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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-06 |
Serum and tear autoantibodies from NOD and NOR mice as potential diagnostic indicators of local and systemic inflammation in Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1516330
PMID:39936155
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研究论文 | 本研究通过分析NOD和NOR小鼠模型中的血清和泪液自身抗体,探索其在干燥综合征局部和全身炎症中的诊断潜力 | 首次系统比较干燥综合征小鼠模型泪液与血清中自身抗体谱差异,特别是发现泪液IgA同型自身抗体多样性高于IgG,并证实泪腺三级淋巴结构是泪液自身抗体的可能来源 | 仅使用两种雄性小鼠模型(NOD和NOR),未涵盖SjD所有表型;泪液自身抗体临床转化价值有待人体验证 | 评估泪液和血清自身抗体作为干燥综合征相关自身免疫性泪腺炎生物标志物的诊断价值 | NOD和NOR小鼠(干燥综合征相关泪腺炎模型)及健康对照BALB/c小鼠 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 自身抗体微阵列、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 免疫荧光图像、自身抗体阵列数据、单细胞转录组数据 | 两种SjD小鼠模型(NOD和NOR)及健康对照BALB/c小鼠的血清和泪液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 利用GSE132420数据集的10x Chromium单细胞RNA测序分析泪腺免疫细胞 |
| 522 | 2026-05-06 |
The cancer-associated fibroblasts interact with malignant T cells in mycosis fungoides and promote the disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474564
PMID:39963655
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究蕈样肉芽肿中癌症相关成纤维细胞与恶性T细胞的相互作用及其促进疾病进展的机制 | 首次揭示蕈样肉芽肿中恶性T细胞从组织驻留记忆T细胞向中央记忆T细胞表型转化的双表型特征,并发现炎性癌症相关成纤维细胞与恶性T细胞通过IL-6/JAK2/STAT3/SOX4或IL-6/HIF-1α/SOX4通路形成正反馈环路,SOX4可能成为关键干预靶点 | 样本量可能有限,且具体样本数量未在摘要中明确;主要基于单细胞测序数据,需进一步功能性验证 | 阐明蕈样肉芽肿的发病机制及肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的作用 | 晚期蕈样肉芽肿患者的肿瘤组织、邻近正常组织和外周血单个核细胞,以及健康对照 | 数字病理学 | 蕈样肉芽肿(皮肤T细胞淋巴瘤) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括晚期MF患者和健康对照的多个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 523 | 2026-05-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051
PMID:40084238
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的外周血单个核细胞,揭示先天性和适应性免疫反应机制对疾病异质性的影响 | 首次在单细胞水平上比较无皮肤银屑病的银屑病关节炎患者与伴有皮肤银屑病的银屑病关节炎患者的基因表达差异,揭示临床表型与免疫机制之间的关联 | 直接比较两组患者未发现差异表达基因,且样本量有限 | 探索银屑病关节炎患者临床异质性与免疫机制的关联,区分不同临床表型在免疫细胞水平上的差异 | 70名银屑病关节炎患者(包括无皮肤银屑病和伴有皮肤银屑病两种表型)和10名健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 70名银屑病关节炎患者和10名健康对照者的外周血单个核细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Rhapsody™ 单细胞分析系统 |
| 524 | 2026-05-05 |
Single-cell analysis revealing the metabolic landscape of prostate cancer
2024-09-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja20243
PMID:38657119
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示前列腺癌的代谢景观 | 利用计算流程进行单细胞RNA测序,首次描绘了前列腺癌中上皮细胞与基质细胞的代谢活性差异,并发现神经内分泌细胞具有高代谢率,可能解释神经内分泌前列腺癌的高营养和能量需求 | 仅基于计算和部分实验验证,未进行大规模临床样本验证 | 通过单细胞水平分析揭示前列腺癌的代谢异质性和疾病进展机制 | 前列腺癌细胞及其微环境中的上皮细胞、基质细胞和神经内分泌细胞 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2026-05-05 |
Graph Fourier transform for spatial omics representation and analyses of complex organs
2024-08-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51590-5
PMID:39209833
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研究论文 | 介绍Spatial Graph Fourier Transform (SpaGFT)方法,利用图信号处理技术对空间组学数据进行表征分析,支持复杂器官的空间生物学研究 | 提出基于图傅里叶变换的空间组学表征方法,可解释性强,能识别空间可变基因和稀有亚细胞结构,并提升多种机器学习任务的准确性 | NA | 开发一种可解释的图表示方法用于空间组学数据的表征和分析 | 人类和小鼠的空间转录组数据、人类淋巴结Visium数据、人类扁桃体CODEX数据、高分辨率空间蛋白组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学、空间蛋白组学、图信号处理 | 图傅里叶变换 | 空间组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 526 | 2026-05-05 |
