单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7515 篇文献，本页显示第 5341 - 5360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5341 | 2024-08-05 |
Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer
2024-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16129
PMID:38494600
|
研究论文 | 本研究探讨了BET家族蛋白BRD3在结直肠癌中的肿瘤抑制作用 | 首次展示了BRD3通过诱导p21表达抑制细胞周期并抑制肿瘤生长的作用 | 未讨论BRD3以外的其他BET家族成员在结直肠癌中的作用 | 研究BRD3在结直肠癌（CRC）中的功能角色 | 结直肠癌细胞及临床样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 5342 | 2024-08-05 |
Mutant U2AF1-Induced Mis-Splicing of mRNA Translation Genes Confers Resistance to Chemotherapy in Acute Myeloid Leukemia
2024-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2543
PMID:38417135
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研究论文 | 该文章探讨了U2AF1突变导致的mRNA翻译基因误剪接与急性髓性白血病化疗耐药之间的关系 | 本研究首次揭示了U2AF1突变如何通过影响mRNA剪接和翻译过程来促成急性髓性白血病的化疗耐药 | 本研究为回顾性分析，可能存在数据整合和样本选择偏差的局限性 | 探讨急性髓性白血病患者对诱导化疗的耐药机制 | 超过1500例急性髓性白血病患者的多组学数据 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 超过1500例急性髓性白血病患者 |
| 5343 | 2024-08-05 |
Striking the Balance with a PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody
2024-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0566
PMID:38745496
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研究论文 | 本文介绍了一种新型PD-L1×4-1BB双特异性抗体ATG-101用于癌症免疫疗法 | ATG-101在降低4-1BB亲和力的同时，具有高亲和力的PD-L1，从而减轻肝毒性 | 尽管ATG-101具有良好的抗肿瘤活性，但其长期安全性和效力仍需进一步验证 | 研究ATG-101的潜力，以改善癌症免疫治疗中的肝毒性问题 | 研究对象为肿瘤微环境中的T细胞和免疫细胞群体 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 在非人灵长类动物中进行了ATG-101治疗，且未给出样本具体数量 |
| 5344 | 2024-08-05 |
ATG-101 Is a Tetravalent PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody That Stimulates Antitumor Immunity through PD-L1 Blockade and PD-L1-Directed 4-1BB Activation
2024-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2701
PMID:38501978
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研究论文 | ATG-101是一种四价PD-L1×4-1BB双特异性抗体，通过PD-L1阻断和PD-L1导向的4-1BB激活刺激抗肿瘤免疫 | 本研究工程化了ATG-101，发现其能够同时与PD-L1和4-1BB结合，并能有效激活T细胞，显示出在ICIs抗性肿瘤中的潜在抗肿瘤活性 | 虽然ATG-101表现出良好的耐受性，但在临床试验中仍需进一步评估其长期安全性和有效性 | 本研究旨在开发一种新的抗肿瘤免疫疗法，以克服现有免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究对象为ATG-101抗体及其对4-1BB+ T细胞和肿瘤微环境的影响 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 多个体内肿瘤模型 |
| 5345 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591777
PMID:38746120
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研究论文 | 本研究设计了一种强大的单细胞分析流程，以研究小鼠胚胎在内胚层形成过程中的基因表达动态 | 提出了一种方法以克服在单细胞分析突变小鼠胚胎中的技术限制 | 突变胚胎的单细胞分析仍然稀少，且通常仅限于FACS分选的群体 | 探索突变如何影响胚胎在胃肠发育阶段的细胞景观 | 突变的小鼠胚胎，从E6.5到E8的发育阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 5346 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal distinct immune-infiltrating phenotypes and macrophage-tumor interaction axes among different lineages of pituitary neuroendocrine tumors
2024-04-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01325-4
PMID:38658971
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研究论文 | 本研究揭示了不同垂体神经内分泌肿瘤的免疫细胞浸润表型及巨噬细胞与肿瘤细胞的相互作用轴。 | 首次系统分析并分类了PitNET中的肿瘤免疫微环境亚型及其与肿瘤细胞的独特相互作用。 | 该研究未涉及PitNET以外的其他肿瘤类型，可能限制了结论的广泛适用性。 | 探讨不同类型PitNET中肿瘤及免疫细胞的多样性及其影响。 | 23例PitNET样本以及与之相关的细胞类型和免疫细胞。 | 数字病理学 | 垂体癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），大量RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学，量热免疫荧光（QIF） | NA | RNA数据 | 23个PitNET样本和365个大量RNA测序样本 |
| 5347 | 2024-08-04 |
NR2E3 loss disrupts photoreceptor cell maturation and fate in human organoid models of retinal development
2024-Apr-23, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI173892
PMID:38652563
