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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 5981 - 6000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5981 | 2024-08-04 |
Spatial analysis toolkits for RNA in situ sequencing
2024 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1842
PMID:38605484
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综述 | 本文介绍了RNA原位测序（ISS）的生物信息学工具包及其数据分析流程 | 提出了适用于ISS数据分析的先进生物信息学工具，并详细审查了每种工具的应用及其与ISS数据的兼容性 | 未提及具体的实验实例支持工具的有效性 | 帮助研究者选择合适的工具以进行ISS数据分析 | RNA原位测序（ISS）和相关数据分析工具 | 数字病理学 | NA | 原位测序（ISS） | NA | 图像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5982 | 2024-08-05 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq analyses revealed the function and clinical value of thrombospondins in colon cancer
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.021
PMID:38827236
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研究论文 | 本研究揭示了血小板反应蛋白在结肠癌中的功能和临床价值。 | 研究首次系统分析了血小板反应蛋白在结肠癌中的表达及作用，识别了其作为新的治疗靶点和预后标志物的潜力。 | 该研究依赖于多个高通量数据集，可能存在数据异质性和分析方法的局限性。 | 明确血小板反应蛋白在结肠癌中的具体作用及其临床意义。 | 利用1981个样本分析血小板反应蛋白在结肠癌中的预后相关性和细胞来源。 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-seq | NA | 样本 | 1981个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5983 | 2024-08-05 |
Plasma proteome analysis implicates novel proteins as potential therapeutic targets for chronic kidney disease: A proteome-wide association study
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31704
PMID:38828357
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研究论文 | 该研究通过全基因组关联研究结合人类血浆蛋白组学识别与慢性肾病相关的新型蛋白。 | 本研究首次系统性识别出22种与慢性肾病显著相关的血浆蛋白，其中INHBC、LMAN2和SNUPN被提出作为新的治疗靶点。 | 研究集中于特定种类的已知蛋白，可能存在未识别新的潜在靶点的局限。 | 识别与慢性肾病发病机制相关的新型蛋白和潜在的治疗靶点。 | 研究涉及与慢性肾病相关的22种血浆蛋白及其在疾病中的作用。 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据 | 分析了健康人类和小鼠肾脏的单细胞RNA测序数据，具体样本量未列明 | NA | NA | NA | NA |
| 5984 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of gene signatures associated with aging in human aortic dissection
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31298
PMID:38828294
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析探讨了与人类主动脉夹层相关的衰老基因签名。 | 研究识别了与衰老相关的枢纽基因，并提出了ESR1下调可能加重主动脉夹层的假说。 | 研究需要进一步验证有关ESR1在主动脉夹层形成中的作用，尤其是在临床环境中。 | 分析衰老相关基因与主动脉夹层的关联，以提供新见解和治疗策略。 | 衰老相关基因及其在主动脉夹层中表达的调控网络。 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及从13名主动脉夹层患者的197,605个主动脉细胞中获得的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5985 | 2024-08-05 |
Molecular characterization of nodose ganglia development reveals a novel population of Phox2b+ glial progenitors in mice
2024-Jun-03, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1441-23.2024
PMID:38830761
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研究论文 | 本文研究了迷走神经结的发展，并发现了一种新的Phox2b+胶质前体细胞群体 | 揭示了迷走神经结的胶质前体细胞具有独特的转录程序，并且这些细胞能够产生自主神经元 | 对迷走神经胶质细胞的发育基因程序尚未完全理解 | 探究迷走神经结中的胶质细胞前体的发育和转录特征 | 以小鼠为研究对象，分析迷走神经结中胶质前体细胞的性质 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 小鼠，性别不限 | NA | NA | NA | NA |
| 5986 | 2024-08-04 |
Mitochondrial RNA modification-based signature to predict prognosis of lower grade glioma: a multi-omics exploration and verification study
2024-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63592-w
PMID:38824202
|
研究论文 | 该研究探讨了线粒体RNA修饰在低级别胶质瘤预后中的作用 | 提出了一种基于线粒体RNA修饰的评分系统以预测低级别胶质瘤的预后，并通过多组学数据进行验证 | 线粒体RNA修饰相关基因的作用机制可能尚未完全解释 | 研究线粒体RNA修饰对低级别胶质瘤的影响及其预后预测能力 | 低级别胶质瘤及其相关的线粒体RNA修饰基因 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | RNA-seq | LASSO回归, 随机生存森林 | 基因表达数据 | 1120个正常脑组织样本和529个低级别胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5987 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
|
研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞（MSCs）的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统，能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后，3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统，并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5988 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
|
研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调，且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5989 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 本研究探讨了CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中的潜在致病性 | 未提供具体实验验证结果的详细信息 | 研究CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤中的致病机制 | 研究了91种循环炎症蛋白与主动脉瘤之间的因果关系 | 数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了731种免疫特征和91种循环炎症蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 5990 | 2024-08-05 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveal heterogeneity and diagnostic markers in papillary thyroid carcinoma lymph-node metastasis
2024-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-023-02262-6
PMID:38146045
|
研究论文 | 本研究分析了乳头状甲状腺癌的淋巴结转移，寻找诊断标记物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，探索了乳头状甲状腺癌淋巴结转移的异质性 | 研究中样本量有限，仅包括66名患者的样本 | 旨在发现乳头状甲状腺癌淋巴结转移的诊断标记物及治疗靶点 | 研究对象为乳头状甲状腺癌患者的淋巴结转移细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和常规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 66名乳头状甲状腺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5991 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素，并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5992 | 2024-08-05 |
Proteomic analysis of pleomorphic dermal sarcoma reveals a fibroblastic cell of origin and distinct immune evasion mechanisms
2024-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62927-x
PMID:38822058
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现多形性皮肤肉瘤的细胞来源和独特的免疫逃逸机制 | 首次识别出多形性皮肤肉瘤的潜在细胞来源及其免疫逃逸机制 | 样本数量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨多形性皮肤肉瘤的细胞起源及其免疫逃逸途径 | 分析健康皮肤、恶性黑色素瘤、鳞状细胞癌和多形性皮肤肉瘤的样本 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 质谱 | NA | 蛋白质数据、单细胞测序数据 | 分析了20个正常皮肤样本、27个恶性黑色素瘤样本、20个鳞状细胞癌样本和24个多形性皮肤肉瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5993 | 2024-08-04 |
Direct comparison of mass cytometry and single-cell RNA sequencing of human peripheral blood mononuclear cells
2024-May-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03399-6
PMID:38816402
|
研究论文 | 本文直接比较了人类外周血单核细胞的质谱细胞术和单细胞RNA测序 | 通过整合质谱细胞术和单细胞RNA测序的数据，提供了细胞类型特征的高分辨率分析 | 缺乏合适的金标准数据集用于评估新单细胞分析工具的有效性 | 探讨转录组学和蛋白质组学之间的关系 | 人类外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，质谱细胞术，流式细胞术 | NA | RNA，蛋白质 | 人类外周血单核细胞的分样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5994 | 2024-08-05 |
Neoantigen-specific stimulation of tumor-infiltrating lymphocytes enables effective TCR isolation and expansion while preserving stem-like memory phenotypes
2024-May-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008645
PMID:38816232
|
研究论文 | 本研究探讨了针对新抗原特异性刺激肿瘤浸润淋巴细胞的效果。 | 开发了一种名为'NeoExpand'的体外刺激方法，能够选择性扩展新抗原反应性的TIL，改善其表型和功能。 | 研究样本仅限于具有p53或RAS突变的25名患者，可能影响结果的普遍适用性。 | 探讨如何优化新抗原反应性肿瘤浸润淋巴细胞的扩展和分离。 | 25名来自肺癌患者的肿瘤样本中的肿瘤浸润淋巴细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 体外刺激 | NA | 样本 | 25个TIL样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5995 | 2024-08-04 |
Multi-modal domain adaptation for revealing spatial functional landscape from spatially resolved transcriptomics
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae257
PMID:38819253
|
研究论文 | 提出了一种用于空间转录组学的多模态领域适应方法stMDA，以揭示空间功能格局 | stMDA整合了基因表达和其他模态的信息，提供了高效的空间聚类和变异分析 | 该研究可能在特定条件下仍面临数据稀疏性的挑战 | 该研究旨在提高空间转录组数据的分析能力 | 主要研究对象为空间转录组学数据及其多模态信息 | 数字病理学 | 癌症组织 | 多模态无监督领域适应 | 多种神经网络架构 | 基因表达数据和其他模态数据 | 涉及多种平台和物种的多样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5996 | 2024-08-04 |
3D reconstruction of a gastrulating human embryo
2024-May-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.041
PMID:38657603
|
研究论文 | 本研究建立了一个人类胚胎的三维模型，以理解早期人类发育，特别是在胚胎发生的重塑阶段。 | 通过高分辨率空间转录组分析，从自然胚胎获得了宝贵的参考数据集，填补了该领域的空白。 | 该研究主要依赖于来自单一样本的空间转录组数据，可能限制了结果的普适性。 | 探讨人类胚胎发育中重要阶段的细胞谱系和组织模式。 | 该研究对象是来自完整卡内基阶段8的人类胚胎的62个横截面。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 62个横截面 | NA | NA | NA | NA |
| 5997 | 2024-08-05 |
PIPET: predicting relevant subpopulations in single-cell data using phenotypic information from bulk data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae260
PMID:38819254
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于大规模数据的表型信息预测单个细胞数据中相关亚群的算法PIPET | 提出了一种新颖的算法，可以使用大规模数据中的多变量表型信息预测单细胞数据中的相关亚群 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在探索如何将小样本的单细胞数据与大样本丰富的临床特征进行整合 | 研究单个细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其与肿瘤相关的表型信息 | 数字病理学 | 肺腺癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多分类模型 | 基因表达数据 | 模拟数据集与肺腺癌和乳腺癌单细胞数据中的细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 5998 | 2024-08-05 |
Reduction of specific enterocytes from loss of intestinal LGR4 improves lipid metabolism in mice
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48622-5
PMID:38782937
|
研究论文 | 该研究探讨肠道LGR4缺乏对脂质代谢的影响 | 首次发现LGR4缺失导致特定肠细胞的减少，从而改善脂质和葡萄糖代谢 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏人类临床数据支持 | 探究肠道LGR4对营养吸收和能量平衡的影响 | Lgr4小鼠及其肠道吸收细胞 | 数字病理学 | 肥胖症和肝脏脂肪变性 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了Lgr4小鼠和野生型小鼠进行对比 | NA | NA | NA | NA |
| 5999 | 2024-08-05 |
Carboxypeptidase M modulates BMSCs osteogenesis-adipogenesis via the MAPK/ERK pathway: An integrated single-cell and bulk transcriptomic study
2024-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302508R
PMID:38713087
|
研究论文 | 本研究探讨了羧肽酶M（CPM）在骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）成骨与成脂过程中的调节作用 | 本研究揭示了CPM作为BMSCs分化的关键调节因子，并提供了MAPK/ERK通路在此过程中的作用机制的新线索 | 研究主要基于现有的数据分析，可能存在单细胞RNA测序数据的局限性 | 研究骨质疏松症（OP）中BMSCs成骨与成脂的平衡失调机制 | 主要研究骨髓来源的间充质干细胞（BMSCs）及其在骨质疏松症中的功能 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | NA | 细胞数据 | 分析了来自八个scRNA-seq数据集的56,377个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6000 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell analysis uncovers the immunopathological mechanisms associated with IgA nephropathy progression
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173651
PMID:38716725
|
研究论文 | 本研究通过跨物种单细胞分析揭示了与IgA肾病进展相关的免疫病理机制 | 采用跨物种单细胞RNA测序的方法探索IgA肾病的致病程序，并发现了与病情进展相关的特定蛋白表达 | 本研究的.sample size相对较小，未来需要更大范围的研究来验证结果 | 探讨IgA肾病的致病机制及其与肾功能下降的关系 | 人类IgA肾病及小鼠和大鼠IgA肾病模型 | 数字病理学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠IgA肾病模型 | 基因表达数据 | 21个进展样本和28个非进展样本 | NA | NA | NA | NA |