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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5941 | 2024-08-05 |
Advances in the role of circulating tumor cell heterogeneity in metastatic small cell lung cancer
2024-Apr, Cancer innovation
DOI:10.1002/cai2.98
PMID:38946931
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研究论文 | 本文深入探讨了小细胞肺癌中循环肿瘤细胞的异质性及其在诊断和预后中的价值 | 讨论了旋转肿瘤细胞的表型分析如何预测转移性肿瘤的新潜在靶标的诊断意义 | 当前小细胞肺癌的治疗方式变化有限,免疫检查点抑制剂对大多数患者的疗效低 | 研究循环肿瘤细胞在小细胞肺癌转移中的作用及其对患者预后的影响 | 循环肿瘤细胞在小细胞肺癌患者中的异质性 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5942 | 2024-08-04 |
Mosaic loss of Y chromosome is associated with aging and epithelial injury in chronic kidney disease
2024-01-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03173-2
PMID:38287344
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研究论文 | 本文探讨了Y染色体马赛克缺失与老龄化和慢性肾脏病之间的关系 | 使用单细胞RNA和ATAC测序技术揭示了肾脏中LOY的存在及其与年龄和慢性肾脏病增长的关联 | 没有详细讨论LOY在其他组织或疾病中的潜在应用 | 研究LOY作为DNA损伤和细胞衰老的指标 | 研究慢性肾脏病患者的肾脏细胞中LOY的情况 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA和ATAC测序 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5943 | 2024-08-05 |
DeepVelo: deep learning extends RNA velocity to multi-lineage systems with cell-specific kinetics
2024-01-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03148-9
PMID:38243313
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研究论文 | DeepVelo利用图卷积网络克服了现有RNA速度估计方法的局限性,适用于具有时间依赖动力学和多谱系的细胞群体 | 该研究通过一般化RNA速度,将其扩展到具有细胞特异性动力学的多谱系系统,推导出时间变化的转录、剪接和降解速率 | 现有方法依赖于预定义的动力学和细胞无关的常量转录动力学速率 | 研究复杂和异质性单细胞RNA测序数据中的细胞分化和谱系决策事件 | 多谱系细胞群体和相关的转录、剪接、降解过程 | 数字病理学 | NA | 图卷积网络 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5944 | 2024-08-05 |
Combination of bulk RNA sequencing and scRNA sequencing uncover the molecular characteristics of MAPK signaling in kidney renal clear cell carcinoma
2024-01-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205436
PMID:38217548
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研究论文 | 本研究结合了整体RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了肾透明细胞癌中MAPK信号通路的分子特征 | 首次整合整体RNA测序和单细胞RNA测序来阐明肾透明细胞癌中MAPK信号通路的分子特征 | 研究主要集中在特定的KIRC样本,可能对其他类型癌症的适用性有限 | 全面探讨MAPK信号通路在肾透明细胞癌中的作用 | KIRC患者及其组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | LASSO和COX回归分析 | 基因组和转录组数据 | 使用了TCGA的多组学数据和KIRC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5945 | 2024-08-05 |
An endoplasmic reticulum stress-related signature featuring ASNS for predicting prognosis and immune landscape in prostate cancer
2024-01-10, Aging
DOI:10.18632/aging.205280
PMID:38206293
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研究论文 | 本研究开发了一种基于内质网应激的风险特征,以预测前列腺癌患者的预后和免疫环境 | 基于内质网应激的风险评分(ERscore)可以独立预测前列腺癌患者的预后,并揭示了与ERscore相关的生物机制 | 本研究可能受到样本量和外部验证数据集的限制 | 研究开发一种新的临床治疗策略,以提高前列腺癌患者的预后 | 前列腺癌患者以及相关的基因和生物标志物 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 随机生存森林分析和多变量Cox分析 | 基因表达数据 | 包括MSKCC队列和GSE70769数据库中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5946 | 2024-08-05 |
New perspectives on the potential of tetrandrine in the treatment of non-small cell lung cancer: bioinformatics, Mendelian randomization study and experimental investigation
2024-01-04, Aging
DOI:10.18632/aging.205384
PMID:38180753
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研究论文 | 本研究探讨了红豆杉碱在非小细胞肺癌治疗中的潜在作用和因果关系 | 研究通过转录组和单细胞测序数据结合SMR及实验验证,提供了红豆杉碱治疗非小细胞肺癌的新视角 | 该研究可能受到数据集和实验样本的限制,尚需进一步验证 | 研究红豆杉碱与非小细胞肺癌的关系,以期改进治疗策略 | 红豆杉碱及其在非小细胞肺癌中的作用 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 转录组测序、单细胞测序、SMR | NA | 基因组数据 | 213个药物目标和529个疾病基因 | NA | NA | NA | NA |
| 5947 | 2024-08-05 |
Tumor-associated macrophages and PD-L1 in prostate cancer: a possible key to unlocking immunotherapy efficacy
2024-01-04, Aging
DOI:10.18632/aging.205378
PMID:38189834
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)与前列腺癌中的PD-L1之间的关系 | 研究首次揭示了在前列腺癌微环境中CD163+ TAMs与PD-L1表达的密切关联 | 研究可能受到样本量和单一地区案例的限制 | 研究旨在评估TAMs与PD-L1在前列腺癌免疫治疗中的作用 | 研究对象为95个前列腺癌组织样本及两个公开的前列腺癌数据集 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 生物信息学和实验技术,包括基因集合富集分析、CIBERSORTx、组织微阵列和免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 95个前列腺癌组织样本和两个公开数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5948 | 2024-08-05 |
Causal relationship between immune cells and hepatocellular carcinoma: a Mendelian randomisation study
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96744
PMID:38947379
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研究论文 | 本研究探讨了731种免疫细胞表型与肝细胞癌(HCC)之间的因果关系 | 通过孟德尔随机ization和单细胞测序技术揭示了免疫细胞表型与HCC的潜在因果关联 | 研究依赖于公开的遗传数据集,可能存在选择偏差和混杂因素 | 揭示免疫细胞表型与肝细胞癌之间的因果关系,以发现有效的药物靶点 | 731种免疫细胞表型及其与HCC的关联 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化,单细胞测序 | NA | 遗传数据,单细胞数据 | 利用公开遗传数据集进行的两样本孟德尔随机化分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5949 | 2024-08-05 |
Elevated RACGAP1 Expression Enhances Malignant Potential in Lung Adenocarcinoma and Serves as a Prognostic Factor
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96334
PMID:38947404
|
研究论文 | 本研究分析了RACGAP1在肺腺癌中的作用及其作为预后因子的潜力 | 通过综合分析和单细胞测序数据,揭示了RACGAP1在肺腺癌的肿瘤相关过程中的作用,并建立了有效的预后模型 | 研究未涉及RACGAP1在其他肿瘤类型中的作用及机制 | 探讨RACGAP1在肺腺癌中的表达及其对预后的影响 | 肺腺癌患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库的肺腺癌患者数据和实验验证样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5950 | 2024-08-05 |
Metabolic Heterogeneity of Tumor Cells and its Impact on Colon Cancer Metastasis: Insights from Single-Cell and Bulk Transcriptome Analyses
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94630
PMID:38947396
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研究论文 | 本研究通过单细胞和大规模转录组分析探索结直肠癌中的代谢异质性,其对转移的影响 | 首次整合单细胞与大规模转录组分析揭示了结直肠癌内的代谢景观及其影响疾病进展的机制 | 尚未详尽探讨某些代谢基因在转移中的作用 | 研究代谢重编程如何影响结直肠癌细胞的异质性及其转移 | 结直肠癌细胞的代谢异质性及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,微阵列分析 | 随机森林模型 | 转录组数据 | 使用GEO和TCGA中的微阵列与单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5951 | 2024-08-05 |
ECT2 promotes the occurrence and is a prognostic biomarker of head and neck squamous cell carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95515
PMID:38947403
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研究论文 | 本研究探讨了ECT2在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用,发现其可能是一个预后生物标志物 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据首次明确了ECT2在HNSCC中的特定角色 | 本研究可能在样本多样性和临床外部验证方面存在局限性 | 研究ECT2在头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 头颈部鳞状细胞癌样本及相关细胞系HSC-3 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据和细胞功能实验数据 | 头颈部鳞状细胞癌样本和细胞系HSC-3 | NA | NA | NA | NA |
| 5952 | 2024-08-05 |
PathFinder: a novel graph transformer model to infer multi-cell intra- and inter-cellular signaling pathways and communications
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1369242
PMID:38846640
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研究论文 | 本研究介绍了一种新颖的图变换模型PathFinder,用于推断多细胞间及细胞内的信号传导路径与通讯 | PathFinder基于分而治之策略设计,将复杂的信号网络分为信号路径,并采用新颖的图变换架构进行评分和排名 | 暂无提及具体局限性 | 旨在理解阿尔茨海默病微环境内复杂的信号机制 | 使用的研究对象包括APOE4基因型特异性的AD和人类肝硬化队列 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 图变换模型 | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5953 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Jun-20, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.06.008
PMID:38908487
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研究论文 | 本研究构建了小鼠胰腺导管树的单细胞图谱,识别了具有潜在胰腺再生和外分泌病理学影响的新细胞群体 | 首次识别出15种新型胰腺导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 尚未在体内进一步验证这些新细胞群体的特定功能 | 旨在全面表征小鼠胰腺导管的单细胞异质性及其在再生和病理中的作用 | 研究对象包括小鼠胰腺的导管细胞和胰腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 包括健康胰腺、慢性胰腺炎和肿瘤样本的多个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 5954 | 2024-08-05 |
Patho-transcriptomic analysis of invasive mucinous adenocarcinoma of the lung (IMA): comparison with lung adenocarcinoma with signet ring cell features (SRCC)
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598839
PMID:38948839
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研究论文 | 该论文分析了侵袭性粘液腺癌(IMA)与具有印戒细胞特征的肺腺癌(SRCC)之间的病理转录组学比较。 | 通过Visium空间转录组学方法揭示了IMA和SRCC中存在的六种不同细胞簇,并识别了各自特征性基因的表达差异。 | 缺乏有效治疗IMA的措施,且在无法进行手术切除的情况下,研究重点可能受限于分子机制的完整性。 | 研究侵袭性粘液腺癌的分子机制及其与印戒细胞特征肺腺癌的差异。 | 侵袭性粘液腺癌(IMA)和具有印戒细胞特征的肺腺癌(SRCC)。 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了两种腺癌类型的不同细胞群体,具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 5955 | 2024-08-05 |
Tissue fibroblasts are versatile immune regulators: An evaluation of their impact on the aging process
2024-06, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102296
PMID:38588867
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research paper | 本文章探讨了成纤维细胞作为免疫调节剂在老化过程中的作用 | 揭示了成纤维细胞在组织免疫和炎症中的多种功能及其在老化过程中的重要性 | 未明确提及具体的实验数据和样本量 | 探究成纤维细胞与免疫细胞在衰老过程中的相互作用 | 老化组织中分离的成纤维细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 基因表达数据 | 来自老化组织的成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5956 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling Reveals the Impact of Genetic Alterations on the Differentiation of Inflammation-Induced Murine Colon Tumors
2024-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16112040
PMID:38893159
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研究论文 | 该研究揭示了基因突变如何影响炎症诱导的鼠类结肠肿瘤细胞分化 | 本研究首次明确了在炎症诱导的结肠肿瘤中,BLM和MSH2KO突变对肿瘤细胞分化的不同影响 | 研究主要基于鼠类模型,可能无法完全代表人类结肠癌的复杂性 | 探讨基因突变对炎症诱导的结肠肿瘤细胞分化的影响 | 以炎症诱导的鼠类结肠肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种突变的鼠类肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5957 | 2024-08-04 |
Critical view on oligo(dT)-based RNA-seq: bias arising, modeling, and mitigating
2024-03-06, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad190
PMID:37857456
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研究论文 | 本文探讨了基于oligo(dT)的RNA测序中存在的偏差及其缓解方法。 | 本研究识别了两个新的未被考虑的偏差,并发展出一种普适的缓解方法以减少这些偏差的影响。 | 研究可能未涵盖所有类型的RNA测序偏差,且其通用性需进一步验证。 | 研究的目的是理解和解决基于oligo(dT)的RNA测序数据中的偏差。 | 研究主要集中在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集及其分析上。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5958 | 2024-08-04 |
Characterizing hub biomarkers for post-transplant renal fibrosis and unveiling their immunological functions through RNA sequencing and advanced machine learning techniques
2024-02-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04971-9
PMID:38378674
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研究论文 | 本文探讨了肾移植后肾纤维化的中心生物标志物及其免疫功能 | 识别了与肾纤维化相关的四个核心基因及其潜在的有效小分子,提出了新的研究思路 | 缺乏临床数据验证所识别生物标志物的实用性 | 研究肾移植后肾纤维化的生物标志物及其机制 | 聚焦于肾纤维化患者的基因组数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞测序、加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | NA | 转录组数据 | 从NCBI基因表达综合体 (GEO) 获取的多名患者的数据和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5959 | 2024-08-04 |
Senescent fibroblast facilitates re-epithelization and collagen deposition in radiation-induced skin injury through IL-33-mediated macrophage polarization
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04972-8
PMID:38369466
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研究论文 | 这篇文章探讨了衰老成纤维细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用 | 本研究揭示了p16表达的衰老成纤维细胞通过分泌IL-33促进辐射诱导的皮肤愈合的机制 | 本研究的限制在于未完全阐明所有潜在的细胞机制和其他因素 | 研究衰老细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用及其机制 | 辐射诱导的皮肤损伤中的衰老成纤维细胞及其对愈合过程的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | 单细胞数据, 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5960 | 2024-08-05 |
Diffuse large B-cell lymphoma: the significance of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes exhaustion mediated by TIM3/Galectin-9 pathway
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05002-3
PMID:38369502
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研究论文 | 本研究探讨了TIM3/Galectin-9通路在弥漫大B细胞淋巴瘤中对CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫的意义 | 首次揭示了TIM3/Galectin-9通路在CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫及免疫逃逸中的关键作用 | 对TIM3介导的CD8+TILs疲惫机制的理解仍然较为有限 | 明确TIM3介导的CD8+TILs疲惫的潜在通路及其在弥漫大B细胞淋巴瘤中的重要性 | 研究对象为弥漫大B细胞淋巴瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | RNA,免疫组化 | NA | NA | NA | NA | NA |