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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5921 | 2024-08-05 |
FABP6 serves as a new therapeutic target in esophageal tumor
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205448
PMID:38277205
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研究论文 | 本研究探讨FABP6在食道肿瘤中的作用,作为新的治疗靶点 | 揭示FABP6在食道肿瘤中的高表达及其潜在的代谢和肿瘤生长相关性 | 未详细探讨FABP6作为治疗靶点的具体机制和临床应用 | 改善食道癌患者的生存率,寻找新的诊断和治疗靶点 | 食道肿瘤微环境中细胞组成及其异质性 | 数字病理学 | 食道癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 使用了初级食道肿瘤的多个细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 5922 | 2024-08-05 |
Identification of molecular characteristics of FUT8 and alteration of core fucosylation in kidney renal clear cell cancer
2024-01-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205482
PMID:38277230
|
研究论文 | 本文研究了KIRC中FUT8的分子特征和核心富糖基化的变化 | 首次识别出KIRC中的两种与核心富糖基化相关的亚型,并探讨了其预后差异 | 研究中没有提及样本量和潜在的临床应用 | 探讨核心富糖基化在肾透明细胞癌中的作用及FUT8的分子特征 | 集中于肾透明细胞癌(KIRC)及其核心富糖基化相关基因 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5923 | 2024-08-04 |
The integration of multi-omics analysis and machine learning for the identification of prognostic assessment and immunotherapy efficacy through aging-associated genes in lung cancer
2024-01-22, Aging
DOI:10.18632/aging.205464
PMID:38261733
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研究论文 | 本研究整合了多组学分析和机器学习,评估与衰老相关基因在肺癌中的预后评估和免疫疗法有效性 | 首次结合多组学分析和机器学习来构建预后模型,特别关注与衰老相关的基因 | 尚未明确关键分子在肺癌发病和进展中的确切作用 | 评估肺癌患者的预后和免疫疗法有效性 | 涉及与免疫相关的关键基因及其在肺癌中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, WGCNA, Lasso-Cox方法, ssGSEA | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5924 | 2024-08-05 |
Malignant cell receptor-ligand subtypes guide the prediction of prognosis and personalized immunotherapy of liver cancer
2024-01-18, Aging
DOI:10.18632/aging.205453
PMID:38244584
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA分析识别肝癌患者的恶性细胞受体-配体亚型 | 通过恶性细胞受体-配体基因识别亚群,提供个性化免疫治疗的新见解 | 未详细说明样本来源和具体的临床应用数据 | 识别基于恶性细胞受体-配体基因的肝癌亚群以发展个性化免疫治疗 | 肝癌患者的恶性细胞及其相关的受体-配体基因 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 16个基因表达水平 | NA | NA | NA | NA |
| 5925 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of the substantia nigra reveals microglial activation in a model of MPTP
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1390310
PMID:38952478
|
研究论文 | 这项工作揭示了MPTP小鼠黑质中小胶质细胞的功能变化、信号通路和关键基因 | 首次在MPTP模型中详细分析了小胶质细胞的激活状态及其功能变化 | 研究可能仅限于特定的细胞类型和小鼠模型,结果可能无法完全外推至其他类型的帕金森病 | 探索MPTP对帕金森病相关细胞和基因的影响 | 使用单细胞RNA测序分析MPTP小鼠的黑质 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MPTP小鼠的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5926 | 2024-08-05 |
Dysfunctional Epithelial Barrier Is Characterized by Reduced E-Cadherin in Idiopathic Subglottic Stenosis
2024-01, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30951
PMID:37565709
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研究论文 | 本研究旨在表征特发性喉下狭窄瘢痕上皮的分子特征和功能表型 | 首次使用单细胞RNA测序分析特发性喉下狭窄瘢痕上皮的变化,发现E-钙黏蛋白表达减少与屏障功能失常相关 | 样本量较小,仅包括6个瘢痕样本,可能限制结果的普遍性 | 研究特发性喉下狭窄的上皮分子特征和功能,以及其与上皮屏障功能的关系 | 特发性喉下狭窄(iSGS)患者的气管活检样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫印迹,免疫荧光 | NA | 活检组织样本 | 6个iSGS瘢痕样本和6个匹配的非瘢痕区域 | NA | NA | NA | NA |
| 5927 | 2024-08-04 |
Integrating bulk and single-cell sequencing reveals metastasis-associated CAFs in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Aug-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122768
PMID:38851417
|
研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAFs)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)转移中的作用 | 首次识别出与HNSCC转移相关的CAFs中的基因,具体验证了TIMPI1在转移CAF中的上调及其对HNSCC细胞转移的影响 | 未详细探讨CAFs在HNSCC转移中的其他潜在机制 | 识别与HNSCC转移相关的CAFs中的基因,并评估其对转移的影响 | 主要研究头颈部鳞状细胞癌的CAFs及其转移相关基因 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞和大规模RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA序列数据 | 来自转移性和非转移性CAFs的细胞和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5928 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptional atlas of human adenomyosis deciphered by the integration of single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics
2024-Jul-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae012
PMID:38486356
|
研究论文 | 本研究揭示了人类腺肌症的转录组特征,整合了单细胞RNA测序和空间转录组学 | 首次识别腺肌症病灶中的独特上皮和侵袭性基质亚群体,支持病因学中的‘内陷’与‘化生’理论的复杂相互作用 | 对腺肌症的研究仍处于起步阶段,相关理论存在争议 | 揭示腺肌症的转录组变化,为准确诊断与治疗策略的发展提供基础 | 研究了正常内膜、病灶及内膜-肌层交界处的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5929 | 2024-08-05 |
Mesenchymal stem cells-extracellular vesicles alleviate pulmonary fibrosis by regulating immunomodulators
2024-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i6.670
PMID:38948098
|
研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞外泌体(MSC-EVs)在减轻肺纤维化中的治疗潜力 | 本研究首次系统评估了MSC-EVs对肺纤维化、氧化应激和免疫炎症的影响 | 研究中未明确描述MSC-EVs的具体分子机制和长期效果 | 研究MSC-EVs在治疗肺纤维化及其相关病理过程中的潜力 | 研究对象包括A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和小鼠肺组织样本 | 使用A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5930 | 2024-08-05 |
Decoding heterogeneous and coordinated tissue architecture in glioblastoma using spatial transcriptomics
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110064
PMID:38947514
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探讨胶质母细胞瘤中的基因表达异质性 | 首次揭示了胶质母细胞瘤中组织干细胞特征在坏死和肿瘤周边区域的富集 | 缺乏对空间复杂性的深入探讨 | 探讨胶质母细胞瘤的基因表达异质性及其空间分布 | 临床胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 临床胶质母细胞瘤标本(具体数量未提供) | NA | NA | NA | NA |
| 5931 | 2024-08-05 |
Generation and characterization of inducible KRAB-dCas9 iPSCs from primates for cross-species CRISPRi
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110090
PMID:38947524
|
研究论文 | 本论文生成并验证了来自灵长类动物的可诱导KRAB-dCas9 iPS细胞系。 | 提供了灵长类动物iPS细胞系的独特资源,以便于跨物种的CRISPR干扰研究。 | 尽管在不同细胞系中KRAB-dCas9的表达水平不同,但对目标基因的下调效果相似,可能限制了结果的普遍性。 | 研究灵长类动物的分子表型比较,为理解人类生物学和进化提供信息。 | 三个人类、三种大猩猩和两种猕猴iPS细胞系。 | 数字病理学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | NA | 单细胞RNA测序 | 八个iPS细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 5932 | 2024-08-05 |
Isolation of Human Bone Marrow Non-hematopoietic Cells for Single-cell RNA Sequencing
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5020
PMID:38948257
|
研究论文 | 本文介绍了一种精确分离人类骨髓非造血细胞以进行单细胞RNA测序的方法 | 提出了一种新的分离协议,特别强调了从人类骨髓中获得高质量骨髓间充质细胞的准确性 | 对非造血细胞表型的理解仍然有限,研究领域内的相关研究较少 | 旨在改善对人类骨髓造血微环境的理解,尤其是非造血细胞的特性 | 人类骨髓中的非造血细胞,特别是骨髓间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5933 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the survival mechanisms of fratricidal CAR-T targeting of T cell malignancies
2024-Jun-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102225
PMID:38948332
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了针对T细胞恶性肿瘤的兄弟相杀CAR-T细胞的生存机制 | 首次介绍了兄弟相杀CAR-T细胞的生存机制及其相关分子 | 尚未完全揭示所有介导CAR-T细胞生存的机制 | 研究兄弟相杀CAR-T产品的生存机制和调控因子 | 针对T细胞的CD26 CAR-T和CD44v6 CAR-T,以及控制的CD19 CAR-T | 数字病理学 | T细胞肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 来自同一供体的多个CAR-T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5934 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics dissecting the development and evolution of nervous system in insects
