单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 5641 - 5660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5641 | 2024-08-05 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-Jun, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
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研究论文 | 单细胞进化转录组学作为一种新兴工具，揭示了进化的分子和细胞机制 | 首次分析了发育过程中转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物体温沙形态的谱系和组织 | 没有提及具体的技术限制或实验范围 | 探索发育与细胞类型进化的分子机制 | 研究不同谱系和组织在整个发育过程中的转录组变化 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5642 | 2024-08-05 |
M2 Macrophages Guide Periosteal Stromal Cell Recruitment and Initiate Bone Injury Regeneration
2024-May-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12061205
PMID:38927412
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研究论文 | 这项研究创建了猪颅骨膜的详细细胞图谱，强调了细胞动态与相互作用在颅骨损伤修复中的重要性 | 该研究揭示了M2巨噬细胞在骨膜免疫反应调节和骨再生过程中的关键作用 | 研究仅限于猪颅骨膜，结果的广泛适用性需要进一步验证 | 探讨骨膜在骨损伤修复中的作用 | 猪颅骨膜 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5643 | 2024-08-05 |
scPLAN: a hierarchical computational framework for single transcriptomics data annotation, integration and cell-type label refinement
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae305
PMID:38935069
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研究论文 | scPLAN是一个用于单细胞RNA测序数据分析的层次计算框架 | scPLAN通过层次细胞类型树对未标记的scRNA-seq数据进行注释，系统性识别潜在的新细胞类型 | 现有的整合方法无法整合不同标注深度的数据集，也未能利用更复杂注释的数据集或新生物发现来提升旧数据的标注 | 提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和整合精确度 | 未标记的scRNA-seq数据和已有标注的数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 层次模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5644 | 2024-08-05 |
Transcriptomic Analyses Reveal the Effects of Walnut Kernel Cake on Adipose Deposition in Pigs
2024-May-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060667
PMID:38927603
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研究论文 | 该研究探讨了核桃仁饼对猪脂肪沉积的影响及其潜在的饲料替代价值 | 首次揭示了核桃仁饼在促进猪脂肪沉积和改善肉质方面的应用潜力 | 对核桃仁饼在猪饲料中的应用研究尚处于起步阶段，缺乏大规模的临床试验数据 | 旨在评估核桃仁饼作为猪饲料中的蛋白质替代品的效果 | 以大迪庆藏猪为研究对象 | 数字病理学 | NA | 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 大迪庆藏猪的样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 5645 | 2024-08-04 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-May-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
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研究论文 | 本文探讨了Shaziling猪睾丸内精原干细胞的发育模式 | 首次利用单细胞转录组技术生成了Shaziling猪睾丸发育的细胞图谱，并识别了新的标记基因 | 本研究仅涵盖了特定的猪种和有限的发展阶段 | 旨在揭示Shaziling猪精原干细胞的发育模式，以促进其繁育 | 研究对象为Shaziling猪的精原干细胞和睾丸组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 82,027个单细胞，来自9个Shaziling猪睾丸 | NA | NA | NA | NA |
| 5646 | 2024-08-05 |
Activation of CD14+ Monocytes via the IFN-γ Signaling Pathway Is Associated with Immune-Related Adverse Events in Hepatocellular Carcinoma Patients Receiving PD-1 Inhibition Combination Therapy
2024-May-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12061140
PMID:38927347
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研究论文 | 研究探讨了HCC患者接受PD-1抑制联合治疗后，CD14+单核细胞通过IFN-γ信号通路激活与免疫相关不良事件之间的关系 | 首次揭示了在PD-1抑制联合治疗中，IFN-γ信号通路诱导的单核细胞激活是HCC患者发生免疫相关不良事件的重要机制 | 该研究的样本量较小，仅包含71名HCC患者，可能影响结果的普遍适用性 | 探明HCC患者在PD-1抑制联合治疗中免疫相关不良事件的机制 | 71名接受PD-1抑制联合治疗的肝癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Olink蛋白组学 | NA | 血液样本 | 71名HCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5647 | 2024-08-05 |
Cystatin M/E ameliorates bone resorption through increasing osteoclastic cell estrogen influx
2024-May-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4313179/v1
PMID:38766009
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研究论文 | 本研究评估了Cystatin M/E在减缓骨吸收过程中的作用，特别是在多发性骨髓瘤模型中。 | 本研究首次显示Cystatin M/E能够增加骨吸收前体细胞的雌激素浓度，并抑制其成熟。 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床转化需要更多的人体数据支持。 | 探讨Cystatin M/E如何通过改善雌激素受体的表达来减少骨质流失。 | 使用多发性骨髓瘤及卵巢切除小鼠模型进行实验。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 蛋白质和mRNA数组 | 包含多发性骨髓瘤及卵巢切除小鼠模型的实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5648 | 2024-08-05 |
Beneficial mechanisms of dimethyl fumarate in autoimmune uveitis: insights from single-cell RNA sequencing
2024-Apr-29, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03096-6
PMID:38684986
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研究论文 | 该研究探讨了二甲基富马酸酯在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 通过单细胞RNA测序，揭示了DMF在自身免疫性葡萄膜炎中影响免疫细胞渗透的潜在机制 | 当前研究缺乏对DMF在自身免疫性葡萄膜炎中全面作用的深入探索 | 研究DMF在自身免疫性葡萄膜炎中的功能及其潜在机制 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及DMF处理的实验小鼠 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和DMF处理的实验小鼠的颈部引流淋巴结细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5649 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers related to angiogenesis in myocardial ischemia-reperfusion injury and prediction of potential drugs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300790
PMID:38935597
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研究论文 | 本研究识别与心肌缺血再灌注损伤相关的血管生成生物标志物并预测潜在药物 | 本研究首次识别Stat3、Rela和Ubb作为心肌缺血再灌注损伤与血管生成的关键基因 | 研究未提及样本的多样性及临床实验证据 | 探索心肌缺血再灌注损伤中的血管生成机制及相关生物标志物 | 心肌缺血再灌注损伤的生物标志物和潜在药物 | 数字病理 | 心血管疾病 | 测序 | WGCNA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5650 | 2024-08-04 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Unravels the Molecular Feature of Tumor-Associated Macrophage of Acute Myeloid Leukemia
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/5539065
PMID:38205232
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研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病及其相关的巨噬细胞分子特征 | 提出了一种巨噬细胞相关指数（MRI）来评估AML患者的预后和免疫特征 | 研究可能受到数据源和样本量的限制，可能需进一步验证 | 深入探索急性髓系白血病与巨噬细胞之间的关联 | 急性髓系白血病患者的基因表达谱和临床变量特征 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA测序 | LASSO和多变量Cox分析 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA, GEO和TARGET数据库的AML患者数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5651 | 2024-08-04 |
Prognostic and therapeutic insights into colorectal carcinoma through immunogenic cell death gene profiling
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17629
PMID:38938617
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研究论文 | 本研究探讨了免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用，并开发了新型的量化系统来预测患者的预后与免疫治疗效果 | 开发了一种新颖的免疫原性细胞死亡量化系统，并在肿瘤免疫微环境中构建了ICD评分 | 本研究侧重于结直肠癌的特定类型，可能无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用与预测患者治疗结果的潜力 | 研究对象为被诊断为结肠腺癌/直肠腺癌的1,184名患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 主成分分析 (PCA) | 基因组数据 | 1,184名结肠腺癌/直肠腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5652 | 2024-08-04 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Uncover and Elucidate GP73-Mediated Pro-Angiogenic Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0387
PMID:38939041
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研究论文 | 本研究展示了GP73介导的促血管生成调控网络在肝细胞癌中的作用 | 揭示了GP73与血管内皮细胞的细胞通信及其在肝细胞癌血管发育中的作用 | 研究可能未能涵盖所有肝细胞癌类型及其复杂性 | 探讨GP73在肝细胞癌中促血管生成的机制及其临床相关性 | 肝细胞癌患者的细胞及其在血管生成中的关键角色 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 细胞、血清 | 肝细胞癌患者的样本未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5653 | 2024-08-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies an aneuploidy-based gene signature to predict sensitivity of lung adenocarcinoma to traditional chemotherapy drugs and patients' prognosis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17545
PMID:38938612
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研究论文 | 该文章研究了一个基于基因签名的模型，以预测肺腺癌对传统化疗药物的敏感性和患者的预后 | 开发了一个五基因异倍体相关风险评分（ARS）模型，发现高表达的CKS1B促进肺腺癌细胞系的增殖、迁移和侵袭性表型 | 目前对异倍体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗能力的研究仍然有限 | 研究异倍体相关基因在肺腺癌中的潜在作用，以改善诊断和治疗方法 | 以肺腺癌（LUAD）细胞系为研究对象，筛选与异倍体相关的基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归与Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用公共数据库的肿瘤数据以及细胞实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 5654 | 2024-08-05 |
VISTA deficiency exerts anti-tumor effects in breast cancer through regulating macrophage polarization
2024-Jul-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112365
PMID:38820964
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research paper | 本研究首次揭示了VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞的影响 | 揭示了VISTA通过STAT通路调节巨噬细胞极化，进而影响肿瘤生长 | 未涉及VISTA在其他类型肿瘤中的作用 | 探讨VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响 | 乳腺癌中的巨噬细胞 | NA | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | NA | 体内实验中使用了VISTA缺失小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 5655 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the differentiation of bone marrow haematopoietic cells in patients with paroxysmal nocturnal haemoglobinuria
2024-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1671
PMID:38924689
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5656 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
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研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少，仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本（四个琼脂样透明带患者和四个健康供体） | NA | NA | NA | NA |
| 5657 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5658 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系，并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析（GSEA），单细胞转录组分析，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 使用了多种数据集，包括TCGA、GTEx和CGGA | NA | NA | NA | NA |
| 5659 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5660 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |