单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 5481 - 5500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5481 | 2024-08-07 |
Monitoring melanoma patients on treatment reveals a distinct macrophage population driving targeted therapy resistance
2024-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101611
PMID:38942020
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接受BRAFi/MEKi治疗的黑色素瘤患者中耐药和响应肿瘤的细针抽吸物，揭示了与靶向治疗耐药相关的特定巨噬细胞群体。 | 发现了与靶向治疗耐药相关的POSTN基因及其信号传导的巨噬细胞群体，并证明了这些巨噬细胞通过CD44受体直接保护黑色素瘤细胞免受MEKi诱导的杀伤。 | NA | 揭示黑色素瘤靶向治疗耐药的机制 | 黑色素瘤患者的耐药和响应肿瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 接受BRAFi/MEKi治疗的黑色素瘤患者的耐药和响应肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5482 | 2024-08-07 |
Deciphering the role of ferroptosis in rheumatoid arthritis: Synovial transcriptome analysis and immune infiltration correlation
2024-Jul-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33648
PMID:39091931
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和免疫浸润相关性探讨铁死亡在类风湿性关节炎中的作用 | 首次揭示了铁死亡相关基因在类风湿性关节炎中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，并验证了TIMP1作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探讨铁死亡在类风湿性关节炎发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 转录组差异基因分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、受试者工作特征（ROC）曲线分析、单细胞测序 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据 | 来自类风湿性关节炎患者的滑膜组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5483 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immunological responses in elderly patients with sepsis
2024-Jun-22, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00446-z
PMID:38909272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年脓毒症患者的外周血样本，探讨了免疫细胞的转录组特征及其在老年脓毒症患者中的变化 | 首次揭示了老年脓毒症患者中免疫细胞的表型转变、表达异质性及细胞间通讯，并发现了HLA-KIR的新型相互作用 | NA | 探究老年脓毒症患者免疫反应的病理机制 | 老年脓毒症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年脓毒症患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5484 | 2024-08-07 |
Establishment and Evaluation of Exosomes-Related Gene Risk Model in Hepatocellular Carcinoma
2024-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10441-6
PMID:37405532
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者血液样本中外泌体mRNA表达水平，建立并评估了一个基于外泌体相关基因的风险预测模型，用于肝癌的诊断和预后评估 | 首次证实了与肝癌发生发展相关的六个基因存在于血液外泌体中，可用于肝癌患者的液体活检，避免了穿刺诊断的需要 | NA | 建立一个基于外泌体mRNA表达水平的风险预测模型，用于肝癌的诊断和预后评估 | 肝细胞癌患者血液样本中的外泌体mRNA表达水平 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 液体活检 | Lasso Cox分析 | mRNA数据 | 肝细胞癌患者和正常对照的mRNA数据来自TCGA和exoRBase 2.0数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 5485 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Pro-angiogenic Macrophage Profiles Reveal Novel Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets for Osteosarcoma
2024-Apr, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-023-10483-w
PMID:37603193
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了与骨肉瘤预后相关的促血管生成巨噬细胞亚型，并发现了新的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次报道了促血管生成巨噬细胞在骨肉瘤预后中的作用，并开发了一个基于LASSO算法的预后模型 | NA | 探索骨肉瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤患者的促血管生成巨噬细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO算法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5486 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals RAC1 Involvement in Macrophages Efferocytosis in Diabetic Kidney Disease
2024-Apr, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01942-y
PMID:38064011
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了RAC1在糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用中的作用 | 首次揭示了RAC1在糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用中的关键作用，并通过实验验证了RAC1的表达变化对巨噬细胞功能的影响 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未涉及体内实验验证 | 探讨糖尿病肾病中巨噬细胞吞噬作用相关的分子机制 | 糖尿病肾病中的巨噬细胞及其吞噬作用 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个数据集，包括GSE131882, GSE195460, GSE151302, GSE131685 | NA | NA | NA | NA |
| 5487 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular dynamics and therapeutic effects of astragaloside IV in slow transit constipation
2024-Jan-29, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10187
PMID:38289380
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了黄芪甲苷IV在治疗慢传输型便秘中的细胞动态和治疗效果 | 首次揭示了黄芪甲苷IV对慢传输型便秘模型中肠道细胞比例和功能的调节作用，并通过网络药理学分析了其作用机制 | 研究仅限于动物模型，需要进一步的人体试验验证 | 确定慢传输型便秘模型中结肠组织细胞的动态变化，并研究黄芪甲苷IV治疗的效果 | 慢传输型便秘的小鼠模型和黄芪甲苷IV的治疗效果 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用洛哌丁胺诱导的慢传输型便秘小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5488 | 2024-08-07 |
Dysregulation of endometrial stromal serotonin homeostasis leading to abnormal phosphatidylcholine metabolism impairs decidualization in patients with recurrent implantation failure
2024, Human reproduction open
IF:8.3Q1
DOI:10.1093/hropen/hoae042
PMID:39091587
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研究论文 | 本研究探讨了异常的血清素稳态是否导致反复植入失败（RIF）患者子宫内膜蜕膜化受损 | 发现RIF患者子宫内膜中血清素代谢稳态异常，伴随单胺氧化酶（MAO）表达减少，影响子宫内膜基质细胞的蜕膜化，导致胚胎植入失败 | 研究揭示了血清素代谢稳态受损和MAO表达异常降低是RIF的原因之一，但血清素在子宫内膜中的来源和其他潜在功能仍需进一步探索 | 探讨异常的血清素稳态是否导致反复植入失败（RIF）患者子宫内膜蜕膜化受损及其机制 | 反复植入失败（RIF）患者的子宫内膜样本和生育能力正常的患者子宫内膜样本 | NA | 生殖系统疾病 | ELISA、免疫荧光组织化学、单细胞测序、RNA测序（RNA-seq）、液相色谱-质谱（LC/MS） | NA | 细胞、基因表达数据 | 50个子宫内膜样本（25个RIF患者和25个生育能力正常的患者） | NA | NA | NA | NA |
| 5489 | 2024-08-07 |
Identifying potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1433147
PMID:39092217
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化方法，旨在识别肺腺癌的新治疗靶点 | 本研究采用多组学方法，结合批量和单细胞RNA测序数据，以及孟德尔随机化分析，揭示了肺腺癌的潜在治疗靶点 | NA | 识别肺腺癌的新治疗靶点 | 肺腺癌及其相关基因和细胞类型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 513个肺腺癌组织和59个非肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 5490 | 2024-08-07 |
The role of metabolic memory in diabetic kidney disease: identification of key genes and therapeutic targets
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1379821
PMID:39092227
|
研究论文 | 本研究探讨了代谢记忆在糖尿病肾病中的作用，并通过单细胞RNA测序数据识别关键基因和治疗靶点 | 本研究首次结合人类数据和动物模型，识别出与代谢记忆和纤维化相关的关键基因NDRG1，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库数据和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索代谢记忆在糖尿病肾病中的作用及潜在的治疗靶点 | 糖尿病肾病中的代谢记忆和纤维化相关基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及12种细胞类型，包括人类和动物模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5491 | 2024-08-05 |
scGAAC: A graph attention autoencoder for clustering single-cell RNA-sequencing data
2024-Sep, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.06.010
PMID:38950719
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研究论文 | 提出了一种基于图注意力自编码器的聚类方法scGAAC，以处理单细胞RNA测序数据 | 引入了一种新的聚类方法，通过图注意力自编码器利用细胞间的结构信息，发现潜在关系 | 尽管scGAAC有效，但可能仍然受到数据噪声和高维度的影响 | 研究并改进单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 图注意力自编码器 | 基因表达数据 | 四个真实的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5492 | 2024-08-05 |
A novel mechanism of ferroptosis inhibition-enhanced atherosclerotic plaque stability: YAP1 suppresses vascular smooth muscle cell ferroptosis through GLS1
2024-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401251R
PMID:39091212
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研究论文 | 本研究揭示了通过YAP1抑制血管平滑肌细胞的铁死亡以增强动脉粥样硬化斑块的稳定性的新机制 | 本研究首次阐明了YAP1/GLS1轴在动脉粥样硬化斑块稳定性中的关键作用 | 本研究的局限性在于主要基于动物模型，尚需进一步在人类中验证 | 研究铁死亡在动脉粥样硬化斑块稳定性中的作用及其机制 | 动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA | 在Apoe小鼠模型中进行了实验 | NA | NA | NA | NA |
| 5493 | 2024-08-04 |
Evolving concepts in meningioma management in the era of genomics
2024-Aug-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35279
PMID:38753473
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综述 | 本文探讨了基因组时代脑膜瘤管理的新概念 | 通过分子分析方法，识别具有不良预后的脑膜瘤患者 | 研究主要为综述性，缺乏原始数据支持 | 帮助读者理解脑膜瘤的分子特征，以制定管理和监测策略 | 相关的脑膜瘤患者及其分子特征 | 数字病理 | NA | 分子测序、DNA甲基化、蛋白质组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5494 | 2024-08-04 |
Integrated multi-omics profiling landscape of organising pneumonia
2024-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1782
PMID:39083563
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢重编程在组织性肺炎中的作用，重点关注炎症和纤维化 | 揭示了组织性肺炎与脂质代谢重编程之间的显著关联，并首次确定了CD36在这一过程中的重要角色 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理机制 | 研究脂质代谢重编程在组织性肺炎中的病理生理意义 | 组织性肺炎小鼠模型及其巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、Visium CytAssist空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和质谱 | NA | 组织样本 | 组织性肺炎小鼠模型的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5495 | 2024-08-05 |
Oncostatin M-driven macrophage-fibroblast circuits as a drug target in autoimmune arthritis
2024-Jul-31, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-024-00347-0
PMID:39080781
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研究论文 | 本研究揭示了在自身免疫性关节炎中由OSM驱动的巨噬细胞-成纤维细胞相互作用作为潜在药物靶点 | 确定了OSM信号通路作为JAK抑制剂在体内的主要靶向通路，并证明了巨噬细胞-成纤维细胞电路在自身免疫性关节炎中的关键作用 | 本研究主要基于小鼠模型，可能无法完全应用于人类自身免疫性关节炎 | 确定JAK抑制剂在自身免疫性关节炎中的治疗靶点 | 以胶原诱导性关节炎小鼠为研究对象，探讨巨噬细胞和成纤维细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 胶原诱导性关节炎小鼠的实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5496 | 2024-08-04 |
Enhancer-driven gene regulatory networks inference from single-cell RNA-seq and ATAC-seq data
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae369
PMID:39082647
|
研究论文 | 本研究介绍了一种名为STREAM的新方法，用于推断来自单细胞转录组和染色质可及性数据的增强子驱动基因调控网络 | STREAM结合了Steiner森林问题模型、混合二聚簇管道和次模优化，提供了一种创新的推断方法 | NA | 研究基因调控程序在复杂生物系统中的作用 | 单细胞转录组和染色质可及性数据，以推断增强子驱动的基因调控网络 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病，弥漫性小淋巴细胞淋巴瘤 | RNA-seq，ATAC-seq | 混合二聚簇，次模优化 | 文本 | 涉及阿尔茨海默病和弥漫性小淋巴细胞淋巴瘤的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 5497 | 2024-08-05 |
Identification of a pro-protein synthesis osteosarcoma subtype for predicting prognosis and treatment
2024-07-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-67547-z
PMID:39014082
|
研究论文 | 本研究识别了一种与前蛋白合成相关的骨肉瘤亚型，用于预测预后和治疗 | 提出了一种基于前蛋白合成骨肉瘤相关基因的预后模型，并通过单细胞RNA测序数据识别了七种骨肉瘤亚克隆类型 | 研究可能受限于公共数据库中的单细胞RNA测序数据，缺乏大规模临床验证 | 探讨骨肉瘤发展的机制及其治疗策略 | 主要关注与前蛋白合成相关的骨肉瘤相关基因及其在预后中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5498 | 2024-08-04 |
Elevated SLC3A2 associated with poor prognosis and enhanced malignancy in gliomas
2024-07-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66484-1
PMID:38977800
|
研究论文 | 本研究探讨了SLC3A2在胶质瘤中的预后价值及其影响 | 首次阐明了SLC3A2在胶质瘤中与不良预后和恶性肿瘤特征的相关性 | 依赖公共数据库和临床样本，缺乏进一步的机制研究 | 明确SLC3A2在胶质瘤中的预后意义及其对肿瘤微环境的影响 | 胶质瘤样本及其相关的生物信息学数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | Cox回归分析，功能富集分析，CCK8，克隆形成，迁移和侵袭实验 | 正交胶质瘤异种移植模型 | 生物信息学数据，临床样本 | 使用多个公共数据库和临床胶质瘤样本进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 5499 | 2024-08-04 |
Predicting intercellular communication based on metabolite-related ligand-receptor interactions with MRCLinkdb
2024-Jul-08, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01950-w
PMID:38978014
|
研究论文 | 本文介绍了MRCLinkdb数据库和算法，用于预测基于代谢物相关配体-受体相互作用的细胞间通讯 | MRCLinkdb整合并组织了与非蛋白质配体-受体相互作用相关的数据，填补了现有工具的空白 | 研究主要集中在文献和已知数据库中的相互作用，可能存在数据不全面的情况 | 本研究旨在开发一个数据库，以提供基于代谢物的细胞间通信预测工具 | 本文研究了人类和小鼠的代谢物-配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序，bulk RNA-seq/microarray | NA | 数据集 | 收集了790个人类和670个小鼠的代谢物-配体-受体相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 5500 | 2024-08-04 |
Multiomics profiling of buffy coat and plasma unveils etiology-specific signatures in hepatocellular carcinoma
2024-Jul, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0042
PMID:38486508
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肝细胞癌中致病因素特异性的血液生物标志物。 | 研究提出了根据病毒感染综合分析得出的致病因素特异性基因表达模式，发现了与肝细胞癌相关的新的血液生物标志物。 | 结果需进一步验证，特别是在不同人群和多种致病因素下的普适性和准确性。 | 探索肝细胞癌中特定病因的血液生物标志物，以提高早期检测能力。 | 肝细胞癌患者的buff coat和血浆样本。 | 数字病理学 | 肝癌 | 全转录组测序（WTS）和靶向蛋白组学分析 | NA | 基因表达数据 | 来源于HCC患者的样本及多个独立数据集的DEGs验证 | NA | NA | NA | NA |