单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-07-08	Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells 2024-03-13, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03670-y PMID:38475896	研究论文	本文研究了人类表皮干细胞（SCs）的细胞周期持续时间（CCD），发现与传统观点相反，SCs的细胞周期比更分化的祖细胞（CPs）更短	挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点，揭示了人类表皮干细胞具有更短的细胞周期持续时间	研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞，未涉及体内环境或其他类型的干细胞	探究人类表皮干细胞的细胞周期特性及其与分化祖细胞的差异	人类角质形成细胞（包括干细胞和分化祖细胞）	细胞生物学	NA	活细胞成像、单细胞RNA测序	NA	图像数据、基因表达数据	初始传代的人类角质形成细胞
42	2025-07-08	Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome 2024-Feb-19, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1 PMID:38463959	研究论文	研究探讨了PEG化血小板生成素模拟肽JNJ-26366821（TPOm）如何通过刺激骨髓血管和基质微环境来缓解急性辐射综合征（ARS）	首次阐明了TPOm通过调节骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞和祖细胞（HSPCs）再生的机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探索TPOm作为治疗急性辐射综合征（ARS）的潜在医疗对策	C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞和祖细胞（HSPCs）、内皮细胞（ECs）和间充质基质细胞（MSCs）	放射医学	急性辐射综合征	流式细胞术、全组织共聚焦显微镜、单细胞RNA测序	小鼠模型	实验数据	C57BL/6J小鼠（9-14周龄）
43	2025-07-07	B-cell-directed CAR T-cell therapy activates CD8+ cytotoxic CARneg bystander T cells in patients and nonhuman primates 2024-07-04, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2023022717 PMID:38558106	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探索了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CARneg旁观者T细胞的激活及其在增强肿瘤反应中的潜力	首次全面鉴定和分析了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CARneg旁观者CD8+ T细胞的表型和转录组特征，揭示了其通过非T细胞受体依赖机制高效杀伤白血病细胞的新机制	研究样本量有限，且主要基于非人灵长类动物模型和部分患者样本，需要更大规模的临床研究验证	探索CAR T细胞治疗后CARneg旁观者T细胞的激活机制及其在抗白血病反应中的作用	非人灵长类动物和患者的T细胞	免疫治疗	B细胞恶性肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	非人灵长类动物模型和患者样本（临床试验#NCT03369353）
44	2025-07-06	Biallelic variants in POPDC2 cause a novel autosomal recessive syndrome presenting with cardiac conduction defects and variable hypertrophic cardiomyopathy 2024-Jul-05, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.07.04.24309755 PMID:39006410	研究论文	研究发现POPDC2基因的双等位基因变异会导致一种新型常染色体隐性遗传综合征，表现为心脏传导缺陷和可变性肥厚型心肌病	首次将POPDC2基因的双等位基因变异与人类心脏传导缺陷和肥厚型心肌病联系起来，并揭示了其分子机制	患者肌肉活检未显示明显的肌病，且样本量较小（4个家族）	探究POPDC2基因变异与心脏传导缺陷和肥厚型心肌病的关联	4个携带POPDC2双等位基因变异的家族	遗传学	心血管疾病	同源建模、电生理研究、单细胞RNA测序	NA	遗传数据、电生理数据、RNA测序数据	4个家族（具体人数未明确）和超过100万人的群体遗传数据
45	2025-07-06	Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis 2024-04-30, Clinical oral investigations IF:3.1Q1 DOI:10.1007/s00784-024-05659-6 PMID:38684576	研究论文	本研究通过全外显子测序等技术，鉴定了一个与Coffin-Siris综合征（CSS）患者牙齿发育不全相关的新SOX4突变，并探索了其潜在的调控机制	首次报告了SOX4错义突变导致综合征性牙齿发育不全，并验证了Sox4在小鼠牙齿发育过程中的高表达及其在牙齿发育通路中的核心作用	研究仅针对一名中国CSS患者，样本量较小，且未进行功能实验验证突变的具体机制	鉴定CSS患者牙齿发育不全的致病突变并探索其调控机制	Coffin-Siris综合征（CSS）患者和小鼠牙齿发育过程	遗传学	Coffin-Siris综合征	全外显子测序、Sanger验证、单细胞RNA测序、荧光原位杂交（FISH）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	基因组数据、RNA测序数据	一名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本
46	2025-07-05	Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions 2024-Dec, PRX life DOI:10.1103/prxlife.2.043009 PMID:40585428	research paper	该研究通过分析单细胞RNA测序数据，探讨了细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制	揭示了细胞表型转变过程中基因调控网络社区间相互作用的动态变化模式，并提出了一个普遍原则：在细胞表型转变过程中，社区间相互作用增加以协调全局基因表达重编程	研究仅分析了五种细胞转变过程，可能无法涵盖所有类型的细胞表型转变	探究细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制	五种不同的细胞转变过程	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	transition path theory	RNA-seq数据	五种不同的细胞转变过程
47	2025-07-05	Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET 2024-Nov-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05821-4 PMID:39548496	研究论文	该研究通过单细胞转录组学分析，揭示了促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤（PitNET）中基因表达特征与临床病理特征的联系	首次在PitNET中系统比较了促性腺激素和催乳素亚型的肿瘤微环境差异，并发现了与肿瘤侵袭性相关的淋巴细胞亚群	样本量相对较小（7例促性腺激素和3例催乳素PitNET），且主要关注两种亚型	探究PitNET肿瘤微环境与肿瘤侵袭性行为的关系	促性腺激素和催乳素垂体神经内分泌肿瘤	数字病理学	垂体神经内分泌肿瘤	单细胞RNA测序，bulk RNA-seq，免疫组化	NA	基因表达数据，组织切片图像	10例单细胞测序样本（7例促性腺激素+3例催乳素），134例bulk RNA-seq样本
48	2025-07-05	The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2 2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028 PMID:38796708	研究论文	本文探讨了PSMP/MSMP作为急性肾损伤（AKI）的新型潜在治疗靶点，通过CCR2促进AKI的机制	首次揭示了PSMP在AKI中的关键作用，并证明PSMP中和抗体可作为AKI的治疗药物	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证PSMP中和抗体的疗效	探索PSMP在AKI中的作用机制并评估其作为治疗靶点的潜力	AKI患者和小鼠模型	肾脏病学	急性肾损伤	单细胞RNA测序	AKI小鼠模型（肾缺血再灌注损伤、甘油和顺铂诱导）	RNA测序数据、临床样本数据	AKI患者和小鼠模型，具体样本量未明确说明
49	2025-07-05	S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis 2024-06-28, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06849-6 PMID:38942784	研究论文	本文研究了S100A8/A9高表达的中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷在脓毒症期间诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制	揭示了S100A8/A9通过下调Nrf1表达抑制线粒体复合物I中的Ndufa3表达，进而导致线粒体功能障碍和PANoptosis的新机制	研究主要基于体外实验和测序分析，缺乏在体实验验证	探究S100A8/A9在脓毒症期间诱导内皮细胞功能障碍的分子机制	中性粒细胞和内皮细胞	分子生物学	脓毒症	scRNA-seq, bulk RNA-seq	NA	测序数据	NA
50	2025-07-05	Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization 2024-06-21, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06840-1 PMID:38906852	研究论文	通过单核RNA测序和空间转录组学对58,081个细胞核进行综合分析，揭示了颅咽管瘤的免疫微环境特征及其细胞间网络	首次通过多组学整合分析揭示了颅咽管瘤的免疫抑制微环境特征，并发现了一种与肿瘤角质化相关的调控网络	样本量相对有限，且研究结果需要进一步的功能验证	阐明颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与肿瘤进展的关系	颅咽管瘤(ACP)样本	数字病理学	颅咽管瘤	单核RNA测序(snRNA-seq), 空间转录组学, asmFISH	NA	单细胞转录组数据, 空间转录组数据	58,081个细胞核
51	2025-07-05	CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1 2024-06-19, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06816-1 PMID:38898019	研究论文	本研究揭示了CSTF3通过调节lncRNA NEAT1的选择性多聚腺苷酸化（APA）在卵巢癌铂类耐药中的作用机制	首次发现CSTF3通过调控NEAT1的APA过程生成短亚型NEAT1_1，从而促进卵巢癌铂类耐药的新机制	研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证	探索卵巢癌铂类耐药的分子机制	卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织	癌症生物学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据集
52	2025-07-05	CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity 2024-06-19, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06784-6 PMID:38898023	研究论文	本研究探讨了CXCR7激活通过重塑CXCL12介导的免疫反应，增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效	发现了CXCR7作为CXCL12的非典型受体在肿瘤细胞中的负调控作用，并验证了选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAM诱导的免疫抑制，增强抗PD-L1抗体的治疗效果	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证	探索通过靶向CXCR7-CXCL12轴增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制	胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)和T细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	转录组分析、单细胞转录组测序、体外共培养系统	小鼠胶质母细胞瘤模型	转录组数据、单细胞测序数据、体外实验数据	未明确说明样本数量，但使用了复发胶质母细胞瘤标本、公共胶质母细胞瘤数据集和小鼠模型
53	2025-07-05	Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2 2024-06-18, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06820-5 PMID:38890311	研究论文	本研究探讨了中性粒细胞反向迁移（rM）的机制，发现趋化因子受体样2（Ccrl2）及其配体chemerin在这一过程中起关键作用	首次揭示了chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞离开炎症部位的新机制	研究主要基于小鼠模型，人体中的相关性尚需验证	探索中性粒细胞反向迁移的分子机制	中性粒细胞及其迁移行为	免疫学	急性肺损伤	scRNA-seq、气袋模型	NA	基因表达数据、细胞追踪数据	小鼠急性肺损伤模型
54	2025-07-05	The Mohawk homeobox gene represents a marker and osteo-inhibitory factor in calvarial suture osteoprogenitor cells 2024-06-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06813-4 PMID:38886383	研究论文	该研究揭示了Mohawk同源盒基因（Mkx）在小鼠颅骨缝合间充质祖细胞中作为骨抑制因子的作用及其在骨修复中的机制	首次发现Mkx基因在颅骨缝合间充质祖细胞中作为骨抑制因子，并证明其机械响应性调控骨分化的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	探究Mkx基因在颅骨缝合间充质祖细胞中的功能及其在骨修复中的作用机制	小鼠颅骨缝合间充质祖细胞	骨生物学	骨修复障碍	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、基因敲除/敲低、机械拉伸实验	基因报告小鼠模型（Mkx; R26R）	基因表达数据、细胞表型数据	未明确说明具体样本量（使用转基因小鼠模型）
55	2025-07-05	Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma 2024-06-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06699-2 PMID:38886351	研究论文	提出一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，通过SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫	首次提出基于三种常见抗肿瘤药物的协同免疫化疗策略，并揭示其通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控免疫微环境的机制	研究主要基于PDX小鼠模型，临床样本量可能有限	开发针对晚期肝细胞癌的有效治疗方案	肝细胞癌患者和PDX小鼠模型	肿瘤免疫治疗	肝细胞癌	单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色	PDX小鼠模型	RNA测序数据、免疫荧光图像数据	未明确说明具体样本量，涉及PDX小鼠模型和临床患者数据
56	2025-07-05	MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing 2024-06-12, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06775-7 PMID:38866777	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集，并通过调控EGFR/SREBP-1通路促进脂质代谢，影响癌细胞增殖和迁移	首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制，并筛选出小分子抑制剂sarizotan	研究主要基于体外实验和类器官模型，尚未进行大规模临床验证	探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗靶点	肝内胆管癌细胞及类器官模型	肿瘤生物学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP	类器官模型	RNA测序数据、代谢物数据	未明确说明具体样本数量
57	2025-07-05	Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration 2024-Mar-28, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1 PMID:38585871	研究论文	通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用	发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群，该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用	研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制	探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能	骨骼肌损伤后的巨噬细胞	单细胞测序	肌肉损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	不同时间点的骨骼肌单细胞样本
58	2025-07-04	Tppp3 is a novel molecule for retinal ganglion cell identification and optic nerve regeneration 2024-12-29, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01917-6 PMID:39734233	研究论文	本文研究了Tppp3在视网膜神经节细胞(RGCs)神经保护和轴突再生中的作用	首次揭示了Tppp3在哺乳动物轴突再生中的作用，并开发了一种新的RGC神经保护和轴突再生治疗策略	研究仅基于啮齿动物模型，尚未在人类中进行验证	探索促进中枢神经系统(CNS)轴突再生的分子调节剂	视网膜神经节细胞(RGCs)和视神经	再生医学	中枢神经系统损伤	单细胞RNA测序，批量RNA测序	视神经挤压(ONC)模型	RNA测序数据	小鼠、猕猴和人类的RGCs
59	2025-07-04	BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences 2024-12-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01906-9 PMID:39696694	研究论文	研究探讨了利鲁唑（RZ）通过增加BDNF水平逆转颅脑放射治疗引起的认知衰退和神经退行性后果的效果	首次在颅脑放射治疗小鼠模型中验证了RZ通过增加BDNF水平改善认知功能的作用机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证	探索缓解放射治疗引起的认知功能障碍（RICD）的神经保护方法	接受颅脑放射治疗的小鼠模型	神经科学	脑癌	空间转录组学分析、双免疫荧光染色、生化评估	小鼠模型	基因表达数据、行为学数据	接受9 Gy颅脑放射的成年小鼠，分为RT+Vehicle和RT+RZ组
60	2025-07-04	Spatial transcriptomics in focal cortical dysplasia type IIb 2024-11-30, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1 DOI:10.1186/s40478-024-01897-7 PMID:39614299	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，探究了局灶性皮质发育不良IIb型（FCD IIb）中异常神经元和气球细胞区域的转录变化	首次在FCD IIb中构建了异常神经元和气球细胞区域的转录组空间图谱，揭示了这些区域在mTOR信号通路、自噬和炎症反应中的潜在作用	样本量较小（仅3例患者），可能影响结果的普遍性	探究FCD IIb中异常神经元和气球细胞区域的分子特征及其在癫痫发生中的作用	局灶性皮质发育不良IIb型患者的脑组织样本	数字病理学	癫痫	空间转录组学	NA	转录组数据	3例FCD IIb患者的新鲜冷冻脑组织样本