单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-09-11	Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow 2024-Sep-09, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008 PMID:39255776	研究论文	本文揭示了胶质母细胞瘤通过招募和分化颅骨骨髓中的树突状“杂交”中性粒细胞来抑制肿瘤生长的机制	首次发现具有树突状特征的中性粒细胞亚群来源于颅骨骨髓而非循环系统，并证实其通过抗原呈递激活T细胞抗肿瘤免疫	NA	探究肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤中的生物学作用及来源机制	胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中的中性粒细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	scRNA-seq（单细胞RNA测序）、标记颅骨移植、靶向消融	NA	基因表达数据、细胞功能实验数据	患者和小鼠胶质母细胞瘤样本（具体数量未明确说明）
42	2025-09-11	Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis 2024-07-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae028 PMID:38289873	研究论文	本研究利用翻译核糖体亲和纯化测序技术鉴定动脉粥样硬化中平滑肌细胞特异性基因表达，发现Itih4作为新型标志基因	首次建立SMC特异性TRAP小鼠模型（SMCTRAP-AS），并发现Itih4等多个既往未报道与动脉粥样硬化SMCs相关的基因	研究基于转基因小鼠模型，结果向人类临床转化的适用性需进一步验证	解析动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的基因表达特征	SMCTRAP和SMCTRAP-AS转基因小鼠的胸主动脉样本	分子生物学	心血管疾病	TRAP-seq（翻译核糖体亲和纯化测序）、免疫荧光染色、空间转录组学	NA	测序数据、图像数据	15月龄SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的主动脉样本
43	2025-09-11	Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction 2024-07-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae075 PMID:38666458	研究论文	本研究探讨丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的调控作用	首次揭示SerpinA3n通过调节基质功能和炎症反应影响心肌梗死后心脏修复的因果机制	研究基于小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证	理解Serpins在心肌梗死后瘢痕形成调控中的作用	心肌梗死小鼠模型	心血管疾病研究	心血管疾病	条件性基因敲除、单细胞转录组学、蛋白质组学、组织学分析	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据	使用SerpinA3n条件性敲除小鼠模型进行研究
44	2025-09-11	Small nucleolar RNA host gene 18 controls vascular smooth muscle cell contractile phenotype and neointimal hyperplasia 2024-05-29, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae055 PMID:38498586	研究论文	本研究揭示长链非编码RNA SNHG18通过调控miR-22-3p维持血管平滑肌细胞收缩表型并抑制损伤诱导的新内膜增生	首次发现SNHG18在血管疾病中的功能作用，并阐明其通过竞争性结合ADAR2调控miR-22生物合成的新机制	NA	探索SNHG18在血管平滑肌细胞表型调控和血管损伤修复中的作用	小鼠和人类血管平滑肌细胞及动脉组织	分子生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序、转录组分析、功能获得/缺失实验	NA	RNA测序数据、基因表达数据	小鼠和人类动脉样本（具体数量未明确说明）
45	2025-09-11	Interleukin-1 receptor accessory protein blockade limits the development of atherosclerosis and reduces plaque inflammation 2024-05-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae046 PMID:38563353	研究论文	研究使用新型抗IL1RAP阻断抗体探究其在动脉粥样硬化中的作用，发现阻断IL1RAP可减小斑块大小并减轻炎症	首次使用非消耗性IL1RAP阻断抗体，并揭示其通过抑制趋化因子产生减少斑块炎症和负担的机制	研究基于小鼠模型，人类应用需进一步验证；样本量未明确说明	探究IL1RAP在动脉粥样硬化发展中的作用及治疗潜力	载脂蛋白E缺陷小鼠（Apoe-/-）和人类动脉粥样硬化斑块样本	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析、体外细胞实验	NA	基因表达数据、细胞表型数据、组织图像数据	NA（具体数量未在摘要中说明）
46	2025-09-11	Cardiac and perivascular myofibroblasts, matrifibrocytes, and immune fibrocytes in hypertension; commonalities and differences with other cardiovascular diseases 2024-05-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae044 PMID:38395029	综述	本文讨论了高血压中心脏和血管周围成纤维细胞亚群（包括肌成纤维细胞、基质纤维细胞和免疫纤维细胞）的更新定义、调控机制及其在心血管病理生理中的作用	强调了基质纤维细胞和免疫纤维细胞在心血管纤维化中的新作用，并整合了谱系追踪和单细胞RNA测序研究的新知识	分子机制导致成纤维细胞活化的具体途径仍大部分未知，且适应性与适应不良性纤维化的转化条件需进一步明确	探讨高血压及相关心血管疾病中成纤维细胞亚群的分类、调控机制及病理作用	心脏和血管周围的成纤维细胞亚群（肌成纤维细胞、基质纤维细胞、免疫纤维细胞）	心血管病理学	心血管疾病	谱系追踪，单细胞RNA测序	NA	NA	NA
47	2025-09-11	An update on periodontal inflammation and bone loss 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1385436 PMID:38919613	综述	本文更新了关于牙周炎症和骨丢失的最新研究进展，重点探讨了牙周病的免疫反应机制及其系统性影响	利用scRNA-seq和动物研究提供了对牙周病免疫反应的新见解，强调了菌群失调在疾病发生发展中的关键作用	NA	探讨牙周病的免疫机制及其与系统性疾病的关联，以开发新的治疗策略	牙周病及其相关的免疫细胞和口腔微生物组	NA	牙周病	scRNA-seq	NA	NA	NA
48	2025-09-10	Diethylhexyl phthalate induces immune dysregulation and is an environmental immune disruptor 2024-12-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136244 PMID:39442302	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）对小鼠免疫系统的抑制作用及其在脓毒症中的恶化效应	首次在单细胞分辨率层面系统阐述DEHP通过抑制炎症信号和热休克蛋白表达导致免疫失调的机制，并建立其与环境免疫干扰现象的关联	研究局限于小鼠模型，人类免疫系统的直接响应仍需进一步验证	探究DEHP对免疫系统的影响及其作为环境免疫干扰物的潜在危害	小鼠脾脏组织及外周血免疫细胞	免疫毒理学	免疫系统疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），盲肠结扎穿刺（CLP）模型	NA	基因表达数据	小鼠脾脏组织样本（具体数量未明确说明）
49	2025-09-10	Pulmonary surfactant biogenesis blockage mediated polyhexamethylene guanidine disinfectant induced pulmonary fibrosis 2024-12-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136307 PMID:39488979	研究论文	本研究探讨了聚六亚甲基胍消毒剂通过阻断肺表面活性物质生物合成诱导肺纤维化的机制	首次揭示PHMG通过破坏自噬流导致肺表面活性物质生物合成阻断的具体分子机制	NA	阐明PHMG消毒剂吸入暴露诱导肺纤维化的毒理学机制	肺泡II型上皮细胞(AT2细胞)	毒理学	肺纤维化	scRNA-seq分析	NA	单细胞转录组数据	NA
50	2025-09-10	Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease 2024-Feb-15, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.173437 PMID:38358820	研究论文	本研究探讨了狼疮患者皮肤成纤维细胞的炎症反应和纤维化表型在瘢痕形成中的作用	揭示了SLE成纤维细胞对炎症的过度反应特性，并发现瘢痕与非瘢痕患者存在差异反应机制，TGF-β被鉴定为关键上游调节因子	样本量有限（22例患者和34例对照），仅针对皮肤组织进行分析	阐明皮肤红斑狼疮患者瘢痕形成的细胞机制和成纤维细胞的作用	系统性红斑狼疮（SLE）和皮肤红斑狼疮（CLE）患者的皮肤成纤维细胞	细胞生物学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、体外细胞因子刺激实验	NA	基因表达数据、细胞实验数据	22例SLE和CLE患者非皮损皮肤样本，34例健康对照样本
51	2025-09-09	Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models 2024-Dec-31, Biostatistics (Oxford, England) DOI:10.1093/biostatistics/kxaf024 PMID:40795862	研究论文	提出一种基于广义双线性模型的单细胞RNA测序数据降维新方法scGBM	开发了快速估计算法处理大规模数据集，并能量化低维表示中的不确定性	NA	解决单细胞RNA测序数据降维中的虚假异质性问题	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq	Poisson bilinear model	基因表达计数数据	可扩展至数百万个细胞的数据集
52	2025-09-09	Impaired innate and adaptive immune responses to BNT162b2 SARS-CoV-2 vaccination in systemic lupus erythematosus 2024-03-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.176556 PMID:38456511	研究论文	本研究全面分析了系统性红斑狼疮患者接种BNT162b2疫苗后的先天和适应性免疫应答，并与健康对照组进行比较	首次在SLE患者中同时评估疫苗诱导的先天免疫和适应性免疫应答，并发现免疫抑制治疗仅影响抗体应答而非T细胞应答	样本量较小（19例SLE患者），且未评估疫苗对临床保护效果的影响	评估SLE患者对BNT162b2疫苗的免疫应答特性	19例系统性红斑狼疮患者和56例健康对照志愿者	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），中和抗体检测，T细胞应答分析	NA	基因表达数据，免疫测定数据	19例SLE患者和56例健康对照
53	2025-09-09	A mouse model of Zhu-Tokita-Takenouchi-Kim syndrome reveals indispensable SON functions in organ development and hematopoiesis 2024-03-08, JCI insight IF:6.3Q1 DOI:10.1172/jci.insight.175053 PMID:38290089	研究论文	本研究开发了ZTTK综合征的小鼠模型，揭示了SON基因在器官发育和造血中的关键作用	首次创建了Son单倍体不足小鼠模型，成功模拟人类ZTTK综合征表型，并通过单细胞转录组分析揭示了造血谱系发育异常的分子机制	研究仅使用小鼠模型，尚未在人类细胞或临床样本中进行直接验证	探究SON基因功能缺失在器官发育和造血过程中的作用机制	Son+/-基因敲除小鼠	生物医学研究	ZTTK综合征	基因敲除、表面标志物分析、单细胞转录组测序	动物模型	基因表达数据、表型数据	未明确说明具体样本数量，使用Son+/-小鼠模型
54	2025-09-09	Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17 PMID:38819570	研究论文	比较分析空间转录组学（ST）数据处理方法，重点关注Visium平台的分析流程	首次系统比较Visium平台分析流程中不同spot选择和基因组/转录组参考对结果的影响	仅针对制造商提供的软件套件进行分析，未涵盖其他ST平台或自定义分析方法	解析空间转录组学数据分析的关键挑战和方法比较	10x Visium技术产生的空间转录组数据	生物信息学	NA	空间转录组学（ST）、RNA-Seq、显微成像	NA	基因表达数据、显微镜图像	数千个micrometer scale spots（具体数量未明确说明）
55	2025-09-07	Single-cell analyses reveal that monocyte gene expression profiles influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts 2024-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.11.12.623270 PMID:39605411	研究论文	通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞基因表达谱影响急性治疗队列中HIV-1病毒库的大小	首次通过无偏倚高通量单细胞测序揭示单核细胞基因表达与HIV-1病毒库大小的负相关关系，并发现IL1B通过NF-κB通路具有天然潜伏逆转活性	样本量相对有限（初始队列14人，验证队列38人），且主要聚焦急性感染期开始ART治疗的人群	研究宿主基因表达差异是否调节抑制性ART治疗期间HIV-1病毒库的大小	HIV-1感染个体（急性感染期开始ART治疗且病毒抑制有效但总HIV-1 DNA量不同的参与者）	生物信息学	艾滋病	scRNA-seq, IPDA	NA	单细胞RNA测序数据	初始队列14人，验证队列38人
56	2025-09-07	Liquid Biopsy for Proliferative Diabetic Retinopathy: Single-Cell Transcriptomics of Human Vitreous Reveals Inflammatory T-Cell Signature 2024 Nov-Dec, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2024.100539 PMID:39220810	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示增殖性糖尿病视网膜病变患者玻璃体中T细胞的炎症特征	首次对疾病状态下人类玻璃体进行单细胞转录组表征，发现PDR玻璃体主要由T细胞组成且中性粒细胞基本缺失	样本量较小（5名患者6只眼睛），属于病例系列研究	识别PDR中可靶向的细胞类型及信号通路，探索玻璃体液活检的可行性	增殖性糖尿病视网膜病变患者的玻璃体和外周血细胞	数字病理学	糖尿病视网膜病变	scRNA-seq（单细胞RNA测序），Chromium 10x平台	NA	单细胞转录组数据	5名成年患者（6只眼睛）的玻璃体细胞和外周血单核细胞
57	2025-09-07	MultiSC: a deep learning pipeline for analyzing multiomics single-cell data 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae492 PMID:39376034	研究论文	提出一种名为MultiSC的深度学习流程，用于整合和分析多组学单细胞数据	开发了新型多模态约束自编码器和基于矩阵分解的模型，有效整合三种组学数据类型并预测转录因子调控的靶基因	NA	解决多组学单细胞数据整合分析工具缺乏的问题，提供全面的细胞活动和基因调控网络分析	单细胞多组学数据（基因表达、染色质可及性、转录因子蛋白表达）	机器学习	NA	NEAT-seq多组学测序技术	多模态约束自编码器（single-cell hierarchical constraint autoencoder）、基于矩阵分解的模型（scMF）、多元线性回归模型	多组学数据（基因表达、染色质可及性、蛋白表达）	NA
58	2025-09-07	The choroid plexus synergizes with immune cells during neuroinflammation 2024-Sep-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.07.002 PMID:39089253	研究论文	本研究通过活体双光子成像和单细胞转录组学揭示了脉络丛在神经炎症中与免疫细胞协同作用的机制	首次发现脉络丛上皮细胞短暂特化以滋养免疫细胞，并协调其招募、存活和分化，同时揭示了巨噬细胞从脑脊液向脉络丛反向招募的新现象	研究基于小鼠LPS诱导的脑膜炎模型，可能无法完全反映人类神经炎症疾病的复杂性	阐明脉络丛在脑炎症调控中的分子机制和细胞动态过程	小鼠脉络丛、中性粒细胞、单核细胞和巨噬细胞	神经免疫学	神经炎症性疾病	纵向双光子成像、单细胞转录组学、脑室内LPS注射	NA	影像数据、转录组数据	小鼠模型（具体数量未明确说明）
59	2025-09-07	HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation 2024-09-05, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024024105 PMID:38683966	研究论文	本研究评估了靶向HA-1的T细胞受体T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的可行性和安全性	首次使用基因工程改造的HA-1特异性TCR-T细胞治疗移植后复发白血病，并展示了临床应用的可行性	研究样本量较小（9例患者），且非设计用于评估疗效的随机对照试验	评估HA-1靶向TCR-T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的安全性和可行性	造血干细胞移植后出现疾病复发的白血病和髓系肿瘤患者	细胞免疫治疗	白血病	T细胞受体基因工程、单细胞RNA测序	NA	临床数据、基因表达数据	9例造血干细胞移植受者
60	2025-09-07	A randomized, placebo-controlled trial of the BTK inhibitor zanubrutinib in hospitalized patients with COVID-19 respiratory distress: immune biomarker and clinical findings 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1369619 PMID:39906744	研究论文	评估新一代BTK抑制剂zanubrutinib在COVID-19呼吸窘迫住院患者中的疗效及免疫生物标志物变化	首次在随机对照试验中验证zanubrutinib对COVID-19患者炎症信号的抑制作用，同时保留病毒血清学反应	多数患者同时接受类固醇和抗病毒治疗可能影响结果，临床恢复指标未显示显著改善	评估BTK抑制剂zanubrutinib治疗SARS-CoV-2感染相关呼吸窘迫的疗效和免疫调节作用	COVID-19住院患者（分为非机械通气组和机械通气≤24小时组）	临床医学	COVID-19	随机对照试验、单细胞转录组分析、血清学检测	NA	临床数据、血清学数据、转录组数据	队列1: 63例患者（zanubrutinib组30例，安慰剂组33例）；队列2: 4例患者