单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 5641 - 5660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5641 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals reduced intercellular adhesion molecule crosstalk between activated hepatic stellate cells and neutrophils alleviating liver fibrosis in hepatitis B virus transgenic mice post menstrual blood-derived mesenchymal stem cell transplantation
2024-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.654
PMID:39040848
|
研究论文 | 该研究探讨了月经血来源的间充质干细胞对乙型肝炎病毒转基因小鼠肝纤维化的治疗作用 | 通过单细胞RNA测序，揭示了激活的肝星状细胞与中性粒细胞之间的细胞间黏附分子相互作用减少的机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类的直接验证 | 揭示月经血来源的间充质干细胞在肝纤维化治疗中的作用机制 | 研究对象为乙型肝炎病毒转基因小鼠及其肝组织中的细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 乙型肝炎病毒转基因小鼠模型，具体样本量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 5642 | 2024-08-05 |
Amphiregulin-producing TH2 cells facilitate esophageal fibrosis of eosinophilic esophagitis
2024-Aug, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2024.100287
PMID:39040657
|
研究论文 | 这篇文章探讨了TH2细胞产生的amphiregulin在嗜酸粒细胞食管炎中的作用，导致食管纤维化。 | 本研究首次揭示了TH2细胞产生的amphiregulin在食管纤维化中的作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | 本研究主要基于小鼠模型及少量人类样本，可能影响普适性 | 阐明嗜酸粒细胞食管炎中食管纤维化的细胞和分子机制 | 研究对象为嗜酸粒细胞食管炎模型小鼠及其对应的人类患者样本 | 数字病理学 | 嗜酸粒细胞食管炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | 小鼠模型 | 组织活检样本 | 小鼠模型与少量人类患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5643 | 2024-08-04 |
Exploring ABHD5 as a Lipid-Related Biomarker in Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Integrating Machine Learning, Bioinformatics, and In Vitro Experiments
2024-Jul-24, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02107-1
PMID:39046603
|
研究论文 | 本研究探讨了ABHD5作为特发性肺纤维化(IPF)的脂质相关生物标志物的潜力 | 通过整合机器学习、生物信息学和体外实验，提出了ABHD5作为IPF新生物标志物的概念 | 研究可能存在样本量不足或特定数据集选择偏倚的问题 | 旨在探索IPF的脂质相关生物标志物及其机制 | 涉及特发性肺纤维化相关的数据集与细胞实验 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 机器学习、单细胞测序，细胞计数试剂盒-8，5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 涉及多个数据集和细胞实验，具体样本数量未提供 | NA | NA | NA | NA |
| 5644 | 2024-08-04 |
Key factor screening in mouse NASH model using single-cell sequencing combined with machine learning
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33597
PMID:39040415
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习相结合，识别与非酒精性脂肪肝炎（NASH）进展密切相关的基因 | 结合单细胞RNA测序和深度学习技术，揭示了NASH相关基因与免疫细胞之间的关系 | NA | 识别与NASH进展相关的关键基因 | 小鼠NASH模型中的细胞群体和基因 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝炎 | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络 | 基因数据 | 比较Chow组和NASH组的细胞群体数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5645 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on drug response genes to predict prognosis and therapeutic response in ovarian cancer
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33367
PMID:39040239
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和大规模RNA测序识别出可预测卵巢癌预后和治疗反应的药物反应基因特征 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序，构建了高灵敏度和特异性的预后模型 | 未提及具体样本大小和多样性，可能影响模型的普适性 | 探索卵巢癌的可靠生物标志物，以预测药物反应和指导治疗选择 | 卵巢癌患者和其基因表达数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5646 | 2024-08-04 |
PARE: A framework for removal of confounding effects from any distance-based dimension reduction method
2024-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012241
PMID:38985831
|
研究论文 | 本研究介绍了一种去除混杂效应的PARE框架，可应用于任何基于距离的降维方法 | PARE框架允许从任何距离基础的降维方法中去除混杂效应，扩展了降维方法的应用 | 暂无明显的限制提及 | 研究目标是开发一种去除混杂效应的框架，以提高生物学模式的可视化 | 研究对象包括基因组和神经影像数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 高维数据 | 涉及单细胞测序数据和神经影像测量的多种样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5647 | 2024-08-05 |
Enhanced abscopal anti-tumor response via a triple combination of thermal ablation, IL-21, and PD-1 inhibition therapy
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03718-1
PMID:38833177
|
研究论文 | 该研究探讨了热消融、IL-21和PD-1抑制治疗的三重组合在肿瘤治疗中的作用 | 研究首次探讨了热消融、IL-21和抗PD-1单克隆抗体的联合疗法对肿瘤的抗肿瘤效果 | 研究未提供不同治疗组的外部验证和临床试验数据 | 研究三重组合疗法在转移性癌症治疗中的潜力 | 探讨热消融对肿瘤浸润淋巴细胞中IL-21R表达的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5648 | 2024-08-05 |
SIRPG expression positively associates with an inflamed tumor microenvironment and response to PD-1 blockade
2024-Jun-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03737-y
PMID:38833156
|
研究论文 | 本研究旨在探讨信号调节蛋白伽玛（SIRPG）与肿瘤免疫微环境表型及T细胞介导的适应性抗肿瘤免疫之间的关系 | 高SIRPG表达与癌症中的发炎免疫表型及对PD-1阻断的良好反应相关，暗示其作为预测生物标志物和新的免疫治疗靶点的潜力 | 缺乏对不同癌症类型中SIRPG功能机制的深入研究 | 探讨SIRPG与肿瘤免疫微环境及PD-1阻断反应的关系 | 对157名非小细胞肺癌和黑色素瘤患者进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 157名患者的临床数据和103,599个细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5649 | 2024-08-04 |
The neuroblastoma tumor microenvironment: From an in-depth characterization towards novel therapies
2024-Jun, EJC paediatric oncology
DOI:10.1016/j.ejcped.2024.100161
PMID:39036648
|
综述 | 本文总结了神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征及其针对新疗法的研究进展 | 提出通过深入理解肿瘤微环境以识别新的疗法组合，特别是针对免疫逃逸和药物耐受性的组合策略 | 本文主要是对已有研究的总结，缺乏新的实验数据 | 探讨神经母细胞瘤肿瘤微环境的特征以及靶向该微环境的新疗法 | 神经母细胞瘤患者的肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞群体 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | 体内和体外实验模型 | 文本 | 众多相关临床试验和研究数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5650 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq of the rare virosphere reveals the native hosts of giant viruses in the marine environment
2024-Jun, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-024-01669-y
PMID:38605173
|
研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序方法，揭示了海洋环境中巨病毒的原生宿主 | 首次通过单细胞RNA测序技术配对活跃的巨病毒与其原生原生生物宿主 | 未能全面覆盖所有可能的宿主和巨病毒之间的相互作用 | 研究巨病毒的原生宿主及其生态重要性 | 研究在诱导的藻类 bloom 中收集的样本中，与巨病毒感染相关的宿主细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 在多个宿主谱系中检测到数百个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5651 | 2024-08-05 |
The Efficacy of Imiquimod-Induced Psoriasis Model on Murine Cells
2024-Jun, Cureus
DOI:10.7759/cureus.62914
PMID:39040747
|
研究论文 | 本研究集中于使用Imiquimod诱导小鼠皮肤细胞的类银屑病模型的有效性 | 本研究通过单细胞RNA测序和轨迹分析首次阐明了IMQ诱导的细胞与对照细胞在分化模式上的显著差异 | 研究指出IMQ诱导的细胞与银屑病细胞之间的差异因素仍需进一步探索 | 研究IMQ在诱导类银屑病模型中的有效性 | 小鼠的皮肤细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5652 | 2024-08-05 |
Matrix Reordering for Noisy Disordered Matrices: Optimality and Computationally Efficient Algorithms
2024-Jan, IEEE transactions on information theory
IF:2.2Q3
DOI:10.1109/tit.2023.3305538
PMID:39036782
|
研究论文 | 本文研究了基于噪声无序单调Toeplitz矩阵模型的矩阵重排序问题 | 提出了一种新的多项式时间自适应排序算法，并保证性能改进 | 分析的多项式时间算法的计算复杂度较高，存在一定的局限性 | 探讨矩阵重排序在单细胞生物学和宏基因组学中的应用 | 聚焦于噪声无序的单调Toeplitz矩阵模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 文本 | 两个真实的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5653 | 2024-08-04 |
CAbiNet: joint clustering and visualization of cells and genes for single-cell transcriptomics
2024-Jul-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae480
PMID:38850160
|
研究论文 | 该文章介绍了一种用于单细胞转录组学数据的聚类和可视化的新方法 | 提出了基于网络的对应分析双聚类方法CAbiNet，该方法高效地进行细胞及其标记基因的共同聚类和可视化 | 文章未提及具体的限制 | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据的聚类和可视化效果 | 研究对象是单细胞RNA测序数据中的细胞及其标记基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5654 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing, spatial transcriptome ad periodontitis: Rethink pathogenesis and classification
2024-07, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.14761
PMID:37794757
|
综述 | 本综述阐明了单细胞RNA测序和空间转录组学在牙周炎中的应用 | 探讨了细胞群体和基因特征与牙周炎病因的相关性，带来了新的诊断思路 | 目前尚未确定与牙周炎相关的具体细胞或基因特征 | 研究单细胞测序和空间转录组学在牙周炎病理学和分类中的应用 | 人类的牙周炎相关研究 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 (ST) | NA | 文献 | 22篇涉及人类的研究论文 | NA | NA | NA | NA |
| 5655 | 2024-08-05 |
CTCF mutation at R567 causes developmental disorders via 3D genome rearrangement and abnormal neurodevelopment
2024-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49684-1
PMID:38951485
|
研究论文 | 本文探讨了CTCF R567W突变对发育紊乱的影响及其机制 | 研究首次揭示了CTCF突变如何通过3D基因组重构影响神经发育 | 仅探索了特定突变的影响，缺乏对其他CTCF突变的广泛分析 | 阐明CTCF突变对人类神经发育障碍的影响及其潜在机制 | 小鼠模型和人类胚胎干细胞衍生的皮层类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠及其胚胎干细胞衍生的皮层类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 5656 | 2024-08-05 |
[Analysis of correlation between high expression of nucleoporin 85 (NUP85) and immune cell infiltration in hepatocellular carcinoma]
2024-Jun, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:38952090
|
研究论文 | 该研究探讨了核孔蛋白85（NUP85）在肝细胞癌中的表达及其与免疫反应的相关性 | 首次系统分析了NUP85在HCC中高表达与免疫细胞浸润的相关性，并提出其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 本研究的局限性在于使用的数据库和分析方法可能存在的数据偏差 | 研究NUP85在肝细胞癌中的意义及其与免疫反应的关系 | 肝细胞癌（HCC）样本中的NUP85表达及其相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，基因表达分析 | NA | mRNA和蛋白数据 | 涉及HCC样本的突变率为19% | NA | NA | NA | NA |
| 5657 | 2024-08-05 |
Cell type evolution reconstruction across species through cell phylogenies of single-cell RNA sequencing data
2024-Feb, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02281-9
PMID:38182680
|
研究论文 | 该论文探讨了细胞类型的起源和进化，利用单细胞RNA测序数据重建细胞谱系 | 首次通过显式的谱系学方法应用于单细胞数据，使用主成分作为谱系特征以构建细胞谱系 | 谱系构建依赖于现有的数据，可能受限于样本的多样性和数量 | 研究细胞类型的进化及其在不同物种之间的比较 | 来自五种远缘相关哺乳动物的眼细胞的比较单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主成分分析 | 基因表达数据 | 五种哺乳动物的眼细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5658 | 2024-08-05 |
O-GlcNAc transferase regulates collagen deposition and fibrosis resolution in idiopathic pulmonary fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1387197
PMID:38665916
|
研究论文 | 本研究探讨了O-GlcNAc转移酶在特发性肺纤维化中的作用。 | 这项研究首次揭示了OGT在特发性肺纤维化中的调节作用及其在胶原沉积和纤维化消退中的关键角色。 | 尚未在临床试验中验证OGT抑制对纤维化分辨率的影响。 | 研究OGT在特发性肺纤维化中的作用及其对胶原沉积和纤维化消退的影响。 | 本研究的对象包括来自特发性肺纤维化及非特发性肺纤维化捐赠者的人肺组织和孤立成纤维细胞。 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 实验模型 | 组织样本和细胞样本 | 未提供具体样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 5659 | 2024-08-05 |
LACC1 deficiency leading to juvenile arthritis and anemia
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110290
PMID:38944365
|
研究论文 | 该研究描述了由LACC1缺失引起的青少年关节炎和贫血的病例 | 首次识别了两种新的LACC1基因变体，并评估了其对患者炎症标志物的影响及治疗效果 | 仅基于单例患者的临床数据，样本量较小，需进一步研究验证 | 探讨LACC1突变对青少年关节炎和贫血的影响及其潜在治疗方案 | 一名因LACC1的复合杂合变异而出现多关节炎和贫血的患者 | 数字病理学 | 青少年关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和血清细胞因子水平 | 1名患者和9名对照患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5660 | 2024-08-05 |
NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110278
PMID:38878806
|
研究论文 | 本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变 | 研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解 | 研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证 | 探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变 | 一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征 | 数字病理学 | NA | 生物信息学分析，F-FDG PET/CT | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者 | NA | NA | NA | NA |