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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2024-02-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad173
PMID:37772937
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了脊索瘤中与内质网应激相关的癌症相关成纤维细胞亚群及其与肿瘤进展的关系 | 首次在脊索瘤中鉴定出表达缺氧基因且功能富集于内质网应激的CAF亚群,并证明其与肿瘤细胞的空间邻近关系和临床预后价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 解析脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤组织和髓核组织样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 免疫荧光图像 | 单细胞测序: 6个肿瘤样本(3原发+3复发)+3个对照样本, 共72,097个细胞; 批量RNA测序: 126例患者; QIF验证: 105例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重定量免疫荧光 | NA | NA |
| 542 | 2025-10-06 |
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445
PMID:39366532
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证探讨SNRPB2在泛癌景观中的作用及其在肝细胞癌中的功能 | 首次系统研究SNRPB2在多种癌症类型中的表达模式及其与预后的关联,并通过实验验证其在肝癌细胞增殖和迁移中的功能 | 需要进一步探索其潜在机制和临床治疗潜力 | 研究SNRPB2在癌症发生发展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 多种癌症类型和肝细胞癌细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析,基因表达分析,基因组和表观基因组分析,基因集富集分析,免疫细胞浸润评估,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,基因组数据,表观基因组数据,单细胞测序数据 | 来自TCGA、CPTAC和GEO等多个公共数据库的多种癌症样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 543 | 2025-10-06 |
Elucidating ferroptosis mechanisms in heart failure through transcriptomics, single-cell sequencing, and experimental validation
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111416
PMID:39293745
|
研究论文 | 通过转录组学、单细胞测序和实验验证阐明心力衰竭中铁死亡的机制 | 首次系统识别并验证了心力衰竭中铁死亡相关基因在不同细胞类型中的差异表达模式 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步功能验证 | 探索铁死亡在心力衰竭发病机制中的作用 | 心力衰竭患者数据、心力衰竭细胞模型和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞测序, LASSO回归, SVM-RFE机器学习 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | GEO数据库中心力衰竭数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 544 | 2025-10-06 |
A cross-disease resource of living human microglia identifies disease-enriched subsets and tool compounds recapitulating microglial states
2024-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01764-7
PMID:39406950
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类小胶质细胞异质性,识别疾病相关亚群并验证化合物对小胶质细胞状态的影响 | 构建了跨疾病的人类小胶质细胞资源库,识别了疾病富集亚群,并发现能重现在体状态的化合物 | 样本来源仅限于已获得的74名捐赠者,尚未涵盖所有神经系统疾病类型 | 解析人类小胶质细胞异质性及其在神经系统疾病中的作用 | 来自74名捐赠者的215,680个活体人类小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, RNAscope-免疫荧光, MERFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 215,680个小胶质细胞来自74名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-06 |
Identification of transcriptional signature change and critical transcription factors involved during the differentiation of mouse trophoblast stem cell into maternal blood vessel associated trophoblast giant cell
2024-11, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111359
PMID:39179089
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析小鼠滋养层干细胞分化为滋养层巨细胞过程中的转录特征变化,并识别关键转录因子 | 首次发现体外分化的滋养层巨细胞与体内母体血管相关滋养层巨细胞亚型的相似性,并鉴定出ZMAT1、EGR1和MITF等关键转录因子 | 研究仅基于小鼠模型,人类胎盘可能存在差异;体外分化系统可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究滋养层干细胞分化为滋养层巨细胞的分子机制及其与胎盘功能的关系 | 小鼠滋养层干细胞和分化的滋养层巨细胞 | 发育生物学 | 胎盘功能相关疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠滋养层干细胞和分化细胞 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-10-06 |
A prognostic biomarker of disulfidptosis constructed by machine learning framework model as potential reporters of pancreatic adenocarcinoma
2024-11, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111371
PMID:39209222
|
研究论文 | 通过机器学习框架构建二硫死亡相关预后生物标志物,探索其在胰腺腺癌中的免疫浸润和治疗潜力 | 首次将新发现的细胞死亡方式二硫死亡与胰腺腺癌预后模型结合,并验证MET基因在二硫死亡中的作用机制 | 样本量较小(仅16个单细胞样本),需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建胰腺腺癌的二硫死亡相关预后生物标志物并探索其临床意义 | 胰腺腺癌患者样本和细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,LASSO回归,WGCNA分析,细胞实验 | LASSO回归,机器学习框架模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 16个PAAD样本(GSE154778数据集)+ TCGA-PAAD数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-06 |
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619910
PMID:39554174
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研究论文 | 本研究通过细胞因子混合物诱导人THP-1巨噬细胞重编程,模拟阿尔茨海默病相关的分子和细胞表型 | 开发了一种通过细胞因子混合物(IL4/CSF1/IL34/TGFβ)实现人巨噬细胞向AD相关表型重编程的新方法 | 研究仅限于体外THP-1巨噬细胞模型,未在原发性人类细胞或体内模型中验证 | 探索细胞因子诱导人巨噬细胞重编程为阿尔茨海默病相关表型的能力 | 人THP-1巨噬细胞系 | 细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,功能测定 | NA | 基因表达数据,功能测定数据 | THP-1巨噬细胞培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-06 |
Multi-omics integration reveals the oncogenic role of eccDNAs in diffuse large B-cell lymphoma through STING signalling
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1815
PMID:39183480
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析揭示了DNA损伤诱导的eccDNAs通过cGAS非依赖性方式激活STING信号通路在弥漫大B细胞淋巴瘤中的致癌作用 | 首次报道eccDNAs在DLBCL中的表达谱及其致癌功能,发现DNA损伤诱导的eccDNAs通过cGAS非依赖性方式激活STING信号通路的新机制 | 未明确说明样本数量和研究人群特征,缺乏临床转化验证数据 | 探究eccDNAs在弥漫大B细胞淋巴瘤中的表达特征、功能机制及治疗意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞、动物模型、GEO数据库 | 多组学整合分析 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 环状DNA测序,原子力显微镜,CCK-8,单细胞RNA测序,化疗药物处理 | 动物模型 | 基因组数据,转录组数据,显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,环状DNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-06 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
|
研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和表观遗传图谱,揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 首次系统揭示胸腺细胞发育中年龄相关的转录和表观遗传差异,并利用CRISPR扰动结合单细胞RNA测序发现保守的转录调控因子 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 单细胞基因组学 | 免疫系统发育 | 单细胞RNA测序, CRISPR扰动, 表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 新生和成年小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 550 | 2025-10-06 |
High-throughput RNA isoform sequencing using programmed cDNA concatenation
2024-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01815-7
PMID:37291427
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研究论文 | 介绍了一种通过程序化cDNA串联实现高通量RNA异构体测序的新方法MAS-ISO-seq | 通过程序化串联cDNA分子,将长读长测序通量提高15倍以上,单次运行可获得近4000万条cDNA读长 | NA | 开发高通量全长RNA异构体测序技术 | 肿瘤浸润T细胞的转录组 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,长读长测序 | NA | RNA序列数据 | NA | PacBio | 长读长测序,单细胞RNA测序 | Sequel IIe | PacBio Sequel IIe测序仪 |
| 551 | 2025-10-06 |
Characterization of mismatch-repair/microsatellite instability-discordant endometrial cancers
2024-02-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35030
PMID:37751191
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研究论文 | 本研究评估了子宫内膜癌中错配修复/微卫星不稳定性检测结果不一致的情况及其临床意义 | 首次系统描述了MMR/MSI检测结果不一致的子宫内膜癌特征,发现亚克隆/异质性MMR表达与高复发率和肿瘤侵袭性相关 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 评估子宫内膜癌中MMR/MSI检测一致性及相关因素 | 666例子宫内膜癌患者样本 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组织化学, 微卫星不稳定性检测, MLH1甲基化分析, 全转录组分析, 二代测序 | NA | 组织样本, 基因表达数据, 甲基化数据 | 666例子宫内膜癌样本 | NA | 数字空间转录组学, 二代测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-06 |
A Network Medical Framework based on Inflammatory Genes to Identify Drug Candidates for Abdominal Aortic Aneurysms
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
|
研究论文 | 本研究基于炎症基因构建网络医学框架,识别腹主动脉瘤的潜在药物候选物 | 整合单细胞RNA测序、RNA测序和网络医学数据,开发基于网络的邻近性测量方法识别靶向SLC2A3的潜在药物 | 研究主要依赖计算模拟,缺乏实验验证 | 识别腹主动脉瘤的关键靶点和潜在治疗药物化合物 | 腹主动脉瘤和非动脉瘤对照样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,药物-靶点相互作用分析,蛋白质-蛋白质相互作用分析,分子动力学模拟 | 网络医学框架 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,药物靶点数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 553 | 2025-10-06 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次在单细胞水平结合scRNA-seq和DIA蛋白质组学识别脓毒症预后相关活性蛋白,并利用Viper算法估计蛋白质活性 | 样本量相对有限(脓毒症患者53例,对照组16例),需要在更大队列中验证 | 通过多组学分析揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学,DIA蛋白质组学 | Viper算法,基因集变异分析,细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 脓毒症患者53例(NS组26例,SV组27例),健康对照16例,共分析34,228个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了LRRc17通过调节心脏成纤维细胞铁死亡来调控心肌梗死后心肌纤维化的机制 | 首次发现LRRc17基因在心肌梗死后通过调节心脏成纤维细胞铁死亡影响心室重构 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 阐明心肌梗死后纤维化的发病机制并寻找治疗靶点 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, Western blotting, 荧光染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 基于GEO数据库中的GSE153485和GSE210159数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-06 |
Antitumor efficacy and potential mechanism of FAP-targeted radioligand therapy combined with immune checkpoint blockade
2024-06-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01853-w
PMID:38825657
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研究论文 | 本研究评估了FAP靶向放射性配体疗法LNC1004联合免疫检查点阻断剂的抗肿瘤疗效及机制 | 首次证明FAP靶向放射性核素治疗可诱导PD-L1上调,并与抗PD-L1免疫疗法产生协同抗肿瘤效应,实现肿瘤完全消除 | 临床研究为初步阶段,样本量有限,需要更大规模临床试验验证 | 探索FAP靶向放射性配体疗法联合免疫检查点阻断剂的抗肿瘤疗效及作用机制 | MC38/NIH3T3-FAP和CT26/NIH3T3-FAP肿瘤异种移植小鼠模型及难治性癌症患者 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),TCR测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,免疫组化图像,临床数据 | 小鼠肿瘤模型和难治性癌症患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-06 |
Macrophages in cardiovascular diseases: molecular mechanisms and therapeutic targets
2024-05-31, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01840-1
PMID:38816371
|
综述 | 系统总结巨噬细胞在心血管疾病中的表型多样性、功能可塑性及其调控机制,并探讨单细胞测序技术带来的新见解 | 整合单细胞测序技术揭示的巨噬细胞异质性和细胞互作机制,聚焦不同心血管疾病背景下炎症与纤维化的关系 | 主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 | 探讨巨噬细胞在心血管疾病中的分子机制和潜在治疗靶点 | 巨噬细胞在心血管疾病中的表型和功能 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-06 |
Targeting BCL9/BCL9L enhances antigen presentation by promoting conventional type 1 dendritic cell (cDC1) activation and tumor infiltration
2024-05-29, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01838-9
PMID:38811552
|
研究论文 | 本研究揭示靶向BCL9/BCL9L通过促进cDC1树突状细胞活化和肿瘤浸润来增强抗原呈递 | 首次阐明BCL9/BCL9L通过XCL1-XCR1轴和NF-κB/IRF1信号通路调控cDC1功能的新机制 | 未明确BCL9/BCL9L在其它免疫细胞亚群中的作用 | 探究靶向BCL9/BCL9L对肿瘤抗原呈递和抗肿瘤免疫的影响 | 常规1型树突状细胞(cDC1)、CD8 T细胞、肿瘤微环境 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组测序、基因敲除、药理学抑制 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2025-10-06 |
Progression from ductal carcinoma in situ to invasive breast cancer: molecular features and clinical significance
2024-04-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01779-3
PMID:38570490
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综述 | 本文系统回顾了乳腺导管原位癌向浸润性乳腺癌进展的分子特征、研究工具及临床管理进展 | 全面整合DCIS向IDC转化的分子机制,系统总结单细胞测序、空间转录组学等新技术在研究中的应用 | 作为综述文章,未包含原始研究数据,主要基于现有文献进行归纳分析 | 深入理解DCIS的生物学特性及其向IDC转化的分子路径,为临床个性化治疗提供依据 | 乳腺导管原位癌(DCIS)和浸润性导管癌(IDC) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 559 | 2025-10-06 |
Characterization of Immunosuppressive Myeloid Cells in Merkel Cell Carcinoma: Correlation with Resistance to PD-1 Pathway Blockade
2024-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-1957
PMID:37851052
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和多重免疫组化分析,揭示了默克尔细胞癌中免疫抑制性髓系细胞的特性及其与PD-1阻断治疗耐药性的关联 | 首次在默克尔细胞癌中系统鉴定肿瘤相关巨噬细胞为主要的髓系细胞成分,并发现其表达免疫抑制基因特征和可靶向的免疫检查点分子 | 样本量相对有限,空间相互作用分析未发现与治疗反应的明确关联 | 探究默克尔细胞癌中髓系细胞的免疫抑制特性及其对PD-1阻断治疗反应的影响 | 默克尔细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 默克尔细胞癌 | 单细胞转录组学, 多重免疫组化染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 9例患者用于单细胞分析,54例患者用于免疫组化分析 | NA | 单细胞RNA测序, 空间分析 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-06 |
Exploring the Immune-related Molecular Mechanisms Underlying the Comorbidity of Temporal Lobe Epilepsy and Major Depressive Disorder through Integrated Data Set Analysis
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
|
研究论文 | 通过整合数据分析探索颞叶癫痫与重度抑郁症共病的免疫相关分子机制 | 首次系统识别TLE和MDD共病的共享基因模块,结合机器学习模型筛选诊断标志物,并通过单细胞测序验证基因的细胞类型表达 | 基于公共数据库的回顾性分析,样本来源有限,需要进一步实验验证 | 阐明TLE与MDD共病的分子病理机制并探索诊断治疗应用 | 颞叶癫痫和重度抑郁症患者的脑组织基因表达数据 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 基因表达分析,单细胞测序 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |