单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 5861 - 5880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5861 | 2024-08-05 |
What Single Cell RNA Sequencing Has Taught Us about Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Jul, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2024.0001
PMID:38369875
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评论 | 本文概述了单细胞RNA测序技术及其在慢性阻塞性肺病中的应用和所得教训 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示慢性阻塞性肺病的细胞和分子网络 | 缺乏对慢性阻塞性肺病的病理生物学的深入理解和指导治疗的生物标志物稀缺 | 探讨慢性阻塞性肺病的分子机制和细胞网络以支持治疗发现 | 研究慢性阻塞性肺病（COPD）中的细胞和分子网络 | 数字病理学 | COPD | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5862 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of immune cells from the coronary sinus reveals immune mechanisms of the progression of persistent atrial fibrillation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110127
PMID:38966571
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研究论文 | 该文章探讨了来自冠状窦的免疫细胞在持续性心房颤动进程中的作用 | 首次通过单细胞测序揭示了持续性心房颤动患者冠状窦中免疫细胞的异质性及其与心房颤动复发的相关性 | 研究未明确提及样本量及潜在的临床应用限制 | 探索免疫细胞在持续性心房颤动进展中的作用及机制 | 持续性心房颤动患者的冠状窦免疫细胞 | 数字病理学 | 心房颤动 | 单细胞测序 | NA | 免疫细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5863 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-sequencing in uveal melanoma: advances in heterogeneity, tumor microenvironment and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1427348
PMID:38966635
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序在葡萄膜黑色素瘤中的应用，重点关注异质性、肿瘤微环境和免疫治疗进展 | 结合生物信息学分析的单细胞RNA测序为理解肿瘤内异质性和微环境提供了新的视角，有助于发现与预后相关的分子指标 | 由于葡萄膜黑色素瘤的特殊生物学特性，免疫治疗的效果有限 | 提高葡萄膜黑色素瘤患者免疫治疗的疗效 | 葡萄膜黑色素瘤患者的肿瘤特征和微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5864 | 2024-08-04 |
Leveraging a neutrophil-derived PCD signature to predict and stratify patients with acute myocardial infarction: from AI prediction to biological interpretation
2024-Jul-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05415-0
PMID:38956669
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研究论文 | 本文提出了一种中性粒细胞衍生的程序性细胞死亡（PCD）特征，旨在预测和分层急性心肌梗死（AMI）患者 | 创新地利用机器学习生成了一种预测性的中性粒细胞衍生PCD特征，并探讨了其生物机制 | 虽然探讨了中性粒细胞相关PCD的临床意义，但生物机制尚未完全阐明 | 旨在通过预测和分层急性心肌梗死患者来改善治疗管理 | 研究对象为急性心肌梗死患者的外周血样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 机器学习，单细胞转录组学，孟德尔随机化 | 随机森林 | 微阵列数据 | 五个独立的微阵列队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5865 | 2024-08-04 |
NOX4-mediated astrocyte ferroptosis in Alzheimer's disease
2024-Jul-02, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01266-w
PMID:38956702
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研究论文 | 本研究探讨了NADPH氧化酶4（NOX4）在阿尔茨海默病（AD）中对铁介导的星形胶质细胞死亡的作用 | 研究首次揭示了NOX4在阿尔茨海默病星形胶质细胞铁死亡中的关键作用 | 研究可能受到样本选择和实验条件的限制 | 研究NOX4与阿尔茨海默病相关的星形胶质细胞铁死亡机制 | 本研究的对象为阿尔茨海默病中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了AD的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5866 | 2024-08-05 |
Pig blastocyst-like structure models from embryonic stem cells
2024-Jul-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00693-w
PMID:38956027
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研究论文 | 该文章报道了从猪胚胎干细胞生成类似囊胚的结构模型 | 创新点在于开发了一种新的三维两步分化策略，能够从猪胚胎干细胞生成具有胚胎特征的囊胚模型 | 该研究未提及对大型动物囊胚模型的潜在伦理问题及其在实际应用中的局限性 | 研究的目的是开发一种能够模拟早期胚胎发育的猪胚胎模型 | 研究的对象是从猪胚胎干细胞中生成的囊胚状结构 | 数字病理学 | NA | 体外培养，三维分化 | NA | 细胞，胚胎模型 | 使用了数量未具体说明的猪胚胎干细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5867 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer and scRNA-seq analyses identify a prognostic coagulation-related gene signature associated with tumor microenvironment in lower-grade glioma
2024-Jul-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01114-w
PMID:38955935
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研究论文 | 该文章通过整合泛癌症和单细胞RNA测序分析，识别出与下级别胶质瘤肿瘤微环境相关的预后凝血相关基因特征 | 本研究创新性地结合了临床特征与基因表达分析，提出了用于下级别胶质瘤预后的凝血相关基因签名 | 研究主要集中在特定癌症类型，对其他癌症类型的适用性尚需进一步验证 | 探讨凝血路径与下级别胶质瘤患者预后的关系 | 本研究聚焦于下级别胶质瘤及其他癌症类型的患者 | 数字病理 | NA | 单样本基因集富集分析（ssGSEA），LASSO回归，CIBERSORT，单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5868 | 2024-08-04 |
Building and analyzing metacells in single-cell genomics data
2024-Jul, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-024-00045-6
PMID:38811801
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评论 | 本文回顾了单细胞基因组学数据中元细胞的构建和分析方法 | 介绍了元细胞的概念及其在简化单细胞基因组学数据中的应用 | 未具体提到元细胞的局限性 | 探讨如何利用元细胞分析单细胞基因组学数据 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5869 | 2024-08-04 |
Mapping the complexity and diversity of tertiary lymphoid structures in primary and peritoneal metastatic gastric cancer
2024-Jul-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009243
PMID:38955417
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研究论文 | 本文探讨了原发性胃癌和腹膜转移性胃癌中三级淋巴结构的复杂性和多样性。 | 该研究揭示了胃癌中三级淋巴结构的细胞组成和成熟状态在不同肿瘤位置和免疫环境中的显著差异。 | 该研究未讨论长时间随访的影响，可能无法全面捕捉TLS的动态变化。 | 研究三级淋巴结构对胃癌抗肿瘤免疫及预后的影响。 | 分析胃癌原发肿瘤及腹膜转移样本中的免疫细胞组成和功能。 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学和免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了来自胃癌原发肿瘤和腹膜转移的存档切除标本 | NA | NA | NA | NA |
| 5870 | 2024-08-04 |
Heterogeneous pseudobulk simulation enables realistic benchmarking of cell-type deconvolution methods
2024-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03292-w
PMID:38956606
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研究论文 | 该文章展示了一种异质性伪混合物模拟方法，以改进细胞类型去卷积方法的基准评估 | 提出了一种异质性模拟策略，以创建更具生物学变异的合成混合样本，从而增强基准测试的可靠性 | 标准方法使用随机选取的单细胞，未考虑细胞间的内在差异，导致合成混合物缺乏适当的生物学变异 | 旨在改进和评估细胞类型去卷积方法的基准测试 | 研究对象为不同去卷积方法在多个数据集上的表现 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 回归方法 | 数据集 | 八个不同的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5871 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome dissecting the microenvironment remodeled by PD1 blockade combined with photodynamic therapy in a mouse model of oral carcinogenesis
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.636
PMID:38962427
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研究论文 | 本研究揭示了PD1阻断联合光动力疗法在小鼠口腔癌发生模型中重塑微环境的效果 | 创新之处在于通过单细胞转录组测序揭示了口腔癌进展过程中微环境的失调，并提出了一种新的治疗策略 | 本研究的局限性在于模型仅使用小鼠，未在临床中进行验证 | 探讨有效的策略以阻止口腔潜在恶性疾病向口腔鳞状细胞癌的进展 | 建立小鼠口腔癌发生模型，研究PD1阻断与光动力疗法的联合效果 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5872 | 2024-08-04 |
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
2024-06-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03309-4
PMID:38898465
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研究论文 | 本研究生成了神经母细胞瘤细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的单细胞RNA-seq图谱 | 提出了一种无监督机器学习方法(acNMF)来比较临床与前临床模型中的基因表达程序 | 未详细研究弱表达的间充质样基因表达与药物耐受机制之间的关系 | 更好地理解患者肿瘤异质性与前临床模型之间的关系 | 聚焦于神经母细胞瘤细胞系及其前临床模型的基因表达程序 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 无监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种细胞系、患者衍生异种移植模型及基因工程小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5873 | 2024-08-05 |
Soluble PD-L1 reprograms blood monocytes to prevent cerebral edema and facilitate recovery after ischemic stroke
2024-02, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.007
PMID:38070624
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研究论文 | 这篇文章探讨了可溶性PD-L1如何通过重新编程血液单核细胞来预防脑水肿并促进缺血性中风后的恢复。 | 相关研究首次展示了PD-1阳性单核细胞作为sPD-L1的治疗靶点的潜力。 | 研究在小鼠模型中进行，实际临床应用的效果和安全性仍需进一步验证。 | 研究PD-L1在急性缺血性中风恢复中的治疗潜力。 | 研究对象为急性缺血性中风患者的循环单核细胞以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 小鼠中动脉闭塞（MCAO）模型 | 生物样本 | 涉及人类患者和小鼠模型，具体样本量未列明 | NA | NA | NA | NA |
| 5874 | 2024-08-04 |
Deciphering the shared mechanisms of Gegen Qinlian Decoction in treating type 2 diabetes and ulcerative colitis via bioinformatics and machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1406149
PMID:38962743
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研究论文 | 本研究探讨了葛根芩莲汤在治疗2型糖尿病和溃疡性结肠炎中的共享机制 | 揭示了T2DM和UC之间的共病机制，并识别了新的生物标志物和治疗策略 | 缺乏临床试验数据以验证研究结果 | 探究T2DM与UC之间的共享致病机制，并阐明葛根芩莲汤的作用机制 | 研究对象包括2型糖尿病和溃疡性结肠炎的相关靶点 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 溃疡性结肠炎 | 生物信息学和机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5875 | 2024-08-04 |
SlowMoMan: a web app for discovery of important features along user-drawn trajectories in 2D embeddings
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae095
PMID:38962404
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研究论文 | 本文提出了SlowMoMan，一个Web应用程序，用于发现用户绘制的二维嵌入中的重要特征 | 该应用程序解决了非线性低维嵌入与原始高维数据之间关系的难题，并提供了一种可视化和排序功能 | 未提及具体的限制 | 研究如何在二维嵌入中识别和排序重要特征 | 研究对象包括轨迹推断、空间转录组学和细胞分类等应用场景 | 计算机视觉 | NA | 非线性低维嵌入 | NA | 高维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5876 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram model and subtype classification in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1399856
PMID:38962008
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研究论文 | 本文整合多重数据集，探讨类风湿性关节炎（RA）中T细胞的异质性及其相关的诊断模型 | 建立了一种与T细胞相关的诊断模型，提供了RA免疫治疗的新方法 | 研究未提及样本的年龄或性别对不同T细胞模式的影响 | 探讨类风湿性关节炎中的T细胞机制及其分类 | 研究对象为582个与类风湿性关节炎相关的T细胞亚型 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq、bulk RNA-seq、孟德尔随机化（MR）和eQTL | XGB机器学习 | 细胞数据 | 分析了10,211个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5877 | 2024-08-05 |
Activation of non-classical Wnt signaling pathway effectively enhances HLA-A presentation in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1336106
PMID:38962268
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研究论文 | 本研究识别了急性淋巴细胞白血病（AML）中造血干细胞前体（HSC-Prog）的克隆异质性，并探讨了与AML免疫逃逸相关的分子通路 | 首次揭示非经典Wnt信号通路在AML中与HLA-A呈现的关系 | 未明确涉及样本的多样性或实验结果的临床应用 | 识别AML中造血干细胞前体的克隆异质性并探讨与免疫逃逸相关的分子机制 | 急性髓性白血病（AML）患者的造血干细胞前体 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA（mRNA） | 样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5878 | 2024-08-05 |
Elucidating the role of angiogenesis-related genes in colorectal cancer: a multi-omics analysis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1413273
PMID:38962272
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析阐明了血管生成相关基因在结直肠癌中的重要性 | 研究中识别了结直肠癌中的两种血管生成相关亚型及其四个关键基因，为个性化治疗提供了新见解 | 在基因突变与亚型的关联方面未发现显著性 | 探索血管生成相关基因在结直肠癌中的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其血管生成相关基因的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RT-PCR, scRNA-seq | LASSO, Xgboost, 决策树 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5879 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing: Technological Progress and Biomedical Application in Cancer Research
2024-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00777-0
PMID:37322261
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用 | 强调了scRNA-seq在肿瘤异质性分析和个性化医学中的潜在应用 | 未提及具体的技术局限性 | 探讨单细胞RNA测序在癌症研究中的应用和技术进展 | 单细胞RNA测序技术及其对癌症和疾病的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5880 | 2024-08-04 |
Comprehensive investigation of malignant epithelial cell-related genes in clear cell renal cell carcinoma: development of a prognostic signature and exploration of tumor microenvironment interactions
2024-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05426-x
PMID:38951896
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研究论文 | 本文全面研究了透明细胞肾细胞癌中的恶性上皮细胞相关基因及其临床相关性 | 建立了一个预后模型MECRGS，并在多个队列中显示出优越的预测性能 | 未提及具体的样本来源和大小 | 探讨恶性上皮细胞相关基因在透明细胞肾细胞癌中的功能和临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌中的219个恶性上皮细胞相关基因 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |