单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7515 篇文献，本页显示第 5781 - 5800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5781 | 2024-08-05 |
Single cell RNA-sequencing and RNA-tomography of the avian embryo extending body axis
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1382960
PMID:38863942
|
研究论文 | 本研究利用高通量测序方法生成小鸡胚胎的分子图谱。 | 该研究结合单细胞RNA测序和RNA成像技术，创建了胚胎躯干的高分辨率转录组图，揭示了与身体轴发育相关的分子通路。 | 缺乏对小鸡胚胎不同发育阶段的多样性探索，可能限制了结果的广泛适用性。 | 旨在通过建立小鸡胚胎发展的分子图谱，理解体轴发育过程中涉及的细胞谱系和基因表达。 | 研究对象为小鸡胚胎的不同细胞谱系，包括体节、神经管、神经脊、侧板中胚层等。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和RNA成像 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5782 | 2024-08-05 |
Single-cell analyzing of tumor microenvironment and cell adhesion between early and late-stage lung cancer
2024-Jul, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.04.013
PMID:38696904
|
研究论文 | 本研究探讨了早期和晚期肺腺癌肿瘤微环境及细胞粘附的单细胞分析 | 提出了TNS1作为早期肺腺癌细胞免疫微环境中的粘附分子，并且可能成为新的预后标志物 | 对调控早期与晚期肺腺癌肿瘤迁移进展的具体因素的理解仍然不完全 | 研究肺腺癌中早期与晚期阶段细胞粘附和肿瘤微环境的差异 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的LUAD样本 |
| 5783 | 2024-08-04 |
A novel single-cell model reveals ferroptosis-associated biomarkers for individualized therapy and prognostic prediction in hepatocellular carcinoma
2024-Jun-10, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01931-z
PMID:38853238
|
研究论文 | 本研究探讨了一种与铁死亡相关的单细胞预测模型，以改善肝细胞癌(HCC)的治疗反应和预后预测。 | 通过LASSO-Cox算法构建了一个包含10个与铁死亡相关的单细胞生物标志物的新模型，提供了个性化治疗和预后预测的新视角。 | 未明确提及研究的局限性 | 旨在提高肝细胞癌患者的治疗反应和预后预测准确性。 | 研究对象为肝细胞癌细胞及其相关的单细胞生物标志物。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | LASSO-Cox模型 | 基因表达数据 | 涉及HCC细胞亚群体的单细胞样本 |
| 5784 | 2024-08-04 |
Deciphering the genetic code of neuronal type connectivity through bilinear modeling
2024-Jun-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91532
PMID:38857169
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的双线性建模方法，用于解码神经元类型之间的遗传连接方式 | 该模型首次将基因表达与连接组数据相结合，成功捕捉了神经元之间的遗传相互作用 | 样本数据有限，模型在特定类型神经元的连接解读中可能存在局限性 | 研究神经元类型之间的遗传连接及其对大脑功能的影响 | 利用小鼠视网膜神经元数据集进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 双线性模型 | 基因表达数据 | 小鼠视网膜神经元数据集中包含的样本数量未具体说明 |
| 5785 | 2024-08-04 |
SCSMD: Single Cell Consistent Clustering based on Spectral Matrix Decomposition
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae273
PMID:38855914
|
研究论文 | 本文提出了一种基于谱矩阵分解的单细胞一致性聚类方法SCSMD | SCSMD融合了多种聚类方法的优势，以确定最佳聚类方案 | NA | 研究单细胞测序数据分析中的聚类问题 | 真实的scRNA-seq数据集，总共15个数据集 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | scRNA-seq | NA | 数据集 | 15个真实的scRNA-seq数据集 |
| 5786 | 2024-08-04 |
High-density generation of spatial transcriptomics with STAGE
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae294
PMID:38647109
|
研究论文 | 本文开发了一种名为STAGE的空间位置监督自编码生成器，用于生成高密度的空间转录组数据 | STAGE使用定制的自监督编码器学习基因表达的连续模式，从而能够生成高分辨率的基因表达，并提高空间转录组数据的质量 | 尚未提及关于STAGE的适用范围或者可能存在的局限性 | 研究旨在改善空间转录组技术中数据分辨率和质量的不足 | 研究对象是空间转录组数据集和基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 自编码生成器 | 自编码器 | 转录组数据 | 四个空间转录组数据集 |
| 5787 | 2024-08-04 |
Structural, Functional, and Genetic Changes Surrounding Electrodes Implanted in the Brain
2024-05-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00057
PMID:38630432
|
研究论文 | 该文章研究植入电极周围的结构、功能和基因变化，旨在改善可植入神经技术的设计 | 创新点在于开发了新的'设备切片'技术，捕捉慢性植入电极与活体大鼠脑组织的相互作用，并揭示了电极周围组织重塑的新观察结果 | 尚需进一步的信息有效链接生物反应与设备设计的特定方面 | 探讨设备与组织整合的基本科学原理，以改善可植入神经技术的设计 | 研究植入电极周围细胞的结构、功能和基因变化 | 数字病理 | NA | 单细胞电生理学，双光子成像，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，细胞电生理数据 | 使用活体大鼠脑组织进行研究，具体样本大小未提供 |
| 5788 | 2024-08-04 |
Identification of prognostic risk model based on plasma cell markers in hepatocellular carcinoma through single-cell sequencing analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1363197
PMID:38859937
|
研究论文 | 本研究基于浆细胞标志物建立了一个肝细胞癌的预后风险模型 | 揭示了肝细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的异质性，并基于浆细胞标志物构建了预后风险模型 | 该研究的局限性在于依赖于单一的数据集进行模型验证 | 旨在探讨肝细胞癌中肿瘤浸润B淋巴细胞的特征及其在治疗中的影响 | 肝细胞癌患者中的肿瘤浸润B淋巴细胞及其亚型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 来自TCGA-LIHC和肝癌研究所（LCI）队列的数据 |
| 5789 | 2024-08-05 |
The lncRNA TPT1-AS1 promotes the survival of neuroendocrine prostate cancer cells by facilitating autophagy
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/IMBV8599
PMID:38859837
|
研究论文 | 这篇文章揭示了lncRNA TPT1-AS1在神经内分泌前列腺癌细胞存活中的作用。 | 这项研究首次提出TPT1-AS1在神经内分泌细胞存活中的保护作用，而非促进神经内分泌分化。 | 本研究未能证明TPT1-AS1在LNCaP细胞中对神经内分泌分化的刺激作用。 | 研究lncRNA TPT1-AS1在前列腺癌发展过程中的角色和机制。 | 研究神经内分泌前列腺癌细胞及相关的lncRNA表达。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了LNCaP和C4-2B细胞模型进行实验 |
| 5790 | 2024-08-05 |
Panoramic analysis of cell death patterns reveals prognostic and immune profiles of head and neck squamous cell carcinoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/PMDA6193
PMID:38859838
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的预测作用和免疫特征 | 提出了细胞死亡指数(CDI)签名作为预测头颈部鳞状细胞癌预后的生物标志物，且发现CAAP1缺失可增强抗肿瘤免疫 | 目前缺乏关于头颈部鳞状细胞癌进展和治疗效果的可靠预测模型 | 探索细胞死亡模式在头颈部鳞状细胞癌中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本及其临床信息 | 数字病理学 | 头颈癌 | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 利用TCGA和GEO数据库的信息进行大规模转录组和单细胞转录组分析 |
| 5791 | 2024-08-05 |
LAYN Serves as a Prognostic Biomarker and Downregulates Tumor-Infiltrating CD8+ T Cell Function in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S464806
PMID:38859944
|
研究论文 | LAYN在肝细胞癌中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次探讨了LAYN在肝细胞癌中与CD8+ T细胞功能障碍及临床预后之间的关系 | 尚未在临床试验中验证LAYN的治疗潜力 | 研究LAYN在肝细胞癌中的免疫功能和预后意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤样本和免疫细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | IF，IHC，ELISA，流式细胞术，mRNA-seq | NA | 肿瘤样本 | 在研究中涉及新鲜样本的检测 |
| 5792 | 2024-08-05 |
Involvement of N4BP2L1, PLEKHA4, and BEGAIN genes in breast cancer and muscle cell development
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1295403
PMID:38859961
|
研究论文 | 本研究探讨了乳腺癌患者在胸大肌细胞中基因表达的变化 | 识别了三种之前未被表征的肿瘤抑制基因，并发现它们在乳腺肿瘤中的表达下调 | 样本量较小，仅涉及50名乳腺癌患者 | 探讨乳腺癌及其与肌肉发育相关的基因表达 | 主要研究对象是乳腺癌患者的正常肌肉细胞基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | RNA | 50名乳腺癌患者 |
| 5793 | 2024-08-04 |
Senescence-targeted MicroRNA/Organoid composite hydrogel repair cartilage defect and prevention joint degeneration via improved chondrocyte homeostasis
2024-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.05.036
PMID:38855061
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老标记物在骨关节炎患者软骨缺损修复中的作用 | 该研究开发了一种针对衰老的miR-24/SMSC类器官复合水凝胶，能够提高软骨修复效果并预防关节退化 | 该研究仅在动物模型中进行了评估，缺乏临床试验的数据支持 | 研究衰老标记物在骨关节炎患者软骨缺损中的作用，为软骨修复提供新视角 | 骨关节炎患者的软骨缺损样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 高通量miRNA测序和qRT-PCR | NA | 临床样本 | 来自骨关节炎CD患者的临床软骨样本 |
| 5794 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the aggressive landscape of high-grade serous carcinoma and therapeutic targets in tumor microenvironment
2024-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216928
PMID:38714290
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了高等级浆液性癌瘤的侵袭性特征和肿瘤微环境中的治疗靶点 | 首次识别出与预后不良相关的S100A9肿瘤细胞亚型，并验证了其标记基因对卵巢癌生长和侵袭的抑制作用 | 缺乏长期随访数据来评估治疗靶点在临床应用中的有效性 | 探索高等级浆液性癌瘤的侵袭机制并寻找新的治疗靶点 | 34例高等级浆液性癌瘤患者的肿瘤样本及其转移部位的109,573个细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 体内和体外模型 | 细胞数据 | 34个肿瘤样本 |
| 5795 | 2024-08-05 |
Preoperative neoadjuvant targeted therapy remodels intra-tumoral heterogeneity of clear-cell renal cell carcinoma and ferroptosis inhibition induces resistance progression
2024-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216963
PMID:38768682
|
研究论文 | 本研究探讨了术前新辅助靶向治疗如何重塑透明细胞肾癌中的肿瘤内异质性，并且铁死亡抑制导致耐药进展 | 首次在整个新辅助管理中描述了肿瘤内异质性，并鉴定了铁死亡作为恶性细胞耐药的关键生物程序 | 研究局限于多中心队列样本，可能影响结果的普适性 | 探索新辅助治疗耐药的关键机制 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤样本及其耐药细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞系模型 | 肿瘤组织样本 | 多个中心的临床试验样本，包括TCGA, ICGC, Checkmate-025和IMmotion151 |
| 5796 | 2024-08-05 |
Unveiling novel cell clusters and biomarkers in glioblastoma and its peritumoral microenvironment at the single-cell perspective
2024-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05313-5
PMID:38851695
|
研究论文 | 该研究以单细胞视角描绘了胶质母细胞瘤及其肿瘤周围微环境的细胞景观 | 首次发现了胶质母细胞瘤中新的细胞亚群和生物标志物，并为精准治疗提供了理论依据 | 样本量较小，仅包含4名患者的8个组织样本，因此结果的普遍适用性可能受到限制 | 描绘胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境的细胞景观，以发现新的细胞亚型和生物标志物 | 4名胶质母细胞瘤患者的组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 组织样本 | 8个组织样本，来自4名胶质母细胞瘤患者 |
| 5797 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals the effects of the FecB mutation on the transcriptome profile in ovine cumulus cells
2024-06-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64001-y
PMID:38849498
|
研究论文 | 研究FecB突变对绵羊卵泡细胞转录组特征的影响 | 采用单细胞RNA测序技术揭示了不同FecB基因型的卵泡细胞在基因表达上的异质性 | 研究中未涉及其他可能影响卵泡细胞分化的遗传因素 | 探索FecB突变如何影响绵羊卵泡细胞的分化过程 | 来自不同FecB基因型的小尾寒羊的卵泡细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三种FecB基因型的小尾寒羊卵泡细胞样本 |
| 5798 | 2024-08-05 |
B cell-mediated antigen presentation promotes adverse cardiac remodeling in chronic heart failure
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.08.593153
PMID:38766182
|
研究论文 | 本文探讨脾脏B细胞通过MHC II介导的抗原呈现对慢性心力衰竭的影响 | 首次揭示了脾脏B细胞在慢性心力衰竭中通过MHC II介导的抗原呈现促进不良心脏重塑的机制 | 对特定免疫细胞在心脏重塑中的具体作用机制的理解仍然有限 | 研究脾脏B细胞在慢性心力衰竭中的作用 | 小鼠和人类心肌梗塞患者的脾脏B细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 细胞 | NA |
| 5799 | 2024-08-04 |
Stress-free single-cell transcriptomic profiling and functional genomics of murine eosinophils
2024-Jun, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00967-3
PMID:38504138
|
研究论文 | 该文章涉及一种无压力的小鼠嗜酸性粒细胞的单细胞转录组分析和功能基因组学方法 | 开发了一种无压力的协议，能够高质量地捕获小鼠组织内嗜酸性粒细胞的单细胞RNA，并揭示了其在结肠炎中的不同肠道亚群及作用 | 需要较高的技术水平，虽然方法可被任何具备基础分子生物学和流式细胞术技能的研究人员使用，但仍需适应其他粒细胞 | 研究嗜酸性粒细胞的异质性及其在健康和疾病中的功能 | 小鼠嗜酸性粒细胞及其在不同组织中的亚群 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA捕获，CRISPR基因筛选 | NA | RNA数据 | 多种组织来源的嗜酸性粒细胞 |
| 5800 | 2024-08-05 |
Identification of a novel prognostic signature based on vitamin metabolism clustering-related genes in lung adenocarcinoma
2024-May-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-245
PMID:38854940
|
研究论文 | 本研究建立了一个基于维生素代谢相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次探索了维生素代谢在肺腺癌中的作用，并建立了一个预后签名 | 未提及样本的多样性和验证该模型在其他人群中的效果 | 旨在识别与肺腺癌相关的维生素代谢差异表达基因 | 研究对象为肺腺癌患者及其维生素代谢模式 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LUAD、GSE68465和GSE72094的数据 |