单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7515 篇文献，本页显示第 5521 - 5540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5521 | 2024-08-04 |
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus
IF:3.3Q1
DOI:10.3171/2024.2.FOCUS2417
PMID:38691860
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综述 | 本文回顾了脊索瘤的分子进展及其治疗反应的科学发现和临床意义 | 提供了对脊索瘤分子机制的深入了解，并探讨了新的治疗方法和技术 | 目前很少有系统治疗显示出显著的有效性，且脊索瘤在多模式治疗后仍倾向复发 | 研究脊索瘤的分子发病机制及其在治疗中的临床应用 | 脊索瘤及其分子特征和治疗反应 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组分析、空间转录组学、游离DNA分析 | NA | 转录组、基因组 | NA |
| 5522 | 2024-08-05 |
Beneficial mechanisms of dimethyl fumarate in autoimmune uveitis: insights from single-cell RNA sequencing
2024-Apr-29, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03096-6
PMID:38684986
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研究论文 | 该研究探讨了二甲基富马酸酯在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 通过单细胞RNA测序，揭示了DMF在自身免疫性葡萄膜炎中影响免疫细胞渗透的潜在机制 | 当前研究缺乏对DMF在自身免疫性葡萄膜炎中全面作用的深入探索 | 研究DMF在自身免疫性葡萄膜炎中的功能及其潜在机制 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及DMF处理的实验小鼠 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和DMF处理的实验小鼠的颈部引流淋巴结细胞 |
| 5523 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers related to angiogenesis in myocardial ischemia-reperfusion injury and prediction of potential drugs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300790
PMID:38935597
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研究论文 | 本研究识别与心肌缺血再灌注损伤相关的血管生成生物标志物并预测潜在药物 | 本研究首次识别Stat3、Rela和Ubb作为心肌缺血再灌注损伤与血管生成的关键基因 | 研究未提及样本的多样性及临床实验证据 | 探索心肌缺血再灌注损伤中的血管生成机制及相关生物标志物 | 心肌缺血再灌注损伤的生物标志物和潜在药物 | 数字病理 | 心血管疾病 | 测序 | WGCNA | 基因序列 | NA |
| 5524 | 2024-08-04 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Unravels the Molecular Feature of Tumor-Associated Macrophage of Acute Myeloid Leukemia
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/5539065
PMID:38205232
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研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病及其相关的巨噬细胞分子特征 | 提出了一种巨噬细胞相关指数（MRI）来评估AML患者的预后和免疫特征 | 研究可能受到数据源和样本量的限制，可能需进一步验证 | 深入探索急性髓系白血病与巨噬细胞之间的关联 | 急性髓系白血病患者的基因表达谱和临床变量特征 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA测序 | LASSO和多变量Cox分析 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA, GEO和TARGET数据库的AML患者数据集 |
| 5525 | 2024-08-04 |
Prognostic and therapeutic insights into colorectal carcinoma through immunogenic cell death gene profiling
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17629
PMID:38938617
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研究论文 | 本研究探讨了免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用，并开发了新型的量化系统来预测患者的预后与免疫治疗效果 | 开发了一种新颖的免疫原性细胞死亡量化系统，并在肿瘤免疫微环境中构建了ICD评分 | 本研究侧重于结直肠癌的特定类型，可能无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究免疫原性细胞死亡在结直肠癌中的作用与预测患者治疗结果的潜力 | 研究对象为被诊断为结肠腺癌/直肠腺癌的1,184名患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | 主成分分析 (PCA) | 基因组数据 | 1,184名结肠腺癌/直肠腺癌患者 |
| 5526 | 2024-08-04 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics to Uncover and Elucidate GP73-Mediated Pro-Angiogenic Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0387
PMID:38939041
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研究论文 | 本研究展示了GP73介导的促血管生成调控网络在肝细胞癌中的作用 | 揭示了GP73与血管内皮细胞的细胞通信及其在肝细胞癌血管发育中的作用 | 研究可能未能涵盖所有肝细胞癌类型及其复杂性 | 探讨GP73在肝细胞癌中促血管生成的机制及其临床相关性 | 肝细胞癌患者的细胞及其在血管生成中的关键角色 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞空间转录组学 | NA | 细胞、血清 | 肝细胞癌患者的样本未具体说明 |
| 5527 | 2024-08-05 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies an aneuploidy-based gene signature to predict sensitivity of lung adenocarcinoma to traditional chemotherapy drugs and patients' prognosis
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17545
PMID:38938612
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研究论文 | 该文章研究了一个基于基因签名的模型，以预测肺腺癌对传统化疗药物的敏感性和患者的预后 | 开发了一个五基因异倍体相关风险评分（ARS）模型，发现高表达的CKS1B促进肺腺癌细胞系的增殖、迁移和侵袭性表型 | 目前对异倍体相关基因在肺腺癌中的预后和免疫治疗能力的研究仍然有限 | 研究异倍体相关基因在肺腺癌中的潜在作用，以改善诊断和治疗方法 | 以肺腺癌（LUAD）细胞系为研究对象，筛选与异倍体相关的基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA测序 | Cox回归与Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 使用公共数据库的肿瘤数据以及细胞实验验证 |
| 5528 | 2024-08-05 |
VISTA deficiency exerts anti-tumor effects in breast cancer through regulating macrophage polarization
2024-Jul-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112365
PMID:38820964
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research paper | 本研究首次揭示了VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞的影响 | 揭示了VISTA通过STAT通路调节巨噬细胞极化，进而影响肿瘤生长 | 未涉及VISTA在其他类型肿瘤中的作用 | 探讨VISTA在乳腺癌中对巨噬细胞极化的影响 | 乳腺癌中的巨噬细胞 | NA | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | NA | 体内实验中使用了VISTA缺失小鼠 |
| 5529 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the differentiation of bone marrow haematopoietic cells in patients with paroxysmal nocturnal haemoglobinuria
2024-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1671
PMID:38924689
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5530 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of human oocytes reveals a differential transcriptomic profile associated with agar-like zona pellucida
2024-Jun-26, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-024-01463-8
PMID:38926883
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研究论文 | 该文章探讨了具有琼脂样透明带的单个细胞卵母细胞的转录组特征 | 揭示了与琼脂样透明带相关的分子机制及其涉及的差异表达基因 | 研究样本数量较少，仅涉及四名患者和四名健康供体 | 阐明琼脂样透明带的分子机制及其对卵母细胞的影响 | 琼脂样透明带卵母细胞与健康卵母细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八个卵母细胞样本（四个琼脂样透明带患者和四个健康供体） |
| 5531 | 2024-08-07 |
Androgens exert multifaceted functions in sex differences analyzed through single-cell transcriptome
2024-Jun-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2652-y
PMID:38940831
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5532 | 2024-08-05 |
Pan-cancer multi-omics analysis of PTBP1 reveals it as an inflammatory, progressive and prognostic marker in glioma
2024-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64979-5
PMID:38918441
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研究论文 | 本研究分析了PTBP1在胶质瘤中的炎症、进展和预后标志物的角色。 | 揭示了PTBP1在多种癌症中的表达、甲基化与预后之间的关系，并首次将其作为胶质瘤的标志物。 | 尚不清楚PTBP1表达与肿瘤微环境的具体关系。 | 探讨PTBP1在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力。 | PTBP1在不同癌症类型中的表达与甲基化模式。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 基因集合富集分析（GSEA），单细胞转录组分析，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 使用了多种数据集，包括TCGA、GTEx和CGGA |
| 5533 | 2024-08-05 |
Insight into Fructose-to-Sucrose Ratio as the Potential Target of Urinalysis in Bladder Cancer
2024-Jun-20, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14060345
PMID:38921479
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研究论文 | 本文探讨了尿液中果糖与蔗糖比作为膀胱癌尿液分析的潜在目标 | 研究首次揭示了尿液中果糖与蔗糖比与膀胱癌风险之间的双向负因果关系 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类膀胱癌的复杂性 | 研究膀胱癌中可操作的非侵入性筛查生物标志物 | 膀胱癌相关的尿液代谢物及其与膀胱癌风险的关系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, Mendelian随机化分析 | BBN诱导的小鼠模型 | 生物标志物数据 | 使用BBN诱导的小鼠模型进行验证的样本 |
| 5534 | 2024-08-05 |
Identification of therapeutic targets and medicines for comorbid Crohn's disease and rheumatoid arthritis: A comprehensive analysis
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32406
PMID:38933947
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研究论文 | 本研究旨在识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的潜在治疗靶点和药物 | 本研究运用单细胞RNA测序和孟德尔随机化等新方法来识别共患疾病的关键免疫细胞及其靶点 | 未提及研究的具体局限性 | 识别共患克罗恩病和类风湿关节炎的治疗靶点和潜在药物 | 共患克罗恩病和类风湿关节炎的患者的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 克罗恩病/类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟 | NA | 文本 | 纳入共患克罗恩病和类风湿关节炎患者的PBMC样本 |
| 5535 | 2024-08-04 |
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-Jun, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03040-1
PMID:38664501
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研究论文 | 这项研究揭示了GSK3β和UCHL3在卵巢癌中通过去 ubiquitination 维持 RIPK4 稳定性并增强肿瘤转移的重要作用 | 本研究首次揭示了GSK3β诱导的RIPK4磷酸化如何增强其与UCHL3的相互作用，从而提高RIPK4的去 ubiquitination 和稳定性 | 该研究主要集中于体外和体内模型，临床验证尚需进一步研究 | 研究 RIPK4 在卵巢癌发展中的作用及其调控机制 | 研究主要对象为卵巢癌组织及细胞，重点关注RIPK4、UCHL3和GSK3β的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 5536 | 2024-08-04 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了一个基于单细胞转录组学的计算管道PERCEPTION，用于预测患者对治疗的反应和抵抗 | 提出了一种新的精准肿瘤治疗计划工具，能够基于单细胞转录组数据预测患者的治疗反应 | 尚未提及任何特定的局限性 | 提升个体癌症患者最佳治疗方案的制定 | 肿瘤患者的单细胞转录组数据 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | 未提供 | 转录组数据 | 在多发性骨髓瘤和乳腺癌的两个临床试验中使用了患者源的初级细胞 |
| 5537 | 2024-08-04 |
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14822
PMID:38923860
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19对神经系统的损伤，并通过胶质瘤组织和胶质瘤类器官的分析提供了证据 | 首次揭示了胶质瘤组织对SARS-CoV-2的易感性以及其对COVID-19相关神经症状的代表性 | 缺乏对SARS-CoV-2入侵中枢神经系统精确机制的深入研究 | 研究COVID-19对神经系统的影响及其机制 | 胶质瘤患者的组织样本和胶质瘤类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、空间转录组分析 | NA | 组织样本、类器官 | 胶质瘤患者的组织样本及其类器官数据 |
| 5538 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02255-1
PMID:38724673
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研究论文 | 本研究揭示了AML/T细胞相互作用对患者结果的相关性及ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用 | 该研究首次揭示了ICAM1作为免疫触发因子在小鼠体内T细胞杀死AML细胞中的作用 | 研究主要集中于AML样本与T细胞的体外相互作用，可能未能全面反映整体免疫环境 | 探讨AML患者对T细胞杀伤的敏感性及其相互作用的分子机制 | AML细胞样本与人源工程化的CD4 T细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 多个AML患者样本和CD4 T细胞的组合 |
| 5539 | 2024-08-04 |
Beyond the marrow: insights from comprehensive next-generation sequencing of extramedullary multiple myeloma tumors
2024-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02206-w
PMID:38493239
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研究论文 | 此研究对外髓性多发性骨髓瘤（EMM）肿瘤进行了全面的下一代测序分析 | 首次揭示EMM的肿瘤微环境，识别关键的分子特征和潜在的治疗靶点 | 样本规模相对较小，仅有14个样本 | 探讨EMM肿瘤的分子特征和开发有效的治疗策略 | 外髓性多发性骨髓瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 下一代测序（NGS） | NA | 肿瘤样本 | 14个样本 |
| 5540 | 2024-08-05 |
Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202308384
PMID:38634607
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研究论文 | 本研究探讨了渗透压胁迫对拟南芥根尖发育的影响，使用单细胞层面的转录调控网络分析 | 首次在单细胞层面重建了相应的转录调控网络，并捕捉到12,968个单细胞的基因和染色质可及性之间的联系 | 数据整合的准确性仍然是个挑战，尤其是在调查特定细胞类型的转录调控网络时 | 研究拟南芥在渗透压胁迫下的根尖发育机制 | 16,670个拟南芥根尖细胞核 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | 16,670个根尖细胞核 |