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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-04-25
[Current applications and translational prospects of omics technologies in urothelial carcinoma]
2024-Nov-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
综述 本文综述了组学技术在尿路上皮癌诊断和治疗中的当前应用与转化前景 结合国家关键策略,深入探讨组学技术如何推动尿路上皮癌诊疗的新发展,包括单细胞组学和空间转录组学在细胞异质性和肿瘤微环境中的新见解 尚未提及具体局限性 探讨组学技术在尿路上皮癌诊疗中的应用和转化前景 尿路上皮癌 机器学习 尿路上皮癌 组学技术 NA NA NA NA NA NA NA
582 2026-04-25
Single-cell transcriptomics of rectal organoids from individuals with perianal fistulizing Crohn's disease reveals patient-specific signatures
2024-10-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过对肛周瘘管型克罗恩病患者直肠类器官进行单细胞转录组测序,揭示了患者特异性基因表达特征 首次利用单细胞转录组技术对直肠类器官进行分析,发现了与疾病、性别和祖源相关的基因表达特征,并确认类器官保留了干细胞和扩增区的疾病信号 类器官缺乏在病变粘膜上皮细胞中观察到的许多炎症信号,可能限制了其模拟炎症微环境的能力 探讨肛周瘘管型克罗恩病患者直肠上皮干细胞区室在转录水平上的病理决定因素 肛周瘘管型克罗恩病患者和健康对照的直肠类器官与粘膜上皮细胞 单细胞转录组学 克罗恩病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 13例患者(8例CD、5例对照)提供77,044个类器官细胞;29例患者(18例CD、11例对照)提供141,367个粘膜上皮细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
583 2026-04-25
Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab
2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
临床试验/研究论文 通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者在接受DKN-01联合纳武利尤单抗治疗前后的细胞状态,揭示治疗耐药机制 首次系统分类胆道癌恶性细胞状态(包括此前未描述的神经样和内皮样状态),并阐明联合免疫治疗的耐药机制 单臂II期试验未观察到客观缓解,样本量有限,需进一步验证细胞状态分类的普适性 探索胆道癌对DKN-01/纳武利尤单抗联合治疗的耐药机制 晚期胆道癌患者配对的治疗前和治疗中活检样本 数字病理学 胆道癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 晚期胆道癌患者(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
584 2026-04-25
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-Oct-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 通过初免-加强疫苗接种策略诱导源自中央记忆T细胞的肺部常驻记忆CD8+ T细胞,从而预防肿瘤肺转移 发现通过肌肉注射DNA疫苗初免后鼻腔喷注减毒流感病毒载体疫苗加强的免疫策略,能高效诱导肺部CD8+常驻记忆T细胞,并证实这些细胞来源于DNA疫苗诱导的中央记忆T细胞,且通过单细胞RNA测序揭示了其转录组重编程过程 未提及具体限制 探究疫苗诱导的肺部常驻记忆T细胞的来源及其在预防肿瘤肺转移中的作用 小鼠模型中的中央记忆T细胞、肺部常驻记忆T细胞及转移性黑色素瘤和间皮瘤 免疫学 黑色素瘤、间皮瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
585 2026-04-25
Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation
2024-05, Nature IF:50.5Q1
研究论文 揭示了门静脉周围区域富含一种表达Marco的免疫抑制性巨噬细胞,该细胞由肠道微生物群诱导,通过白细胞介素-10和Marco受体抑制炎症,其功能缺失会促进肝脏炎性疾病 首次通过活体成像和区域特异性单细胞转录组学发现门静脉周围区域存在免疫抑制性巨噬细胞,并鉴定出Odoribacteraceae菌科及其后生元isoallolithocholic acid诱导该细胞亚群,阐明了共生菌与肝脏免疫稳态之间的新机制 研究主要基于动物模型和体外验证,缺乏直接的人类临床数据支持 探究肝脏门静脉周围与中央静脉周围区域免疫系统的功能差异及其在炎症调控中的作用机制 肝脏门静脉周围区域富含Marco的免疫抑制性巨噬细胞及其与肠道微生物群的互作关系 免疫学 原发性硬化性胆管炎、非酒精性脂肪性肝炎 活体成像、区域特异性单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型及体外培养细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'基因表达分析平台
586 2026-04-25
