单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7515 篇文献，本页显示第 5381 - 5400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5381 | 2024-08-04 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
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评论 | 本研究讨论了空间生物学在乳腺癌中的应用及其影响 | 探讨了空间转录组学和蛋白质组学以及新兴的多重成像技术对乳腺癌研究的贡献 | 未具体提及具体研究数据或样本限制 | 旨在探索空间方法对乳腺癌进展和治疗的理解 | 涉及乳腺癌相关的空间关系及其生物学机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 多重成像技术 | NA | NA | NA |
| 5382 | 2024-08-05 |
Soluble PD-L1 reprograms blood monocytes to prevent cerebral edema and facilitate recovery after ischemic stroke
2024-02, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.12.007
PMID:38070624
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研究论文 | 这篇文章探讨了可溶性PD-L1如何通过重新编程血液单核细胞来预防脑水肿并促进缺血性中风后的恢复。 | 相关研究首次展示了PD-1阳性单核细胞作为sPD-L1的治疗靶点的潜力。 | 研究在小鼠模型中进行，实际临床应用的效果和安全性仍需进一步验证。 | 研究PD-L1在急性缺血性中风恢复中的治疗潜力。 | 研究对象为急性缺血性中风患者的循环单核细胞以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | 小鼠中动脉闭塞（MCAO）模型 | 生物样本 | 涉及人类患者和小鼠模型，具体样本量未列明 |
| 5383 | 2024-08-04 |
Deciphering the shared mechanisms of Gegen Qinlian Decoction in treating type 2 diabetes and ulcerative colitis via bioinformatics and machine learning
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1406149
PMID:38962743
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研究论文 | 本研究探讨了葛根芩莲汤在治疗2型糖尿病和溃疡性结肠炎中的共享机制 | 揭示了T2DM和UC之间的共病机制，并识别了新的生物标志物和治疗策略 | 缺乏临床试验数据以验证研究结果 | 探究T2DM与UC之间的共享致病机制，并阐明葛根芩莲汤的作用机制 | 研究对象包括2型糖尿病和溃疡性结肠炎的相关靶点 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 溃疡性结肠炎 | 生物信息学和机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 5384 | 2024-08-04 |
SlowMoMan: a web app for discovery of important features along user-drawn trajectories in 2D embeddings
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae095
PMID:38962404
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研究论文 | 本文提出了SlowMoMan，一个Web应用程序，用于发现用户绘制的二维嵌入中的重要特征 | 该应用程序解决了非线性低维嵌入与原始高维数据之间关系的难题，并提供了一种可视化和排序功能 | 未提及具体的限制 | 研究如何在二维嵌入中识别和排序重要特征 | 研究对象包括轨迹推断、空间转录组学和细胞分类等应用场景 | 计算机视觉 | NA | 非线性低维嵌入 | NA | 高维数据 | NA |
| 5385 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, Mendelian randomization, and eQTL reveals T cell-related nomogram model and subtype classification in rheumatoid arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1399856
PMID:38962008
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研究论文 | 本文整合多重数据集，探讨类风湿性关节炎（RA）中T细胞的异质性及其相关的诊断模型 | 建立了一种与T细胞相关的诊断模型，提供了RA免疫治疗的新方法 | 研究未提及样本的年龄或性别对不同T细胞模式的影响 | 探讨类风湿性关节炎中的T细胞机制及其分类 | 研究对象为582个与类风湿性关节炎相关的T细胞亚型 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq、bulk RNA-seq、孟德尔随机化（MR）和eQTL | XGB机器学习 | 细胞数据 | 分析了10,211个细胞 |
| 5386 | 2024-08-05 |
Activation of non-classical Wnt signaling pathway effectively enhances HLA-A presentation in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1336106
PMID:38962268
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研究论文 | 本研究识别了急性淋巴细胞白血病（AML）中造血干细胞前体（HSC-Prog）的克隆异质性，并探讨了与AML免疫逃逸相关的分子通路 | 首次揭示非经典Wnt信号通路在AML中与HLA-A呈现的关系 | 未明确涉及样本的多样性或实验结果的临床应用 | 识别AML中造血干细胞前体的克隆异质性并探讨与免疫逃逸相关的分子机制 | 急性髓性白血病（AML）患者的造血干细胞前体 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大规模RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA（mRNA） | 样本数量未具体说明 |
| 5387 | 2024-08-05 |
A mitochondria-related genes associated neuroblastoma signature - based on bulk and single-cell transcriptome sequencing data analysis, and experimental validation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415736
PMID:38962012
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研究论文 | 本文建立了一种与线粒体相关基因相关的神经母细胞瘤标志，通过数据分析和实验验证进行了研究 | 提出了一个新的预测工具，能够有效评估神经母细胞瘤患者的预后和对化疗药物的敏感性 | 研究可能未涵盖所有类型的神经母细胞瘤患者，且数据集的多样性有限 | 旨在分析线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的重要性及其在患者预后中的应用 | 本研究对象为神经母细胞瘤患者及其相关的线粒体相关基因 | 数字病理 | 神经母细胞瘤 | 转录组测序 | 一致性聚类和机器学习算法 | 单细胞和整体转录组数据 | NA |
| 5388 | 2024-08-05 |
Elucidating the role of angiogenesis-related genes in colorectal cancer: a multi-omics analysis
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1413273
PMID:38962272
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析阐明了血管生成相关基因在结直肠癌中的重要性 | 研究中识别了结直肠癌中的两种血管生成相关亚型及其四个关键基因，为个性化治疗提供了新见解 | 在基因突变与亚型的关联方面未发现显著性 | 探索血管生成相关基因在结直肠癌中的作用及其机制 | 结直肠癌患者及其血管生成相关基因的表达 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RT-PCR, scRNA-seq | LASSO, Xgboost, 决策树 | 基因表达数据 | NA |
| 5389 | 2024-08-05 |
LSD1/KDM1A and GFI1B repress endothelial fate and induce hematopoietic fate in induced pluripotent stem cell-derived hemogenic endotheliums
2024-Jul-04, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285214
PMID:38961746
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子GFI1B及其共因子LSD1/KDM1A在胚胎内皮转化过程中的作用 | 揭示了LSD1/KDM1A和GFI1B在不同细胞亚群中的时间点功能对血液生成的影响 | 未能在未分化的HE细胞中检测到GFI1B的表达 | 理解诱导多能干细胞转化为血液生成细胞的机制 | 使用患者来源的iPSC线和健康的iPSC线进行对比研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多条患者来源的iPSC线和健康iPSC线 |
| 5390 | 2024-08-04 |
Spatial Dissection of the Immune Landscape of Solid Tumors to Advance Precision Medicine
2024-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0699
PMID:38657223
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综述 | 本论文概述了在实体肿瘤中空间免疫景观的分析方法，以促进精准医疗。 | 介绍了空间转录组学和蛋白质组学的最新进展及其在肿瘤免疫细胞组成分析中的应用 | 未提及具体的研究限制 | 深入了解实体肿瘤的异质性免疫景观，以改善预后和治疗反应预测 | 重点研究实体肿瘤中的免疫细胞成分及其在肿瘤微环境中的角色 | 数字病理学 | 固体恶性肿瘤 | 空间多组学技术 | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |
| 5391 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing: Technological Progress and Biomedical Application in Cancer Research
2024-Jul, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-023-00777-0
PMID:37322261
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用 | 强调了scRNA-seq在肿瘤异质性分析和个性化医学中的潜在应用 | 未提及具体的技术局限性 | 探讨单细胞RNA测序在癌症研究中的应用和技术进展 | 单细胞RNA测序技术及其对癌症和疾病的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 5392 | 2024-08-04 |
Comprehensive investigation of malignant epithelial cell-related genes in clear cell renal cell carcinoma: development of a prognostic signature and exploration of tumor microenvironment interactions
2024-Jul-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05426-x
PMID:38951896
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研究论文 | 本文全面研究了透明细胞肾细胞癌中的恶性上皮细胞相关基因及其临床相关性 | 建立了一个预后模型MECRGS，并在多个队列中显示出优越的预测性能 | 未提及具体的样本来源和大小 | 探讨恶性上皮细胞相关基因在透明细胞肾细胞癌中的功能和临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌中的219个恶性上皮细胞相关基因 | 数字病理 | 肾癌 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA |
| 5393 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of Crohn's disease: Unveiling heterogeneity and evaluating ustekinumab outcomes
2024-Jul, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3715
PMID:38962887
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序揭示克罗恩病的细胞复杂性，识别关键细胞群体及其转录组特征 | 揭示了克罗恩病中八种不同细胞类型及其重要的成纤维细胞和T细胞相互作用，为疾病机制和治疗靶点提供了新见解 | 未提及具体的样本大小和长期疗效评估 | 探究克罗恩病的细胞组成及其与健康对照的差异 | 克罗恩病患者与健康对照者的细胞组成 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5394 | 2024-08-05 |
Exploring the role of CD8+ T cells in clear renal cell carcinoma metastasis
2024-Jul, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13819
PMID:38872260
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研究论文 | 本研究探讨了CD8+ T细胞在透明细胞肾细胞癌转移中的作用 | 首次将CD8 T细胞根据其基因特征分类为四个亚群，并发现其与预后差相关 | 缺乏临床样本的直接验证 | 揭示透明细胞肾细胞癌转移中CD8 T细胞的功能和特征 | 透明细胞肾细胞癌中的CD8 T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 5395 | 2024-08-05 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing, NK cell marker genes reveal a prognostic and immune status in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-07-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65917-1
PMID:38951569
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研究论文 | 该研究探讨了NK细胞标记基因与胰腺导管腺癌患者的预后和免疫反应之间的关系 | 本研究首次通过构建NK细胞标记基因的签名预测胰腺癌患者的预后，并与免疫状态显示了强相关性 | 本研究的局限性在于样本主要依赖于公开数据库，可能存在选择偏倚 | 研究NK细胞在胰腺导管腺癌中的作用及其对患者预后的影响 | 研究胰腺导管腺癌患者中的NK细胞标记基因及其相关性 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和RNA测序 | Cox分析 | 基因表达数据 | 纳入7个NK细胞标记基因，验证了6个GEO数据集的预测能力 |
| 5396 | 2024-08-04 |
Advances in single-cell long-read sequencing technologies
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae047
PMID:38774511
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综述 | 本文讨论了单细胞长读长测序技术的最新进展 | 提供了针对细胞复杂性来源的新见解，并强调了单细胞RNA异构体测序(scRiso-seq)的显著进展 | 主要集中在下游分析的实际考虑和操作挑战上 | 探讨单细胞测序技术在转录组和基因组研究中的应用 | 长读长测序技术在单细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 长读长测序 | NA | RNA和DNA序列 | NA |
| 5397 | 2024-08-04 |
scRNA-seq Reveals Novel Genetic Pathways and Sex Chromosome Regulation in Tribolium Spermatogenesis
2024-03-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae059
PMID:38513111
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研究论文 | 该研究揭示了赤面粉甲虫中生殖细胞发生的新遗传通路和性染色体调控机制 | 首次展示了棉果科昆虫中生殖细胞发生的特异性标记和分子通路 | 研究主要集中在非模式生物，可能缺乏与已知编码分子的直接比较 | 探索赤面粉甲虫的生殖细胞发生过程及其分子基础 | 研究对象为赤面粉甲虫的成年雄性睾丸中的细胞群体 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性赤面粉甲虫的睾丸样本 |
| 5398 | 2024-08-05 |
Tyrosine Kinase Inhibition Activates Intratumoral γδ T Cells in Gastrointestinal Stromal Tumor
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0061
PMID:37922405
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研究论文 | 本研究探讨酪氨酸激酶抑制对胃肠道间质瘤中γδ T细胞的影响 | 发现酪氨酸激酶抑制能够进一步刺激肿瘤内γδ T细胞，并揭示其在免疫疗法中的潜在靶向作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的生物反应 | 探讨酪氨酸激酶抑制对胃肠道间质瘤中γδ T细胞的作用机制 | 使用转基因小鼠模型研究γδ T细胞及其在胃肠道间质瘤中的作用 | 数字病理学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括转基因小鼠模型和新鲜人类胃肠道间质瘤标本 |
| 5399 | 2024-08-04 |
Immunophenotypic characterization of leukemic stem cells in acute myeloid leukemia using single tube 10-colour panel by multiparametric flow cytometry: Deciphering the spectrum, complexity and immunophenotypic heterogeneity
2024-Aug, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.14250
PMID:38456256
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研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术对急性髓性白血病中的白血病干细胞进行免疫表型特征的全面分析。 | 提出了一种单管10色多参数流式细胞术面板，能够轻松、可重复地区分白血病干细胞和正常造血干细胞，并揭示了免疫表型的异质性。 | 研究中样本数量有限，且对不同亚群的区分可能受到样本特征的影响。 | 探讨急性髓性白血病中白血病干细胞的免疫表型特征及其异质性。 | 急性髓性白血病患者的骨髓抽取样本。 | 数字病理 | 急性髓性白血病 | 多参数流式细胞术（MFC）和单细胞测序 | NA | 生物样本（骨髓抽取样本） | 从255个样本中评估225个白血病干细胞和183个正常造血干细胞 |
| 5400 | 2024-08-04 |
SLC16A3 is a Prognostic Marker and Affects Immune Regulation in Bladder Cancer
2024-Jul-02, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究探讨了SLC16A3在膀胱癌中的表达及其预后标志物功能。 | 首次系统分析SLC16A3在膀胱癌中的作用及其与免疫调节的关系。 | 研究内容主要基于公共数据库，可能存在样本选择偏倚。 | 探讨SLC16A3在膀胱癌中的预后和免疫调节作用。 | 412名膀胱癌患者及3115个膀胱癌细胞样本。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序、逆转录定量聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据、细胞样本 | 412名膀胱癌患者和3115个膀胱癌细胞样本 |