单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7518 篇文献，本页显示第 6001 - 6020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6001 | 2024-08-05 |
Serglycin secreted by late-stage nucleus pulposus cells is a biomarker of intervertebral disc degeneration
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44313-9
PMID:38167807
|
研究论文 | 本文探讨了晚期髓核细胞分泌的serglycin作为椎间盘退变的生物标志物 | 首次识别了晚期髓核细胞并确认了serglycin如何调节椎间盘退变的潜在机制 | 样本量较小，仅包含三名男性和四名女性 | 研究serglycin在椎间盘退变中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 晚期髓核细胞及其分泌的serglycin | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 七个（男性三名，女性四名） |
| 6002 | 2024-08-04 |
PANoptosis and Autophagy-Related Molecular Signature and Immune Landscape in Ulcerative Colitis: Integrated Analysis and Experimental Validation
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S455862
PMID:38800594
|
研究论文 | 本研究调查了与PANoptosis和自噬相关的溃疡性结肠炎(UC)的分子特征和免疫微环境 | 本研究首次识别并验证了与UC相关的PANoptosis和自噬的新分子特征，可能影响免疫失调和伤口愈合 | 研究中对候选基因的验证主要基于小鼠模型，缺乏大规模临床样本支持 | 探讨溃疡性结肠炎中PANoptosis和自噬相关基因的分子特征及免疫微环境 | 溃疡性结肠炎患者及小鼠模型的相关基因和免疫细胞渗透 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 分析了UC数据集GSE206285，验证了小鼠模型中的关键候选基因表达 |
| 6003 | 2024-08-05 |
Unveiling the molecular complexity of proliferative diabetic retinopathy through scRNA-seq, AlphaFold 2, and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1382896
PMID:38800474
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、非负矩阵因式分解、机器学习和AlphaFold 2方法探索增殖性糖尿病视网膜病变的分子水平 | 创新点在于结合多种高科技手段对PDR的细胞和分子特征进行深入研究 | 本研究可能受到样本量和研究设计的限制 | 探究增殖性糖尿病视网膜病变的复杂分子病理机制 | 针对增殖性糖尿病视网膜病变患者和健康对照者的单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), AlphaFold 2, 机器学习 | NA | 基因表达数据 | 包含增殖性糖尿病视网膜病变患者与健康对照者的样本 |
| 6004 | 2024-08-05 |
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12
PMID:38622400
|
研究论文 | 本研究描述了一种针对小鼠调节性B细胞的分离协议，以进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的小鼠调节性B细胞的分离和分析方法，拓展了对调节性B细胞生物学的理解 | 研究主要集中于小鼠模型，可能在转化到人类时存在局限性 | 研究调节性B细胞在健康和疾病中的生物学特征 | 以易患狼疮的小鼠（MRL/lpr小鼠）为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 6005 | 2024-08-05 |
Lysyl Oxidase Regulates Epithelial Differentiation and Barrier Integrity in Eosinophilic Esophagitis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.025
PMID:38340809
|
研究论文 | 本研究探讨了赖氨酸氧化酶（LOX）在嗜酸性食管炎中的作用，尤其是在上皮细胞分化和屏障完整性方面 | 本研究首次揭示了LOX在食管上皮中的非经典角色，作为重要的信号分子参与上皮稳态调节 | 本研究主要基于体外实验，临床应用的直接证据有限 | 研究LOX在嗜酸性食管炎中的功能作用及其对上皮细胞分化和屏障完整性的影响 | 人类嗜酸性食管炎患者来源的类器官和细胞文化模型 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | 三维类器官模型 | 基因组数据 | 使用了患者来源的类器官 |
| 6006 | 2024-08-04 |
Peripheral nervous system lymphatic vessels: A simple delivery route to promote nerve regeneration
2024-Jul, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114783
PMID:38688418
|
研究论文 | 本文阐明了周围神经系统淋巴血管的存在及其在神经再生中的作用 | 首次证明了外围神经中的淋巴血管在促进神经再生中的独特运输能力 | 研究主要集中在动物模型上，缺乏临床人类样本的验证 | 探讨周围神经系统淋巴血管在神经再生中的作用及其输送能力 | 使用大鼠、PROX1-EGFP转基因小鼠和人类的周围神经样本 | 数字病理学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 使用了大鼠和转基因小鼠的样本 |
| 6007 | 2024-08-05 |
Characteristics of peripheral blood mononuclear cells and potential related molecular mechanisms in patients with autoimmune hepatitis: a single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jun, Medical molecular morphology
IF:1.2Q3
DOI:10.1007/s00795-024-00380-5
PMID:38340154
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性肝炎患者外周血单核细胞的特征及潜在相关分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统性分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特征 | 对免疫细胞群体特征的理解仍然有限，可能没有考虑其他类型的免疫细胞 | 分析自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞特点及其潜在的分子机制 | 来自4名健康对照和4名自身免疫性肝炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3690个来自健康对照和3511个来自自身免疫性肝炎患者的单细胞转录组 |
| 6008 | 2024-08-04 |
Improving replicability in single-cell RNA-Seq cell type discovery with Dune
2024-May-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05814-6
PMID:38789920
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法Dune，用于优化单细胞RNA-Seq中细胞类型发现的簇分辨率和可重复性之间的权衡 | Dune通过迭代合并簇来最大化不同分区之间的一致性，改善了集群分析的稳健性 | 本文未提及具体限制因素 | 旨在提高单细胞转录组测序中细胞分类的可靠性和再现性 | 涉及单细胞RNA-Seq数据集中的细胞类型分类 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用来自不同平台的多个数据集进行验证 |
| 6009 | 2024-08-05 |
Identifying potential drug targets for keloid: A Mendelian randomization study
2024-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.023
PMID:38797322
|
研究论文 | 本文识别了瘢痕疙瘩的潜在药物靶点 | 通过孟德尔随机化研究发现七种潜在的药物靶点，特别强调了NTM的临床相关性 | 本研究可能受限于样本量和数据库的可用性 | 识别瘢痕疙瘩的药物靶点以改进治疗效果 | 靶向瘢痕疙瘩的七种蛋白质 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析 | NA | 蛋白质数据, scRNA-seq数据 | NA |
| 6010 | 2024-08-04 |
The Identification of RPL4 as a Hub Gene Associated with Goat Litter Size via Weighted Gene Co-Expression Network Analysis
2024-May-15, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14101470
PMID:38791687
|
研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别出与山羊窝重相关的枢纽基因RPL4 | 揭示了RPL4基因在山羊生育能力中的重要作用，为评估山羊窝重提供了生物标志物 | 未提及样本的地理分布和环境影响因素 | 探索与山羊生殖性能相关的标志基因 | 山羊卵母细胞中的基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 卵母细胞数据集GSE136005来自GEO数据库 |
| 6011 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatotoxic analgesic generating AM404 in the midbrain PAG region
2024-05-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61791-z
PMID:38750093
|
研究论文 | 本文开发了一种无肝毒性的非阿片类小分子SRP-001，能够有效管理疼痛且安全性高 | SRP-001不会产生肝毒性代谢物，且在高剂量下保护肝脏紧密连接的完整性 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床应用仍需进一步验证 | 研究一种新的非肝毒性镇痛药SRP-001及其机制 | CD-1小鼠及其对SRP-001和ApAP的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 生物医学数据 | CD-1小鼠，具体样本量未提及 |
| 6012 | 2024-08-05 |
Identifying Key Regulatory Genes in Drug Resistance Acquisition: Modeling Pseudotime Trajectories of Breast Cancer Single-Cell Transcriptome
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101884
PMID:38791962
|
研究论文 | 本文提出了一种结合数学建模和伪时间分析的方法，以研究乳腺癌单细胞转录组中的药物耐药性关键调控基因 | 创新点在于使用时间序列scRNA-seq数据和单基因数学模型，识别了约560-680个表现多稳定表达状态的基因 | 对分子系统层面动态细胞转变的理解仍然有限 | 研究药物耐药性获得的关键调控基因 | MCF-7乳腺癌细胞系在他莫昔芬处理下的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 单基因数学模型 | 基因表达数据 | 6000个基因的多个亚群体 |
| 6013 | 2024-08-05 |
A Gold Standard-Derived Modular Barcoding Approach to Cancer Transcriptomics
2024-May-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16101886
PMID:38791964
|
研究论文 | 本文提出了一种灵活条形码的癌症转录组学方法，将癌症特异性基因表达模块组合成便于管理的信息。 | 创新点在于采用高质量金标准导出的模块捕捉与特定癌症类型相关的功能性基因，提供了快速有效的假设生成和测试方式 | 本研究的局限性在于未提供与不同癌症类型之间更广泛的数据对比 | 研究目的在于简化癌症转录组信息，以便于更广泛的研究和临床应用 | 研究对象为癌症类型特异性的基因表达模块 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6014 | 2024-08-05 |
Deciphering the Genetic Links between Psychological Stress, Autophagy, and Dermatological Health: Insights from Bioinformatics, Single-Cell Analysis, and Machine Learning in Psoriasis and Anxiety Disorders
2024-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105387
PMID:38791423
|
研究论文 | 本研究探讨了心理压力、自噬相关基因与皮肤健康之间的关系，特别关注银屑病与焦虑障碍的共病机制 | 揭示了银屑病与焦虑障碍之间可能存在的共享生物机制及其潜在生物标志物 | 样本数据来源于GEO数据库，未具体提及样本的多样性和数据的全面性 | 探索银屑病与焦虑障碍之间的共病机制 | 银屑病与焦虑障碍相关的数据和基因 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序分析 | 机器学习算法 | 基因数据 | 未具体提及样本数量 |
| 6015 | 2024-08-04 |
Special Issue "Cancer Immunotherapy: Tumor Microenvironment, Biomarker Discovery and Immune Resistance"
2024-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105113
PMID:38791152
|
研究论文 | 该特刊汇集了癌症免疫治疗领域的最新研究成果和进展 | 介绍了新型药物开发和机制理解的最新进展 | 未提及具体的研究限制 | 推动对癌症免疫治疗领域新的理解和技术应用 | 癌症免疫治疗相关的肿瘤微环境、生物标志物和免疫耐受性 | 数字病理学 | 癌症 | 人工智能，机器学习，单细胞测序，空间分析 | NA | NA | NA |
| 6016 | 2024-08-04 |
Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.03.556122
PMID:37732188
|
研究论文 | 本文提出Polaris，一个用于图像基础空间转录组分析的分析管道 | 结合深度学习模型进行细胞分割和点检测，以及概率基因解码器以准确量化单细胞基因表达 | NA | 开发一个无缝的解决方案用于分析空间转录组数据 | 图像基础空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | NA |
| 6017 | 2024-08-04 |
Spotless, a reproducible pipeline for benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics
2024-May-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88431
PMID:38787371
|
研究论文 | 本文介绍了一个可重复的管道，用于基准测试空间转录组学中的细胞类型去卷积方法 | 开发了一个模拟引擎生成银标准，并比较了11种去卷积方法的性能 | 在细胞类型极为丰富或稀少的数据集中，所有方法的性能显著下降 | 研究空间转录组学中细胞类型的去卷积技术的有效性 | 基于63个银标准、3个金标准和2个案例研究进行评估 | 数字病理学 | 肝脏疾病与黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 简单回归模型 | 转录组数据 | 63个银标准和2个案例研究 |
| 6018 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene-Regulatory Networks of Advanced Symptomatic Atherosclerosis
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323184
PMID:38639096
|
研究论文 | 本研究探讨了在动脉粥样硬化进展过程中单细胞基因表达模式的临床和病理生理相关性 | 首次通过整合高基因丰度的单细胞亚群与冠状动脉疾病基因调控网络，确认GRN39在促进晚期、症状性动脉粥样硬化中的关键作用 | 对单细胞转录组数据的详细理解仍然不足，且临床适用性需要进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化发病机制的细胞遗传调控网络 | 在Ldlr-/-Apob100/100小鼠模型和人类样本中的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 16588个单细胞和600名冠状动脉疾病患者的基因组数据 |
| 6019 | 2024-08-05 |
Metabolic pathway-based subtypes associate glycan biosynthesis and treatment response in head and neck cancer
2024-May-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00602-0
PMID:38783045
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于代谢通路的头颈癌分类，强调了富含糖类代谢的MPS1亚型的治疗挑战性 | 创新之处在于定义了代谢通路基础的亚型，并揭示了其与治疗反应之间的关联 | 缺乏对临床结果的全面分析以及可能的样本量不足 | 研究头颈鳞状细胞癌的代谢异质性及其对临床结果的影响 | 四个独立临床队列中的头颈鳞状细胞癌转录组数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个独立的临床队列 |
| 6020 | 2024-08-05 |
In-depth organic mass cytometry reveals differential contents of 3-hydroxybutanoic acid at the single-cell level
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48865-2
PMID:38782922
|
研究论文 | 本文建立了一种深入的单细胞代谢组学平台，以揭示3-羟基丁酸在单细胞水平上的差异性含量 | 首次展示了MCF-7细胞内3-羟基丁酸水平的细致亚型分析 | 尚未提及该技术在其他细胞类型或生物体中的应用效果 | 旨在通过单细胞代谢组学探讨癌症细胞在氧化应激下的异质性 | 研究对象为MCF-7细胞及其3-羟基丁酸的代谢特征 | 数字病理学 | 癌症 | 有机质谱细胞术 | NA | 代谢数据 | 单细胞，约600种代谢物 |