High-resolution diffusion magnetic resonance imaging and spatial-transcriptomic in developing mouse brain
2024-08-15, NeuroImage
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120734
PMID:39032791
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研究论文 | 该研究获取了小鼠发育大脑的32微米各向同性分辨率多壳扩散磁共振成像数据集,并整合艾伦发育小鼠脑图谱的空间转录组学数据,探究脑组织微观结构变化 | 首次提供了包括DTI、DKI和NODDI模型的高分辨率dMRI来追踪小鼠出生后大脑白质和灰质的微观结构变化,并强调了空间转录组学与dMRI的基因型-表型相关性 | 未见明确说明 | 利用高分辨率扩散磁共振成像和空间转录组学探究发育中小鼠大脑的微观结构变化及其分子基础 | 出生后不同天数的小鼠大脑 | 机器学习 | NA | 高分辨率扩散磁共振成像,空间转录组学 | NA | 图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 527 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13592
PMID:38158643
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综述 | 综述单细胞RNA测序技术在揭示癌症相关成纤维细胞异质性中的应用 | 从单细胞RNA测序视角系统综述癌症相关成纤维细胞异质性,并探讨多模态单细胞平台整合策略 | 未提供具体实验验证或定量分析结果 | 探讨单细胞RNA测序在理解癌症相关成纤维细胞异质性中的应用及临床转化潜力 | 癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2026-05-04 |
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07797-z
PMID:39112713
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研究论文 | 通过体内外模型研究致癌RAS剂量滴定如何改变衰老状态并影响肿瘤起始 | 首次开发RAS剂量递增模型,揭示低剂量RAS驱动的非连续性下游表型,并发现NRAS(G12V)水平降低可导致肝细胞免疫逃逸与肿瘤形成 | 未明确说明局限性 | 探究致癌RAS剂量变化对衰老表型及肿瘤起始的影响 | 肝细胞衰老模型中的小鼠肝细胞及肿瘤 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝细胞样本及肿瘤样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2026-05-04 |
Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation
2024-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010
PMID:39027343
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人皮质骨细胞图谱,发现一种新型破骨细胞亚群——骨静细胞(OSCs),其具有高趋化活性,可招募间充质干细胞,参与骨重塑中的逆转阶段 | 首次鉴定出IDO1高表达/CCL3高表达/CCL4高表达的破骨细胞前体亚群(骨静细胞),并证明其在骨重塑逆转期具有最强的间充质干细胞趋化能力,揭示了破骨细胞系早期阶段与骨形成偶联的新机制 | 该研究主要基于单细胞转录组数据和体外共培养实验,骨静细胞在体内骨重塑中的具体功能及其作为治疗靶点的可行性仍需进一步验证 | 阐明骨髓炎后骨重塑失败的细胞和分子机制,探索破骨细胞系在骨形成与骨吸收偶联中的作用 | 人皮质骨(正常、感染和重建状态)样本,以及正常小鼠胫骨骨折模型和骨髓炎相关胫骨骨折模型 | 数字病理学, 机器学习 | 骨髓炎, 骨延迟愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞转录组)、图像(免疫荧光、生物发光成像) | 人皮质骨样本(具体数量未提及,包含正常、感染和重建三种状态),小鼠模型样本(正常骨折和骨髓炎骨折模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2026-05-04 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
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研究论文 | 通过机器学习选择骨肉瘤免疫细胞标志物,构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架结合20种机器学习算法构建基于肿瘤浸润免疫细胞的预后模型,并发现CLK1作为潜在癌基因促进骨肉瘤细胞增殖和迁移 | 未提及具体的局限性 | 提高对骨肉瘤肿瘤微环境的理解,开发预后模型并识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤患者临床和RNA表达数据、单细胞RNA测序数据以及人骨肉瘤细胞系MG63和U2OS | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11例骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-05-03 |
Aging-induced immune microenvironment remodeling fosters melanoma in male mice via γδ17-Neutrophil-CD8 axis
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55164-3
PMID:39738047
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科研论文 | 通过单细胞RNA测序揭示雄性小鼠中衰老诱导的免疫微环境重塑通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进黑色素瘤转移 | 首次发现衰老通过下调S1pr1驱动γδ17细胞扩增,进而招募促肿瘤中性粒细胞抑制CD8+T细胞功能,形成γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移 | 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究衰老免疫系统如何促进肿瘤转移的机制 | 年轻与年老雄性小鼠的肺免疫微环境 | 单细胞转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及年轻和年老雄性小鼠的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 532 | 2026-05-03 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
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综述 | 该文章综述了空间生物学方法(包括空间转录组学和蛋白质组学)如何促进对乳腺癌进展和治疗的理解,并探讨了新兴多重成像技术的影响 | 强调了空间生物学方法在揭示乳腺癌空间关系中的创新性应用,以及多重成像技术如何推动该领域未来发展 | 未明确提及具体局限性,但作为综述,可能依赖于现有研究并缺乏新实验数据 | 总结空间生物学方法在乳腺癌研究中的贡献,并展望未来研究方向 | 乳腺癌的空间生物学 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,蛋白质组学 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 533 | 2026-05-02 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-08-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
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研究论文 | 提出了一个基于细胞谱系的模型,模拟侧枝形成过程中体细胞表观遗传漂变对分生组织表观遗传多样性的影响 | 首次将体细胞表观遗传漂变与侧枝形成的脱离子叶模型结合,预测了茎尖分生组织DNA甲基化异质性在发育过程中收敛于非零状态 | 模型假设自由细胞独立性最大化,可能简化了不同物种或环境条件下的实际分支过程复杂性 | 探索侧枝形成过程中体细胞表观遗传漂变的动态及其对分生组织表观遗传变异的影响 | 植物茎尖分生组织和腋芽前体细胞 | 机器学习 | NA | NA | 细胞谱系模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2026-05-02 |
scRNA-seq reveals that origin recognition complex subunit 6 regulates mouse spermatogonial cell proliferation and apoptosis via activation of Wnt/β-catenin signaling
2024-01-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202330
PMID:37788012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现ORC6通过激活Wnt/β-catenin信号调控小鼠精原细胞增殖与凋亡 | 首次揭示ORC6在精原细胞中上调并通过Wnt/β-catenin信号通路调控精原细胞增殖与凋亡 | 研究仅限于小鼠C18-4细胞系,需在体内实验进一步验证 | 探究ORC6基因在精原细胞增殖和凋亡中的作用机制 | 小鼠睾丸精原细胞及C18-4细胞系 | 单细胞转录组学 | 生殖相关疾病 | scRNA-seq, 西方印迹, 免疫荧光, EdU, TUNEL, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 细胞系实验数据 | 小鼠睾丸组织样本及C18-4细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-05-02 |
Identification and Validation of Cytotoxicity-Related Features to Predict Prognostic and Immunotherapy Response in Patients with Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/3468209
PMID:39247556
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研究论文 | 基于细胞毒性相关特征构建并验证透明细胞肾细胞癌患者预后及免疫治疗反应预测模型 | 首次利用单细胞RNA测序数据鉴定细胞毒性相关T细胞簇,并基于此构建预后风险模型,结合免疫浸润分析评估免疫治疗反应 | 仅依赖公共数据集GSE224630,缺乏独立外部验证队列;模型临床转化需进一步前瞻性研究验证 | 开发基于细胞毒性相关特征的预后模型,指导ccRCC患者免疫治疗决策 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | 机器学习和数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因共表达网络分析(WGCNA)、免疫浸润分析(CIBERSORT、MCP-counter、TIMER) | Cox比例风险模型、列线图 | 单细胞转录组数据和批量转录组数据 | GSE224630数据集中的ccRCC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2026-05-01 |
Combined single cell and spatial transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity of hedgehog pathway in gastric cancer
2024-12, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-024-00297-0
PMID:39251886
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研究论文 | 结合单细胞和空间转录组分析揭示胃癌中Hedgehog通路的细胞异质性 | 首次综合运用单细胞测序和空间转录组学深入探讨Hedgehog通路在胃癌中的作用,发现CCND1在成纤维细胞末端发育中起关键作用,并揭示其与肿瘤相关成纤维细胞形成及患者预后和治疗的关联 | 未提供明确的限制信息,但可能包括样本数量有限、验证仅基于bulk转录组数据等潜在局限 | 深入研究Hedgehog通路在胃癌中的作用,寻找潜在治疗靶点 | 胃癌肿瘤组织中的成纤维细胞及CCND1相关的细胞亚群 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, bulk转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, bulk转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及胃癌肿瘤组织、单细胞及空间转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2026-05-01 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomics to elucidate the role and potential mechanisms of autophagy in aging tissue
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00996-w
PMID:39414741
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研究论文 | 利用批量与单细胞转录组学结合的方法,揭示自噬在衰老组织中的作用及潜在机制 | 首次系统鉴定了与衰老最相关的组织为血液组织,并通过单细胞分辨率发现经典单核细胞中自噬水平升高与衰老密切相关,同时揭示了缺氧、促炎因子和活性氧在其中的作用 | 未详细说明,但可能涉及样本来源有限(如仅包括正常与急性髓系白血病样本)及机制验证不足 | 识别与衰老过程中自噬相关性最强的组织,并探索自噬在衰老组织微环境中的功能和机制 | 健康组织样本(超过7000个批量RNA-seq)、不同年龄血液单细胞测序数据、急性髓系白血病(AML)批量与单细胞数据 | 自然语言处理 | 急性髓系白血病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过7000个正常组织批量RNA-seq样本、不同年龄血液单细胞样本、超过2000个AML批量RNA-seq样本及多组AML单细胞数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 538 | 2026-05-01 |
Non-glycanated ΔDCN isoform in muscle invasive bladder cancer mediates cancer stemness and gemcitabine resistance
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-00998-8
PMID:39466536
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研究论文 | 本研究探讨了非糖基化ΔDCN亚型在肌层浸润性膀胱癌中促进癌症干细胞性和吉西他滨耐药的机制 | 首次在膀胱癌干细胞中鉴定出非糖基化ΔDCN亚型,并阐明其通过细胞质定位差异促进干细胞表型和化疗耐药,与糖基化DCN的抗肿瘤功能形成鲜明对比 | 未具体说明研究局限性 | 探究DCN对膀胱癌干细胞的调控作用及其在肌层浸润性膀胱癌中的潜在机制 | 膀胱癌干细胞(BCSCs)和肌层浸润性膀胱癌(MIBC) | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据、临床病理数据、生存数据 | 从TCGA和GEO获取数据,涉及临床组织样本和膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2026-05-01 |
Exploring tumor microenvironment interactions and apoptosis pathways in NSCLC through spatial transcriptomics and machine learning
2024-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-024-01025-6
PMID:39699801
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研究论文 | 通过空间转录组学和机器学习探索非小细胞肺癌中肿瘤微环境相互作用与凋亡通路 | 结合单细胞测序、空间转录组学、孟德尔随机化和多种机器学习算法构建预后模型,并验证SLC7A5基因在NSCLC中的功能 | 未提及具体局限性 | 探索程序性细胞死亡在NSCLC中的作用机制及潜在治疗靶点 | 非小细胞肺癌(NSCLC)细胞及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化 | 多种机器学习算法(如LASSO、随机森林等) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA(未提及具体样本量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 540 | 2026-05-01 |
YY1 knockout in pro-B cells impairs lineage commitment, enabling unusual hematopoietic lineage plasticity
2024-10-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351734.124
PMID:39362773
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研究论文 | 本研究揭示YY1转录因子在pro-B细胞中敲除后导致B细胞谱系承诺丧失,赋予细胞异常的造血谱系可塑性 | 首次发现YY1在pro-B细胞阶段敲除可完全消除B细胞谱系承诺,并使细胞重获向T细胞等多谱系分化的能力,揭示了YY1在造血谱系决定中的关键调控作用 | 未明确说明研究限制 | 探究YY1转录因子在B细胞发育中pro-B细胞阶段对谱系承诺的调控作用 | YY1敲除的pro-B细胞及其分化后的T细胞样细胞 | 机器学习 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序、RNA测序、ChIP测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |