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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-07-06
Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma
2024-09-10, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过全基因组CRISPR/Cas9筛选发现H2AFY作为PD-1阻断抗体耐药的调控基因,揭示了其在高危神经母细胞瘤中通过表观遗传调控细胞状态和免疫原性的作用 首次发现H2AFY作为PD-1阻断疗法耐药的表观遗传调控因子,并通过多组学整合分析阐明其促进细胞向间充质样状态转变的机制 仅基于MYCN驱动的小鼠模型和有限的患者样本,且H2AFY在免疫微环境中的具体分子机制需进一步验证 探究高危神经母细胞瘤中与PD-1/L1轴免疫检查点疗法相关的癌细胞内在免疫调控网络 MYCN扩增的高危神经母细胞瘤细胞及小鼠模型 NA 神经母细胞瘤 CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序, 表观遗传学分析, 多组学整合分析 NA 单细胞测序数据, 转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'测序平台
42 2026-07-06
Itm2a expression marks periosteal skeletal stem cells that contribute to bone fracture healing
2024-09-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组学鉴定Itm2a作为骨膜骨骼干细胞的标记,揭示其在骨折愈合中的贡献 首次发现跨膜蛋白2A(Itm2a)作为骨膜骨骼干细胞(P-SSCs)的特异性标记,并展示了其在骨折愈合中的干细胞特性和治疗潜力 未明确提及 鉴定骨膜骨骼干细胞(P-SSCs)的体内身份及膜蛋白标记,以促进骨折愈合和组织工程 小鼠和人类的骨膜骨骼干细胞(Itm2a+ P-SSCs) 数字病理学 骨折 单细胞转录组学 不适用 基因表达数据 未明确提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞转录组学分析,使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序
43 2026-07-06
Type 1 innate lymphoid cells: a biomarker and therapeutic candidate in sarcoidosis
2024-09-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 使用单细胞RNA测序和空间转录组学分析发现ILC1是结节病的生物标志物和治疗候选靶点 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示结节病中基质-免疫CXCL12/CXCR4轴的上调及ILC1的积累,并证明ILC1可作为结节病的诊断生物标志物和潜在治疗靶点 主要基于皮肤样本和肺肉芽肿小鼠模型,可能不全面反映结节病的全身性特征 探索结节病中免疫细胞的特异性变化及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 结节病和非结节病肉芽肿性疾病患者的皮肤样本 数字病理学 结节病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 结节病和非结节病肉芽肿性疾病患者皮肤样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
44 2026-07-06
Retinal perivascular macrophages regulate immune cell infiltration during neuroinflammation in mouse models of ocular disease
2024-08-29, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 研究发现视网膜血管周围巨噬细胞在眼部疾病小鼠模型的神经炎症过程中调控免疫细胞浸润 首次揭示视网膜血管周围巨噬细胞通过表达促趋化转录组和血小板因子4(Pf4/CXCL4)作为标志物,并证明其在调控免疫细胞穿越血-视网膜屏障中的关键作用 主要基于小鼠模型和CCL2诱导的炎症模型,可能无法完全代表人类疾病复杂性;且未深入探讨Pf4在人类中的对应机制 阐明视网膜血管周围巨噬细胞在血-视网膜屏障功能和神经炎症中的功能 视网膜血管周围巨噬细胞及其在眼部炎症(糖尿病视网膜病变和葡萄膜炎)中的作用 数字病理学 糖尿病视网膜病变, 葡萄膜炎 单细胞RNA测序 Pf4Cre转基因小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明,但使用小鼠模型和CCL2注射实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
45 2026-07-06
Spatiotemporal transcriptomic mapping of regenerative inflammation in skeletal muscle reveals a dynamic multilayered tissue architecture
2024-08-27, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过时空转录组学解析骨骼肌再生炎症,揭示动态多层组织结构 首次整合空间转录组学与免疫荧光技术,发现受损肌纤维周围有序分布的巨噬细胞亚群形成功能性再生炎症区(RIZs),并揭示其组织结构和动态变化 主要基于小鼠模型,可能无法完全代表人类骨骼肌再生过程;间歇性糖皮质激素治疗的观察未深入探讨其长期影响 研究巨噬细胞在骨骼肌再生中的空间适应性和功能多样性,以及如何构建支持有效组织修复的有序组织架构 急性损伤和早期肌营养不良的骨骼肌组织中的髓系细胞(单核细胞、巨噬细胞和树突状细胞) 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 肌营养不良症 空间转录组学, 免疫荧光 NA 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
46 2026-07-06
Single-cell multiomic analysis identifies macrophage subpopulations in promoting cardiac repair
2024-08-27, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞多组学分析鉴定巨噬细胞亚群在促进心脏修复中的作用 利用时空单细胞表观基因组学分析,首次在再生(P1)和非再生(P10)小鼠心脏中鉴定出修复性Arg1+巨噬细胞和促炎性S100a9+Ly6c+单核细胞的不同作用,并通过阻断CXCR2趋化因子改善非再生心脏的伤口修复反应 研究仅限于小鼠模型,未在人类心脏组织中进行验证 阐明心脏单核吞噬细胞在心脏修复中的功能和细胞命运决定机制 再生(P1)和非再生(P10)小鼠心脏中的心脏单核吞噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞多组学分析、单细胞RNA测序、单细胞表观基因组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、单细胞表观基因组学数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞表观基因组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞表观基因组学分析平台
47 2026-07-06
Designing Oligonucleotide-Based FISH Probe Sets with PaintSHOP
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 介绍PaintSHOP平台用于设计基于寡核苷酸的FISH探针集 PaintSHOP是一个用户友好的网络平台,整合了大量预发现的探针库和功能序列数据库,并提供交互式工具用于探针设计 文中未明确讨论局限性 描述PaintSHOP平台在寡核苷酸FISH探针设计中的应用方法 DNA寡核苷酸FISH探针 数字病理学 NA 荧光原位杂交(FISH) NA 核酸序列 NA NA 空间转录组学, 空间基因组学 NA NA
48 2026-07-05
Score matching for differential abundance testing of compositional high-throughput sequencing data
2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种用于分析成分高通量测序数据的差异丰度检验方法cosmoDA 将α-β幂相互作用模型扩展以包含协变量信息,并结合广义分数匹配估计框架,开发出可减少相关特征导致的假阳性发现的差异丰度检验方案 未明确提及 开发一种能够准确表征异质群体中协变量依赖性并降低相关特征假阳性率的差异丰度检验方法 成分高通量测序数据,包括单细胞RNA-Seq和扩增子测序数据 机器学习 NA RNA-seq, 扩增子测序 α-β幂相互作用模型 成分计数数据 模拟数据和真实数据 NA 单细胞RNA-seq, 扩增子测序 NA NA
49 2026-07-05
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq revealed key genes for bone metastasis and chemoresistance in prostate cancer
2024-12, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示前列腺癌骨转移和化疗耐药的关键基因LDHA 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,系统识别出LDHA作为前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的关键基因,并通过细胞实验验证其功能 未提及具体的样本量和多中心验证,可能缺乏临床样本的进一步验证 探究前列腺癌进展、骨转移和化疗耐药的分子机制 前列腺癌相关基因和细胞系,包括PCa细胞和破骨细胞分化相关基质 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, TRAP染色 Lasso回归模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
50 2026-07-05
Immune responses in checkpoint myocarditis across heart, blood and tumour
2024-12, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、显微成像和蛋白质组学分析,研究免疫检查点抑制剂相关心肌炎在心脏、血液和肿瘤中的免疫反应 揭示了免疫检查点抑制剂相关心肌炎(irMyocarditis)中细胞毒性T细胞、传统树突状细胞和炎症性成纤维细胞在心脏组织中的共定位及频率增加,并发现心脏扩增的TCR克隆不识别假定的心脏自身抗原,且与肿瘤组织中的TCR库重叠性低 样本量有限(28例患者和41例健康对照),且未深入探讨心脏扩增TCRs与致命性心肌炎病例之间的具体机制 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制及其与抗肿瘤免疫的关系,并识别潜在生物标志物 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体的心脏、肿瘤和血液样本 数字病理学 免疫相关心肌炎 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 多重显微成像, 蛋白质组学分析 NA 图像, 文本, 蛋白质组数据 28例免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和41例未受影响个体(包括心脏细胞84,576个,血细胞366,066个) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA和TCR测序;Illumina NovaSeq用于测序
51 2026-07-05
Egfl6 promotes ovarian cancer progression by enhancing the immunosuppressive functions of tumor-associated myeloid cells
2024-11-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 发现Egfl6通过与β3整合素结合并激活p38和SYK信号,作为趋化因子促进髓系细胞迁移并使其分化至免疫抑制状态,从而推动卵巢癌进展 首次鉴定Egfl6作为髓系细胞功能的调节因子,阐明其通过β3整合素-p38/SYK信号轴促进肿瘤免疫抑制的机制,并证明Egfl6中和抗体可恢复抗PD-L1疗法的疗效 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,需进一步验证Egfl6在其他癌症类型中的作用及临床转化潜力 研究Egfl6在卵巢癌中调节肿瘤相关髓系细胞免疫抑制功能的机制 卵巢癌小鼠模型及人类卵巢癌组织样本 机器学 卵巢癌 NA NA NA 人类卵巢癌组织样本(未明确数量)及小鼠模型(同基因型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-07-05
Dual targeting macrophages and microglia is a therapeutic vulnerability in models of PTEN-deficient glioblastoma
2024-10-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 在PTEN缺失的胶质母细胞瘤模型中,双重靶向巨噬细胞和小胶质细胞是一种治疗脆弱性 首次发现巨噬细胞与微胶质细胞在GBM肿瘤微环境中呈负相关,并揭示LOX抑制通过NF-κB-PATZ1通路上调OLFML3表达,导致微胶质细胞代偿性浸润 未在人类临床试验中验证,仅限于小鼠模型 探究PTEN缺失型胶质母细胞瘤中巨噬细胞和微胶质细胞的相互作用及双重靶向的治疗潜力 PTEN缺失的胶质母细胞瘤小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞和微胶质细胞 数字病理学 脑癌 单细胞转录组学、多重顺序免疫荧光 NA 转录组数据、免疫荧光图像 PTEN缺失型GBM小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
53 2026-07-05
Endothelial YAP/TAZ activation promotes atherosclerosis in a mouse model of Hutchinson-Gilford progeria syndrome
2024-10-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞YAP/TAZ激活促进HGPS小鼠动脉粥样硬化 首次阐明内皮YAP/TAZ信号通路在HGPS血管病理中的关键作用,为开发靶向YAP/TAZ药物治疗早衰症相关动脉粥样硬化开辟新途径 未介绍 探究HGPS血管病变的分子机制,特别是内皮细胞中YAP/TAZ通路的作用 表达早衰蛋白的LmnaG609G/G609G小鼠及野生型对照小鼠的主动脉样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA-seq,原子力显微镜,超声评估 NA 基因表达数据,力学数据,超声图像 未明确样本数量,涉及HGPS模型小鼠和野生型对照小鼠 未明确 单细胞RNA-seq 未明确 未明确
54 2026-07-05
UnTWISTing intestinal fibrosis: single-cell transcriptomics deciphers fibroblast heterogeneity, uncovers molecular pathways, and identifies therapeutic targets
2024-09-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示肠道纤维化中成纤维细胞异质性、分子通路并识别治疗靶点 首次鉴定出TWIST1+FAP+成纤维细胞亚群与CXCL9+巨噬细胞的相互作用,并发现TWIST1是纤维化微环境的关键调节因子 NA 解析肠道纤维化的细胞和分子机制 克罗恩病相关的肠道纤维化组织中的成纤维细胞和巨噬细胞 数字病理学 克罗恩病, 肠道纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-07-05
PAC1 constrains type 2 inflammation through promotion of CGRP signaling in ILC2s
2024-09-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 PAC1通过促进ILC2中的CGRP信号传导来约束2型炎症 发现PAC1以细胞内在方式选择性促进ILC2对CGRP信号的响应,并揭示其在2型炎症相关疾病中的调控作用 NA 探究ILC2如何内在调控对神经信号的响应及其在2型炎症中的作用 小鼠和人体的2型先天淋巴样细胞(ILC2s) NA 哮喘、肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型和人体外周血ILC2样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
56 2026-07-05
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病肠道纤维化发病机制中TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 首次鉴定出FAP+成纤维细胞是纤维化肠道中ECM产生最多的关键亚型,并发现TWIST1作为潜在治疗靶点 未提及具体局限性 阐明克罗恩病肠道纤维化的细胞和分子机制 克罗恩病伴肠梗阻患者的纤维化和非纤维化回肠组织 数字病理学 克罗恩病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
57 2026-07-05
Single-cell RNA sequencing of cells from fresh or frozen tissue reveals a signature of freezing marked by heightened stress and activation
2024-04, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析新鲜或冷冻组织中的细胞,发现冷冻会激活应激和活化相关基因表达 首次系统比较新鲜与冷冻组织单细胞RNA测序数据,揭示冷冻过程对细胞转录组的特异性影响模式 主要聚焦于T细胞、ILC和NK细胞亚群,其他免疫细胞类型可能具有不同冷冻敏感性 评估冷冻保存对单细胞RNA测序结果的影响 人类组织中的T细胞、固有淋巴细胞(ILC)和自然杀伤(NK)细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
58 2026-07-05
Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 描述了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞并进行单细胞转录组分析的方法 首次在转录组水平上深入表征调节性B细胞,超越了表面标志物的传统方法 未提供实验结果的验证或大规模样本分析 建立调节性B细胞的分离方案以进行单细胞转录组分析,探究其在自身免疫和癌症免疫中的作用 从狼疮易感小鼠中分离的调节性B细胞 自然语言处理 自身免疫性疾病(狼疮) 单细胞RNA测序 NA 转录组数据(单细胞RNA测序) 狼疮易感MRL/lpr小鼠(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序
59 2026-07-04
Dysregulated Treg repair responses lead to chronic rejection after heart transplantation
2024-12-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型,揭示心脏移植后IL-33+成纤维细胞与受体Treg之间的失调修复反应导致慢性排斥的机制 首次发现Treg分泌的双调蛋白(Areg)在慢性排斥反应中促进成纤维细胞增殖和纤维化,颠覆了传统认为Treg修复功能有益的观点 主要基于MHC-II不匹配小鼠模型,人类样本验证规模有限,且未涉及其他免疫抑制方案的影响 阐明心脏移植后慢性排斥反应中IL-33/Areg通路介导的失调修复机制 MHC-II不匹配心脏移植小鼠模型、临床心脏移植患者样本 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 MHC-II不匹配小鼠心脏移植模型(IL-33缺陷供体/Treg特异性Areg缺陷受体)及临床心脏移植患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
60 2026-07-04
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-12, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 研究了早期引入高浓度精料导致羔羊瘤胃上皮角化不全的机制,发现瘤胃丁酸过度积累通过阻断角质形成细胞分化引发该病 首次通过单细胞RNA测序揭示早期断奶羔羊瘤胃上皮从分化角质细胞到终末分化角质细胞的转变受阻,并利用瘤胃类器官模型验证高剂量丁酸直接导致角化不全 未提及具体限制,但模型仅针对新生羔羊且局限于短期观察 阐明瘤胃上皮角化过程及其影响因素,特别是早期营养干预策略对瘤胃健康的影响 新生羔羊瘤胃上皮组织及类器官 机器学习和单细胞组学 反刍动物消化系统疾病 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, 代谢组学分析 NA 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 组织切片图像 24只14日龄羔羊,分为三组(母乳、母乳+苜蓿干草、母乳+玉米大豆精料启动) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒
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