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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-06 |
Single-cell exome sequencing reveals polyclonal seeding and TRPS1 mutations in colon cancer metastasis
2024-09-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01960-8
PMID:39307879
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研究论文 | 通过单细胞外显子测序揭示结肠癌转移中的多克隆播散和TRPS1基因突变机制 | 首次在单细胞水平证明结肠癌肝转移和淋巴转移均来源于多克隆循环肿瘤细胞,并发现TRPS1 R544Q突变通过TRPS1/ZEB1轴促进癌症侵袭转移 | 研究仅基于一例IV期结肠癌患者,样本量有限 | 探索结肠癌转移的克隆演化和遗传异质性机制 | 结肠癌患者的原发肿瘤、肝转移灶和淋巴转移灶 | 癌症基因组学 | 结肠癌 | 单细胞外显子测序,单细胞转录组分析 | NA | 基因组测序数据,转录组数据 | 来自1例IV期结肠癌患者的150个单细胞(包括原发肿瘤、肝转移和淋巴转移) | NA | 单细胞外显子测序,单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 522 | 2025-10-06 |
A new paradigm for generating high-quality cardiac pacemaker cells from mouse pluripotent stem cells
2024-09-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01942-w
PMID:39237509
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研究论文 | 本研究开发了一种通过双起搏细胞标记物和模拟发育路径从小鼠多能干细胞生成高质量心脏起搏细胞的新方法 | 采用双标记物Shox2和Hcn4建立报告细胞系,并通过FSK方法显著提高起搏细胞产量,同时通过单细胞RNA测序绘制分化轨迹并鉴定关键调控因子ZFP503 | 研究仅使用小鼠多能干细胞,尚未在人类细胞中验证 | 开发高质量心脏起搏细胞的分化策略以推进心脏生物起搏技术 | 小鼠多能干细胞及其分化的心脏起搏细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,干细胞分化 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-10-06 |
FGF Signaling Regulates Development of the Anterior Fontanelle
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.14.603452
PMID:39071418
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGF信号通过调控WNT信号通路调节前囟门闭合和额缝形成的机制 | 首次在前囟门中发现FGF-WNT信号回路,揭示了SCX+细胞区域选择性分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究FGF信号如何调控前囟门闭合和额缝形成的发育过程 | 小鼠前囟门发育过程中的细胞分化和信号通路 | 发育生物学 | 颅缝早闭症 | 单细胞转录组学,小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2025-10-06 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验探讨NDC80/HEC1在胶质瘤中的作用机制及其预后价值 | 首次发现HEC1通过促进巨噬细胞从M1向M2表型转化来调控肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索HEC1在胶质瘤发生发展中的功能及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤组织和细胞系 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 共培养实验 | NA | RNA测序数据, 实验数据 | 人类胶质瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2025-10-06 |
Targeting MS4A4A: A novel pathway to improve immunotherapy responses in glioblastoma
2024-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14791
PMID:38997808
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研究论文 | 本研究探索通过抑制MS4A4A驱动M2巨噬细胞向M1表型极化,以增强胶质母细胞瘤对PD-1免疫疗法的反应 | 首次揭示MS4A4A通过铁死亡途径调控巨噬细胞极化的新机制,并提出联合免疫检查点阻断治疗的新策略 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索MS4A4A抑制在改善胶质母细胞瘤免疫治疗反应中的作用 | 胶质母细胞瘤相关的肿瘤相关巨噬细胞,特别是M2表型巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析,流式细胞术,Western blot | NA | 基因表达数据,空间分布数据,蛋白质数据 | 小鼠皮下和原位移植模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 526 | 2025-10-06 |
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14822
PMID:38923860
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研究论文 | 本研究通过神经胶质瘤组织和类器官证实COVID-19可导致神经系统损伤 | 首次发现神经胶质瘤组织具有易感SARS-CoV-2感染的固有特性,并建立神经胶质瘤类器官作为中枢神经系统SARS-CoV-2感染的研究模型 | 样本来源仅限于神经胶质瘤患者,缺乏其他神经系统疾病的对照研究 | 探究SARS-CoV-2侵入中枢神经系统的机制及COVID-19导致的神经损伤 | 神经胶质瘤患者的组织样本和神经胶质瘤类器官 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 空间转录组分析,单细胞测序 | 类器官模型 | 组织样本,转录组数据 | 神经胶质瘤患者组织样本及衍生类器官 | NA | 空间转录组,单细胞测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-10-06 |
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus
IF:3.3Q1
DOI:10.3171/2024.2.FOCUS2417
PMID:38691860
|
综述 | 本文系统回顾了脊索瘤分子发病机制的科学发现及其临床治疗意义 | 整合单细胞转录组分析、空间转录组学和游离DNA等新兴技术,揭示脊索瘤异质性分子通路 | NA | 总结脊索瘤分子发病机制的最新进展及其对神经外科治疗的增强作用 | 脊索瘤肿瘤发生机制与治疗反应 | 数字病理 | 脊索瘤 | 单细胞转录组分析, 空间转录组学, 游离DNA分析, 基因组学, 转录组学, 表观基因组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 528 | 2025-10-06 |
Exploring the potential relationship between short sleep risks and cognitive function from the perspective of inflammatory biomarkers and cellular pathways: Insights from population-based and mice studies
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14783
PMID:38797980
|
研究论文 | 通过人群和动物研究探讨短睡眠风险与认知功能的关系及其炎症机制 | 结合人群流行病学数据与单细胞转录组学分析,揭示短睡眠通过炎症通路影响认知功能的细胞机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系,小鼠模型结果向人类外推需谨慎 | 研究短睡眠对认知功能的影响及其分子机制 | 美国NHANES人群数据(2011-2014)和实验小鼠 | 生物医学研究 | 认知功能障碍 | 生物信息学分析, 单细胞转录组测序, GO和KEGG富集分析 | NA | 血液检测数据, 认知测试数据, 基因表达数据 | NHANES人群数据(2011-2014)和小鼠实验数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | GSE137665单细胞转录组数据集 |
| 529 | 2025-10-06 |
Circulating cancer-specific CD8 T cell frequency is associated with response to PD-1 blockade in Merkel cell carcinoma
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101412
PMID:38340723
|
研究论文 | 本研究通过检测默克尔细胞癌患者血液中MCPyV特异性CD8 T细胞频率,发现其与PD-1抑制剂治疗反应密切相关 | 首次系统鉴定病毒驱动型癌症特异性T细胞,并揭示循环癌症特异性CD8 T细胞频率与免疫治疗疗效的强关联性 | 样本量有限(27例患者),且主要针对病毒相关默克尔细胞癌 | 探究癌症特异性T细胞在PD-1阻断治疗应答中的作用机制 | 默克尔细胞癌患者 | 癌症免疫学 | 默克尔细胞癌 | 多肽-HLA-I多聚体技术,26色流式细胞术,单细胞转录组测序,T细胞受体测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 27例默克尔细胞癌患者 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 530 | 2025-10-06 |
An alternative splicing signature defines the basal-like phenotype and predicts worse clinical outcome in pancreatic cancer
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101411
PMID:38325381
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研究论文 | 本研究发现了胰腺癌基底样亚型的特异性剪接特征及其与预后的关联 | 首次鉴定出QKI剪接因子作为基底样亚型决定因子,揭示了剪接调控在胰腺癌亚型分化中的新机制 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 探索剪接失调在胰腺癌亚型分化中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的分子亚型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 531 | 2025-10-06 |
Surface CD52, CD84, and PTGER2 mark mature PMN-MDSCs from cancer patients and G-CSF-treated donors
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101380
PMID:38242120
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术识别了成熟PMN-MDSCs的特异性基因标记,并发现CD52、CD84和PTGER2可作为其潜在表面标志物 | 首次聚焦于成熟PMN-MDSCs的分子特征,发现了跨癌症类型和G-CSF处理供体的共享基因标记,并识别出三个新型表面标志物 | 研究样本来源包括癌症患者和G-CSF处理供体,但未明确样本规模及癌症类型的全面覆盖程度 | 精确分子表征循环多形核髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs),特别是成熟亚群的特异性标志物 | 癌症患者和G-CSF处理的健康供体的成熟PMN-MDSCs及肿瘤相关中性粒细胞 | 免疫学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-10-06 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌在治疗过程中的谱系与生态演化模型 | 提出基于谱系与生态评分的联合动态分析框架,首次在单细胞水平揭示肝癌治疗响应的演化轨迹 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 建立监测肿瘤治疗响应演化的分析框架 | 肝细胞癌患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 谱系-生态评分系统 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 纵向肿瘤活检样本+716例肝癌患者验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 533 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Interaction between CCL19+ Inflammatory Keratinocytes and CCR7+ Dendritic Cells and B Cells in Pemphigus
2024-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.03.016
PMID:38537931
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-09-07 |
Bridging gaps: a neural network approach for cross-species scRNA-seq analysis in COVID-19
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105324
PMID:39236555
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2025-10-06 |
Revealing the crucial roles of suppressive immune microenvironment in cardiac myxoma progression
