单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7515 篇文献，本页显示第 5821 - 5840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5821 | 2024-08-05 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jun-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了成蚊Aedes aegypti中肠细胞图谱 | 首次建立了Aedes aegypti中肠单细胞RNA测序的分离和测序协议 | 缺乏对已知转录组的重复性验证和其他中肠细胞的功能研究 | 研究Aedes aegypti中肠细胞类型及其在arbovirus感染中的作用 | Aedes aegypti成虫的中肠细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | NA |
| 5822 | 2024-08-04 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢修改如何限制SARS-CoV-2在类人气道器官中的传播 | 通过建立人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，首次揭示了脂质通路修改对SARS-CoV-2传播的限制作用 | 本研究主要基于体外模型，尚需进一步验证在真实生物体中的效果 | 揭示脂质代谢在COVID-19病毒感染中的作用机制 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，主要关注SARS-CoV-2的感染和传播 | 数字病理学 | 新冠病毒感染 | 单细胞测序（ScRNAseq） | 气道类器官（iPSC-AOs） | 细胞与分子生物数据 | NA |
| 5823 | 2024-08-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
|
评论 | 本文回顾了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用和转录组权衡。 | 提出了单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种创新且尚未充分利用的技术，提供了独特的细胞层面转录组分析视角。 | 需要考虑传统方法与scRNA-seq之间的权衡。 | 探讨单细胞RNA测序在生殖毒理学中的应用及其对毒性物质暴露的响应。 | 主要研究斑马鱼的个体细胞基因表达谱。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5824 | 2024-08-05 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
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review | 该综述重点介绍了膀胱癌患者的新靶点、进展和治疗方法 | 结合抗体药物偶联物（ADC）与免疫疗法的成功被视为膀胱癌治疗的重大突破，并探讨了其他ADC作为治疗选项的兴趣 | 该文献没有明确提及局限性 | 旨在阐明膀胱癌的治疗靶点，以改善患者特异性的护理和治疗结果 | 膀胱癌患者及其治疗相关的新靶点和方法 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 5825 | 2024-08-05 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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review | 这篇综述总结了单细胞和空间组学在理解膀胱癌生物学中的最新进展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间组学技术在肿瘤微环境、膀胱癌异质性、癌症干性和细胞可塑性方面的创新应用 | 在将研究结果转化为临床实践和实施个体化治疗策略方面仍存在挑战 | 探讨单细胞和空间组学在膀胱癌中的应用及其对新治疗策略发展的影响 | 研究膀胱癌中肿瘤微环境和细胞异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间组学技术 | NA | NA | NA |
| 5826 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
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研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |
| 5827 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
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研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 |
| 5828 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
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研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 |
| 5829 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
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研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 |
| 5830 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5831 | 2024-08-05 |
Integrative bioinformatics approach yields a novel gene expression risk model for prognosis and progression prediction in prostate cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18405
PMID:38842134
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研究论文 | 本文构建了一个基于基因表达的新型前列腺癌预后和进展预测风险模型 | 开发了一个整合多种数据集的风险模型，并鉴定出八个独立预后因子 | 模型的验证仅通过一个独立数据集进行，可能限制了其广泛适用性 | 旨在建立一个有效的前列腺癌进展预测模型 | 前列腺癌患者，重点分析基因表达与无进展生存期之间的关系 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两例去势相关前列腺癌和两例激素相关前列腺癌样本 |
| 5832 | 2024-08-04 |
Mapping the Cellular Biogeography of Human Bone Marrow Niches Using Single-Cell Transcriptomics and Proteomic Imaging
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585083
PMID:38559168
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和蛋白质组成像绘制了人类骨髓微环境的细胞生物地理学 | 首次全面构建了人类骨髓的空间分辨多组学图谱 | 研究主要集中于较小的样本量，可能无法代表所有人群 | 探索人类骨髓中非造血细胞的空间组织及其功能 | 29,325个富集的非造血骨髓细胞及18例个体的样品 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) 和CO-检测通过索引 (CODEX) 多重成像 | NA | 图像和转录组数据 | 29,325个非造血骨髓细胞和18个个体样本 |
| 5833 | 2024-08-05 |
CD4+ T cell heterogeneity in gestational age and preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1401738
PMID:38774869
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠期和子痫前期中CD4+ T细胞的异质性。 | 文章首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体组分析揭示了妊娠年龄对决策性CD4 T细胞亚群的多样性和克隆性的重要性。 | 未提及具体的样本数量和方法的局限性。 | 研究CD4+ T细胞在妊娠期和子痫前期中的异质性及其对母胎耐受的影响。 | 决策性CD4 T细胞亚群及其在子痫前期中的表达变化。 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5834 | 2024-08-05 |
Dissection of molecular mechanisms of liver injury induced by microcystin-leucine arginine via single-cell RNA-sequencing
2024-Nov, Journal of environmental sciences (China)
DOI:10.1016/j.jes.2023.08.032
PMID:38844317
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研究论文 | 这篇文章探讨了微囊藻毒素-亮氨酸精氨酸（MC-LR）引起的肝损伤的分子机制 | 首次建立了小鼠肝脏对MC-LR反应的单细胞图谱，提供了对MC-LR诱导肝毒性的深入见解 | 文章未提及具体的样本量和可重复性等限制 | 研究微囊藻毒素MC-LR引起的肝毒性分子机制 | 以小鼠为研究对象，分析MC-LR诱导的肝脏损伤 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠的肝脏样本 |
| 5835 | 2024-08-05 |
Type 17 immune response promotes oral epithelial cell proliferation in periodontitis
2024-Aug, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究探讨了17型免疫反应对牙周炎中口腔上皮细胞增殖的影响 | 揭示了17型免疫反应在牙周炎中对口腔上皮细胞增殖的促进作用 | 研究的样本仅限于小鼠模型和初步的人类细胞实验，可能无法完全代表临床情况 | 研究17型免疫反应对牙周炎患者口腔上皮细胞增殖的影响 | 牙周炎小鼠模型及人类正常口腔角质形成细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 小鼠模型及相关的单细胞RNA测序数据 |
| 5836 | 2024-08-05 |
3D model of mouse embryonic pancreas and endocrine compartment using stem cell-derived mesoderm and pancreatic progenitors
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109959
PMID:38832019
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研究论文 | 本研究旨在通过将小鼠胚胎干细胞分化为中胚层祖细胞和胰腺祖细胞来生成胰腺聚集体 | 该工作使用干细胞衍生的中胚层和胰腺前体生成胰腺模型，且不使用Matrigel，首次展示了PP与MP聚集的效果 | 该研究可能在组织的形态和功能复现方面存在局限性，未考虑其他可能影响胰腺发育的因素 | 研究小鼠胰腺的发育及其内分泌腺的形成机制 | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的中胚层祖细胞和胰腺祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 5837 | 2024-08-05 |
Molecular maps of synovial cells in inflammatory arthritis using an optimized synovial tissue dissociation protocol
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109707
PMID:38832018
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研究论文 | 本研究优化了滑膜组织活检的解离方法，为单细胞组学研究创建了人类滑膜在炎症性关节炎中的单细胞图谱 | 提出了一种有效的滑膜解离方法，并建立了包含多种滑膜细胞亚群的新型单细胞RNA-seq图谱 | 研究中仅涉及了25个滑膜组织样本，可能限制结果的普适性 | 优化滑膜组织解离协议，以提升单细胞组学研究的效率 | 来自25个患有炎症性关节炎的滑膜组织的单细胞 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及25个滑膜组织样本，包含超过100,000个未分拣的滑膜细胞 |
| 5838 | 2024-08-05 |
Qi Lang formula relieves constipation via targeting SCF/c-kit signaling pathway: An integrated study of network pharmacology and experimental validation
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31860
PMID:38841509
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研究论文 | 本研究探讨了Qi Lang公式（QLF）通过靶向SCF/c-kit信号通路在缓解便秘中的作用 | 阐明了QLF在促进ICC增殖以及恢复神经递质水平的机制 | 本研究仅在大鼠模型中进行，可能限制了其临床应用的普遍性 | 揭示Qi Lang公式缓解便秘的潜在机制 | 通过分析QLF及其靶点来研究与ICC相关的便秘 | 数字病理学 | 便秘 | UPLC-MS/MS, scRNA-seq, ELISA, Western blot, 免疫荧光 | NA | NA | 使用大鼠模型进行实验，具体样本数量未说明 |
| 5839 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA-seq unveils the immune infiltration landscape associated with cuproptosis in cerebral cavernous malformations
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00603-y
PMID:38835051
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研究论文 | 该研究揭示了与杯死亡相关的分子特征在脑海绵状血管畸形中的作用 | 首次展示了杯死亡与脑海绵状血管畸形病理之间的分子联系以及新识别的三个关键基因 | 研究中的样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨与脑海绵状血管畸形发展相关的杯死亡分子特征 | 分析了15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 | 数字病理学 | 脑海绵状血管畸形 | RNA测序 | 机器学习模型（LASSO和随机森林） | 基因表达数据 | 15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 |
| 5840 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of zinc homeostasis in the tumor microenvironment and prognosis of prostate cancer
2024-Jun-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01006-z
PMID:38833013
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研究论文 | 这篇文章探讨了锌稳态在前列腺癌肿瘤微环境和预后中的作用 | 构建了锌稳态模式亚型并开发了锌稳态相关风险评分以改进前列腺癌预后预测 | 锌稳态在前列腺癌中的具体影响尚未完全探明 | 研究锌稳态在前列腺癌中的作用及其对预后的影响 | 前列腺癌患者的临床样本和相关基因 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序，贝叶斯网络推断 | 多种机器学习算法 | 临床样本，基因组数据 | NA |