spVC for the detection and interpretation of spatial gene expression variation
2024-04-19, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出 spVC 方法,用于检测和解释空间基因表达变异 基于广义泊松模型,整合协变量的常数和空间变化效应,提高连续表达模式捕获能力和可解释性 未明确提及局限性 开发一种统计方法来检测和解释空间转录组数据中的基因表达变异 空间转录组数据中的基因表达模式 数字病理学 NA 空间转录组学 广义泊松模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
587 2026-04-25
[Prediction of prognosis of patients with radical resection of intrahepatic cholangiocarcinoma based on single cell omics]
2024-Apr-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
研究论文 基于单细胞组学分析肝内胆管癌根治术后患者预后预测 首次通过单细胞测序整合多个数据集,识别与预后相关的关键上皮细胞亚群,并提出抗氧化型与非抗氧化型的ICC组织分型概念,构建预后预测模型 研究为回顾性病例系列,样本量有限,且模型验证仅基于公开数据集,可能需进一步外部验证 分析基于单细胞组学的肝内胆管癌根治术后患者预后预测 肝内胆管癌患者(46例单细胞测序、100例微阵列数据) 计算机视觉, 机器学习 肝内胆管癌 单细胞测序, 微阵列分析, ssGSEA算法, Cox比例风险模型 Cox比例风险模型 单细胞测序数据, 微阵列表达数据 46例患者(单细胞测序),100例患者(微阵列数据) Gene Expression Omnibus数据库, EMBI数据库 单细胞RNA测序 NA NA
588 2026-04-25
Elucidating the changes in the heterogeneity and function of radiation-induced cardiac macrophages using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示辐射诱导心脏巨噬细胞的异质性和功能变化 首次在辐射诱导心脏损伤动物模型中,表征早期阶段巨噬细胞的多样性、特征及演化 NA 探究辐射后心脏功能的早期变化及心脏巨噬细胞在此过程中的作用 辐射诱导心脏损伤小鼠模型中的心脏巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠心脏组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
589 2026-04-25
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞性和抑制炎症的关键作用 首次通过急性基因敲除实验证明ΔNp63在成年表皮中维持角质形成细胞增殖和自我更新,并抑制银屑病样炎症 仅在小鼠模型中研究,未在人体表皮中验证;ΔNp63敲除后细胞消失机制未完全阐明 探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其调控机制 成年小鼠表皮角质形成细胞 分子生物学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠表皮样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
590 2026-04-24
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts: diversity, topography, and perivascularity
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过结合成像空间转录组学(MERFISH)和免疫组化共染技术优化工作流程,系统分析了小鼠视网膜平铺片上神经节细胞的空间分布、多样性和血管周围性 首次在分子水平上全面描绘了视网膜神经节细胞(RGC)类型在二维视网膜表面的空间拓扑结构,鉴定了血管周围RGC类型并验证了其进化保守性和神经保护作用 主要基于小鼠模型,人类数据仅来自有限的组织样本;且工作流程需要薄切片可能丢失完整细胞形态信息 揭示视网膜神经节细胞类型在视网膜表面的空间组织规律及其与血管微环境的关系 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)及人类视网膜同源细胞类型 数字病理学 视神经疾病 MERFISH,免疫组织化学染色,视神经压迫模型 计算配准方法 图像 小鼠视网膜平铺片(数量未具体说明),人类视网膜组织样本 NA 空间转录组学 MERFISH 成像空间转录组学(MERFISH)结合免疫组化共染技术
591 2026-04-24
CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph nodes and blood following mRNA vaccination in humans
2024-Sep, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学评估mRNA疫苗接种后人类血液和淋巴结中CD4+ T细胞的转录表型 利用深度学习反向表位映射方法Trex预测抗原特异性,结合单细胞转录组学揭示了淋巴结和血液中刺突蛋白特异性CD4+ T细胞的异质性表型,并比较了疫苗接种与感染后的差异 未在论文标题和摘要中明确提及局限性 探究mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中CD4+ T细胞的转录表型特征 BNT162b2 mRNA疫苗接种者和SARS-CoV-2感染者的刺突蛋白特异性CD4+ T细胞 机器学习 NA 单细胞转录组学 深度学习模型Trex 单细胞转录组数据 1277个刺突特异性CD4+ T细胞(其中238个通过Trex方法预测) NA 单细胞RNA测序 NA NA
592 2026-04-24
Comprehensive single cell transcriptomics analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathways
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 对小鼠骨肉瘤进行单细胞转录组学分析,揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用及额外靶向通路 首次通过单细胞RNA测序在免疫活性转基因小鼠模型中全面分析Skp2敲除对骨肉瘤肿瘤异质性、微环境复杂性、转移和免疫激活的影响,并发现潜在逃逸机制 NA 探索Skp2在骨肉瘤中的功能及其作为治疗靶点的潜力,并揭示相关分子机制 小鼠骨肉瘤肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 骨肉瘤小鼠模型的原发肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
593 2026-04-24
Neutrophil extracellular traps induced by IL-1β promote endothelial dysfunction and aggravate limb ischemia
2024-06, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension IF:4.3Q1
研究论文 本研究探讨了IL-1β诱导的中性粒细胞胞外陷阱在肢体缺血中促进内皮功能障碍和加重缺血的机制 首次揭示IL-1β通过诱导NETs形成,并激活STAT1信号通路,导致内皮细胞激活和炎症,从而加重下肢缺血 文章未提及具体实验样本量及模型局限性 探究NETs在肢体缺血相关血管炎症和重塑中的功能意义 人类肢体缺血组织及小鼠缺血模型中的中性粒细胞和内皮细胞 数字病理学 下肢缺血,血管疾病 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,蛋白质印迹 NA 基因表达数据,图像,蛋白质表达数据 人类肢体缺血样本和小鼠缺血模型样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
594 2026-04-24
Immune microniches shape intestinal Treg function
2024-04, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过活体成像、光激活引导的单细胞RNA测序和空间转录组学,研究了肠道中免疫微环境如何塑造调节性T细胞的功能 首次揭示了固有层而非淋巴聚集区是支持效应调节性T细胞功能的关键微环境,并识别了CD206巨噬细胞与效应T细胞之间的耐受性相互作用 未说明 理解肠道免疫系统中调节性T细胞的空间组织和功能维持机制 小鼠肠道组织中对肝螺杆菌有反应的调节性T细胞 生物信息学 炎症性肠病 活体成像、光激活引导单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 图像、基因表达数据 小鼠肠道样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
595 2026-04-24
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 研究鉴定出一个由表观遗传控制的记忆星形胶质细胞亚群,该亚群在再刺激时表现出加剧的促炎反应,并促进中枢神经系统病理 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传记忆,并阐明ACLY-p300轴通过调控染色质可及性控制该记忆的形成 未明确记忆星形胶质细胞在人类多发性硬化症中的长期稳定性及与其他神经退行性疾病的关联 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性及其整合过去刺激事件的能力 星形胶质细胞和实验性自身免疫性脑脊髓炎与多发性硬化症模型 数字病理学 多发性硬化症 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序、染色质免疫沉淀测序、核酸靶向检测测序、CRISPR-Cas9基因编辑 NA 测序数据和图像数据 急性与慢性EAE小鼠模型及人类慢性多发性硬化症尸检样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq、ChIP-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞RNA测序用于单细胞转录组分析;Illumina NovaSeq用于测序文库测序
596 2026-04-24
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文描述了表观遗传调控的记忆性星形胶质细胞亚群,通过整合过去刺激事件加剧炎性反应,促进中枢神经系统病理过程 首次发现星形胶质细胞存在表观遗传控制的记忆亚群,并阐明ACLY-p300通路通过乙酰辅酶A调节染色质可及性来维持促炎记忆的机制 主要基于动物模型(EAE),人体验证仅限于MS慢性病灶的关联分析,记忆功能在人类中的直接证据有限 探究疾病相关星形胶质细胞亚群的稳定性、调控机制及其对后续刺激的响应能力 多发性硬化症(MS)及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中的星形胶质细胞 神经科学 多发性硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、ChIP-seq、FIND-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、组蛋白修饰数据 EAE模型小鼠(急性/慢性),以及慢性MS患者脑组织样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'转录组测序,Illumina NovaSeq高通量测序平台
597 2026-04-23
Unraveling the connection between Hashimoto's Thyroiditis and non-alcoholic fatty liver disease: exploring the role of CD4+central memory T cells through integrated genetic approaches
2024-08, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合遗传学方法探讨了桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的潜在联系 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化等方法,揭示了CD4+中央记忆T细胞在两种疾病中的上调,并鉴定出MAGI3等关键基因的因果关联 研究依赖于现有单细胞RNA测序数据,样本量可能有限,且功能验证不足 探索桥本甲状腺炎与非酒精性脂肪肝病之间的遗传学联系 桥本甲状腺炎患者、非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的CD4+中央记忆T细胞 生物信息学 桥本甲状腺炎, 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 细胞通讯分析, 代谢分析 NA 单细胞RNA测序数据 桥本甲状腺炎患者、非酒精性脂肪肝病患者及健康对照的样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
598 2026-04-23
Trem2 Agonist Reprograms Foamy Macrophages to Promote Atherosclerotic Plaque Stability-Brief Report
2024-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨了Trem2激动剂抗体AL002a在动脉粥样硬化小鼠模型中如何通过重编程泡沫巨噬细胞来促进斑块稳定性 首次在动脉粥样硬化模型中测试Trem2激动剂抗体的治疗潜力,并揭示其通过调节泡沫巨噬细胞转录组改善斑块稳定性的新机制 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类临床试验,且长期安全性和疗效未知 验证Trem2激动剂能否通过增强巨噬细胞存活和功能来改善动脉粥样硬化斑块稳定性 动脉粥样硬化易感小鼠(Ldlr-/-)及其主动脉斑块中的泡沫巨噬细胞 心血管疾病研究 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、体外细胞功能验证 动物疾病模型(小鼠) 基因表达数据、组织病理学图像 未明确说明具体数量,但涉及治疗组和对照组小鼠的主动脉样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
599 2026-04-23
A vagal reflex evoked by airway closure
2024-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究鉴定了一种由气道闭合触发的迷走神经反射,该反射会导致喘息,并揭示了表达PVALB的迷走神经元和表达PIEZO2的神经上皮小体在这一过程中的关键作用 首次描述了由气道闭合特异性触发的迷走神经反射通路,并确定了表达PVALB的迷走神经元和表达PIEZO2的神经上皮小体作为该反射的关键感受器 研究主要在小鼠模型中进行,其在人类中的直接适用性尚需验证;神经上皮小体在其他呼吸反射中的作用尚未完全阐明 揭示在气道闭合时维持呼吸功能的神经反射机制 小鼠的迷走神经感觉神经元、肺神经上皮小体 神经科学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序、体内迷走神经节成像、基因敲除 NA 基因表达数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
600 2026-04-22
A computational approach to assessing the prognostic implications of BRAF and RAS mutations in patients with papillary thyroid carcinoma
2024-11, Endocrine IF:3.0Q2
研究论文 本研究采用单细胞RNA测序技术,探讨了BRAF和RAS突变在甲状腺乳头状癌中的预后价值及其对疾病进展的影响 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRAF和RAS基因在甲状腺乳头状癌中的上调表达模式,并阐明了这些突变与肿瘤微环境中免疫相关通路改变的复杂相互作用 未明确说明样本的具体数量及临床随访数据,可能限制了预后评估的统计学效力 评估BRAF和RAS突变对甲状腺乳头状癌患者预后的影响,探索其分子机制 甲状腺乳头状癌组织样本及正常对照样本 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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