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当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 5521 - 5540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5521 2024-08-05
Imbalance of programmed cell death patterns mediated by dendritic cell subsets in systemic lupus erythematosus and lupus nephritis
2024-Mar-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
研究论文 本研究探讨了系统性红斑狼疮(SLE)和狼疮性肾炎(LN)中免疫细胞死亡模式的异常。 研究首次揭示了CLEC9A+cDC1在SLE和LN中细胞死亡模式失衡中的作用。 该研究的样本大小及其代表性可能限制其结果的普适性。 研究SLE和LN中免疫细胞死亡模式与疾病的关联。 研究对象为系统性红斑狼疮患者及狼疮性肾炎患者的免疫细胞。 数字病理学 狼疮性肾炎 大规模RNA测序和单细胞RNA测序 NA RNA数据 涵盖了SLE和LN患者的外周血单核细胞及肾脏组织样本 NA NA NA NA
5522 2024-08-04
A single-cell transcriptomic study of heterogeneity in human embryonic tanycytes
2024-07-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了人类胚胎tanycytes的异质性 首次利用单细胞转录组数据分析人类胚胎tanycytes的群体和基因调控网络 人类tanycytes的研究仍相对有限,可能影响对其生物学功能的全面理解 研究人类胚胎tanycytes的异质性及其在能量平衡中的作用 人类胚胎tanycytes 数字病理学 肥胖与糖尿病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
5523 2024-08-05
Differences in microenvironment of lung cancer and pleural effusions by single-cell RNA sequencing
2024-Jul, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
研究论文 本研究首次通过单细胞RNA测序比较肺癌和胸腔积液的微环境 该研究首次对相同患者的肺癌活检和胸腔积液进行直接比较,揭示了微环境的显著差异 样本量较小,仅研究了十名患者,结果的普遍适用性可能受到限制 研究肺癌微环境及其与胸腔积液微环境的比较 十名肺癌患者的匹配活检和胸腔积液样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 10名患者的匹配样本 NA NA NA NA
5524 2024-08-04
scDrugPrio: a framework for the analysis of single-cell transcriptomics to address multiple problems in precision medicine in immune-mediated inflammatory diseases
2024-03-20, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 该文章提出了一个计算框架scDrugPrio,用于分析单细胞转录组数据,以提高免疫介导炎症疾病的药物优先选择和再利用 scDrugPrio集成了细胞类型特异性的表达变化、改变的细胞间相互作用和药物性质,以选择和排名数千种药物 尽管适用于小鼠模型,但在相同诊断的患者中发现了显著的细胞和基因表达差异,可能导致对治疗反应的个体差异 研究免疫介导炎症疾病中的药物优先选择和个性化治疗 对不同患者的单细胞RNA测序数据进行分析,比较药物预测的变异性 数字病理学 免疫介导炎症疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 网络模型 基因表达数据 十一名克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA
5525 2024-08-04
An atlas of cell-type-specific interactome networks across 44 human tumor types
2024-02-12, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究提出了一种涵盖44种人类肿瘤类型的细胞类型特异性相互作用网络图谱。 开发了名为CellNetdb的数据门户,为研究人员提供细胞类型特异性相互作用网络的全面资源,并识别了不同肿瘤类型中的共同特征和差异。 尚未明确指出具体的研究限制 研究细胞类型中特异性相互作用网络以及其在肿瘤微环境中的作用。 563名患者和44种不同类型的肿瘤样本。 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 563个患者的样本,涉及44种不同的肿瘤类型 NA NA NA NA
5526 2024-08-05
Integrative analysis of spatial and single-cell transcriptome data from human pancreatic cancer reveals an intermediate cancer cell population associated with poor prognosis
2024-01-31, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文通过整合空间和单细胞转录组数据揭示了与差病预后相关的中间癌细胞群体 识别了一种新型癌细胞亚群Ep_VGLL1,具有基底样和经典亚型之间的过渡特征 由于肿瘤的内部和外部异质性,分子特征和生物学意义尚未明确阐明 探讨胰腺癌的细胞异质性及其与预后的关系 来自17个胰腺肿瘤组织的单细胞RNA测序和空间转录组数据 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组测序 NA 基因表达数据 17个胰腺肿瘤组织样本(16个胰腺癌和一个高等级发育不良样本) NA NA NA NA
5527 2024-08-04