2024-08-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01912-2
PMID:39090109
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了心脏粘液瘤中抑制性免疫微环境的关键作用 | 首次构建心脏粘液瘤的单细胞图谱,发现粘液瘤细胞具有成纤维细胞样特征但表达独特的磷酸二酯酶和增殖相关基因,并揭示了M2样巨噬细胞浸润与栓塞发生的临床关联 | 样本数量有限,体外共培养实验未能完全模拟体内复杂微环境 | 解析心脏粘液瘤的细胞组成和免疫微环境特征 | 心脏粘液瘤组织和其中的细胞群体 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 75,641个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2025-10-06 |
A Cullin 5-based complex serves as an essential modulator of ORF9b stability in SARS-CoV-2 replication
2024-06-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01874-5
PMID:38937432
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研究论文 | 本研究揭示了CUL5-TOM70-HSP90α复合物通过调控ORF9b蛋白稳定性在SARS-CoV-2复制中的关键作用 | 首次发现ORF9b蛋白在K67位点发生泛素化并通过蛋白酶体途径降解,鉴定出TOM70作为底物受体连接ORF9b与HSP90α和CUL5形成复合物 | 未明确说明研究的样本规模和技术重复次数 | 阐明SARS-CoV-2 ORF9b蛋白的稳定性调控机制及其在病毒复制中的作用 | SARS-CoV-2病毒ORF9b蛋白及其与宿主蛋白的相互作用 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞测序,蛋白质泛素化分析 | NA | 测序数据,蛋白质相互作用数据 | COVID-19患者肺上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 537 | 2025-10-06 |
Inhibition of the eukaryotic initiation factor-2α kinase PERK decreases risk of autoimmune diabetes in mice
2024-Jun-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176136
PMID:38889047
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研究论文 | 通过抑制PERK激酶降低小鼠自身免疫性糖尿病风险的研究 | 首次发现PERK抑制可逆转应激人胰岛中的mRNA翻译阻断,并通过稳定PD-L1增强β细胞免疫检查点功能 | 研究主要基于小鼠模型和人胰岛体外实验,尚未进行人体临床试验 | 探索PERK抑制对自身免疫性糖尿病的预防作用 | 易患1型糖尿病的小鼠模型、人胰岛和EndoC-βH1人β细胞系 | 分子生物学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠模型、人胰岛和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 538 | 2025-10-06 |
Comparative single-cell RNA sequencing analysis of immune response to inactivated vaccine and natural SARS-CoV-2 infection
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29577
PMID:38572977
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较分析灭活疫苗与自然SARS-CoV-2感染引起的免疫反应差异 | 首次对灭活疫苗和自然感染进行系统性单细胞RNA测序比较分析,揭示了IL-15RA/IL-15受体通路在疫苗加强免疫中的选择性激活作用 | 样本量相对有限(12名疫苗接种者),仅分析了外周血单核细胞 | 比较灭活SARS-CoV-2疫苗与自然感染引起的免疫反应差异 | 12名接种灭活疫苗的个体和COVID-19患者的外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名疫苗接种者和COVID-19患者的系列PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2025-10-06 |
Immune features revealed by single-cell RNA and single-cell TCR/BCR sequencing in patients with rheumatoid arthritis receiving COVID-19 booster vaccination
2024-04, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29573
PMID:38566569
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研究论文 | 通过单细胞RNA和TCR/BCR测序揭示类风湿关节炎患者接种COVID-19加强疫苗后的免疫特征 | 首次在RA患者中结合单细胞RNA测序和单细胞TCR/BCR测序分析COVID-19加强疫苗的免疫反应 | 样本量较小,仅观察了疫苗接种前后两个时间点 | 研究COVID-19加强疫苗对类风湿关节炎患者免疫细胞亚群和免疫反应的影响 | 稳定期类风湿关节炎患者 | 单细胞测序分析 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR/BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫受体序列数据 | 配对的外周血单个核细胞样本(接种前1周和接种后4周) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | NA | NA |
| 540 | 2025-10-06 |
vSPACE: Exploring Virtual Spatial Representation of Articular Chondrocytes at the Single-Cell Level
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.577817
PMID:38370845
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研究论文 | 开发了一种名为vSPACE的新方法,通过虚拟空间表示展示人类关节软骨细胞的单细胞RNA测序数据 | 提出了一种将单细胞RNA测序数据在二维空间中虚拟空间表示的新方法,模拟空间转录组学技术概念但以虚拟方式实现 | 方法目前仅限于二维空间表示,且仅在人关节软骨细胞数据上验证 | 探索单细胞水平上关节软骨细胞的虚拟空间表示方法 | 人类关节软骨细胞 | 单细胞分析 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | vSPACE | 单细胞RNA测序数据 | 6名健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |