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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5361 | 2024-08-04 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2024-05-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03267-x
PMID:38773520
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法HATCHet2,用于从肿瘤的多样本群体DNA测序数据中同时推断克隆和单倍型特异的拷贝数异常。 | HATCHet2改进了早期HATCHet方法,通过引入新的统计量mhBAF来提高对焦点拷贝数异常的识别,并能识别镜像亚克隆CNAs。 | 该研究可能受限于从相对较小的样本中得出的结论,并未涵盖更广泛的样本多样性。 | 研究的目的是提高从肿瘤样本中推断拷贝数异常的准确性。 | 研究对象为来自10名前列腺癌患者的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 群体DNA测序 | HATCHet2 | 基因组数据 | 10个前列腺癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5362 | 2024-08-05 |
Adipose-tissue regulatory T cells are a consortium of subtypes that evolves with age and diet
2024-Jan-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2320602121
PMID:38227656
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研究论文 | 研究表明,脂肪组织中的调节性T细胞随着年龄和饮食的变化而演变 | 发现脂肪组织中存在功能上不同的调节性T细胞亚型,并且这些亚型在不同年龄和饮食下表现出不同的基因表达特征 | 未涉及具体的临床应用示例,仅在小鼠模型中进行研究 | 探索年龄和饮食对脂肪组织调节性T细胞异质性的影响 | 研究了小鼠的腹膜内脂肪组织中的调节性T细胞亚型 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄和饮食的小鼠多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5363 | 2024-08-04 |
Endothelial cell ferroptosis influences IDH wild-type glioblastoma growth in recurrent glioblastoma multiforme patients
2024, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2024e13961
PMID:38985083
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研究论文 | 该研究揭示了内皮细胞铁死亡在复发性胶质母细胞瘤中的作用 | 本研究首次通过单细胞测序分析复发性胶质母细胞瘤中内皮细胞铁死亡的上调及其对肿瘤生长的影响 | 研究主要集中在内皮细胞与胶质母细胞瘤的相互作用,可能忽略了其它细胞类型的影响 | 理解复发性胶质母细胞瘤中肿瘤内变化驱动因素 | 分析复发性和原发性胶质母细胞瘤的内皮细胞铁死亡特征 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | 对两对原发性和复发性胶质母细胞瘤进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5364 | 2024-08-05 |
M2 Macrophage Classification of Colorectal Cancer Reveals Intrinsic Connections with Metabolism Reprogramming and Clinical Characteristics
2024, Pharmacogenomics and personalized medicine
DOI:10.2147/PGPM.S458798
PMID:39011168
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研究论文 | 本文研究了结直肠癌中M2巨噬细胞的分类及其与代谢重编程和临床特征的内在联系 | 提出了一种独特的M2分类技术,并发现了代谢表型与免疫特征之间的关系 | 仍需进一步研究以确认所识别的基因特征在免疫与肿瘤代谢之间的关键作用 | 探讨结直肠癌中免疫细胞代谢演变的临床意义 | M2巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的代谢变化 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和批量RNA测序 | 混合聚类模型 | 基因表达数据 | 分析了来自TCGA和GEO数据集的多组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5365 | 2024-08-05 |
Dysregulated energy and protein homeostasis and the loss of GABAergic amacrine cells in aging retina
2024-Aug, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109985
PMID:38945518
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研究论文 | 本研究阐明了C57BL/6小鼠在衰老过程中的主要视网膜神经元的转录组变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同类型视网膜细胞在衰老过程中的独特变化 | 研究主要集中于C57BL/6小鼠,结果可能不适用于其他品系或物种 | 探讨衰老过程中视网膜细胞转录组的变化,以理解与衰老相关的视网膜退化机制 | 1.5-2个月和24-30个月大的C57BL/6小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两组年龄小鼠(1.5-2个月与24-30个月) | NA | NA | NA | NA |
| 5366 | 2024-08-04 |
Paris saponin VII inhibits triple-negative breast cancer by targeting the MEK/ERK/STMN1 signaling axis
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155746
PMID:38763012
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研究论文 | 本研究探讨了Paris saponin VII对三阴性乳腺癌的治疗效果及其潜在机制 | 首次表明STMN1磷酸化的抑制可能是PSⅦ抗癌作用的机制 | 尚未进行临床试验验证 | 阐明PSⅦ对三阴性乳腺癌的治疗作用 | 研究对象为三阴性乳腺癌细胞及相关基因表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 分子对接、分子动力学、西方印迹 | NA | 单细胞测序数据 | 4T1异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5367 | 2024-08-04 |
Early human fetal lung atlas reveals the temporal dynamics of epithelial cell plasticity
2024-Jul-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50281-5
PMID:39003323
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研究论文 | 该研究提供了发育中的人类肺脏的单细胞图谱 | 该研究通过对超过150,000个单细胞进行测序,揭示了人类胎肺的细胞谱系发展动态 | 该研究可能未涵盖所有潜在的细胞类型和发育阶段 | 研究人类胎肺的发展及其在发育缺陷和疾病状态下的功能变化 | 分析19个健康人类假腺性胎肺组织中的细胞发育轨迹 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 19个健康人类胎肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5368 | 2024-08-04 |
Unraveling the molecular architecture of autoimmune thyroid diseases at spatial resolution
2024-Jul-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50192-5
PMID:39003267
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术探讨自身免疫性甲状腺疾病的分子结构及细胞异质性 | 首次识别出不同类型的细胞亚群及其在甲状腺中的分布,揭示了与甲状腺疾病相关的特定细胞损伤和纤维母细胞亚群 | 该研究的样本量和选取标准未明确说明,可能影响结果的普适性 | 研究自身免疫性甲状腺疾病的分子机制和细胞间相互作用 | 研究对象为自身免疫性甲状腺疾病患者的甲状腺组织样本 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 空间转录组技术 | NA | 甲状腺组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5369 | 2024-08-05 |
Altered tumor microenvironment heterogeneity of penile cancer during progression from non-lymphatic to lymphatic metastasis
2024-Jul, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70025
PMID:39003681
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研究论文 | 本研究首次探讨了阴茎癌在从非淋巴转移到淋巴转移过程中肿瘤微环境异质性的变化 | 研究揭示了阴茎癌微环境中上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间的相互作用以及肿瘤进展和淋巴结转移中功能合作的重要性 | 研究样本量较小,仅涉及六名进行单细胞RNA测序的患者和七名进行整体RNA测序的患者 | 研究阴茎癌的肿瘤微环境如何随着从非淋巴转移到淋巴转移的进展而变化 | 六名阴茎癌患者的细胞,分别为四名淋巴转移患者(IV期)和两名非淋巴转移患者(I期) | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序和整体RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者的46,861个细胞和七名患者的RNA样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5370 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65710-0
PMID:38926537
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性 | 首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用,及其细胞类型特异性的可变剪接动态 | 本研究仅基于小鼠模型,未来需要在其他物种中验证结果 | 深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化 | 年轻和老年小鼠的睾丸单细胞 | 数字病理 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 43323个睾丸单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5371 | 2024-08-05 |
Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109912
PMID:38974465
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研究论文 | 这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性 | 揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用 | 本研究主要集中在小鼠模型上,缺乏对人类肠上皮干细胞的验证 | 探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能 | Lgr5+肠干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5372 | 2024-08-05 |
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00117-6
PMID:38499808
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研究论文 | 本文探讨了SorLA在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能特性中的影响 | 揭示了SorLA在调节小胶质细胞释放TNFα中的作用,其对胶质瘤微环境及肿瘤进展有重要影响 | 本研究主要依赖于已发布的scRNA-seq数据和体外模型,可能限制了在临床背景下的直接适用性 | 研究SorLA如何影响胶质瘤微环境中的小胶质细胞功能 | 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞(GAMs) | 数字病理学 | 胶质瘤 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5373 | 2024-08-04 |
Glutamine metabolism prognostic index predicts tumour microenvironment characteristics and therapeutic efficacy in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18198
PMID:38506093
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研究论文 | 本文探讨了谷氨酰胺代谢在卵巢癌肿瘤微环境特征和治疗效果中的预测作用 | 构建了谷氨酰胺代谢预测指数(GMPI),作为卵巢癌的独立预测因子 | 尚未全面阐明谷氨酰胺代谢在肿瘤微环境中的总体角色 | 研究谷氨酰胺代谢在卵巢癌中的作用及其预测患者预后的能力 | 患者的卵巢癌及其在肿瘤微环境中的特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5374 | 2024-08-05 |
Combining bulk and scRNA-seq to explore the molecular mechanisms governing the distinct efferocytosis activities of a macrophage subpopulation in PDAC
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18266
PMID:38501838
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研究论文 | 本研究探讨了在胰腺导管腺癌(PDAC)中不同巨噬细胞亚群的吞噬活性所涉及的分子机制。 | 首次结合大样本和单细胞RNA测序数据,揭示了PDAC中巨噬细胞亚型在吞噬过程中的活性差异及其转录因子的作用。 | 样本量虽大,但只来自于基因表达公共数据库,缺乏临床数据的交叉验证。 | 分析巨噬细胞亚群在PDAC中的作用,以提高PDAC患者的预后。 | 涉及22,124个细胞的PDAC组织样本,分析其在吞噬过程中的活性及转录因子。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型数据 | 8个PDAC组织样本,分析了22,124个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5375 | 2024-08-05 |
Exploring the current landscape of single-cell RNA sequencing applications in gastric cancer research
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18159
PMID:38494861
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在胃癌研究中的应用现状 | 研究单细胞RNA测序在揭示肿瘤异质性及识别潜在治疗靶点方面的重要性 | 肿瘤异质性和技术限制仍然是该领域面临的主要障碍 | 探讨单细胞RNA测序对胃癌研究的意义及其优缺点 | 胃癌的细胞群体、稀有细胞及动态转录变化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5376 | 2024-08-04 |
STRN3 promotes tumour growth in hepatocellular carcinoma by inhibiting the hippo pathway
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18147
PMID:38429901
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研究论文 | 本研究发现STRN3通过抑制Hippo通路促进肝细胞癌的肿瘤生长 | 首次揭示了STRN3通过抑制Hippo通路来促进肝细胞癌肿瘤生长的机制 | 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在数据来源的限制 | 旨在探究STRN3在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤生长的影响 | 对371名肝癌患者及其肿瘤和正常组织进行了临床相关性分析 | 数字病理学 | 肝癌 | qRT-PCR, western blotting, CCK8实验, 转移实验, 流式细胞术, 单细胞测序, 免疫组化 | NA | 细胞组织样本和临床数据 | 371名肝癌患者及其组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5377 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic analysis in clear cell renal cell carcinoma: Deciphering the role of APP within the tumour microenvironment
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18186
PMID:38445803
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研究论文 | 本研究探讨了淀粉样前体蛋白(APP)在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的角色 | 首次运用单细胞转录组分析揭示了APP在ccRCC的肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其与临床结果的相关性 | 需要进一步研究来验证这些发现并探讨APP的调控机制及治疗意义 | 了解淀粉样前体蛋白(APP)在ccRCC肿瘤微环境中的潜在预后生物标志物作用 | 聚焦于肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中APP的表达及其与ccRCC患者预后的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5378 | 2024-08-04 |
Progress in single-cell multimodal sequencing and multi-omics data integration
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01092-3
PMID:38495443
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综述 | 本文总结了单细胞多模态组学数据的实验方法和多组学数据整合的计算方法 | 提出了将多种单细胞组学技术整合以获得更全面的细胞状态 | 可能没有深入探讨每种整合技术的具体应用和局限性 | 旨在探讨单细胞多模态组学及其数据整合在理解细胞状态和基因调控中的应用 | 单细胞多模态组学技术和数据整合方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5379 | 2024-08-05 |
Increased blood CSF3R+ myeloid-derived suppressor cell is a predictor for breast cancer recurrence
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
DOI:10.62347/MUKD2745
PMID:39005677
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研究论文 | 本研究探讨了CSF3R+骨髓来源抑制细胞(MDSCs)在乳腺癌复发中的潜在作用 | 首次确认CSF3R+ MDSCs作为预测乳腺癌复发的生物标志物 | 该研究样本量较小,仅包含35名乳腺癌患者 | 研究MDSCs在乳腺癌复发中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 乳腺癌患者中MDSCs的丰度及基因表达特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NanoString分析 | 动物模型 | 血液标本 | 35名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 5380 | 2024-08-05 |
Integrated pan-cancer genomic analysis reveals the role of SLC30A5 in the proliferation, metastasis, and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.97214
PMID:39006068
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研究论文 | 本研究探讨了SLC30A5在肝细胞癌中的表达及其预后意义。 | 发现SLC30A5在多个肿瘤类型中表达上调,并与肝细胞癌的不良预后相关联。 | 研究主要集中于肝细胞癌,其他类型癌症的相关性尚需进一步验证。 | 探讨SLC30A家族基因在多种癌症中的表达及其预后影响,特别是在肝细胞癌中的作用。 | 主要研究对象为SLC30A5及其在肝细胞癌中的作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及33种癌症类型的样本,Huh7细胞系用于功能实验 | NA | NA | NA | NA |