2024-06, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2024.101201
PMID:38608931
|
综述 | 本文探讨了单细胞转录组学在昆虫神经系统分解中的成就 | 本文创新性在于将单细胞转录组学应用于揭示昆虫神经系统的发展和进化 | 研究限制在于主要聚焦于代表性昆虫,可能无法涵盖所有昆虫的神经系统 | 研究昆虫神经系统在发展和进化过程中的分子和细胞架构 | 代表性的昆虫神经系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5935 | 2024-08-05 |
Enoyl coenzyme a hydratase 1 attenuates aortic valve calcification by suppressing Runx2 via Wnt5a/Ca2+ pathway
2024-Jun, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12038
PMID:38946717
|
研究论文 | 本研究探讨了Enoyl辅酶A水合酶1在钙化主动脉瓣疾病中的作用及其机制 | 发现ECH1通过抑制Wnt信号通路调节Runx2,揭示了ECH1-Wnt5a/Ca在CAVD中的新机制 | 研究主要通过体外和体内实验进行,缺乏临床试验数据 | 探讨ECH1在钙化主动脉瓣疾病中的治疗潜力和机制 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞及ApoE小鼠模型 | 数字病理 | 钙化主动脉瓣 | 单细胞测序 | ApoE小鼠模型 | 生物样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5936 | 2024-08-05 |
Single-cell 3D genome structure reveals distinct human pluripotent states
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03268-w
PMID:38741214
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研究论文 | 研究揭示了人类多能性胚胎干细胞的三维基因组结构与其多能状态之间的关系 | 首次通过单细胞高分辨率3D基因组结构分析展示了不同多能状态的特征性基因组重塑 | 未深入探讨多能性状态的调控机制和其他潜在的外部影响因素 | 探讨多能性胚胎干细胞的转录特征及其与基因组结构的关系 | 人类多能性胚胎干细胞(hESCs)在不同多能性状态下的特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,三维基因组结构分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5937 | 2024-08-04 |
Single Cell Atlas: a single-cell multi-omics human cell encyclopedia
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03246-2
PMID:38641842
|
研究论文 | 构建了一个包含人类组织的单细胞多组学地图 | 首次整合五种单细胞组学、空间转录组学和两种体积组学的数据,形成全面的单细胞多组学图谱 | 未提及特定的局限性 | 旨在深入探索健康成人和胎儿组织中的异质细胞群体 | 涉及125个健康成人和胎儿组织的细胞样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 组学数据 | 125个健康成人和胎儿组织 | NA | NA | NA | NA |
| 5938 | 2024-08-04 |
Powerful and accurate detection of temporal gene expression patterns from multi-sample multi-stage single-cell transcriptomics data with TDEseq
2024-04-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03237-3
PMID:38622747
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为TDEseq的非参数统计方法,旨在从单细胞转录组数据中检测时间基因表达模式 | TDEseq利用平滑样条基函数和分层结构线性加性混合模型,增强了对时间点相关性的处理能力 | NA | 提高在单细胞转录组研究中识别时间基因表达模式的准确性和能力 | 特定细胞类型中的时间表达模式 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 分层结构线性加性混合模型 | 转录组数据 | 分析了四个已发布的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5939 | 2024-08-05 |
Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods
2024-04-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03224-8
PMID:38622708
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研究论文 | 本研究开发了Demuxafy框架,通过整合多种单细胞去重和双细胞检测方法,提升了单细胞RNA测序中的供体分配和双细胞去除的准确性 | Demuxafy框架通过多个去重和双细胞检测方法的共识交集,显著提高了液滴分配的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序中液滴分配和双细胞去除的准确性 | 液滴,单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 液滴 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5940 | 2024-08-05 |
Merit of integrating in situ transcriptomics and anatomical information for cell annotation and lineage construction in single-cell analyses of Populus
2024-04-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03227-5
PMID:38570851
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研究论文 | 本文强调结合原位转录组学和解剖信息以构建波普勒斯(Populus)单细胞分析中的细胞注释和谱系构建模型的必要性 | 提出了采用原位转录组和解剖信息来改进细胞类型注释和谱系构建的方法 | NA | 研究波普勒斯的单细胞RNA测序中的细胞类型注释和谱系构建 | 四个关于分化木质部分的单细胞RNA测序研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |