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当前共找到 7461 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-04-29 |
Cancer-cell derived S100A11 promotes macrophage recruitment in ER+ breast cancer
2024-12-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2429186
PMID:39587886
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研究论文 | 通过分析25个ER+乳腺肿瘤的单细胞RNA测序数据，发现癌细胞分泌的S100A11促进巨噬细胞招募，揭示其在肿瘤微环境中的调控作用 | 首次发现S100A11在巨噬细胞与癌细胞相互作用中的新角色，并验证其作为潜在治疗靶点调控富含巨噬细胞的肿瘤微环境 | NA | 探究雌激素受体阳性乳腺癌中癌细胞与巨噬细胞的相互作用机制，特别是S100A11的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 25个雌激素受体阳性乳腺肿瘤中的癌细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 25个雌激素受体阳性乳腺肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 562 | 2026-04-29 |
sc-SPLASH provides ultra-efficient reference-free discovery in barcoded single-cell sequencing
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630263
PMID:39763839
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研究论文 | sc-SPLASH是一种高效的分析流程，能够对条形码化的单细胞RNA测序和空间转录组数据进行无参考基因组的从头发现 | 首次将统计学优先、无参考基因组发现的SPLASH框架扩展到条形码化单细胞RNA测序和空间转录组学数据，并提供了优化的预处理和k-mer计数模块BKC | 未提及明显的局限性 | 开发一种高效的流程，用于在单细胞和空间转录组数据中进行无参考基因组的从头发现，以捕捉传统方法遗漏的转录组多样性 | 人类细胞、海鞘、海绵 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 序列数据（k-mer计数） | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 563 | 2026-04-29 |
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271934
PMID:39382116
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综述 | 综述了空间转录组学在口腔发病机制研究中的应用，包括工作流程、数据分析方法以及在不同颅面区域疾病研究中的实例 | 综述了空间转录组学在口腔和颅面发育及疾病研究中的最新应用，展示了其在解析组织复杂性方面的独特优势 | 未明确提及，但可能包括空间转录组学技术的成本、分辨率限制以及数据分析的复杂性 | 探讨空间转录组学如何用于研究口腔和颅面区域的发育与发病机制 | 口腔和颅面组织，包括颅骨、腭、唾液腺、舌头、口底、口咽和牙周组织 | 数字病理学 | 口腔疾病、头颈癌、干燥综合征、牙周病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 564 | 2026-04-29 |
Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing
2024-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.06.005
PMID:38945476
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析小鼠泪腺的细胞异质性和复杂性 | 首次通过单细胞RNA测序对小鼠泪腺细胞类型进行无偏分类，并构建了全面的细胞图谱 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人体样本 | 揭示健康泪腺的细胞类型及其异质性 | C57BL/6J小鼠的泪腺细胞 | 机器学习和单细胞组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 43,850个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 565 | 2026-04-29 |
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.08.005
PMID:39122180
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学探究年龄和功能障碍对睑板腺细胞群体动态变化的影响 | 首次通过单细胞和空间转录组学技术，揭示睑板腺细胞分化过程中脂质生成基因的分层表达模式，以及年龄相关腺体萎缩和免疫细胞浸润的新机制 | 未明确提及限制条件，可能包括小鼠模型与人类差异、样本量较小或功能验证不足 | 研究睑板腺功能障碍（MGD）的细胞分化、脂质合成及腺体萎缩机制 | 年轻（6月龄）和年老（22月龄）野生型C57Bl/6小鼠，以及年轻（3月龄）和年老（13月龄）Awat2敲除小鼠的睑板腺组织 | 数字病理学 | 干眼病（睑板腺功能障碍） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及两种基因型（野生型和Awat2敲除）及不同年龄段（3-22月龄）的小鼠，具体样本数量未说明 | Resolve Biosciences | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | Resolve Biosciences Molecular Cartography panel | 使用含100个睑板腺特异性基因的Molecular Cartography panel进行空间转录组分析 |
| 566 | 2026-04-29 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
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研究论文 | 构建新生儿和成年小鼠T细胞发育的转录和表观遗传图谱，揭示年龄相关差异的基因调控程序 | 首次整合转录组和表观遗传组数据，揭示T细胞发育中与年龄相关的基因调控程序差异，并利用CRISPR扰动结合单细胞测序鉴定关键调控因子 | 仅基于小鼠模型，人类年龄相关差异需进一步验证 | 研究T细胞发育过程中与年龄相关的基因调控程序及其机制 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR扰动、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 新生儿和成年小鼠的胸腺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，结合CRISPR扰动技术 |
| 567 | 2026-04-29 |
Single-Cell Sequencing Illuminates Thymic Development: An Updated Framework for Understanding Thymic Epithelial Tumors
2024-06-03, The oncologist
DOI:10.1093/oncolo/oyae046
PMID:38520743
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析胸腺上皮肿瘤研究中揭示的胸腺发育新框架，包括胸腺上皮区室的细胞多样性、分化与衰老过程及肿瘤发生机制 | 利用单细胞分子分析技术为胸腺上皮肿瘤的临床和基础研究提供新视角，提出针对肿瘤异质性和起源细胞等未解问题的新见解 | 胸腺上皮肿瘤的罕见性限制了肿瘤发生机制的研究和合理治疗方案的开发 | 探讨单细胞测序如何深化对胸腺正常发育和恶性转化的理解，以推动罕见胸腺上皮肿瘤的改进治疗策略 | 胸腺上皮肿瘤（包括胸腺瘤和胸腺癌）及正常胸腺组织 | 单细胞组学 | 胸腺上皮肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2026-04-29 |
HIF2A mediates lineage transition to aggressive phenotype of cancer-associated fibroblasts in lung cancer brain metastasis
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2356942
PMID:38778816
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研究论文 | 通过对肺转移性肺癌单细胞RNA测序数据的再分析，发现癌症相关成纤维细胞在缺氧条件下经历由HIF-2α驱动的谱系转变，从而增强血管生成并促进肿瘤生长，揭示了肺癌脑转移的新机制 | 发现HIF-2α驱动癌症相关成纤维细胞谱系转变至更具侵袭性的表型，并明确其在肺癌脑转移微环境中的功能变化，提供了潜在的治疗靶点 | 未明确定量分析的样本规模有限，仅使用了四个配对的脑转移和原发肺癌样本进行验证 | 阐明肺癌脑转移中癌症相关成纤维细胞的谱系组成和功能变化及其分子机制 | 肺癌患者（包含原发灶和脑转移灶）的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据（单细胞和批量RNA测序）、免疫组化图像 | 四个配对的脑转移和原发肺癌样本（用于多重免疫组化验证） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基于公共数据集GSE131907的分析 |
| 569 | 2026-04-29 |
SIGLEC15, negatively correlated with PD-L1 in HCC, could induce CD8+ T cell apoptosis to promote immune evasion
2024, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2376264
PMID:38988824
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研究论文 | 探究SIGLEC15在肝细胞癌中与PD-L1的负相关性及其通过诱导CD8+ T细胞凋亡促进免疫逃逸的机制 | 首次揭示SIGLEC15与PD-L1在肝细胞癌中的负相关表达模式，阐明SIGLEC15通过抑制CD8+ T细胞活力和诱导凋亡而非直接促进肿瘤增殖来介导免疫逃逸 | 未提及研究的明显局限 | 阐明SIGLEC15在肝细胞癌免疫逃逸中的功能及其与PD-L1的表达关系 | 肝细胞癌细胞系、免疫缺陷和免疫健全小鼠模型、Jurkat T细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | PCR分析、免疫组化、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 肝细胞癌组织样本、小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-04-28 |
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003
PMID:39306240
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研究论文 | 评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录谱的影响，重点关注单核吞噬细胞的变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示干眼症诱导结膜单核吞噬细胞中TLF+调节性巨噬细胞和CCR2+炎性细胞的差异化基因表达模式，并证实调节性巨噬细胞对抑制炎症和杯状细胞丢失的关键作用 | 主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证；调节性巨噬细胞耗竭实验依赖甘露糖化氯膦酸盐脂质体，可能存在非特异性效应 | 阐明干眼症条件下结膜免疫细胞的动态变化及调节性巨噬细胞的免疫抑制功能 | C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq | Monocle 3细胞轨迹模型 | 单细胞转录组数据、染色质开放性数据 | 非应激和干燥应激处理的C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 对分选的结膜免疫细胞进行单细胞RNA测序和scATAC-seq分析 |
| 571 | 2026-04-28 |
Tumour evolution and microenvironment interactions in 2D and 3D space
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08087-4
PMID:39478210
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研究论文 | 通过空间转录组学分析了来自6种癌症类型的131个肿瘤切片，结合单核RNA测序和CODEX数据，研究了肿瘤在二维和三维空间中的演化及其与微环境的相互作用 | 首次大规模结合Visium空间转录组学、单核RNA测序和CODEX多模态数据，定义了肿瘤微区域和空间亚克隆，并利用深度学习算法重建三维肿瘤结构，揭示了免疫热区和冷区的空间分布 | 样本量有限且仅涵盖6种癌症类型；三维重构基于连续切片可能引入对齐误差；深度学习算法依赖未监督学习，需进一步验证其生物学意义 | 研究肿瘤细胞与非癌细胞在二维和三维空间中的空间相互作用和演化机制 | 来自78例病例的131个肿瘤切片，涵盖6种癌症类型 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学, 单核RNA测序, CODEX多重免疫荧光 | 无监督深度学习 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, CODEX多重成像数据 | 131个肿瘤切片（78例患者，6种癌症类型），48例匹配的单核RNA测序样本，22例匹配的CODEX样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台，结合10x单核RNA测序和CODEX多重免疫荧光技术 |
| 572 | 2026-04-28 |
A spatial expression atlas of the adult human proximal small intestine
2024-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07793-3
PMID:39112711
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研究论文 | 利用空间转录组学、空间蛋白质组学和单分子荧光原位杂交技术，重建了成人近端小肠的综合空间表达图谱，揭示了沿隐窝-绒毛轴的区域化表达和细胞类型分布 | 首次在成人近端小肠中系统描绘了沿隐窝-绒毛轴的基因表达空间异质性，发现迁移性肠上皮细胞从绒毛底部脂滴组装和铁吸收向顶端乳糜微粒合成和铁释放的转变，并揭示绒毛顶端细胞具有促免疫原性特征 | 未明确提及具体局限性 | 重建成人近端小肠的空间表达图谱，解析隐窝-绒毛轴的基因表达和细胞类型空间异质性 | 成人近端小肠组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学， 空间蛋白质组学， 单分子荧光原位杂交 | NA | 空间基因表达数据， 空间蛋白质表达数据 | 成人近端小肠组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学， 单分子荧光原位杂交 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台， 单分子荧光原位杂交技术 |
| 573 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of lacrimal gland in GVHD mouse model
2024-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.04.006
PMID:38703817
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示GVHD小鼠模型泪腺的转录景观 | 首次构建GVHD小鼠泪腺细胞图谱，发现Lrg1高表达上皮细胞新亚群，并描绘细胞间通信网络 | 仅基于小鼠模型，需在人类样本中验证；部分转录结果通过免疫荧光验证，缺乏功能实验 | 研究GVHD小鼠模型中泪腺细胞群的全局转录表达谱，揭示眼表GVHD的发病机制 | GVHD小鼠模型的泪腺细胞 | 转录组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | GVHD小鼠模型泪腺细胞（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2026-04-28 |
Inflammatory recruitment of healthy hematopoietic stem and progenitor cells in the acute myeloid leukemia niche
2024-04, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02136-7
PMID:38228679
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研究论文 | 揭示急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞被炎症性募集的机制 | 首次证明健康造血干细胞和祖细胞在低白血病浸润时即主动参与骨髓微环境炎症反应，并识别出AML来源的纳米级胞外囊泡是触发该炎症反应的关键因素 | 未明确讨论样本量大小及临床验证结果 | 探究急性髓系白血病微环境中健康造血干细胞和祖细胞是否主动参与炎症传播及其机制 | 急性髓系白血病小鼠模型中的健康造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个独立同源小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-04, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞微环境及潜在发病机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析翼状胬肉的细胞异质性，发现免疫成纤维细胞、EMT上皮细胞和活化血管内皮细胞等新亚群，并揭示巨噬细胞与ACKR1+活化血管内皮细胞的相互作用在疾病发展中的关键作用 | 需要进一步的体内外实验验证单细胞测序发现的细胞间相互作用机制，且样本量有限 | 探究翼状胬肉的发病机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者及正常对照者的结膜组织细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 45605个细胞（来自翼状胬肉患者和正常对照） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 576 | 2026-04-28 |
A model of human neural networks reveals NPTX2 pathology in ALS and FTLD
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07042-7
PMID:38355792
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研究论文 | 通过人类神经网络模型揭示ALS和FTLD中NPTX2的病理作用 | 首次利用iCoMoNSCs衍生的长寿命功能性神经网络iNets模拟TDP-43蛋白病，并鉴定出NTPX2作为TDP-43关键调控靶点，阐明其在神经毒性中的直接作用 | 未提及明确的局限性 | 研究TDP-43病理在神经退行性疾病中的出现机制及后果 | 诱导多能干细胞衍生的神经干细胞及其分化形成的神经网络 | 自然语言处理 | 肌萎缩侧索硬化症、额颞叶变性 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 患者样本（肌萎缩侧索硬化症和额颞叶变性患者） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 577 | 2026-04-28 |
Circulating myeloid-derived MMP8 in stress susceptibility and depression
2024-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07015-2
PMID:38326622
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研究论文 | 循环髓系来源的MMP8在应激易感性和抑郁症中的作用 | 首次揭示外周髓系细胞特异性蛋白酶MMP8在应激易感性和抑郁症中通过直接浸润脑区影响细胞外空间和神经生理的机制 | 未明确MMP8从外周进入脑实质的具体分子途径，且研究主要基于小鼠模型，人类数据仅涉及血清水平检测 | 探究外周免疫系统改变如何通过特定分子影响中枢神经系统功能和压力相关行为 | 人类重度抑郁症患者血清样本及慢性社交挫败应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 基因表达数据、蛋白质组学数据 | 人类患者血清样本与小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于免疫细胞高维表型分析 |
| 578 | 2026-04-27 |
Single-cell RNA sequencing in stroke and traumatic brain injury: Current achievements, challenges, and future perspectives on transcriptomic profiling
2024-Dec-09, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X241305914
PMID:39648853
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综述 | 综述单细胞RNA测序在脑卒中和创伤性脑损伤中的应用现状、挑战及未来转录组分析的展望 | 系统总结了scRNA-seq在脑卒中和急性创伤性脑损伤领域的最新成果，并展望了结合空间转录组学的未来应用方向 | 组织解离过程可能诱导细胞应激反应，影响数据的准确性 | 概述单细胞RNA测序技术的工作流程、数据分析方法及优缺点，并探讨其在脑损伤研究中的应用与未来前景 | 脑卒中和创伤性脑损伤中的细胞类型及转录组特征 | 自然语言处理 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 基于液滴的scRNA-seq系统和空间转录组学平台 |
| 579 | 2026-04-27 |
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176207
PMID:39621585
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研究论文 | 本文发现内皮细胞中HIF脯氨酰羟化酶（PHD1-3）在缺血后失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 | 首次揭示内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3联合失活（而非单独PHD2失活）通过糖酵解/MCT4轴驱动AKI向CKD转变，并发现MCT4抑制剂syrosingopine可恢复适应性修复 | 未明确提及，但可能包括机制细节需进一步验证和临床转化距离 | 探究内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的调控作用 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤、慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、药物抑制 | NA | 单细胞转录组数据、组织病理数据 | 小鼠模型（PHDTiEC基因敲除小鼠）和人类肾组织样本（伴有严重AKI） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 580 | 2026-04-27 |
CTLA-4-expressing ILC3s restrain interleukin-23-mediated inflammation
2024-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07537-3
PMID:38867048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肠道IL-23受体表达细胞中，ILC3s上调CTLA-4以抑制IL-23介导的炎症 | 首次揭示ILC3s表达CTLA-4作为免疫检查点限制IL-23病理作用的新机制 | 未阐明CTLA-4阳性ILC3s在人类炎症性肠病中的具体功能变化及长期效应 | 探究IL-23介导组织保护与病理炎症之间的调控机制 | 肠道IL-23受体表达细胞（T细胞和ILC3s）及小鼠模型 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肠道细胞及人类ILC3s样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |