本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5741 | 2024-08-04 |
Transcriptional and functional remodeling of lung-resident T cells and macrophages by Simian varicella virus infection
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408212
PMID:38887303
|
研究论文 | 这篇文章探讨了猿水痘病毒感染如何重塑肺部常驻T细胞和巨噬细胞的转录组和功能 | 提出了SVV感染后肺部细胞转录组的变化以及适应性反应的见解 | 未明确阐述SVV与人类VZV感染的所有潜在差异 | 研究SVV感染对肺部免疫反应的影响 | 肺部常驻T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | 猕猴实验模型 | 转录组数据 | 未提供样本量信息 | NA | NA | NA | NA |
| 5742 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis of the clinical significance and molecular mechanism of T-box transcription factor 3 in osteosarcoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.96168
PMID:38911382
|
研究论文 | 该文章研究了TBX3在骨肉瘤中的临床意义和分子机制 | 文章首次揭示TBX3在骨肉瘤进展中的潜在作用及其作为生物标志物的可能性 | 研究采用的数据来自微阵列和RNA-seq,可能存在数据偏差的风险 | 研究TBX3在骨肉瘤中的作用及其临床重要性 | 重点研究TBX3在不同骨肉瘤阶段的表达以及与疾病进展的关系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5743 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell transcriptomics and epigenetic analysis reveals enhancer-controlled TIMP1 as a regulator of ferroptosis in colorectal cancer
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01474-7
PMID:38032469
|
研究论文 | 本研究探讨了增强子控制的基因在结直肠癌中对铁死亡的调控作用和机制。 | 发现TIMP1作为铁死亡调控因子通过增强子与转录因子SPI1结合而上调,提供了结直肠癌治疗的新分子靶点。 | 研究仅基于特定数据集的单细胞RNA测序和ChIP-seq数据,可能局限于这些特定样本的普适性。 | 研究增强子控制的基因在结直肠癌铁死亡中的作用和机制。 | 结直肠癌(CRC)中不同细胞群体及其与铁死亡的相关性。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq),ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 从GSE200997和GSE166254数据集中涉及的结直肠癌和正常结肠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5744 | 2024-08-04 |
The Fibroblast Landscape in Stomach Carcinogenesis
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.02.001
PMID:38342299
|
评论 | 本文总结和讨论了近年来关于人类胃中成纤维细胞组分从正常到化生、异型增生和癌症的研究。 | 本文创新点在于强调了成纤维细胞群体在胃癌发生过程中的异质性和可塑性,尤其是在化生和异型增生中的变化。 | 本文为综述,可能未包含某些最新的研究进展。 | 研究胃癌发生过程中成纤维细胞的组分和特征。 | 研究对象为人类胃中不同阶段(正常、化生、异型增生和癌症)的成纤维细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5745 | 2024-08-04 |
Multi-omic profiling of breast tumor microenvironment uncovers a role of mitochondrial calcium gatekeepers
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.95979
PMID:38911376
|
研究论文 | 本研究旨在阐明线粒体钙摄取1/2(MiCU1/2)在乳腺癌中的作用 | 采用针对整个肿瘤组织、单细胞和空间转录组分析的新型网络应用,发掘MiCU1/2与肿瘤免疫微环境之间的关联 | NA | 探讨MiCU1/2作为乳腺癌的独立诊断生物标志物及其预后预测的潜力 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 涉及乳腺癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5746 | 2024-08-05 |
Mussel inspired 3D elastomer enabled rapid calvarial bone regeneration through recruiting more osteoprogenitors from the dura mater
2024, Regenerative biomaterials
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/rb/rbae059
PMID:38911700
|
研究论文 | 该研究开发了一种3D弹性体,促进了颅骨缺损的再生。 | 首次揭示了硬脑膜细胞与巨噬细胞之间的相互作用对颅骨全层修复的关键作用。 | 研究中未提及样本数量和临床试验情况,可能影响结果的广泛适用性。 | 探索新材料在颅骨再生中的应用及其机制。 | 主要研究硬脑膜细胞和巨噬细胞在颅骨愈合中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D弹性体 | 生物材料实验数据 | 8mm颅骨缺损模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5747 | 2024-08-05 |
A review on gene regulatory network reconstruction algorithms based on single cell RNA sequencing
2024-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01473-8
PMID:38032470
|
综述 | 本文综述了15种基于单细胞RNA测序的基因调控网络重建工具及其优缺点 | 强调了单细胞RNA测序技术的进步如何促进了基因调控网络的重建 | 未能提供对所有GRN重建工具的深入验证 | 介绍不同的基因调控网络重建工具及其在单细胞RNA测序中的应用 | 15种基因调控网络重建工具 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5748 | 2024-08-05 |
Development and validation of matrix metalloproteinase for predicting prognosis and tumour microenvironment immune profiles in uterine corpus endometrial carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.91277
PMID:38911387
|
研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶(MMP)在预测子宫体癌患者预后和肿瘤微环境免疫特征中的应用 | 文章创新性在于构建了MMP评分系统,能够有效预测子宫内膜癌患者的预后与肿瘤微环境的免疫细胞浸润 | 尽管低MMP评分组患者预后较差,但对免疫治疗的反应更好,这一结论需要更深入的临床验证 | 研究的目的是评估MMP表达模式对子宫内膜癌预后的影响 | 研究对象为子宫内膜癌患者及其MMP相关的表达数据和临床信息 | 数字病理学 | 子宫癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 主成分分析(PCA) | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5749 | 2024-08-05 |
Identification Of Endothelial Cell Immune-related Gene Signature for Lung Adenocarcinoma by Integrated Analysis of Single-cell and Bulk RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94501
PMID:38911372
|
研究论文 | 本研究旨在探讨内皮细胞免疫相关基因在肺腺癌(LUAD)中的预后价值,并提供进一步见解 | 通过整合单细胞和大规模RNA测序数据,构建了新的预后模型和预后标志,发展了针对LUAD患者的个性化治疗方向 | 研究的模型和标志还需要在更广泛的人群中进一步验证 | 研究内皮细胞免疫相关基因在肺腺癌中的作用及其预后价值 | 肺腺癌患者及其相关的内皮细胞免疫相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和大规模RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 分析了来自GEO数据库的单细胞RNA测序样本和来自TCGA的批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5750 | 2024-08-05 |
Melatonin improves mouse oocyte quality from 2-ethylhexyl diphenyl phosphate-induced toxicity by enhancing mitochondrial function
2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116559
PMID:38865937
|
研究论文 | 本研究探讨了2-乙基己基二苯酸酯对小鼠卵母细胞质量的影响,并评估了褪黑激素的保护作用 | 揭示了2-乙基己基二苯磷酸酯在小鼠卵母细胞上的毒性机制,并显示褪黑激素能够部分恢复卵母细胞的成熟能力 | 该研究主要针对小鼠卵母细胞,可能无法直接推广到其他物种或临床应用 | 研究2-乙基己基二苯磷酸酯对小鼠卵母细胞的影响及其潜在修复机制 | 小鼠卵母细胞及其在体外培养中的成熟情况 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5751 | 2024-08-04 |
Targeting ESE3/EHF With Nifurtimox Inhibits CXCR2+ Neutrophil Infiltration and Overcomes Pancreatic Cancer Resistance to Chemotherapy and Immunotherapy
2024-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.02.046
PMID:38492894
|
研究论文 | 本研究探讨了EHF在胰腺癌化疗和免疫治疗中的作用,以及Nifurtimox的治疗潜力 | 提出了EHF在CXCR2+中性粒细胞招募中的重要作用,及其对化疗和免疫治疗敏感性的影响 | 未提及具体的临床试验结果或长期效果评估 | 识别新的靶点和化合物以克服胰腺癌的治疗抵抗 | 采用小鼠模型及基因组和单细胞分析研究CXCR2+中性粒细胞招募 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因组单核苷酸多态性测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | KPC小鼠、Ehf敲除小鼠及人源化小鼠 | 基因组数据、细胞分型数据 | 多种小鼠模型,具体样本数量未披露 | NA | NA | NA | NA |
| 5752 | 2024-08-04 |
Radiofrequency radiation reshapes tumor immune microenvironment into antitumor phenotype in pulmonary metastatic melanoma by inducing active transformation of tumor-infiltrating CD8+ T and NK cells
2024-Jul, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01260-5
PMID:38538718
|
研究论文 | 这篇文章研究了射频辐射如何重塑肺部转移性黑色素瘤的肿瘤免疫微环境 | 该研究首次表明非侵入性射频辐射通过活化肿瘤浸润CD8+ T细胞和NK细胞,诱导抗肿瘤表型的重塑 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨非侵入性射频辐射对肿瘤进展和肿瘤免疫微环境表型的影响 | 建立了肺部转移性黑色素瘤的小鼠模型,以研究肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部转移性黑色素瘤 | RNA-seq | NA | RNA数据 | B16F10细胞注射的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5753 | 2024-08-05 |
Microcirculatory disturbance in acute liver injury is triggered by IFNγ-CD40 axis
2024-Jun-21, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-024-00387-w
PMID:38907339
|
研究论文 | 文章分析了急性肝损伤中IFNγ-CD40轴引发的微循环障碍的分子机制 | 首次揭示了IFNγ-CD40轴在急性肝损伤微循环障碍中的关键作用 | 研究仅限于单中心的回顾性分析,结果可能有限于特定人群和模型 | 探讨急性肝损伤的发病机制及其与微循环障碍的关系 | 急性肝损伤患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | Con A诱导的小鼠模型 | 血液样本、肝脏组织 | 120名急性肝损伤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5754 | 2024-08-05 |
Identifying Novel Proteins for Chronic Pain: Integration of Human Brain Proteomes and Genome-Wide Association Data
2024-Jun-21, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2024.104610
PMID:38909833
|
研究论文 | 本文旨在通过整合人脑蛋白组数据和全基因组关联数据来识别慢性疼痛的新蛋白质 | 提出了一种整合蛋白组和基因组数据的方法,以识别调节慢性疼痛风险的关键基因 | 研究可能受到样本选择和数据整合方法的限制 | 探讨遗传变异如何影响慢性疼痛的易感性 | 重点研究通过调节脑蛋白表达来影响慢性疼痛风险的关键基因 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序 | 整合蛋白组与基因组的数据分析 | 蛋白质组数据,转录组数据 | 387,649(GWAS数据),376和152(发现和确认的蛋白质组数据) | NA | NA | NA | NA |
| 5755 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of a progressive Rosai-Dorfman disease affecting the cerebral parenchyma: a case report
2024-05-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01794-z
PMID:38769536
|
case report | 报告了一例影响大脑实质的渐进性Rosai-Dorfman疾病的单细胞分析 | 首次通过单细胞RNA测序探讨神经性RDD的可能致病机制 | 该案例是基于单个患者,结果可能缺乏普遍性 | 探讨神经性Rosai-Dorfman疾病的致病机制 | 一例致命和皮质类固醇抗药性的神经性RDD病例 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织活检样本 | 1个患者的活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5756 | 2024-08-04 |
SCIMAP: A Python Toolkit for Integrated Spatial Analysis of Multiplexed Imaging Data
2024-May-03, ArXiv
PMID:38745703
|
研究论文 | SCIMAP是一个专为多重成像数据的集成空间分析而设计的Python工具包 | 开发了一个针对多重成像数据复杂性的专用工具包,提供高效的数据预处理、分析和可视化功能 | 目前尚缺乏专门针对多重成像数据的现成软件工具 | 旨在满足对多重成像数据复杂性的分析和视觉化需求 | 主要研究多达10^7个细胞及其表现出的空间关系 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 图像 | 多达10^7个细胞,测量多达100种生物分子 | NA | NA | NA | NA |
| 5757 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Epstein-Barr Virus-Associated Hemophagocytic Lymphohistiocytosis
2024-Apr-20, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-024-01701-0
PMID:38642164
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序表征EBV-HLH的免疫特征并与EBV-IM进行比较 | 首次详细探讨了IFNγ及其他细胞因子在EBV-HLH中的作用 | 样本数量较少,仅包括三名EBV-HLH患者 | 研究EBV感染引发的EBV-HLH的免疫反应特点 | 三名背景不同的EBV-HLH儿童患者及两名EBV-IM患者 | 数字病理学 | EB病毒相关淋巴组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名患者,包括三名EBV-HLH患者和两名EBV-IM患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5758 | 2024-08-04 |
SCIMAP: A Python Toolkit for Integrated Spatial Analysis of Multiplexed Imaging Data
2024, Journal of open source software
DOI:10.21105/joss.06604
PMID:38873023
|
研究论文 | 本文介绍了SCIMAP,一个用于多重成像数据的集成空间分析的Python工具包 | SCIMAP专门为多重成像数据的复杂性量身定制,提供了图像可视化与数据分析之间的无缝集成 | 目前尚未提及SCIMAP在特定研究领域的局限性 | 研究多重成像数据的空间关系及其统计显著性 | 主要研究不同细胞之间的空间关系 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 成像数据 | 涉及10个或更多细胞,测量多达100种生物分子 | NA | NA | NA | NA |
| 5759 | 2024-08-04 |
Absence of Slc39a14/Zip14 in mouse pancreatic beta cells results in hyperinsulinemia
2024-01-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00117.2023
PMID:38019082
|
研究论文 | 本研究探讨了SLC39A14/ZIP14在小鼠胰腺β细胞中在胰岛素分泌中的作用 | 揭示了ZIP14在胰腺β细胞内的锌转运与葡萄糖刺激下的胰岛素分泌之间的关系,提供了对2型糖尿病治疗的新见解 | 尚未充分研究ZIP14在β细胞中的具体功能,以及其在磁共振成像中的应用 | 探索ZIP14介导的细胞内锌转运在葡萄糖刺激的胰岛素分泌及代谢反应中的作用 | 小鼠胰腺β细胞特定的ZIP14敲除模型 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | KO模型 | 体内,体外和外切除实验数据 | 使用了β-KO小鼠及分离的胰岛 | NA | NA | NA | NA |
| 5760 | 2024-08-04 |
GJA4 expressed on cancer associated fibroblasts (CAFs)-A 'promoter' of the mesenchymal phenotype
2024-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102009
PMID:38833783
|
研究论文 | 研究发现癌相关成纤维细胞上的GJA4能够促进结直肠癌的间充质表型。 | 揭示了GJA4在肿瘤基质中的致恶机制和其与M2巨噬细胞的协同作用。 | 未详细探讨GJA4对肿瘤微环境中其他细胞类型的影响。 | 探讨GJA4在促进结直肠癌中的作用和机制。 | 结直肠癌(CRC)中的癌相关成纤维细胞(CAFs)。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞分析、空间转录组学、免疫荧光染色等 | NA | 组织样本 | 涉及的样本数量未指定 | NA | NA | NA | NA |