单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7517 篇文献，本页显示第 5941 - 5960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5941 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell sequencing and bulk RNA-seq to identify and develop a prognostic signature related to colorectal cancer stem cells
2024-05-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62913-3
PMID:38806611
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序与传统RNA测序相结合，识别并开发与结直肠癌干细胞相关的预后标记。 | 首次提出基于结直肠癌干细胞相关基因的预后风险模型，并鉴定关键基因RPS17作为潜在的预后标记和治疗靶点。 | 目前尚无临床可用的基于CRCSC相关基因的预后标记。 | 研究结直肠癌干细胞在肿瘤转移、复发和化疗耐药中的作用，并开发相关的预后标记。 | 本研究对象为结直肠癌相关干细胞及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因数据 | 使用TCGA和GEO数据库的数据进行分析，样本数量未具体列出 |
| 5942 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the evolution of the immune landscape during perihematomal edema progression after intracerebral hemorrhage
2024-May-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03113-8
PMID:38807233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑出血后周围血肿水肿的免疫环境演变。 | 首次在单细胞水平上全面描绘了人类周围血肿水肿组织中的多样免疫细胞群体。 | 研究仅限于9名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 目标是表征人类周围血肿水肿组织中免疫细胞群体的转录组特征。 | 9名基底节脑出血患者的周围血肿水肿组织样本。 | 数字病理学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 9名患者的周围血肿水肿组织样本 |
| 5943 | 2024-08-05 |
GLI1+ Cells Contribute to Vascular Remodeling in Pulmonary Hypertension
2024-May-24, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323736
PMID:38639105
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研究论文 | 这篇文章探讨了GLI1+细胞在肺动脉高压中对血管重塑的贡献 | 阐明了GLI1+细胞作为肺动脉高压中血管平滑肌细胞的新来源，并探索了其信号通路的潜在治疗作用 | 尚未完全阐明GLI1+细胞在动态血管重塑过程中的具体机制 | 研究GLI1+细胞在肺动脉高压中的作用及其在血管重塑中的重要性 | 主要研究GLI1+细胞在肺动脉高压小鼠模型中的表型和功能 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 使用了GLI1Cre-ERT2; tdTomatoflox小鼠进行实验分析 |
| 5944 | 2024-08-04 |
Analysis of synthetic cellular barcodes in the genome and transcriptome with BARtab and bartools
2024-May-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100763
PMID:38670101
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研究论文 | 本文介绍了一种用于细胞条形码分析的工具BARtab和bartools | 提出了一个综合的端到端细胞条形码分析工具包，包含多个功能以简化数据提取和分析 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞条形码在基因组和转录组中的应用 | 针对细胞条形码的网络状况进行分析，包含人群水平、单细胞和空间转录组实验 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | 多个示例样本，包括大样本、单细胞及空间转录组实验 |
| 5945 | 2024-08-04 |
Semaglutide ameliorates obesity-induced cardiac inflammation and oxidative stress mediated via reduction of neutrophil Cxcl2, S100a8, and S100a9 expression
2024-May, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04784-2
PMID:37318712
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研究论文 | 本研究探讨了塞马鲁肽在肥胖导致的心脏炎症和氧化压力中的作用。 | 揭示了塞马鲁肽通过降低中性粒细胞Cxcl2、S100a8和S100a9表达来减轻肥胖引起的心脏炎症和氧化压力的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理情况。 | 探究肥胖引起的心肌损伤机制及塞马鲁肽的心脏保护影响。 | 肥胖小鼠模型及其心脏组织和血清中的炎症和氧化压力水平。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血清和心脏组织样本 | 肥胖小鼠模型 |
| 5946 | 2024-08-04 |
The guardians of pulmonary harmony: alveolar macrophages orchestrating the symphony of lung inflammation and tissue homeostasis
2024-Apr-30, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0263-2023
PMID:38811033
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综述 | 该文章全面论述了肺泡巨噬细胞在肺部炎症和组织稳态中的重要作用 | 整合了单细胞测序、细胞和组织成像技术等多项最新研究，提供了肺泡巨噬细胞功能可塑性的综合视角 | 未提供具体的实验数据或样本分析结果 | 探讨肺泡巨噬细胞在维持肺部健康和应对疾病环境中的作用 | 主要研究肺泡巨噬细胞及其相应的信号通路和功能特点 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、细胞成像技术 | NA | NA | NA |
| 5947 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the Wnt/Ca2+ signaling pathway with inflammation, apoptosis in nucleus pulposus degeneration
2024-Apr-23, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-07368-3
PMID:38654287
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研究论文 | 本研究揭示了正常与退变的人类髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的差异表达 | 首次通过单细胞RNA测序分析发现人类退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异 | 研究主要集中在特定人群的细胞，样本的多样性和广泛性可能会影响结果的普适性 | 研究正常与退变髓核细胞中Wnt/Ca2+信号通路的表达差异及其机制 | 正常与退变的人类髓核细胞 | 数字病理学 | 脊椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 5948 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of Drosophila miranda testis reveals the evolution and trajectory of germline sex chromosome regulation
2024-Apr, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002605
PMID:38687805
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研究论文 | 这篇文章揭示了发育中性染色体的调控及其对性染色体结构演化的影响 | 本研究利用D. miranda的年轻性染色体，展示了以前的常染色体是如何获得特定于性染色体的调控程序 | 本研究主要集中在D. miranda的性染色体，可能不适用于其他物种 | 研究性染色体的演变及生殖系调控机制 | 使用单细胞和大规模RNA测序分析D. miranda的生殖细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5949 | 2024-08-04 |
Studying plant vascular development using single-cell approaches
2024-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102526
PMID:38479078
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研究论文 | 研究通过单细胞方法理解植物血管发育 | 总结和反思了最近使用单细胞转录组技术研究血管细胞类型的新进展 | NA | 理解血管细胞发育中的转录调控 | 植物血管细胞及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 5950 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics analysis identifies context-specific gene regulatory gates and mechanisms
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae180
PMID:38653489
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研究论文 | 该研究介绍了一种名为scGATE的新计算工具，用于推断特定细胞类型或状态的转录因子与基因之间的调控关系 | scGATE通过使用贝叶斯框架推断布尔规则，无需为每个布尔规则单独进行公式和可能性计算，从而显著减少了时间复杂度 | NA | 推断特定细胞类型或状态的基因调控网络 | 转录因子与基因的相互作用网络 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 使用小鼠组织和人血的合成及真实单细胞数据 |
| 5951 | 2024-08-04 |
Non-coding genome contribution to ALS
2024, International review of neurobiology
DOI:10.1016/bs.irn.2024.04.002
PMID:38802183
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研究论文 | 总结了非编码基因组在肌肉萎缩侧索硬化症（ALS）中的贡献 | 提出细胞特异性功能注释对于发现ALS相关遗传变异的重要性 | 缺乏针对大多数ALS患者的特定遗传驱动因素的理解 | 探索非编码基因组中的遗传风险变异对ALS的影响 | ALS患者的非编码基因组遗传变异 | 数字病理学 | 肌肉萎缩侧索硬化症 | 单细胞表观遗传学分析和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 5952 | 2024-08-04 |
Comparative Methods for Demystifying Spatial Transcriptomics
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3838-5_17
PMID:38819570
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组技术(ST)的比较方法。 | 提出了通过比较不同基因组或转录组参考对ST实验结果影响的新见解。 | 研究中只集中于Visium平台提供的分析软件，未涵盖其他可能的ST平台。 | 分析空间转录组实验中的基因表达特征并优化分析流程。 | 研究对象包括使用ST技术的细胞群体及其基因表达数据。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 图像和基因表达数据 | 使用了不同点的多组RNA读取数据 |
| 5953 | 2024-08-04 |
Dynamic changes of immunocyte subpopulations in thermogenic activation of adipose tissues
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1375138
PMID:38812501
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研究论文 | 本研究探讨了不同冷暴露期间脂肪组织内免疫细胞的动态变化 | 识别了几种新的免疫细胞亚群，这些亚群可能有助于脂肪组织在冷暴露下的产热激活 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不完全反映人类的情况 | 探讨冷暴露对热生成脂肪组织内免疫细胞的整体变化 | 不同冷暴露期间的热生成性脂肪组织中的免疫细胞 | NA | 代谢疾病 | 单细胞测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 定量实时PCR | NA | 免疫细胞数据 | 使用了两个不同类型的热生成性脂肪组织的样本 |
| 5954 | 2024-08-04 |
Dissecting Spatiotemporal Structures in Spatial Transcriptomics via Diffusion-Based Adversarial Learning
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0390
PMID:38812530
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研究论文 | 本文介绍了一种计算框架PearlST，用于准确推断空间转录组数据中的时空结构 | 提出了结合偏微分方程增强对抗图自编码器的新方法，显著提升从空间转录组数据中提取特征的能力 | 未知所涉及的具体技术限制和数据集限制 | 研究空间转录组数据中的时空结构推断 | 空间转录组数据及其相关生物学背景 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 对抗图自编码器 | Wasserstein对抗正则化图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个不同分辨率的空间转录组数据集 |
| 5955 | 2024-08-05 |
Autoimmune CD8+ T cells in type 1 diabetes: from single-cell RNA sequencing to T-cell receptor redirection
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1377322
PMID:38800484
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评论 | 本文探讨了1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其T细胞受体的机制。 | 提出了通过调节自身反应性CD8+ T细胞来治疗或显著改善1型糖尿病的潜在策略。 | 缺乏对CD8+ T细胞的精确和稳定靶向治疗的机制探讨。 | 探讨1型糖尿病中自身免疫CD8+ T细胞及其TCR的作用机制。 | 自身免疫CD8+ T细胞和T细胞受体。 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, CAR-T | NA | NA | NA |
| 5956 | 2024-08-05 |
The profile of cytokines against bacterial infection in dental pulp
2024-Jun, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3707
PMID:38811236
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研究论文 | 文章总结了健康和炎症牙髓中不同细胞类型的细胞因子分泌谱 | 首次在单细胞水平分析牙髓中细胞对细菌感染的细胞因子反应模式 | 仅依赖于GEO数据集的单细胞转录组数据，缺乏进一步的实验证实 | 研究牙髓细胞如何通过细胞因子响应细菌感染 | 健康和炎症状态下的牙髓组织细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 健康牙髓和炎症牙髓样本的基因表达数据 |
| 5957 | 2024-08-05 |
M2 macrophage-derived TGF-β induces age-associated loss of adipogenesis through progenitor cell senescence
2024-Jun, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101943
PMID:38657734
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研究论文 | 这项研究揭示了M2巨噬细胞来源的TGF-β通过前体细胞衰老引起的与年龄相关的脂肪生成损失 | 本研究首次展示了p16high衰老前体细胞在年龄相关的脂肪生成损失中的生物学作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类的生理和病理状态 | 探索与年龄相关的脂肪生成衰退的分子机制 | 衰老的脂肪前体细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 癌症消耗症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 老年p16-CreERT2/Rosa26-LSL-tdTomato小鼠中的p16high脂肪细胞 |
| 5958 | 2024-08-04 |
Immune rebalancing at the maternal-fetal interface of maternal SARS-CoV-2 infection during early pregnancy
2024-May-28, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae006
PMID:38441496
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研究论文 | 该研究分析了早期妊娠中母体SARS-CoV-2感染对母胎界面的影響。 | 发现了早期妊娠中母体感染SARS-CoV-2引起的免疫应答和代谢变化，以及随后建立的新动态平衡。 | 目前对早期妊娠SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响仍然了解不足。 | 探讨母体SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响及其机制。 | 分析了感染SARS-CoV-2的胎盘样本。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和代谢组学 | NA | 胎盘样本 | NA |
| 5959 | 2024-08-05 |
CCR5-overexpressing mesenchymal stem cells protect against experimental autoimmune uveitis: insights from single-cell transcriptome analysis
2024-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03134-3
PMID:38802924
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研究论文 | 研究CCR5过表达的间充质干细胞在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的保护作用 | 本研究首次显示CCR5在间充质干细胞中过表达可以增强其归巢能力并改善其免疫调节效果，从而预防实验性自身免疫性葡萄膜炎 | 本研究主要基于小鼠模型，临床应用效果和机制仍需进一步验证 | 探讨自身免疫性葡萄膜炎的病理机制及基于间充质干细胞的治疗策略 | 小鼠模型以经典的实验性自身免疫性葡萄膜炎为研究对象 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | RNA序列 | 小鼠模型 |
| 5960 | 2024-08-05 |
Deciphering bat influenza H18N11 infection dynamics in male Jamaican fruit bats on a single-cell level
2024-May-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48934-6
PMID:38802391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自热带果蝠感染的流感病毒H18N11的免疫反应动态 | 首次在单细胞水平上解析了果蝠对流感病毒H18N11的免疫反应 | 研究仅限于雄性牙买加果蝠，可能无法代表其他性别或种群的反应 | 深入了解果蝠对病毒感染的免疫反应 | 雄性牙买加果蝠及其感染的流感病毒H18N11 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 雄性牙买加果蝠若干个体的单细胞样本 |