单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 5521 - 5540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5521 | 2024-08-05 |
Activation of non-classical Wnt signaling pathway effectively enhances HLA-A presentation in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1336106
PMID:38962268
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研究论文 | 本研究识别了急性淋巴细胞白血病（AML）中造血干细胞前体（HSC-Prog）的克隆异质性，并探讨了与AML免疫逃逸相关的分子通路 | 首次揭示非经典Wnt信号通路在AML中与HLA-A呈现的关系 | 未明确涉及样本的多样性或实验结果的临床应用 | 识别AML中造血干细胞前体的克隆异质性并探讨与免疫逃逸相关的分子机制 | 急性髓性白血病（AML）患者的造血干细胞前体 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA（mRNA） | 样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5522 | 2024-08-05 |
A mitochondria-related genes associated neuroblastoma signature - based on bulk and single-cell transcriptome sequencing data analysis, and experimental validation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415736
PMID:38962012
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研究论文 | 本文建立了一种与线粒体相关基因相关的神经母细胞瘤标志，通过数据分析和实验验证进行了研究 | 提出了一个新的预测工具，能够有效评估神经母细胞瘤患者的预后和对化疗药物的敏感性 | 研究可能未涵盖所有类型的神经母细胞瘤患者，且数据集的多样性有限 | 旨在分析线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的重要性及其在患者预后中的应用 | 本研究对象为神经母细胞瘤患者及其相关的线粒体相关基因 | 数字病理 | 神经母细胞瘤 | 转录组测序 | 一致性聚类和机器学习算法 | 单细胞和整体转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5523 | 2024-08-05 |
Elucidating the role of angiogenesis-related genes in colorectal cancer: a multi-omics analysis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1413273
PMID:38962272
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析阐明了血管生成相关基因在结直肠癌中的重要性 | 研究中识别了结直肠癌中的两种血管生成相关亚型及其四个关键基因，为个性化治疗提供了新见解 | 在基因突变与亚型的关联方面未发现显著性 | 探索血管生成相关基因在结直肠癌中的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其血管生成相关基因的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RT-PCR, scRNA-seq | LASSO, Xgboost, 决策树 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5524 | 2024-08-05 |
LSD1/KDM1A and GFI1B repress endothelial fate and induce hematopoietic fate in induced pluripotent stem cell-derived hemogenic endotheliums
2024-Jul-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285214
PMID:38961746
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子GFI1B及其共因子LSD1/KDM1A在胚胎内皮转化过程中的作用 | 揭示了LSD1/KDM1A和GFI1B在不同细胞亚群中的时间点功能对血液生成的影响 | 未能在未分化的HE细胞中检测到GFI1B的表达 | 理解诱导多能干细胞转化为血液生成细胞的机制 | 使用患者来源的iPSC线和健康的iPSC线进行对比研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多条患者来源的iPSC线和健康iPSC线 | NA | NA | NA | NA |
| 5525 | 2024-08-04 |
Spatial Dissection of the Immune Landscape of Solid Tumors to Advance Precision Medicine
2024-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0699
PMID:38657223
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综述 | 本论文概述了在实体肿瘤中空间免疫景观的分析方法，以促进精准医疗。 | 介绍了空间转录组学和蛋白质组学的最新进展及其在肿瘤免疫细胞组成分析中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 深入了解实体肿瘤的异质性免疫景观，以改善预后和治疗反应预测 | 重点研究实体肿瘤中的免疫细胞成分及其在肿瘤微环境中的角色 | 数字病理学 | 固体恶性肿瘤 | 空间多组学技术 | NA | RNA和蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5526 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing: Technological Progress and Biomedical Application in Cancer Research
2024-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00777-0
PMID:37322261
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用 | 强调了scRNA-seq在肿瘤异质性分析和个性化医学中的潜在应用 | 未提及具体的技术局限性 | 探讨单细胞RNA测序在癌症研究中的应用和技术进展 | 单细胞RNA测序技术及其对癌症和疾病的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5527 | 2024-08-04 |
Comprehensive investigation of malignant epithelial cell-related genes in clear cell renal cell carcinoma: development of a prognostic signature and exploration of tumor microenvironment interactions
2024-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05426-x
PMID:38951896
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研究论文 | 本文全面研究了透明细胞肾细胞癌中的恶性上皮细胞相关基因及其临床相关性 | 建立了一个预后模型MECRGS，并在多个队列中显示出优越的预测性能 | 未提及具体的样本来源和大小 | 探讨恶性上皮细胞相关基因在透明细胞肾细胞癌中的功能和临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌中的219个恶性上皮细胞相关基因 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5528 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of Crohn's disease: Unveiling heterogeneity and evaluating ustekinumab outcomes
2024-Jul, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3715
PMID:38962887
|
研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病的细胞复杂性，识别关键细胞群体及其转录组特征 | 揭示了克罗恩病中八种不同细胞类型及其重要的成纤维细胞和T细胞相互作用，为疾病机制和治疗靶点提供了新见解 | 未提及具体的样本大小和长期疗效评估 | 探究克罗恩病的细胞组成及其与健康对照的差异 | 克罗恩病患者与健康对照者的细胞组成 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5529 | 2024-08-05 |
Exploring the role of CD8+ T cells in clear renal cell carcinoma metastasis
2024-Jul, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13819
PMID:38872260
|
研究论文 | 本研究探讨了CD8+ T细胞在透明细胞肾细胞癌转移中的作用 | 首次将CD8 T细胞根据其基因特征分类为四个亚群，并发现其与预后差相关 | 缺乏临床样本的直接验证 | 揭示透明细胞肾细胞癌转移中CD8 T细胞的功能和特征 | 透明细胞肾细胞癌中的CD8 T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5530 | 2024-08-05 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing, NK cell marker genes reveal a prognostic and immune status in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65917-1
PMID:38951569
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研究论文 | 该研究探讨了NK细胞标记基因与胰腺导管腺癌患者的预后和免疫反应之间的关系 | 本研究首次通过构建NK细胞标记基因的签名预测胰腺癌患者的预后，并与免疫状态显示了强相关性 | 本研究的局限性在于样本主要依赖于公开数据库，可能存在选择偏倚 | 研究NK细胞在胰腺导管腺癌中的作用及其对患者预后的影响 | 研究胰腺导管腺癌患者中的NK细胞标记基因及其相关性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和RNA测序 | Cox分析 | 基因表达数据 | 纳入7个NK细胞标记基因，验证了6个GEO数据集的预测能力 | NA | NA | NA | NA |
| 5531 | 2024-08-04 |
Advances in single-cell long-read sequencing technologies
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae047
PMID:38774511
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综述 | 本文讨论了单细胞长读长测序技术的最新进展 | 提供了针对细胞复杂性来源的新见解，并强调了单细胞RNA异构体测序(scRiso-seq)的显著进展 | 主要集中在下游分析的实际考虑和操作挑战上 | 探讨单细胞测序技术在转录组和基因组研究中的应用 | 长读长测序技术在单细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | RNA和DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5532 | 2024-08-04 |
scRNA-seq Reveals Novel Genetic Pathways and Sex Chromosome Regulation in Tribolium Spermatogenesis
2024-03-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae059
PMID:38513111
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研究论文 | 该研究揭示了赤面粉甲虫中生殖细胞发生的新遗传通路和性染色体调控机制 | 首次展示了棉果科昆虫中生殖细胞发生的特异性标记和分子通路 | 研究主要集中在非模式生物，可能缺乏与已知编码分子的直接比较 | 探索赤面粉甲虫的生殖细胞发生过程及其分子基础 | 研究对象为赤面粉甲虫的成年雄性睾丸中的细胞群体 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性赤面粉甲虫的睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5533 | 2024-08-05 |
Tyrosine Kinase Inhibition Activates Intratumoral γδ T Cells in Gastrointestinal Stromal Tumor
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0061
PMID:37922405
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研究论文 | 本研究探讨酪氨酸激酶抑制对胃肠道间质瘤中γδ T细胞的影响 | 发现酪氨酸激酶抑制能够进一步刺激肿瘤内γδ T细胞，并揭示其在免疫疗法中的潜在靶向作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的生物反应 | 探讨酪氨酸激酶抑制对胃肠道间质瘤中γδ T细胞的作用机制 | 使用转基因小鼠模型研究γδ T细胞及其在胃肠道间质瘤中的作用 | 数字病理学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括转基因小鼠模型和新鲜人类胃肠道间质瘤标本 | NA | NA | NA | NA |
| 5534 | 2024-08-04 |
Immunophenotypic characterization of leukemic stem cells in acute myeloid leukemia using single tube 10-colour panel by multiparametric flow cytometry: Deciphering the spectrum, complexity and immunophenotypic heterogeneity
2024-Aug, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.14250
PMID:38456256
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研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术对急性髓性白血病中的白血病干细胞进行免疫表型特征的全面分析。 | 提出了一种单管10色多参数流式细胞术面板，能够轻松、可重复地区分白血病干细胞和正常造血干细胞，并揭示了免疫表型的异质性。 | 研究中样本数量有限，且对不同亚群的区分可能受到样本特征的影响。 | 探讨急性髓性白血病中白血病干细胞的免疫表型特征及其异质性。 | 急性髓性白血病患者的骨髓抽取样本。 | 数字病理 | 急性髓性白血病 | 多参数流式细胞术（MFC）和单细胞测序 | NA | 生物样本（骨髓抽取样本） | 从255个样本中评估225个白血病干细胞和183个正常造血干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5535 | 2024-08-04 |
Spatial heterogeneity and functional zonation of living tissues and organs in situ
2024-Jul-02, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvae049
PMID:38953373
|
研究论文 | 介绍了活体组织和器官内的空间异质性和功能分区 | 利用最新的成像和转录组技术，揭示了器官内的分区及其生理作用 | 传统分析方法难以详细调查这些分区 | 深入理解器官中免疫系统的空间差异 | 各个器官的不同区域及其免疫系统 | 数字病理学 | NA | 活体成像、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5536 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing in exploring the pathogenesis of diabetic retinopathy
2024-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1751
PMID:38946005
|
综述 | 本综述总结了单细胞RNA测序在探索糖尿病视网膜病变病因中的应用 | 强调了通过单细胞RNA测序识别差异表达基因、关键细胞亚群体和复杂细胞间相互作用的创新点 | 缺乏对糖尿病视网膜病变的全面理解，尤其是涉及到的细胞多样性和分子异质性 | 研究糖尿病视网膜病变的发病机制 | 包括糖尿病视网膜病变患者、非人灵长类动物和小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 包括糖尿病视网膜病变患者及多个模型的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 5537 | 2024-08-05 |
Systematic evaluation with practical guidelines for single-cell and spatially resolved transcriptomics data simulation under multiple scenarios
2024-06-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03290-y
PMID:38831386
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研究论文 | 本文系统评估了49种针对单细胞RNA测序和空间分辨转录组数据的模拟方法 | 提供了关于不同模拟方法的准确性、功能性、可扩展性和可用性的详细比较，并提出了实际的选择指导 | 没有任何方法在所有标准上表现最佳，且某些方法只能生成不真实的模拟数据 | 评估单细胞RNA测序和空间分辨转录组数据的模拟方法以提供实践指导 | 49种用于单细胞RNA测序和空间分辨转录组的数据模拟方法 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 转录组数据 | 152个来自24个平台的参考数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5538 | 2024-08-05 |
Integrated bioinformatics analysis and experimental validation identifies CPE as a potential biomarker and therapeutic target for skin aging
2024-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15120
PMID:38886965
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研究论文 | 本文通过整合生物信息学分析和实验验证，识别了CPE作为皮肤衰老的潜在生物标志物和治疗靶点。 | 创新点在于首次通过加权基因共表达网络分析和机器学习技术，确定了CPE作为皮肤衰老的关键标志物，揭示其在皮肤衰老中的功能。 | 本文未提及特定的临床试验或广泛的人群数据以验证CPE的生物标志物和治疗靶点的有效性。 | 研究皮肤衰老的机制并识别新的生物标志物和治疗靶点。 | 研究对象为人类真皮成纤维细胞(HDFs)，分析其在衰老过程中的CPE表达变化。 | 数字病理学 | 皮肤衰老 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习 | NA | 转录组数据 | 使用了衰老相关的总体转录组和单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5539 | 2024-08-04 |
Sequential drug treatment targeting cell cycle and cell fate regulatory programs blocks non-genetic cancer evolution in acute lymphoblastic leukemia
2024-05-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03260-4
PMID:38822412
|
研究论文 | 本研究探讨了G2/M检查点抑制在急性淋巴细胞白血病中的作用 | 揭示了WEE1靶向疗法与细胞命运决策调控回路之间的关系 | 需要进一步研究以验证不同患者群体中的疗效和反应 | 更好地理解药物效果与癌细胞状态多样性之间的机制 | 针对KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq | NA | 生物学细胞数据 | RS4;11细胞系和KMT2A::AFF1重排细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5540 | 2024-08-04 |
Potential marker genes for chronic obstructive pulmonary disease revealed based on single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024-05-23, Aging
DOI:10.18632/aging.205849
PMID:38787375
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序和孟德尔随机化分析，识别了慢性阻塞性肺疾病（COPD）的潜在标记基因 | 通过单细胞测序和孟德尔随机化分析揭示了与COPD相关的四个关键基因，提供了新的预防和治疗COPD的见解 | 提供的抽象中未提及具体的局限性 | 研究COPD的病理机制，识别相关关键基因 | 重点研究与COPD相关的免疫细胞标记基因 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和孟德尔随机化分析 | NA | 基因组数据 | 使用了来自UK Biobank数据库的独立队列（ukb-b-16751）进行分析 | NA | NA | NA | NA |