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研究论文 | 本文研究了NR2E3缺失对人类视网膜发育中的感光细胞成熟和命运的影响 | 提出了人类感光细胞发育的详细谱系，并定义了杆状视网膜特异性转录因子的作用 | 缺乏与小鼠模型的比较数据 | 研究NR2E3在光感受器细胞发育中的具体角色 | 使用携带视网膜疾病变异的类器官和同源及无关对照进行研究 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA序列数据 | 使用了数个视网膜类器官样本 |
| 5348 | 2024-08-04 |
Single cell lineage tracing reveals clonal dynamics of anti-EGFR therapy resistance in triple negative breast cancer
2024-04-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01327-2
PMID:38605363
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研究论文 | 该研究揭示了三阴性乳腺癌中抗EGFR治疗抵抗的克隆动力学 | 首次使用单细胞转录组学和细胞条形码技术重构EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞的亚克隆动态 | 研究中未提及样本的多样性及其对结果的影响 | 探究EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞对阿法替尼治疗的反应差异及其机制 | EGFR扩增的三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞转录组学，细胞条形码 | 深度学习 | 基因表达数据 | 应用于阿法替尼治疗响应的少量细胞样本 |
| 5349 | 2024-08-05 |
Imbalance of programmed cell death patterns mediated by dendritic cell subsets in systemic lupus erythematosus and lupus nephritis
2024-Mar-28, Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences
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研究论文 | 本研究探讨了系统性红斑狼疮(SLE)和狼疮性肾炎(LN)中免疫细胞死亡模式的异常。 | 研究首次揭示了CLEC9A+cDC1在SLE和LN中细胞死亡模式失衡中的作用。 | 该研究的样本大小及其代表性可能限制其结果的普适性。 | 研究SLE和LN中免疫细胞死亡模式与疾病的关联。 | 研究对象为系统性红斑狼疮患者及狼疮性肾炎患者的免疫细胞。 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 大规模RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 涵盖了SLE和LN患者的外周血单核细胞及肾脏组织样本 |
| 5350 | 2024-08-04 |
A single-cell transcriptomic study of heterogeneity in human embryonic tanycytes
2024-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-66044-7
PMID:38965316
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎tanycytes的异质性 | 首次利用单细胞转录组数据分析人类胚胎tanycytes的群体和基因调控网络 | 人类tanycytes的研究仍相对有限，可能影响对其生物学功能的全面理解 | 研究人类胚胎tanycytes的异质性及其在能量平衡中的作用 | 人类胚胎tanycytes | 数字病理学 | 肥胖与糖尿病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5351 | 2024-08-05 |
Differences in microenvironment of lung cancer and pleural effusions by single-cell RNA sequencing
2024-Jul, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2024.107847
PMID:38889499
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序比较肺癌和胸腔积液的微环境 | 该研究首次对相同患者的肺癌活检和胸腔积液进行直接比较，揭示了微环境的显著差异 | 样本量较小，仅研究了十名患者，结果的普遍适用性可能受到限制 | 研究肺癌微环境及其与胸腔积液微环境的比较 | 十名肺癌患者的匹配活检和胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 10名患者的匹配样本 |
| 5352 | 2024-08-04 |
scDrugPrio: a framework for the analysis of single-cell transcriptomics to address multiple problems in precision medicine in immune-mediated inflammatory diseases
2024-03-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01314-7
PMID:38509600
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研究论文 | 该文章提出了一个计算框架scDrugPrio，用于分析单细胞转录组数据，以提高免疫介导炎症疾病的药物优先选择和再利用 | scDrugPrio集成了细胞类型特异性的表达变化、改变的细胞间相互作用和药物性质，以选择和排名数千种药物 | 尽管适用于小鼠模型，但在相同诊断的患者中发现了显著的细胞和基因表达差异，可能导致对治疗反应的个体差异 | 研究免疫介导炎症疾病中的药物优先选择和个性化治疗 | 对不同患者的单细胞RNA测序数据进行分析，比较药物预测的变异性 | 数字病理学 | 免疫介导炎症疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 网络模型 | 基因表达数据 | 十一名克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据 |
| 5353 | 2024-08-04 |
An atlas of cell-type-specific interactome networks across 44 human tumor types
2024-02-12, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01303-w
PMID:38347596
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研究论文 | 本研究提出了一种涵盖44种人类肿瘤类型的细胞类型特异性相互作用网络图谱。 | 开发了名为CellNetdb的数据门户，为研究人员提供细胞类型特异性相互作用网络的全面资源，并识别了不同肿瘤类型中的共同特征和差异。 | 尚未明确指出具体的研究限制 | 研究细胞类型中特异性相互作用网络以及其在肿瘤微环境中的作用。 | 563名患者和44种不同类型的肿瘤样本。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 563个患者的样本，涉及44种不同的肿瘤类型 |
| 5354 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of spatial and single-cell transcriptome data from human pancreatic cancer reveals an intermediate cancer cell population associated with poor prognosis
2024-01-31, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01287-7
PMID:38297291
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研究论文 | 本文通过整合空间和单细胞转录组数据揭示了与差病预后相关的中间癌细胞群体 | 识别了一种新型癌细胞亚群Ep_VGLL1，具有基底样和经典亚型之间的过渡特征 | 由于肿瘤的内部和外部异质性，分子特征和生物学意义尚未明确阐明 | 探讨胰腺癌的细胞异质性及其与预后的关系 | 来自17个胰腺肿瘤组织的单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 17个胰腺肿瘤组织样本（16个胰腺癌和一个高等级发育不良样本） |
| 5355 | 2024-08-04 |
Unsupervised spatially embedded deep representation of spatial transcriptomics
2024-01-12, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01283-x
PMID:38217035
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研究论文 | 本文介绍了一种用于空间转录组学的无监督深度表示方法SEDR | 提出了一种结合深度自编码器和掩蔽自监督学习机制的新方法SEDR，用于构建低维基因表达的潜在表示 | NA | 优化转录组数据与空间信息的整合，以解析组织异质性和映射细胞间通讯 | 使用10×Visium数据集进行聚类性能的评估 | 数字病理学 | NA | 深度自编码器 | 变分图自编码器 | 基因表达数据 | 手动注释的10×Visium数据集 |
| 5356 | 2024-08-05 |
SingmiR: a single-cell miRNA alignment and analysis tool
2024-Jul-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae225
PMID:38572750
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研究论文 | 本研究介绍了SingmiR工具，通过提供针对单细胞miRNA-seq数据的快速处理与定量分析。 | SingmiR是首个专为单细胞miRNA-seq数据设计的网络服务器，具有自解释界面并提供全面的分析功能 | 目前尚无针对大规模单细胞miRNA-seq数据的扩展验证 | 本研究旨在加速生物学家开发单细胞miRNA-seq协议的原型流程 | 研究对象为人类的非编码单细胞样本中的miRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 小到中等规模的数据集 |
| 5357 | 2024-08-05 |
Multiplexed imaging to reveal tissue dendritic cell spatial localisation and function
2024-Jul-05, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14962
PMID:38969618
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综述 | 本文简要概述了多重成像技术在识别树突状细胞及其组织特异性功能中的应用 | 提出了多重成像技术作为一种新方法来理解树突状细胞的空间定位和功能 | 未提及具体的实验数据或案例分析 | 理解树突状细胞在组织中的空间组织和细胞间相互作用 | 树突状细胞及其在组织特异性中的功能 | 数字病理学 | NA | 多重成像技术 | NA | NA | NA |
| 5358 | 2024-08-04 |
Growth hormone promotes myelin repair after chronic hypoxia via triggering pericyte-dependent angiogenesis
2024-Jul-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.026
PMID:38653248
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研究论文 | 这篇文章探讨了生长激素在慢性缺氧后促进髓鞘修复的机制。 | 该研究首次展示了生长激素通过触发周细胞依赖的血管生成来改善白质损伤。 | 该研究未提供对人类疾病的直接临床相关性 | 研究生长激素在缺氧导致的白质损伤中的作用及其机制 | 以缺氧新生小鼠为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 小鼠模型 | 新生小鼠及其后代 |
| 5359 | 2024-08-04 |
Integrating single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics to elucidate a specialized subpopulation of astrocytes, microglia and vascular cells in brains of mouse model of lipopolysaccharide-induced sepsis-associated encephalopathy
2024-Jul-03, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03161-0
PMID:38961424
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研究论文 | 本研究揭示了在脂多糖诱导的败血症相关脑病小鼠模型中，特定星形胶质细胞、微胶质细胞和血管细胞的亚群体及其相互作用。 | 结合使用单核RNA测序和空间转录组学，确认了Astro-2、Micro-2与Vas-1细胞之间的独特共定位关系，并发现其相关的配体-受体上调。 | 研究未能观察到Anxa1-/-和野生型小鼠在其他脑细胞类型、数量或分布上的显著差异。 | 揭示败血症相关脑病的细胞和分子机制。 | 使用脂多糖注射建立小鼠模型，分析不同时间点的脑组织。 | 数字病理学 | 败血症相关脑病 | 单核RNA测序(snRNA-seq)和立体测序(Stereo-seq) | 小鼠模型 | 脑组织 | 野生型小鼠和Anxa1-/-小鼠 |
| 5360 | 2024-08-05 |
ezSingleCell: an integrated one-stop single-cell and spatial omics analysis platform for bench scientists
2024-Jul-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48188-2
PMID:38961061
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研究论文 | ezSingleCell是一个互动且易于使用的应用程序，用于分析各种单细胞和空间组学数据类型 | 结合了公开可用的最佳方法进行深入数据分析、整合和交互式数据可视化 | NA | 提供一个便捷的平台供科研人员分析单细胞和空间组学数据 | 单细胞和空间组学数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 3000个细胞的标准scRNA-seq数据集 |