单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7518 篇文献，本页显示第 6021 - 6040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6021 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics reveal extracellular vesicles secretion with a cardiomyocyte proteostasis signature during pathological remodeling
2024-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06319-x
PMID:38783104
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6022 | 2024-08-04 |
A Spatial Transcriptomics Browser for Discovering Gene Expression Landscapes across Microscopic Tissue Sections
2024-May-13, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46050284
PMID:38785552
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研究论文 | 本研究开发了一个空间转录组浏览器，以便在微观组织切片中发现基因表达图景 | 该工具应用了自组织映射(SOM)机器学习方法来分析空间转录组数据，生成每个点的基因表达景观 | 文章未提及具体的样本量和该工具的局限性 | 研究空间转录组技术在细胞生态系统组织和相互作用知识挖掘中的应用 | 主要研究内容为单基因表达、功能基因集表达以及细胞间相互作用的空间模式 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组 | 自组织映射(SOM) | 图像 | 使用了小鼠脑组织和黑色素瘤的相关组织样本 |
| 6023 | 2024-08-05 |
Deciphering infected cell types, hub gene networks and cell-cell communication in infectious bronchitis virus via single-cell RNA sequencing
2024-May, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012232
PMID:38743760
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序系统性研究感染性支气管炎病毒对细胞类型和细胞间通讯的影响 | 首次系统性鉴定了特定细胞类型中表达的组织特异性分子标志物和相应的基因网络 | 未提及样本数量的具体细节及其在研究中的影响 | 探讨感染性支气管炎病毒在小鸡中的致病机制及其对免疫反应的影响 | 研究感染性支气管炎病毒感染后的肾脏、法氏囊和气管组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6024 | 2024-08-05 |
Integrating phylogenies into single-cell RNA sequencing analysis allows comparisons across species, genes, and cells
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002633
PMID:38787797
|
研究论文 | 本文探讨了将系统发育整合到单细胞RNA测序分析中的应用，以比较物种、基因和细胞之间的联系 | 提出了将系统发育方法整合进scRNA-seq分析中，以克服物种间比较的挑战并加强基因和细胞演化假设的验证 | NA | 实现跨物种、基因和细胞的比较，揭示细胞基因表达与细胞功能演化之间的联系 | 单细胞RNA测序数据及其在不同物种和细胞中的比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 系统发育树 | RNA序列 | NA |
| 6025 | 2024-08-05 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
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研究论文 | 这项研究展示了HIV感染患者肠道粘膜免疫细胞的转录组特征 | 研究发现免疫非应答者在肠道浆细胞的比例低于免疫应答者，并探讨了记忆B细胞和滤泡B细胞向浆细胞转化的障碍 | 样本数量有限，只有少数免疫非应答者被纳入研究 | 探讨HIV感染患者中的肠道粘膜免疫细胞在免疫恢复中的作用 | 研究对象包括HIV阴性对照、免疫应答者和免疫非应答者 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据及免疫细胞分析数据 | 54,475个免疫细胞来自五个HIV阴性对照、九个免疫应答者和三个免疫非应答者 |
| 6026 | 2024-08-05 |
Immunological Characteristics of Hepatic Dendritic Cells in Patients and Mouse Model with Liver Echinococcus multilocularis Infection
2024-Apr-25, Tropical medicine and infectious disease
IF:2.8Q1
DOI:10.3390/tropicalmed9050095
PMID:38787028
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研究论文 | 本文探讨了肝脏包虫感染患者和小鼠模型中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 首次系统分析了肝脏树突状细胞亚群在肝脏包虫感染中表现出的免疫表型特征 | 未深入探讨不同小鼠模型对免疫特征的影响 | 研究肝脏包虫感染微环境中肝脏树突状细胞的免疫特征 | 临床包虫感染患者和小鼠模型中的肝脏树突状细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 组织样本 | 四个包虫感染患者标本和感染小鼠模型 |
| 6027 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis of super-enhancer-induced LINC00862 and validation as a SIRT1-promoting factor in cervical cancer and gastric cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101982
PMID:38718436
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研究论文 | 本研究探讨了LINC00862在多癌症中的生物学意义及其在宫颈癌和胃癌中的作用 | 揭示了LINC00862在宫颈癌和胃癌中的致癌机制，并验证了其作为生物标志物的潜力 | 未具体列出LINC00862在其他类型癌症中的作用及有效性 | 研究LINC00862在不同癌症中的表达及其与免疫疗法的关系 | 主要研究肿瘤和基质细胞中的LINC00862表达及其调控机制 | 数字病理学 | 宫颈癌与胃癌 | 染色质免疫沉淀和RNA免疫沉淀等 | NA | 生物信息学数据和单细胞测序数据 | 涉及大多数肿瘤和基质细胞的表达分析 |
| 6028 | 2024-08-04 |
Dysregulation of peripheral and intratumoral KLRG1+ CD8+T cells is associated with immune evasion in patients with non-small-cell lung cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101968
PMID:38713923
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研究论文 | 本研究探讨了KLRG1+ CD8+ T细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中的免疫逃避中的作用 | 本研究首次揭示KLRG1+ CD8+ T细胞与NSCLC肿瘤免疫逃避的关联性，并提出KLRG1作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究中可能缺乏大规模样本数据来验证KLRG1的预后价值 | 研究KLRG1在非小细胞肺癌患者中的免疫调节作用 | 非小细胞肺癌患者的外周血和肿瘤组织中的KLRG1+ CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，细胞单一测序数据 | NSCLC患者与健康供体、良性肺结节患者的对比样本 |
| 6029 | 2024-08-05 |
Differential role of glucocorticoid receptor based on its cell type specific expression on tumor cells and infiltrating lymphocytes
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101957
PMID:38643748
|
研究论文 | 本研究探讨了糖皮质激素受体在肿瘤细胞和浸润淋巴细胞中特殊细胞类型表达的差异性作用 | 发展了一个与雌激素受体状态无关的糖皮质激素受体标志（GRsig），并评估其在不同乳腺癌亚型中的独立预后能力 | 未提及具体的实验设计或模型限制 | 研究糖皮质激素受体在乳腺癌不同细胞类型中的表达及其预后意义 | 乳腺癌肿瘤上皮细胞和浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 独立乳腺癌队列的样本数量未具体提及 |
| 6030 | 2024-08-05 |
MAPKAP1 orchestrates macrophage polarization and lipid metabolism in fatty liver-enhanced colorectal cancer
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101941
PMID:38692197
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪肝在大肠癌进展中的机械作用，重点关注巨噬细胞极化和脂质代谢。 | 发现MAPKAP1是通过M2巨噬细胞极化和脂质代谢重编程促进大肠癌的重要基因。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的复杂性。 | 研究脂肪肝如何影响大肠癌的进展，特别是在巨噬细胞极化和脂质代谢方面。 | 使用小鼠脂肪肝模型以及大肠癌特异性基因MAPKAP1进行研究。 | 数字病理学 | 大肠癌 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | NA | 小鼠模型，样本数量未具体说明 |
| 6031 | 2024-08-05 |
FTO elicits tumor neovascularization in cancer-associated fibroblasts through eliminating m6A modifications of multiple pro-angiogenic factors
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216911
PMID:38685450
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研究论文 | 本研究揭示了FTO通过消除多种促血管生成因子的m6A修饰，促进癌症相关成纤维细胞（CAFs）介导的肿瘤血管生成 | 首次明确了FTO在肿瘤微环境中对CAFs介导的血管生成的作用机制 | 本研究的局限性在于未能明确m6A修饰对CAFs激活的具体作用 | 探讨FTO在CAFs介导的血管生成中的作用及机制 | 研究癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 眼睑黑色素瘤 | 单细胞转录组分析、多组学分析 | NA | mRNA | CAFs样本数量未明确 |
| 6032 | 2024-08-05 |
Cardiopulmonary progenitors facilitate cardiac repair via exosomal transfer of miR-27b-3p targeting the SIK1-CREB1 axis
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13593
PMID:38185757
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研究论文 | 这篇文章探讨了心肺前体细胞在心脏修复中的作用，特别是通过外泌体转移miR-27b-3p靶向SIK1-CREB1轴来促进心脏修复 | 该研究首次揭示心肺前体细胞通过外泌体转移miR-27b-3p促进心脏修复的机制 | 研究只在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 研究心肺前体细胞在缺血性心脏疾病中修复受损心脏的机制 | 本研究对象为小鼠胚胎衍生的心肺前体细胞 | 数字病理学 | 缺血性心脏病 | scRNA-seq, miRNA-seq, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 细胞, RNA | 使用E9.5小鼠胚胎获取心肺前体细胞，具体样本数量未提及 |
| 6033 | 2024-08-05 |
Identification and validation of a lactate metabolism-related six-gene prognostic signature in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Apr-16, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05723-4
PMID:38627278
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研究论文 | 本文揭示了乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，并构建了一个可靠的乳酸代谢相关预后标志。 | 文章首次系统性地识别和验证了与乳酸代谢相关的六个基因的预后标志，提供了新思路用于肝内胆管癌的预后评估和治疗。 | 研究对乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学功能的探索仍然有限，需要更多的临床数据来验证。 | 研究目的是明确乳酸代谢在肝内胆管癌中的生物学作用，开发预后工具。 | 研究对象为肝内胆管癌患者及其相关细胞系。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 高和低乳酸代谢相关基因得分组中的患者样本 |
| 6034 | 2024-08-04 |
Casp11 Deficiency Alters Subgingival Microbiota and Attenuates Periodontitis
2024-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231221712
PMID:38197150
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研究论文 | 本研究探讨了Caspase-11介导的非经典焦亡、亚龈微生物群变化与巨噬细胞极化之间的相互作用 | 揭示了Caspase-11在牙周炎病理生理过程中的关键作用，并强调其对亚龈微生物群和巨噬细胞M1极化的影响 | 具体机制尚不清楚，需进一步研究以验证这些发现 | 探讨Caspase-11缺失对亚龈微生物群及牙周炎的影响 | 牙周炎患者的临床样本以及实验性牙周炎小鼠模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 临床样本 | 牙周炎患者的临床样本及实验性小鼠模型 |
| 6035 | 2024-08-05 |
Identification of CFH and FHL2 as biomarkers for idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1363643
PMID:38784225
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研究论文 | 本研究识别了CFH和FHL2作为特发性肺纤维化的生物标志物 | 本研究首次确认CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的诊断价值 | 该研究缺乏长期临床验证，临床适用性尚需进一步评估 | 研究CFH和FHL2在特发性肺纤维化中的作用及其与免疫细胞的关系 | 特发性肺纤维化相关的关键基因及其在免疫细胞中的表达 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 基因微阵列分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两组数据共涉及647个差异表达基因 |
| 6036 | 2024-08-04 |
Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis of Dermal Fibroblast Development in Perinatal Mouse Skin: Dynamic Lineage Differentiation and Key Driver Genes
2024-Jun, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.11.008
PMID:38072389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和空间转录组学研究了胎儿鼠皮肤中真皮成纤维细胞的发展 | 首次系统分析了不同发育阶段的单细胞RNA测序数据，并识别了多个重要驱动基因 | 主要集中在小鼠的发育阶段，可能不适用于其他物种或更广泛的生物学过程 | 探讨皮肤发育过程中真皮成纤维细胞的动态谱系分化及其关键驱动基因 | 聚焦于不同发育阶段小鼠皮肤的真皮成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA数据 | 多个阶段的小鼠样本（胚胎13.5天，14.5天，16.5天和出生后0天，2天，4天） |
| 6037 | 2024-08-05 |
Hepatic organoids move from adolescence to maturity
2024-Jun, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15893
PMID:38451053
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研究论文 | 这篇文章探讨了肝脏类器官在肝脏研究中的贡献和未来发展 | 指出肝脏类器官在基本研究、药物发现和疾病病理生物学理解方面的四种先进应用 | 没有具体提及研究的局限性 | 旨在评估肝脏类器官在肝脏疾病研究中的应用 | 肝脏类器官及其在不同领域的应用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序和CRISPR技术 | 类器官模型 | 细胞和组织 | NA |
| 6038 | 2024-08-04 |
Multiregional transcriptomics identifies congruent consensus subtypes with prognostic value beyond tumor heterogeneity of colorectal cancer
2024-May-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48706-2
PMID:38773143
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研究论文 | 研究多区域转录组学在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤异质性的影响 | 首次通过多区域转录组学探究了结直肠癌中的凝聚共识分型及其预后能力 | 该研究仅基于单个医院的样本，可能限制了结果的广泛适用性 | 评估转录组异质性对结直肠癌预后的影响及其分类能力 | 对来自692名患者的1093个肿瘤样本进行研究，包括98个原发肿瘤和35对原发-转移样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 1093个肿瘤样本，来自692名患者 |
| 6039 | 2024-08-04 |
A comparative study on the dose-effect of low-dose radiation based on microdosimetric analysis and single-cell sequencing technology
2024-05-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62501-5
PMID:38773212
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研究论文 | 本研究探讨了低剂量辐射对BEAS-2B细胞系的潜在机制 | 使用微剂量分析和单细胞测序技术，提供了选择对低剂量辐射反应敏感生物标志物的新视角 | 研究中的数值不确定性可能影响微剂量与基因表达的相关性 | 深入探索低剂量辐射诱发的生物机制 | BEAS-2B细胞系及其对低剂量辐射的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 蒙特卡罗模型 | 细胞能量分布和基因表达数据 | NA |
| 6040 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF family reveals KLF6 as a promising prognostic and immune biomarker in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-May-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03369-3
PMID:38773440
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研究论文 | 本研究全面分析了KLF家族，并揭示KLF6作为胰腺导管腺癌中有前景的预后和免疫生物标志物 | 本研究提出KLF6是胰腺导管腺癌中一个新的诊断生物标志物，并作为潜在治疗靶点 | 未在临床上验证KLF6的作用及其作为生物标志物的应用效果 | 探讨KLF家族基因在胰腺导管腺癌中的生物学功能及其临床意义 | 研究胰腺导管腺癌中的KLF家族基因及其表达模式 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归模型 | 转录组数据 | 包含了大量胰腺癌患者的转录组样本 |