单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 5761 - 5780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5761 | 2024-08-05 |
Multiomics Analyses Identify AKR1A1 as a Biomarker for Diabetic Kidney Disease
2024-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0540
PMID:38394643
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析确定了AKR1A1作为糖尿病肾病的生物标志物 | 研究首次揭示AKR1A1在糖尿病肾病细胞功能障碍中的潜在分子中心作用 | 研究可能受限于单细胞RNA测序和蛋白质组学数据的特定性和样本量 | 揭示糖尿病肾病的病理生理机制并寻找生物标志物 | 糖尿病肾病相关的功能基因及其蛋白产物 | 生物医学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和蛋白质组学 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 包括糖尿病心脏研究样本的纵向代谢物分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5762 | 2024-08-04 |
A Novel Macrophage Subpopulation Conveys Increased Genetic Risk of Coronary Artery Disease
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.324172
PMID:38747151
|
研究论文 | 该文章探讨了一种新的巨噬细胞亚群如何增加冠状动脉疾病的遗传风险 | 研究揭示了CD52-hi巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的关键作用，以及与冠状动脉疾病相关的特定遗传变异和候选致病基因 | 研究可能在样本规模和病例异质性方面存在局限性 | 探索冠状动脉疾病中巨噬细胞亚群的遗传贡献和致病机制 | 主要以人类单核细胞源的巨噬细胞为研究对象 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞多组学 | NA | 基因组数据 | 来自38个动脉粥样硬化样本的5000多个巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5763 | 2024-08-04 |
Establishment and validation of a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature for predicting clinical outcomes and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01092-z
PMID:38900330
|
研究论文 | 本文建立并验证了一个新的CD8+ T细胞相关预后标志，通过整合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据来预测肝细胞癌的临床结果和免疫治疗反应 | 提出了基于CD8+ T细胞的预后标志，这为肝细胞癌患者临床结果和免疫治疗反应的预测提供了强有力的模型 | 尚未提及研究的具体局限性 | 探讨CD8+ T细胞相关基因在肝细胞癌中的预后意义 | 利用来自不同数据库的HCC的单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和大规模RNA测序 | Cox-Lasso回归模型 | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5764 | 2024-08-05 |
MYCT1 controls environmental sensing in human haematopoietic stem cells
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07478-x
PMID:38839950
|
research paper | 本文探讨了MYCT1在调节人类造血干细胞（HSCs）环境感知和内吞作用中的重要性 | 发现MYCT1是人类HSC的重要调控因子，其缺失使HSC在培养中失去干性 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证结果 | 揭示MYCT1在保持人类造血干细胞干性中的作用 | 人类造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5765 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing of 3' RNA Transcripts
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_16
PMID:38907922
|
research paper | 本研究描述了一种通过单细胞封闭和捕获mRNA转录本3'端聚腺苷酸尾巴的单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法 | 结合细胞和分子条形码的技术创新使得能对细胞中表达的基因进行更精确的识别 | NA | 探讨单细胞RNA测序在细胞状态和行为研究中的应用 | 单个细胞内的RNA表达 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5766 | 2024-08-05 |
Sequencing: 10X Genomics 3' HT Assay for Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3918-4_15
PMID:38907921
|
研究论文 | 本文章介绍了10X Genomics 3' HT试剂盒用于基因表达的单细胞RNA测序方法 | 此试剂盒引入了新的专有芯片，支持更高数量的细胞条形码和更大样本容量 | 没有提到特定的局限性 | 研究单细胞RNA测序技术以提升基因表达研究的准确性 | 研究对象为单个细胞及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达序列 | 每次实验最多可处理16个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5767 | 2024-08-04 |
Zinc ions regulate mitochondrial quality control in neurons under oxidative stress and reduce PANoptosis in spinal cord injury models via the Lgals3-Bax pathway
2024-Aug-20, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了锌离子如何通过Lgals3-Bax通路在脊髓损伤模型中调节线粒体质量控制并降低PANoptosis | 研究揭示了锌离子在氧化应激下通过靶向Lgals3-Bax通路保护线粒体的机制，为脊髓损伤的治疗提供了一种新的方法 | 研究对锌离子的作用机制进行了探讨，但可能需要更多的临床数据来进一步验证 | 本研究旨在探讨锌离子在脊髓损伤中的保护作用及其机制 | 研究对象为脊髓损伤模型中的神经元 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5768 | 2024-08-05 |
Comparison of genetic and epigenetic profiles of periodontitis according to the presence of type 2 diabetes
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.620
PMID:38903536
|
研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病与牙周炎之间的遗传和表观遗传特征的比较 | 使用多组学方法揭示了与Fc-伽马受体介导的吞噬作用通路相关的特定遗传和表观遗传变化 | 暂无具体的限制说明 | 深入理解2型糖尿病与牙周炎之间的相互关系 | 2型糖尿病患者的牙周组织样本与健康参与者进行比较 | 数字病理学 | 牙周炎, 2型糖尿病 | 全基因组测序, 甲基化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 甲基化数据, RNA测序数据 | 涉及牙周炎患者（含糖尿病与不含糖尿病）及健康参与者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5769 | 2024-08-04 |
Tissue module discovery in single-cell-resolution spatial transcriptomics data via cell-cell interaction-aware cell embedding
2024-Jun-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.05.001
PMID:38823396
|
research paper | 本研究提出了一种新的深度学习方法SPACE，用于通过细胞相互作用意识的细胞嵌入分析单细胞分辨率的空间转录组数据 | SPACE能够识别具有特殊空间分布模式和不同邻近相互作用细胞类型的空间信息细胞亚型，并自动发现具有明显边界的细胞社区 | NA | 揭示个体细胞如何发挥组织特异性功能的空间组织原则 | 单细胞分辨率的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5770 | 2024-08-05 |
Knockdown of ATRX enhances radiosensitivity in glioblastoma
2024-Jun-19, Chinese neurosurgical journal
DOI:10.1186/s41016-024-00371-6
PMID:38898533
|
研究论文 | 本研究探讨了ATRX在胶质母细胞瘤中的放射敏感性作用 | 揭示了ATRX突变对胶质母细胞瘤患者生存期的影响，并提出ATRX作为克服放射抗性的新靶点 | 未提供具体的临床试验数据支持 | 研究ATRX在胶质母细胞瘤放射抗性中的作用 | 胶质母细胞瘤患者的ATRX突变率及其表达 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从癌症基因组图谱中获取的胶质瘤患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5771 | 2024-08-04 |
Traumatic brain injury promotes neurogenesis at the cost of astrogliogenesis in the adult hippocampus of male mice
2024-Jun-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49299-6
PMID:38890340
|
研究论文 | 创伤性脑损伤(TBI)导致小鼠成年海马中的神经发生增加，同时减少星形胶质细胞生成 | 本研究揭示了创伤性脑损伤如何改变神经干细胞的命运，促进神经发生而代价于星形胶质细胞生成 | 本研究仅在雄性小鼠中进行，未考虑性别对结果的影响 | 探讨创伤性脑损伤对成年小鼠海马神经干细胞及其衍生细胞线的影响 | 成年雄性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 受控皮层撞击模型 | 细胞、基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5772 | 2024-08-05 |
Empowering artificial intelligence in characterizing the human primary pacemaker of the heart at single cell resolution
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63542-6
PMID:38890395
|
研究论文 | 本文利用新颖的深度学习解卷积方法对人类窦房结的细胞异质性进行了表征 | 采用Bulk2space方法揭示了人类窦房结的独特单细胞组成 | 样本稀缺性可能影响研究结果的全面性 | 探讨人类窦房结的细胞组成和功能 | 主要聚焦于人类窦房结的细胞群体 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | RNA-seq | 深度学习解卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 包含18个人类细胞群体以及小鼠scRNA-Seq数据作为参考 | NA | NA | NA | NA |
| 5773 | 2024-08-05 |
Identification of a novel monocyte/macrophage-related gene signature for predicting survival and immune response in acute myeloid leukemia
2024-06-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64567-7
PMID:38890346
|
研究论文 | 本研究开发了一种单核细胞/巨噬细胞相关的预后风险评分模型，以预测急性髓系白血病（AML）的生存和免疫反应 | 首次提出了MMrisk模型，该模型基于八个单核细胞/巨噬细胞相关基因，能有效预测AML患者的生存率和免疫特征 | 研究可能受限于样本量及所用数据集的特异性，尚需更多临床验证 | 旨在通过识别新的治疗生物标志物来改善急性髓系白血病的预后和免疫治疗效果 | 研究对象为急性髓系白血病患者及其单核细胞/巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序，差异表达基因分析 | Cox回归分析，LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用两个GEO数据集进行验证，样本具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5774 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis
2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02613-2
PMID:38890734
|
研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制 | 发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群，并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制 | 研究未提及样本数量和临床有效性验证 | 探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制 | 分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 分析了32724个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5775 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18373
PMID:38894657
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用 | 首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群，并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型 | 研究对象仅限于27名胃癌患者，数据来源单一，可能影响研究结果的广泛适用性 | 揭示胃癌快速进展的分子生物学机制 | 对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 27名胃癌患者的38个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5776 | 2024-08-05 |
Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction
2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374
PMID:38752343
|
研究论文 | 本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。 | 通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析，识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型，提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。 | 该研究的样本规模较小，仅包括38名患者和38名对照，可能限制结果的广泛适用性。 | 研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。 | 38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液样本 | 38名急性心肌梗死患者和38名对照，共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5777 | 2024-08-05 |
Human-like adrenal features in Chinese tree shrews revealed by multi-omics analysis of adrenal cell populations and steroid synthesis
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了中国树鼩的肾上腺细胞群和类固醇合成中的人类样特征 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组分析系统性映射了中国树鼩肾上腺细胞类型和类固醇代谢通路 | 研究主要集中在树鼩的肾上腺细胞类型及其与人类的比较，其他模型的比较可能有限 | 研究树鼩中肾上腺类固醇合成的细胞类型及其功能 | 中国树鼩的肾上腺细胞群和类固醇合成机制 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合症，原发性醛固酮增多症，高血压 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析，质谱，免疫组化 | NA | RNA序列，代谢数据 | 多种细胞类型的样本，包括树鼩，人类，猕猴和小鼠的比较 | NA | NA | NA | NA |
| 5778 | 2024-08-05 |
Applications of single-cell RNA sequencing in spermatogenesis and molecular evolution
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
评论 | 本文综述了单细胞RNA测序在精子发生和分子演化中的应用 | 该文章创新性地探索了单细胞转录组测序技术在揭示精子发生细胞异质性及其分子演化过程中的作用 | 文章主要为综述，缺乏实验数据支持 | 阐明单细胞RNA测序在哺乳动物精子发生中的调控机制 | 精子发生细胞及其生态位细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5779 | 2024-08-05 |
Meiotic transcriptional reprogramming mediated by cell-cell communications in humans and mice revealed by scATAC-seq and scRNA-seq
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过scATAC-seq和scRNA-seq揭示了人类和小鼠中的减数分裂转录重编程受到细胞间通讯的介导 | 首次展示了精原细胞在减数分裂早期阶段重编程的转录变化以及Sertoli细胞与生殖细胞之间信号的角色 | 对减数分裂调控机制的深入了解仍然有限，需要更多研究来确认发现 | 研究减数分裂过程中转录重编程的机制及其与生殖细胞功能的关系 | 人类和小鼠的精巢组织中的减数分裂细胞 | 数字病理学 | 无阻塞性无精症 | scATAC-seq和scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 人类和小鼠的精巢组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5780 | 2024-08-04 |
Clinically relevant molecular hallmarks of PFA ependymomas display intratumoral heterogeneity and correlate with tumor morphology
2024-01-24, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02682-x
PMID:38265527
|
研究论文 | 本文探讨了后颅窝A型（PF-EPN-A）ependymoma的分子特征及其肿瘤内部异质性与肿瘤形态之间的关联。 | 研究揭示了PF-EPN-A肿瘤内部的异质性以及其与肿瘤形态的临床相关性，尤其在细胞密度及其不同区域的DNA甲基化差异方面。 | 研究主要集中在113个样本，可能无法全面代表所有PF-EPN-A病例的分子特征。 | 识别PFA ependymomas中形态不同区域的分子差异及其临床意义。 | 分析113个PF-EPN-A样本以及40个相关复发样本。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数分析和原位荧光杂交（FISH） | NA | 组织样本 | 113个PF-EPN-A样本，包括40个复发样本 | NA | NA | NA | NA |