单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 5681 - 5700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5681 | 2024-08-05 |
Integrative profiling of untreated primary membranous nephropathy at the single-cell transcriptome level
2024-Jul, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfae168
PMID:39027416
|
研究论文 | 本研究在单细胞转录组水平上综合剖析了未治疗的原发性膜性肾病 | 首次利用单细胞RNA测序全面分析原发性膜性肾病患者的血液、肾脏和尿液样本，揭示了细胞成分和细胞间通信的变化 | 样本数量较少，仅包含五名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨原发性膜性肾病的发病机制与潜在的干预策略 | 五名经活检证实的原发性膜性肾病患者 | 数字病理学 | 原发性膜性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液、肾脏和尿液样本 | 五名患者的血液、肾脏和尿液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5682 | 2024-08-05 |
Selectively T cell phosphorylation activation of azvudine in the thymus tissue with immune protection effect
2024-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.03.032
PMID:39027259
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研究论文 | 本研究探讨了药物Azvudine在胸腺组织中选择性激活T细胞磷酸化的作用及其免疫保护效果 | 研究表明胸腺的免疫细胞对氟呱韦(FNC)表现出较强的代谢能力，并强调了磷酸化激酶在NA药物性质评估中的重要性 | 本研究主要在大鼠和树猕猴模型中进行，可能缺乏对人类患者的直接适用性 | 探讨Azvudine在处理COVID-19患者时的免疫保护机制 | 该研究的对象为大鼠和SARS-CoV-2树猕猴的胸腺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，蛋白质组学，平行反应监测（PRM） | NA | RNA，蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5683 | 2024-08-05 |
Foundation models in molecular biology
2024-Jun-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2024.240006
PMID:39027316
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研究论文 | 本文总结了基于分子生物学中各种数据的基础模型。 | 介绍了在分子生物学中发展的基础模型，并探讨了其潜在的研究方向。 | 未提及具体的局限性 | 探索和总结分子生物学中基础模型的发展情况。 | 聚焦于RNA序列、DNA序列、蛋白质序列、单细胞转录组和空间转录组数据。 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型 | 基础模型 | RNA序列数据、DNA序列数据、蛋白质序列数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5684 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics of gastric cancer brain metastasis reveals atypical vasculature strategies with supportive immune profiles
2024, Gastroenterology report
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/gastro/goae067
PMID:39027914
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌脑转移中不典型血管化策略和支持性免疫特征的空间转录组学。 | 本研究展示了肿瘤与免疫成分之间的空间互动，特别是不同的血管招募策略，提供了对GCBM的新的分子见解。 | 该研究的样本数量有限，仅研究了三例GCBM患者，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究胃癌脑转移患者中不同细胞成分之间的空间相互作用，尤其是血管系统与脑微环境的关系。 | 研究对象为三名胃癌脑转移患者的肿瘤、免疫和脑组织区域。 | 数字病理学 | 胃癌 | 数字空间分析 | NA | 转录组数据 | 三名胃癌脑转移患者的140个区域 | NA | NA | NA | NA |
| 5685 | 2024-08-05 |
scVIC: deep generative modeling of heterogeneity for scRNA-seq data
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae086
PMID:39027640
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研究论文 | 本文介绍了scVIC，一种用于单细胞RNA测序数据的深度生成建模算法 | scVIC创新性地同时处理生物异质性和批次效应，解决了传统方法的局限性 | 本文未提及具体的限制性因素 | 该研究旨在开发一种有效的方法以准确分析单细胞层面的异质性 | 研究对象为模拟和生物单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 变分推断 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了模拟和生物scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5686 | 2024-08-05 |
Advancing immunotherapy for melanoma: the critical role of single-cell analysis in identifying predictive biomarkers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1435187
PMID:39026661
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研究论文 | 该文章探讨了单细胞分析在黑色素瘤免疫治疗中的关键作用 | 首次强调了单细胞分析技术在预测黑色素瘤患者治疗反应的潜力 | 存在RNA-蛋白表达不一致和肿瘤异质性等挑战 | 研究黑色素瘤的免疫微环境及其对治疗反应的影响 | 探索黑色素瘤细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5687 | 2024-08-04 |
Coupled single-cell and bulk RNA-seq analysis reveals the engulfment role of endothelial cells in atherosclerosis
2024-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101250
PMID:39022128
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞在动脉粥样硬化中吞噬凋亡细胞碎片的角色 | 发现了内皮细胞中一种独特亚群以及SR-B1在吞噬作用中的重要性 | NA | 研究内皮细胞在动脉粥样硬化中对凋亡细胞碎片的吞噬作用 | 内皮细胞和凋亡细胞碎片 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | RNA数据 | 小鼠主动脉和人类主动脉的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5688 | 2024-08-05 |
Integrated single cell-RNA sequencing and Mendelian randomization for ischemic stroke and metabolic syndrome
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110240
PMID:39021802
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化，探讨代谢综合征与缺血性中风之间的分子机制和遗传关联 | 首次识别缺血性中风与代谢综合征之间的共同分子特征和遗传关联 | 未能深入探讨具体的代谢失调机制和环境因素的影响 | 理解代谢失调在缺血性中风中的作用 | 缺血性中风和代谢综合征之间的遗传关联 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | 随机森林, Lasso回归, XGBoost | 基因表达数据 | 涉及多个细胞群体的标准化数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5689 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity and key subsets of tissue-resident memory T cells in cervical cancer
2024-Jul-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00637-3
PMID:39014148
|
研究论文 | 本研究分析了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的细胞异质性及其关键亚群 | 首次揭示了宫颈癌中组织驻留记忆T细胞的异质性及其在免疫反应中的作用 | 研究仅基于有限的样本数量和组织来源，可能无法涵盖所有的细胞特性 | 探讨组织驻留记忆T细胞在宫颈癌中的异质性及其对癌症免疫的贡献 | 来自11个宫颈癌组织和5个正常宫颈组织的组织驻留记忆T细胞及非组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12945个组织驻留记忆T细胞和25627个非组织驻留记忆T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5690 | 2024-08-05 |
Establishing an oxidative stress mitochondria-related prognostic model in hepatocellular carcinoma based on multi-omics characteristics and machine learning computational framework
2024-Jul-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01147-1
PMID:39014263
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研究论文 | 本文建立了一种基于多组学特征和机器学习计算框架的氧化应激线粒体相关预后模型，用于肝细胞癌的预测 | 采用多种机器学习算法构建了一种包含26个基因的共识氧化应激线粒体相关标志物，并筛选出6个具有良好预后价值的基因 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能存在数据异质性和外部验证不足的问题 | 本文旨在探讨线粒体功能与氧化应激在肝细胞癌中的预后价值 | 研究对象为肝细胞癌患者的基因表达数据 | 机器学习 | 肝癌 | 基因表达分析，机器学习 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用来自TCGA、GEO和ICGC的HCC样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5691 | 2024-08-05 |
Single cell profiling to determine influence of wheeze and early-life viral infection on developmental programming of airway epithelium
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602506
PMID:39026695
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研究论文 | 本研究旨在表征哮喘儿童气道上皮的发育表型及其与早期呼吸道病毒感染的关系 | 研究发现哮喘儿童的气道上皮在发育过程中表现出异常分化和基底细胞活化，这为理解哮喘的生物学基础提供了新见解 | 该研究主要集中于特定年龄段的儿童，可能无法代表所有年龄组的情况 | 探索幼儿哮喘与早期RSV感染对气道上皮发育编程的影响 | 从不同组别的哮喘与非哮喘儿童中收集的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 幼儿哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 共计涉及来自四个相互排斥组的儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 5692 | 2024-08-05 |
T-distributed Stochastic Neighbor Network for unsupervised representation learning
2024-Jul-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2024.106520
PMID:39024709
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研究论文 | 本文提出了一种简单的端到端T-分布随机邻居网络（TsNet）用于无监督表示学习和聚类下游任务 | 引入了适应性连接分布学习模块和基于T-分布随机邻居嵌入的损失函数，显著提高了表示的区分度 | 未提及具体的局限性 | 探索如何从通用数据中提取有意义的结构信息 | 通用数据的聚类表示学习，包括向量、图像和表格数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | TsNet | 图像，文本 | 涉及真实单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的聚类 | NA | NA | NA | NA |
| 5693 | 2024-08-04 |
Applications of single-cell multi-omics in liver cancer
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101094
PMID:39022385
|
综述 | 本文探讨了单细胞多组学在肝癌研究中的应用。 | 强调通过整合多种单模态技术到单细胞分辨率的多组学方法中，推动个体化治疗的发展。 | 当前单细胞多组学在肝癌研究中的应用仍然有限。 | 旨在深入理解肝癌的生物学及其临床影响。 | 主要关注肝细胞癌（HCC）的细胞异质性及其治疗反应机制。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5694 | 2024-08-04 |
A bibliometric study of the intellectual base and global research hotspots for single-cell sequencing [2009-2022] in breast cancer
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33219
PMID:39022007
|
研究论文 | 该研究总结并量化了与乳腺癌单细胞测序相关的研究动态和趋势 | 提供了关于乳腺癌单细胞测序的全面和公正的研究状态报告 | 当前缺乏对研究结果的深入分析，未来需更多跨国合作 | 研究乳腺癌单细胞测序的研究动态和热点 | 与乳腺癌单细胞测序相关的研究文章和评论 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | 分析了583篇文章和评论 | NA | NA | NA | NA |
| 5695 | 2024-08-04 |
Comprehensive analysis and experimental verification reveal the molecular characteristics of EGLN3 in pan-cancer and its relationship with the proliferation and apoptosis of lung cancer
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33206
PMID:39021988
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研究论文 | 这篇文章探讨了EGLN3在各种癌症中的分子特征及其在肺癌增殖和细胞凋亡中的作用 | 本研究首次全面分析了EGLN3在泛癌症中的表达模式及其与免疫细胞浸润的关系 | 本研究的局限性在于未能充分阐明EGLN3在不同癌症类型中的特异性作用 | 研究EGLN3在癌症中的生物功能及其临床意义 | 研究对象为EGLN3及其与肺癌细胞增殖和凋亡的关系 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序, 免疫荧光 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5696 | 2024-08-05 |
Intense impact of IL-1β expressing inflammatory macrophages in acute aortic dissection
2024-06-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65931-3
PMID:38937528
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研究论文 | 本文探讨了IL-1β表达的炎症巨噬细胞对急性主动脉夹层的影响 | 首次识别了与急性主动脉夹层相关的新治疗靶点，尤其是IL-1β炎症巨噬细胞的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类的病理机制存在差异 | 识别与炎症细胞相关的新治疗靶点 | 人类急性主动脉夹层样本和小鼠急性主动脉夹层模型 | 数字病理学 | 急性主动脉夹层 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 组织样本 | 人类样本和小鼠模型的数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5697 | 2024-08-05 |
Farnesyltransferase inhibition overcomes oncogene-addicted non-small cell lung cancer adaptive resistance to targeted therapies
2024-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49360-4
PMID:38937474
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研究论文 | 本研究探讨了磷酸酰基转移酶抑制剂在克服非小细胞肺癌适应性抗药性方面的作用 | 该研究揭示了药物适应的共同路径和早期抗药性细胞的特征，并确定了FTI作为有效的治疗组合 | 研究中对分子事件的动力学和序列了解仍然不足 | 研究如何克服非小细胞肺癌对靶向疗法产生的适应性抗药性 | 包括EGFR、ALK、BRAF和KRAS突变的非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、实时细胞周期动态监测 | NA | 细胞 | 广泛的肿瘤细胞系，包括多种突变类型 | NA | NA | NA | NA |
| 5698 | 2024-08-05 |
Integrating Multi-omics Data for Alzheimer's Disease to Explore Its Biomarkers Via the Hypergraph-Regularized Joint Deep Semi-Non-Negative Matrix Factorization Algorithm
2024-Apr-15, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-024-02211-9
PMID:38619646
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研究论文 | 本文提出了一种超图正则化联合深度半非负矩阵分解算法，以集成与阿尔茨海默病相关的多组学数据 | 本文的创新点在于提出了一种新算法HR-JDSNMF，通过高阶关联挖掘和多层次数据分解来整合多组学数据 | 尽管该方法优于多种其他算法，但可能仍存在在更大规模的真实世界数据上验证结果的限制 | 本研究旨在探讨阿尔茨海默病的多组学生物标志物 | 研究对象包括与阿尔茨海默病相关的基因组学、转录组学和影像数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 正电子发射断层扫描（PET）、单核苷酸多态性（SNP）、基因表达 | 深度半非负矩阵分解（JDSNMF） | 基因组数据、转录组数据、影像数据 | 实验数据通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）收集，但具体样本大小未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 5699 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes in bladder cancer patients using single-cell sequencing and construction of a prognostic model
2024, American journal of clinical and experimental immunology
IF:1.4Q4
DOI:10.62347/VLDZ7581
PMID:39022795
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研究论文 | 本研究评估了膀胱癌患者肿瘤微环境中巨噬细胞相关基因的表达并构建了预后模型 | 使用单细胞测序技术识别并分析膀胱癌患者中的巨噬细胞相关基因。 | NA | 评估膀胱癌患者肿瘤微环境中巨噬细胞相关基因的表达并构建预后模型 | 膀胱癌患者的肿瘤微环境中的巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5700 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Cell Type-Specific Molecular Pathology in a 2VO Cerebral Ischemic Mouse Model
2024-Aug, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03755-4
PMID:38180614
|
研究论文 | 本研究利用小鼠双血管阻塞缺血模型分析了海马中特定细胞类型的分子病理 | 首次对2VO模型进行单细胞转录组分析，揭示了不同寻常的少突胶质前体细胞亚型 | 缺乏对其他脑区的细胞类型-specific基因表达的研究 | 研究缺血后海马中细胞类型特异性的分子病理 | 2VO小鼠模型中的海马细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组分析 | 2VO模型 | 细胞 | 27,069个细胞对应14种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |