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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6061 | 2024-08-05 |
Meiotic transcriptional reprogramming mediated by cell-cell communications in humans and mice revealed by scATAC-seq and scRNA-seq
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过scATAC-seq和scRNA-seq揭示了人类和小鼠中的减数分裂转录重编程受到细胞间通讯的介导 | 首次展示了精原细胞在减数分裂早期阶段重编程的转录变化以及Sertoli细胞与生殖细胞之间信号的角色 | 对减数分裂调控机制的深入了解仍然有限,需要更多研究来确认发现 | 研究减数分裂过程中转录重编程的机制及其与生殖细胞功能的关系 | 人类和小鼠的精巢组织中的减数分裂细胞 | 数字病理学 | 无阻塞性无精症 | scATAC-seq和scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 人类和小鼠的精巢组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6062 | 2024-08-04 |
Clinically relevant molecular hallmarks of PFA ependymomas display intratumoral heterogeneity and correlate with tumor morphology
2024-01-24, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02682-x
PMID:38265527
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研究论文 | 本文探讨了后颅窝A型(PF-EPN-A)ependymoma的分子特征及其肿瘤内部异质性与肿瘤形态之间的关联。 | 研究揭示了PF-EPN-A肿瘤内部的异质性以及其与肿瘤形态的临床相关性,尤其在细胞密度及其不同区域的DNA甲基化差异方面。 | 研究主要集中在113个样本,可能无法全面代表所有PF-EPN-A病例的分子特征。 | 识别PFA ependymomas中形态不同区域的分子差异及其临床意义。 | 分析113个PF-EPN-A样本以及40个相关复发样本。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数分析和原位荧光杂交(FISH) | NA | 组织样本 | 113个PF-EPN-A样本,包括40个复发样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6063 | 2024-08-05 |
Novel lissencephaly-associated NDEL1 variant reveals distinct roles of NDE1 and NDEL1 in nucleokinesis and human cortical malformations
2024-01-09, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02665-y
PMID:38194050
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研究论文 | 该研究识别了第一个与大脑皮层发育不良相关的NDEL1变异,并阐明了NDE1和NDEL1在细胞核运动和人类皮层畸形中的不同作用 | 首次识别了与大脑皮层回归症相关的NDEL1变异,揭示了NDE1和NDEL1在细胞核运动中的独特角色 | 未涉及NDEL1变异在其他类型发育不良中的潜在作用 | 研究NDE1和NDEL1在神经细胞迁移和皮层畸形发病机制中的作用 | 两个携带相同de novo体细胞马赛克NDEL1变异的患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | NA | 两个患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6064 | 2024-08-04 |
A pan-cancer single-cell transcriptional analysis of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372432
PMID:38903527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析肿瘤微环境中的抗原呈递癌相关成纤维细胞(apCAFs) | 首次深入解析了apCAFs在不同实体肿瘤类型中的作用及其与抗肿瘤效应的关系 | 研究主要依赖公共数据库的数据,可能存在数据的偏倚或不完整 | 探讨apCAFs在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 不同类型实体肿瘤中的抗原呈递癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9种不同类型的实体肿瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6065 | 2024-08-05 |
Retinal ganglion cell type-specific expression of synuclein family members revealed by scRNA-sequencing
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.95598
PMID:38903914
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了视网膜神经节细胞中突触素家族成员的表达模式和作用 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析视网膜细胞中突触素的表达,专注于视网膜神经节细胞亚型 | 对于突触素家族成员在视网膜中的确切位置和作用仍缺乏全面理解 | 研究突触素家族成员在视网膜神经节细胞中的表达模式 | 健康和受伤视网膜中的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 人类、鼠和鸡的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6066 | 2024-08-05 |
Immune cell related signature predicts prognosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk-RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1370801
PMID:38903709
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研究论文 | 该文章探讨了免疫细胞相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后作用。 | 文章创新性地提出了一个由免疫相关基因构成的预后模型,识别出CTSC、ALOX12和RMND5B作为与预后相关的基因。 | 文章没有详细说明样本的多样性和选择偏倚的可能性。 | 研究食管鳞状细胞癌中免疫细胞相关基因的作用及其对预后的影响。 | 主要研究对象为食管鳞状细胞癌患者的免疫细胞相关基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序与大规模RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 数据来源于多个公共数据库,总计分析了3915个DEGs | NA | NA | NA | NA |
| 6067 | 2024-08-05 |
Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination
2024-Jun-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92844
PMID:38873887
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研究论文 | 该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态 | 首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态,并在体内定位 | 目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚 | 探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态 | 小鼠胚胎中的神经脊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 6068 | 2024-08-05 |
Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure
2024-Jun, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2024.03.001
PMID:38899223
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研究论文 | 本文探讨了肾脏特定细胞类型在调节人类血压中的作用 | 首次确认肌成纤维细胞在血压调节中的重要性,并通过多组独立数据进行了验证 | 研究仅集中于特定成人群体,可能不适用于其他人群 | 探讨肾脏中细胞类型如何影响血压的基因调控 | 主要研究肌成纤维细胞和内皮细胞在血压调节中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据和单细胞转录组数据 | 1028980名欧洲血统成年人和14个成熟人类肾脏的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6069 | 2024-08-05 |
Overexpressed KCNK1 regulates potassium channels affecting molecular mechanisms and biological pathways in bladder cancer
2024-Apr-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01844-1
PMID:38689322
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研究论文 | 本研究旨在探讨KCNK1在膀胱癌中的表达、分子机制及其生物功能 | 首次揭示KCNK1在膀胱癌中的过表达及其在三维空间中的复杂转录调控网络 | 未在不同种族或其他类型癌症中验证KCNK1的角色 | 研究KCNK1在膀胱癌中的作用及其潜在分子机制 | 膀胱癌患者的KCNK1表达及其与临床特征的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、ATAC-seq、ChIA-PET | NA | mRNA、蛋白质、免疫组化数据 | 外部样本1486,内部样本245 | NA | NA | NA | NA |
| 6070 | 2024-08-05 |
The CDK9 inhibitor enitociclib overcomes resistance to BTK inhibition and CAR-T therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jun-18, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00589-7
PMID:38886769
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研究论文 | 该文章探讨了CDK9抑制剂enitociclib对抗MCL中的BTK抑制和CAR-T疗法的耐药性 | 研究表明CDK9是双重耐药样本中上调基因的关键成分,提出针对CDK9的治疗可能有效对抗耐药性 | 尚未提及临床试验的数据和对其他类型淋巴瘤的适用性 | 研究新疗法以克服对BTK抑制和CAR-T治疗的耐药性 | 主要研究了mantle cell lymphoma (MCL) 的耐药性以及enitociclib的疗效 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞系 | 涉及MCL和弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 6071 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing unveils extensive intratumoral heterogeneity of cancer/testis antigen expression in melanoma and lung cancer
2024-Jun-17, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008759
PMID:38886115
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤和肺癌中癌/睾丸抗原表达的广泛肿瘤内异质性 | 首次使用单细胞mRNA测序详细描述了肿瘤内癌/睾丸抗原表达的异质性,特别是在黑色素瘤和肺癌中 | 虽然研究揭示了广泛的异质性,但肺癌中只在五个肿瘤中发现一个肿瘤的均匀表达,因此发现可能不足 | 研究癌/睾丸抗原在黑色素瘤和肺癌中的表达异质性及其对免疫治疗的影响 | 临床获得的黑色素瘤和肺癌样本中的癌细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤; 肺癌 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA表达数据 | 临床衍生样本中的多肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6072 | 2024-08-05 |
PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development
2024-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49342-6
PMID:38858353
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研究论文 | 该文章全面阐述了新生子宫在单细胞分辨率下的动态发展,及PR-SET7在子宫内干扰素应答和细胞死亡中的作用 | 揭示了PR-SET7通过催化H4K20me1对新生子宫基质发展进行表观遗传调控的机制 | 研究未明确探讨PR-SET7在其他阶段或不同生理条件下的作用 | 阐明PR-SET7在新生子宫基质发育中的表观遗传调控作用 | 新生子宫基质及其细胞群体 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6073 | 2024-08-04 |
KLRB1 defines an activated phenotype of CD4+ T cells and shows significant upregulation in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112072
PMID:38636371
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研究论文 | 本研究探讨KLRB1在CD4+ T细胞中的作用及其在原发性干燥综合症中的重要性 | 发现KLRB1在CD4+ T细胞激活表型中的独特性并与临床疾病指标相关 | 样本量有限,仅包含37名健康对照和44名患者的数据 | 研究KLRB1在原发性干燥综合症中的作用 | 44名原发性干燥综合症患者和37名健康对照的外周血样本 | 数字病理学 | 原发性干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 流式细胞术 | 血液样本 | 共81个样本,包括44名患者和37名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 6074 | 2024-08-04 |
Deciphering Abnormal Platelet Subpopulations in COVID-19, Sepsis and Systemic Lupus Erythematosus through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115941
PMID:38892129
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研究论文 | 本研究旨在理解激活血小板的转录异质性及其对败血症、新冠肺炎和系统性红斑狼疮等疾病的影响 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习方法,揭示了血小板亚群在疾病严重性中的差异,并标识出重要的血小板异质性生物标志物 | 本研究的局限性在于对激活血小板转录组异质性的了解仍然有限,未来需进一步验证发现的生物标志物 | 本研究旨在剖析激活血小板的复杂转录谱,以帮助开发针对异常和致病血小板亚型的靶向疗法 | 本研究分析了来自413例患者的47,977个血小板的单细胞转录谱 | 数字病理 | 新冠肺炎, 败血症, 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组, 深度神经网络 (DNN), 极端梯度提升 (XGB), UMAP | NA | 转录组 | 413个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6075 | 2024-08-04 |
Identification of Marker Genes in Infectious Diseases from ScRNA-seq Data Using Interpretable Machine Learning
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115920
PMID:38892107
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研究论文 | 本文提出了一种早期诊断系统,用于区分免疫失调综合征的严重程度 | 通过可解释的机器学习方法识别感染相关的关键基因,能够区分不同感染程度 | 本文未提及样本量及数据来源的具体限制 | 构建用于识别感染严重程度的早期诊断系统 | 重点研究不同免疫细胞和基因在感染中的表达变化 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6076 | 2024-08-05 |
Sex-Based Mechanisms of Cardiac Development and Function: Applications for Induced-Pluripotent Stem Cell Derived-Cardiomyocytes
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115964
PMID:38892161
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研究论文 | 本文概述了性别在心脏发育和功能中的机制,并探讨了诱导多能干细胞衍生心肌细胞的应用 | 首次全面理解性别特异性心脏差异的机制 | 对性别差异的机制尚未完全阐明 | 研究性别在心脏生理和病理中的作用和机制 | 主要研究男性和女性的心脏发育及其功能的差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 诱导多能干细胞, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6077 | 2024-08-05 |
scZAG: Integrating ZINB-Based Autoencoder with Adaptive Data Augmentation Graph Contrastive Learning for scRNA-seq Clustering
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115976
PMID:38892162
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研究论文 | 本文提出了一种结合ZINB模型和自适应数据增强图对比学习的深度学习框架,用于单细胞RNA测序的聚类分析 | 创新地结合了ZINB模型去噪和自适应图对比学习,解决了单细胞RNA测序数据的高维稀疏性问题 | 可能未能充分涵盖所有潜在的高维拓扑结构 | 研究单细胞RNA测序数据的聚类分析方法 | 重点研究单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别和聚类 | 计算机视觉 | NA | ZINB模型,图对比学习 | APPNPGCN | 基因表达数据 | 10个常见的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6078 | 2024-08-04 |
Circadian Rhythm Disruption in Hepatocellular Carcinoma Investigated by Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-May-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115748
PMID:38891936
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研究论文 | 本研究通过整合分析大规模和单细胞RNA测序数据,探讨了肝细胞癌中的生物钟节律失调 | 首次结合大规模RNA转录组分析和单细胞测序,确定与生物钟节律失调相关的基因的表达变化 | 具体的细胞和分子机制尚不清楚 | 研究生物钟节律失调在肝细胞癌发生中的作用及其相关基因 | 肝细胞癌患者的CRD相关基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6079 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Metabolic Changes in Epithelial Glycosphingolipids and Establishes a Prognostic Risk Model for Pancreatic Cancer
2024-May-24, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics14111094
PMID:38893622
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析揭示了胰腺癌中上皮糖鞘脂代谢的变化,并建立了预后风险模型 | 首次将上皮糖鞘脂代谢与胰腺癌的预后联系起来,建立了基于六基因的预后模型 | 该研究的样本量及其外部验证的数据库可能限制了结果的广泛适用性 | 探索胰腺癌中糖鞘脂代谢的变化及其与患者预后的关系 | 胰腺腺癌组织中的上皮细胞及其代谢特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞代谢数据 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据,具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 6080 | 2024-08-05 |
Unraveling Divergent Transcriptomic Profiles: A Comparative Single-Cell RNA Sequencing Study of Epithelium, Gingiva, and Periodontal Ligament Tissues
2024-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115617
PMID:38891804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序研究牙周组织的转录组特征 | 首次揭示了牙周组织的层次结构和环境因素对细胞组成的影响 | 样本量较小,仅涉及7个组织样本,可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在识别牙周特异性标记以深入了解牙周病理生理 | 主要研究人类牙周韧带、牙龈和上皮组织的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 7个组织样本 | NA | NA | NA | NA |