单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5981 2024-08-04
Single-cell metabolomics in rare disease: From technology to disease
2024-May-31, Intractable & rare diseases research IF:1.1Q2
研究论文 该文章探讨了单细胞代谢组学在稀有疾病中的应用和潜力 文章创新性地提出单细胞代谢组学能够彻底改变稀有疾病的诊断、治疗和管理策略 文章未具体说明现有研究的局限性 推动稀有疾病的准确和快速诊断,并促进治疗药物的发展 稀有疾病,特别是代谢类稀有疾病 数字病理学 稀有疾病 单细胞测序技术 NA NA NA NA NA NA NA
5982 2024-08-05
CD47, a novel YAP target gene, contributes to hepatic stellate cell activation and liver fibrosis induced by high-fat diet
2024-May-30, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究探讨了CD47在高脂饮食诱导的肝星状细胞活化和肝纤维化中的作用 本研究首次揭示了CD47作为YAP的转录靶点,在高脂饮食条件下促进肝星状细胞活化的机制 关于CD47在肝星状细胞中的具体调控机制仍不完全明了 研究CD47在肝星状细胞活化及肝纤维化中的角色及其调控机制 小鼠肝星状细胞及其在高脂饮食条件下的行为 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型 NA NA NA NA
5983 2024-08-04
Harnessing TME depicted by histological images to improve cancer prognosis through a deep learning system
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究提供了一种强大的深度学习系统,通过组织学图像增强肿瘤微环境(TME)信息以改善癌症预后 提出了整合图像和图形深度学习的模型(IGI-DL),并开发了基于TME的癌症预后预测模型 研究未涉及空间转录组学(ST)的临床可用性限制 改善癌症预后,尤其是在没有ST数据的患者中 使用组织学图像来预测癌症预后和TME 数字病理学 乳腺癌和结直肠癌 深度学习 IGI-DL模型 组织学图像 使用The Cancer Genome Atlas的乳腺癌和结直肠癌队列,以及外部的Molecular and Cellular Oncology结直肠癌队列 NA NA NA NA
5984 2024-08-04
Targeting PDGF signaling of cancer-associated fibroblasts blocks feedback activation of HIF-1α and tumor progression of clear cell ovarian cancer
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 该研究探讨了与卵巢透明细胞癌相关的癌症相关成纤维细胞的PDGF信号通路。 该研究揭示了在卵巢透明细胞癌中的化疗抗性机制,并提出了针对CAFs的治疗策略。 该研究主要基于体外和小鼠模型,临床相关性仍需进一步验证。 研究卵巢透明细胞癌的化疗抗性机制及潜在的治疗方法。 卵巢透明细胞癌患者的手术标本及其相关的癌症相关成纤维细胞。 数字病理学 卵巢癌 单细胞分析和空间转录组学 NA 显微镜图像 手术标本分析及共培养实验 NA NA NA NA
5985 2024-08-05
A comprehensive single-cell breast tumor atlas defines epithelial and immune heterogeneity and interactions predicting anti-PD-1 therapy response
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 我们展示了一个包含236,363个细胞的初级乳腺肿瘤微环境单细胞RNA测序综合图谱 首次通过InteractPrint方法揭示了肿瘤上皮细胞与免疫细胞的相互作用,并能够预测抗PD-1治疗的反应 在这项研究中没有提到样本的时间顺序或长期效果的评估 目标是分析乳腺肿瘤微环境中免疫和肿瘤上皮细胞的异质性 本研究的对象包括来自119个活检样本的肿瘤微环境中的免疫细胞和癌上皮细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 InteractPrint 细胞数据 119个活检样本 NA NA NA NA
5986 2024-08-05
Monocyte bioenergetics: An immunometabolic perspective in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 本文揭示了代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者外周单核细胞的生物能量特征 首次指出在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中,外周单核细胞表现出特定的高糖酵解和线粒体呼吸特征 研究主要基于小鼠模型,临床适用性可能受限 探讨单核细胞的生物能量特征在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的作用 代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者的外周单核细胞 免疫代谢 代谢功能障碍相关脂肪肝炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 小鼠模型 基因表达数据 NA NA NA NA NA
5987 2024-08-05
Chemoradiotherapy-induced ACKR2+ tumor cells drive CD8+ T cell senescence and cervical cancer recurrence
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 该文章探讨了化学放疗(CCRT)后宫颈癌复发的机制,发现ACKR2+肿瘤细胞在驱动CD8+ T细胞衰老中的作用 创新点在于识别出了一种特定的CCRT耐药性ACKR2+肿瘤细胞亚群,以及其在CD8+ T细胞衰老与肿瘤复发中的作用 本研究的局限性在于主要依赖回顾性分析,可能存在选择偏倚 研究化学放疗后宫颈癌复发的机制及预测指标 研究对象为宫颈癌患者的肿瘤组织样本,特别关注化学放疗前后的变化 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA 组织样本 NA NA NA NA NA
5988 2024-08-05
IL-7-primed bystander CD8 tumor-infiltrating lymphocytes optimize the antitumor efficacy of T cell engager immunotherapy
2024-May-21, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究探讨了Fc融合IL-7如何优化T细胞接合物免疫疗法的抗肿瘤效果 发现rhIL-7-hyFc能显著增加肿瘤浸润的非反应性旁观者CD8 T细胞,这些细胞在特定的T细胞接合物的作用下可转化为具有肿瘤杀伤能力的细胞 本研究主要集中在固体肿瘤中CD8 T细胞的变化,可能未涵盖其他类型肿瘤或免疫细胞的作用 探讨如何通过IL-7增强T细胞接合物免疫疗法在固体肿瘤中的效果 研究目的是分析IL-7对肿瘤浸润CD8 T细胞的影响及其在免疫疗法中的应用 NA 肿瘤 单细胞转录组分析 NA 细胞 多种固体肿瘤中的CD8肿瘤浸润淋巴细胞 NA NA NA NA
5989 2024-08-05
Aberrant follicular regulatory T cells associate with immunoglobulin hyperproduction in nasal polyps with ectopic lymphoid tissues
2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 这篇文章探讨了鼻息肉中异位淋巴组织中的卵泡调节性T细胞(TFR细胞)的存在和功能 研究首次揭示了鼻息肉中TFR细胞的特征和功能缺失,并表明维生素D治疗可以逆转其抑制功能 对TFR细胞在外周病变组织中的作用理解仍然有限 调查鼻息肉中TFR细胞的存在、表型和功能 鼻息肉中的TFR细胞 免疫学 鼻息肉 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,流式细胞术,ELISA NA 细胞数据 从鼻息肉中分离的多种T细胞亚群 NA NA NA NA
5990 2024-08-05
Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets
2024-Mar-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文章介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI,用于从scRNA-seq数据集中识别细胞谱系 GEMLI能够从缺乏谱系信息的scRNA-seq数据中可靠地识别小到中型细胞谱系,并重建多细胞结构 该方法在技术上复杂,通常受限于时间分辨率 研究细胞分化过程中的遗传信息传递 人类乳腺癌活检样本中的细胞谱系 数字病理学 乳腺癌 scRNA-seq NA 转录组数据 人类乳腺癌活检样本 NA NA NA NA
5991 2024-08-04
Research progress in isolation and identification of rumen probiotics
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 本文综述了瘤胃益生菌的分离和鉴定的经典技术及其最新进展 介绍了基于微滴的高通量细胞培养和单细胞测序的新技术及其在微生物培养和鉴定中的应用 大部分潜在益生菌仍未被成功培养,限制了相关研究的深入 旨在提供技术参考以促进瘤胃微生物学领域的发展 主要针对瘤胃益生菌的分离和鉴定技术 数字病理学 NA 高通量培养、单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
5992 2024-08-05
Revealing molecular and cellular heterogeneity in hypopharyngeal carcinogenesis through single-cell RNA and TCR/BCR sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文揭示了在低级和高级上皮内瘤变到癌变过程中,头颈部肿瘤HSCC的分子和细胞异质性 通过单细胞RNA和TCR/BCR测序,首次构建了不同疾病阶段的细胞动态转录组图谱,并揭示了主要分子 尚未完全理解在肿瘤形成过程中TME内不同细胞簇的具体变化及其影响 探究HSCC发展过程中的肿瘤微环境动态变化及机制 对来自不同阶段的HSCC组织样本中的60854个细胞进行研究 数字病理学 喉下癌 单细胞RNA测序和TCR/BCR测序 NA 细胞 九个组织样本 NA NA NA NA
5993 2024-08-05
Unraveling metabolic characteristics and clinical implications in gastric cancer through single-cell resolution analysis
2024, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞分辨率分析揭示了胃癌的代谢特征及其临床意义 利用单细胞RNA测序技术,首次深入探讨了不同细胞类型在胃癌中的代谢路径和调控机制 研究的局限性未在摘要中提及 综合研究胃癌中不同细胞类型的代谢路径及其调控机制 胃癌肿瘤样本和正常样本中的各种细胞类型 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 无监督聚类 RNA数据 NA NA NA NA NA
5994 2024-08-05
Single-cell transcriptome landscape elucidates the cellular and developmental responses to tomato chlorosis virus infection in tomato leaf
2024-Jul, Plant, cell & environment
研究论文 该研究揭示了病毒感染对番茄叶片细胞和发育的反应。 首次利用单细胞RNA测序分析病毒感染阶段的细胞类型特异性表达和表观遗传特征。 未探讨不同环境条件下病毒感染对细胞响应的影响。 研究植物细胞在病毒感染下的发育和响应机制。 健康和番茄黄化病毒感染的番茄叶片中的23226个单个细胞。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 23226个单个细胞 NA NA NA NA
5995 2024-08-04
Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-May-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究介绍了一种成本效益高的疾病建模方法,结合了混合的肿瘤类器官和单细胞RNA测序技术 提出了一种计算方法Vireo-bulk,有效分解混合RNA-seq数据,并揭示了供体iPSC系在巨噬细胞分化过程中的异质性 研究中未提及具体样本量和其他潜在的实验限制 旨在通过混合的bulk和单细胞RNA测序技术提高疾病建模的成本效益 以同源诱导多能干细胞分化的类器官为研究对象,探索疾病机制 数字病理学 肾脏疾病 RNA-seq NA RNA序列数据 NA NA NA NA NA
5996 2024-08-05
Investigation of ENO2 as a promising novel marker for the progression of colorectal cancer with microsatellite instability-high
2024-May-09, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了ENO2作为微卫星不稳定高(MSI-H)结直肠癌进展的潜在新标志物。 该研究首次揭示了ENO2在MSI-H结直肠癌中的中心基因作用,并建立了基于ENO2的预后预测模型。 该研究仅基于单细胞RNA测序数据,临床验证可能需要更多样本与多中心数据支持。 探索微卫星不稳定高结直肠癌的代谢转录组相关亚型并识别预后生物标志物。 微卫星不稳定高结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
5997 2024-08-04
A Clustering Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Automatic Weighting Penalty and Low-Rank Representation
2024 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种基于自动加权惩罚和低秩表示的单细胞RNA-Seq数据聚类方法 引入加权距离约束并结合相似性约束,提出JAGLRR聚类方法,提高了特征贡献的评估 未提及具体的局限性 改善现有单细胞RNA-Seq数据的聚类分析 单细胞RNA测序数据 数字病理学 NA RNA-Seq NA 数据集 8个真实数据集和模拟数据集 NA NA NA NA
5998 2024-08-04
A potential defensive role of TIM-3 on T lymphocytes in the inflammatory involvement of diabetic kidney disease
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了TIM-3在糖尿病肾病中T淋巴细胞的潜在防御作用 提出了TIM-3在糖尿病肾病进展中的保护性作用,并基于CD3+TIM-3+ T细胞的监测建议识别高风险患者 尚未完全了解各种T淋巴细胞亚群在糖尿病肾病中的调节机制 研究糖尿病肾病中T淋巴细胞的免疫检查点分子的功能及其对疾病进展的影响 360名糖尿病肾病成人患者和DKD小鼠模型的肾脏样本 数字病理 糖尿病肾病 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞测序(scRNA-seq) NA 图像和基因数据 360个糖尿病肾病患者 NA NA NA NA
5999 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of the maternal-fetal interface during ICP and normal pregnancy
2024-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians
研究论文 本研究揭示了在妊娠期肝内胆汁淤积(ICP)与正常妊娠中母-胎界面的细胞异质性和基因表达差异 首次应用单细胞RNA测序技术系统性分析了ICP与正常妊娠中胎盘的细胞类型、基因特征和功能变化 样本数量较小,仅分析了两名个体,可能影响结果的通用性 研究ICP影响胎盘的遗传机制 对比ICP和正常妊娠胎盘中母-胎界面的细胞类型和基因表达 数字病理学 妊娠期肝内胆汁淤积 单细胞RNA测序 NA 基因表达 2名个体,一名为ICP患者,一名为正常妊娠者 NA NA NA NA
6000 2024-08-04
Lapagyl mitigates UV-induced inflammation and immunosuppression via Foxp3+ Tregs and CCL pathway: A single-cell transcriptomics study
2024-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究评估了草本产品Lapagyl对紫外辐射引起的皮肤老化的疗效 揭示了Lapagyl通过调节Foxp3+ Tregs和CCL通路减轻皮肤炎症和免疫抑制的机制 模型建立在SKH-1无毛小鼠上,结果能否推广到人类尚需进一步验证 评估Lapagyl在对抗紫外辐射引起的皮肤老化中的有效性 研究对象为使用紫外辐射模型的SKH-1无毛小鼠 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 组织样本 SKH-1无毛小鼠 NA NA NA NA
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