单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 5361 - 5380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5361 | 2024-08-05 |
Tumor-associated characteristics and immune dysregulation in nasopharyngeal carcinoma under the regulation of m7G-related tumor microenvironment cells
2024-Jun-25, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-024-03441-2
PMID:38918785
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研究论文 | 本研究揭示了在m7G相关肿瘤微环境细胞调控下，鼻咽癌微环境中的肿瘤相关特征和免疫失调 | 揭示了m7G调控的肿瘤微环境细胞与鼻咽癌免疫分布及其生物学特征之间的关系 | 本研究未详细探讨m7G修饰的具体机制及其在治疗中的潜在应用 | 探索m7G修饰相关的肿瘤微环境细胞在鼻咽癌中的作用 | 分析来自11个鼻咽癌肿瘤样本和3个鼻咽淋巴增生样本的68,795个单细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解算法 | 单细胞数据 | 68,795个单细胞，来自11个鼻咽癌样本和3个鼻咽淋巴增生样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5362 | 2024-08-05 |
Identification of New Chemoresistance-Associated Genes in Triple-Negative Breast Cancer by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2024-Jun-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25136853
PMID:38999963
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析识别了与三阴性乳腺癌化学耐药相关的新基因 | 首次揭示了三阴性乳腺癌细胞中转录异质性的显著性，并通过scRNA-seq识别了稀有的抗药性相关细胞亚群 | 未能明确所有机制，特别是在其他亚群中的耐药基因的作用 | 揭示三阴性乳腺癌中化疗耐药的转录特征 | 三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了多种三阴性乳腺癌细胞样本，具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 5363 | 2024-08-04 |
EHMT2 Inactivation in Pancreatic Epithelial Cells Shapes the Transcriptional Landscape and Inflammation Response of the Whole Pancreas
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.584700
PMID:38529489
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研究论文 | 本研究阐明了EHMT2在维持胰腺转录组和炎症反应中的关键作用 | 揭示了EHMT2失活如何重塑局部环境并影响胰腺的炎症反应 | 未提及具体样本数量和研究范围的局限性 | 探讨EHMT2在胰腺炎症中的功能影响 | 采用条件性敲除小鼠模型研究胰腺外分泌细胞中的EHMT2 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq、数字细胞学解卷积、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 条件性敲除动物的胰腺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5364 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals granzyme K-expressing cytotoxic Tfh cells in tertiary lymphoid structures in IgG4-RD
2024-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.019
PMID:37652139
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研究论文 | 本研究揭示了在IgG4相关疾病患者的三级淋巴结构中表达颗粒酶K的细胞毒性Tfh细胞。 | 发现了一种新的HLA+GZMK+细胞毒性Tfh细胞亚群，并提出浸润的Tfr细胞可能抑制这些细胞的功能。 | 研究主要集中在IgG4相关疾病患者的特定组织，可能限制了结果的广泛适用性。 | 通过单细胞转录组学识别IgG4-RD患者三级淋巴结构中的GC-Tfh细胞亚群。 | 来自IgG4相关疾病患者的组织浸润T细胞。 | 数字病理 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 已分析的样本来自IgG4相关疾病患者的受累病灶中的CD3+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5365 | 2024-08-05 |
Genome-wide meta-analysis implicates variation affecting mast cell biology in urticaria
2024-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.033
PMID:37690594
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究确定了影响荨麻疹易感性的基因组位点 | 识别了6个基因组位点与荨麻疹相关的常见遗传变异，这些位点涉及肥大细胞生物学中的特定基因 | 缺乏对其他种族或地区的研究结果，这可能限制了结果的普遍性 | 旨在确定影响荨麻疹易感性的基因组位点 | 研究对象为来自三个欧洲队列的荨麻疹病例和对照组 | 数字病理学 | 荨麻疹 | 全基因组关联研究 | NA | 遗传数据 | 14,306个荨麻疹病例和650,664个对照 | NA | NA | NA | NA |
| 5366 | 2024-08-05 |
Unravelling the heterogeneity of oral squamous cell carcinoma by integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome data
2024-02, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18108
PMID:38279519
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研究论文 | 本研究通过单细胞和整体转录组数据的综合分析揭示了口腔鳞状细胞癌的异质性 | 识别出四种主要的肿瘤细胞亚群及其独特的分子特征和功能特性，并探讨其与肿瘤微环境的相互作用 | 研究可能没有涵盖所有潜在的亚群和与其相关的临床特征 | 探讨口腔鳞状细胞癌组织中肿瘤细胞的异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 口腔鳞状细胞癌组织中的肿瘤细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5367 | 2024-08-04 |
Ehmt2 inactivation in pancreatic epithelial cells shapes the transcriptional landscape and inflammation response of the whole pancreas
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1412767
PMID:38948355
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研究论文 | 本研究探讨了Ehmt2在胰腺细胞中的失活如何影响整个胰腺的转录谱和炎症反应 | 揭示了Ehmt2在维护器官免受炎症影响中的重要作用，并展示了其对胰腺癌起始和炎症相关疾病的调控机制 | 未具体说明样本数量和特定实验条件的限制 | 研究Ehmt2在胰腺细胞中的作用及其对转录和炎症反应的影响 | 条件性缺失的胰腺外分泌上皮细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 来自条件性缺失动物的正常和年轻成人胰腺组织的比较研究 | NA | NA | NA | NA |
| 5368 | 2024-08-05 |
Deciphering the Underlying Mechanisms of Sanleng-Ezhu for the Treatment of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Based on Network Pharmacology and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
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研究论文 | 本文揭示了三棱-莪术对特发性肺纤维化的治疗机制 | 首次利用网络药理学和单细胞RNA测序数据探索了三棱-莪术的作用机制，并确定了其影响的细胞类型和信号通路 | 未进行长期临床试验以验证三棱-莪术的疗效和安全性 | 探究三棱-莪术在特发性肺纤维化治疗中的潜在机制 | 特发性肺纤维化相关基因及生物活性成分 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | LC-MS/MS和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | GSE53845数据集中有1907个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 5369 | 2024-08-05 |
Exploring the Pathogenesis of Autoimmune Liver Diseases from the Heterogeneity of Target Cells
2024-Jul-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00531
PMID:38993508
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review | 本综述探讨了靶细胞异质性对自身免疫性肝病病因学的影响 | 提出了靶细胞的异质性为自身免疫性肝病的病因学提供了新的见解 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果 | 研究自身免疫性肝病的病因机制及潜在治疗策略 | 主要关注肝细胞和胆管细胞的异质性 | 数字病理学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5370 | 2024-08-05 |
Myeloid-T cell interplay and cell state transitions associated with checkpoint inhibitor response in melanoma
2024-Jul-12, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.03.015
PMID:38593812
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研究论文 | 该文章探讨了黑色素瘤中髓系细胞与T细胞之间的相互作用及其在检查点抑制剂反应中的细胞状态转变 | 揭示了检查点抑制剂反应前肿瘤免疫微环境的特征，提出通过调节髓系细胞和效应细胞的相互作用以改善免疫治疗反应的可能性 | 研究主要限于22名阶段III-IV转移性黑色素瘤患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨免疫治疗前肿瘤微环境与黑色素瘤患者对检查点抑制剂反应之间的关系 | 22名检查点抑制剂初治的阶段III-IV转移性黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 22名患者的肿瘤免疫浸润细胞和外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 5371 | 2024-08-05 |
Targeting CSF1R in myeloid-derived suppressor cells: insights into its immunomodulatory functions in colorectal cancer and therapeutic implications
2024-Jul-11, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02584-4
PMID:38992688
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研究论文 | 本研究探讨了CSF1R在结直肠癌中的免疫调节功能及其对骨髓源抑制细胞的影响 | 探讨了CSF1R和JAK/STAT3信号轴在结直肠癌免疫抑制中的关键作用，并评估了LNCs@CSF1R siRNA与抗PD-1联合治疗的疗效 | 研究的样本仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类结直肠癌中的相应机制 | 研究骨髓源抑制细胞在结直肠癌中的免疫抑制作用 | 主要研究小鼠模型中的骨髓源抑制细胞及其相关信号通路 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠结直肠癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 5372 | 2024-08-04 |
Deconwolf enables high-performance deconvolution of widefield fluorescence microscopy images
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02294-7
PMID:38844629
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研究论文 | 本研究开发了Deconwolf，一种用于高性能去卷积宽场荧光显微镜图像的开源软件 | Deconwolf能够在普通笔记本电脑上高效运行，并显著提高了在DNA和RNA原位杂交图像中分辨拥挤荧光点的准确性 | 此文未提及具体的局限性 | 旨在克服传统显微镜方法在拥挤分子靶标分辨率上的限制 | 研究针对DNA和RNA原位杂交图像的荧光点及细胞切片中的个体转录本 | 数字病理学 | NA | 荧光显微镜 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5373 | 2024-08-05 |
CellRank 2: unified fate mapping in multiview single-cell data
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02303-9
PMID:38871986
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研究论文 | 提出了CellRank 2框架，用于统一研究多视角单细胞数据中的细胞命运 | CellRank 2能够结合多种数据视角和时间点信息，提供了对细胞命运的深入分析 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细胞的命运映射和动态变化 | 单细胞转录组数据，涉及人类造血和内胚层发育 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多达数百万个细胞的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 5374 | 2024-08-04 |
Action of circulating and infiltrating B cells in the immune microenvironment of colorectal cancer by single-cell sequencing analysis
2024-Jun-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v16.i6.2683
PMID:38994150
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了循环和浸润B细胞在结直肠癌免疫微环境中的作用机制 | 该研究揭示了结直肠癌中B细胞的异质性及其在肿瘤免疫中的功能差异 | 样本量相对较小，仅涉及23名结直肠癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨结直肠癌免疫微环境中循环和浸润B细胞亚群的作用 | 分析来自23名CRC患者的肿瘤、正常和外周血样本中的B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 样本 | 69个样本（包括正常、肿瘤和外周血样本） | NA | NA | NA | NA |
| 5375 | 2024-08-05 |
Immunological and microbial shifts in the aging rhesus macaque lung during nontuberculous mycobacterial infection
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00829-24
PMID:38771046
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研究论文 | 本研究比较了年轻和老年猕猴在非结核分枝杆菌感染中的免疫和微生物变化 | 本研究揭示了老年猕猴对非结核分枝杆菌感染的免疫反应增强，提供了对人类年龄相关疾病机制的新见解 | 缺乏对非人灵长类动物的更大样本量的研究，可能限制了结果的广泛适用性 | 探究老年猕猴在非结核分枝杆菌感染过程中免疫和微生物的变化 | 研究对象为三只年轻和两只老年的猕猴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据，免疫细胞反应数据 | 五只猕猴（两只年轻雌性，一只年轻雄性，两个老年雌性） | NA | NA | NA | NA |
| 5376 | 2024-08-05 |
Phenotypic and transcriptional changes in peripheral blood mononuclear cells during alphavirus encephalitis in mice
2024-Jun-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00736-24
PMID:38695564
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研究论文 | 本研究利用小鼠Sindbis病毒感染模型探讨外周血单核细胞在病毒脑炎中的表型和转录组变化 | 首次将单细胞RNA测序与流式细胞术结合，系统分析了小鼠外周血单核细胞的转录和表型变化 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 研究SINV感染对小鼠外周血单核细胞的影响，以理解病毒脑炎的免疫机制 | SINV感染的小鼠，特别是其外周血单核细胞及中枢神经系统内的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5377 | 2024-08-05 |
Spatial genomic, biochemical and cellular mechanisms underlying meningioma heterogeneity and evolution
2024-Jun, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01747-1
PMID:38760638
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研究论文 | 研究了影响脑膜瘤内部异质性及其演化的空间基因组、 Biochemical 和细胞机制 | 通过空间方法揭示出驱动高等级脑膜瘤内部异质性的基因和蛋白表达程序 | 对驱动内部异质性的可针对机制理解不足 | 揭示脑膜瘤内部异质性与其分子、时间和空间演化之间的联系 | 高等级脑膜瘤和其复发样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR干扰 | NA | 空间转录组 | 配对的原发和复发脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5378 | 2024-08-05 |
Comparative single cell analysis reveals complex patterns of cell type and cell signaling innovations at the fetal-maternal interface
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.01.591945
PMID:38746137
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研究论文 | 本研究揭示了胎盘-母体接口处细胞类型和信号传导创新的复杂模式 | 发现了新型的绒毛膜和决定位细胞类型，并重建了细胞间信号网络 | 研究中未提及样本的具体数量和选择标准 | 探索哺乳动物胎盘-母体接口的细胞类型和信号传导动态 | 对树袋熊、马达加斯加普通刺猬和小鼠等不同哺乳动物胎盘-母体接口的单细胞RNA测序进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5379 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing and multiple machine learning algorithms to identify key T-cell differentiation gene for progression of NAFLD cirrhosis to hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2024.1301099
PMID:38993839
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研究论文 | 该文章探讨了T细胞分化基因在NAFLD肝硬化进展为肝细胞癌中的关键作用 | 通过单细胞测序和多种机器学习算法，系统地识别出五种不同的T细胞分化状态，并确定LDHA为核心基因 | 目前的研究主要集中于HCC的发生，而精确的免疫发病机制仍然不明确 | 研究NAFLD肝硬化向肝细胞癌进展过程中T细胞的分化及其相关基因 | 采用来自两种NAFLD肝硬化样本和五个健康样本的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 2个NAFLD肝硬化样本和5个健康样本 | NA | NA | NA | NA |
| 5380 | 2024-08-04 |
Mitophagy and clear cell renal cell carcinoma: insights from single-cell and spatial transcriptomics analysis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1400431
PMID:38994370
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体自噬在透明细胞肾癌中的变化及其对肿瘤微环境的影响 | 揭示了UBB基因及其相关的泛素化过程在透明细胞肾癌发展中的重要性 | NA | 深入研究透明细胞肾癌中线粒体自噬活性变化及其对肿瘤代谢和发展策略的影响 | 透明细胞肾癌肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 多个透明细胞肾癌肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |