单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
561	2025-05-23	YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development 2024-01-22, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029 PMID:38141609	research paper	该研究揭示了YAP和TAZ在小鼠骨骼发育中如何协调成骨前体细胞的动员与血管生成及力学调控	首次发现YAP和TAZ在胚胎骨骼发育中协调成骨前体细胞动员与血管生成，并介导力学调控	研究主要基于小鼠模型，人类细胞共培养实验仅作为补充验证	探究胚胎骨骼发育中成骨前体细胞动员与血管生成协调的分子机制	小鼠胚胎骨骼发育过程中的成骨前体细胞和血管系统	发育生物学	骨骼发育异常	单细胞RNA测序，3D人类细胞共培养	小鼠模型	基因表达数据，细胞培养数据	NA
562	2025-05-23	Deciphering maternal-fetal cross-talk in the human placenta during parturition using single-cell RNA sequencing 2024-01-10, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adh8335 PMID:38198568	研究论文	利用单细胞RNA测序技术解析人类胎盘在分娩过程中的母胎交流	首次建立人类胎盘的单细胞图谱，揭示分娩过程中母体和胎儿细胞类型的转录组活性变化，并发现胎盘源性单细胞特征可用于无创预测早产	研究主要关注足月分娩，对早产的预测仍需进一步验证	解析分娩过程中母胎交流的细胞贡献和通讯机制	人类胎盘中的母体和胎儿细胞	单细胞转录组学	妊娠相关疾病	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	人类胎盘组织样本（具体数量未明确说明）
563	2025-05-23	Insights into midgut cell types and their crucial role in antiviral immunity in the lepidopteran model Bombyx mori 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1349428 PMID:38420120	review	该综述探讨了鳞翅目模型家蚕中肠细胞类型及其在抗病毒免疫中的关键作用	揭示了昆虫中肠细胞在免疫防御中的新机制，包括单细胞转录组学发现的新亚群以及昆虫与高等哺乳动物胃肠道的相似性	NA	阐明中肠细胞类型在昆虫免疫防御中的复杂作用	家蚕中肠细胞（柱状细胞、肠内分泌细胞、杯状细胞和再生细胞）	昆虫免疫学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
564	2025-05-23	Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from pregnant women with Systemic lupus erythematosus 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2024.2376649 PMID:39066603	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了系统性红斑狼疮（SLE）孕妇外周血单个核细胞的免疫细胞组成和基因表达谱	首次在单细胞水平上比较了妊娠期活动性和非活动性SLE患者的免疫细胞类型比例和转录模式	样本量较小（仅12例患者），且未包含健康孕妇对照组	阐明妊娠期SLE患者的免疫细胞变化和分子机制	系统性红斑狼疮孕妇的外周血单个核细胞	数字病理学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序（10x Genomics技术）	NA	RNA测序数据	12例患者（分为4组，每组3人）
565	2025-05-23	Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing 2024, International reviews of immunology IF:4.3Q2 DOI:10.1080/08830185.2022.2144291 PMID:36369864	研究论文	通过单细胞RNA测序技术对先兆子痫孕妇及产后妇女的免疫细胞进行分析	首次在单细胞水平上描绘了先兆子痫患者母体免疫系统的景观和异质性	样本量较小（3例患者和2例对照）	研究先兆子痫与免疫系统改变的关系	先兆子痫孕妇及产后妇女的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞转录组学	先兆子痫	单细胞RNA测序（10× genomics平台）	NA	单细胞转录组数据	3例早发型先兆子痫孕妇和2例健康对照的PBMCs样本，共获得80,429个单细胞转录组
566	2025-05-23	Chemokine receptors in primary and secondary lymphoid tissues 2024, International review of cell and molecular biology DOI:10.1016/bs.ircmb.2023.11.003 PMID:39260934	综述	本文综述了趋化因子受体在初级和次级淋巴组织中的存在和功能	详细讨论了常规趋化因子受体在免疫细胞中的关键作用及其在淋巴组织中的功能	主要关注常规趋化因子受体，对非典型趋化因子受体的讨论较少	探讨趋化因子受体在免疫细胞和淋巴组织中的作用	初级和次级淋巴组织中的免疫细胞	免疫学	NA	高维光谱流式细胞术、单细胞测序	NA	NA	NA
567	2025-05-22	Divergent WNT signaling and drug sensitivity profiles within hepatoblastoma tumors and organoids 2024-11-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52757-w PMID:39567475	研究论文	该研究通过单细胞RNA-seq/ATAC-seq、空间转录组学和高通量药物分析，揭示了肝母细胞瘤的分子异质性和药物敏感性	发现了肝母细胞瘤中两种不同的肿瘤上皮特征（胎儿型和胚胎型），并揭示了它们对WNT信号的不同反应模式以及对不同靶向药物的敏感性	NA	表征肝母细胞瘤的分子异质性并识别新的靶向治疗方法	肝母细胞瘤和肿瘤来源的类器官	癌症研究	肝母细胞瘤	单细胞RNA-seq/ATAC-seq, 空间转录组学, 高通量药物分析	NA	基因组数据, 转录组数据	NA
568	2025-05-22	Molecular profiles, sources and lineage restrictions of stem cells in an annelid regeneration model 2024-11-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54041-3 PMID:39557833	研究论文	通过结合单细胞RNA测序和嵌合转基因技术，研究了海洋环节动物Platynereis dumerilii在后部再生过程中的细胞特征和谱系限制	揭示了细胞类型特异性损伤反应、位置身份因子的重新表达以及多个细胞群中干细胞特征的再现，并发现了一种新的嵌合转基因策略	研究仅针对海洋环节动物Platynereis dumerilii，可能不适用于其他动物门类	探讨动物再生能力的分子和细胞机制	海洋环节动物Platynereis dumerilii	再生生物学	NA	单细胞RNA测序、嵌合转基因技术	NA	RNA测序数据	NA
569	2025-05-22	Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer 2024-11-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54364-1 PMID:39550375	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了前列腺癌治疗过程中肿瘤微环境的转录组景观，并识别了club-like细胞作为与免疫抑制性髓系细胞相互作用的关键上皮细胞亚型	首次全面描绘了前列腺癌治疗时间线上多个时间点的肿瘤微环境转录组景观，并发现club-like细胞与免疫抑制性髓系细胞的相互作用及其在前列腺癌治疗抵抗中的作用	研究样本量相对有限（120例患者），且未深入探讨club-like细胞与PMN-MDSC相互作用的分子机制	探索前列腺癌治疗抵抗的机制，特别是肿瘤微环境在其中的作用	前列腺癌患者的肿瘤微环境，特别是club-like细胞和免疫抑制性髓系细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学	NA	转录组数据	120例前列腺癌患者
570	2025-05-22	GPRC5A promotes lung colonization of esophageal squamous cell carcinoma 2024-11-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54251-9 PMID:39550386	research paper	该研究探讨了GPRC5A在食管鳞状细胞癌（ESCC）早期扩散和肺转移中的作用及其机制	发现GPRC5A通过WWP1/LATS1/YAP1信号通路促进ESCC的早期扩散和肺转移，并提出了针对该通路的治疗策略	研究样本量有限（148例ESCC患者），且机制研究主要在体外和动物模型中进行	探究ESCC早期扩散细胞（DCCs）在肺中定植和转移的分子机制	食管鳞状细胞癌（ESCC）的早期扩散细胞和肺转移灶	癌症生物学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	148例ESCC患者
571	2025-05-22	Defective germinal center selection results in persistence of self-reactive B cells from the primary to the secondary repertoire in Primary Antiphospholipid Syndrome 2024-11-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54228-8 PMID:39548093	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、B细胞受体（BCR）谱分析、CITEseq分析和单细胞永生化技术，探讨了原发性抗磷脂综合征（PAPS）中自身反应性B细胞的起源	揭示了抗磷脂特异性B细胞在PAPS患者中的存在、多反应性及其从天然库中衍生的特性，并发现这些细胞在PAPS患者中未被清除，持续存在于记忆和长寿命浆细胞阶段	研究样本仅限于三重阳性PAPS患者，可能无法代表所有PAPS患者的情况	阐明PAPS中自身反应性B细胞的生存机制，并探索潜在的治疗靶点	PAPS患者的周围血液和骨髓中的B细胞	免疫学	原发性抗磷脂综合征	单细胞RNA测序、BCR谱分析、CITEseq分析、单细胞永生化	NA	单细胞RNA测序数据、BCR序列数据	三重阳性PAPS患者的周围血液和骨髓样本
572	2025-05-22	Multi-omics with dynamic network biomarker algorithm prefigures organ-specific metastasis of lung adenocarcinoma 2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53849-3 PMID:39543109	研究论文	本研究通过动态网络生物标志物算法和多组学数据，预测肺腺癌的器官特异性转移	利用动态网络生物标志物算法和单细胞RNA测序数据，定位癌细胞转移前状态及其基因特征，并构建神经网络模型预测癌细胞转移轨迹	研究仅基于两个临床队列，样本量可能有限	早期检测肺腺癌转移，提高患者生存率	肺腺癌患者及其转移病灶	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、液相色谱-质谱联用技术	神经网络	基因表达数据、血清蛋白质组数据	两个临床队列，涵盖四种主要类型的肺腺癌远处转移
573	2025-05-22	Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq 2024-11-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54202-4 PMID:39543112	研究论文	介绍了一种名为Dyna-vivo-seq的策略，用于在体内单细胞水平上实现时间分辨的动态转录分析	Dyna-vivo-seq通过在体内标记新RNA和旧RNA，提供了研究基因表达动态的新方法，能够揭示细胞异质性	目前仅在小鼠模型中进行验证，尚未在其他生物体或人类中应用	研究急性肾损伤期间的细胞RNA动态变化	雌性小鼠的近端小管细胞	基因组学	急性肾损伤	代谢RNA标记的单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	雌性小鼠的近端小管细胞样本
574	2025-05-22	Identification of signaling pathways that specify a subset of migrating enteric neural crest cells at the wavefront in mouse embryos 2024-07-08, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.034 PMID:38636517	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了小鼠胚胎中前沿迁移肠神经嵴细胞（ENCCs）的分子机制及其与周围细胞的相互作用	首次绘制了前沿ENCCs在迁移过程中的时空动态和分子图谱，并鉴定了调控其分化的关键信号通路	研究主要基于小鼠模型，人类Hirschsprung病组织的验证数据有限	探索肠神经系统（ENS）发育过程中前沿ENCCs的分子调控机制	小鼠胚胎中的前沿迁移肠神经嵴细胞（ENCCs）及其周围组织	发育生物学	Hirschsprung病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	RNA-seq数据, 空间转录组数据	小鼠胚胎组织
575	2025-05-22	Single-cell transcriptomics across 2,534 microbial species reveals functional heterogeneity in the rumen microbiome 2024-Jul, Nature microbiology IF:20.5Q1 DOI:10.1038/s41564-024-01723-9 PMID:38866938	研究论文	利用基于液滴的单细胞RNA测序和泛基因组计算分析，研究瘤胃微生物组的功能异质性	开发了微生物组单细胞转录组学方法，构建了瘤胃微生物组的单细胞转录组图谱，揭示了微生物单细胞水平的功能角色	NA	研究瘤胃微生物组的功能异质性	瘤胃微生物组中的微生物细胞	微生物组学	NA	基于液滴的单细胞RNA测序，泛基因组计算分析	NA	单细胞转录组数据	174,531个微生物细胞，2,534个物种
576	2025-05-22	scRNA-seq data from the larval Drosophila ventral cord provides a resource for studying motor systems function and development 2024-05-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.016 PMID:38569548	研究论文	利用高质量的scRNA-seq数据，结合解剖学验证，对果蝇幼虫腹神经索（VNC）的细胞类型进行全面普查	首次在幼虫阶段定义了构成成虫VNC的神经谱系，并发现了一种在幼虫神经肌肉接头处基础神经传递和稳态中必需的谷氨酸受体亚基	NA	研究果蝇幼虫VNC的细胞类型及其在运动系统功能和发育中的作用	果蝇幼虫腹神经索（VNC）的细胞类型	单细胞RNA测序	NA	scRNA-seq, FACS	NA	单细胞RNA测序数据	果蝇幼虫VNC细胞
577	2025-05-22	Villus myofibroblasts are developmental and adult progenitors of mammalian gut lymphatic musculature 2024-05-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.005 PMID:38537630	研究论文	该研究揭示了小肠绒毛内平滑肌细胞的发育和维持机制，及其在脂肪吸收中的作用	通过单细胞RNA测序和定量谱系追踪，鉴定了小肠绒毛内平滑肌细胞的祖细胞层次结构，并发现NOTCH3-DLL4信号轴调控平滑肌纤维与乳糜管的组装	研究主要基于小鼠模型，人类肠道平滑肌的发育和维持机制可能有所不同	探究小肠绒毛平滑肌的形成、组装及维持机制	小鼠小肠绒毛内的平滑肌细胞及其祖细胞	发育生物学	消化系统疾病	单细胞RNA测序, 定量谱系追踪	NA	基因表达数据, 谱系追踪数据	NA
578	2025-05-22	Metaplastic regeneration in the mouse stomach requires a reactive oxygen species pathway 2024-05-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.002 PMID:38521055	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胃部损伤后细胞再生的机制，揭示了活性氧（ROS）通路在胃部化生再生中的关键作用	首次详细描述了ROS和线粒体调控因子Ppargc1a（Pgc1α）及Nf2el2（Nrf2）在胃部化生再生过程中的作用机制，并发现这些机制同样适用于胰腺腺泡细胞的化生过程	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类组织中验证	探究胃部损伤后细胞再生的分子机制	小鼠胃部细胞及胰腺腺泡细胞	细胞生物学	胃部疾病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	NA
579	2025-05-22	Single-cell assessment of primary and stem cell-derived human trophoblast organoids as placenta-modeling platforms 2024-03-25, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.023 PMID:38359834	研究论文	本文通过单细胞转录组学评估了源自新鲜分离的早期妊娠滋养层细胞或已建立的hTSC细胞系的类器官如何再现体内定义的发育细胞轨迹和转录调控过程	首次全面评估了不同来源的滋养层类器官在模拟滋养层发育和转录调控过程中的准确性和局限性	发现干细胞来源的类器官中存在一个在体内几乎不存在的扩展祖细胞状态，这表明当前类器官平台在模拟某些特定滋养层发育特征时存在偏差	评估当前滋养层类器官平台作为胎盘建模工具的准确性和局限性	人类滋养层干细胞(hTSCs)和相关的滋养层类器官	发育生物学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	未明确说明样本数量，但涉及新鲜分离的早期妊娠滋养层细胞和已建立的hTSC细胞系
580	2025-05-22	Construction of single-cell cross-species chromatin accessibility landscapes with combinatorial-hybridization-based ATAC-seq 2024-03-25, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.01.015 PMID:38330939	研究论文	开发了一种名为CH-ATAC-seq的组合杂交方法，用于构建斑马鱼、果蝇和蚯蚓的单细胞染色质可及性图谱	首次在非哺乳动物物种中构建单细胞染色质可及性图谱，并整合多物种数据系统识别细胞类型特异性调控元件	研究范围限于斑马鱼、果蝇和蚯蚓等特定非哺乳动物物种，未涵盖更广泛的生物多样性	探索脊椎动物和无脊椎动物之间保守的调控程序	斑马鱼、果蝇、蚯蚓、人类、猴子和小鼠的细胞	表观基因组学	NA	scATAC-seq, CH-ATAC-seq, scRNA-seq	NA	基因组数据	约80万个细胞类型特异性cCREs，涵盖152种主要细胞类型