及抑制促炎细胞因子中的共同作用，提供了新的见解 | 研究未深入探讨其他转录因子的影响和机制 | 研究Blimp-1和c-Maf在肠道免疫反应中的作用 | 小鼠模型，特别是双缺失Prdm1MafCd4小鼠与感染的反应 | 数字病理学 | 肠道炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，RNA测序，ATAC测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠样本涉及不同基因缺失类型 |
| 6069 | 2024-08-05 |
Thioredoxin is a metabolic rheostat controlling regulatory B cells
2024-May, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01798-w
PMID:38553615
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研究论文 | 本研究揭示了硫氧还蛋白在调节性B细胞分化和功能中的角色 | 首次揭示了硫氧还蛋白通过调节线粒体电子运输和活性氧水平影响调节性B细胞的分化与功能 | 研究主要集中于系统性红斑狼疮患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索调节性B细胞分化和功能的代谢需求 | 研究调节性B细胞的代谢过程及其在系统性红斑狼疮中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 6070 | 2024-08-04 |
Identification of ligand and receptor interactions in CKD and MASH through the integration of single cell and spatial transcriptomics
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302853
PMID:38768139
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和空间转录组学，识别慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的配体-受体相互作用 | 创建了一个整合分析框架，以更全面地分析在慢性肾病和MASH中的细胞特异性配体-受体相互作用 | 研究主要基于两个人体群体的数据，可能存在样本偏倚 | 探索慢性肾病和MASH中细胞特异性配体-受体相互作用的分子机制 | 主要研究细胞之间的配体-受体相互作用 | 数字病理学 | 慢性肾病和代谢功能障碍相关脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 两个可用的人体队列 |
| 6071 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome revealed dysregulated RNA-binding protein expression patterns and functions in human ankylosing spondylitis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1369341
PMID:38770048
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研究论文 | 本研究探讨了强直性脊柱炎（AS）不同免疫细胞类型中 RNA 结合蛋白（RBP）的表达特征和调控模式。 | 揭示了 AS 患者不同免疫细胞中 RBP 的特定表达特点及其在病理过程中的关键作用。 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 研究 RBPs 在强直性脊柱炎发生和发展中的潜在关键作用。 | 研究对象为健康对照组（HC）和强直性脊柱炎（AS）患者的外周血单核细胞（PBMC）样本。 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | scRNA-seq 和大规模 RNA-seq | NA | RNA 数据 | HC 29 例，AS 10 例，此外还有 NC 3 例，AS 5 例 |
| 6072 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing to Identify an Immunogenic Cell Death-Related 5-Gene Prognostic Signature in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S449419
PMID:38770169
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，识别出与免疫原性细胞死亡相关的5基因预后标志在肝细胞癌中的应用 | 提出了一种新的预后模型，基于免疫原性细胞死亡相关基因的表达来评估HCC患者对免疫治疗的敏感性 | 研究可能受到样本数量和来源的限制，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨免疫原性细胞死亡相关基因在肝细胞癌中的作用及其与预后的关系 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境中的细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了肝细胞癌样本及细胞系进行验证 |
| 6073 | 2024-08-04 |
NTCdb: Single-cell transcriptome database of human inflammatory-associated diseases
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.057
PMID:38765608
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研究论文 | 提出了一个人类炎症相关疾病的单细胞转录组数据库NTCdb | 集成了来自17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞的开放数据，填补了关于免疫细胞数据的空白 | 目前数据库可能仍缺乏广泛的临床样本或特定疾病的细胞数据 | 建立一个关于炎症相关疾病的单细胞转录组数据库，以支持疾病机制的研究 | 单细胞转录组数据，特别是来自炎症相关疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 来源于17种炎症相关疾病的1,023,166个细胞 |
| 6074 | 2024-08-05 |
Integration of multiomics analyses reveals unique insights into CD24-mediated immunosuppressive tumor microenvironment of breast cancer
2024-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01882-9
PMID:38622285
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研究论文 | 本研究揭示了CD24介导的乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的独特见解 | 使用多组学分析方法深入探索了CD24与免疫细胞的相互作用及其对预后模型的影响 | 未探讨所有可能的免疫标志物，可能限制了研究的全面性 | 探讨CD24在乳腺癌中的免疫调节作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | CD24相关基因及其与免疫细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq和MQIF | 机器学习预后模型 | 基因表达数据 | 基于 bulk RNA-seq 数据构建的风险模型包含1488个差异基因 |
| 6075 | 2024-08-04 |
IGF2BP3 promotes glutamine metabolism of endometriosis by interacting with UCA1 to enhances the mRNA stability of GLS1
2024-May-17, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00834-7
PMID:38760723
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研究论文 | 本研究探讨了IGF2BP3在内膜异位症中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了IGF2BP3与UCA1相互作用并增强GLS1 mRNA稳定性对谷氨酰胺代谢的影响。 | 该研究主要在体外和小动物模型中进行，可能无法完全反映人类病理特征。 | 研究IGF2BP3对内膜异位症发生和发展的影响及其分子机制。 | 内异症相关的间质细胞及其谷氨酰胺代谢的相关过程。 | 数字病理学 | 内膜异位症 | RNA免疫沉淀、RNA拉下实验、荧光原位杂交、单细胞空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 异位内膜病变与正常内膜组织的比较分析 |
| 6076 | 2024-08-04 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-May-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
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研究论文 | 本研究旨在识别与脓毒症相关的线粒体基因并进行分析 | 首次发现四个与脓毒症生存负相关的线粒体基因，提供了脓毒症免疫机制的新见解 | 样本量较小，仅涉及20例脓毒症和12例系统性炎症反应综合征 | 阐明脓毒症患者的线粒体基因机制并为临床治疗提供新思路 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合征患者的外周血细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 32个患者（20例脓毒症，12例SIRS） |
| 6077 | 2024-08-05 |
Four centrosome-related genes to predict the prognosis and drug sensitivity of patients with colon cancer
2024-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i5.1908
PMID:38764831
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研究论文 | 本研究探索了中心体相关基因在结肠癌中的作用。 | 构建了一个由四个基因组成的中心体相关预后特征，能够准确预测结肠癌患者的预后。 | 未详细说明研究的限制因素。 | 研究中心体相关基因在结肠癌中的作用及其对预后的预测能力。 | 结肠癌患者及其相关的中心体相关基因。 | 生物信息学 | 结肠癌 | 生物信息学分析 | Cox回归模型 | 基因组数据 | 726个中心体相关基因 |
| 6078 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-sequencing data reveal molecular subtypes based on lactylation-related genes and prognosis and therapeutic response in glioma
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30726
PMID:38765164
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸化在胶质瘤中的作用，建立了基于乳酸化相关基因的分子亚型和预后模型 | 首次结合单细胞和散装RNA测序数据，识别出基于乳酸化相关基因的胶质瘤分子亚型及其预后关联 | 本研究的数据主要来源于公共数据库，可能存在样本偏差及外部验证缺乏的问题 | 研究乳酸化在胶质瘤中的作用，识别分子亚型及其预后意义 | 胶质瘤患者，重点关注乳酸化相关基因的表达与生存预测 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类 | 基因表达数据 | NA |
| 6079 | 2024-08-05 |
Identifying the miRNA-gene networks contributes to exploring paravertebral muscle degeneration's underlying pathogenesis and therapy strategy
2024-May-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30517
PMID:38765163
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研究论文 | 本研究探讨了与脊椎旁肌肉退化相关的miRNA-基因网络及其潜在病理机制和治疗策略 | 通过构建miRNA-基因网络，揭示了脊椎旁肌肉退化的病理过程，提供了新的诊断和治疗方法 | 尚未详尽说明miRNA-mRNA之间具体的调控机制 | 探索脊椎旁肌肉退化的病理机制与治疗策略 | 聚焦于脊椎旁肌肉退化与低背痛的关系 | 数字病理学 | 低背痛 | RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及多个免疫细胞及76个差异表达基因和106个差异表达miRNA |
| 6080 | 2024-08-04 |
A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01687-w
PMID:38627596
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研究论文 | 本研究生成了小鼠胆汁淤积损伤和修复过程中的高分辨率时空基因表达图谱 | 结合空间增强分辨率组学测序和单细胞转录组学，揭示了胆管细胞驱动信号在损伤-修复反应中的关键作用 | 没有明确提到本研究的具体局限性 | 探索胆汁淤积损伤中细胞动态和分子机制，以期为胆道疾病的发展提供治疗途径 | 小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 空间增强分辨率组学测序，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中进行的实验，具体样本数量未给出 |