单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 5781 - 5800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5781 | 2024-08-05 |
Establishment of a prognostic model for hypoxia-associated genes in OPSCC and revelation of intercellular crosstalk
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371365
PMID:38887298
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研究论文 | 该文章建立了一个与缺氧相关的预后模型，并揭示了细胞间的相互作用 | 提出了将缺氧亚型与免疫微环境和临床特征相结合的新方法 | 样本量和数据来源可能限制了模型的广泛适用性 | 探讨缺氧对口咽鳞状细胞癌（OPSCC）预后的影响 | OPSCC患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 口咽癌 | scRNA-seq, WGCNA, CIBERSORT | Cox模型, LASSO | 基因组数据 | 来源于GEO的OPSCC整体测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5782 | 2024-08-05 |
Integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq to explore the differentiation mechanism of human nail stem cells mediated by onychofibroblasts
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1416780
PMID:38887517
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研究论文 | 该研究探讨了人类指甲干细胞（NSC）由指甲成纤维细胞（OF）介导的分化机制 | 首次揭示了指甲成纤维细胞在调节指甲干细胞分化中的作用，并确定了BMP4信号通路的关键角色 | 对指甲成纤维细胞细胞特性和转录组学特征的理解仍有限 | 研究人类指甲成纤维细胞的特性及其在指甲干细胞分化中的作用 | 人类指甲成纤维细胞和干细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 三种来自人类指甲单位的指甲成纤维细胞样本和对照成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5783 | 2024-08-05 |
ScnML models single-cell transcriptome to predict spinal cord neuronal cell status
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1413484
PMID:38894722
|
研究论文 | 本研究开发了一种机器学习预测模型ScnML，用于预测脊髓神经细胞的亚群体和标记基因。 | ScnML模型通过XGBoost算法在预测中实现了高度准确性，并发现了新的重要基因，提升了脊髓神经细胞状态预测的潜力。 | 现有实验技术识别脊髓神经细胞发展过程依然存在劳动密集和成本高的问题。 | 准确识别脊髓神经细胞的细胞状态，以促进新治疗和康复策略的发展。 | 脊髓神经细胞的亚群体及标记基因。 | 机器学习 | NA | XGBoost | NA | 转录组数据 | 训练数据集的准确率为94.33%，测试数据集的准确率为94.08%至94.26%不等 | NA | NA | NA | NA |
| 5784 | 2024-08-05 |
Targeting BMP2 for therapeutic strategies against hepatocellular carcinoma
2024-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101970
PMID:38797016
|
研究论文 | 本研究探讨了BMP2在肝细胞癌（HCC）生长和转移中的作用 | 文章创新性地结合了单细胞RNA测序和整体RNA测序来分析BMP2在HCC中的关键作用 | NA | 研究BMP2在肝细胞癌进展中的作用，评估其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌细胞系Huh-7及其相关的HCC模型 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5785 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing to classify and characterize tumor subgroups in bulk RNA-sequencing data
2024-Jul, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04710-6
PMID:38811523
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为CLIPPR的算法，用于从大规模转录组数据中分类和特征化肿瘤亚组 | 通过结合单细胞模型、RNA推断的拷贝数变异信号和初始大规模模型，CLIPPR算法展示了其在肿瘤分类方面的优势 | 虽然CLIPPR算法在整体准确性方面表现优越，但在某些情况下仍可能面临分类准确性有限的问题 | 提升癌症亚组的分类准确性，以便实现个性化治疗 | 研究针对脑膜瘤的分类，并包括多达789个样本的肿瘤数据 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | CLIPPR元模型 | 转录组数据 | 77个样本和约10,000个单细胞，以及789个肿瘤样本和711个TCGA胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5786 | 2024-08-05 |
Single-cell technologies in psoriasis
2024-Jul, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110242
PMID:38750947
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综述 | 本文综述了单细胞技术在牛皮癣研究中的应用 | 介绍了单细胞技术在了解牛皮癣发病机制中的新进展 | 未提及具体的实验结果或数据 | 探讨牛皮癣的发病机制 | 牛皮癣相关的免疫细胞及其与皮肤实质细胞的相互作用 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞转录组、蛋白组和代谢组 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5787 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq reveals dark- and light-induced differentially expressed gene atlases of seedling leaves in Arachis hypogaea L
2024-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14306
PMID:38391124
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研究论文 | 本文探讨了花生种子叶在暗光条件下的不同基因表达图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统性研究花生在光照条件下的基因表达变化 | 研究可能未覆盖所有潜在的基因调控机制 | 探明花生种子叶在不同光照条件下的基因表达及其调控机制 | 主要研究对象为一周大的花生幼苗叶片的单细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 13409和11296个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5788 | 2024-08-07 |
Correction to: Leveraging single-cell sequencing to classify and characterize tumor subgroups in bulk RNA-sequencing data
2024-Jul, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04731-1
PMID:38834749
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5789 | 2024-08-05 |
Multi-omics profiling reveal cells with novel oncogenic cluster, TRAP1low/CAMSAP3low, emerge more aggressive behavior and poor-prognosis in early-stage endometrial cancer
2024-Jun-17, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02039-2
PMID:38880903
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了一种新的癌基因集群，TRAP1低表达/CAMSAP3低表达在早期子宫内膜癌中表现出更具攻击性的行为和较差的预后。 | 首次发现TRAP1和CAMSAP3在特定细胞集群中显著下调，并构建了结合TRAP1、CAMSAP3和TP53的新的预测模型。 | 本研究的样本量相对较小，仅包含24名早期子宫内膜癌患者，可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究早期子宫内膜癌的临床异质性，识别高质量预后标志物及其在肿瘤攻击性行为中的潜在作用。 | 研究对象为早期子宫内膜癌患者及其癌和旁癌组织的样本。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 蛋白质组学和单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 生物样本 | 24名早期子宫内膜癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5790 | 2024-08-04 |
Cystatin F attenuates neuroinflammation and demyelination following murine coronavirus infection of the central nervous system
2024-Jun-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03153-0
PMID:38879499
|
研究论文 | Cystatin F在小鼠冠状病毒感染后的神经炎症和脱髓鞘化过程中的作用 | 首次详细探讨了Cystatin F在病毒感染后神经疾病严重性中的影响 | 主要使用小鼠模型，结果可能无法直接推广到人类 | 研究Cystatin F在小鼠冠状病毒引起的神经疾病中的作用 | Cystatin F缺失的小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 电子显微镜 | NA | 细胞, RNA | Cst7-/-小鼠和控制小鼠的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5791 | 2024-08-04 |
Chemokine expression profile of an innate granuloma
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.577927
PMID:38352492
|
研究论文 | 本研究旨在表征参与形成粒腺瘤的趋化因子。 | 使用空间转录组学技术动态研究趋化因子表达在粒腺瘤形成过程中的变化。 | 研究中对其他免疫细胞的角色探索不足。 | 探索趋化因子在免疫细胞形成粒腺瘤中的作用。 | 小鼠感染模型和其免疫反应中的单核细胞来源巨噬细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 小鼠感染模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5792 | 2024-08-05 |
ScSNViz: a user-friendly toolset for visualization and analysis of Cell-Specific Expressed SNVs
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596816
PMID:38895293
|
研究论文 | 介绍了一种名为scSNViz的R基础工具集，用于可视化和分析细胞特异性表达的单核苷酸变异。 | 提供了3D可视化功能，兼容多个流行的scRNA-seq处理工具，并能够进行统计指标的估计和图形表示。 | NA | 旨在理解单细胞水平的遗传变异，以获取细胞异质性和基因表达调控的见解。 | 着重分析细胞特异性表达的单核苷酸变异（sceSNVs）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5793 | 2024-08-04 |
Single-cell lineage capture across genomic modalities with CellTag-multi reveals fate-specific gene regulatory changes
2024-Jun, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01931-4
PMID:37749269
|
研究论文 | 本研究提出了一种新的方法CellTag-multi，用于在不同的单细胞基因组测序中进行细胞谱系追踪 | 提出了CellTag-multi方法，可以直接捕获作为多腺苷酸化转录本表达的遗传随机条形码，适用于多种单细胞测定 | NA | 研究细胞谱系追踪与转录组分析相结合的方法 | 小鼠造血过程中的前体细胞谱系及其重编程过程中的基因调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测定 | NA | 转录本 | 小鼠造血过程中的前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5794 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing of tumour infiltrating T cells efficiently identifies tumour-specific T cell receptors based on the T cell activation score
2024-May-10, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03710-9
PMID:38727812
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序建立了一种有效的方法来分离肿瘤反应性T细胞受体 | 创新性地结合多个激活和效应分子的表达水平来提高肿瘤特异性TCR的分离效率 | 研究仅包含两名肺腺癌患者，样本量较小 | 旨在识别肿瘤特异性T细胞受体以改善癌症治疗 | 研究对象为肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 2名肺腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5795 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell and bulk RNA sequencing unveils a machine learning-based pan-cancer major histocompatibility complex-related signature for predicting immunotherapy efficacy
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03714-5
PMID:38714579
|
研究论文 | 该文章探讨了主要组织相容性复合体（MHC）在肿瘤免疫治疗中的潜在生物标志物作用，并开发了MHCsig以预测免疫治疗的疗效 | 开发了新的MHCsig，可以有效预测多种肿瘤免疫治疗的益处 | NA | 研究MHC与免疫治疗反应之间的关系 | 免疫治疗患者的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 大量的全癌症数据和临床队列 | NA | NA | NA | NA |
| 5796 | 2024-08-05 |
Overexpressing S100A9 ameliorates NK cell dysfunction in estrogen receptor-positive breast cancer
2024-May-07, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03699-1
PMID:38713229
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研究论文 | 本研究探讨了S100A9在雌激素受体阳性乳腺癌中的作用，改善了自然杀伤细胞的功能 | 首次揭示了S100A9在ER+/HER2-BC中对NK细胞功能的重要调节作用 | 研究主要集中在细胞及分子水平，临床验证和长时间效应尚不明确 | 探索雌激素受体阳性乳腺癌中NK细胞的功能状态及其调节机制 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞系及其对NK细胞的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞mRNA测序, 批量mRNA测序, qPCR, ELISA | NA | 基因表达数据 | 研究中使用了MCF-7, T47D, MDA-MB-468和MDA-MB-231细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 5797 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Pituitary Gland Changes in Diet-Induced Obesity in Male Mice
2024-Jan-16, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad196
PMID:38146776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了膳食诱导肥胖小鼠的垂体腺变化。 | 本研究首次揭示了高脂饮食如何导致垂体细胞群体和基因表达的显著变化。 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨肥胖对垂体细胞群体及基因表达的影响。 | 研究对象为喂养高脂饮食和对照饮食的雄性小鼠的垂体腺。 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提供具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 5798 | 2024-08-04 |
Advances and applications of biomimetic biomaterials for endogenous skin regeneration
2024-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.04.011
PMID:38883311
|
综述 | 文章概述了生物仿生材料在促进自体皮肤再生中的最新进展 | 提出了新型的生物仿生材料，具备精确的结构、化学成分和生物物理特性 | 当前应用的生物材料在结构和功能上过于简单，无法精确模拟复杂的组织结构 | 探讨生物仿生材料在自体皮肤再生中的应用及其进展 | 关注生物仿生材料如何促进自体皮肤的再生 | 数字病理学 | NA | 重编程、柔性电子皮肤、人工智能、单细胞测序和空间转录组 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5799 | 2024-08-04 |
The art of healing hearts: Mastering advanced RNA therapeutic techniques to shape the evolution of cardiovascular medicine in biomedical science
2024-Aug, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102627
PMID:38723793
|
综述 | 本文深入分析了心血管疾病背景下RNA疗法的发展状态 | 强调了各种针对分子生物学基本法则不同阶段的RNA疗法方法 | 本文未提及具体实验数据或临床试验结果 | 探讨新的RNA治疗方法及其在心血管疾病中的应用 | 心血管疾病中的多种编码和非编码RNA候选者 | 生物医学 | 心血管疾病 | 下一代测序技术，单细胞测序技术 | NA | RNA，基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5800 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics in embryonic mouse diaphragm muscle reveals regional gradients and subdomains of developmental gene expression
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110018
PMID:38883818
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研究论文 | 本文提供了小鼠胚胎横膈肌空间基因表达数据，揭示了肌肉区域的基因特征及其发育过程 | 首次报告了小鼠胚胎横膈肌的空间基因表达模式 | 目前缺乏对其他胚胎时期或不同肌肉类型的系统性研究 | 研究小鼠胚胎横膈肌的发育和神经肌肉连接形成中的基因表达模式 | 小鼠胚胎横膈肌，特别是在胚胎天数E14.5和E18.5的样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 横截面小鼠胚胎样本，具体样本大小未提供 | NA | NA | NA | NA |