Unsupervised spatially embedded deep representation of spatial transcriptomics
2024-01-12, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文介绍了一种用于空间转录组学的无监督深度表示方法SEDR 提出了一种结合深度自编码器和掩蔽自监督学习机制的新方法SEDR,用于构建低维基因表达的潜在表示 NA 优化转录组数据与空间信息的整合,以解析组织异质性和映射细胞间通讯 使用10×Visium数据集进行聚类性能的评估 数字病理学 NA 深度自编码器 变分图自编码器 基因表达数据 手动注释的10×Visium数据集 NA NA NA NA
5528 2024-08-05
SingmiR: a single-cell miRNA alignment and analysis tool
2024-Jul-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究介绍了SingmiR工具,通过提供针对单细胞miRNA-seq数据的快速处理与定量分析。 SingmiR是首个专为单细胞miRNA-seq数据设计的网络服务器,具有自解释界面并提供全面的分析功能 目前尚无针对大规模单细胞miRNA-seq数据的扩展验证 本研究旨在加速生物学家开发单细胞miRNA-seq协议的原型流程 研究对象为人类的非编码单细胞样本中的miRNAs 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 小到中等规模的数据集 NA NA NA NA
5529 2024-08-04
Growth hormone promotes myelin repair after chronic hypoxia via triggering pericyte-dependent angiogenesis
2024-Jul-03, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 这篇文章探讨了生长激素在慢性缺氧后促进髓鞘修复的机制。 该研究首次展示了生长激素通过触发周细胞依赖的血管生成来改善白质损伤。 该研究未提供对人类疾病的直接临床相关性 研究生长激素在缺氧导致的白质损伤中的作用及其机制 以缺氧新生小鼠为研究对象 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 小鼠模型 新生小鼠及其后代 NA NA NA NA
5530 2024-08-04
Integrating single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics to elucidate a specialized subpopulation of astrocytes, microglia and vascular cells in brains of mouse model of lipopolysaccharide-induced sepsis-associated encephalopathy
2024-Jul-03, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了在脂多糖诱导的败血症相关脑病小鼠模型中,特定星形胶质细胞、微胶质细胞和血管细胞的亚群体及其相互作用。 结合使用单核RNA测序和空间转录组学,确认了Astro-2、Micro-2与Vas-1细胞之间的独特共定位关系,并发现其相关的配体-受体上调。 研究未能观察到Anxa1-/-和野生型小鼠在其他脑细胞类型、数量或分布上的显著差异。 揭示败血症相关脑病的细胞和分子机制。 使用脂多糖注射建立小鼠模型,分析不同时间点的脑组织。 数字病理学 败血症相关脑病 单核RNA测序(snRNA-seq)和立体测序(Stereo-seq) 小鼠模型 脑组织 野生型小鼠和Anxa1-/-小鼠 NA NA NA NA
5531 2024-08-05
ezSingleCell: an integrated one-stop single-cell and spatial omics analysis platform for bench scientists
2024-Jul-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 ezSingleCell是一个互动且易于使用的应用程序,用于分析各种单细胞和空间组学数据类型 结合了公开可用的最佳方法进行深入数据分析、整合和交互式数据可视化 NA 提供一个便捷的平台供科研人员分析单细胞和空间组学数据 单细胞和空间组学数据 数字病理学 NA scRNA-seq NA 数据集 3000个细胞的标准scRNA-seq数据集 NA NA NA NA
5532 2024-08-04
10× single-cell sequencing revealed cellular composition heterogeneity in cardiac myxoma with malignant glandular properties
2024-07, Microvascular research IF:2.9Q2
研究论文 本研究揭示了心脏粘液瘤的细胞组成异质性及其恶性腺体特性 首次通过10×单细胞测序分析心脏粘液瘤的细胞成分及其基因表达 样本数量有限,仅来源于4例手术切除的心脏粘液瘤 探究心脏粘液瘤细胞成分及其基因表达在肿瘤发展中的作用 4例手术切除的心脏粘液瘤样本,包含1例腺体粘液瘤和3例非腺体粘液瘤 数字病理学 心脏肿瘤 10×单细胞测序 NA 活细胞 4例心脏粘液瘤样本 NA NA NA NA
5533 2024-08-05
What Single Cell RNA Sequencing Has Taught Us about Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Jul, Tuberculosis and respiratory diseases IF:2.5Q2
评论 本文概述了单细胞RNA测序技术及其在慢性阻塞性肺病中的应用和所得教训 介绍了单细胞RNA测序如何揭示慢性阻塞性肺病的细胞和分子网络 缺乏对慢性阻塞性肺病的病理生物学的深入理解和指导治疗的生物标志物稀缺 探讨慢性阻塞性肺病的分子机制和细胞网络以支持治疗发现 研究慢性阻塞性肺病(COPD)中的细胞和分子网络 数字病理学 COPD 单细胞RNA测序 NA NA NA NA NA NA NA
5534 2024-08-04
Single-cell sequencing of immune cells from the coronary sinus reveals immune mechanisms of the progression of persistent atrial fibrillation
2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 该文章探讨了来自冠状窦的免疫细胞在持续性心房颤动进程中的作用 首次通过单细胞测序揭示了持续性心房颤动患者冠状窦中免疫细胞的异质性及其与心房颤动复发的相关性 研究未明确提及样本量及潜在的临床应用限制 探索免疫细胞在持续性心房颤动进展中的作用及机制 持续性心房颤动患者的冠状窦免疫细胞 数字病理学 心房颤动 单细胞测序 NA 免疫细胞 NA NA NA NA NA
5535 2024-08-04
Integrating spatial transcriptomics and bulk RNA-seq: predicting gene expression with enhanced resolution through graph attention networks
2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究提出了一种新的方法STGAT,利用图注意网络提高了基因表达的空间分辨率。 STGAT方法结合了空间转录组学和大规模RNA测序数据,可以在近细胞级别预测基因表达,填补了现有数据的空白。 目前仅在乳腺癌样本中进行了测试,可能不适用于其他类型的癌症。 本研究旨在通过空间转录组学与大规模RNA测序数据结合,改进基因表达的预测。 研究对象为肿瘤组织样本,特别是只有WSI和大规模RNA测序数据的患者样本。 数字病理 乳腺癌 RNA-seq GAT 图像 两个乳腺癌空间转录组数据集 NA NA NA NA
5536 2024-08-04
ALKBH5-mediated m6A modification of IL-11 drives macrophage-to-myofibroblast transition and pathological cardiac fibrosis in mice
2024-Mar-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了ALKBH5介导的m6A修饰如何驱动小鼠心脏巨噬细胞向肌成纤维细胞的转变及病理性心脏纤维化 本研究首次揭示了ALKBH5在心脏巨噬细胞转变和心脏纤维化中的作用机制,并识别了IL-11 mRNA作为ALKBH5介导的m6A去甲基化的靶标 本研究的结果主要基于小鼠模型,可能在临床应用上需要进一步验证 研究心脏巨噬细胞转变和心脏纤维化过程中ALKBH5的作用 心脏巨噬细胞及其在高血压诱导的病理条件下的转变 数字病理学 心脏病 单细胞转录组学、谱系追踪、旁体共生技术 NA mRNA 小鼠模型 NA NA NA NA
5537 2024-08-05
Single cell RNA-sequencing in uveal melanoma: advances in heterogeneity, tumor microenvironment and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文探讨了单细胞RNA测序在葡萄膜黑色素瘤中的应用,重点关注异质性、肿瘤微环境和免疫治疗进展 结合生物信息学分析的单细胞RNA测序为理解肿瘤内异质性和微环境提供了新的视角,有助于发现与预后相关的分子指标 由于葡萄膜黑色素瘤的特殊生物学特性,免疫治疗的效果有限 提高葡萄膜黑色素瘤患者免疫治疗的疗效 葡萄膜黑色素瘤患者的肿瘤特征和微环境 数字病理学 葡萄膜黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA NA NA NA NA NA NA
5538 2024-08-04
Leveraging a neutrophil-derived PCD signature to predict and stratify patients with acute myocardial infarction: from AI prediction to biological interpretation
2024-Jul-02, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本文提出了一种中性粒细胞衍生的程序性细胞死亡(PCD)特征,旨在预测和分层急性心肌梗死(AMI)患者 创新地利用机器学习生成了一种预测性的中性粒细胞衍生PCD特征,并探讨了其生物机制 虽然探讨了中性粒细胞相关PCD的临床意义,但生物机制尚未完全阐明 旨在通过预测和分层急性心肌梗死患者来改善治疗管理 研究对象为急性心肌梗死患者的外周血样本 机器学习 心血管疾病 机器学习,单细胞转录组学,孟德尔随机化 随机森林 微阵列数据 五个独立的微阵列队列 NA NA NA NA
5539 2024-08-04
A unified model-based framework for doublet or multiplet detection in single-cell multiomics data
2024-Jul-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种基于复合泊松模型的框架,用于在单细胞多组学数据中检测多细胞聚集体。 创新之处在于使用复合泊松模型来检测细胞聚集体,并利用实验细胞哈希结果作为多细胞状态的真实数据。 本研究的局限性在于尚未涵盖所有单细胞多组学技术的整合应用。 研究的目的是在单细胞多组学数据中准确检测和消除多细胞聚集体。 研究对象为280,123个液滴的单细胞多组学数据。 数字病理学 NA DOGMA-seq 复合泊松模型 数据集包含液滴信息 280,123个液滴来自两个组织 NA NA NA NA
5540 2024-08-04
NOX4-mediated astrocyte ferroptosis in Alzheimer's disease
2024-Jul-02, Cell & bioscience
研究论文 本研究探讨了NADPH氧化酶4(NOX4)在阿尔茨海默病(AD)中对铁介导的星形胶质细胞死亡的作用 研究首次揭示了NOX4在阿尔茨海默病星形胶质细胞铁死亡中的关键作用 研究可能受到样本选择和实验条件的限制 研究NOX4与阿尔茨海默病相关的星形胶质细胞铁死亡机制 本研究的对象为阿尔茨海默病中的星形胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 使用了AD的单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA
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