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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-05 |
Restoring Mitochondrial Quantity and Quality to Reverse Warburg Effect and Drive Tumor Differentiation
2024-Dec-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494402/v1
PMID:39711563
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研究论文 | 本研究通过联合使用视黄酸和线粒体解偶联剂恢复肿瘤线粒体功能,诱导神经母细胞瘤分化并抑制增殖 | 首次提出通过协同增强线粒体生物合成和呼吸作用来恢复肿瘤线粒体数量和质量,从而逆转Warburg效应并驱动肿瘤分化 | 研究主要聚焦于神经母细胞瘤模型,在其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探索通过恢复线粒体功能诱导肿瘤分化的治疗策略 | 神经母细胞瘤细胞和原位异种移植模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,U-C-葡萄糖/谷氨酰胺同位素示踪,线粒体功能分析 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 542 | 2025-10-05 |
Cross-species single-cell RNA sequencing reveals divergent phenotypes and activation states of adaptive immunity in human carotid and experimental murine atherosclerosis
2024-11-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae154
PMID:39041203
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研究论文 | 通过跨物种单细胞RNA测序比较人类颈动脉和实验性小鼠动脉粥样硬化的免疫细胞组成和激活状态 | 首次通过整合人类和小鼠单细胞RNA测序数据揭示物种间免疫细胞组成的显著差异,挑战标准小鼠模型的转化价值 | 研究主要关注颈动脉粥样硬化,结果可能不适用于其他血管部位;样本数量相对有限 | 比较人类和小鼠动脉粥样硬化中适应性免疫细胞的表型和激活状态差异 | 人类颈动脉粥样硬化斑块和小鼠动脉粥样硬化血管组织中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,多色流式细胞术 | 生物信息学整合分析 | 单细胞转录组数据 | 人类颈动脉斑块样本(验证队列43例患者)+7个小鼠单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 543 | 2025-10-05 |
Regulation of Ptbp1-controlled alternative splicing of pyruvate kinase muscle by liver kinase B1 governs vascular smooth muscle cell plasticity in vivo
2024-11-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae187
PMID:39189621
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研究论文 | 本研究揭示了肝激酶B1通过调控Ptbp1依赖的丙酮酸激酶肌肉亚型选择性剪接来控制血管平滑肌细胞可塑性的机制 | 首次发现Lkb1通过调控Ptbp1-PKM选择性剪接轴控制血管平滑肌细胞命运决定,并证明PKM2激活剂可逆转血管病变 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究控制血管平滑肌细胞可塑性的关键分子机制 | 血管平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据,影像数据 | Lkb1flox/flox;Myh11-Cre/ERT2基因工程小鼠和人类主动脉瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 544 | 2025-10-05 |
Proximity-dependent labeling identifies dendritic cells that drive the tumor-specific CD4+ T cell response
2024-10-04, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8843
PMID:39365874
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研究论文 | 本研究通过邻近标记技术识别了驱动肿瘤特异性CD4+ T细胞反应的树突状细胞 | 首次使用LIPSTIC单细胞转录组学技术追踪树突状细胞与T细胞的相互作用,揭示了肿瘤引流淋巴结和肿瘤微环境中少数超活化树突状细胞的关键作用 | 未明确说明样本规模和研究模型的具体限制 | 探究树突状细胞在肿瘤免疫应答中的具体作用机制 | 树突状细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 肿瘤免疫 | LIPSTIC邻近标记、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies interferon-inducible monocytes/macrophages as a cellular target for mitigating the progression of abdominal aortic aneurysm and rupture risk
2024-09-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae117
PMID:38836630
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞是减轻腹主动脉瘤进展和破裂风险的细胞靶点 | 首次通过单细胞RNA测序在腹主动脉瘤中发现独特的干扰素诱导性单核细胞/巨噬细胞亚群,并揭示其在疾病进展中的关键作用 | 研究基于AngII灌注的ApoE-/-小鼠模型,人类样本验证尚需进一步研究 | 探索腹主动脉瘤发展和进展中涉及的细胞类型和信号通路 | AngII灌注的ApoE-/-小鼠腹主动脉标本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同病理特征的腹主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-10-05 |
Description of Bacterial RNA Transcripts Detected in Mycobacterium tuberculosis - Infected Cells from Peripheral Human Granulomas using Single Cell RNA Sequencing
2024-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.20.608852
PMID:39229107
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序检测人类结核肉芽肿中结核分枝杆菌的RNA转录本 | 在针对真核mRNA设计的单细胞RNA测序文库中成功捕获并分析了结核分枝杆菌的转录本,揭示了细菌转录本的序列变异模式 | 仅包含经医院病理实验室确认的结核感染患者的细菌序列数据,样本来源有限 | 探索结核分枝杆菌在感染宿主细胞中的转录特征和序列变异 | 来自巴布亚新几内亚莫尔兹比港总医院结核病诊所患者的细针穿刺样本 | 数字病理 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 经抗酸显微镜和/或GeneXpert分析确认的结核感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序转录组学流程,使用poly-T引物在约30微米珠上启动mRNA扩增 |
| 547 | 2025-10-05 |
Immune disease dialogue of chemokine-based cell communications as revealed by single-cell RNA sequencing meta-analysis
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603936
PMID:39071425
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荟萃分析 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示免疫疾病中基于趋化因子的细胞通讯机制 | 首次通过跨疾病跨组织的单细胞RNA测序荟萃分析系统揭示免疫细胞趋化与外渗模式 | 基于公开数据库的二次分析,受原始数据质量和覆盖范围限制 | 解析免疫疾病中细胞间通讯与免疫细胞迁移机制 | 多种免疫疾病患者组织样本(皮肤、肺、结肠、肾脏) | 生物信息学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 配体-受体相互作用分析 | 单细胞转录组数据 | 多种免疫疾病公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 548 | 2025-10-05 |
NAD + activates renal metabolism and protects from chronic kidney disease in a model of Alport syndrome
2024-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.580911
PMID:38464264
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研究论文 | 本研究通过Alport综合征小鼠模型揭示了NAD+补充通过激活肾代谢途径特别是近端小管细胞的脂肪酸氧化来保护慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术,首次报道该模型中转录水平的性别差异,明确了NAD+补充通过近端小管细胞发挥肾脏保护作用的具体机制 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型,尚未在人类或其他慢性肾脏病模型中验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型 | 代谢研究 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化检测 | NA | RNA测序数据, 影像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-05 |
Modeling Glioma Intratumoral Heterogeneity with Primary Human Neural Stem and Progenitor Cells
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619254
PMID:39484434
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研究论文 | 利用人类神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型研究肿瘤内异质性 | 首次使用从胎儿脑组织纯化的同源神经干细胞和祖细胞建立胶质瘤模型,系统研究细胞起源对肿瘤异质性的影响 | 使用免疫缺陷小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 探究细胞起源如何塑造胶质瘤的肿瘤内异质性 | 人类神经干细胞、胶质祖细胞和少突胶质前体细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种同源神经细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 550 | 2025-10-05 |
Chronic social defeat stress induces meningeal neutrophilia via type I interferon signaling
2024-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610447
PMID:39257811
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性社交挫败应激通过I型干扰素信号通路诱导脑膜中性粒细胞增多的机制 | 首次发现慢性应激通过I型干扰素信号通路驱动颅骨骨髓来源的中性粒细胞向脑膜迁移 | 研究仅使用小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 探究应激相关障碍中脑膜免疫反应的分子机制 | 小鼠脑膜免疫细胞 | 神经免疫学 | 应激相关障碍 | 流式细胞术,免疫组织化学,组织透明化,单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-05 |
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.22.590194
PMID:38712147
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研究论文 | 介绍NS-Forest v4.0算法及其Python包,用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 引入On-Target Fraction指标量化标记基因特异性,改进算法以识别密切相关的细胞类型间高选择性表达模式的标记基因组合 | NA | 开发可扩展的数据驱动解决方案,识别最小必要且充分的标记基因组合以实现细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 数百万细胞的大规模单细胞RNA测序图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-05 |
Defining the T cell transcriptional landscape in pediatric liver transplant rejection at single cell resolution
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582173
PMID:38464256
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了儿童肝移植排斥反应中T细胞的转录组特征 | 首次在单细胞分辨率下定义了儿童肝移植排斥中CD8+ T细胞的克隆扩增和基因表达特征,并发现这些克隆在组织学排斥缓解后仍持续存在 | 样本量相对较小(14名患者),且为回顾性研究 | 探究儿童肝移植急性细胞排斥反应中T细胞的转录组特征和免疫应答机制 | 儿童肝移植患者的肝脏活检组织 | 单细胞生物学 | 肝移植排斥反应 | 单细胞测序,免疫受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 14名患者的30份冷冻肝脏活检组织(5份移植前或无排斥,9份有排斥) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞免疫受体谱分析 |
| 553 | 2025-10-05 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2024-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.21.537881
PMID:37162914
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研究论文 | 开发了一种基于广义双线性模型的单细胞RNA测序数据降维新方法scGBM | 提出使用泊松双线性模型直接建模计数数据,引入快速估计算法可扩展到数百万细胞的数据集,并能量化细胞潜在位置的不确定性 | 未明确说明方法在其他单细胞数据类型上的适用性 | 解决单细胞RNA测序数据降维中标准方法可能诱导虚假异质性和掩盖真实生物学变异的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义双线性模型,泊松双线性模型 | 基因表达计数数据 | 可扩展到数百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 554 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2024-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630532
PMID:39763898
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和空间转录组技术构建小鼠前列腺细胞图谱,揭示去势抵抗的细胞机制 | 首次系统整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组技术,揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势抵抗中的作用 | 主要基于小鼠模型,人类前列腺数据的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺细胞身份和去势反应的转录、表观遗传及空间基础 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-05 |
Modeling Lewy body disease with SNCA triplication iPSC-derived cortical organoids and identifying therapeutic drugs
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk3700
PMID:39259788
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研究论文 | 利用SNCA基因三倍化iPSC来源的皮质类器官模拟路易体病并筛选治疗药物 | 首次建立人类皮质路易体病模型,通过高通量药物筛选发现四种能抑制α-突触核蛋白聚集的FDA批准药物 | 研究基于基因三倍化特定突变模型,可能无法完全代表散发性路易体病的病理机制 | 阐明α-突触核蛋白在皮质神经元中的病理机制并筛选治疗药物 | 路易体病患者来源的iPSC皮质类器官和兴奋性神经元 | 数字病理学 | 路易体病 | 单细胞RNA测序, 实时震动诱导转化试验 | 皮质类器官模型 | 基因表达数据, 蛋白质聚集数据 | 1280种FDA批准药物筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-05 |
A pheromone receptor in cichlid fish mediates attraction to females but inhibits male parental care
2024-Sep-09, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2024.07.029
PMID:39094572
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和基因编辑技术揭示了慈鲷鱼类中信息素受体Or113a在调控雄性求偶行为和抑制父本育幼行为中的双重功能 | 发现单一信息素受体Or113a既能介导对雌性的吸引又能在演化中获得抑制父本育幼行为的新功能 | 研究仅针对慈鲷鱼类,其他鱼类物种的信息素感知机制仍需进一步探索 | 探究脊椎动物信息素信号演化如何导致新生殖行为策略的产生 | 慈鲷鱼类(特别是单倍色鲷类群)的生殖行为调控机制 | NA | NA | 单细胞转录组学,CRISPR基因编辑 | NA | 基因表达数据,行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 557 | 2025-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过招募和分化颅骨骨髓中的树突状样“杂交”中性粒细胞来抑制肿瘤生长的机制 | 首次发现颅骨骨髓来源的具有树突状特征的杂交中性粒细胞在胶质母细胞瘤中发挥抗肿瘤作用 | NA | 探究胶质母细胞瘤中肿瘤相关中性粒细胞的来源、分化和功能 | 胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中的肿瘤相关中性粒细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2025-10-05 |
Translatome profiling reveals Itih4 as a novel smooth muscle cell-specific gene in atherosclerosis
2024-07-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae028
PMID:38289873
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研究论文 | 本研究通过翻译核糖体亲和纯化测序技术鉴定出Itih4作为动脉粥样硬化中平滑肌细胞特异性表达的新基因 | 开发了SMCTRAP转基因小鼠模型,首次应用TRAP测序技术直接分析组织中的平滑肌细胞特异性基因表达 | 研究样本量较小,仅使用15月龄小鼠的胸主动脉样本 | 研究动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的基因表达特征 | SMCTRAP和SMCTRAP-AS转基因小鼠的胸主动脉样本 | 单细胞组学 | 动脉粥样硬化 | TRAP-seq, 免疫荧光染色, 空间转录组学, 全基因组关联分析 | 转基因小鼠模型 | 测序数据, 图像数据 | 15月龄SMCTRAP和SMCTRAP-AS小鼠的胸主动脉样本 | NA | 翻译核糖体亲和纯化测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 559 | 2025-10-05 |
Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction
2024-07-02, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae075
PMID:38666458
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的关键调控作用 | 首次发现SerpinA3n通过调节基质功能和蛋白酶活性影响心肌梗死后心脏重塑过程 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究丝氨酸蛋白酶抑制剂在心肌梗死后瘢痕形成中的作用机制 | SerpinA3n条件性基因敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、组织学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组分析 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-05 |
Small nucleolar RNA host gene 18 controls vascular smooth muscle cell contractile phenotype and neointimal hyperplasia
2024-05-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae055
PMID:38498586
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA SNHG18通过调控miR-22-3p生物合成来维持血管平滑肌细胞收缩表型并抑制损伤诱导的新内膜增生 | 首次发现SNHG18在血管疾病中的功能作用,揭示了其通过竞争性结合ADAR2促进miR-22-3p生成的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证相对有限 | 探索SNHG18在血管平滑肌细胞表型调控和血管损伤修复中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、小鼠损伤血管模型、人类动脉样本 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因功能增益/缺失研究 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 小鼠和人类动脉样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |